本発明は、制御された量のタンパク質またはタンパク質化合物が表面結合された、生きたまたは死んだバクテリアを含んでなる薬剤の製造のための組成物、および該組成物を調製するための方法に関する。バクテリアは、多価の異種タンパク質ディスプレイ媒介物を提供し、これは粘膜を介した送達のためのワクチンまたは薬剤の製造に使用される。

【発明の詳細な説明】
【発明の詳細な説明】
【０００１】
発明の背景
近年、ｉ）免疫系の機構に対する新たな洞察、およびｉｉ）大多数の病原体の感染経路を擬態する理論的根拠のために、またｉｉｉ）新たに出現した疾患に対して容易に投与され且つ効果的であるワクチンの必要性のために、粘膜ワクチン接種に対する注目が増大している。更に、地球規模でのバイオテロの脅威は、容易に製造でき、且つ訓練された人物がいなくても迅速に投与できる効果的なワクチンを必要としている。
【０００２】
粘膜免疫系は、粘膜の一つの部位での誘導が該粘膜免疫系全体に亘って特定の応答をもたらすので、効果的な免疫応答を得るためには理想的であるように思える。粘膜部位での誘導はまた、最も頻繁には、全身性の免疫応答をもたらす（Huang J. et al., 2004 Vaccine 6:794-801; Verdonck F. et al., 2004 Vaccine 31-32:4291-9）。殆どの病原体は、粘膜表面を介して宿主に感染する。この事実によって、該感染経路の初期段階でその効果を働かせるワクチンの作製が有利となる。結局、病原体に対して特異的なワクチン成分を送達できる、非病原性または弱毒化された病原性微生物の開発に努力が集中されてきた。
【０００３】
最近の数１０年間に、組換え微生物を用いて異種タンパク質を表面ディスプレイするための方法の開発において顕著な進歩がなされた。異種タンパク質の表面ディスプレイは、組換えＤＮＡ技術を使用して、サルモネラ（Arnold H. et al. 2004 Infect Immun. 11:6546-53）のような弱毒化された病原性バクテリア、およびスタフィロコッカス（Wernerus H. et al. 2002 Biotechnol J. 1:67-78）またはラクトバチルス（Grangette C. et al. 2004 Infect Immun. 5:2731-7）のような非病原性バクテリアの両方において示されてきた。異種タンパク質は組換え細胞によって産生され、次いで、該タンパク質は細胞表面に向けられる。微生物中において分泌されたタンパク質を表面に固定するための、幾つかの方法が記載されている。スタフィロコッカスにおいて示された一つのアプローチは、アミノ酸を固定する一続きの細胞壁を、一続きのタンパク質の中に導入することである。このキメラタンパク質は、その分泌の際に細胞壁の中に組み込まれ、ここで、それは一続きの固定アミノ酸を介して細胞壁に結合される（Wernerus H. et al. 2002 Biotechnol J. 1:67-78）。別のアプローチでは、細胞溶解によって産生されたバクテリアゴーストが、抗体または治療的に有効なポリペプチド等の活性物質のためのキャリアまたはターゲッティング媒介物として用いられてきた（CA 2,370,714）。溶解性遺伝子、例えばバクテリオファージ遺伝子Ｅを含有する適切なバクテリア株は、空のゴーストを形成するために、細胞溶解を受けるように誘導される。次いで、望ましい活性物質がこの空のゴーストの中に運ばれ、そこで内側細胞膜表面に固定されることができる。この場合、活性物質は細胞表面に露出されるのではなく、細胞ゴーストの内部に封入される。
【０００４】
幾つかの刊行物は、ワクチン送達技術のために、生きたバクテリアの表面ディスプレイ能力を使用することの顕著な生物学的可能性を記載している（Wernerus H. et al. 2004 Biotechnol Appl Biochem. 40 (3): 209-28）。しかし、これらのアプローチは組換え微生物に依拠しており、遺伝子的に改変された微生物を使用し且つ送達することのリスク、および一般的な反対意見が、ヒトおよび動物において該生ワクチン送達技術を適用することに対する障害になっていた。組換えＤＮＡを含む死滅したバクテリアもまた、それらが結局は環境中で広がり得る組換えＤＮＡを担持するので、リスクとみなされる。例えばバイオテロリストの攻撃下のような一定の環境下では、ＧＭＯに基づく技術の使用は許容可能なリスクとみなされかもしれない。
【０００５】
遺伝子改変されたバクテリア株に依存しない抗原ディスプレイ媒介物
を提供するためには、非常に僅かな試みしか行われてこなかった。米国特許出願ＵＳ２００３／０１８０８１６Ａ１は、非ＧＭグラム陽性菌から、ＡｃｍＡ細胞壁結合ドメインに融合されるタンパク質を結合するための能力が改善された細胞壁材料を得るための方法を開示している（ＷＯ９９／２５８３６）。この開示された方法に従えば、グラム陽性菌を酸性溶液で処理して、タンパク質、リポタイコ酸（lipoteichoic acid）および糖鎖を含む細胞壁成分を除去する。こうして、得られた細胞壁材料は天然のタンパク質を大部分はストリップされるが、外部環境に対する障壁が残留されて、ゴーストと称される。ＡｃｍＡドメインタンパク質を含んでなるキメラタンパク質は、非共有結合でこれらゴーストに結合することができる。
【０００６】
アレルギーに罹患した患者および感染症に罹患した患者の両者に対する治療を提供するために設計されるワクチン接種法の必要性を満たすためには、改善された抗原およびアレルゲン提示モードが必要とされる。ワクチン接種の概念は、免疫系の二つの基本的な特徴、即ち、特異性および記憶に基づいている。ワクチン接種はレシピエントの免疫系をプライミングし、同じタンパク質に繰返し露出されるときに、該免疫系は、例えば微生物感染の攻撃に対して更に活発に反応する地位にあるであろう。ワクチンは、レシピエントにおいて防御的免疫反応を生じさせるために、ワクチン接種に使用することを目的としたタンパク質混合物である。この防御は、ワクチンの中に存在する成分および相同的抗原のみからなるであろう。
【０００７】
他のタイプのワクチン接種に比較して、アレルギーワクチン接種は、アレルギー患者において進行中の免疫反応の存在によって複雑化される。この免疫反応は、アレルゲンに露出される際のアレルギー症状の放出を媒介する、アレルゲン特異的ＩｇＥの存在によって特徴付けられる。従って、天然の供給源に由来するアレルゲンを使用したアレルギーワクチン接種は副作用の固有のリスクを有しており、この副作用の最大の結果は患者の生命を脅かすものである。
【０００８】
この問題を回避するためのアプローチは、三つのカテゴリーに分類される。実際には、２以上のカテゴリーに属する手段が組合されることが多い。第一のカテゴリーの手段は、実質的な累積投与量に達するまで、長時間に亘って小量の投与量を数回投与することを含んでいる。第二のカテゴリーの手段は、アレルゲンを水酸化アルミニウム等のゲル物質の中に組み込むことによる、アレルゲンの物理的修飾を含んでいる。水酸化アルミニウム製剤は、アジュバント効果と、活性なアレルゲン成分の組織濃度を低下させる遅いアレルゲン放出のデポー効果を有している。第三のカテゴリーの手段には、アレルゲン性、即ち、ＩｇＥ結合性を低下させる目的での、アレルゲンの化学的修飾が含まれる。
【０００９】
従来の特異的なアレルギーワクチン接種は、アレルギー疾患のための原因療法である。それは基本的な免疫学的機構に干渉して、患者の免疫状態の持続的な改善をもたらす。従って、特異的なアレルギーワクチン接種の保護効果は、対症薬物治療とは対照的に、治療期間を越えて延長される。この治療を受けている幾人かの患者は治癒し、加えて、殆どの患者は疾患の重篤度および経験した症状の軽減、或いは少なくとも疾患の悪化の停止を経験する。従って、特異的アレルギーのワクチン接種は、喘息を発症する枯草熱のリスクを低減し、新たな感受性を生じるリスクを低減する保護効果を有している。
【００１０】
成功したアレルギーワクチン接種の根底にある免疫学的機構は、詳細には知られていない。特定の病原体に対する抗体の産生のような特異的免疫応答は、適応性免疫応答として知られている。この応答は、病原体に対する非特異的反応である先天的免疫応答から区別することができる。アレルギーワクチンは、適合性免疫応答に対処するようになっており、これは抗原特異性を備えた細胞および分子、例えばＴ細胞および抗原産生Ｂ細胞含んでいる。Ｂ細胞は、対応した特異性のＴ細胞からの補助なしに、抗体産生細胞に成熟することはできない。アレルギー性免疫応答の刺激に関与するＴ細胞は、主にＴｈ２型のものである。Ｔｈ１細胞とＴｈ２細胞との間での新たなバランスの確立は、特異的アレルギーワクチン接種の免疫学的機構にとって有益であり、且つ中心的であることが提案されてきた。これがＴｈ２細胞の減少、Ｔｈ２細胞からＴｈ１細胞へのシフト、またはＴｈ１細胞のアップレギュレーションの何れによってもたらされるかは議論の分かれるところである。最近、調節性のＴ細胞はアレルギーワクチン接種の機構にとって重要であることが提案されている。このモデルに従えば、調節性Ｔ細胞、即ちＴｈ３またはＴｒ１細胞が、対応した抗原特異性のＴｈ１細胞およびＴｈ２細胞の両方をダウンレギュレートする。これらの曖昧さにもかかわらず、活性なワクチンは、アレルゲン特異的Ｔ細胞（好ましくはＴＨ１細胞）を刺激する能力をもたなければならないと一般に信じられている。
【００１１】
特異的アレルギーワクチン接種は、その長所にもかかわらず、広範に使用されるに至っていない。一つの理由は、反復したワクチン接種、特に数ヶ月にも亘る注射を含んでなる伝統的なワクチン接種プログラムに伴う不便さである。更に重要な他の理由は、アレルギー性副作用のリスクである。感染性物質に対する通常のワクチン接種は、１回または数回の高投与量免疫感作を使用して効果的に行われる。しかし、アレルギ性ワクチン接種については、病的免疫応答が既に進行中なので、この戦略を使用することはできない。
【００１２】
従って、従来の特異的アレルギーワクチン接種は、長期間に亘って適用される複数回の皮下免疫感作を使用して行われる。この過程は二つの段階、即ち、投与量増加段階および維持段階に分けられる。投与量増加段階においては、典型的には１６週に亘り、微量から出発して徐々に増大する投与量が適用される。推奨される維持投与量に達したときに、この投与量は、維持段階の間、典型的には６週毎の注射で適用される。各回の注射の後、極めて稀ではあるが、原理的には生命を脅かし得るアナフィラキシー副作用のリスクに起因して、患者は３０分間の医療的看護の下に置かれなければならない。加えて、診療所は、救急救命治療をサポートするための設備を設置すべきである。異なる投与経路に基づくワクチンは、現在の皮下注射に基づくワクチンに固有のアレルギー副作用を排除または低減するであろうし、またより広範な使用を促進し、更には、おそらく家庭での自己ワクチン接種を可能にするであろうことに疑いはない。
【００１３】
特異的アレルギーワクチン接種のためのワクチンを改善する試みが、３０年以上に亘って行われてきており、これには種々雑多なアプローチが含まれている。幾つかのアプローチは、ＩｇＥ反応性の修飾を介してアレルゲン自体を扱ってきた。他のアプローチは、投与経路を取扱ってきた。
【００１４】
免疫系は口腔を介してアクセス可能であり、アレルゲンの舌下投与は既知の投与経路である。投与は、ワクチン製剤を舌下に配置して、短時間、例えば３０〜６０秒だけそこに残留させることによって実行されてよい。
【００１５】
口腔粘膜経路を使用する従来のアレルギーワクチンは、アレルゲン溶液を毎日投与することからなっている。比較において、与えられた治療的（累積的）維持投与量は、比較し得る皮下の維持投与量を５〜５００倍越えた。
【００１６】
ワクチンを製造するために、選択されたタンパク質化合物（例えばアレルゲンまたは抗原）を提示できる改善された生物学的媒介物についての必要性が存在している。
【００１７】
発明の概要
本発明は、１以上の異種タンパク質化合物（proteinaceous compound）を表面ディスプレイする生物学的媒介物（biological vehicle）を含有してなる薬剤として使用するための医薬組成物であって：
ａ）１以上の非病原性バクテリア株の細胞と、
ｂ）二官能性架橋剤（bi-functional cross-linker）によって、前記細胞の表面上のアクセス可能な化学的物質（accessible chemical entity）に共有結合された１以上のタンパク質化合物と
を含んでなり、前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まず、また前記二官能性架橋剤はシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に結合され、また前記タンパク質化合物および前記架橋剤は前記細胞に対して異種起源である医薬組成物に向けられている。好ましくは、前記薬剤は、動物もしくはヒト患者の治療または予防的処置のためのものである。
好ましい実施形態において、前記二官能性架橋剤は、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジンおよびパラホルムアルデヒドからなる群から選択される。
【００１８】
更に、当該組成物の生物学的媒介物は、遺伝子的に修飾されたバクテリア株、もしくは遺伝子的に修飾されていないバクテリア株、またはそれらの組み合せの細胞を含んでなるものでよい。好ましい実施形態において、当該組成物のバクテリア株は、ラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ロイコノストック（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ）、Ｎ族ストレプトコッカス（Ｇｒｏｕｐ Ｎ Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、非病原性のスタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、および非病原性のバチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）から選択されるバクテリア属のメンバーである。
【００１９】
一つの実施形態において、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原またはその変異体である。或いは、前記１以上のタンパク質化合物は、アレルゲン、動物もしくはヒトの癌抗原、または動物もしくはヒト起源の自己抗原、またはそれらの変異体である。
【００２０】
本発明による組成物は、更に、二官能性架橋剤および／またはスペーサー化合物を含んでよい。当該組成物において、二官能性架橋剤またはスペーサーを含んでなる結合したタンパク質化合物分子の細胞当りの数は、１〜約１００，０００であってよい。スペーサーの不存在において、細胞当りの結合したタンパク質化合物分子の数は、１〜約１０，０００の範囲である。当該組成物は更に、封入された製剤の中に含まれてよい。
【００２１】
当該組成物は、薬剤として使用されてよい。特に、当該組成物は、動物またはヒトの患者における感染性疾患、癌、アレルギー、および自己免疫疾患からなる群から選択される疾患を予防および／または治療するための薬剤製造のために使用されてよい。従って、本発明の組成物は、動物またはヒトの患者の疾患またはアレルギーの予防および／または治療に使用されてよく、その際、患者は有効投与量の当該組成物を投与される。
【００２２】
本発明は更に、１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる本発明の医薬組成物を調製する方法であって、
ｉ）１以上のバクテリア株の細胞、ｉｉ）１以上の異種タンパク質化合物、およびｉｉｉ）異種二官能性架橋剤を含有する混合物を調製する工程と；該混合物をインキュベートして、前記二官能性架橋剤がシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に結合された前記生物学的媒介物を形成する工程と；該生物学的媒介物を前記混合物から分離する工程とを含んでなり、前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まない方法を提供する。好ましい実施形態において、前記混合物は０℃以下の温度、好ましくは−１℃〜−３０℃の温度、最も好ましくは−２０℃でインキュベートされる。
【００２３】
本発明の方法によれば、前記生物学的媒介物は、遺伝子的に修飾されていないバクテリア株、または遺伝子的に修飾されたバクテリア株の細胞を含んでよい。更に、本発明はラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性スタフィロコッカス、および非病原性バチルスから選択されるバクテリア属のメンバーであるバクテリア株を用いて実施される。
【００２４】
本発明の方法に従えば、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原またはその変異体であってよい。別の実施形態において、前記１以上のタンパク質化合物は、アレルゲンまたはその変異体であってよく；或いは、前記１以上の化合物は動物もしくはヒトの癌抗原およびその変異体、または自己抗原およびその変異体であってよい。
【００２５】
本発明の方法の更なる実施形態において、前記混合物は更に、二官能性架橋剤および／またはスペーサー化合物を含有してよい。該方法は、更に、前記生物学的媒介物を含有する組成物を封入する工程を含んでよい。
【００２６】
発明の説明
Ｉ．図面の簡単な説明
図１．１μｇ／ｍＬまたは２μｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼを使用した、ラクトバチルスに対する化学的架橋結合。１０¹⁰細胞を含有する架橋反応混合物の細胞画分または上清画分において検出された、β−ガラクトシダーゼ活性の量。
【００２７】
図２． ラクトバチルスに対するアラビノースイソメラーゼの化学的架橋結合。１０¹⁰細胞を含有する架橋反応混合物の細胞画分または上清画分において検出された、アラビノースイソメラーゼ活性の量。表面架橋結合された酵素は三角形の記号で描かれ、酵素の合計量は四角形の記号で描かれている。
【００２８】
図３． エンハンサ分子としてキトサンを使用した、ラクトバチルスに対するβ−ガラクトシダーゼの化学的架橋。
【００２９】
図４． 実施例１１に記載された、グルタルアルデヒドを使用したラクトバチルス細胞に対するＢｅｔｖ１タンパク質の化学的架橋結合。パネルＡは、グルタルアルデヒドを使用して架橋結合されたペレット材料の位相差写真を示している。パネルＢは、グルタルアルデヒドを添加しなかった場合の、Ｂｅｔｖ１タンパク質およびラクトバチルス細胞の混合物からの細胞を示している。各パネルの右側の写真は、左側の写真で分析された物質から選択された細胞を更に高倍率で示している。
【００３０】
図５． グルタルアルデヒドを使用してラクトバチルス細胞に架橋結合されたＢｅｔｖ１の表面分布。パネルＡおよびＢは、実施例１２に記載した通りに調製されたペレット材料中の細胞の写真を示している。パネルＡは、Ｂｅｔｖ１タンパク質が存在する架橋反応から誘導された細胞を示している；一方、Ｂは、Ｂｅｔｖ１タンパク質を省略したネガティブ対照反応から誘導された細胞を示している。Ｂｅｔｖ１タンパク質の検出は、実施例１２に記載したように、ウサギ由来の一次抗Ｂｅｔｖ１抗体およびＣｙ−３標識された二次抗ウサギ抗体を使用して行われた。左側の写真は位相差画像であり、右側の写真は蛍光画像（励起光および発行のためのフィルター限界は、それぞれ５４５〜５７５ｎｍおよび６１０〜６８０ｎｍ）であり、これらは顕微鏡およびカメラ共に同一の設定を使用した同じ細胞の写真である。
【００３１】
図６． ＳＬＩＴ処理、免疫感作およびその後のインビトロでの再刺激後の脾臓細胞増殖。四群のマウスが、３週間、毎日１回次の投与を受けた：ＢｅｔＶ−Ｌｂ：Ｌ．アシドフィルスＸ３７に結合されたＢｅｔＶ１を含むワクチン複合体； Ｌｂ：未処理のＬ．アシドフィルスＸ３７； ＢｅｔＶ１ ２．５μｇ：１日当り精製ＢｅｔＶ１タンパク質２．５μｇ； ＢｅｔＶ１ ５μｇ：１日当り精製ＢｅｔＶ１タンパク質５μｇ； 緩衝液：ネガティブ対照群は緩衝液の投与を受ける。
【００３２】
図７． 未処理のラクトバチルス、ＬａｃＳ結合したラクトバチルス、またはＬａｃＳタンパク質単独を使用したインビトロでの樹状細胞刺激。ＬＸ３７：未処理のＬ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ Ｘ３７； ＬＸ３７＋ｌａｃＳ＋ｇｌｕｔ：グルタルアルデヒドを使用してラクトバチルスに表面結合されたβ−ガラクトシダーゼ； ＬａｃＳ：タンパク質ＬａｃＳ単独。
【００３３】
ＩＩ．用語の定義
アレルゲン： 過敏性反応またはアレルギー反応を誘起する抗原である。
抗原： 免疫応答を誘導できる何れかのタンパク質物質。
抗原変異体： 天然の抗原からアミノ酸組成が変化した何れかの抗原。
ＡＰＩ： 有効な医薬成分。
架橋剤： 二つの反応基を含み、それによって二つの標的基を共有結合させる手段を提供する化学試薬。ホモ二官能性架橋剤では前記反応基は同一であり、同様の基の間に共有結合を形成する。ヘテロ二官能性架橋剤では、前記反応基は異なる化学性を有し、異なる官能基の間での架橋の形成を可能にする。異種の二官能性架橋剤とは、それが結合される細胞とは異なる起源を有する（即ち生来のものではない）化学試薬として定義される。
ＤＣ： 樹状細胞。
ＦＤＡ： 食品医薬品局。
ＧＭ： 遺伝子的に修飾された。
ＧＭＯ： 遺伝子的に修飾された生物。
ＧＬＡ： グルタルアルデヒド。
【００３４】
異種タンパク質化合物： それが共有結合または非共融結合によって表面結合または架橋結合される細胞とは異なる起源を有する（即ち生来のものではない）タンパク質含有化合物として定義される。
Ｍ９緩衝液： ０．６％のＮａ₂ＨＰＯ₄、０．３％のＫＨ₂ＰＯ₄、０．５％のＮａＣｌ、０．０２５％のＭｇＳＯ₄を含有する水溶液。
ＭＲＳ： ラクトバチルスの培養に適した培地。
ＯＮＰＧ： オルト−ニトロフェニル−β−Ｄ−ガラクトピラノシド
ＰＣＲ： ポリメラーゼ連鎖反応
スペーサー： 架橋反応を高める複数の反応器を備えた分子。細胞表面と標的タンパク質との間のブリッジとして使用される。
標的タンパク質： バクテリア細胞表面上にディスプレイされるべきタンパク質化合物。
【００３５】
トランスジェニック核酸分子： ホスト起源のゲノム（プラスミドＤＮＡ、エピソームＤＮＡおよび染色体ＤＮＡの両方を含む）の中に導入されて、安定に組込まれる核酸分子である。ここで前記ＤＮＡはタンパク質をコードする配列を含んでなり、また前記トランスジェニック核酸分子は天然のホスト生物には存在せず、遺伝子修飾技術によってホスト細胞の中に導入される。
室温： １５〜２５℃、好ましくは１８℃である。
【００３６】
ＩＩＩ．詳細な説明
本発明は、１以上のタンパク質化合物の表面ディスプレイを特徴とし、その性質がワクチン送達、全細胞バイオ吸収材、バイオフィルタ、微小バイオ触媒、および診断ツールの領域において特別な用途を有する生物学的媒介物を提供する。本発明は、治療的に有効で安全な公的に許容可能なワクチンは、以下の成分および特性を備えるべきであるとの認識に基づいている：
ａ）好ましくは、動物もしくはヒト（患者）の粘膜における免疫担当細胞を探し当て、これに一時的に結合できる生物学的な非病原性媒介物、
ｂ）前記媒介物は、免疫担当細胞に抗原提示して特異的免疫応答を導くことができる１以上の異種抗原の表面ディスプレイを提供し、
ｃ）またアジュバントまたは免疫モジュレータとして、免疫細胞を刺激し、それによって好ましくは前記患者のホスト細胞を含む全体の免疫系を刺激して、所望のサイトカインを分泌することができ、
ｄ）１以上の表面ディスプレイされた異種抗原を含んでなる前記ワクチンは、安価で且つ製造が容易であり、複雑な架橋剤、例えばバクテリア壁ムレイン前駆体を合成する必要性を回避する。
【００３７】
非病原性バクテリアは、ａ）およびｃ）の性質を提供し、それによってこれらバクテリア表面に存在する特定のタンパク質は、それらが粘膜中の標的細胞を探し当てて、これに結合することとを可能にし、バクテリア−細胞のクロストークによって種々の応答、例えばサイトカインおよびムチンの産生を開始する（Christensen H.R. et al. 2002, J Immunology 168:171-8, Mack D.R. et al. 2003 Gut 52:827-33）。バクテリア細胞の粘膜への局在化は、Adlerberth I. et al., 1996 Appl Environ Microbiol 7:2244-51によって既述されたように、哺乳類細胞へのマンノース感受性結合によって媒介され得る。従って、本発明はその表面成分が未だ存在する非病原性バクテリア株を用い、それによって表面に局在する抗原の効果的な提示を支持することができる。本発明は、１以上の異種タンパク質化合物が表面結合される非病原性バクテリア細胞を提供することによって、ｂ）の要件を満たす。該異種化合物は、当該バクテリア細胞の表面に親和性結合または吸着されてよく、またはカップリング剤を用いて共有結合されてもよい。天然の供給源から単離され、化学的に合成され、または組換えＤＮＡ技術を使用して産生されたタンパク質化合物が、本発明のバクテリア表面に結合されてよい。本発明のバクテリア表面に結合およびディスプレイされる異種タンパク質化合物は、該バクテリア細胞自身によって合成および分泌され得る化合物に限定されない。前記異種タンパク質化合物は、その合成が本発明のバクテリアには存在しない触媒工程に依拠した、翻訳後修飾を含むことができる。ここに本発明の一つの顕著な利点が存在し、前記バクテリア表面にディスプレイされた異種タンパク質化合物は、それが表面にディスプレイされるバクテリア細胞の生合成能力の範囲内にある化合物に限定されることなく、その組成および構造を特定の用途のために加工し得る化合物であってよい。本発明の方法は、タンパク質化合物の高密度パッキングされた表面ディスプレイを提供することができ、これは抗原提示の再のそれらの免疫原性を向上させるように働く。本発明の所定のバクテリアサンプルにおける表面結合されたタンパク質化合物の量は、正確に決定することができるので、治療製剤としての抗原投与量の正確な制御を容易にし、これが本発明のもう一つの顕著な利点である。
【００３８】
既知の技術とは対照的に、ＧＭバクテリアによる異種抗原タンパク質の表面ディスプレイに基づけば、本発明の一実施形態における非病原性バクテリア株は、当該表面ディスプレイされた異種タンパク質化合物が該細胞自身によって組換え発現されないので、遺伝子的に修飾されたものとして分類されるものではない。別の実施形態において、１以上の異種タンパク質化合物が結合される前記非病原性バクテリア株は、それ自身が遺伝子的に修飾される。
【００３９】
本発明の実施するために適した非病原性バクテリア株には、グラム陽性バクテリア株、好ましくは、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性スタフィロコッカス、非病原性バチルスからなるバクテリア属の群由来の種から選択される。より好ましくは、前記非病原性バチルス株は、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性スタフィロコッカスからなるバクテリア属からなる群から選択される種から選択される。更に好ましくは、前記非病原性バクテリア株は、ラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムからなるバクテリア属の群から選択される種から選択される。
更に詳細に言えば、前記好ましい非病原性バクテリア株は、ラクトバチルス・アセトトレランス（Lactobacillus acetotolerans）、ラクトバチルス・アシジピシチス（Lactobacillus acidipiscis）、ラクトバチルス・アシドフィルス（Lactobacillus acidophilus）、ラクトバチルス・アギリス（Lactobacillus agilis）、ラクトバチルス・アルギドゥス（Lactobacillus algidus）、ラクトバチルス・アリメタリウス（Lactobacillus alimentarius）、ラクトバチルス・アミロリティクス（Lactobacillus amylolyticus）、ラクトバチルス・アミロフィルス（Lactobacillus amylophilus）、ラクトバチルス・アミロボルス（Lactobacillus amylovorus）、ラクトバチルス・アニマリス（Lactobacillus animalis）、ラクトバチルス・アリゾネンシス（Lactobacillus arizonensis）、ラクトバチルス・アビアリウス（Lactobacillus aviarius）、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス（Lactobacillus bifermentans）、ラクトバチルス・ブレビス（Lactobacillus brevis）、ラクトバチルス・ブフネリ（Lactobacillus buchneri）、ラクトバチルス・カゼイ（Lactobacillus casei）、ラクトバチルス・コエロホミニス（Lactobacillus coelohominis）、ラクトバチルス・コリノイデス（Lactobacillus collinoides）、ラクトバチルス・コリニホルミス・亜種コリニホルミス（Lactobacillus coryniformis subsp. Coryniformis）、ラクトバチルス・コリニホルミス亜種トルケンス（Lactobacillus coryniformis subsp. Torquens）、ラクトバチルス・クリスパツス（Lactobacillus crispatus）、ラクトバチルス・クルバツス（Lactobacillus curvatus）、ラクトバチルス・サイプリカセイ Lactobacillus cypricasei）、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクス（Lactobacillus delbrueckii subsp. Bulgaricus）、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ（Lactobacillus delbrueckii subsp delbrueckii）、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ラクチス（Lactobacillus delbrueckii subsp. Lactis）、ラクトバチルス・ドゥリアヌス（Lactobacillus durianus）、ラクトバチルス・エクイ（Lactobacillus equi）、ラクトバチルス・ファルチミニス（Lactobacillus farciminis）、ラクトバチルス・フェリントシェンシス（Lactobacillus ferintoshensis）、ラクトバチルス・フェルメントゥム（Lactobacillus fermentum）、ラクトバチルス・フォルニカリリス（Lactobacillus fornicalis）、ラクトバチルス・フルクチボランス（Lactobacillus fructivorans）、ラクトバチルス・フルメンティ（Lactobacillus frumenti）、ラクトバチルス・フクエンシス（Lactobacillus fuchuensis）、ラクトバチルス・ガリナルム（Lactobacillus gallinarum）、ラクトバチルス・ガッセリ（Lactobacillus gasseri）、ラクトバチルス・グラミニス（Lactobacillus graminis）、ラクトバチルス・ハムステリ（Lactobacillus hamsteri）、ラクトバチルス・ヘルベチクス（Lactobacillus helveticus）、ラクトバチルス・ヘルベチクス亜種ジュグルチ（Lactobacillus helveticus subsp. Jugurti）、ラクトバチルス・ヘテロヒオッキイ（Lactobacillus heterohiochii）、ラクトバチルス・ヒルガルディイ（Lactobacillus hilgardii）、ラクトバチルス・ホモヒオッキイ（Lactobacillus homohiochii）、ラクトバチルス・インテスチナリス（Lactobacillus intestinalis）、ラクトバチルス・ジャポニクス（Lactobacillus japonicus）、ラクトバチルス・ジェンセニイ（Lactobacillus jensenii）、ラクトバチルス・ジョンソニイ（Lactobacillus johnsoniiＩ，ラクトバチルス・ケフィリ（Lactobacillus kefiri）、ラクトバチルス・キムチイ（Lactobacillus kimchii）、ラクトバチルス・クンケエイ（Lactobacillus kunkeei）、ラクトバチルス・レイヒマンニイ（Lactobacillus leichmannii）、ラクトバチルス・レティバジ（Lactobacillus letivazi）、ラクトバチルス・リンドネリ（Lactobacillus lindneri）、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス（Lactobacillus malefermentans）、ラクトバチルス・マリ（Lactobacillus mali）、ラクトバチルス・マルタロミクス（Lactobacillus maltaromicus）、ラクトバチルス・マニホチボランス（Lactobacillus manihotivorans）、ラクトバチルス・ミンデンシス（Lactobacillus mindensis）、ラクトバチルス・ムコサエ（Lactobacillus mucosae）、ラクトバチルス・ムリヌス（Lactobacillus murinus）、ラクトバチルス・ナゲリイ（Lactobacillus nagelii）、ラクトバチルス・オリス（Lactobacillus oris）、ラクトバチルス・パニス（Lactobacillus