本発明は、腫瘍血管において発現が増加されたポリヌクレオチドおよびポリペプチドの同定に関する。さらに、本発明は、同定されたポリヌクレオチドおよびポリペプチド、ならびに該ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの阻害剤の、血管新生の調節ならびにがんなどの血管新生関連疾患の診断および治療における使用に関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞における血管新生を阻害する方法であって、前記細胞における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項２】
被験者の組織における血管新生を阻害する方法であって、前記被験者の前記組織における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項３】
被験者における過剰なまたは望ましくない血管新生に関連した障害を治療する方法であって、前記被験者における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項４】
被験者におけるがんを治療する方法であって、前記被験者における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項５】
被験者における転移を治療または予防する方法であって、前記被験者における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項６】
被験者における造腫瘍性を低下させる方法であって、前記被験者における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップを含む方法。
【請求項７】
前記被験者が、がんと診断されている、請求項１から６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
前記がんが、乳がんである、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させるステップが、前記ポリペプチドをエンコードする核酸のレベルを減少させるステップを含む、請求項１から６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記ポリペプチドをエンコードする核酸のレベルを減少させるために前記被験者にアンチセンスＲＮＡを送達するステップを含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記ポリペプチドをエンコードする核酸のレベルを減少させるために前記被験者にＲＮＡｉを送達するステップを含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を減少させることが、前記ポリペプチドの活性を減少させることを含む、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記ポリペプチドの活性を減少させるために前記ポリペプチドを特異的に結合する抗体を前記被験者に送達するステップを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記ポリペプチドの活性を減少させるために前記ポリペプチドを特異的に結合するアプタマーを前記被験者に送達するステップを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
前記ポリペプチドの活性を減少させるために前記ポリペプチドを特異的に阻害する小分子を前記被験者に送達するステップを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
表１に記載の少なくとも２つのポリペプチドの発現および／または活性が減少される、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
表１に記載の少なくとも３つのポリペプチドの発現および／または活性が減少される、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記１つ以上のポリペプチドが、ＳＦＲＰ２、ＪＡＫ３およびＦＡＰならびにこれらの任意の組み合わせから成る群より選択される、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
前記ポリペプチドがＳＦＲＰ２であり、かつ、前記被験者にカルシニューリン阻害剤を送達することによってＳＦＲＰ２の活性が減少される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記カルシニューリン阻害剤が、タクロリムスである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
細胞における血管新生を増加させる方法であって、前記細胞における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を増加させるステップを含む方法。
【請求項２２】
被験者の組織における血管新生を増加させる方法であって、前記被験者の前記組織における表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を増加させるステップを含む方法。
【請求項２３】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を増加させるステップが、前記ポリペプチドをエンコードする核酸を前記被験者に送達するステップを含む、請求項２１または２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を増加させるステップが、前記ポリペプチドを前記被験者に送達するステップを含む、請求項２１または２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記被験者が、心血管疾患を有する、または虚血もしくは喫煙の経験がある、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
被験者の組織における血管新生を検出する方法であって、前記組織からサンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップとを含み、対照サンプルにおける発現および／または活性レベルに対する発現および／または活性の増加が、血管新生を示すものである方法。
【請求項２７】
被験者におけるがんを診断する方法であって、前記被験者から組織サンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップとを含み、対照サンプルにおける発現および／または活性レベルに対する発現および／または活性の増加が、がんを示すものである方法。
【請求項２８】
表１に記載の少なくとも２つのポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップを含む、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項２９】
表１に記載の少なくとも５つのポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップを含む、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３０】
表１に記載の少なくとも１０のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップを含む、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３１】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップが、前記１つ以上のポリペプチドをエンコードする核酸のレベルを判定するステップを含む、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３２】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップが、前記１つ以上のポリペプチドのレベルを判定するステップを含む、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３３】
