ＲＮＡを切断するオリゴリボヌクレオチドおよびリボヌクレアーゼ
【課題】標的ＲＮＡ鎖の鎖切断に有用な、オリゴリボヌクレオチドおよびオリゴリボヌクレオシドを含めたオリゴマー化合物の合成および使用方法の提供。
【解決手段】ｄｓＲＮａｓｅを活性化する、２’−ペントリボフラノシルヌクレオシドのサブ配列を有するオリゴリボヌクレオチドおよびオリゴリボヌクレオシドを含むオリゴマー性化合物。さらに、哺乳動物リボヌクレアーゼ、すなわちＲＮＡを分解する酵素（ｄｓＲＮａｓｅ）、およびそのようなリボヌクレアーゼのための基質。上記化合物は、相補的核酸鎖に対する結合親和性、ならびにヌクレアーゼ耐性を増加させるための置換基を含むことができ、蛋白質の発現を調節するオリゴヌクレオチド療法や、その適合疾患の診断等のために有用である。
【解決手段】ｄｓＲＮａｓｅを活性化する、２’−ペントリボフラノシルヌクレオシドのサブ配列を有するオリゴリボヌクレオチドおよびオリゴリボヌクレオシドを含むオリゴマー性化合物。さらに、哺乳動物リボヌクレアーゼ、すなわちＲＮＡを分解する酵素（ｄｓＲＮａｓｅ）、およびそのようなリボヌクレアーゼのための基質。上記化合物は、相補的核酸鎖に対する結合親和性、ならびにヌクレアーゼ耐性を増加させるための置換基を含むことができ、蛋白質の発現を調節するオリゴヌクレオチド療法や、その適合疾患の診断等のために有用である。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズすることができる合成のオリゴマー性化合物であって、
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に対する前記化合物の結合親和性を、ＲＮＡ標的に対する修飾されていないオリゴリボヌクレオチドの結合親和性と比較して改良するよう修飾された少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする、
合成のオリゴマー性化合物。
【請求項２】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に対する前記化合物の結合親和性を、ＲＮＡ標的に対する修飾されていないオリゴリボヌクレオチドの結合親和性と比較して改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含む、請求項１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３】
前記ＲＮＡ標的にハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断することができる、請求項１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項７】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項６記載のオリゴマー性化合物。
【請求項８】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項９】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１０】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズすることができる合成のオリゴマー性化合物であって、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項１１】
修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含む、請求項１０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１２】
前記ＲＮＡ標的にハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断しうる、請求項１０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１３】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１４】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１５】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１６】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項１５記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１７】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、かつ前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１８】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項１７記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１９】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも１つの２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロ修飾リボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有し、前記アルキル上の置換が、アミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテル修飾である第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定なヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とするオリゴマー性化合物。
【請求項２０】
少なくとも１つの２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロ修飾リボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含み、ここで、前記アルキル上の置換がアミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテルである、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２１】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２２】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２３】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２４】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２５】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、および前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２６】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２７】
前記ＲＮＡ標的とハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断しうる、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２８】
前記第１のセグメントおよび前記第３のセグメントの前記リボフラノシルヌクレオシドサブユニットがそれぞれ、２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロを有するように修飾されており、かつ前記アルキル上の置換がアミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテルである、請求項２２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２９】
前記ヌクレオシドサブユニットの少なくとも２つが、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３０】
前記第１のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３１】
前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３２】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３３】
前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々が、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３４】
前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３５】
