説明

反応容器

【課題】少なくとも一つの反応部が高温下での反応を行うためのものである、複数の反応部を有する反応容器において、一つの反応部の高熱下での反応時に他の反応部また試薬収容部などに熱的な影響の少ない反応容器を提供することを目的とする。
【解決手段】同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う反応部および試薬収容部を有してなる反応容器であって、反応部の加熱部と試薬収容部の最短の距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器とする。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、例えば抗原抗体反応による抗原の検出及びDNAの検出等の生化学反応に用いられる反応容器に関するものである。
【背景技術】
【0002】
近年、化学反応やDNA反応、たんぱく質反応などの生化学反応をチップ上にて行うμ−Total Analysis System技術やLab−on−Chip技術が研究され実現して
きており、今まで大型の実験装置や大量の試薬が必要であった反応実験が数ミリ角以下の
チップで少量の試薬で行えるようになってきている。
【0003】
生化学反応の例としては、酵素反応によるDNA増幅反応や、既知の配列を有するプローブDNAを用い、ハイブリダイゼーション法により検体DNAの配列を検出する方法、DNAの配列決定の中でもSNP(一塩基多型)の検出法などがある。
SNPの検出法としては、インベーダー法、タックマンPCR法をタイピング工程に用いる方法が知られている(特許文献1参照)。
【0004】
一般的にDNAを用いた検出反応には血液等を採取し抽出したものを用いるが、採取する血液等の試料を少量で済ませるため、検体DNAの調製法として、酵素反応によるDNA増幅反応を用いることが多い。
試料中に含まれる微量のDNAを増加させる方法には種々の方法が知られているが、その代表的な方法として、PCR増幅反応が知られている。この方法は、試料中の二本鎖DNAの変性工程(一本鎖に解離)、アニーリング工程(一本鎖DNAとプライマーを結合)、伸長工程(プライマーからDNAを合成)から構成される3工程を1サイクルとし、このサイクルを繰り返して試料中のDNAを増加させる方法である。変性工程は約95℃、アニーリング工程は50〜60℃、伸長工程は60〜80℃で行われる。PCR増幅反応はこの熱サイクルを繰り返すことにより行われる。1サイクルに要する時間はせいぜい数分程度であり、このサイクルを繰り返して必要量のDNAを得る。
なお、PCR反応の前には前処理として95℃で数分〜5、6分加熱することもある。
【0005】
SNPの検出法の一つであるインベーダー法は、二種類の非蛍光標識オリゴヌクレオチド(アレルプローブ、インベーダープローブ)、一種類の蛍光標識オリゴヌクレオチド(FRETプローブ)及びDNA構造に特異的なエンドヌクレアーゼ(クリベース)を使用する。アレルプローブは、鋳型DNAの配列とは無関係な配列(フラップ)を5’側に有し、3’側に鋳型DNAに特異的な相補配列を有するオリゴヌクレオチドで、その相補配列の5’側末端はSNP部位となっている。他方、インベーダープローブは、前記SNP部位から鋳型DNAの3’側に相補的に結合するように設計されている。また、FRETプローブは蛍光標識を有するオリゴヌクレオチドで、その5’末端に蛍光標識(レポーター)を有し、その上流にはクエンチャーが結合している。そして、このレポーターから3’側の部位が自己ハイブリゼーションして二本鎖を構成しており、この二本鎖から3’末端側に、アレルプルーブのフラップと相補的な配列である一本鎖の部位を有するものである。また、クリベースは、ヌクレオチドが三重に重なった部位を認識し、三重に重なったヌクレオチドの3’側を切断して遊離させる酵素である。
【0006】
このインベーダー法においては、まず検査対象の鋳型DNAとアレルプローブをハイブリゼーションしたときに、SNP部位にインベーダープローブの3’末端が侵入する。このため、このSNP部位で、鋳型DNA、アレルプローブ及びインベーダープローブを重ね合わせて三重になる。このSNP部位の構造をクリベースが認識して、アレルプローブのフラップを切断・遊離させる。次に、アレルプローブ起源の前記遊離フラップはFRETプローブとハイブリゼーションする。このハイブリゼーションによって、自己ハイブリゼーションの二本鎖とアレルプローブ起源の前記遊離フラップとの交点で三重となり、クリベースは再びこの構造を認識してFRETプローブのレポーターを切断し、クエンチャーから開放される。そして、励起光を照射することにより、切断遊離されたレポーターの蛍光標識が蛍光発色する。仮にSNP部位の塩基がアレルプローブとマッチしないものであった場合、アレルプローブ起源のフラップは切断・遊離せず、したがって、蛍光発光率が著しく低いから、この蛍光強度の差を検出することによってSNPを検査することができる。なお、励起光としては一般に紫外光又は可視光が利用されている。
また、これらの反応は約63℃で数十分〜4時間程度インキュベートすることにより行われる。
【0007】
