癌における新規組成物および方法
本発明は、癌を検出、診断および処置する際に使用するための新規配列に関する。本発明は、その発現が癌と関連する癌関連（ＣＡ）ポリヌクレオチド配列を提供する。本発明は、癌と関連するＣＡポリペプチドを提供し、そして診断用組成物および癌の検出のための方法を提供する。本発明は、ＣＡポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体を提供する。本発明はまた、診断ツールおよび治療用組成物、ならびに癌のスクリーニング、予防および処置のための方法を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸であって、表１〜１２９に示されるヒトポリヌクレオチドコード配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む、核酸、またはその相補体。
【請求項２】
請求項１に記載の組換え核酸を含む、宿主細胞。
【請求項３】
請求項１に記載の単離された核酸を含む、発現ベクター。
【請求項４】
請求項３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項５】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、検出可能な標識をさらに含む、ポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、固体支持体に結合される、ポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、少なくとも部分的に、化学合成によって調製される、ポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、アンチセンスフラグメントである、ポリヌクレオチド。
【請求項９】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、一本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１０】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、二本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、少なくとも１５個の連続したヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１２】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、少なくとも２０個の連続したヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１３】
癌関連（ＣＡ）核酸を検出するためのマイクロアレイであって、以下：
表１〜１２９に示されるヒトポリヌクレオチドコード配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、またはその相補体を含む、少なくとも１つのプローブ、
を備える、マイクロアレイ。
【請求項１４】
請求項１３に記載のマイクロアレイであって、少なくとも１５個の連続したヌクレオチドを含む、マイクロアレイ。
【請求項１５】
請求項１３に記載のマイクロアレイであって、少なくとも２０個の連続したヌクレオチドを含む、マイクロアレイ。
【請求項１６】
単離されたポリペプチドであって、表１〜１２９に示されるヒトゲノムポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡ配列のオープンリーディングフレーム、またはその相補体内にコードされる、ポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリペプチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドまたはそのフラグメントが、固体支持体に結合される、ポリペプチド。
【請求項２１】
単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、請求項１６〜２０のいずれか一項に記載のポリペプチドに結合する、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２２】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが、固体支持体に結合される、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２３】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体が、モノクローナル抗体である、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２４】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体が、ポリクローナル抗体である、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２５】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが、検出可能な標識をさらに含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２６】
単離された抗体であって、請求項１６〜２０のいずれか一項に記載のポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントに結合し、該抗体が、以下の工程：（ｉ）宿主動物を該ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で免疫する工程、およびｉｉ）該抗原またはその抗原結合フラグメントに対する抗体を発現する該宿主から細胞を収集する工程、を包含する方法によって調製される、単離された抗体。
【請求項２７】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列に選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド、またはそれらのフラグメント、またはそれらの相補体を含む、キット。
【請求項２８】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリヌクレオチド配列の配列に選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド、それらのフラグメントまたはそれらの相補体を含む、キット。
【請求項２９】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３０】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３１】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリペプチド配列を含む、ポリペプチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３２】
潜在的薬物の抗癌活性についてスクリーニングするための方法であって、該方法が、以下：
（ａ）表１〜１２９に示される配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される核酸配列によってコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子またはそのフラグメントを発現する細胞を提供する工程；
（ｂ）癌細胞由来の組織サンプルを抗癌薬物候補と接触させる工程；および
（ｃ）該組織サンプル中での該ＣＡ遺伝子の発現に対する該抗癌薬物候補の効果をモニタリングする工程、