前記第１のサブユニット、前記第２のサブユニットおよび前記第３のサブユニットの前記ヌクレオシドサブユニットがそれぞれ、ホスホロチオエート結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３６】
前記第１のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノ結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３７】
前記第３のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノ結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３８】
配列中に少なくとも１２個のリボフラノシルヌクレオシドを含み、あらかじめ選択されたＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されており；
前記化合物はギャップ部分が間に入った２つのウイング部分を有し；
ウイング部分はそれぞれ少なくとも１つの修飾ヌクレオシドサブユニットを含み、前記修飾ヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
前記ギャップ部分は、少なくとも４個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、
ことを特徴とする化合物。
【請求項３９】
前記ギャップ部分が少なくとも５個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、請求項３８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４０】
複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント；および
複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメント；
を順に含み、オリゴマーのヌクレオシドサブユニットはホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項４１】
前記第２のセグメントが少なくとも５個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオチドサブユニットを有する、請求項４０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４２】
前記オリゴマーがあらかじめ選択されたＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうる、請求項４０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４３】
あらかじめ選択されたＲＮＡを特異的に切断する方法であって、
前記ＲＮＡを、少なくとも１２個のリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを前記あらかじめ選択されたＲＮＡと特異的にハイブリダイズしうる配列で含むオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されており；
前記化合物は、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドサブユニットを含む少なくとも１つのセグメントを有し、前記修飾ヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており；
前記化合物は、少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有するさらなるセグメントを有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４４】
前記さらなるセグメントが少なくとも５個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、請求項４３記載の方法。
【請求項４５】
蛋白質の望ましくない産生により特徴づけられる疾患を有する生物を治療する方法であって、
生物を、リボ核酸の相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有する本発明のオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記標的ＲＮＡに対する前記化合物の親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
複数のヌクレオシドサブユニットは連続する配列中に位置しており、かつ２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４６】
薬学的に有効な量のオリゴマー性化合物を薬学的に許容しうる希釈剤または担体中に含む組成物であって、前記オリゴマー性化合物は、ＲＮＡの相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を含み、オリゴマー性化合物の複数のヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記標的ＲＮＡに対する前記化合物の親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており；
さらなる複数のヌクレオシドサブユニットが２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする組成物。
【請求項４７】
配列特異的標的ＲＮＡのインビトロ修飾の方法であって、ｄｓＲＮａｓｅ酵素および前記標的ＲＮＡを含む試験溶液を、前記標的ＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有するオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ここでヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性を改良するように修飾されており；および
複数のヌクレオシドサブユニットは２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４８】
生物においてハイブリダイゼーションおよびｄｓＲＮａｓｅ酵素活性化を同時に促進する方法であって、生物を、標的ＲＮＡの相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有するオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ここで、ヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変；の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
複数のヌクレオシドサブユニットは２’−ヒドロキシ−ペントフラノシル糖成分を有することを特徴とする方法。
【請求項４９】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
少なくとも１つの代用物ヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
連続する配列中に位置する少なくとも４個のリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含み、かつ２’−ヒドロキシル成分をそこに有する第２のセグメント；を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定なヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする化合物。
【請求項５０】
前記ヌクレオシドサブユニット代用物がペプチド核酸サブユニットである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５１】
前記ヌクレオシドサブユニット代用物がモルホリノヌクレオシドサブユニットである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５２】
前記ヌクレオシド代用物がシクロブチルヌクレオシドである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５３】
前記ヌクレオシド代用物がピロリジンヌクレオシドである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５４】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、非リンヌクレオチド間結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定であるヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項５５】