なお、前述のインベーダー法や一般的なハイブリダイゼーション法では、検体DNAの前処理として95℃で数分〜5、6分加熱することもある。
【0008】
チップを用いて、これらの反応を行う場合、DNAの配列を決定する場合などは、スライドガラス上にプローブDNAを固定し、その上でハイブリダイゼーション反応を行う方法が知られている。
また、チップ上に設けたウェルと呼ばれる微小な穴やくぼみが形成され反応場として用いることも知られている。ウェルは、半導体やガラスにエッチングで設けたり、穴のあいた板を積層することで形成されていた。
ウェルを用いる場合、試薬を基板上に固定する必要がなく、またPCR反応などにも適用できる。
【0009】
ウェルタイプのものとしては、例えば、基板表面に多数のウェルが設けられている検出用基板が開示されている(特許文献2、3、4参照)。
また、内部に流路を設け、両端に開口部を有する、PCR反応用の装置も知られている(特許文献5参照)。
【0010】
しかし、複数の反応を同一のチップ上で行う場合、ある一つの反応時における、他の部分への影響が問題となることがある。例えば、同一のチップ上に、試薬を収容する部分と、PCR反応を行う部分、そしてハイブリダイゼーション法でDNAの反応検出を行う部分を設け、これらの反応を連続して行うことを想定してみる。一般的にPCR反応は90〜100℃に加熱する工程、50〜70℃程度に保温する工程がある。またハイブリダイゼーション反応はおよそ60〜70℃程度に加熱する工程がある。このように、同一チップ状で多数の反応を行うと、ある一つの反応を行っているときに、他の反応部分または試薬収容部分に熱的な影響を与えることが懸念される。
【0011】
例えば、同一のチップ上に水、バッファ、酵素等の試薬を収容する試薬収容部と、100℃近くまで加熱をする第一反応部と、第二反応部を有しているチップを用いた反応において、試薬収容部から第一の反応に必要な試薬を分注し、100℃近い温度により加熱反応を行った場合、試薬収容部に収容されている水、バッファ等の試薬は蒸発する恐れがある。また、酵素には熱により変性し不可逆に失活してしまうため、例えば第一反応部での反応後、第二反応部の反応に酵素を使用する場合、反応効率の低下または反応が進行しない恐れがある。さらに、蒸発を防ぐためにフタ材をかぶせておいたとしても、蒸発した試薬がフタ材の裏面に付着し、例えば前記の例で言うと第一の反応終了後に第二の反応を行うために試薬収容部から第二反応部へ試薬を分注する際に、試薬を正確に所望の量を回収できないことがある。
【0012】
【特許文献1】特開2002−300894号公報
【特許文献2】WO2003/031972号公報
【特許文献3】特開平09−99932号公報
【特許文献4】特開2003−70456号公報
【特許文献5】特許第2759071号公報
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【0013】
本発明は、このような事情を考慮してなされたもので、少なくとも一つの反応部が高温下での反応を行うためのものである、複数の反応部を有する反応容器において、一つの反応部の高熱下での反応時に他の反応部また試薬収容部などに熱的な影響の少ない反応容器を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【0014】
請求項1の発明は、同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う反応部および試薬収容部を有してなる反応容器であって、反応部の加熱部と試薬収容部の最短の距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器である。
【0015】
請求項2の発明は、長尺状の同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う第一反応部、および加熱領域を有し加熱反応を行う第ニ反応部および試薬収容部を有し、かつ試薬収容部、第一反応部、第ニ反応部の順に配置されてなる反応容器であって、
第一反応部の加熱部と試薬収容部の最短距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器である。
【0016】
請求項3の発明は、前記第一反応部の加熱領域と第ニ反応部の最短距離が15mm以上であることを特徴とする請求項2記載の反応容器である。
【0017】
請求項4の発明は、前記試薬収容部及び/又は第一反応部及び/又は第ニ反応部が、凹形状または少なくとも一つの開口部を有する空洞形状であることを特徴とする請求項1〜3のいずれかに記載の反応容器である。
【0018】
請求項5の発明は、前記第一反応部が遺伝子増幅反応部、第二反応部がDNAのハイブリダイゼーション反応部であることを特徴とする請求項1〜4のいずれかに記載の反応容器である。
【0019】
請求項6の発明は、前記試薬収容部が複数あり、該試薬収容部の一つに酵素が収容されており、かつ酵素が収容されている試薬収容部と、第一反応部の加熱領域の最短距離が30mm以上であることを特徴とする請求項1〜5のいずれかに記載の反応容器である。
【0020】
請求項7の発明は、前記基材が、樹脂組成物からなり、かつ熱伝導率が0.2(Kcal/m/h/℃)以下であることを特徴とする請求項1〜6のいずれかに記載の反応容器である。