を包含する、方法。
【請求項３３】
請求項３２に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記ＣＡ遺伝子が、表１〜１２９に示される配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つの核酸配列を含む、方法。
【請求項３４】
請求項３２に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、さらに以下：
（ｄ）前記薬物候補の非存在下での発現レベルを該薬物候補の存在下での発現レベルと比較する工程、
を包含する、方法。
【請求項３５】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３６】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１、および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３７】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３８】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３９】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチド、またはそのフラグメントの発現レベルを検出する工程；および
（ｉｉ）該試験サンプル中での該ポリペプチドの発現レベルを、正常細胞サンプル中でのポリペプチドの発現レベルと比較する工程であって、ここで、該正常細胞サンプル中でのポリペプチド発現のレベルに対して変化した該試験細胞サンプル中での該ポリペプチドの発現のレベルが、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４０】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドまたはそのフラグメントの活性レベルを検出する工程であって、ここで、該活性が、表１３０に列挙されるポリペプチドについての少なくとも１つの活性に対応する、工程；および
（ｉｉ）該試験サンプル中での該ポリペプチドの活性レベルを、正常細胞サンプル中でのポリペプチドの活性レベルと比較する工程であって、ここで、該正常細胞サンプル中でのポリペプチド活性のレベルに対して変化した該試験細胞サンプル中での該ポリペプチドの活性のレベルが、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４１】
試験血清サンプル中の抗体の存在と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される抗原性ポリペプチドまたはその抗原性フラグメントに対する抗体のレベルを検出する工程；および
（ｉｉ）該試験細胞サンプル中の該抗体のレベルを、コントロールサンプル中の該抗体のレベルと比較する工程であって、ここで、該コントロールサンプル中の抗体のレベルに対して変化した該試験サンプル中の抗体の変化したレベルが、該試験血清サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４２】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性を調節し得る生物活性薬剤についてスクリーニングするための方法であって、ここで、該ＣＡＰが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される核酸配列を含む核酸によってコードされ、該方法が、以下：
ａ）該ＣＡＰおよび候補生物活性薬剤を組み合わせる工程；および
ｂ）該ＣＡＰの生物活性に対する該候補薬剤の効果を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項４３】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現に影響する、方法。
【請求項４４】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性に影響し、ここで、このような活性が、表１３０に列挙される活性から選択される、方法。
【請求項４５】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４６】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４７】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４、および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４８】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４９】
癌を診断するための方法であって、以下：
ａ）第１の個体の第１の組織型における、表１〜１２９に概説されたヒト配列からなる群より選択された核酸配列を含む、一つ以上の遺伝子の発現を決定する工程；および
ｂ）該遺伝子の発現と該第１の個体に由来する第２の正常な組織型または第２の罹患していない個体に由来する正常な組織型とを比較する工程；
を包含し、
ここで、該発現の相違は、該第１の個体が癌を有することを示す、方法。
【請求項５０】
癌を処置するための方法であって、該方法は、患者にＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを投与する工程を包含し、ここで、該ＣＡＰが、表１〜１２９に概説された配列からなる群より選択されるヒト核酸配列を含む核酸によってコードされる、方法。
【請求項５１】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、該ＣＡタンパク質に結合する、方法。
【請求項５２】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５３】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５４】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４、および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５５】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項１】
単離された核酸であって、表１〜１２９に示されるヒトポリヌクレオチドコード配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む、核酸、またはその相補体。
【請求項２】
請求項１に記載の組換え核酸を含む、宿主細胞。
【請求項３】
請求項１に記載の単離された核酸を含む、発現ベクター。
【請求項４】
請求項３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項５】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、検出可能な標識をさらに含む、ポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、固体支持体に結合される、ポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、少なくとも部分的に、化学合成によって調製される、ポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、アンチセンスフラグメントである、ポリヌクレオチド。