前記非リン結合が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレン−ヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５６】
前記非リンヌクレオチド間結合が、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、メチレンメチルイミノ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５７】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットがホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５８】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも３個のヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、交互のリンおよび非リンヌクレオチド間結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項５９】
前記非リン結合が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６０】
前記非リンヌクレオチド間結合が、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、メチレンメチルイミノ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６１】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６２】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定であるヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項６３】
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットの第３のセグメントを含み、前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されている、請求項６２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６４】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されている、請求項６２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６５】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
ＤＮＡまたはＲＮＡ主要構築ブロックヌクレオシドではない少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されたヌクレオチド間結合により連結されている、ことを特徴とする化合物。
【請求項６６】
前記第１のセグメントヌクレオシドサブユニットが、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−アルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−アルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの７−アルキル誘導体、５−ハロウラシルおよびシトシン、５−プロピニルウラシルおよびシトシン、６−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、２−チオウラシルおよびシトシン、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシルアデニンおよびグアニン、および５−トリフルオロメチルウラシルおよびシトシンをその複素環塩基として有するヌクレオシドから選択される、請求項６５記載の化合物。
【請求項６７】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズすることができ、
アデノシン、２’−デオキシアデノシン、グアノシン、２’−デオキシグアノシン、シチジン、２’−デオキシシチジン、ウリジンおよび２’−デオキシチミジンからなるヌクレオシド群を除く少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含む合成のオリゴマー性化合物であって、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とするオリゴマー性化合物。
【請求項６８】
二本鎖基質の分解を触媒する活性を有する哺乳動物リボヌクレアーゼであって、前記基質の前記鎖の一方はｍＲＮＡであり、および前記基質の前記鎖の他方は、複数の２’修飾ヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメントおよび２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメントを順に有する化合物を含むことを特徴とするリボヌクレアーゼ。
【請求項６９】
前記化合物の前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７０】
前記化合物の前記第１のセグメントの前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７１】
前記化合物の前記第２のセグメントの前記サブユニットが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている、請求項７０記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７２】
前記化合物の前記第２のセグメントの前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項７０記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７３】
前記化合物の前記第１のセグメントの前記サブユニットが、２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットである、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７４】
（Ａ） 前記活性はＮａＣｌにより阻害され；
（Ｂ） 前記活性はＭｇ＋＋を必要とし；および
（Ｄ） 前記哺乳動物リボヌクレアーゼは、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより決定して約５０から約８０キロダルトンの見かけの分子量を有する、
請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７５】
前記リボヌクレアーゼが核から単離される、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７６】
前記リボヌクレアーゼが細胞質から単離される、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７７】
前記リボヌクレアーゼがヒト細胞または組織から単離しうる、請求項６８記載の哺乳動物蛋白質。
【請求項７８】
第１のオリゴヌクレオチドおよび第２のオリゴヌクレオチドのデュープレックスを含む二本鎖ＲＮＡ基質であって、
（Ａ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドはそれぞれホスホジエステル結合を有する少なくとも４個の連続するリボフラノシル残基を有する中心部分を有し、
ここで前記中心部分は、前記デュープレックス中で互いに塩基対を形成しており；
（Ｂ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つは、一本鎖ヌクレアーゼに対してそれらを耐性にする化学修飾を有する、前記中心部分に隣接する部分を有する
ことを特徴とする基質。
【請求項７９】
第１のオリゴヌクレオチドおよび第２のオリゴヌクレオチドのデュープレックスを含む二本鎖ＲＮＡ基質であって、
（Ａ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドはそれぞれホスホジエステル結合を有する少なくとも４個の連続するリボフラノシル残基を有する中心部分を有し、ここで前記中心部分は前記デュープレックス中において互いに塩基対を形成しており；
（Ｂ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つは、一本鎖ヌクレアーゼに対してそれらを耐性にし、かつデュープレックスの他方のオリゴヌクレオチドに対するそれらの親和性を増加させる化学修飾を有する、前記中心部分に隣接する部分を有する
ことを特徴とする基質。
【請求項８０】
前記化学修飾がホスホロチオエート結合または２’−メトキシ修飾である、請求項７８記載の二本鎖ＲＮＡ基質。
【請求項８１】
請求項７８記載のｄｓＲＮＡ基質を含む親和性マトリックス。
【請求項８２】