【0021】
請求項8の発明は、前記基材が、ポリプロピレンを主成分とすることを特徴とする請求項1〜7のいずれかに記載の反応容器である。
【発明の効果】
【0022】
本発明によれば、同一の基板上に加熱領域を有し加熱反応を行う反応部および試薬収容部を有してなる反応容器において、加熱による反応部や試薬収容部などへの影響のない反応容器とすることができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【0023】
本発明は、同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う反応部および試薬収容部を有してなる反応容器であって、反応部の加熱領域と試薬収容部の最短の距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器である。
または、長尺状の同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う第一反応部、加熱領域を有し加熱反応を行う第二反応部および試薬収容部を有し、かつ試薬収容部、第一反応部、第二反応部の順に配置されてなる反応容器であって、第一反応部の加熱領域と試薬収容部の最短距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器である。
【0024】
以下、詳細に説明する。
図1に、本発明における一実施形態を示す図を示す。図1は、略長方形の板状の基板2に、試薬を収容する複数の試薬収容部3と、複数の反応部4が形成されており、反応部を包含するように加熱領域5がある。そして加熱領域5と試薬収容部3の最短の距離6が15mm以上である。
【0025】
図2に、本発明における別の一実施形態を示す図を示す。図2は、略長方形の板状の基板2に、試薬を収容する複数の試薬収容部3と、第一反応部7としてPCR反応をおこなうPCR反応部と、第二反応部としてPCR反応により調製された核酸検体を反応検出するための複数の反応検出部9が形成されており、第一反応部の反応を行う部分に加熱領域8を有し、第二反応部である反応検出部を包含するように加熱領域9がある。なお、図2において、第一反応部7は基材に設けた2つの開口部を流路で接続てなり、流路は基材裏面に設けた溝部をフィルム7bで被覆することにより形成してなる。
そして加熱領域8と試薬収容部3の最短の距離11が15mm以上である。また、加熱領域8と反応検出部9の最短の距離12が15mm以上である。
【0026】
本発明に用いる基板は、反応系に悪影響を与えないものであればよい。また、反応を検出する際、基板下方より光学検出する場合は透明性が高い方が好ましい。
【0027】
また、熱伝導率(Kcal/m/h/℃)が0.2以下であることが好ましい。この範囲であれば、後述の試薬収容部と反応部を一定の距離を開けて設けることにより、反応部に加えた熱の影響が試薬収容部などにいかなくなるものである。
【0028】
このようなものとして、例えば、PC(ポリカーボネート)、PP(ポリプロピレン)、シクロオレフィン系ポリマー、メチルペンテン系樹脂、フッ素ポリマー、シリコーン樹脂などを用いることができる。
特にポリプロピレン系の樹脂を用いることが好ましい。
【0029】
また、このような合成樹脂を用いて基板を作成すれば、耐熱性、耐薬品性、成形加工性などに優れているため好ましい。さらに、2種類以上の樹脂を接合して用いてもよい。この場合、それぞれの樹脂の特徴を活かして基板を作成することにより、試薬及び試料等の特性に応じた多様な基板とすることが可能となり、用途ごとに使い分けることができる。例えば、基板の上半分と下半分とで材料を分けたりすることも可能となる。また、後述の試薬収容部やPCR反応部など部分ごとに材料を分けることもできる。
なお、基板の素材としてガラスを用いてもよい。
【0030】
通常、熱伝導率は金属で100(Kcal/m/h/℃)以上、ガラスで約1(Kcal/m/h/℃)、樹脂で1(Kcal/m/h/℃)以下である。
反応部でDNAのハイブリダイゼーションやインベーダー反応、PCR反応を行う場合、反応工程や前処理工程で、100℃近い加熱工程を経る。しかし、例えば試薬収容部に水、バッファなどを収容する場合、熱による蒸発試薬の蒸発を防ぐために、60℃以上にならないようにすることが好ましい。またその他、熱に弱い試薬を熱から守るためには、その試薬の特性に合わせて適宜距離、材質などを設定すればよいが一般的には60℃程度以上にならないようにすれば多くの反応系では問題ない。
【0031】
基材として樹脂組成物を用いる場合、樹脂の熱伝導率は一般的に1(Kcal/m/h/℃)以下程度であるので、試薬収容部と反応部の加熱部を前述の範囲にすることで、熱の伝播を抑え、試薬収容部内の温度上昇を抑えることができる。
【0032】
また、基材の厚みは0.05〜5mmの範囲内であることが好ましい。さらに好ましくは0.5〜1.5mmの範囲内である。
薄すぎると強度が低下する。熱伝導率の低い材質のものであっても、空気に比べると熱伝導度は高いため、この範囲より厚すぎると伝わる熱の量が増大するため好ましくない。
【0033】