【請求項９】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、一本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１０】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、またはその相補体もしくはそれらのフラグメントが、二本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、少なくとも１５個の連続したヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１２】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、少なくとも２０個の連続したヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１３】
癌関連（ＣＡ）核酸を検出するためのマイクロアレイであって、以下：
表１〜１２９に示されるヒトポリヌクレオチドコード配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、またはその相補体を含む、少なくとも１つのプローブ、
を備える、マイクロアレイ。
【請求項１４】
請求項１３に記載のマイクロアレイであって、少なくとも１５個の連続したヌクレオチドを含む、マイクロアレイ。
【請求項１５】
請求項１３に記載のマイクロアレイであって、少なくとも２０個の連続したヌクレオチドを含む、マイクロアレイ。
【請求項１６】
単離されたポリペプチドであって、表１〜１２９に示されるヒトゲノムポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡ配列のオープンリーディングフレーム、またはその相補体内にコードされる、ポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリペプチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドまたはそのフラグメントが、固体支持体に結合される、ポリペプチド。
【請求項２１】
単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、請求項１６〜２０のいずれか一項に記載のポリペプチドに結合する、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２２】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが、固体支持体に結合される、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２３】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体が、モノクローナル抗体である、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２４】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体が、ポリクローナル抗体である、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２５】
請求項２１に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが、検出可能な標識をさらに含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２６】
単離された抗体であって、請求項１６〜２０のいずれか一項に記載のポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントに結合し、該抗体が、以下の工程：（ｉ）宿主動物を該ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で免疫する工程、およびｉｉ）該抗原またはその抗原結合フラグメントに対する抗体を発現する該宿主から細胞を収集する工程、を包含する方法によって調製される、単離された抗体。
【請求項２７】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列に選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド、またはそれらのフラグメント、またはそれらの相補体を含む、キット。
【請求項２８】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるポリヌクレオチド配列の配列に選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド、それらのフラグメントまたはそれらの相補体を含む、キット。
【請求項２９】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３０】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３１】
電子ライブラリーであって、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択されるＣＡポリペプチド配列を含む、ポリペプチド、またはそのフラグメントを含む、電子ライブラリー。
【請求項３２】
潜在的薬物の抗癌活性についてスクリーニングするための方法であって、該方法が、以下：
（ａ）表１〜１２９に示される配列ｈＤｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される核酸配列によってコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子またはそのフラグメントを発現する細胞を提供する工程；
（ｂ）癌細胞由来の組織サンプルを抗癌薬物候補と接触させる工程；および
（ｃ）該組織サンプル中での該ＣＡ遺伝子の発現に対する該抗癌薬物候補の効果をモニタリングする工程、
を包含する、方法。
【請求項３３】
請求項３２に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記ＣＡ遺伝子が、表１〜１２９に示される配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つの核酸配列を含む、方法。
【請求項３４】
請求項３２に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、さらに以下：
（ｄ）前記薬物候補の非存在下での発現レベルを該薬物候補の存在下での発現レベルと比較する工程、
を包含する、方法。
【請求項３５】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３６】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１、および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３７】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３８】
請求項３３に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、ここで、前記薬物候補が、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項３９】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチド、またはそのフラグメントの発現レベルを検出する工程；および