リボヌクレアーゼまたは非分解性ＲＮＡ結合蛋白質を精製する方法であって、前記リボヌクレアーゼまたは非分解性ＲＮＡ結合蛋白質を含む試料を請求項８１記載の親和性マトリックスと接触させることを含む方法。
【請求項８３】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；および
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント
を順に含む、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項８４】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメントをさらに含み、前記第２のセグメントは、前記オリゴマー性化合物中で前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置している、請求項８３記載の化合物。
【請求項８５】
前記第２のセグメントがホスホジエステルヌクレオチド間結合を有する、請求項８３記載の化合物。
【請求項８６】
前記第２のセグメントがホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有する、請求項８３記載の化合物。
【請求項８７】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント；および
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメント
を順に含む、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項８８】
前記第２のセグメントがホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有する、請求項８７記載の化合物。
【請求項８９】
前記ｍＲＭＡによりコードされる蛋白質の望ましくない産生により特徴づけられる疾患を有する生物を治療するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９０】
前記ｍＲＮＡまたは前記ｍＲＮＡによりコードされる蛋白質の１つを同定するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９１】
生物において、前記ｍＲＮＡによりコードされる蛋白質に関連する異常な状態を診断するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９２】
二本鎖基質の分解を触媒する活性を有する哺乳動物リボヌクレアーゼであって、前記基質の前記鎖の一方がｍＲＮＡであり、かつ前記鎖の他方が請求項１記載の化合物を含むことを特徴とするリボヌクレアーゼ。
【請求項９３】
前記オリゴヌクレオチドの１つが配列番号８のヌクレオチド配列を有する、請求項７８記載の二本鎖ＲＮＡ基質。
【請求項１】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズすることができる合成のオリゴマー性化合物であって、
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に対する前記化合物の結合親和性を、ＲＮＡ標的に対する修飾されていないオリゴリボヌクレオチドの結合親和性と比較して改良するよう修飾された少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする、
合成のオリゴマー性化合物。
【請求項２】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に対する前記化合物の結合親和性を、ＲＮＡ標的に対する修飾されていないオリゴリボヌクレオチドの結合親和性と比較して改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含む、請求項１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３】
前記ＲＮＡ標的にハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断することができる、請求項１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項７】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項６記載のオリゴマー性化合物。
【請求項８】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項９】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１０】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズすることができる合成のオリゴマー性化合物であって、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項１１】
修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されている少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含む、請求項１０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１２】
前記ＲＮＡ標的にハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断しうる、請求項１０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１３】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１４】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１５】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１６】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項１５記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１７】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、かつ前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項１１記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１８】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項１７記載のオリゴマー性化合物。
【請求項１９】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも１つの２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロ修飾リボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有し、前記アルキル上の置換が、アミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテル修飾である第１のセグメント；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定なヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とするオリゴマー性化合物。
【請求項２０】
少なくとも１つの２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロ修飾リボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第３のセグメントをさらに含み、ここで、前記アルキル上の置換がアミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテルである、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２１】
前記第２のセグメントが前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２２】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２３】
前記第２のセグメントが４−１２個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２４】
前記第２のセグメントが５−９個のヌクレオシドサブユニットを含む、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２５】
前記第２のセグメントが少なくとも５個のサブユニットを有し、および前記第１のセグメントおよび第３のセグメントがそれぞれ少なくとも３個のサブユニットを有する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２６】