試薬収容部は、開口部を有する凹形状(ウェル形状)であることが好ましい。
試薬収容部は、複数設けることもでき、試薬収容部を複数設ける場合、大きさが異なっていても良い。試薬収容部の数は、目的に応じて適宜設定できる。
また、試薬収容部は、予め一つの試薬を入れておき、後から別の試薬を入れ、混合させる混合場として用いることもできる。
【0034】
試薬収容部の凹形状としては、中でも半球状または円筒状で底部が半球状なものが好ましい。半球状であれば試薬を充填する際、試薬の飛び散り、気泡の混入を防げるものとなる。また収容した試薬を分取、回収の分取性、回収性に優れるものとなる。
窪みを有する試薬収容部の場合、窪みを除いた部分の底部が半球状になっていれば良い。窪みの底部も半球状になっていることが好ましい。微量試薬の液滴は収容されるとき、玉状で供給されるとすると、ちょうど試薬の液滴が半球状の窪みにはまり保持される構造になる。また、試薬の量が窪みの容量より大きい場合でも、半球状であれば、気泡の混入なく、試薬の一部が窪みに入り込み保持される。
なお、それ以外にも、開口部が円形または多角形で、断面が三角形状、四角形状、台形形状になっているものでもかまわない。
【0035】
試薬収容部の容量は、10〜300μlの範囲内であることが好ましい。特にDNAを扱う生化学反応では、反応量が微量であり、用いる試薬は高価であることが多い。
そのため、反応に用いる試薬などは多くても数百μl程度になり、前述の範囲内であることが好ましい。また、数百μl以上の試薬を用いる場合は試薬収容部を2つ以上用いてもよい。
【0036】
前記試薬収容部の開口径が1〜50mmの範囲内であることが好ましい。
試薬の量は、数百nl程度の極微量〜数百μl程度であり、また一般的な分注針や分注チップの径は数十μm〜数mm程度である、そのため、分注適性、目的容量を考慮すると、試薬収容部の開口径が1〜50mmの範囲内であることが好ましい。
【0037】
また、深さは1〜50mmの範囲内であることが好ましい。
【0038】
また、前記試薬収容部は、図6(b)に示すような基板をくりぬいた形状にしてもよいし、図6(a)に示すように基板裏面が反応部の形状に沿って基板下方向に凸形状になっていても良い。
【0039】
また、試薬収容部上に蓋材を設けても良い。蓋材を設けることにより、ごみ、汚染物質などによる汚染を防ぐことができる。
蓋材としてはフィルム状のものを用いることができる。このようなものとしては、例えばポリエチレン、ポリプロピレン、ポリメチルペンテン等のポリオレフィンフィルム、ポリメチルアクリレート、ポリメチルメタクリレート等のアクリル系フィルム、ポリスチレンフィルム、ポリアセタールフィルム、ポリアミドフィルム、ポリアクリロニトリルフィルム、ポリカーボネートフィルム、シクロオレフィン系フィルム、シリコン樹脂系フィルム、フッ素系樹脂フィルムなどが挙げられる。
また、アルミニウムなどの金属箔や、金属箔と前述の樹脂フィルムの積層フィルムを用いても良い。
【0040】
これらのフィルム状蓋材は、接着剤を用いて貼り合わせることができる。接着剤としては、耐熱性の硬化性接着剤を用いることができる。
また、ヒートシールにより貼り合わせてもかまわない。ヒートシールであれば、試薬への接着剤の影響を考慮しなくても良いので好ましい。
【0041】
ヒートシールの条件は、温度140℃〜220℃、圧力1kg〜3kg、時間0.3秒〜2.0の範囲内で、加圧しながら貼り合わせることが好ましい。温度、圧力、時間がこれ以上であると基材が変形を起こしやすくなる。また、これ以下の温度、圧力、時間であるると貼り合わせが困難である。また、温度を上げる場合は、内容物の熱劣化を考慮して時間を短くするとよい。
【0042】
また、蓋材を設けた場合、試薬の回収は、蓋材の上から注射器のような針状の回収具を用いて、突き刺し、回収しても良い。
【0043】
なお、蓋材を剥がさずに試薬を回収する場合は、蓋材は剥離する必要がない。
【0044】
また、例えば図5に示すように開口部周囲に凸部を設けても良い。凸部を設けることにより、蓋材を貼り合わせやすくできる。
特にヒートシールにより貼り合わせる場合、加熱する部分が、基材全体ではなく、凸部のところだけでよいので、試薬収容部内の試薬への熱的な影響を低減することができる。
【0045】
このような凸部としては、幅は0.1〜2mm、好ましくは0.3〜0.7mmの範囲内であることが好ましい。この範囲より小さいと、凸部でヒートシールすることができず、この範囲より大きいと、基材、内容物への影響(ダメージ)が大きくなってしまう。
また、凸部を設けることにより収容部の容量を増やしてもよい。その場合、収容部の強度とヒートシール適性を考慮して、凸部を例えば図5(b)に示すように2段階に形成してもよい。すなわち、強度を出すためにある程度の厚みを持たせた凸部を設け、その上に幅の小さい凸部を設ける2段階構造にすることにより強度とヒートシール適性を両立させてもよい。
【0046】
反応部としては、凹形状または少なくとも一つの開口部を有する空洞形状のものがあげられる。反応部では、反応の有無を検出してもよい。
また、第一反応部、第二反応部を有する場合、両方が凹形状または少なくとも一つの開口部を有する空洞形状であってもよいし、片方が凹形状でもう片方が一つの開口部を有する空洞形状であってもよい。