panis）、ラクトバチルス・パンテリ（Lactobacillus pantheri）、ラクトバチルス・パラブフネリ（Lactobacillus parabuchneri）、ラクトバチルス・パラカセイ亜種パラカセイ（Lactobacillus paracasei subsp. Paracasei）、ラクトバチルス・パラカセイ亜種シュードプランタルム（Lactobacillus paracasei subsp Pseudoplantarum）、ラクトバチルス・パラカセイ亜種トレランス（Lactobacillus paracasei subsp. Tolerans）、ラクトバチルス・パラケフィリ（Lactobacillus parakefiri）、ラクトバチルス・パラリメンタリウス（Lactobacillus paralimentarius）、ラクトバチルス・パラプランタルム（Lactobacillus paraplantarum）、ラクトバチルス・ペントスス（Lactobacillus pentosus）、ラクトバチルス・ペロレンス（Lactobacillus perolens）、ラクトバチルス・プランタルム（Lactobacillus plantarum）、ラクトバチルス・ポンチス（Lactobacillus pontis）、ラクトバチルス・プシタチ（Lactobacillus psittaci）、ラクトバチルス・リューテリ（Lactobacillus reuteri）、ラクトバチルス・ラムノスス（Lactobacillus rhamnosus）、ラクトバチルス・ルミニス（Lactobacillus ruminis）、ラクトバチルス・サケイ（Lactobacillus sakei）、ラクトバチルス・サリバリウス（Lactobacillus salivarius）、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリチニウス（Lactobacillus salivarius subsp. Salicinius）、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリバリウス（Lactobacillus salivarius subsp. Salivarius）、ラクトバチルス・サンフランシセンシス（Lactobacillus sanfranciscensis）、ラクトバチルス・シャルペアエ（Lactobacillus sharpeae）、ラクトバチルス・スエビクス（Lactobacillus suebicus）、ラクトバチルス・テルモフィルス（Lactobacillus thermophilus）、ラクトバチルス・テルモトレランス（Lactobacillus thermotolerans）、ラクトバチルス・ワクチノステルクス（Lactobacillus vaccinostercus）、ラクトバチルス・バギナリス（Lactobacillus vaginalis）、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス（Lactobacillus versmoldensis）、ラクトバチルス・ビツリヌス（Lactobacillus vitulinus）、ラクトバチルス・ベルミホルメ（Lactobacillus vermiforme）、ラクトバチルス・ゼアエ（Lactobacillus zeae）、ビフィドバクテリウム・アドレッセンチス（Bifidobacterium adolescentis）、 ビフィドバクテリウム・アエロフィルム（Bifidobacterium aerophilum）、ビフィドバクテリウム・アンギュラツム（Bifidobacterium angulatum）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Bifidobacterium animalis）、ビフィドバクテリウム・アステロイデス（Bifidobacterium asteroides）、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Bifidobacterium bifidum）、ビフィドバクテリウム・ボウム（Bifidobacterium boum）、ビフィドバクテリウム・ブレベ（Bifidobacterium breve）、 ビフィドバクテリウム・カテヌラツム（Bifidobacterium catenulatum）、ビフィドバクテリウム・コエリヌム（Bifidobacterium choerinum）、ビフィドバクテリウム・コリネフォルメ（Bifidobacterium coryneforme）、ビフィドバクテリウム・クニクリ（Bifidobacterium cuniculi）、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Bifidobacterium dentium）、ビフィドバクテリウム・ガリクム（Bifidobacterium gallicum）、ビフィドバクテリウム・ガリナルム（Bifidobacterium gallinarum）、ビフィドバクテリウム・インディクム（Bifidobacterium indicum）、ビフィドバクテリウム・ロングム（Bifidobacterium longum）、ビフィドバクテリウム・ロングム亜種ロングム（Bifidobacterium longum subsp. Longum）、ビフィドバクテリウム・ロングム亜種インファンティス（Bifidobacterium longum subsp. Infantis）、ビフィドバクテリウム・ロングム亜種スイス（Bifidobacterium longum subsp. Suis）、ビフィドバクテリウム・マグヌム（Bifidobacterium magnum）、ビフィドバクテリウム・メリチクム（Bifidobacterium merycicum）、ビフィドバクテリウム・ミニマム（Bifidobacterium minimum）、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム（Bifidobacterium pseudocatenulatum）、ビフィドバクテリウム・シュードロングム（Bifidobacterium pseudolongum）、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種グロボスム（Bifidobacterium pseudolongum subsp. Globosum）、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種シュードロングム（Bifidobacterium pseudolongum subsp. Pseudolongum）、ビフィドバクテリウム・プシクロアエロフィルム（Bifidobacterium psychroaerophilum）、ビフィドバクテリウム・プロルム（Bifidobacterium pullorum）、ビフィドバクテリウム・ルミナンティウム（Bifidobacterium ruminantium）、ビフィドバクテリウム・サエキュラレ（Bifidobacterium saeculare）、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ（Bifidobacterium scardovii）、ビフィドバクテリウム・スブティレ（Bifidobacterium subtile）、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム（Bifidobacterium thermoacidophilum）、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム亜種スイス（Bifidobacterium thermoacidophilum subsp. Suis）、ビフィドバクテリウム・テルモフィルム（Bifidobacterium thermophilum）、ビフィドバクテリウム・ウリナリス（Bifidobacterium urinalis）からなるバクテリア種の群から選択される種から選択される。
【００４０】
前記非病原性バクテリアの表面に結合され且つディスプレイされる１以上のタンパク質化合物は、広範な種類の化合物から選択されてよく、該タンパク質は更に、糖鎖、脂質または他の翻訳後付加された修飾を含んでもよい。好ましくは、該化合物は、置換（翻訳後修飾を意味する）または非置換のタンパク質もしくはペプチドであり、ここでの前記化合物は動物またはヒトにおいて液性または細胞性応答の発生を誘導することができ、例えば抗原、アレルゲン、アレルゴイド、ペプチド、タンパク質、ハプテン、糖タンパク質、ペプチド核酸（ＰＮＡｓ、合成遺伝子擬似物の一種）、およびウイルス性またはバクテリア性物質、ならびにそれらのアナログまたは誘導体である。このような修飾は、化学的修飾または合成的修飾、例えば１以上のアミノ酸のＰＥＧ化（ＰＥＧ＝ポリエチレングリコール）、ビオチニル化、脱アミノ化、マレイン化、置換によって、架橋によって、グリコシル化によって、または他の組み合え技術または合成技術によって行なうことができる。こ
の用語はまた、天然に生じる突然変異、アイソフォームおよびレトロインバースアナログを含むものである。
【００４１】
更に好ましくは、前記化合物は、動物またはヒトにおいて特異的抗体の発生および／または特異的Ｔ細胞応答を誘導することができる。或いは、前記化合物は、動物もしくはヒトにおいて細胞障害性Ｔ細胞応答の発生を誘導することができ、または前記化合物はアレルギー応答の発生を誘導することができる。更に、前記化合物は予め存在する抗体またはＴ細胞と反応できてよく、或いは、肥満細胞上のＩｇＥ抗体に結合できまたは先に感作された哺乳類におけるＩ型アレルギー反応を媒介できる化合物であってよい。好ましい実施形態において、前記タンパク質化合物は動物またはヒトにおいて、１以上の感染性物質またはアレルゲンに対する免疫の発生を誘導することができる。或いは、前記タンパク質化合物は、動物またはヒトにおいて、自己免疫疾患に対する免疫の発生を誘導することができる。更なる実施形態において、タンパク質化合物またはその変異体は、動物またはヒトにおける癌抗原として働くものである。
【００４２】
動物またはヒトにおいて免疫の発生を誘導する前記タンパク質化合物は、例えば以下の群から選択されるバクテリア、ウイルス、真菌、プロトゾア、およびプリオンの１以上を起源とするもの、またはそれらの変異体であってよい：
＜抗原供給源＞
ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（例えば選択された肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルス）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン（例えばクロイッツフェルト−ヤコブ病または変異体）、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫（Schistosoma）、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属（Epidermophyton）、小胞子菌属（Microsporum）、白癬菌属（Trichophyton）、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ（Onychocola）、シタリジウム（Scytalidium）、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌（Zygomycetes）、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマ。
【００４３】
アレルギーの治療もしくは緩和、または治療的若しくは予防的アレルギーワクチン接種のためのタンパク質化合物は、下記の供給源の１以上を起源とするものであってよい：
＜アレルゲン供給源＞
「アレルゲン」の用語は、アレルギー、即ち、個体が反復露出されたときにＩｇＥ媒介性反応を誘導することが報告されている天然に存在するタンパク質、またはタンパク質の混合物を意味する。本発明の目的にとって、アレルゲンは、植物、ペット、家畜、昆虫、蛛形類の動物、および食品に由来するものであってよく、カバノキおよび分類学的に関連した樹木由来の花粉、日本の杉樹、オリーブ樹、ブタクサ、雑草（weed）、草（grass）、刺すもの、昆虫、蚊／蚋、ゴキブリ、塵ダニ、屋内カビ、屋外カビ、ウシ、ネコ、イヌ、ウマ、齧歯類、ピーナッツ、ナッツ、果実、ミルク、大豆、小麦、卵、魚、および甲殻類が含まれる。特に、適切には、アレルゲンは中でも、樹木、草、ハーブ、真菌、ハウスダストダニ、貯蔵物ダニ、ゴキブリ、動物の毛、およびフケを起源とする吸入性アレルゲンであってよい。樹木、草およびハーブに由来する重要な花粉アレルゲンは、中でもカバノキ（Betula）、ハンノキ（Alnus）、ハシバミ（Corylus）、クマシデ（Carpinus）、およびオリーブ（Olea）が含まれる分類学上の目であるファガレス（Fagales）、オレアレス（Oleales）およびピナレス（Pinales）、中でもロリウム（Lolium）、フレウム（Phleum）、ポア（Poa）、シノドン（Cynodon）、ダクチリス（Dactylis）およびセカーレ（Secale）の属を含むポアレス（Poales）目、中でもアムブロシア（Ambrosia）、アルテミシア（Artemisia）およびパリエタリア（Parietaria）属のハーブを含むアステラレス（Asterales）およびロサレス（Rosales）、ウルチカレス（Urticales）の目を起源とするものである。真菌由来の重要な吸入性アレルゲンは、中でも、アルテルナリア（Alternaria）属およびクラドスポリウム（Cladosporium）属を起源とするものである。他の重要な吸入性アレルゲンは、デルマトファゴイデス属のハウスダストダニ、およびブロミア属（Blomia）、ユーログリフス属（Euroglyphus）およびレピドグリフス属（Lepidoglyphus）の貯蔵ダニに由来するもの、ゴキブリ由来のもの、並びにネコ、イヌ、ウマ、およびマウス、ラット、モルモットおよびウサギのような齧歯類等の動物由来ものである。更に、本発明による組換えアレルゲンは、刺したり噛んだりする昆虫、例えばミツハチ（アピダエ上科）、スズメバチ（ベスピデア上科）およびアリ（フォルミコイダエ上科）を含む分類学状の膜翅目（Hymenoptera）由来のものを含む毒液アレルゲンであってもよい。
【００４４】
特定のアレルゲン成分には、例えば、ファガレス（Fagales）目のBet v 1（B. verrucosa、カバノキ）、Aln g 1（Alnus glutinosa、ハンノキ）、Cor a 1（Corylus avelana、ハシバミ）、およびCar b 1（Carpinus betulus、クマシデ）が含まれる。他は、Cry j 1（Pinales）、Amb a 1および2、Art v 1（Asterales）、Par j 1（Urticales）、Ole e 1（Oleales）、Ave e 1、Cyn d 1、Dac g 1、Fes p 1、Hol l 1、Lol p 1および5、Pas n 1、Phl p 1および5、Poa p 1、2および5、Sec c 1および5、Sor h 1（種々の草の花粉）、Alt a 1およびCla h 1（真菌）、Der f 1および2、Der p 1および2、Der m 1（それぞれハウスダストダニ、D. farinae、D. pteronyssinus およびD. microceras）、Lep d 1および2、並びにBlo t 1および2、Eur m 1および2、Gly d 1および2（Lepidoglyphus destructor; Blomia Tropicalis and Glyphagus domesticus storage mite and Euroglyphus maynei）、Bla g 1および2、Per a 1（それぞれゴキブリ、Blatella germanicaおよびPeriplaneta americana）、Fel d 1（ネコ）、Can f 1（イヌ）、Equ c 1, 2および3（ウマ）、Apis m 1および2（ミツバチ）、Ves v 1, 2および5、Pol a 1, 2および5（全てスズメバチ）、並びにSol i 1, 2, 3および4（フシアリ）である。
【００４５】
該アレルゲンは、アレルゲン抽出物、単離された精製アレルゲン、およびその変異体または断片の形態であってよい。該アレルゲンはまた、組換え遺伝子発現技術によって得られたもの、即ち、組換えアレルゲンおよびその変異体もしくは断片、またはその突然変異体および断片であってよい。例えば、該組換えアレルゲンは、組換えＢｅｔｖ１、Ｆｅｌ ｄ１、Ｐｈｌ ｐ１もしくは５、Ｌｏｌ ｐ１もしくは５、Ｓｏｒ ｈ１、Ｃｙｎ ｄ１、Ｄａｇ ｇ１および５、Ｄｅｒ ｆまたはｐ１もしくは２、Ａｍｂ ａ１および２、Ｃｒｙ ｊ１および２、Ｖｅｓ ｖ１、２および５、またはＤｏｌ ｍ１、２および５、Ａｐｉ ｍ１、またはゴキブリＢｌａ ｇ１および２、Ｐｅｒ ａ１であってよい。 その組成が修飾されるＢｅｔ ｖ１の突然変異体、またアミノ酸を含む置換に潜在的に適するＢｅｔ ｖ１のアミノ酸が、例えばＷＯ９９／４７６８０、ＷＯ０２０４０６７６、ＷＯ０３／０９６８６９に記載されている。
【００４６】
ここで使用される「アレルゲン抽出物」の表現は、「アレルゲン抽出物」（H. Ipsen et al, chapter 20 in Allergy, principle and practise (Ed. S. Manning) 1993, Mosby-Year Book, St. Louis）に記載されたように、生物学的アレルゲン供給材料の抽出によって得られた抽出物を意味する。このような抽出物は、水溶性材料の水抽出に続き、濾過等の精製ステップで溶液、即ち抽出物を得ることによって得ることができる。次いで、該抽出得物は更なる精製および／または凍結乾燥等の処理を受けて、実質的に全ての水を除去されてよい。一般に、アレルゲン抽出物は、タンパク質および他の分子の混合物を含んでいる。アレルゲンタンパク質は屡々、主アレルゲン、中間アレルゲン、副アレルゲン、または分類なしとして分類される。アレルゲン抽出物は、一般的に、主アレルゲンおよび副アレルゲンの両方を含有する。主アレルゲンは、一般的には平均アレルゲン抽出物の約５〜１５％をなしており、より頻繁には約１０％をなしている。ここで言うアレルゲン抽出物の量は、このようなアレルゲン抽出物の乾燥分含量を意味する。
【００４７】
好ましくは、該乾燥材料の水含量は１０重量％、より好ましくは５重量％を越えない。
生物学的アレルゲン供給源材料は、汚染材料、例えば外来花粉、ならびにアレルゲン花粉源材料のための植物および花の破片を含んでよい。
汚染の程度は、最小化されるべきである。好ましくは、汚染物の含量は生物学的供給源材料の１０％（ｗ／ｗ）を越えるべきではない。
【００４８】
通常、アレルゲン抽出物は、ＢＣＡまたはロウリー（Ｌｏｗｒｙ）のような標準のタンパク質アッセイで測定したときに、アレルゲン抽出物の乾燥分含量の少なくとも１０％のタンパク質を含有し、残部は他の「非タンパク質材料」からなっていて、これらは生物学的アレルゲン供給源を起源とする脂質、炭水化物、または結合水であってよい。
【００４９】
アレルゲン抽出物は、液体アレルゲン抽出物を８００ミクロバール未満の圧力で、且つ１００時間以下の時間で凍結乾燥し、水を除去することによって得られる凍結乾燥材料の形態で製剤化および貯蔵されてよい。アレルギー抽出物の分野において、国際的に許容される標準化方法は存在しない。抽出物強度、即ち、生物的能力の多くの異なる単位が存在する。用いられる方法および使用される単位は、通常、アレルゲン含量および生物学的活性を評価する。ここでの例は、ＳＱ単位（標準化された品質単位）、ＢＡＵ（生物学的アレルゲン単位）、ＢＵ（生物学的単位）、ＵＭ（質量の単位）、ＩＵ（国際単位）、およびＩＲ（反応性の指数）である。従って、ここに開示される以外の起源の抽出物が使用されるのであれば、それらは、ＳＱ単位または上記で述べた何れかの単位で能力を決定するために、ここに開示された抽出物に対して標準化される必要がある。この主題は、文献［“Allergenic extracts”, H. Ipsen et al, chapter 20 in Allergy, principle and practise (Ed. S. Manning) 1993, Mosby-Year Book, St. Louis and Lowenstein H. (1980) Arb Paul Ehrlich Inst 75:122］の中で取り扱われている。与えられた抽出物のバイオ能力、即ち、インビボでのアレルゲン活性は多くの因子に依存し、最も重要なのは、該抽出物中の主アレルゲンの含量であり、これは生物学低供給源材料の組成と共に変化する。
望ましいバイオ能力を得るために使用されるアレルゲンのグラムでの量は、問題の抽出物の種類と共に変化し、所定の種類の抽出物について、アレルゲン抽出物の量は、当該抽出物の実際のバイオ能力と共に一つのバッチからもう一つのバッチへとバッチ毎に変化する。
【００５０】
与えられた抽出物のバッチについて、望ましいバイオ能力を得るために使用されるアレルゲン抽出物のグラムでの量は、以下の手順を使用して決定されてよい：
ａ）１以上の免疫学的インビボ試験を使用して、種々の量の参照抽出物のバイオ能力が決定され、バイオ能力と参照抽出物の量との間の関係が樹立される。前記免疫学的インビボ試験の例は、皮膚穿刺試験（ＳＰＴ）、結膜吸入誘発試験（ＣＰＴ）、アレルゲンでの気管支刺激（ＢＣＡ）、および１以上のアレルギー症候群がモニターされる種々の臨床試験である（例えば、Haugaard et al., J Allergy Clin Immunol, Vol. 91, No. 3, pp 709-722, March 1993参照）。
ｂ）上記のバイオ能力と参照抽出物との間の確立された関係に基づいて、ｉ）アレルギー症候群を治療または緩和する効果、ｉｉ）免疫学的インビボ試験において記録された副作用、およびｉｉｉ）個体間における上記ｉ）およびｉｉ）の変動といった要素のバランスを充分に考慮した上で、本発明の製剤に使用するための１以上の関連投与量が選択される。このバランス考量は、許容し得ないレベルの副作用を生じることなく、最大の充分な治療的効果を得るように行われる。これら要素のバランスを考量する方法は、当業者に周知である。見出された１以上の関連投与量のバイオ能力は、ＳＱ単位、ＢＡＵ、ＩＲ単位、ＩＵ（上記参照）のような利用可能なバイオ能力単位で表現されてよい。
【００５１】
ｃ）該参照抽出物から１以上のバイオ能力参照標準抽出物が調製され、もし使用されるときは、該参照標準抽出物のバイオ能力単位値が１以上の関連投与量に割当てられたバイオ能力単位値に基づいて計算される（例えば、このようなＢＡＵのための標準は以下に示すようにＦＤＡから入手することができる）。
ｄ）各抽出物タイプの参照標準抽出物について、抽出物のバイオ能力を評価するための多くのパラメータが選択される。このような評価パラメータの例は、全アレルゲン活性、定義された主アレルゲンの量、および該抽出物の全体の分子組成である。全アレルゲン活性は、標準方法を使用して得られた抽出物に対して生じた標準化された抗体混合物、例えば、マウスまたはウサギにおいて発生された抗体またはアレルギー患者血清のプールを使用して、ＥＬＩＳＡおよびＭａｇｉｃＬｉｔｅ（登録商標）蛍光免疫アッセイ（ＬＩＡ）のような、インビトロでの競合免疫アッセイを使用して測定されてよい。主アレルゲンの含量は、例えば、ロケット免疫電気泳動（ＲＩＥ）によって定量され、参照標準と比較されてよい。全体の分子組成は、例えば、交差免疫電気泳動（ＣＩＥ）およびドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）を使用して試験すればよい。
【００５２】
ｅ）バイオ能力が未知の与えられた抽出物バッチ（試験抽出物）について、望ましいバイオ能力レベルを得るために使用される抽出物の量は、次のようにして決定されてよい。選択された各評価パラメータについて、試験抽出物は、上記で述べた関連の測定方法を使用して参照標準抽出物と比較され、この測定結果に基づいて、望ましいバイオ能力を有する抽出物の量が計算される。
【００５３】
アレルギー治療、または治療的もしくは予防的アレルギーワクチン接種のためのアレルゲンの有効投与量とは、１回だけ、または一定投与量もしくは増大する投与量で反復して摂取したときに、例えば適応性免疫応答を生じ、従ってアレルギー患者を脱感作する手段として作用する量を意味するべきである。好ましくは、この用語は、治療計画に従う固体投与量形態の反復投与（ある期間に亘って数回の適用から数ヶ月に亘って少なくとも毎日１回まで）の後に、適応性免疫応答を誘導するために必要な、各投与量形態におけるアレルゲンの量を意味するべきである。好ましくは、脱感作には、該投与量を投与したときのアレルギー症候群の緩和が含まれる。臨床的アレルギー症候群には、鼻炎、結膜炎、喘息、蕁麻疹、湿疹が含まれ、これは目および鼻の発赤および痒み、鼻の痒みおよび鼻水、コーチング（coaching）、ウィージング（weezing）、浅い呼吸、組織の痒みおよび浮腫みのような共通の症状を伴った皮膚、目、鼻、上部および下部気道における反応を含むが含まれる。
【００５４】
ある実施形態において、アレルゲンの投与量は、約０．１５μｇ〜１０ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約０．５μｇ〜５ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約０．５μｇ〜３．７５ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約２．５μｇ〜３．７５ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約２．５μｇ〜２．５ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約２５μｇ〜２．５ｍｇ／用量のアレルゲン抽出物含量、より好ましくは約２５μｇ〜１．２５ｍｇ／用量、更により好ましくは約２５μｇ〜１ｍｇ／用量、最も好ましくは約２５μｇ〜０．７５ｍｇ／用量である。
【００５５】
更なる実施形態において、アレルゲン投与量は、約０．０１５μｇ〜１ｍｇ／用量、より好ましくは約０．０５μｇ〜５００μｇ／用量、より好ましくは約０．０５μｇ〜３７５μｇ／用量、より好ましくは約０．２５μｇ〜３７５μｇ／用量、より好ましくは約０．２５μｇ〜２５０μｇ／用量、より好ましくは約２．５μｇ〜２５０μｇ／用量、より好ましくは約２．５μｇ〜１２５μｇ／用量、更により好ましくは約２．５μｇ〜１００μｇ／用量、最も好ましくは約２．５μｇ〜７５μｇ／用量の単一のアレルゲン含有量を有する。
【００５６】
更なる実施形態において、アレルゲン投与量は、約０．０１５μｇ〜１ｍｇ／投与量形態、より好ましくは約０．０５μｇ〜５００μｇ／投与量形態、より好ましくは約０．０５μｇ〜３７５μｇ／投与量形態、より好ましくは約０．２５μｇ〜３７５μｇ／投与量形態、より好ましくは約０．２５μｇ〜２５０μｇ／投与量形態、より好ましくは約２．５μｇ〜２５０μｇ／投与量形態、より好ましくは約２．５μｇ〜１２５μｇ／投与量形態、更により好ましくは約２．５μｇ〜１００μｇ／投与量形態、最も好ましくは約２．５μｇ〜７５μｇ／投与量形態の単一のアレルゲン含有量を有する。
【００５７】
＜本発明の生物学的媒介物へのタンパク質の表面結合＞
１以上のタンパク質化合物が、非供給結合または共有結合によって非病原性バクテリアの表面に結合される。本発明は更に、共有結合によって二以上の分子を一緒に結合できる化学的架橋剤を用いて、前記１以上のタンパク質化合物を非病原性バクテリア細胞に結合するための方法を開示する。一般に、化学的架橋剤は、特異的官能基（最も頻繁にはタンパク質もしくは他の分子上のアミンまたはスルフヒドリル基）に対する、反応性末端を含んでいる。本発明を実施するために適した架橋剤の例には、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジン、およびパラホルムアルデヒドが含まれる。タンパク質β−ガラクトシダーゼをラクトバチルス・プランタルム（Lactobacillus plantarum）の細胞表面に化学的に架橋するための、二官能性架橋剤であるグルタルアルデヒドの使用が、実施例１，２，６および７に開示されている。
【００５８】
或いは、１以上のタンパク質化合物と非病原性バクテリア表面との間の共有結合は、トランスフェラーゼ、例えばトランスグルタミナーゼ［該酵素は国際性化学および分子生物学連合の推奨（１９９２年）に従う酵素分類番号Ｅ．Ｃ．２の下に分類される］、オキシドレダクターゼ、例えばラッカーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼ（該酵素は酵素分類番号Ｅ．Ｃ．１の下に分類される）、ペプチドリガーゼ（該酵素は酵素分類番号Ｅ．Ｃ．６の下に分類される）、またはヒドロラーゼ、例えばトランスペプチダーゼもしくはエンドペプチダーゼ（該酵素は酵素分類番号Ｅ．Ｃ．３の下に分類される）から選択される触媒を用いて酵素的に触媒される。タンパク質β−ガラクトシダーゼをラクトバチルス・プランタルムの細胞表面に共有結合させるためのトランスグルタミナーゼの使用は、実施例５に開示される。
或いは、１以上のタンパク質化合物は、実施例４に例示されるように弱い非特異的結合によって、非病原性バクテリアの表面に非共有結合的に結合されてもよい。
【００５９】
化学的または触媒的架橋結合、または１以上のタンパク質化合物の非病原性バクテリア表面への結合のための反応条件は、例えば結合されるべき細胞およびタンパク質の比率、ｐＨ、緩衝液のイオン強度、および反応混合物の温度を変化させることによって、細胞当りの結合されたタンパク質化合物の分子数を変化させるために調節されてよい。従って、本発明の一実施形態において、架橋反応は低温で、好ましくは０℃以下の温度、より好ましくは−１℃〜−２０℃、例えば−２０℃の温度で行われ、驚くべきことに、ここでの低温はより多くのタンパク質分子のバクテリア細胞表面への共有結合をもたらすことが示されている（実施例９〜１２参照）。
結合されるタンパク質化合物の分子の数はまた、実施例３および８に開示したように、反応混合物の中にスペーサー分子を含めることによっても向上され得る。本発明の特別な利点の一つは、本発明のバクテリア細胞の表面に結合およびディスプレイされ得るタンパク質化合物分子の数および密度に関する。実施例１および３に示したように、タンパク質化合物分子は、バクテリア表面上の化学的実態に直接に、または多価スペーサーを介して間接的に架橋結合されてよく、それにより、結合される分子の数はバクテリア細胞がインビボでその細胞表面に結合している天然のタンパク質分子の数に限定されない。
【００６０】
異種タンパク質化合物を本発明の非病原性バクテリア細胞の表面に架橋結合させる結合は、一方ではバクテリア細胞の表面におけるアクセス可能な化学的物質と、他方ではタンパク質化合物の末端もしくは内部置換基との間の共有結合である。異種タンパク質化合物と前記アクセス可能な物質との間の架橋は、更に、異種の二官能性架橋剤を含んでなるものであってよく、その際に、前記架橋は架橋された生成物の一体的な成分である。本発明のバクテリア細胞は、化学的にアクセス可能で且つ異種タンパク質化合物が架橋結合され得る壁を含んでなる外側表面を有している。より詳細に言えば、本発明のバクテリア細胞上の表面における化学的にアクセス可能な物質は、細胞壁または外側細胞膜を含んでなるバクテリア細胞エンベロープの成分であり、前記物質は前記細胞の外部環境中に存在する化合物に直接露出される。
【００６１】
異種タンパク質化合物が非共有結合的にバクテリア細胞の表面に結合される本発明の一実施形態において、バクテリア細胞当りに結合される化合物の分子の数は、少なくとも１００である。
【００６２】
本発明のワクチンの調製および試験：
本発明は、実施例１７に例示したようにワクチンの製造に用いられ、更に動物またはヒトにおいて試験され且つ治療的に使用されてよい、１以上のタンパク質化合物が表面結合された非病原性バクテリアを調製するための方法を提供する。第一の工程においては、タンパク質化合物（例えば抗原）が細胞表面に共有結合された非病原性バクテリアが、例えば実施例１または９に記載したような化学的架橋技術によって製造される。或いは、バクテリアおよび抗原の複合体が、実施例５に記載したような架橋性酵素を使用して、または実施例４に記載したような非特異的結合を使用して製造される。こうして、例えば、バクテリア細胞は表面結合したタンパク質化合物と共に製造され、ここでの結合した化合物は、ヒト病原性結核菌（Mycobacterium tuberculosis）もしくはインフルエンザウイルスの特異的抗原、または動物の病原体である大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）の表面抗原である。表面結合した大腸菌抗原を有するバクテリア細胞は、特に子ブタの下痢を予防または治療するために、家畜のブタに使用する獣医学的ワクチンの製造に使用される。結核菌、インフルエンザウイルスまたは獣医学的大腸菌によって生じる病気の治療に使用するための、特定の抗原が表面結合されたバクテリア細胞を含んでなるワクチンの製造における工程は類似しており、以下に説明する通りである。
【００６３】
１．表面結合された抗原提示のための、非病原性バクテリア株の選別
レシピエント宿主に一時的に感染することが記載されている多くのバクテリア株を、更なる分析のために選別する。これらの株は、文献（Christensen H.R. et al. 2002, J Immunology 168:171-8）および実施例１８に記載されているようにして、インビトロ樹状細胞モデルにおいて分析される。好ましい株は、ＩＬ１、ＩＬ２、ＩＬ６、ＩＬ１２、ＴＮＦα、および／またはＴＧＦβを含む炎症性サイトカインの誘導を特徴とするものである。