前記第２のセグメントが少なくとも７個のヌクレオシドサブユニットを有する、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２７】
前記ＲＮＡ標的とハイブリダイズしたときに、二本鎖ＲＮＡｓｅ酵素を活性化して前記ＲＮＡ標的を切断しうる、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２８】
前記第１のセグメントおよび前記第３のセグメントの前記リボフラノシルヌクレオシドサブユニットがそれぞれ、２’−Ｏ−Ｃ１−２０アルキル、２’−Ｏ−置換Ｃ１−２０アルキルまたは２’−フルオロを有するように修飾されており、かつ前記アルキル上の置換がアミノ、ヒドロキシまたはＣ１−１０アルキルエーテルである、請求項２２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項２９】
前記ヌクレオシドサブユニットの少なくとも２つが、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３０】
前記第１のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３１】
前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３２】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３３】
前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々が、ホスホロチオエート、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステル結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３４】
前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットの各々がホスホロチオエート結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３５】
前記第１のサブユニット、前記第２のサブユニットおよび前記第３のサブユニットの前記ヌクレオシドサブユニットがそれぞれ、ホスホロチオエート結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３６】
前記第１のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノ結合により連結されている、請求項１９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３７】
前記第３のセグメントのヌクレオシドサブユニットの各々が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノ結合により連結されている、請求項２０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項３８】
配列中に少なくとも１２個のリボフラノシルヌクレオシドを含み、あらかじめ選択されたＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されており；
前記化合物はギャップ部分が間に入った２つのウイング部分を有し；
ウイング部分はそれぞれ少なくとも１つの修飾ヌクレオシドサブユニットを含み、前記修飾ヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
前記ギャップ部分は、少なくとも４個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、
ことを特徴とする化合物。
【請求項３９】
前記ギャップ部分が少なくとも５個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、請求項３８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４０】
複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント；および
複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメント；
を順に含み、オリゴマーのヌクレオシドサブユニットはホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項４１】
前記第２のセグメントが少なくとも５個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオチドサブユニットを有する、請求項４０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４２】
前記オリゴマーがあらかじめ選択されたＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうる、請求項４０記載のオリゴマー性化合物。
【請求項４３】
あらかじめ選択されたＲＮＡを特異的に切断する方法であって、
前記ＲＮＡを、少なくとも１２個のリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを前記あらかじめ選択されたＲＮＡと特異的にハイブリダイズしうる配列で含むオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されており；
前記化合物は、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドサブユニットを含む少なくとも１つのセグメントを有し、前記修飾ヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており；
前記化合物は、少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有するさらなるセグメントを有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４４】
前記さらなるセグメントが少なくとも５個の連続するリボヌクレオシドサブユニットを有する、請求項４３記載の方法。
【請求項４５】
蛋白質の望ましくない産生により特徴づけられる疾患を有する生物を治療する方法であって、
生物を、リボ核酸の相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有する本発明のオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記標的ＲＮＡに対する前記化合物の親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
複数のヌクレオシドサブユニットは連続する配列中に位置しており、かつ２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４６】
薬学的に有効な量のオリゴマー性化合物を薬学的に許容しうる希釈剤または担体中に含む組成物であって、前記オリゴマー性化合物は、ＲＮＡの相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を含み、オリゴマー性化合物の複数のヌクレオシドサブユニットは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記標的ＲＮＡに対する前記化合物の親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変、の少なくとも１つを改良するように修飾されており；
さらなる複数のヌクレオシドサブユニットが２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする組成物。
【請求項４７】
配列特異的標的ＲＮＡのインビトロ修飾の方法であって、ｄｓＲＮａｓｅ酵素および前記標的ＲＮＡを含む試験溶液を、前記標的ＲＮＡに特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有するオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ここでヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性を改良するように修飾されており；および
複数のヌクレオシドサブユニットは２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖成分を有する、
ことを特徴とする方法。
【請求項４８】
生物においてハイブリダイゼーションおよびｄｓＲＮａｓｅ酵素活性化を同時に促進する方法であって、生物を、標的ＲＮＡの相補鎖と特異的にハイブリダイズしうるヌクレオシドサブユニットの配列を有するオリゴマー性化合物と接触させることを含み、