第一反応部、第二反応部を有する場合、例えば第一反応部が開口部を有する空洞形状であり、第二反応部が凹形状でもよい。
【0047】
凹形状の反応部は、基板がプラスチック、合成樹脂系であれば切削加工、成型加工により形成することができる。ガラスであれば切削加工により形成することができる。また、反応部は複数有することができ、目的に応じて適宜設定できる。
凹形状の反応部の開口径は0.1〜5mmの範囲内、深さが0.1〜5mm範囲内であることが好ましい。前述のようにライフサイエンス分野では、微量試薬を用いて厳密な温度制御を行うことが多く、効率的に反応を行うためには、前記範囲内であることが好ましい。
また、反応部内には予め、反応に必要な試薬を収容していても良い。
【0048】
また、凹形状は特に限定するものではないが、底部が平坦でありウェル開口部から底部まで壁面が傾斜している円錐台形形状であることが好ましい。底部が平坦でありウェル開口部から底部まで壁面が傾斜している円錐台形状であれば、下方からの光学的な検出に有利である。例えば反応部内に蛍光物質を下方から紫外線を照射し、同じく下方から蛍光を検出する場合、球状やその他複雑な形状であると、蛍光物質の励起源である紫外線が屈折、散乱して蛍光物質に照射される量が減少してしまう。また生じた蛍光も屈折、散乱し、検出する蛍光強度の低下、誤検出などの原因となってしまう。
なお、それ以外にも、開口部が円形または多角形で、断面が半球形状、U字形状、三角形状、四角形状になっているものでもかまわない。また、開口部が多角形で断面が台形形状でもかまわない。
【0049】
また、前記反応部は、図6(b)に示すような基板をくりぬいた形状にしてもよいし、図6(a)に示すように基板裏面が反応部の形状に沿って基板下方向に凸形状になっていても良い。
【0050】
また、反応部上に保護フィルムを設けても良い。保護フィルムを設けることにより、ごみ、汚染物質などによる汚染を防ぐことができる。
保護フィルムとしてはフィルム状のものを用いることができる。このようなものとしては、例えばポリエチレン、ポリプロピレン、ポリメチルペンテン等のポリオレフィンフィルム、ポリメチルアクリレート、ポリメチルメタクリレート等のアクリル系フィルム、ポリスチレンフィルム、ポリアセタールフィルム、ポリアミドフィルム、ポリアクリロニトリルフィルム、ポリカーボネートフィルム、シクロオレフィン系フィルム、シリコン樹脂系フィルム、フッ素系樹脂フィルムなどが挙げられる。
また、アルミニウムなどの金属箔や、金属箔と前述の樹脂フィルムの積層フィルムを用いても良い。
【0051】
これらの保護フィルムは、接着剤を用いて貼り合わせることができる。接着剤としては、耐熱性の硬化性接着剤を用いることができる。
また、ヒートシールにより貼り合わせてもかまわない。反応部内に予め試薬を収容しておく場合、ヒートシールであれば、試薬への接着剤の影響を考慮しなくても良いので好ましい。
【0052】
ヒートシールの条件は、温度140℃〜220℃、圧力1kg〜3kg、時間0.3秒〜2.0の範囲内で、加圧しながら貼り合わせることが好ましい。温度、圧力、時間がこれ以上であると基材が変形を起こしやすくなる。また、これ以下の温度、圧力、時間であるると貼り合わせが困難である。また、温度を上げる場合は、内容物の熱劣化を考慮して時間を短くするとよい。
【0053】
保護フィルムは使用する前に剥がす必要があるため、易剥離性であることが好ましい。
【0054】
また、例えば図5に示すように開口部周囲に凸部を設けても良い。凸部を設けることにより、蓋材を貼り合わせやすくできる。特にヒートシールにより貼り合わせる場合、加熱する部分が、基材全体ではなく、凸部のところだけでよいので、反応部内に予め試薬を収容しておく場合、試薬への熱的な影響を低減することができる。
また、剥離する際も、接点が開口部を除いた基材全体ではなく、凸部上だけであるので剥離が容易にできる。
【0055】
このような凸部としては、幅は0.1〜2mm、好ましくは0.3〜0.7mmの範囲内であることが好ましい。この範囲より小さいと、凸部でヒートシールすることができず、この範囲より大きいと、基材、内容物への影響(ダメージ)が大きくなってしまう。
また、凸部を設けることにより反応部の容量を増やしてもよい。その場合、反応部の強度とヒートシール適性を考慮して、凸部を例えば図5(b)に示すように2段階に形成してもよい。すなわち、強度を出すためにある程度の厚みを持たせた凸部を設け、その上に幅の小さい凸部を設ける2段階構造にすることにより強度とヒートシール適性を両立させてもよい。
また、凸部同士を凸部と同じ高さで連結させても良い。そのようにすることで、剥離する際に、引っ掛かりがなくスムーズに剥離ができる。
【0056】
ウェル状の試薬収容部、反応部に試薬、検体などの溶液を充填する際、ウェル内部に表面処理を施しておくと気泡の混入なく溶液を注入できる。また、ウェルから溶液を回収する際にも高回収率が期待できる。
また、予め試薬を入れあるウェルに後から別の試薬を入れ、混合する場合にも試薬が適切に広がるために混合がしやすい。さらに、ウェル内で加熱により反応を行う際、液在籍位置が安定し、また蒸発しにくいものとなる。