【００６４】
２．非病原性バクテリア上での表面結合された提示のための抗原製造
結核菌抗原、例えばＥＳＡＴ６（Sorensen A.L. et al. 1999 Infect Immun. 63:1710-17）は、発現系、例えばＰ１７０発現系（Madsen S. et al. 1999 Mol Microbiol. 32:75-87）を使用して、ラクトコッカス・ラクチス（Lactococcus lactis）において組換え的に製造される。該抗原をコードする遺伝子が発現ベクター、例えば、ｐＡＭＪ２９７の中に挿入されてＬ．ラクチス株の中に形質転換され、これは引続き、先に記載されたように発酵装置中の増殖培地において培養される（Madsen S. et al. 1999 supra）。当該抗原は、前記形質転換されたＬ．ラクチス細胞によって、発酵の際に合成および分泌される。次いで、例えば交差流濾過を使用して、Ｌ．ラクチス細胞培養液から上清が分離される。この上清の中に存在する結核菌抗原は、例えばゲル濾過を含む従来のタンパク質精製法を使用して精製される。この精製された抗原は適切な緩衝液、例えば実施例１に記載したＭ９の中に溶解される。インフルエンザ抗原は、組換え遺伝子発現によって、または文献［Tree J.A. et al. 2001 Vaccine 19(25-26): 3444-50］に記載されたように、完全なウイルスからの抗原の精製によって製造される。
【００６５】
３．バクテリア上での表面結合された抗原提示に使用するための、非病原性バクテリア細胞の製造
工程１において選別された株を、増殖培地［複合培地、例えば動物実験および獣医学的用途のためのワクチンを調製する場合にはＭＲＳ（Ｏｘｏｉｄ）］中において培養する。動物起源の増殖培地成分に存在し得るウイルスおよびプリオンのような感染性物質の危険の故に、ヒトに使用するためのワクチンを調製するときには、株の培養のためには合成成分のみに基づく増殖培地が使用される。更に、選択される株増殖培地は、例えばＦＤＡによって発行されたヒトでの治療的使用のための安全性ガイドラインに合致するものである。発酵槽の中での培養の後に、バクテリア細胞は、例えば遠心分離または交差流濾過によって増殖培地から分離される。このバクテリア細胞は、新鮮な増殖培地またはＭ９緩衝液のような適切な緩衝液の中に再懸濁される。これらの細胞は、等容積の５０％オートクレーブ処理されたグリセロールを添加した後、−８０℃において少なくとも１年保存することができる。
【００６６】
４．架橋反応および製剤
工程３で製造されたバクテリア、および工程２で製造された抗原は、実施例１、および３〜１２に記載した１以上の方法を使用して表面結合される。表面結合された抗原を有する得られた非病原性バクテリアは、次の試験で評価される：バクテリア細胞に表面結合された抗原の量は、免疫検出技術、例えば結合された抗原に対して特異的な蛍光標識抗体を用いたＥＬＩＳＡ試験、または結合された抗原に対して特異的な抗体を用いたバクテリア細胞抽出物のウエスタンブロット分析を使用して決定される。加えて、バクテリア表面での抗原の分布が、顕微鏡に基づく分析において同じ抗体を使用して分析される。表面結合された抗原を含む細胞は、工程３に記載したように、適切な緩衝液、例えばＭ９緩衝液の中に懸濁され、グリセロール中において−８０℃で保存される。該細胞はそのまま使用してもよい。しかし、ワクチンはまた、新規な方法または周知の方法を使用して封入されてもよい。この封入は、保存の際、また胃液のような敵対的環境の中に移行する際に、当該ワクチンが元の性質を維持することを保証しなければならない。更に、この封入は、当該ワクチンが望ましい粘膜部位で放出されることを保証すべきである。生きた、または死滅した微生物を保存するための種々の封入方法が記載されており、また商業的に入手可能である。例えば、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｅｎｃａｐｄｒｕｇｄｅｌｉｖｅｒｙ．ｃｏｍ（Encap Drug Delivery, UK）参照。
【００６７】
５．動物モデルにおける製品の試験
工程４に従って調製および処方された、抗原が表面結合されたバクテリアを含んでなる試験ワクチンを、約１０⁸〜約１０¹¹細胞を含有するアリコートに分割する。各々が１０匹のマウスを含んでなる四つの動物群を、次のようにして試験ワクチンまたは対照ワクチンでワクチン接種した：二つの群は、異なる投与量で試験ワクチンの接種を受けた；一つの群は、表面結合された抗原を伴わないバクテリア細胞を含んでなる対照ワクチンを受ける；また一つの群は精製抗原を受ける。ワクチンは、経口もしくは鼻投与されるか、または鼻空腸チューブによって投与される。ワクチン接種計画は次の通りである。投与量は、第１、２、３、１４、１５、１６、４２、４３および４４日に与えられた。血液サンプルおよび粘膜サンプルが第０日から開始して毎週採取され、ここでの最初の血液サンプルおよび粘膜サンプルは免疫感作前の血清からなっている。最終の血液サンプルおよび粘膜サンプルは第６３日に採取され、これらのマウスは屠殺された後に、脾臓および任意にリンパ節を除去される。この血液および粘膜は、標準の技術、例えばＥＬＩＳＡ技術を使用して、抗原特異的抗体について分析される。脾臓は、例えばクロム放出アッセイを使用して、抗原特異的な細胞障害性Ｔ細胞の存在について分析される。
【００６８】
前述の動物ワクチン接種試験に従う有用な試験用ワクチンは、次の性質を示す：
・表面結合した抗原の存在しない本発明のバクテリア細胞を含んでなる対照ワクチンで処理されたマウスにおいては、検出可能な抗原特異的抗体または抗原特異的細胞障害性Ｔ細胞応答はなく、また
・試験ワクチンで処理されたマウスにおける抗原特異的抗体および／または抗原特異的細胞障害性Ｔ細胞応答のレベルは、少なくとも高い投与量においては、精製された抗原で処理されたマウスにおいて検出されるレベルよりも大きく、その差は統計的に有意である。
【００６９】
抗原の濃度を調節することによって、細胞当り約１分子の抗原を結合させることができる。単細胞を含んでなる１回の投与量は下限投与量を定義する。架橋条件の最適化（実施例１３）は、細胞当り少なくとも１０，０００の表面結合された分子を生じることが予想される。もし、架橋反応が標的タンパク質の一つの分子を架橋するとすれば、１０¹²細胞の１回の投与量は、８３ｎｇの架橋結合された標的タンパク質を含有するであろう。従って、本発明に従う充分な化学的架橋結合は、細胞当り１０，０００分子の標的タンパク質を架橋して、１０¹²細胞の投与量当り約１ｍｇの架橋されたタンパク質を与えるであろう。二官能性架橋剤またはスペーサーの使用、より好ましくはそれらの組み合せの使用は、単細胞に結合され得る標的タンパク質の分子数を、約１００，０００にまで更に増大することを可能にする。単一投与量中の細胞の数もまた最適化でき、それによって単一投与量中の抗原の合計量を増大させることができるであろう。この細胞の数および表面結合された分子の数は上限投与量を定義する。
【００７０】
本発明のワクチンの製剤および投与：
本発明の一つの実施形態は、１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる薬剤を製造するための医薬組成物であって：
ａ）１以上の非病原性バクテリア株の細胞と、
ｂ）二官能性架橋剤によって、前記細胞の表面上のアクセス可能な化学的物質に共有結合された１以上のタンパク質化合物と
を含んでなり、前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まず、また前記二官能性架橋剤はシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に結合され、また前記タンパク質化合物および前記架橋剤は前記細胞に対して異種起源である医薬組成物を提供する。前記表面ディスプレイされるタンパク質化合物は抗原であり、また前記生物学的媒介物が生きた、または死滅したバクテリアである場合、当該組成物はそれ自身が、口粘膜、経口、鼻、舌下、膣または肛門投与を含む何れかの粘膜投与のためのワクチンとして使用されてよい。
【００７１】
「口粘膜投与」の用語は、活性成分の局部的または全身的効果を得るために活性成分が患者の口腔または咽頭の粘膜と接触することを可能にするように、本発明の医薬組成物が、舌下または口腔内のどこかに置かれる投与経路を意味する。口粘膜投与経路の一例は、舌下投与である。
【００７２】
「舌下投与」の用語は、活性成分の局部的または全身的効果を得るために、製剤が舌の下に配置される投与経路を意味する。この使用のために、ワクチンは、ワクチンの元の性質を保存し且つ最適な保存寿命を与える適切な材料と共に、溶液または結晶化された乾燥もしくは凍結乾燥された物質として製剤化される。しかし、ワクチンはまた、新規なまたは周知の方法を使用してカプセル封入されてもよい。このカプセル封入は、保存の際および胃液のような敵対的環境内での移動の際に元の性質を維持することを保証しなければならない。更に、カプセル封入は、当該ワクチンが望ましい粘膜場所において放出されることを保証すべきである。生きたまたは死滅した微生物を保存するための種々の封入方法が記載されており、また商業的に入手可能である。例えば、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｅｎｃａｐｄｒｕｇｄｅｌｉｖｅｒｙ．ｃｏｍ参照。
各微生物細胞上に表面結合された抗原の平均量、および各ワクチン投与量における非病原性バクテリアの数は、実施例１３に記載した方法に従って計算されてよい。
【００７３】
粘膜投与に加えて更に、皮膚または皮下投与が有利であるかもしれない。また、非経腸的投与も、選択された疾患に対するワクチン接種またはこれを治療するために有用であり得る。表面結合された抗原を含む非病原性バクテリアのエクスビボでの腫瘍細胞、樹状細胞または他の哺乳類細胞に対する提示は、移植または再移植の前に有用である可能性がある。
【００７４】
製剤化されたワクチンは、液体、エアロゾル、粉末、結晶および錠剤のような多くの形態で投与されてよい。製剤化されたワクチンはまた、ワクチンの活性を調節し、または追加の特性を与える活性物質を含有してもよい。この活性物質は、インターロイキンまたは他の活性な医薬成分（ＡＰＩ）のような、複雑または単純な免疫調節化合物であることができるであろう。該ＡＰＩは、同時に投与されたときに当該ワクチンの治療的効果を高め、または当該ワクチンから有用な性質を誘導する１以上の新規または周知の薬物であってよい。
【００７５】
各特異的ワクチンンの成分である適切な株を同定すること、および本発明のワクチンの予備分析：
ワクチンは、通常はアジュバントおよび特異的ワクチン成分からなる。アジュバントの役割は、免疫系を刺激して特異的病原体または抗原の効果を高めることである。ワクチンにおける微生物細胞の重要な性質は、粘膜アジュバントとして、および／または特定の抗原に対して応答することに加えて、望ましい方法で応答するように免疫系に指令する複合体成分として作用することである。幾つかの側面においては、ワクチンに対する適切な免疫応答は液性であるが、他の側面においては、それは細胞性または両者の組み合せであってよい。更に、該応答は、所謂Ｔｈ１またはＴｈ２応答に偏向されてよく、或いは炎症性応答もしくは抗炎症性応答に向けて偏向されてよく、または耐性を誘導するように偏向されてもよい。適切な株を用いることによって、結合されたタンパク質に向う免疫偏向は制御することができる。
【００７６】
粘膜の免疫系は全体の免疫系の一部であり、結局、粘膜における免疫応答は全身に反映される。それは組織、リンパ系および非リンパ系細胞、並びに抗体およびサイトカインのようなエフェクター分子の一体的なネットワークからなっている。抗原提示細胞、Ｔリンパ球およびサイトカインの間の相互作用は、正しい特異的免疫応答を提供することに対する鍵である。免疫系の細胞と感染性物質もしくは抗原との間の適合は、インターロイキンの産生をもたらす。インターロイキンは、感染性物質もしくは抗原に対して如何に挙動するかを、残りの免疫系に対して指令するメディエータ分子である。本質的に、インターロイキンは、炎症促進性または炎症抑制性の何れかの免疫応答を指令する二つの分類に分けられる。しかし、２０を越えるインターロイキンが知られており、しかも異なる感染に対する各々の応答が異なるレベルの各インターロイキンを生じるから、莫大な数の副分類が存在するはずである。
【００７７】
種々のバクテリアに対する免疫応答を分析する方法が、エクスビボで確立されている（Christensen H.R. et al. 2002, J Immunology 168:171-8）。該方法は、免疫系のキーモジュレータとして認識される樹状細胞（ＤＣ）に基づいている。ＤＣは、外来細胞もしくは抗原に遭遇したときに、成熟免疫担当細胞へと発達する。この遭遇の際に、ＤＣはサイトカインを分泌して自己刺激を行うと共に、免疫系の他の細胞を刺激する。このエクスビボ方法において、ＤＣからのサイトカインは、不活性化されたまたは生きた微生物への露出の後に定性的および定量的に測定される。異なる微生物がこのような方法を使用して試験されており、その結果は、同じ属のメンバーの間および更には同じ種の間での変動をも含む、異なるバクテリアの間での有意な変動を示す。従って、適切な候補はサイトカイン放出プロファイルによって示される望ましい免疫応答を指令するものであるから、ＤＣ法は、所定のワクチンについてのバクテリア候補を同定するために有用である。この候補はまた、同時に特異的抗原を提示しながら、望ましい免疫応答を指令するべきである。従って、外来抗原がそれらの細胞表面に結合されているバクテリア候補はまた、実施例１８に示したように、ＤＣ法を使用して試験されてもよい。
【００７８】
獣医学的目的での本発明のワクチンの動物実験および適用：
ワクチンは、例えば開示された実施例に記載の方法を使用することにより、設計および製造されてよい。ワクチンは、例えば、抗原供給源およびアレルゲン供給源としてそれぞれ列記された感染性物質およびアレルゲンの群から選択される病原体に対する、ワクチンとして有用な成分を含有してよい。それはまた、例えば感染病、癌、アレルギーおよび自己免疫疾患の群から選択される他の疾患に対するワクチンとして有用な成分を含有してもよい。
【００７９】
該ワクチンは、実施例から選択される製剤化方法を使用して、動物実験において試験されてよい。試験動物は、如何なる動物種のものであってもよい。ワクチンは、該動物に摂食させてもよく、または飲み水に混合されてもよい。該ワクチンはまた、膣または肛門から投与されてよく、または該ワクチンは胃および胃液を通過する装置を通して、例えば鼻空腸チューブを使用することによって小腸に直接投与されてもよい。ワクチンは、口−鼻領域または鰓領域で動物に直接噴霧することによって、または該ワクチンを動物小屋に簡単に噴霧することによって投与されてよい。ワクチンはまた、魚類および他の水生動物が生きている水に添加されてもよい。この投与は、１回だけ実施されてもよく、またはワクチン接種のブーストおよび免疫記憶の維持を確実にするために、規則的にフォローアップされてもよい。この実験は、病原体での抗原刺激または問題の疾患に似た病気の誘導の前後において、ワクチン接種またはプラセボ治療を用いて実行されてよい。実験の終点には、生存動物および健康な動物の数 ｖ．ｓ． 死亡動物または病気の動物の数の分析が含まれてよいが、これに限定されない。生存動物の間での病気の重篤度もまた、重要なパラメータである可能性がある。治療された動物からの生検および特異的抗体の力価もまた、ワクチン接種の効果を示す可能性がある。生検からの細胞はまた、問題の抗原に対する特異的応答を含む免疫アッセイにおいて試験されてよい。
【００８０】
動物実験は、下記のものを同定するために設計されてよい：
・特定のワクチンに使用するための多くの候補の正しい非病原性バクテリア、
・理想的平均数の抗原が表面結合された非病原性バクテリアの理想的投与量、
・最適な投与経路、
・ワクチンの効果を高める物質、および
・ワクチン接種の頻度およびワクチン接種の期間。
この動物実験の結果は、家庭内動物、ペット、家畜、牧畜、飼育動物、または野生動物のワクチン接種のための計画を設定するために有用であろう。
【００８１】
幾つかの側面において、動物での結果は、ヒトのワクチン試験の設計のために有用であり得る。また、動物試験は、前臨床試験においてヒトワクチンを試験するために有用であり得る。
【００８２】
ヒトを目的としたワクチンのヒトでの試験および適用：
先の例で述べたように、ワクチンは、例えば上記で説明した方法を使用することによって設計および製造されてよい。該ワクチンは、病原体または上記アレルゲン供給源の下に列記された何等かのアレルギーに対するワクチンとして有用な成分を含有してよい。また、それは癌もしくは自己免疫疾患、または上記アレルゲン供給源の下に列記された他の病気に対するワクチンとしても有用である。該ワクチンは、獣医学的ワクチンについて述べたように、前臨床試験の完了後の臨床試験において試験されてよい。製剤化方法は、実施例において記載した何れか一つから選択されてよい。健康な人々および／または病気の人々が、臨床試験に含められてよい。該ワクチンは、錠剤として、食物の一部として、または飲料水として摂取されてよい。該ワクチンは、舌下で投与されてよく、または口および鼻の領域にスプレーされてもよい。該ワクチンはまた、膣もしくは肛門に投与されてよく、或いは、例えば鼻空調チューブを使用することにより、該ワクチンは胃および胃液を越える装置を介して小腸に直接投与されてもよい。この投与は、１回だけ実施されてもよく、またはワクチン接種のブーストおよび免疫記憶の維持を確実にするために、規則的にフォローアップされてもよい。このワクチン接種は、ワクチンおよび／またはプラセボを用いて実施されて良く、またランダム化された二重盲検アプローチを使用してもよい。実験の終点には、生存者および健康なヒトの数 ｖ．ｓ． 死亡したまたは病気のヒトの数の分析が含まれてよいが、これに限定されない。生存者の間での病気の重篤度もまた、重要なパラメータである可能性がある。治療された生存者、治療された健康なヒトおよび病気のヒトからの生検は、臨床試験からの結果を分析するために使用されてよい。また、特異的抗体の力価は、ワクチン接種の効果を示す可能性がある。生検からの細胞はまた、問題の抗原に対する特異的応答を含む免疫アッセイにおいて試験されてよい。
【００８３】
臨床試験は、下記のものを同定および選択するために設計されてよい：
・特定のワクチンに使用するための多くの候補からの非病原性バクテリア、
・最適平均数の抗原が表面結合された非病原性バクテリアの最適投与量、
・最適な投与経路、
・ワクチンの効果を高める物質、および
・ワクチン接種の頻度およびワクチン接種の期間。
この臨床試験の結果は、ヒトのワクチン接種計画を設定するために有用であり、その点において、該ワクチンはヒトのワクチン接種の目的ために有用であろう。
【００８４】
癌等の疾患に関連した表面結合された抗原を含有するワクチンにエクスビボで露出されたＤＣはまた、該疾患の治療のためにも有用であり得る。エクスビボでの露出は、ＤＣの患者への再移植の前に行ってよい。更に、同じタイプの抗原が生きたまたは死滅した非病原性バクテリアに表面面結合されているワクチンは、癌ワクチンのようなワクチンに対して適正なアジュバント効果を与えるために、非経腸的に使用されてよい。
【００８５】
本発明の方法はまた、バイオテロ攻撃における病原体に対する、効率的で且つ投与が容易なワクチンを製造するために有用であり得る。例えば、現存のライセンスされた炭素菌ワクチンは、経腸的に投与されなければならず、且つ防御的免疫を誘導するためには複数回の投与を必要とする（Flick-Smith H.C. et al. 2002, Infection and Immunity, 70:2022）。これは、訓練された人を必要とし、また粘膜免疫応答を刺激するための最適な経路ではない。また、この投与は、非常に短時間に莫大な数の人々にワクチン接種するためには理想的なものではない。
【００８６】
ＩＩＩ．実施例
実施例１．グルタルアルデヒドによるβ−ガラクトシダーゼのラクトバチルスへの化学的架橋
この実施例は、５炭素ジアルデヒドの二官能性架橋剤であるグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）を使用した、スルホロブス・ソルファタリクス（Sulfolobus solfataricus）由来のタンパク質であるβ−ガラクトシダーゼ（Pisani F.M. et al. 1990 Eur J Biochem., 187:321-8）の、ラクトバチルス・プランタルム（Lactobacillus plantarum）ＵＰ１の細胞表面への化学的架橋を実証するものである。ＧＬＡは、タンパク質のアミノ基とシッフ塩基（−Ｈ＝Ｎ−）を形成することによって、架橋剤として作用する。従って、ＧＬＡに媒介されたβ−ガラクトシダーゼのバクテリア表面への架橋は、β−ガラクトシダーゼタンパク質に存在するリジンもしくはアルギニン残基と、前記バクテリアの細胞表面またはその近傍にあるアクセス可能なリジンまたはアルギニン残基との間で生じると思われる。
【００８７】
架橋研究のためのβ−ガラクトシダーゼは、ｐＥＴ−３ａベクター系（インビトロゲン社、ＣＡ）を使用した大腸菌における組換え発現により得られた。簡単に言えば、β−ガラクトシダーゼをコードするＬａｃＳ遺伝子を、Ｓ．ソルファタリクスのゲノムＤＮＡから標準ＰＣＲ技術によって増幅し、ｐＧＥＴ−３ａベクターの中にクローン化し、大腸菌の中に形質転換した。β−ガラクトシダーゼを細胞内で発現させ、次いで、該大腸菌細胞を溶解した。前記溶解物を８０℃で３０分加熱することにより、溶解物の中に放出されたβ−ガラクトシダーゼを熱的沈殿によって部分的に精製した。Ｌ．プランタルムＵＰ１を、通気を伴わずに、ＭＲＳ（Oxoid、Hampshire UK）中において３４℃で２４時間増殖させた。この細胞を遠心分離により回収し、Ｍ９緩衝液（０．６％Ｎａ₂ＨＰＯ₄、０．３％ＫＨ₂ＰＯ₄、０．５％ＮａＣｌ、０．０２５％ＭｇＳＯ₄）の中に再懸濁させ、細胞密度を１ｍＬ当り１０¹⁰細胞に調節した。Ｌ．プランタルム細胞の固定された量（１０¹⁰）を、異なる量のβ−ガラクトシダーゼおよび０．２％ＧＬＡ（Sigma-Aldrich、St. Lois MO）と共に室温で５０分間インキュベートした。ＧＬＡ処理された細胞の生存を、該細胞混合物をＭＲＳ寒天上に広げることによって試験した。生存コロニーは生成されず、ＧＬＡ処理によって殆どの細胞が死滅したことを示した。ＧＡＬ処理に続き、該細胞混合物を遠心分離にかけ、細胞画分および上清を得た。単離された細胞をＭ９緩衝液で２回、完全に洗浄した。ＧＬＡに媒介されたβ−ガラクトシダーゼのＬ．プランタルム細胞への架橋をモニターするために、文献（Sambrook J et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbour Press, Plainview, NY）に記載のＯＮＰＧ法を用いたβ−ガラクトシダーゼ酵素活性によって、上清および細胞画分の間におけるβ−ガラクトシダーゼの分布を決定した。細胞の反復Ｍ９洗浄に起因して、細胞画分における未結合β−ガラクトシダーゼの量は無視できた。従って、細胞画分において測定された酵素活性は、Ｌ．プランタルム細胞の表面に結合された酵素の量に対応すると解釈される。１ｇ／ｍＬおよび２ｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼおよびｍＬ当り１０¹⁰細胞を使用した架橋は、それぞれ、酵素の合計量の３３％および４０％（検出可能な酵素活性の単位に基づく）の細胞表面への結合を生じた（図１）に対して、ＧＬＡを伴わない対照反応における表面結合は５％未満しか表面結合されなかった（データは示さず）。１ｇ／ｍＬおよび２ｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼとのＧＬＡ架橋後に得られた細胞画分は、４８０Ｕおよび６１０Ｕの酵素活性を有していたが、その各々は、細胞当り６００および８００分子のβ−ガラクトシダーゼに対応する。結論として、この実施例は、ＧＬＡが酵素的に活性なタンパク質をラクトバチルス細胞の表面に架橋できることを示している。細胞表面に架橋された酵素は、その酵素活性を保持し、ＧＬＡに媒介された細胞表面へのタンパク質の架橋は、該タンパク質の機能を損なわないことを示している。
【００８８】
実施例２．グルタルアルデヒドによるアラビノースイソメラーゼのラクトバチルスへの化学的架橋
タンパク質のバクテリア細胞表面への化学的架橋がβ−ガラクトシダーゼに限定されないことを立証するために、我々は、好熱性テルモアナエロバクター・マスラニ（thermophilic Thermoanaerobacter mathrani）由来のアラビノースイソメラーゼ酵素の、バクテリア細胞への架橋を示す。アラビノースイソメラーゼは、Ｄ−ガラクトースをＤ−タガトースへと変換するものであり、Ｊｏｒｇｅｎｓｅｎおよび協同研究者が記載したように、大腸菌での組換え細胞内発現よって得られた（Jorgensen F et al. 2004, Appl Microbiol Biotechnol 64:816-22）。組換え大腸菌における増殖および発現の後に、フレンチプレスを使用して細胞を溶解刺せた。この溶解混合物を遠心分離し、アラビノースイソメラーゼを含有するその上清を、その後の架橋実験のために使用した。実施例１に記載したようにして、ラクトバチルス・プランタルムＵＰ１を増殖させ、洗浄した。この洗浄された細胞（１０¹⁰細胞）を、アラビノースイソメラーゼを含有する異なる量の溶解物、および最終濃度０．１％のＧＬＡと共にインキュベートした。この架橋反応は、３７℃で６０分間実行された。その後、実施例１に記載したようにして該細胞を回収および洗浄した。細胞画分および上清の両方における酵素活性を、先に記載されたようにして分析した（Jorgensen F et al. 2004, Appl Microbiol Biotechnol 64:816-22）。図２は、アラビノースイソメラーゼが、濃度に依存して、ラクトバチルスの細胞表面に架橋結合されることを示している。アラビノースイソメラーゼ酵素はＧＬＡ処理によって阻害されないから（データは示さず）、細胞画分および上清画分における検出可能な全触媒活性は、ＧＡＬ処理に先立ってＬ．プランタルム細胞に添加された酵素の量に対応する。図２は、細胞画分におけるアラビノースイソメラーゼ活性と、細胞および上清画分における酵素活性の合計量との比較に基づけば、三つの全ての架橋条件の下で、アラビノースイソメラーゼの５０％超がＬ．プランタルム細胞の表面に結合されたことを示している。結論として、この実施例は、ＧＬＡが架橋活性のアラビノースイソメラーゼを効率的にラクトバチルス細胞の表面に架橋結合させることを示している。
【００８９】
実施例３．スペーサー分子としてのキトサンは、グルタルアルデヒドによりラクトバチルスに架橋結合されるβ−ガラクトシダーゼのレベルを向上する：
キトサンは複数の反応性基を含む天然に存在する分子であり、これは化学的架橋結合により、バクテリア細胞表面に結合されるタンパク質の量を増大させるためのスペーサー分子として使用することができる。Ｌ．プランタルム細胞を実施例１に記載したようにして増殖および洗浄し、１ｍＬ当り１０¹⁰細胞の濃度でＭ９緩衝液の中に懸濁させ、これに０．５％ｗ／ｖのキトサン５００ｋＤＡ（Cognis Deutschland GmbH, Germany）および０．２％ＧＬＡを、１ｇ／ｍＬまたは２ｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼと共に添加した。細胞に対するβ−ガラクトシダーゼの架橋結合に対するキトサンの効果を、キトサンを伴わない対照架橋反応と比較した。Ｌ．プランタルム細胞を実施例１に記載したようにして回収および洗浄し、この洗浄した細胞画分および架橋反応混合物の上清におけるβ−ガラクトシダーゼ触媒活性を測定した。図３は、キトサンが架橋反応を向上させることを立証している。何故なら、合計のβ−ガラクトシダーゼ活性の９０％超が細胞画分に結合されているのに対して、キトサンの不存在下では、３５％のβ−ガラクトシダーゼ活性しか細胞画分に結合されていないからである。この実施例は、分子スペーサーとしてキトサンを使用することが架橋結合反応を向上させ、結合されたβ−ガラクトシダーゼの量を、細胞当り８００分子から細胞当り約２０００分子へと増大させることを示している。
【００９０】
実施例４．ラクトバチルスの表面へのタンパク質の非共有結合
架橋剤を用いたラクトバチルスの化学的処理は、非生細胞を生じる。この実施例は、未処理の生きたバクテリアが、非共有結合でβ−ガラクトシダーゼを結合できることを示す。理論に拘束されるものではないが、細胞表面とタンパク質との間の相互作用は、イオン性、疎水性、またはβ−ガラクトシダーゼと細胞表面上の糖部分との間のものである。
【００９１】
ラクトバチルス・プランタルムＵＰ１を、実施例１に記載したようにして増殖および洗浄した。細胞（１０¹⁰）を、２μｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼと共に３７℃で６０分間インキュベートした。この細胞を遠心分離し、５００μＬのＭ９緩衝液で２回洗浄した。架橋反応混合物から得られた、洗浄された細胞画分および上清におけるβ−ガラクトシダーゼ触媒活性を分析した。細胞画分では５３８Ｕが検出された一方、上清には５４５５Ｕが測定されたが、これは全β−ガラクトシダーゼの９％が細胞表面に結合したことに対応する。この実施例は、架橋媒体を使用することなく、ラクトバチルスがその細胞表面にβ−ガラクトシダーゼを結合できることを示している。しかし、前記非共有架橋結合によっては、添加されたβ−ガラクトシダーゼの９％だけしか結合されないのに対して、実施例１に記載したように、ＧＬＡ試薬および同量のβ−ガラクトシダーゼを使用すると、添加されたβ−ガラクトシダーゼの４０％が結合された。従って、この非共有結合法は、ＧＬＡ法を使用した共有結合法に比較して、効率が４倍低い。結合したβ−ｇａｌにおける減少（４０％から９％）は、細胞当り８００分子から１８０分子へのβ−ガラクトシダーゼの減少に対応する。この反応は、より高い量の結合タンパク質を得るように最適化されてよい。最適化は、緩衝液のｐＨ、イオン強度温度、または他のパラメータを制御することによって達成されてよい。
【００９２】
実施例５．β−ガラクトシダーゼの酵素触媒によるラクトバチルスへの架橋結合
トランスグルタミナーゼ（ＴＧ）酵素は、タンパク質の中および間において、分子間架橋および分子内架橋を形成することができる。従って、ＴＧは外部から添加されたタンパク質とバクテリアの細胞壁成分の中のアミノ酸残基との間の架橋結合を触媒することができる。アシル転位反応を介して、ＴＧは、アシルドナーとしてのペプチドもしくはタンパク質−結合グルタミン残基のγ−カルボキシアミド基と、アシルアクセプタとしての幾つかの一級アミン（ペプチドもしくはタンパク質−結合リジン残基のεアミノ基を含む）との間の架橋を触媒する。タンパク質−結合したリジン残基がアシルアクセプタとして作用するときに、この反応は、ε−（γ−グルタミル）リジンイソペプチドの形態の架橋の形成を導く。この反応は、バクテリア細胞を標的タンパク質（例えば抗原またはアレルゲン）およびＴＧと混合することによって行われ、ここでは架橋が時間と共に漸進的に増大する。反応条件は、好ましくは約６．５〜約８．０のｐＨにおいて緩衝され、また架橋反応を最適化するために、≧１０ｍＭのＣａＣｌ₂を含有する。 更に、９０℃以下の温度での標的タンパク質の熱処理、および２０ｍＭジチオスレイトールの添加は、架橋結合を高める可能性がある。ミルクタンパク質中のＴＧ阻害剤物質が報告されているので（Boenisch et al. 2004, Jour Food Science 69(8)）、ミルク由来のバクテリア細胞の熱処理 は、架橋反応の前に実施されてよい。更に、架橋すべき標的タンパク質は、Ｎ末端またはＣ末端において、ＴＧ基質として機能し且つ架橋反応を向上させることができる複数の反応性残基を含んだアミノ酸で延長されてよい。ＴＧに媒介された標的タンパク質のバクテリア細胞表面への架橋は、その機能的活性（例えば触媒活性）を測定することによって、または酵素、抗原またはアレルゲンのような標的タンパク質に対して特異的な抗体を使用する免疫化学的技術によって、洗浄された細胞画分および上清を標的タンパク質について分析することにより検出することができる。
【００９３】
実施例６．グルタルアルデヒドを使用することによる、β−ラクトグロブリンのラクトバチルスへの架橋
β−ラクトグロブリン（ＢＬＧ）は、アレルギーを生じるホエー画分のミルクタンパク質である。経口投与後に粘膜免疫応答を誘発できるＧＬＧを含有した組成物の調製は、このようなアレルギーに罹患している患者におけるＢＬＧアレルギーの治療に用いられてよい。次の成分が、ラクトバチルス細胞へのＧＬＧの架橋結合を立証するために行われるアッセイに含められた。
ラクトバチルス細胞：ラクトバチルス・プランタルムの培養物（２９９ｖ）をＭＲＳブロス（Ｆｌｕｋｋａ ６９９６６）中において３０℃で一晩増殖させた。１ｍＬの一晩（ｏ／ｎ）培養物のアリコートを遠心分離し、得られたペレットを１ｍＬのＭ９緩衝液で洗浄した後、それを後で使用するために−２０℃で凍結した。使用する前に、該凍結ペレットを解凍し、Ｍ９緩衝液の中に再懸濁させた（５００ｍＬのＭ９緩衝液中に再懸濁された１ｍＬ・ｏ／ｎ培養物からのペレット）。
ＢＬＧ： 滅菌蒸留水中に調製されたＢＬＧの１％溶液（L 6879, Sigma-Aldrich）
グルタルアルデヒド（ＧＬＡ）： グルタルアルデヒド（1.04239, Merck）の水中の２５％溶液。グルタルアルデヒドは、５炭素のジアルデヒドであり、一級アミノ基（タンパク質の場合は殆どがリジン）とシッフ塩基（＞Ｃ＝Ｎ−）を形成することによって、架橋剤として作用する。
表１に示した容積中にラクトバチルス細胞、ＢＧＬタンパク質およびグルタルアルデヒドを含むサンプルを混合し、室温で６０分間、周期的混合しながらインキュベートした。
【表１】