ここで、ヌクレオシドサブユニットの少なくとも１つは、修飾されていない化合物と比較して、化合物の薬物動態学的結合、吸収、分布またはクリアランス特性；前記化合物の前記標的ＲＮＡに対する親和性または特異性；または前記化合物の電荷の改変；の少なくとも１つを改良するように修飾されており、
複数のヌクレオシドサブユニットは２’−ヒドロキシ−ペントフラノシル糖成分を有することを特徴とする方法。
【請求項４９】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
少なくとも１つの代用物ヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
連続する配列中に位置する少なくとも４個のリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含み、かつ２’−ヒドロキシル成分をそこに有する第２のセグメント；を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定なヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とする化合物。
【請求項５０】
前記ヌクレオシドサブユニット代用物がペプチド核酸サブユニットである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５１】
前記ヌクレオシドサブユニット代用物がモルホリノヌクレオシドサブユニットである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５２】
前記ヌクレオシド代用物がシクロブチルヌクレオシドである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５３】
前記ヌクレオシド代用物がピロリジンヌクレオシドである、請求項４９記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５４】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、非リンヌクレオチド間結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対して安定であるヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項５５】
前記非リン結合が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレン−ヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５６】
前記非リンヌクレオチド間結合が、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、メチレンメチルイミノ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５７】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットがホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項５４記載のオリゴマー性化合物。
【請求項５８】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
少なくとも３個のヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、交互のリンおよび非リンヌクレオチド間結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定なヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項５９】
前記非リン結合が、カーボネート、カルバメート、シリル、イオウ、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６０】
前記非リンヌクレオチド間結合が、ホルムアセタール、チオホルムアセタール、メチレンメチルイミノ、メチレンジメチルヒドラゾ、メチレンオキシメチルイミノまたはメチレンカルボニルアミノヌクレオチド間結合である、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６１】
前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項５８記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６２】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって；
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメント；前記第１のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されており；および
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；前記第２のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して分解に対してより安定であるヌクレオチド間結合により連結されている、
を含む化合物。
【請求項６３】
少なくとも２つのヌクレオシドサブユニットの第３のセグメントを含み、前記第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、３’−デオキシ−３’−チオ−ホスホロチオエート、５’−デオキシ−５’−チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、５’−デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、５’−デオキシ−５’−アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノホスフェートエステル、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されている、請求項６２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６４】
前記第１のセグメントおよび第３のセグメントの前記ヌクレオシドサブユニットが、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−デオキシホスフィネート、３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデート、ホスホルアミデート、アルキルホスホネート、アリールホスホネートまたはホスホトリエステルホスフェート結合により連結されている、請求項６２記載のオリゴマー性化合物。
【請求項６５】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的に特異的にハイブリダイズしうる合成のオリゴマー性化合物であって、
ＤＮＡまたはＲＮＡ主要構築ブロックヌクレオシドではない少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含み、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されたヌクレオチド間結合により連結されている、ことを特徴とする化合物。
【請求項６６】
前記第１のセグメントヌクレオシドサブユニットが、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−アルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−アルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの７−アルキル誘導体、５−ハロウラシルおよびシトシン、５−プロピニルウラシルおよびシトシン、６−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、２−チオウラシルおよびシトシン、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシルアデニンおよびグアニン、および５−トリフルオロメチルウラシルおよびシトシンをその複素環塩基として有するヌクレオシドから選択される、請求項６５記載の化合物。
【請求項６７】
あらかじめ選択されたＲＮＡ標的と特異的にハイブリダイズすることができ、
アデノシン、２’−デオキシアデノシン、グアノシン、２’−デオキシグアノシン、シチジン、２’−デオキシシチジン、ウリジンおよび２’−デオキシチミジンからなるヌクレオシド群を除く少なくとも１つのリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメント；
を含む合成のオリゴマー性化合物であって、
前記オリゴマー性化合物の前記ヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合と比較して前記結合を分解から安定化するように修飾されているヌクレオチド間結合により連結されていることを特徴とするオリゴマー性化合物。
【請求項６８】