なお、溶液が水系の場合、親水処理を施すことが好ましい。具体的には水との接触角が70°以下、好ましくは40°以下がよい。
また、接触角の測定は、公知の接触角計を用いて測定する。また、ウェル内の接触角の測定は困難であるため、同様の表面状態である基板の表面を用いて測定しても良い。
【0057】
開口部を有する空洞形状の反応部は、両端に基材を貫通する貫通孔を設け、基材の裏面に両貫通孔を接続する溝部を設ける。この溝部上に底部形成用フィルムを貼り合わせることにより、流路状反応部を形成する。
この時、溝部の幅、高さはそれぞれ1mm〜5mmの範囲内であることが好ましい。
【0058】
前記溝部は両貫通孔を直線で結んでいても良いし、試薬や検査対象の蒸発を防ぐために屈曲した形状であっても良い。
【0059】
底部形成用フィルムとしてはフィルム状のものを用いることができる。このようなものとしては、例えばポリエチレン、ポリプロピレン、ポリメチルペンテン等のポリオレフィンフィルム、ポリメチルアクリレート、ポリメチルメタクリレート等のアクリル系フィルム、ポリスチレンフィルム、ポリアセタールフィルム、ポリアミドフィルム、ポリアクリロニトリルフィルム、ポリカーボネートフィルム、シクロオレフィン系フィルム、シリコン樹脂系フィルム、フッ素系樹脂フィルムなどが挙げられる。
また、アルミニウムなどの金属箔や、金属箔と前述の樹脂フィルムの積層フィルムを用いても良い。
【0060】
底部形成用フィルムは接着剤を用いて貼り合わせることができる。また、ヒートシールにより貼り合わせても良い。ヒートシールであれば、反応部内への接着剤の影響を考慮しなくても良いので好ましい。
また、底部形成用フィルムは、一部溝部へ食い込む形状であれば好ましい。基材と底部形成用フィルムの間に隙間が生じず、試薬や検査対象の漏れがないものとなるからである。
【0061】
また、例えば図3に示すように、貫通孔開口部は容量を増やすために基材から上部に突出した形状にしてもよい。
【0062】
また、開口部にはフタ材を設けてもよい。
【0063】
本発明の加熱領域とは、反応部の加熱される領域のことをいう。例えば複数の凹形状の反応部を有し、複数の反応部をちょうど包含するような加熱部材を接近させて加熱する場合、加熱部材により、目的の反応温度に加熱される領域を言う。そしてその加熱領域から試薬収容部までの距離が15mm以内であることが必要である。(図1においては6、図2においては11)、また、第一反応部、第二反応部を有する場合、第一反応部と第二反応部の距離(図2の12)も15mm以内であることが好ましい。
【0064】
また、その他の反応部を設けても良いが、熱の影響を考慮して位置設計することが重要である。
【0065】
また、凹形状の反応部を用いる場合、反応部同士を接続する流路を設けてもよい。またウェル状反応部と試薬収容部、反応部、その他の反応部を接続する流路を設けてもよい。これら流路を形成することにより、連続した反応を行わせることが可能となる。
【0066】
また、基板には、変形などを軽減するためにリブを設けてもよい。リブとしては、基板端部の下部及び/又は上部に幅0.1〜3mm、高さ0.1〜3mm程度のものを設ければよい。また、置いたときに安定するよう、支持用脚部を設けてもよい。
【0067】
本発明では、様々な生化学系の反応用として用いることができ、例えば抗原抗体反応及びDNA反応の検出などに用いることができる。
抗原抗体反応による抗原検出の場合、例えば、予め各ウェル状反応部内に抗原を含む試料を入れておき、後から検体として抗体を含む試薬を添加し、抗原または抗体のいずれかに標識物質を付けておくことで、反応の有無を検出できる。標識物質としては、蛍光などの発光物質が一般的に用いられる。なおこの場合、基板上に試薬収容部を設けて置き、検体を収容しておいてもよい。
【0068】
DNAの検出の場合、例えば、予めウェル状反応部内に核酸プローブを用意しておく。その後、検体DNAをウェル状反応部に供給し、核酸プローブと検体DNAのハイブリダイゼーション反応により、DNAの検出を行うことができる。その際、検体DNAに標識物質を付けておけば、その標識物質の有無を検出することにより検出が可能となる。また、検体DNAは、血液等から抽出したDNAをPCR法、LAMP法などにより調製しておいたものを用いることができる。また、核酸プローブとして配列の異なる核酸を複数用意することで検出物質としての検体DNAがどのような配列であるかを検出することができる。なおこの場合、基板上に試薬収容部を設けて置き、検出物質を収容しておいてもよい。
【0069】
また、基板上に遺伝子増幅反応部を設けておき、チップ上で連続して、血液などから抽出したDNAを遺伝子増幅反応により増幅させ、それを検体とし、反応部で核酸プローブとの反応の有無を検出してもよい。具体的には、例えばウェル状試薬収容部に検体として血液などから抽出したDNAを収容しておき、分注動作により、遺伝子増幅反応部へ分注し、遺伝子増幅反応により調製した検体をウェル状の反応部へ分注すればよい。ウェル状試薬収容部から遺伝子増幅反応部、ウェル状反応部へは流路を用いて送液しても良い。
なお、ここでいう遺伝子とはDNA、RNAなどのことをいう。また遺伝子増幅反応方法としては前記PCR法、LAMP法などがある。
【0070】