【００９４】
６０分のインキュベーションの後、サンプルを遠心分離し、細胞ペレットを５００μＬのＭ９緩衝液（Ｍ９緩衝液：７．３グラムのＮａ₂ＨＰＯ₄、２．９グラムのＫＨ₂ＰＯ₄、および２．０グラムのＮＨ₄Ｃｌを、水に溶解して全容積を１リットルしたもの）で２回洗浄した。
ペレット中における架橋されたＢＬＧの量は、ウシβ−ラクトグロブリンＥＬＩＳＡ定量キット（Catalog nr. E10-125, Bethyl Laboratories）を幾らかの変更を伴って使用し、またキット製造業者が記載した溶液を用いて測定された。検出すべきＢＬＧタンパク質がラクトバチルス細胞の表面に架橋されたので、ＥＬＩＺＡキット法を変更して、抗体に基づく測定のために懸濁液中において全細胞を使用することを可能にした。簡単に言えば、検出は、ＨＲＰ（西洋ワサビペルオキシダーゼ）に結合させたウサギ抗ＢＧＬ抗体を使用して行った。ペレットを１００μＬのブロッキング溶液中に再懸濁させ、１００μＬの検出溶液（１ｍＬの希釈緩衝液＋０．１μＬのＨＲＰ抗体）と混合し、室温で６０分間、規則的に混合しながらインキュベートした。次いで、細胞を遠心分離し、２００μＬの洗浄溶液で３回洗浄した後、１００μＬの希釈緩衝液中に再懸濁させた。最後に、マイクロタイタープレート中の５０μＬ容積の逐次希釈された材料に１００μＬのＴＭＢ試薬（T 0440, Sigma Aldrich）を添加することによって、ＴＭＢ（テトラメチルベンジジン）発色反応を行った。このマイクロタイタープレートを室温で５〜３０分間インキュベートした後、１００μＬの２Ｍ Ｈ₂ＳＯ₄を添加することにより反応を停止させ、プレートリーダー中において４５０ｎｍでの吸光度を測定した。キットマニュアルに記載された通り、ＯＤ₄₅₀の値とＢＧＬ濃度とをリンクさせる標準曲線が、マイクロタイタープレート設定に含められた。
【００９５】
【表２】