二本鎖基質の分解を触媒する活性を有する哺乳動物リボヌクレアーゼであって、前記基質の前記鎖の一方はｍＲＮＡであり、および前記基質の前記鎖の他方は、複数の２’修飾ヌクレオシドサブユニットを含む第１のセグメントおよび２’−ヒドロキシル成分をそこに有する少なくとも４個の連続するリボフラノシルヌクレオシドサブユニットを含む第２のセグメントを順に有する化合物を含むことを特徴とするリボヌクレアーゼ。
【請求項６９】
前記化合物の前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７０】
前記化合物の前記第１のセグメントの前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７１】
前記化合物の前記第２のセグメントの前記サブユニットが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている、請求項７０記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７２】
前記化合物の前記第２のセグメントの前記サブユニットが、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている、請求項７０記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７３】
前記化合物の前記第１のセグメントの前記サブユニットが、２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットである、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７４】
（Ａ） 前記活性はＮａＣｌにより阻害され；
（Ｂ） 前記活性はＭｇ＋＋を必要とし；および
（Ｄ） 前記哺乳動物リボヌクレアーゼは、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより決定して約５０から約８０キロダルトンの見かけの分子量を有する、
請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７５】
前記リボヌクレアーゼが核から単離される、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７６】
前記リボヌクレアーゼが細胞質から単離される、請求項６８記載の哺乳動物リボヌクレアーゼ。
【請求項７７】
前記リボヌクレアーゼがヒト細胞または組織から単離しうる、請求項６８記載の哺乳動物蛋白質。
【請求項７８】
第１のオリゴヌクレオチドおよび第２のオリゴヌクレオチドのデュープレックスを含む二本鎖ＲＮＡ基質であって、
（Ａ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドはそれぞれホスホジエステル結合を有する少なくとも４個の連続するリボフラノシル残基を有する中心部分を有し、
ここで前記中心部分は、前記デュープレックス中で互いに塩基対を形成しており；
（Ｂ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つは、一本鎖ヌクレアーゼに対してそれらを耐性にする化学修飾を有する、前記中心部分に隣接する部分を有する
ことを特徴とする基質。
【請求項７９】
第１のオリゴヌクレオチドおよび第２のオリゴヌクレオチドのデュープレックスを含む二本鎖ＲＮＡ基質であって、
（Ａ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドはそれぞれホスホジエステル結合を有する少なくとも４個の連続するリボフラノシル残基を有する中心部分を有し、ここで前記中心部分は前記デュープレックス中において互いに塩基対を形成しており；
（Ｂ） 前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つは、一本鎖ヌクレアーゼに対してそれらを耐性にし、かつデュープレックスの他方のオリゴヌクレオチドに対するそれらの親和性を増加させる化学修飾を有する、前記中心部分に隣接する部分を有する
ことを特徴とする基質。
【請求項８０】
前記化学修飾がホスホロチオエート結合または２’−メトキシ修飾である、請求項７８記載の二本鎖ＲＮＡ基質。
【請求項８１】
請求項７８記載のｄｓＲＮＡ基質を含む親和性マトリックス。
【請求項８２】
リボヌクレアーゼまたは非分解性ＲＮＡ結合蛋白質を精製する方法であって、前記リボヌクレアーゼまたは非分解性ＲＮＡ結合蛋白質を含む試料を請求項８１記載の親和性マトリックスと接触させることを含む方法。
【請求項８３】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；および
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント
を順に含む、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項８４】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメントをさらに含み、前記第２のセグメントは、前記オリゴマー性化合物中で前記第１のセグメントと前記第３のセグメントとの間に位置している、請求項８３記載の化合物。
【請求項８５】
前記第２のセグメントがホスホジエステルヌクレオチド間結合を有する、請求項８３記載の化合物。
【請求項８６】
前記第２のセグメントがホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有する、請求項８３記載の化合物。
【請求項８７】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第１のセグメント；
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合またはホスホジエステルヌクレオチド間結合により連結されている少なくとも４個の連続する２’−ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを有する第２のセグメント；および
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合により連結されている複数の２’−Ｏ−アルキルヌクレオシドサブユニットを有する第３のセグメント
を順に含む、合成のオリゴマー性化合物。
【請求項８８】
前記第２のセグメントがホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有する、請求項８７記載の化合物。
【請求項８９】
前記ｍＲＭＡによりコードされる蛋白質の望ましくない産生により特徴づけられる疾患を有する生物を治療するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９０】
前記ｍＲＮＡまたは前記ｍＲＮＡによりコードされる蛋白質の１つを同定するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９１】
生物において、前記ｍＲＮＡによりコードされる蛋白質に関連する異常な状態を診断するための、請求項６８記載の前記リボヌクレアーゼの使用。
【請求項９２】
二本鎖基質の分解を触媒する活性を有する哺乳動物リボヌクレアーゼであって、前記基質の前記鎖の一方がｍＲＮＡであり、かつ前記鎖の他方が請求項１記載の化合物を含むことを特徴とするリボヌクレアーゼ。
【請求項９３】
前記オリゴヌクレオチドの１つが配列番号８のヌクレオチド配列を有する、請求項７８記載の二本鎖ＲＮＡ基質。
【図１】
【図２】
【図３−１】
【図３−２】
【図３−３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図２】
【図３−１】
【図３−２】
【図３−３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【公開番号】特開２０１１−１４２９１１（Ｐ２０１１−１４２９１１Ａ）
【公開日】平成２３年７月２８日（２０１１．７．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−１７２０７（Ｐ２０１１−１７２０７）
【出願日】平成２３年１月２８日（２０１１．１．２８）
【分割の表示】特願平９−５３５６６３の分割
【原出願日】平成９年６月６日（１９９７．６．６）
【出願人】（５９５１０４３２３）アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド (53)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２３年７月２８日（２０１１．７．２８）
【国際特許分類】
【出願日】平成２３年１月２８日（２０１１．１．２８）
【分割の表示】特願平９−５３５６６３の分割
【原出願日】平成９年６月６日（１９９７．６．６）
【出願人】（５９５１０４３２３）アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド (53)
【Ｆターム（参考）】
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