また、一塩基遺伝子多型(SNP)の解析にも用いることができる。なお、検体を検出するための試薬は複数あってもよく、検体が蛍光標識されていない場合には、試薬のひとつが標識されていればよい。
【0071】
また、標識物質は、反応物に特有に作用するものを、反応後に加えることもできる。このようなものとしては、DNAの検出におけるインターカレーターなどがある。また、ここでいう標識物質とは間接的なものも含む。すなわち、蛍光物質などに結合する物質を標識物質として検体またはプローブ核酸などの検体を検出するための試薬に結合させておき、後から蛍光物質を加えても良い。
【0072】
また、多段階反応を行ってSNPまたはDNAを検出してもよい。
例えば、インベーダー・アッセイ法(サードウェイブテクノロジーズ,Inc(米国ウィスコンシン州マディソン市)を用いても良い。これによりSNP解析の具現化を図ることが可能となる。
【0073】
この場合、検体を検出するための試薬が複数種でもよく、予めウェル状反応部内に少なくとも1種の試薬を入れておき、その後、検体と試薬を同時または順次注入し、反応をおこなっても良い。
【0074】
また、ウェル状反応部、PCR反応部には、反応用液の乾燥を防ぐ目的でミネラルオイルなどの反応用液より比重の軽い不揮発性液体を加えても良い。
また、検体を検出するための試薬はウェル状反応部内に固定してもよいし、固定させずに保持させておくだけでもよい。
【実施例】
【0075】
<実施例1>
図4の検出チップを、金型成形により作成する。成形に用いた樹脂は、ポリプロピレン(プライムポリマー株式会社製)を用いて寸法縦2.5cm×横12cmの成形品を作成した。
【0076】
試薬収容部3は直径13mm、深さ6mmで先端が半球状とした。試薬収容部は間隔1.5mmにし、横方向に2行、縦方向に2列にし計4個設けた。
【0077】
第一反応部7であるPCR反応部は、直径9mm、深さ4mmで先端が半球状のものを形成した。
【0078】
第二反応部9は反応検出用で直径3mm、深さ2mmで側面が傾斜し底面が平坦である、断面台形形状とした。第二反応部は間隔1.5mmにし、横方向に4行、縦方向に5列にし計20個設けた。
【0079】
なお、基材厚みは1mmで試薬収容部、第一反応部及び第二反応部の底部は基板から下方にはみ出す形状にした。基板の端から試薬収容部、第一反応部(PCR反応部)、第二反応部(反応検出部)という順に設け、第一反応部加熱領域と試薬収容部の最短距離は15mmにし、第一反応部の加熱領域と第二反応部の最短距離は15mmとした。
なお、第一反応部の加熱領域は、後述の加熱部材が縦9×横9mmなので、第一反応部を包含する9×9mmの領域である。
【0080】
次に表面処理として、コロナ処理を行った。処理条件は電源に380W(電圧64V、電流4.9A)印加し、コロナ放電を発生させ、表面処理を行った。
【0081】
このチップを用いてPCRによる検体DNAの増幅及びインベーダ反応によるSNPの検出を行った。インベーダー反応はインベーダーアッセイキット(ThirdWaveTechonogy社製に順ずる)。
【0082】
まず、4つの試薬収容部3にはそれぞれ
・ミネラルオイル120μl[ウェル1]
・PCR試薬(純水、バッファー、DNAポリメラーゼ、dNTP、Primer)20μl[ウェル2]
・インベーダー試薬(純水、バッファー、酵素(クリベース)、フレットプローブ)65μl[ウェル3]
・血液から採取し、前処理を施した検体DNA8μl[ウェル4]
を針の内径2mmのピペットを用いて加え収容した。
なお、図4において試薬収容部の各ウェルは、左上をウェル1、右上をウェル2、左下をウェル3、右下をウェル4とした。
反応部にはインベーダープローブ0.15μlづつを針の内径2mmのピペットを用いて加えて、乾燥させた。
【0083】
まず、ウェル2からPCR試薬を12μlとり、ウェル4に入れ、ピペットを数回ポンピングすることにより混合した。混合した試薬のうち5μlを第二反応部(PCR反応部)にいれ、その上からウェル1からミネラルオイル5μlを入れた。
液の回収注入にはいずれも針の内径2mmのピペットを用いた。
【0084】
第一反応部(PCR反応部)内で95℃5分加熱した後、95℃30秒−70℃30秒−65℃90秒のサイクルを30回行うことで、PCR反応を行った。なお、加熱冷却の温度制御は第一反応部の上下に縦9×横9mmのペルチェ素子を配置し行った。
【0085】
PCR反応終了後、PCR反応終了液を全量取り出し、ウェル3に入れ、インベーダー試薬と混合した。なお、反応液のうち、ミネラルオイルの下にある反応終了液だけを針の内径2mmのピペットにより抽出した。
なお、この時、A点における表面の温度を測定したが、PCR反応中最大で54℃までしか上昇しなかった。
【0086】
混合した液を40μlとり、2μlづつ20の第二反応部に分注し、その後ウェル4からミネラルオイル80μlとり、4μlづつを同じく20の反応部に分注した。なお分注には針の内径2mmのピペット用いた。
【0087】
次に20の第二反応部に61℃、20分間の加熱環境下に置き、インベーダー反応を行った。反応時には20のウェル状反応部全てで気泡の膨張による反応液の噴出しは見られなかった。