【００９６】
表２の計算されたＢＬＧは、標準曲線を使用することにより、測定されたＯＤ₄₂₀値から誘導されたタンパク質濃度である。バックグラウンド値の４５０ｎｍ吸光度が、反応チューブへのＢＧＬ添加の不存在下で決定されたが、これはおそらく、ＨＲＰ抗体の非特異的結合を反映している。ＢＬＧタンパク質のラクトバチルス細胞への非特異的付着は、おそらく、グルタルアルデヒドが省略されたサンプル３におけるＢＬＧのレベルを説明している。
【００９７】
実施例７．グルタルアルデヒドを使用することによる、Ｓ．アウレウスヌクレアーゼのラクトバチルスへの架橋結合
スタフィロコッカス・アウレウスは重要なバクテリア病原体であり、この場合の治療は、多剤耐性バクテリア株の発生に起因して特に困難である。候補ワクチン成分は、スタフィロコッカス・アウレウスから分泌されたヌクレアーゼ（Ｎｕｃ）であり、これはラクトコッカス・ラクチスにおける異種タンパク質発現によって製造されたものである（Poquet I. et al. 1998 J Bact., 180:1904-1912）。以下の成分が、ラクトバチルス細胞へのＮｕｃタンパク質の架橋結合を立証するために行われるアッセイに含められた。
ラクトバチルス細胞： 実施例６に記載のようにして増殖および調製されたラクトバチルス・アシドフィルス（Ｘ３７）の培養物。
Ｎｕｃタンパク質（Ａ）：精製されたＮｕｃタンパク質（1 mg/mL、Calbiochem）。
Ｎｕｃタンパク質（Ｂ）：ラクトコッカス・ラクチスにおいて産生された組換えＮｕｃタンパク質（187 μg/mL）。
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は、実施例に記載したとおりである。
表えに示した容積の中にラクトバチルス細胞、Ｍ９緩衝液、Ｎｕｃタンパク質およびグルタルアルデヒドを含有するサンプルを混合し、室温で６０分間、周期的に混合しながらインキュベートした。
【表３】