前記発現および／または活性が、血管組織において判定される、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３４】
前記発現および／または活性が、内皮細胞および／または周皮細胞において判定される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記サンプルが、血液、血清、血漿、唾液、尿、脳脊髄液および汗から成る群より選択される、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３６】
前記がんが、乳がんである、請求項２７に記載の方法。
【請求項３７】
前記１つ以上のポリペプチドが、ＳＦＲＰ２、ＪＡＫ３およびＦＡＰから成る群より選択される、請求項２６または２７に記載の方法。
【請求項３８】
被験者における組織の血管新生の可能性を判定する方法であって、前記被験者の組織からサンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上ポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップとを含み、対照サンプルにおける発現および／または活性レベルに対する発現および／または活性の増加が、前記組織の血管新生の可能性増加を示すものである方法。
【請求項３９】
被験者におけるがんの転移の可能性を判定する方法であって、前記被験者のがんから組織サンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上ポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップとを含み、対照サンプルにおける発現および／または活性レベルに対する発現および／または活性の増加が、前記がんの転移の可能性増加を示すものである方法。
【請求項４０】
被験者におけるがん治療の有効性を調査する方法であって、がんの治療を受けている被験者からサンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上ポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップと、前記発現および／または活性レベルと対照サンプルにおける発現および／または活性レベルとを比較するステップとを含み、前記サンプルにおける発現および／または活性レベルの前記対照サンプルに対する減少が、前記治療の有効性を示すものである方法。
【請求項４１】
被験者におけるがんの進行を調査する方法であって、がんを有する被験者からサンプルを得るステップと、前記サンプルにおける表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップと、前記発現および／または活性レベルと対照サンプルにおける発現および／または活性レベルとを比較するステップとを含み、前記サンプルにおける発現および／または活性レベルの前記対照サンプルに対する増加が、前記がんの進行を示すものである方法。
【請求項４２】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定することが、前記１つ以上のポリペプチドをエンコードする核酸のレベルを判定するステップを含む、請求項３８から４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
前記表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するステップが、前記１つ以上のポリペプチドのレベルを判定するステップを含む、請求項３８から４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記発現および／または活性が、血管組織において判定される、請求項３８から４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記発現および／または活性が、内皮細胞および／または周皮細胞において判定される、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記がんが、乳がんである、請求項３８から４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
前記１つ以上のポリペプチドが、ＳＦＲＰ２、ＪＡＫ３およびＦＡＰから成る群より選択される、請求項３８から４１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
血管新生を調節する化合物を同定するための方法であって、表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を試験化合物の存在下および不在下で判定するステップと、前記１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性のレベルをその化合物の不在下でのレベルに対して増加させるまたは減少させる化合物を、血管新生を調節する化合物として選択するステップとを含む方法。
【請求項４９】
腫瘍の成長または転移の阻害に有用な化合物を同定する方法であって、表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を試験化合物の存在下および不在下で判定するステップと、前記１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性のレベルをその化合物の不在下でのレベルに対して増加させるまたは減少させる化合物を、腫瘍成長または転移の阻害に有用な化合物として選択するステップとを含む方法。
【請求項５０】
前記方法の少なくとも一部分が、細胞において行われる、請求項４８または４９に記載の方法。
【請求項５１】
前記細胞が、内皮細胞である、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
前記細胞が、腫瘍細胞である、請求項５０に記載の方法。
【請求項５３】
表１に記載の少なくとも２つのポリペプチドをエンコードするポリペプチドにハイブリダイズする核酸を含む核酸アレイ。
【請求項５４】
表１に記載の少なくとも２つのポリペプチドに特異的に結合する抗体を含む抗体アレイ。
【請求項５５】
ＳＦＲＰ２に特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項５６】
ヒトＳＦＲＰ２に特異的に結合する、請求項５５に記載のモノクローナル抗体。
【請求項５７】
アミノ酸２９〜４０（ＧＱＰＤＦＳＹＲＳＮＣ（配列番号：１））、８５〜９６（ＫＱＣＨＰＤＴＫＫＥＬＣ（配列番号：２））、１１９〜１２５（ＶＱＶＫＤＲＣ（配列番号：３））１３８〜１５２（ＤＭＬＥＣＤＲＦＰＱＤＮＤＬＣ（配列番号：４））、１７３〜１９０（ＥＡＣＫＮＫＮＤＤＤＮＤＩＭＥＴＬＣ（配列番号：５））、２０２〜２２０（ＥＩＴＹＩＮＲＤＴＫＩＩＬＥＴＫＳＫＴ−Ｃｙｓ（配列番号：６））、および２７０〜２９５（ＩＴＳＶＫＲＷＱＫＧＱＲＥＦＫＲＩＳＲＳＩＲＫＬＱＣ（配列番号：７））から成る群より選択されるエピトープを特異的に認識する、請求項５６に記載のモノクローナル抗体。
【請求項５８】
表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するための試薬を含む、血管新生を評定するためのキット。
【請求項５９】
表１に記載の１つ以上のポリペプチドの発現および／または活性を判定するための試薬を含む、がんを診断するためのキット。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【公表番号】特表２０１１−５２３５５１（Ｐ２０１１−５２３５５１Ａ）
【公表日】平成２３年８月１８日（２０１１．８．１８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５０９４９７（Ｐ２０１１−５０９４９７）
【出願日】平成２１年５月１５日（２００９．５．１５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／００３０４７
【国際公開番号】ＷＯ２００９／１３９９１５
【国際公開日】平成２１年１１月１９日（２００９．１１．１９）
【出願人】（５０００９３８３４）ザ・ユニヴァーシティ・オヴ・ノース・キャロライナ・アト・チャペル・ヒル (14)
【Ｆターム（参考）】