反応が完了したら、蛍光検出を行った。検出した結果、蛍光が検出されSNPの検出ができた。また、蛍光増幅曲線を見たところ、5分でPLATEAUに達し、効率よく反応が検出された。
【0088】
<比較例1>
試薬収容部、第二反応部を基板中央の方へよせた設計にし、第一反応部加熱領域と試薬収容部の最短距離は1.5mmにし、第一反応部の加熱領域と第二反応部の最短距離は1.5mmとした以外は実施例1と同様、図4のような配置のチップを用いて行った。
【0089】
比較例1では、PCR反応時、A点における表面の温度を測定したが、PCR反応中最大で87℃に上昇した。
【0090】
また、第二反応部でインベーダー反応を行った結果、蛍光が検出されSNPの検出ができたが、蛍光増幅曲線を見たところ、PLATEAUに達する時間が14分であり、実施例1に比べ反応効率低かった。
これは第一反応部におけるPCR反応時に試薬収容部の温度が上昇し、クリベースが熱により一部失活してしまったためであると思われる。
【図面の簡単な説明】
【0091】
【図1】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【図2】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【図3】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【図4】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【図5】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【図6】本発明の反応容器の一例を示す概要図である。
【符号の説明】
【0092】
1 反応容器
2 基材
3 試薬収容部
4 反応部
5 反応部の加熱領域
6 試薬収容部と反応部の加熱領域の距離
7 第一反応部
7a 貫通孔開口部突出部
7b 底部形成用フィルム
8 第一反応部の加熱領域
9 第ニ反応部
10 第ニ反応部の加熱領域
11 試薬収容部と第一反応部の加熱領域の距離
12 第一反応部の加熱領域と第ニ反応部の距離
20 加熱部材
A 測定点


【特許請求の範囲】
【請求項1】
同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う反応部および試薬収容部を有してなる反応容器であって、反応部の加熱部と試薬収容部の最短の距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器。
【請求項2】
長尺状の同一基板に、加熱領域を有し加熱反応を行う第一反応部、および加熱領域を有し加熱反応を行う第ニ反応部および試薬収容部を有し、かつ試薬収容部、第一反応部、第ニ反応部の順に配置されてなる反応容器であって、
第一反応部の加熱部と試薬収容部の最短距離が15mm以上であることを特徴とする反応容器。
【請求項3】
前記第一反応部の加熱領域と第ニ反応部の最短距離が15mm以上であることを特徴とする請求項2記載の反応容器。
【請求項4】
前記試薬収容部及び/又は第一反応部及び/又は第ニ反応部が、凹形状または少なくとも一つの開口部を有する空洞形状であることを特徴とする請求項1〜3のいずれかに記載の反応容器。
【請求項5】
前記第一反応部が遺伝子増幅反応部、第二反応部がDNAのハイブリダイゼーション反応部であることを特徴とする請求項1〜4のいずれかに記載の反応容器。
【請求項6】
前記試薬収容部が複数あり、該試薬収容部の一つに酵素が収容されており、かつ酵素が収容されている試薬収容部と、第一反応部の加熱領域の最短距離が30mm以上であることを特徴とする請求項1〜5のいずれかに記載の反応容器。
【請求項7】
前記基材が、樹脂組成物からなり、かつ熱伝導率が0.2(Kcal/m/h/℃)以下であることを特徴とする請求項1〜6のいずれかに記載の反応容器。
【請求項8】
前記基材が、ポリプロピレンを主成分とすることを特徴とする請求項1〜7のいずれかに記載の反応容器。

【図1】
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【図2】
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【図3】
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【図4】
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【図5】
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【図6】
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【公開番号】特開2007−189962(P2007−189962A)
【公開日】平成19年8月2日(2007.8.2)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2006−12233(P2006−12233)
【出願日】平成18年1月20日(2006.1.20)
【出願人】(000003193)凸版印刷株式会社 (10,630)
【Fターム(参考)】