【００９８】
６０分のインキュベーションの後、サンプルを遠心分離し、ペレットを１ｍLのＭ９緩衝液で２回洗浄した。ペレット材料中のＮｕｃタンパク質濃度は、実施例１に記載した溶液を用い、一次Ｎｕｃ抗体（ウサギ抗Ｎｕｃ抗体）および二次ＡＰ結合抗ウサギ抗体（リン酸標識され且つアフィニティー精製されたヤギにおいて産生されたウサギＩｇＧに対する抗体、 Catalog nr. 075-1506, KPL）を用いた抗体に基づくアッセイを使用して決定された。簡単に言えば、ペレットを１００μＬのブロッキング溶液中に再懸濁させ、１００μＬの検出溶液（１ｍＬの希釈緩衝液＋１μＬのＮｕｃ抗体）と混合し、室温で６０分間、規則的に混合しながらインキュベートした。次いで、細胞を遠心分離し、５００μＬの洗浄溶液で２回洗浄した後、１００μＬの希釈緩衝液中に再懸濁させた。次に、１００μＬの検出溶液（４ｍＬの希釈緩衝液＋１μＬのＡＰ抗体）を添加し、該サンプルを規則的に混合しながら室温で６０分間インキュベートした。次いで、サンプルを遠心分離し、５００μＬの洗浄溶液で３回洗浄し、１００μＬの希釈緩衝液中に再懸濁させた。最後に、マイクロタイタープレート中の５０μＬ容積の逐次希釈された材料に１００μＬのＢｌｕｅＰｈｏｓマイクロウエルホスファターゼ基質系（50-88-02、KPL）を添加することによって、ＡＰ（アルカリホスファターゼ）発色反応を行った。このマイクロタイタープレートを室温で１０〜３０分間インキュベートした後、１００μＬの２。５％ＥＤＴＡを添加することにより反応を停止させ、プレートリーダー中において５９５０ｎｍでの吸光度を測定した。同じ実験設定を別々に使用して、ＯＤ₄₅₀の値とＮｕｃ濃度とをリンクさせる標準曲線を発生させた。
【００９９】
【表４】

表４に与えられた計算されたＮｕｃ値は、バックグラウンド値を差引いた後に標準曲線を使用することにより、測定されたＯＤ₅₉₅値から誘導されたタンパク質濃度である。ラクトバチルス・アシドフィルス細胞へのＮｕｃタンパク質の架橋結合が立証され、また結合されたＮｕｃの量は、当該アッセイ中に存在するＮｕｃタンパク質および細胞の量に比例する。
【０１００】
実施例８．グルタルアルデヒドおよびキトサンを使用することによる、ラクトバチルスへのｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼの架橋結合
キトサンは複数のアミノ基を含む天然に存在する分子であり、これはグルタルアルデヒド架橋反応に関与することができる。所謂スペーサー分子は、結果を改善するために、架橋反応混合物屡々添加される。
キトサンを介してのβ−ガラクトシダーゼのラクトバチルスへの架橋結合を立証するために行われたアッセイに、以下の成分が用いられた。
β−ガラクトシダーゼは、スルホロブス・ソルファタリクス由来のｌａｃＳ遺伝子（Pisani F.M. et al. 1990 Eur J Biochem., 187:321-8）の、ｐＥＴ−３ａベクター系（Invitrogen, CA）を使用した大腸菌での組換え発現によって得られた。簡単に言えば、β−ガラクトシダーゼをコードするＰＣＲ断片が、標準のＰＣＲ技術を使用して増幅され、ｐＥＴ−３ａベクターの中にクローニングされ、β−ガラクトシダーゼの細胞内発現のために大腸菌の中に形質転換された。発現されたｌａｃＳタンパク質の製剤は、前記大腸菌細胞を溶解させた後の部分的精製（熱沈殿）によって得られ、ここでは溶解物が８０℃で３０分間加熱され、遠心分離されて前記溶解物中の他のタンパク質の殆どが除去される（ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼは熱的に安定な酵素である）。ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼタンパク質の濃度は、クーマシー染色されたゲル中で検出可能なタンパク質に基づいて、約４００μｇ／ｍＬと見積もられた。
ラクトバチルス細胞： ラクトバチルス・プランタルム（２９９ｖ）の培養物は、実施例６に記載したようにして増殖および調製された。
１％のキトサン溶液を、７．３ｍｇのキトサン（５００ｋＤａ）（Cognis Deutschland GmbH, Germany）、７３０μＬのＨ₂Ｏおよび２０μＬの２Ｎ・ＨＣｌを混合することによって調製した。
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は実施例６に記載した通りである。
表５に示した容積の中にラクトバチルス細胞、Ｍ９緩衝液およびキトサンを含有するサンプルを混合し、室温で５分間インキュベートした。次いで、表５に示した容積で、ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼおよびグルタルアルデヒドを添加し、サンプルを室温で１５分間混合した。
【表５】

【０１０１】
１５分のインキュベーションの後、サンプルを遠心分離し、ペレットを１００μＬのＭ９緩衝液中に再懸濁させた。ｌａｃＳタンパク質分布を決定するために、ペレットおよび上清溶液に対して、６５℃で、ＯＮＧＰ法を用いたβ−ガラクトシダーゼ酵素活性のための標準アッセイ（Sambrook J et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbour Press, Plainview, NY）を実施した。得られたβ−ガラクトシダーゼ酵素の相対的な量が表６に示されており、ここでの表に纏められた値は酵素活性（ｍＬ当りの単位）×溶液の容積（ｍＬ）として計算される。