（ｉｉ）該試験サンプル中での該ポリペプチドの発現レベルを、正常細胞サンプル中でのポリペプチドの発現レベルと比較する工程であって、ここで、該正常細胞サンプル中でのポリペプチド発現のレベルに対して変化した該試験細胞サンプル中での該ポリペプチドの発現のレベルが、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４０】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドまたはそのフラグメントの活性レベルを検出する工程であって、ここで、該活性が、表１３０に列挙されるポリペプチドについての少なくとも１つの活性に対応する、工程；および
（ｉｉ）該試験サンプル中での該ポリペプチドの活性レベルを、正常細胞サンプル中でのポリペプチドの活性レベルと比較する工程であって、ここで、該正常細胞サンプル中でのポリペプチド活性のレベルに対して変化した該試験細胞サンプル中での該ポリペプチドの活性のレベルが、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４１】
試験血清サンプル中の抗体の存在と関連する癌を検出するための方法であって、以下の工程：
（ｉ）表１〜１２９に示されるｈＰｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される抗原性ポリペプチドまたはその抗原性フラグメントに対する抗体のレベルを検出する工程；および
（ｉｉ）該試験細胞サンプル中の該抗体のレベルを、コントロールサンプル中の該抗体のレベルと比較する工程であって、ここで、該コントロールサンプル中の抗体のレベルに対して変化した該試験サンプル中の抗体の変化したレベルが、該試験血清サンプル中の癌の存在を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項４２】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性を調節し得る生物活性薬剤についてスクリーニングするための方法であって、ここで、該ＣＡＰが、表１〜１２９に示されるポリヌクレオチド配列ｈＲｘｘ〜ｙｙｙからなる群より選択される核酸配列を含む核酸によってコードされ、該方法が、以下：
ａ）該ＣＡＰおよび候補生物活性薬剤を組み合わせる工程；および
ｂ）該ＣＡＰの生物活性に対する該候補薬剤の効果を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項４３】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現に影響する、方法。
【請求項４４】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性に影響し、ここで、このような活性が、表１３０に列挙される活性から選択される、方法。
【請求項４５】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４６】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４７】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４、および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４８】
請求項４２に記載の生物活性薬剤についてスクリーニングする方法であって、該生物活性薬剤が、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項４９】
癌を診断するための方法であって、以下：
ａ）第１の個体の第１の組織型における、表１〜１２９に概説されたヒト配列からなる群より選択された核酸配列を含む、一つ以上の遺伝子の発現を決定する工程；および
ｂ）該遺伝子の発現と該第１の個体に由来する第２の正常な組織型または第２の罹患していない個体に由来する正常な組織型とを比較する工程；
を包含し、
ここで、該発現の相違は、該第１の個体が癌を有することを示す、方法。
【請求項５０】
癌を処置するための方法であって、該方法は、患者にＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを投与する工程を包含し、ここで、該ＣＡＰが、表１〜１２９に概説された配列からなる群より選択されるヒト核酸配列を含む核酸によってコードされる、方法。
【請求項５１】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、該ＣＡタンパク質に結合する、方法。
【請求項５２】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、転写インヒビターであって、かつ配列番号２８、４２、５６、１４２、１６７、１６９、１７３、１７５、１７７、１８５、１８７、１９３、１９５、２２７、２５５、２５８、２６０、２７４、２８６、２９８、３００、３０２、３０４、３２２、３２４、３９２、３９４、４１２、４６０、４６２、６３６、７２８、７８９、８６１、９０１、９０７、９２７、および９７７からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５３】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、Ｇタンパク質結合レセプターアンタゴニストであって、かつ配列番号４６、９１３、９１５、９２１および９３３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５４】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、カルシウム結合タンパク質アンタゴニストであって、かつ配列番号４８、５０、２０１、３３６、３３８、３４６、４０４、および４０６からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【請求項５５】
請求項５０に記載の癌を処置するための方法であって、ここで、前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、ユビキチン周期アンタゴニストであって、かつ配列番号３４、３６、６２、１０４、１０６、１０８、１１０、１５１、および１５３からなる群より選択されるＣＡＰ配列（ｈＰｘｘ〜ｙｙｙ）の活性を調節する、方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図２】
【図３】
【図４】
【公表番号】特表２００６−５１８９９１（Ｐ２００６−５１８９９１Ａ）
【公表日】平成１８年８月２４日（２００６．８．２４）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００４−５６５７４７（Ｐ２００４−５６５７４７）
【出願日】平成１５年１２月２２日（２００３．１２．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０４１３８９
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０６０３０４
【国際公開日】平成１６年７月２２日（２００４．７．２２）
【出願人】（５０４１７７２１７）サイグレス ディスカバリー， インコーポレイテッド (17)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１８年８月２４日（２００６．８．２４）
【国際特許分類】
【出願日】平成１５年１２月２２日（２００３．１２．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０４１３８９
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０６０３０４
【国際公開日】平成１６年７月２２日（２００４．７．２２）
【出願人】（５０４１７７２１７）サイグレス ディスカバリー， インコーポレイテッド (17)
【Ｆターム（参考）】
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