【表６】

架橋率は、測定されたペレットおよび全ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼ活性の間の比である。
この実施例は、スペーサーとしてキトサンを含めることが架橋物質の収率を有意に増大させることを示している。
【０１０２】
実施例９．グルタルアルデヒドによるアゾカゼインのラクトバチルスへの冷間架橋結合
我々は驚くべきことに、グルタルアルデヒドによる架橋結合が、凍結プロトコール（冷間架橋）を使用して行うことができ、またこのプロトコールを使用して高収率の架橋されたタンパク質を得ることができることを見出した。
以下の成分が、ラクトバチルスへのアゾカゼインの架橋結合を立証するために実施されるアッセイに含められた：
アゾカゼイン： 一般的なプロテアーゼ基質として周知である。それは、定量的な分光学的測定のために使用できるアゾ色素に結合されたカゼインからなっている。架橋実験のために、滅菌蒸留水中に溶解されたアゾカゼイン（A 2765, Sigma-Aldrich）の１％溶液を調製した。
ラクトバチルス細胞： ラクトバチルス・プランタルム（２９９ｖ）の培養物を、実施例６に記載したようにして増殖および調製した。
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は、実施例６に記載した通りである。
表７に示した容積中にラクトバチルス細胞、アゾカゼイン、Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒドを含有するサンプルを混合し、直ちに液体窒素を使用して凍結した後、−２０℃の冷凍器の中に配置し、そこでサンプルを３日間維持した。
【表７】



【０１０３】
架橋を評価するために、サンプルを回答し、遠心分離し、４２０ｎｍでのアゾ基吸収を件主付することによって上清のアゾカゼイン含量を測定した。表７に与えられた回収値は、対照（初期濃度に類似した水中の純粋なアゾカゼイン）に比較したときの上清中に残存するアゾ染色のパーセンテージとして計算された。２．５ｍｇ／ｍＬおよび５．０ｍｇ／ｍＬのアゾカゼインの溶液は両者とも、上記の冷間プロトコールに従い、０．２５％のグルタルアルデヒドを使用して効率的に架橋されることが分かった。遠心分離は固いペレットを生じ、これは再懸濁が不可能であった。このことは、高度の架橋が生じたことを示している。ラクトバチルス細胞の添加を伴った、および該添加を伴わない架橋の結果は、非常に類似している。インキュベーションン間の細胞の位置が固定される凍結プロトコールに起因して、冷間架橋は、均一に凝集塊へと結合した細胞およびアゾカゼインを生じる。
【０１０４】
実施例１０
グルタルアルデヒドによるβ−ガラクトシダーゼのラクトバチルスへの冷間架橋
タンパク質のラクトバチルス表面へのグルタルアルデヒドに媒介された架橋のための凍結プロトコール（冷間架橋）もまた、ラクトバチルスに架橋されたβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＳ）の更に高い収率を与える。
以下の成分が、凍結プロトコールを使用したｌａｃＳのラクトバチルス細胞への架橋結合を立証するために行われるアッセイに含められた：
ラクトバチルス細胞：ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｘ３７）を、実施例６に記載したようにして増殖および調製した。
ｌａｃＳは、実施例８に記載したようにして調製した。
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は、実施例６に記載したようにして調製した。
ラクトバチルス細胞、ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼタンパク質溶液、Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒドを含有するサンプルを表８に示した容積で混合し、直ちに液体窒素を使用して凍結した後、−２０℃の冷凍器の中に配置し、そこでサンプルを３日間維持した。
【表８】

【０１０５】
架橋を評価するために、サンプルを解凍し、遠心分離し、ペレットを２００μＬのＭ９緩衝液で１回洗浄した。最後に、ペレットを１００μＬのＭ９緩衝液中に再懸濁させた。
６５℃でのＯＮＰＧアッセイを使用して、実施例７に記載した通りにβ−ガラクトシダーゼ活性を測定した。得られたβ−ガラクトシダーゼ活性の相対的量を表９に示す。この表に纏められた値は、酵素活性（ｍＬ当りの単位）×溶液の容積（ｍＬ）として計算される。











【表９】

【０１０６】
回収は、合体されたペレット＋上清＋洗浄溶液における、架橋後に検出された添加されたｌａｃＳ活性の画分である。グルタルアルデヒド処理は酵素の不活性化を導き、該不活性化は、回収可能な全活性において観察される喪失を最もよく説明する。Ｘ３７細胞の添加は、恐らくはグルタルアルデヒド反応に提示されるより多くの標的に起因して、回収を改善する
架橋の値は、全ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼ活性のパーセンテージとして表された、ペレットのβ−ガラクトシダーゼ活性である。一般に、添加されたｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼタンパク質の殆どは架橋され、殆どの酵素活性は、２９９ｖ細胞が含められるか否かに関係なくペレット画分中に見られる。より高いタンパク質濃度については、回収は１００％に近い。
ペレット画分の顕微鏡検査は、ＧＬＡなしのサンプル（チューブ番号５）について正常なＸ３７単細胞を示した。細胞の添加なしで（チューブ番号６〜８）で架橋が行われたときは小さな凝集が観察され、これはバクテリア細胞と同じサイズであった。細胞およびタンパク質材料の両者からなる混合された凝集が、細胞およびｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼタンパク質の両方が添加された実験（チューブ２〜４）について観察された。ｌａｃＳを添加せずにインキュベートされた細胞もまた、架橋された細胞の小さい塊を示した（チューブ番号１）。
【０１０７】
実施例１１．室温での架橋と比較した、グルタルアルデヒドによるＢｅｔｖ１のラクトバチルスへの冷間架橋
カバノキ（Betula verrucosa）からの主要な花粉抗原であるＢｅｔｖ１は、１７ｋｄのタンパク質であり（Breiteneder H. et al. 1989 EMBO J., 8:1935-1938）、Ｉ型アレルギー反応（アレルギー性気管支喘息）の主原因の一つである。
次の成分が、Ｂｅｔｖ１のラクトバチルス細胞への冷間架橋の効率を決定するために行ったアッセイに含められた：
精製された組換えＢｅｔｖ１タンパク質は、文献［Spangfort et al. (1996) Prot. Exp. Purification, 8, 365-373］に記載された方法に従って得られた。
放射能でラベルされたＢｅｔｖ１タンパク質は、インビトロのタンパク質合成系を使用して製造された（RTS 100 E.coli HY Kit, Roche Applied Science）。簡単に言えば、Ｂｅｔｖ１リーディングフレームを含むＰＣＲ断片を、その増幅のために使用したＰＣＲプライマーに添加されたＮｄｅ１およびＳａｌ１制限部位によって、ｐＩＶＥＸ２．３ｄベクター（Roche社）の中にクローニングした。得られたクローンから精製されたプラスミドＤＮＡのうち、配列解析によってエラーのないＢｅｔｖ１コーディング配列を含むことが分かったものを、インビトロタンパク質合成のためのＤＮＡ鋳型として使用した。Ｌ−［³⁵Ｓ］メチオニン（SJ235, Amersham Biosciences）を使用し、製造業者が記載したようにして放射能ラベリングを行った。Ｂｅｔｖ１タンパク質を保持できる遠心分離３０Ｋフィルタ（Ultrafree, Amicon Bioseparations, Millipore）を使用して、インビトロ合成されたタンパク質から低分子量タンパク質を洗い流した。³⁵Ｓ−標識されたＢｅｔｖ１タンパク質がこの工程で精製され、ＳＤＳ・ＰＡＧＥ上で単一の優勢な放射活性バンドを与えた。最後に、この³⁵Ｓ−標識されたＢｅｔｖ１タンパク質は、放射能ラベリング実験に使用される混合物（１０μＬの³⁵Ｓ標識されたＢｅｔｖ１タンパク質、４９０μＬのＭ９緩衝液、５５０μＬのキャリアＢｅｔｖ１）を製造するために、Ｍ９緩衝液および非放射活性キャリアＢｅｔｖ１（４０μｇ／ｍＬ）と混合された。
ラクトバチルス細胞：実施例６に記載したようにして、ラクトバチルス・アシドフィルスの培養物（Ｘ３７）を増殖および調製した。
Ｂｅｔｖ１： ５０％グリセロールを含有するリン酸ナトリウム緩衝液中の１．３２ｍｇ／ｍＬ
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は、実施例６に記載した通りに調製した。
ラクトバチルス細胞、Ｂｅｔｖ１タンパク質溶液、およびグルタルアルデヒドを表１０に示した容積で混合し、直ちに液体窒素を使用して凍結した後、−２０℃の冷凍器中に配置した。
【表１０】

【０１０８】
−２０℃で３日後に、サンプルを解凍および遠心分離した。そのペレットを２００μＬのＭ９緩衝液で洗浄し、１００μＬのＭ９緩衝液中に再懸濁させた。該ペレット、上清および洗浄溶液中の³⁵Ｓ−放射能の測定が、５μＬの液滴を非吸収性紙表面上に置き、該液滴を５０℃で乾燥し、フィルムカセットの中で該乾燥された液滴を覆って超高感度の保存燐スクリーン（Storage Phosphor Screen：Pachard Instrument Company）を配置することによって行われた。露出された保存燐スクリーンを走査し（Cyclone, Pachard Instrument Company）、全ての分析スポットについて同じ直径を有する円形領域について検出された光単位（ＤＬＵ）信号を積算した。その結果が表１１に示されており（相対単位）、ここで表に纏められた値は、走査結果（ＤＬＵ／ｍＬ）×溶液容積（ｍＬ）として計算された。
【表１１】

【０１０９】
回収は、ペレット＋上清＋洗浄溶液中における、添加された³⁵Ｓ−Ｂｅｔｖ１活性の架橋後に検出された画分である。架橋は、ペレット中に検出された全³⁵Ｓ−Ｂｅｔｖ１活性のパーセンテージである。³⁵Ｓ−Ｂｅｔｖ１溶液の希釈を使用して、添加された全放射能を測定し、またサンプルが局在されていない非吸収性紙の面積を、測定されたＤＬＵ値からバックグラウンドを差引くために使用した。
【０１１０】
ペレット化区分の顕微鏡検査は、ＧＬＡなしのサンプルについて正常なＸ３７単細胞を示したのに対して、ＧＬＡか今日は、Ｂｅｔｖ１タンパク質物質で装飾された小さい凝集物の細胞を生じた（図４）。ペレット画分の中に見られるＢｅｔｖ１タンパク質の大部分は合体された細胞であることが分かったが、大きなタンパク質凝集物および小さい凝集物は、細胞洗浄の反復工程の間に除去されたであろう。
グルタルアルデヒドは、広範に使用されるタンパク質架橋剤である（Migneault I. et al. 2004 BioTechniques, 37:790-802）。比較実感において、室温のグルタルアルデヒドは、Ｂｅｔｖ１を二つの異なるタイプのラクトバチルス細胞に架橋させるために使用された。
【０１１１】
以下の成分が、ラクトバチルス細胞へのＢｅｔｖ１の室温架橋の効率を決定するために行ったアッセイに含められた。
ラクトバチルス細胞（Ａ）：ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｘ３７）の培養物は、実施例６に記載したようにして増殖および調製された。
ラクトバチルス細胞（Ｂ）：ラクトバチルス・アシドフィルス（６１６）の培養物は、実施例６に記載したようにして増殖および調製された。
Ｂｅｔｖ１： ５０％グリセロールを含有するリン酸ナトリウム緩衝液中の１．３２ｍｇ／ｍＬ
³⁵Ｓ−Ｂｅｔｖ１は、上記の通りに調製された。
Ｍ９緩衝液およびグルタルアルデヒド（ＧＬＡ）は、実施例６に記載した通りに調製した。
ラクトバチルス細胞、Ｂｅｔｖ１タンパク質溶液、およびグルタルアルデヒドを表１２に示した容積に従って混合し、室温で６０分間、周期的に混合しながらインキュベートした。
【表１２】

【０１１２】
室温でのインキュベーションの後、サンプルを遠心分離し、そのペレットを１００μＬのＭ９緩衝液で３回洗浄し、５０μＬのＭ９緩衝液中に再懸濁させた。該ペレット、上清および洗浄溶液中の³⁵Ｓ−放射能の測定が、５μＬの液滴を非吸収性紙表面上に置き、上記で述べたように処理することによって行われた。その結果が表１３に示されており（相対単位）、ここでの表に纏められた値は、走査結果（ＤＬＵ／ｍＬ）×溶液容積（ｍＬ）として計算された。


【表１３】

【０１１３】
回収および架橋について表に纏めたものは、上記で述べたようにして計算された。ペレット材料は顕微鏡で試験され、両ラクトバチルスの株の細胞は、架橋の結果として幾分大きな細胞凝集物を生じるが、同様の実験において、Ｍ９緩衝液を使用して細胞濃度を希釈したときには、細胞凝集は減少する（データは示さず）ことが分かった。
ラクトバチルス細胞と共に架橋されたＢｅｔｖ１タンパク質の小さい凝集物の生成は、室温で行われたときには１〜３％であるのに対して、冷間架橋法を使用すると１１％の平均架橋にまで増大したが、これは架橋レベルの有意で且つ予測されない改善である。
上記二つの架橋法に従って調製されたＢｅｔｖ１を表面結合させたラクトバチルス接合体は、１００倍に濃縮されてよい。各濃度の５μＬのアリコートは、実施例１５に従うＳ．Ｌ．Ｉ．Ｔ型実験においてマウスに投与されたときに、それぞれ冷間架橋または室温架橋に従って調製された、ラクトバチルス細胞に結合された０．３３０ｍｇまたは０．０７５ｍｇのＢｅｔｖ１タンパク質を含有する投与量を与えるであろう。
【０１１４】
実施例１２．グルタルアルデヒドによってラクトバチルスに架橋結合されたＢｅｔｖ１の表面分布
グルタルアルデヒドによってラクトバチルスに架橋結合されたＢｅｔｖ１の表面分布が、抗体に基づく検出法を用いて試験された。以下の容積を混合し、直ちに液体窒素を使用して凍結した後、−２０℃の冷凍器の中に配置した：１００μＬのラクトバチルス・アシドフィルス（Ｘ３７）細胞、５μＬのＢｅｔｖ１タンパク質および２μＬのＧＬＡ。全ての溶液は、実施例８に記載した通りである。架橋混合物からＢｅｔｖ１を省いたネガティブ対照を、当該実験の他のサンプルと同じ方法で処理した。
−２０℃で３日後、該混合物を解凍し、遠心分離し、そのペレットをＭ９緩衝液で洗浄した。残留グルタルアルデヒドからの自己蛍光を回避するために、当該ペレットを先ず５００μＬの４０ｍＭエタノールアミン中に再懸濁させ。室温で２時間インキュベートした。次いで、各サンプルを遠心分離し、次いでそのペレットを、２ｍＬのＮａＢＨ₄溶液（ＰＢＳ緩衝液中の１ｍｇ／ｍＬ、ｐＨ８．０）の中に室温で１０分間再懸濁させた。最後に、該ペレット物質を５００μＬのＭ９緩衝液で３回洗浄した。
ウサギ抗Ｂｅｔｖ１抗体（ALK-Abello A/S）を二次Ｃｙ−３標識抗ウサギ抗体（PA43004, Amersham Biosciences）と組み合せて使用することにより、Ｂｅｔｖ１の存在を視覚化させた。簡単に言えば、１μＬの一次抗体（ウサギ抗Ｂｅｔｖ１）と共に該ペレットを５００μＬのＴＢＳ（50 mM Tris, 0.9% NaCl, pH 7.6）中に再懸濁させ、室温で６０分間インキュベートした。次いで、このサンプルを遠心分離し、５００μＬのＴＢＳ緩衝液で３回洗浄し、該ペレットを、１μＬの二次交代（Ｃｙ−３抗ウサギ）と共に５００μＬのＴＢＳ中に再懸濁させ、暗所において室温で６０分間インキュベートした。最後に、該ペレットを５００μＬのＰＢＳで３回洗浄し、５００μＬのＰＢＳ中に最懸濁させ、ＣＣＤカメラ（Princeton Instuments）を備えた蛍光顕微鏡（Axioskop 2, Zeiss）によって分析したが、ここでの写真はＭｅｔａＭｏｒｐｈソフトウエア（Universal Imaging Company）を使用することにより作成された。
同一の設定を用いた顕微鏡およびカメラの下でサンプルを見るときに、明瞭な蛍光信号がラクトバチルス細胞の表面に局在化された。これは、Ｂｅｔｖ１タンパク質がラクトバチルス細胞の表面に架橋結合され得ること、および該架橋結合されたタンパク質（ｂｅｔｖ１）がその抗体認識特性を維持することを実証している。
【０１１５】
実施例１３．タンパク質化合物の非病原性バクテリア表面への化学的架橋の最適化および制御
化標的タンパク質化合物とバクテリア細胞の細胞表面との間の化学的架橋の形成速度、および細胞当りの結合された標的タンパク質の量は、架橋反応条件によって調節することができる。例えば、インキュベーション時間および温度は、必要な架橋度を得るように設定される。化学的架橋剤濃度、および標的タンパクの対細胞比は、１０¹²細胞当り約１ｎｇ〜少なくとも約１ｍｇの架橋された標的タンパク質架橋密度を生じるように、架橋反応において調節される。更に、反応プロセスの際の試薬の混合は、試薬間の効率的接触、バクテリア細胞の外表面でのタンパク質の均一な分布の両方を保証するために、また細胞凝集物の形成を防止するために定義される。バクテリア細胞に結合された標的タンパク質化合物の量、密度および分布は、免疫化学的方法および顕微鏡によって分析される。或いは、架橋のための別の二官能性化学試薬および架橋のための別のスペーサーが試験されてよい。本発明の開示された方法は、外表面に制御された量の架橋されたタンパク質を含んだ１以上のバクテリア細胞の製造を可能にする。
【０１１６】
実施例１４．非病原性バクテリアに架橋された標的タンパク質化合物の投与量評価
バクテリア細胞に架橋された、またはワクチンとして処方された標的タンパク質化合物（例えば酵素、抗原またはアレルゲン）の投与量は、次のようにして計算される。
架橋されたタンパク質の投与量＝Ｎ×Ｍ×ＣＦＵ／Ａ
ここで、Ｎは細胞当りの架橋されたタンパク質分子の数、Ｍは分子量、ＣＦＵは１回投与量中のコロニー形成単位の数、Ａはアボガドロ数の６．０２×１０²³／ｍｏｌである。
【０１１７】
実施例１において、表面結合されたβ−ガラクトシダーゼ分子の数は、バクテリア表面上のβ−ガラクトシダーゼ酵素活性に基づいて、細胞当り約６００〜８００分子と見積もられた。この見積りは、バクテリア細胞への抗原分子の結合が完了した後に、酵素活性が保存されることを仮定している。しかし、例えばＧＬＡ処理および／または全ての架橋されたβ−ガラクトシダーゼに対する基質分子の不完全なアクセスに起因して、酵素活性は有意に低下し得る。従って、表面結合された分子の数は、見積もられた６００〜８００よりも高い可能性がある。もし、ＧＬＡ処理によって酵素活性が２倍〜３倍低下するとすれば、細胞当りの分子の数は１，２００〜２，４００かもしれない。表面結合された分子の正しい数は、例えば同位体ラベルされた抗原または免疫に基づく技術を使用して、正確に決定することができる。
【０１１８】
実施例１および２において、結合反応における増大する量の抗原の添加は表面結合される抗原の量を増大させることが示されたから（図１および２）、抗原分子をバクテリア表面に結合するためのプロトコールは飽和性ではない。表面結合された抗原の量は、実施例７に詳述したように、架橋反応条件（ＧＬＡ濃度、温度および／またはインキュベーション時間を含む）を調節することによって更に増大させることができる。
【０１１９】
実施例６において、架橋結合されたＢＬＧタンパク質の量は約４６ｎｇ／ｍＬであった。ＢＧＬタンパク質は約１８，３００の分子量を有している。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、使用される反応容積について１×１０⁹細胞当り４．６ｎｇのＢＬＧタンパク質、または細胞当り１５１の架橋された分子に相当する。
【０１２０】
実施例７において、架橋結合されたＮｕｃタンパク質の量は、使用した最大のＮｕｃ濃度について約２２μｇ／ｍＬであった。Ｎｕｃタンパク質の分子量は約１８ｋｄである。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、使用される反応容積について４×１０⁸細胞当り２．２μｇのＮｕｃタンパク質、または細胞当り１８４×１０³の架橋された分子に相当する。
【０１２１】
実施例８において、架橋結合されたｌａｃＳ分子の数は、使用したキトサンの量に依存して、６〜５０％であることが分かった。該ｌａｃＳ・β−ガラクトシダーゼは、５７ｋｄのタンパク質である。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、２×１０⁸細胞当り０．４８〜４．０μｇのｌａｃＳタンパク質、または細胞当り２５×１０³〜２１１×１０³の架橋された分子に相当する。
【０１２２】
実施例９において、架橋結合されたアゾカゼイン分子の数は、添加された材料の約９０％であることが分かった。これは、使用した１００μＬの細胞溶液当り４５０μｇに相当する。カゼインは、２０〜２５ｋｄの範囲の分子量をもった幾つかの異なる形態で見出される。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、４×１０⁸細胞当り４５０μｇのカゼイン、または細胞当り約２７×１０⁸の架橋された分子に相当する。
【０１２３】
実施例１０において、架橋結合されたｌａｃＳ分子の数は、８０〜９０％であることが分かった。これは、使用した最大のｌａｃＳ容積について１００μＬの細胞溶液当り１８μｇに相当する。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、４×１０⁸細胞当り１８μｇのｌａｃＳ、または細胞当り約４７５×１０³の架橋された分子に相当する。
【０１２４】
実施例１１において、冷間法を使用して架橋結合されたＢｅｔｖ１分子の数は、添加された材料の約１０％であることが分かった。これは、使用した１００μＬの細胞溶液当り０．６６μｇに相当する。Ｂｅｔｖ１は、１７ｋｄのタンパク質である。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、４×１０⁸細胞当り０．６６μｇのＢｅｔｖ１、または細胞当り約５８×１０³の架橋された分子に相当する。
実施例１１において、室温法を使用して架橋結合されたＢｅｔｖ１分子の数は、１〜２％の範囲であることが分かった。これは、最大のＢｅｔｖ１容積について１００μＬの細胞溶液当り０．２μｇに相当する。ラクトバチルス培養物の一晩の増殖について２×１０⁹細胞／ｍＬを仮定すれば、これは、４×１０⁸細胞当り０．２μｇのＢｅｔｖ１、または細胞当り約１８×１０³の架橋された分子に相当する。
【０１２５】
実施例１において、バクテリア細胞の表面に架橋結合された標的タンパク質（β−ガラクトシダーゼ）は、約５０ｋＤａの質量を有している。従って、１０¹²細胞を含み且つ細胞当り約１，０００の標的タンパク質分子が架橋結合された、１回投与量中の標的タンパク質の量は次の通りである：
投与量架橋結合された標的タンパク質
＝１，０００×５０，０００ｇ×ｍｏｌ^-1×１０¹²／６．０２×１０²³ｍｏｌ^-1
＝８３μｇ
【０１２６】
実施例１５．動物モデルにおけるアレルギーの舌下投与による治療のための薬剤としての、表面結合されたカバノキ花粉アレルゲンＢｅｔｖ１を含有するラクトバチルス接合体の使用
１５．１ 方法
動物： 雌、６〜１０週齢のＢａｌｂ／ｃｊマウスを自社で繁殖させ、１２時間の明サイクルおよび１２時間の暗サイクル下での病原体を含まない特定の環境に収容した。ここに記載した全ての実験は、デンマーク法制に従って実施された。
１５．２ ＢｅｔＶ１・Ｌ．アシドフィルスＸ３７接合体の製造
共有結合されたＬ．アシドフィルスＸ３７／ＢｅｔＶ１アレルゲン接合体は、下記に記載したような、反復されたグルタルアルデヒド反応によって調製された：
ビオニールＡ／Ｓ国内株コレクション（Bioneer A/S internal strain collection）から入手したＬ．アシドフィルスＸ３７を、３０℃のＭＲＳ培地２５０ｍＬの中で、通気することなく２日間増殖させた。細胞を回収し、１００ｍＬのＭ９緩衝液中で洗浄し、得られた細胞ペレットを、使用するまで−２０℃で維持した。この細胞ペレットを１２５ｍＬのＭ９緩衝液中に溶解し、１２本の５０ｍＬのＮｕｎｃチューブの中に分けた。この細胞懸濁液および各チューブに対して、１０ｍＬのＭ９緩衝液、１５０μＬの２５％グルタルアルデヒド（1.04239, Merck）、および１５０μＬのＢｅｔＶ１（２．５６ｍｇ／ｍＬのの濃度）を混合し、室温で６０分間インキュベートし、頻繁に混合した。該混合物を４０００ＲＰＭで遠心分離し、上清を保持し、後での使用のために−２０℃で保存した。得られた細胞ペレットを１０ｍＬのＭ９緩衝液で洗浄し、５ｍＬのＭ９の中に再懸濁させ、プールし、次いで遠心分離し（４０００ＲＰＭ）、得られた細胞ペレットを最小容積のＭ９緩衝液の中に溶解させた。２．５ｍＬの細胞懸濁液が得られ、これを−８０℃で一晩維持した。この細胞懸濁液は、最初の架橋反応から保持された上清液を使用して、反復した架橋反応を受けた。この細胞懸濁液を、４本の５０ｍＬ・Ｎｕｎｃチューブの中に分け、各チューブに対して、２５ｍＬのＢｅｔＶ１（保持された上清）、１０ｍＬのアセトン、および５０μＬの２５％グルタルアルデヒドを添加した。この反応は室温で６０分間行われ、頻繁に混合された。遠心分離により細胞を回収し、１０ｍＬのＭ９緩衝液中で洗浄し、最小量のＭ９の中に溶解させた。１．５ｍＬの細胞懸濁液が得られ、これは免疫療法治療剤として使用するまで、−８０℃で保持された。
【０１２７】
１５．３ 舌下免疫療法（ＳＬＩＴ）治療
マウスを、３週間にわたって週に５日だけ、実施例１５．２に記載した室温架橋法によって製造された、ラクトバチルス・アシドフィルスＸ−３７の表面に結合されたＢｅｔＶ１（投与量当り２．５μｇのＢｅｔＶ１および２．５×１０⁹個のバクテリア）を含有する薬剤；またはａ）未処理のラクトバチルス・アシドフィルスＸ−３７（２．５×１０⁹個のバクテリア）、ｂ）二つの異なる濃度（投与量当り２．５μｇおよび５．０μｇ）、またはｃ）緩衝液を含んでなる対照組成物で治療した。ＳＬＩＴ治療の２週間後、これらのマウスはＡｌｕｍに吸着された１０μｇのＢｅｔＶ１で免疫感作され、また治療の３週間後に再度免疫感作された。最後の免疫感作の１１日後に、これらマウスを屠殺し、脾臓を摘出し、脾臓細胞を下記に記載するようにインビトロで再刺激した。
【０１２８】
１５．４ Ｔ細胞増殖およびサイトカイン産生
治療されたマウスから誘導された脾臓組織を、単細胞懸濁液中で細かく切断し、ＲＰＭＩ−１６４０（BioWhittaker, Belgium）の中で洗浄した。細胞をカウントし、５０μｇ／ｍＬのゲンタマイシン（Gibco, UK）、１％のヌトリドーマ（Roche, Germany）および１．５ｍＭのモノチオグリセロール（Sigma, USA）を含有するｒｐｍｉ−１６４０の中の１．６７×１０⁶細胞／ｍＬに調節した。９６穴の平底培養プレート（Nunc, Denmark）の各ウエルに３×１０⁵細胞を添加し、該細胞をＢｅｔｖ１（０、５および４０μｇ／ｍＬ）により刺激した。この細胞を、３７℃で６日間、５％ＣＯ₂の雰囲気中において培養した。培養器官の最後の１８時間に０．５μＣｉの³Ｈ−チミジンを各ウエルに添加し、続いてＴｏｍｔｅｃの９６ウエルプレート収穫器（Tomtec, USA）上に細胞を回収し、Ｗａｌｌａｃ・Ｍｉｃｒｏｂｅｔａ・１４５０液体シンチレーションカウンタ（Wallac, Finland）を使用して取り込まれた放射能ラベルをカウントすることによって、増殖を測定した。
【０１２９】
１５．５ 結果：
共有結合されたカバノキ花粉アレルゲンＢｅｔＶ１を含むラクトバチルス接合体または対照組成物で治療を受けたマウスから単離した脾臓細胞の、Ｂｅｔｖ１でインビトロ再刺激したときの増殖を測定することによって、Ｔ細胞応答を評価した。図６は、Ｂｅｔｖ１ラクトバチルスアシドフィルスＸ−３７接合体での前処理が、脾臓増殖の顕著な現象をもたらした個とを示しており、これはアレルゲン反応性Ｔ細胞の抑制と、それによるアレルギー反応の抑制を示している。ラクトバチルス・アシドフィルスＸ−３７単独、またはＢｅｔｖ１単独でマウスを前処理した場合には、そうではなかった。
【０１３０】
実施例１６．動物モデルにおけるバクテリア感染を治療するための薬剤としての、表面結合されたＳ．アウレウスヌクレアーゼを含んだラクトバチルス接合体に基づくスタフィロコッカス・アウレウスワクチンの使用
本発明に使用するためのＳ．アウレウス抗原ヌクレアーゼは、Ｌ．ラクチス発現系（Madsen et al., 1999 Mol Microbiol. 32:75-87）および実施例７に記載した方法を使用して製造することができる。ワクチン接合体は、実施例７に記載され通りに調製され、または実施例１１に記載したような最適化されたプロトコールを使用して調製された。使用したラクトバチルス株はＬ．アシドフィルスＸ３７であったが、高いアジュバント効果を示す他の株も試験される。異なる株のアジュバント効果は、実施例１８に記載の樹状細胞モデルにおいて試験される。
選択されたラクトバチルス株に表面結合されたヌクレアーゼを含むワクチン接合体が、マウス実験における経口ワクチンとして試験される。未処置のマウスを四つのグループに分ける。グループ１は、１ｍＬ当り１０⁸〜１０¹²バクテリアの３００μＬの経口投与を受ける； グループ２は、同じ濃度の未処理のバクテリアの投与を受ける；グループ３は、前記接合体の濃度に対応する濃度で、ヌクレアーゼタンパク質を単独で受ける；グループ４は、リン酸緩衝液を単独で受ける。種々の治療剤が、３週間に亘って１日１回経口投与される。血液サンプルが採取され、ＥＬＩＳＡ法を使用して前記ヌクレアーゼに特異的な抗体が分析される。更に、例えば５週間に亘る１週間に１回の免疫感作、または経口投与の代りに鼻投与が使用される他のワクチン接種計画および戦略が試験される。
【０１３１】
実施例１７．本発明の方法によるアレルギーワクチンの製造、および動物モデルにおける該ワクチンの投与
実施例１１に記載の最適化された化学的架橋技術を使用して、細胞表面にアレルゲンが共有結合された非病原性バクテリアを製造した。この実施例は、ピーナッツ由来のアレルゲン、またはミルクアレルゲンであるＢ−ラクトグロブリン由来のアレルゲンを用いたワクチンの製造に焦点が当てられている。このアレルギーワクチンの製造には、以下の工程が用いられる
【０１３２】
１７．１．株の選別
多くのバクテリア株が、実施例１８および文献（Christensen H.R. et al. 2002, J Immunology 168:171-8）に記載されたような、インビトロ樹状細胞モデルにおいて分析される。好ましい株は、Ｔｈ１偏向免疫応答の顕著な誘導またはディスプレイされたアレルゲンに対する耐性の誘導を特徴とするものである。
【０１３３】
１７．２．アレルゲンの製造
ピーナッツアレルゲンＡｒａＨ２が、遺伝子発現系を使用して大腸菌の中で産生された。このアレルゲンをコードする遺伝子は、適合性発現ベクターであるｐＡＭＪ２９７に挿入され、Ｌ．ラクチス株の中に導入され、次いで文献（Madsen S. et al. 1999 Mol Microbiol. 32:75-87.）に記載のように、発酵槽の増殖培地の中で培養される。該アレルゲンは、発酵増殖の際に、組換えＬ．ラクチスによって合成および分泌される次いで、例えば交差流濾過を使用して、細胞培養物から上清を分離する。この上清中の組換えアレルゲンは、従来のタンパク質精製法、例えばゲル濾過を使用して精製される。得られたアレルゲンは、適切な緩衝液、例えばＭ９緩衝液中に溶解される。β−ラクトグロブリンアレルゲンは、実施例１に記載したようにして得られる。
【０１３４】
１７．３．非病原性バクテリア細胞バイオマスの製造
工程１において選択された株は、複合培地、例えば動物実験および獣医学的使用のためのワクチンの調製のためのＭＲＳ（Ｏｘｏｉｄ）を用いた、適切な増殖培地の中で培養される。ヒトに使用するワクチンを調製するための株培養については、動物起源の増殖培地成分中の感染性物質、例えばウイルスおよびプリオンの危険に起因して、合成成分のみに基づく増殖培地が用いられる。ヒトに使用するワクチンの調製に使用される増殖培地はまた、例えばＦＤＡにより制定された安全性ガイドラインに合致すべきである。発酵装置における培養の後、バクテリア細胞は、例えば交差流濾過を使用して増殖培地から分離される。このバクテリア細胞は、新鮮な増殖培地または適切な緩衝液、例えばM9緩衝液中に再懸濁される。オートクレーブ処理された等容積の５０％グリセロールを添加することにより、該細胞は−８０℃で少なくとも１年間保存することができる。
【０１３５】
１７．４．架橋反応および製剤
工程３で製造されたバクテリア、および工程２で製造されたアレルゲンは、実施例６に記載した方法を使用して架橋される。こうして得られたアレルゲンが表面に結合されたバクテリアは、次の試験において評価される。表面結合されたアレルゲンの量は、免疫技術を使用して、例えばＥＬＩＳＡ試験においてアレルゲン特異的な蛍光ラベルされた抗体を適用することによって測定される。或いは、架橋反応からの細胞抽出物中に存在する表面結合したアレルゲンの量は、放射能ラベルされたアレルゲンを使用して、実施例６における方法で決定される。加えて、バクテリア表面におけるアレルゲンの分布は、同じ抗体を顕微鏡分析に使用して分析される。この表面結合されたアレルゲンを含む細胞は、緩衝液、例えばＭ９緩衝液中に懸濁され、工程３に記載したようにして、グリセロール中において−８０℃で保存される。
【０１３６】
１７．５．抗原が表面結合されたバクテリアの動物アレルギーモデルにおける試験
工程４からの表面結合されたアレルゲンを含んだ細胞が試験ワクチンを構成し、これは１０⁸〜１０¹¹の細胞を含むアリコートに分割される。各々が１０匹のマウスを含む四つのグループが、以下のプロトコールに従って、試験ワクチンでまたは対照ワクチンでワクチン接種される：二つのグループは異なる量の医師権ワクチンを受ける；一つのグループは、表面結合されたアレルゲンを伴わないバクテリア細胞を含む対照ワクチンを受け、残りのグループは精製されたアレルゲンからなる対照ワクチンを受ける。このワクチンは、文献（Repa et al. 2004 Clin Exp Immunol. 1:12-8）に記載の動物モデルを使用して、蛍光投与または鼻投与される。或いは、アレルギーモデルが使用され、ここではアレルゲンに対して動物を感作するために、最初にコレラ毒素アジュバントと組み合わせた５μｇ／ｍＬのアレルゲンでマウスを免疫感作する。その後、当該応答を脱感作するために、該マウスは前記ワクチン接合体で傾向的に治療される。これは、実施例１５に記載した脾臓細胞活性化アッセイおよびＩｇＥ抗体の評価によって評価される。ピーナッツアレルギーについてのアレルギーモデルは、文献（Xiu-Min Li et al J allergy Clin Immunol 2000 106:1）に記載されており、またβ−ラクトグロブリンについては文献（Xiu-Min Li et al J allergy Clin Immunol 2001 107:4）に記載されている。これらのプロトコールは、本発明の試験において使用された。
【０１３７】
実施例１８．未処理バクテリアおよび接合体の免疫刺激効果
樹状細胞（ＤＣ）は、Ｔｈ１、Ｔｈ２およびＴｈ３細胞バランスにおいて重要な免疫調節的役割を果たし、動物またはヒトの粘膜表面の全体に亘って存在している。従って、ＤＣは当該ワクチン接合体による調節の標的であり得る。本実施例において、我々は、インビトロでのＤＣに対する本発明のワクチン接合体の免疫刺激効果を分析した。該ＤＣモデルを使用して、望ましい免疫応答を刺激するバクテリア株を選択した。従って、伝統的な病原体ワクチンの場合、高いアジュバント効果を備えたバクテリア株が好ましい。しかし、免疫系をＴｈ１型応答に向けて偏向させるバクテリア株は、アレルギーワクチンのためには望ましい可能性がある一方、強いＣＤ８＋細胞障害性Ｔ細胞応答を好むバクテリア株は、癌ワクチンの開発において好ましい可能性がある。同ように、耐性または抗炎症性を誘導するバクテリア株は、自己免疫疾患の治療のためのワクチン接合体の設計において好ましいかも知れない。
【０１３８】
１８．１．ワクチン接合体
Ｌ．アシドフィルスＸ３７に表面結合されたβ−ガラクトシダーゼを含むワクチン接合体を、実施例１０に記載したようにして調製した。骨髄細胞を、文献（Lutz et al. J. Immunol. Methods 1999 223:77）の記載方法を僅かに変更した方法で単離し、培養した。簡単に言えば、８から１２週齢の２匹の雌Ｃ５７ＢＬ／６マウス（Charles River Breeding Laboratories, Portage, MI）からの大腿骨および脛骨を除去し、筋肉および腱を剥がした。これらの骨を７０％エタノールの中に２分間浸漬し、ＰＢＳ中で濯いだ後、両端を鋏で切除し、２７ゲージの針を使用して骨髄をＰＢＳでフラッシュした。細胞クラスターを反復ぴペッティングにより解離させた。得られた細胞懸濁液を１０分間３００×ｇで遠心分離し、ＰＢＳ中で１回洗浄した。細胞を、４ｍＭのＬ−グルタミン、１００Ｕ／ｍＬのペニシリン、１００μｇ／ｍＬのストレプトマイシン、５０μＭの２−ＭＥ、１０％（ｖ／ｖ）の熱不活性化されたＦＢＳ（Atlanta Biologicals, Norcross, GA）、および１５ｎｇ／ｍＬのマウスＧＭ−ＣＳＦを補充したＲＰＭＩ１６４０（Sigma-Aldrich, St. Louis, MO）の中に際懸濁させた。ＧＭ−ＣＳＦは、ＧＭ−ＣＳＦ産生細胞株（ＧＭ−ＣＳＦトランスフェクトされたＡｇ８．６５３ミエローマ細胞株：Zal et al. 1994 J. Immunol. Methods 223:77）から回収された５〜１０％（ｖ／ｖ）培養上清として添加した。この製造されたＧＭ−ＣＳＦを、特異的ＥＬＩＳＡキット（BD PharMingen, San Diego, CA）を使用して定量した。ＤＣを富化させるために、３×１０⁶個の白血球を含む１０ｍＬの細胞懸濁液を、１００ｍｍの細菌学的ペトリ皿に播種し（第０日）、５％のＣＯ₂雰囲気中において３７℃で８日間インキュベートした。第３日に、新鮮な調製された追加の培地１０ｍＬを各プレートに添加した。第６日に、各プレートから９ｍＬを３００×ｇで５分間遠心分離し、得られた細胞ペレットを１０ｍＬの新鮮な培地中に再懸濁させ、該再懸濁液を皿に戻した。第８日に、下記に説明するように、細胞を使用して、サイトカイン放出および表面マーカーの発現に対するラクトバチルスの効果を評価した。
【０１３９】
１８．２．サイトカイン放出の誘導
８日齢のＤＣ富化された培養物を含むペトリ皿から、非付着製細胞を穏やかにピペッティングした。集められた細胞を３００×ｇで５分間遠心分離し、１０ｎｇ／ｍＬのＧＭ−ＣＳＦだけを補充した培地中に再懸濁させた。細胞を、４８ウエルの組織培養プレートに１０⁸／５００μＬ／ウエルの密度で播種し、次いで各ウエルに次の溶液のうちの一つを添加した（１００μＬ／ウエル）。ａ）表意面結合されたＬａｃＳを備えた接合されたＬ．アシドフィルスＸ３７（１〜１０００μｇ／ｍＬ）溶液、ｂ）未処理のＬ．アシドフィルスＸ３７（１〜１０００μｇ／ｍＬ）溶液、ｃ）精製されたＬａｃＳ・β−ガラクトシダーゼ（ＬａｃＳ接合体と同様のＬａｃＳ濃度で、実施例３に記載した通りに調製した）、ｄ）ＬＰＳ（大腸菌Ｏ２６：Ｂ６；Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）が、ポジティブ対照として１μｇ／ｍＬで幾つかの培養物に添加された。培地のみ、または２μｍのラテックスビーズ（Polysciences, Warrington, PA）を含む培地を、それぞれ未刺激の対照およびネガティブ対照として使用した。５％ＣＯ₂における３７℃で１５時間の刺激時間の後、培養上清を回収し、サイトカイン分析を行うまで−８０℃で保存した。
【０１４０】
１８．３． 培養上清におけるサイトカインの定量
商業的に入手可能なＥＬＩＳＡキット（BD PharMingen）を、製造業者の指示に従って使用することにより、ＩＬ−１２およびＴＮＦ−αが分析された。ＢＤ・ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎから購入した適合性Ａｂ対を使用して、ＩＬ−１０およびＩＬ６が同ように分析された。
【０１４１】
１８．４．結果
ワクチン接合体で刺激された樹状細胞は、ＩＬ−１２誘導を示した（図７）。更に、ＩＬ−１２の誘導は、接合体濃度を増大させるに伴って増大した。当該ワクチン接合体は、未処理のＬ．足フィル巣度のそれと同様のＩＬ−１２誘導を示し、バクテリアのアジュバント成分がワクチン接合体において保存されることを示した。接合に使用されたタンパク質（ＬａｃＳ）は、単独では免疫誘導を示さなかった。
【図面の簡単な説明】
【０１４２】
【図１】図１は、１μｇ／ｍＬまたは２μｇ／ｍＬのβ−ガラクトシダーゼを使用した、ラクトバチルスに対する化学的架橋結合を示すグラフである。
【図２】図２は、ラクトバチルスに対するアラビノースイソメラーゼの化学的架橋結合を示すグラフである。
【図３】図３は、エンハンサ分子としてキトサンを使用した、ラクトバチルスに対するβ−ガラクトシダーゼの化学的架橋を示すグラフである。
【図４】図４は、実施例１１に記載された、グルタルアルデヒドを使用したラクトバチルス細胞に対するＢｅｔｖ１タンパク質の化学的架橋結合を示す写真である。
【図５】図５は、グルタルアルデヒドを使用してラクトバチルス細胞に架橋結合されたＢｅｔｖ１の表面分布を示す写真である．
【図６】図６は、ＳＬＩＴ処理、免疫感作およびその後のインビトロでの再刺激後の脾臓細胞の増殖を示すグラフである。
【図７】図６は、未処理のラクトバチルス、ＬａｃＳ結合したラクトバチルス、またはＬａｃＳタンパク質単独を使用したインビトロでの樹状細胞刺激を示すグラフである。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる、薬剤として使用するための医薬組成物であって：
ａ）１以上の非病原性バクテリア株の細胞と、
ｂ）二官能性架橋剤によって、前記細胞の表面上のアクセス可能な化学的物質に結合された１以上のタンパク質化合物と
を含んでなり、
前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まず、また前記二官能性架橋剤はシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に共有結合され、また前記タンパク質化合物および前記架橋剤は前記細胞に対して起源において異種である医薬組成物。
【請求項２】
請求項１に記載の組成物であって、前記二官能性架橋剤は、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジンおよびパラホルムアルデヒドからなる群から選択される組成物。
【請求項３】
請求項１または２に記載の組成物であって、前記生物学的媒介物は、遺伝子的に修飾されていないバクテリア株もしくは遺伝子的に修飾されたバクテリア株、またはそれらの組み合せの細胞を含んでなる組成物。
【請求項４】
請求項１〜３の何れか１項に記載の組成物であって、前記バクテリア株は、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性のスタフィロコッカス、および非病原性のバチルスからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項５】
請求項１〜４の何れか１項に記載の組成物であって、前記株は、ラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項６】
請求項１〜５の何れか１項に記載の組成物であって、前記株は、ラクトバチルス・アセトトレランス、ラクトバチルス・アシジピシチス、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・アギリス、ラクトバチルス・アルギドゥス、ラクトバチルス・アリメタリウス、ラクトバチルス・アミロリティクス、ラクトバチルス・アミロフィルス、ラクトバチルス・アミロボルス、ラクトバチルス・アニマリス、ラクトバチルス・アリゾネンシス、ラクトバチルス・アビアリウス、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス、ラクトバチルス・ブレビス、ラクトバチルス・ブフネリ、ラクトバチルス・カゼイ、ラクトバチルス・コエロホミニス、ラクトバチルス・コリノイデス、ラクトバチルス・コリニホルミス・亜種コリニホルミス、ラクトバチルス・コリニホルミス亜種トルケンス、ラクトバチルス・クリスパツス、ラクトバチルス・クルバツス、ラクトバチルス・サイプリカセイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ラクチス、ラクトバチルス・ドゥリアヌス、ラクトバチルス・エクイ、ラクトバチルス・ファルチミニス、ラクトバチルス・フェリントシェンシス、ラクトバチルス・フェルメントゥム、ラクトバチルス・フォルニカリリス、ラクトバチルス・フルクチボランス、ラクトバチルス・フルメンティ、ラクトバチルス・フクエンシス、ラクトバチルス・ガリナルム、ラクトバチルス・ガッセリ、ラクトバチルス・グラミニス、ラクトバチルス・ハムステリ、ラクトバチルス・ヘルベチクス、ラクトバチルス・ヘルベチクス亜種ジュグルチ、ラクトバチルス・ヘテロヒオッキイ、ラクトバチルス・ヒルガルディイ、ラクトバチルス・ホモヒオッキイ、ラクトバチルス・インテスチナリス、ラクトバチルス・ジャポニクス、ラクトバチルス・ジェンセニイ、ラクトバチルス・ジョンソニイ、ラクトバチルス・ケフィリ、ラクトバチルス・キムチイ、ラクトバチルス・クンケエイ、ラクトバチルス・レイヒマンニイ、ラクトバチルス・レティバジ、ラクトバチルス・リンドネリ、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス、ラクトバチルス・マリ、ラクトバチルス・マルタロミクス、ラクトバチルス・マニホチボランス、ラクトバチルス・ミンデンシス、ラクトバチルス・ムコサエ、ラクトバチルス・ムリヌス、ラクトバチルス・ナゲリイ、ラクトバチルス・オリス、ラクトバチルス・パニス、ラクトバチルス・パンテリ、ラクトバチルス・パラブフネリ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種パラカセイ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種シュードプランタルム、ラクトバチルス・パラカセイ亜種トレランス、ラクトバチルス・パラケフィリ、ラクトバチルス・パラリメンタリウス、ラクトバチルス・パラプランタルム、ラクトバチルス・ペントスス、ラクトバチルス・ペロレンス、ラクトバチルス・プランタルム、ラクトバチルス・ポンチス、ラクトバチルス・プシタチ、ラクトバチルス・リューテリ、ラクトバチルス・ラムノスス、ラクトバチルス・ルミニス、ラクトバチルス・サケイ、ラクトバチルス・サリバリウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリチニウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリバリウス、ラクトバチルス・サンフランシセンシス、ラクトバチルス・シャルペアエ、ラクトバチルス・スエビクス、ラクトバチルス・テルモフィルス、ラクトバチルス・テルモトレランス、ラクトバチルス・ワクチノステルクス、ラクトバチルス・バギナリス、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス、ラクトバチルス・ビツリヌス、ラクトバチルス・ベルミホルメ、ラクトバチルス・ゼアエ、ビフィドバクテリウム・アドレッセンチス、 ビフィドバクテリウム・アエロフィルム、ビフィドバクテリウム・アンギュラツム、ビフィドバクテリウム・アニマリス、ビフィドバクテリウム・アステロイデス、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム、ビフィドバクテリウム・ボウム、ビフィドバクテリウム・ブレベ、 ビフィドバクテリウム・カテヌラツム、ビフィドバクテリウム・コエリヌム、ビフィドバクテリウム・コリネフォルメ、ビフィドバクテリウム・クニクリ、ビフィドバクテリウム・デンティウム、ビフィドバクテリウム・ガリクム、ビフィドバクテリウム・ガリナルム、ビフィドバクテリウム・インディクム、ビフィドバクテリウム・ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ インファンティス、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ スイス、ビフィドバクテリウム・マグヌム、ビフィドバクテリウム・メリチクム、ビフィドバクテリウム・ミニマム、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種グロボスム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種シュードロングム、ビフィドバクテリウム・プシクロアエロフィルム、ビフィドバクテリウム・プロルム、ビフィドバクテリウム・ルミナンティウム、ビフィドバクテリウム・サエキュラレ、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ、ビフィドバクテリウム・スブティレ、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム亜種スイス、ビフィドバクテリウム・テルモフィルム、ビフィドバクテリウム・ウリナリスから選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項７】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原、またはその変異体である組成物。
【請求項８】
請求項７に記載の組成物であって、前記動物もしくはヒトの病原体が、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン（例えばクロイッツフェルト−ヤコブ病を生じるものまたは変異体）、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される組成物。
【請求項９】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、抽出物、精製物、組換え体、突然変異体もしくはペプチド供給源、またはそれらの変種のアレルゲンを含んでなる組成物。
【請求項１０】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンの供給源は、カバノキ、ネコ、杉樹、オリーブ樹、ブタクサ、他の雑草、刺す昆虫、蚊／蚋、ゴキブリ、ウシ、イヌ、塵ダニ、草、屋外カビ、屋内カビ、齧歯類、ウマ、ナッツ、ミルク、大豆、小麦、卵、甲殻類および魚からなる群から選択される組成物。
【請求項１１】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ花粉（Bet v）、草花粉（Phl p、Lol p、Cyn dまたはSor h）、ハウスダストダニ（Der pまたはDer f）、ダニ（Eur m 、Blo t 、Gly m、Lep d）、ブタクサ花粉（Amb a）、杉樹花粉（Cry j）、ネコ（Fel d）、スズメバチ（Ves vまたはDol m）、ミツバチ（Api m）およびゴキブリ（Bla gおよびPer a）からなる群から選択される組成物。
【請求項１２】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンが、Ｂｅｔｖ１、Ｂｅｔｖ２、Ｐｈｌ ｐ１もしくはＰｈｌ ５、Ｌｏｌ ｐ１、Ｌｏｌ ｐ５、Ｃｙｎ ｄ１、Ｓｏｒ ｈ１、Ｄｅｒ ｐ１、Ｄｅｒ ｐ２、Ｄｅｒ ｆ１、Ｄｅｒ ｆ２、Ｅｕｒ ｍ１、Ｂｌｏ ｔ１、Ｇｌｙ ｍ１、Ｌｅｐ ｄ１、Ａｍｂ ａ１、Ｃｒｙ ｊ１、Ｆｅｌ ｄ１、Ｖｅｓ ｖ１、２または５、Ｄｏｌ ｍ１、Ｄｏｌ ｍ２、Ｄｏｌ ｍ５、Ａｐｉ ｍ１、Ｂｌａ ｇ１、およびＰｅｒ ａ１からなる群から選択されるタンパク質またはペプチドである組成物。
【請求項１３】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物またはヒトの癌抗原またはその変異体である組成物。
【請求項１４】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物またはヒトを起源とする自己抗原またはその変異体である組成物。
【請求項１５】
請求項１〜１４の何れか１項に記載の組成物であって、更に、スペーサー化合物を含有する組成物。
【請求項１６】
請求項１５に記載の組成物であって、前記スペーサーがキトサンである組成物。
【請求項１７】
請求項１〜１６の何れか１項に記載の組成物であって、細胞当りの前記結合されたタンパク質化合物の分子数が１〜約１００，０００の範囲である組成物
【請求項１８】
請求項１〜１６の何れか１項に記載の組成物であって、細胞当りの前記結合されたタンパク質化合物の分子数が１〜約１０，０００の範囲である組成物。
【請求項１９】
請求項１〜１８の何れか１項に記載の組成物を含有してなる封入された製剤。
【請求項２０】
請求項１〜１９の何れか１項に記載の組成物の使用であって、動物またはヒト患者における感染性疾患、癌、アレルギー、および自己免疫疾患からなる群から選択される疾患を予防および／または治療するための薬剤を製造するための使用。
【請求項２１】
請求項９〜１１の何れか１項に記載の組成物の使用であって、動物またはヒト患者におけるアレルギーを予防および／または治療するための薬剤を製造するための使用。
【請求項２２】
請求項２０に記載の組成物の使用であって、前記感染性疾患は、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン（例えばクロイッツフェルト−ヤコブ病を生じるものまたは変異体）、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される動物またはヒトの病原体によって生じる使用。
【請求項２３】
動物またはヒト患者の疾患またはアレルギーを予防および／または治療するための方法であって、前記患者に、請求項１〜２２の何れか１項に記載の組成物の有効投与量を投与する方法。
【請求項２４】
請求項２３に記載の方法であって、前記疾患は、感染性疾患、癌、アレルギーおよび自己免疫疾患からなる群から選択される方法。
【請求項２５】
１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる請求項１の医薬組成物を製造する方法であって：
ａ．下記を含有する混合物を調製することと；
ｉ）１以上のバクテリア株の細胞、
ｉｉ）１以上の異種タンパク質化合物、および
ｉｉｉ）異種二官能性架橋剤
ｂ．該混合物をインキュベートして、前記二官能性架橋剤がシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に共有結合された前記生物学的媒介物を形成する工程と；
ｃ．該生物学的媒介物を前記混合物から分離する工程と
を含んでなり、
前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まない方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、前記二官能性架橋剤が、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジンおよびパラホルムアルデヒドからならる群から選択される方法。
【請求項２７】
請求項２５または２６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）における混合物が０℃以下の温度でインキュベートされる方法。
【請求項２８】
請求項２５または２６に記載の方法であって、前記温度が、−１℃〜−３０℃である方法。
【請求項２９】
請求項２５〜２８の何れか１項に記載の方法であって、前記生物学的媒介物が、遺伝子修飾されていないバクテリア株または遺伝子修飾されたバクテリア株を含んでなる方法。
【請求項３０】
請求項２５〜２９の何れか１項に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性のスタフィロコッカス、および非病原性のバチルスからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである方法。
【請求項３１】
請求項３０に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである方法。
【請求項３２】
請求項３１に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトバチルス・アセトトレランス、ラクトバチルス・アシジピシチス、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・アギリス、ラクトバチルス・アルギドゥス、ラクトバチルス・アリメタリウス、ラクトバチルス・アミロリティクス、ラクトバチルス・アミロフィルス、ラクトバチルス・アミロボルス、ラクトバチルス・アニマリス、ラクトバチルス・アリゾネンシス、ラクトバチルス・アビアリウス、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス、ラクトバチルス・ブレビス、ラクトバチルス・ブフネリ、ラクトバチルス・カゼイ、ラクトバチルス・コエロホミニス、ラクトバチルス・コリノイデス、ラクトバチルス・コリニホルミス・亜種コリニホルミス、ラクトバチルス・コリニホルミス亜種トルケンス、ラクトバチルス・クリスパツス、ラクトバチルス・クルバツス、ラクトバチルス・サイプリカセイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ラクチス、ラクトバチルス・ドゥリアヌス、ラクトバチルス・エクイ、ラクトバチルス・ファルチミニス、ラクトバチルス・フェリントシェンシス、ラクトバチルス・フェルメントゥム、ラクトバチルス・フォルニカリリス、ラクトバチルス・フルクチボランス、ラクトバチルス・フルメンティ、ラクトバチルス・フクエンシス、ラクトバチルス・ガリナルム、ラクトバチルス・ガッセリ、ラクトバチルス・グラミニス、ラクトバチルス・ハムステリ、ラクトバチルス・ヘルベチクス、ラクトバチルス・ヘルベチクス亜種ジュグルチ、ラクトバチルス・ヘテロヒオッキイ、ラクトバチルス・ヒルガルディイ、ラクトバチルス・ホモヒオッキイ、ラクトバチルス・インテスチナリス、ラクトバチルス・ジャポニクス、ラクトバチルス・ジェンセニイ、ラクトバチルス・ジョンソニイ、ラクトバチルス・ケフィリ、ラクトバチルス・キムチイ、ラクトバチルス・クンケエイ、ラクトバチルス・レイヒマンニイ、ラクトバチルス・レティバジ、ラクトバチルス・リンドネリ、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス、ラクトバチルス・マリ、ラクトバチルス・マルタロミクス、ラクトバチルス・マニホチボランス、ラクトバチルス・ミンデンシス、ラクトバチルス・ムコサエ、ラクトバチルス・ムリヌス、ラクトバチルス・ナゲリイ、ラクトバチルス・オリス、ラクトバチルス・パニス、ラクトバチルス・パンテリ、ラクトバチルス・パラブフネリ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種パラカセイ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種シュードプランタルム、ラクトバチルス・パラカセイ亜種トレランス、ラクトバチルス・パラケフィリ、ラクトバチルス・パラリメンタリウス、ラクトバチルス・パラプランタルム、ラクトバチルス・ペントスス、ラクトバチルス・ペロレンス、ラクトバチルス・プランタルム、ラクトバチルス・ポンチス、ラクトバチルス・プシタチ、ラクトバチルス・リューテリ、ラクトバチルス・ラムノスス、ラクトバチルス・ルミニス、ラクトバチルス・サケイ、ラクトバチルス・サリバリウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリチニウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリバリウス、ラクトバチルス・サンフランシセンシス、ラクトバチルス・シャルペアエ、ラクトバチルス・スエビクス、ラクトバチルス・テルモフィルス、ラクトバチルス・テルモトレランス、ラクトバチルス・ワクチノステルクス、ラクトバチルス・バギナリス、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス、ラクトバチルス・ビツリヌス、ラクトバチルス・ベルミホルメ、ラクトバチルス・ゼアエ、ビフィドバクテリウム・アドレッセンチス、 ビフィドバクテリウム・アエロフィルム、ビフィドバクテリウム・アンギュラツム、ビフィドバクテリウム・アニマリス、ビフィドバクテリウム・アステロイデス、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム、ビフィドバクテリウム・ボウム、ビフィドバクテリウム・ブレベ、 ビフィドバクテリウム・カテヌラツム、ビフィドバクテリウム・コエリヌム、ビフィドバクテリウム・コリネフォルメ、ビフィドバクテリウム・クニクリ、ビフィドバクテリウム・デンティウム、ビフィドバクテリウム・ガリクム、ビフィドバクテリウム・ガリナルム、ビフィドバクテリウム・インディクム、ビフィドバクテリウム・ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム bv ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム bv インファンティス、ビフィドバクテリウム・ロングム bv スイス、ビフィドバクテリウム・マグヌム、ビフィドバクテリウム・メリチクム、ビフィドバクテリウム・ミニマム、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種グロボスム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種シュードロングム、ビフィドバクテリウム・プシクロアエロフィルム、ビフィドバクテリウム・プロルム、ビフィドバクテリウム・ルミナンティウム、ビフィドバクテリウム・サエキュラレ、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ、ビフィドバクテリウム・スブティレ、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム亜種スイス、ビフィドバクテリウム・テルモフィルム、ビフィドバクテリウム・ウリナリスから選択されるバクテリア種のメンバーである方法。
【請求項３３】
請求項２５〜３２の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原、またはその変異体である方法。
【請求項３４】
請求項３３に記載の方法であって、前記動物もしくはヒトの病原体が、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン（例えばクロイッツフェルト−ヤコブ病を生じるものまたは変異体）、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される方法。
【請求項３５】
請求項２５〜３４の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、抽出物、精製物、組換え体、突然変異体もしくはペプチド供給源、またはそれらの変種のアレルゲンである方法。
【請求項３６】
請求項３３に記載の方法であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ、ネコ、杉樹、オリーブ樹、ブタクサ、他の雑草、刺す昆虫、蚊／蚋、ゴキブリ、ウシ、イヌ、塵ダニ、草、屋外カビ、屋内カビ、齧歯類、ウマ、ナッツ、ミルク、大豆、小麦、卵、甲殻類および魚からなる群から選択される方法。
【請求項３７】
請求項３５に記載の方法であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ花粉（Bet v）、草花粉（Phl p、Lol p、Cyn dまたはSor h）、ハウスダストダニ（Der pまたはDer f）、ダニ（Eur m 、Blo t 、Gly m、Lep d）、ブタクサ花粉（Amb a）、杉樹花粉（Cry j）、ネコ（Fel d）、スズメバチ（Ves vまたはDol m）、ミツバチ（Api m）およびゴキブリ（Bla gおよびPer a）からなる群から選択される法。
【請求項３８】
請求項３５に記載の方法であって、前記アレルゲンが、Ｂｅｔｖ１、Ｂｅｔｖ２、Ｐｈｌ ｐ１もしくはＰｈｌ ５、Ｌｏｌ ｐ１、Ｌｏｌ ｐ５、Ｃｙｎ ｄ１、Ｓｏｒ ｈ１、Ｄｅｒ ｐ１、Ｄｅｒ ｐ２、Ｄｅｒ ｆ１、Ｄｅｒ ｆ２、Ｅｕｒ ｍ１、Ｂｌｏ ｔ１、Ｇｌｙ ｍ１、Ｌｅｐ ｄ１、Ａｍｂ ａ１、Ｃｒｙ ｊ１、Ｆｅｌ ｄ１、Ｖｅｓ ｖ１、２または５、Ｄｏｌ ｍ１、Ｄｏｌ ｍ２、Ｄｏｌ ｍ５、Ａｐｉ ｍ１、Ｂｌａ ｇ１、およびＰｅｒ ａ１からなる群から選択されるタンパク質またはペプチドである方法。
【請求項３９】
請求項２５〜３２の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、動物またはヒトの癌抗原またはその変種である方法。
【請求項４０】
請求項２５〜３４の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、動物またはヒトを起源とする自己抗原またはその変異体である方法。
【請求項４１】
請求項２５〜４０の何れか１項に記載の方法であって、前記混合物が、更にスペーサー化合物を含有する方法。
【請求項４２】
請求項３７に記載の方法であって、前記スペーサーがキトサンである方法。
【請求項４３】
請求項２３〜３８の何れか１項に記載の方法であって、前記結合されたタンパク質化合物の細胞当りの分子数が１〜約１００，０００の範囲である方法。
【請求項４４】
請求項２３〜３８の何れか１項に記載の方法であって、前記結合されたタンパク質化合物の細胞当りの分子数が１〜約１０，０００の範囲である方法
【請求項４５】
請求項２３〜４０の何れか１項に記載の方法であって、更に、前記生物学的媒介物を封入する工程を含んでなる方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【公表番号】特表２００８−５２３１１６（Ｐ２００８−５２３１１６Ａ）
【公表日】平成２０年７月３日（２００８．７．３）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−５４５８３７（Ｐ２００７−５４５８３７）
【出願日】平成１７年１２月１４日（２００５．１２．１４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＤＫ２００５／０００７９２
【国際公開番号】ＷＯ２００６／０６３５９２
【国際公開日】平成１８年６月２２日（２００６．６．２２）
【出願人】（５０３０５５９３４）
【Ｆターム（参考）】