本発明は、短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子を用いて遺伝子発現を調節するのに有用な化合物、組成物、及び方法に関する。特に本発明は、被験者又は生物における疾患、異常、形質、状態の維持及び発達に関与する発現偽遺伝子等の遺伝子の発現の調節に用いられる、短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、及び短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）等の低分子核酸分子並びに方法を特徴とする。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を介して発現偽遺伝子標的ＲＮＡの開裂を導く、化学的に合成された短二本鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子であって、
ａ）前記ｓｉＮＡ分子の各々の鎖は、約１８から約２３のヌクレオチド長であり、
ｂ）前記ｓｉＮＡ分子の一つの鎖は、ｓｉＮＡ分子がＲＮＡ干渉を介した発現偽遺伝子標的ＲＮＡの開裂を導くために充分な相補性を、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡに対して有するヌクレオチド配列を含むｓｉＮＡ分子。
【請求項２】
前記ｓｉＮＡ分子はリボ核酸を含まない請求項１記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項３】
前記ｓｉＮＡ分子は一つ以上のリボ核酸を含む請求項１記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項４】
前記二本鎖ｓｉＮＡ分子の第１の鎖は、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部と相補的であるヌクレオチド配列を含み、
前記二本鎖ｓｉＮＡ分子の第２の鎖は、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部と実質的に類似したヌクレオチド配列を含む請求項１記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項５】
ｓｉＮＡ分子の各々の鎖は、約１８から約２３のヌクレオチドを含み、
各々の鎖は、他方の鎖のヌクレオチドに相補的である少なくとも約１９のヌクレオチドを含む請求項４記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項６】
前記ｓｉＮＡ分子は、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部と相補的であるヌクレオチド配列を含むアンチセンス領域を含み、
前記ｓｉＮＡは、センス領域を更に含み、
前記センス領域は、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部に実質的に類似したヌクレオチド配列を含む請求項１記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項７】
前記アンチセンス領域および前記センス領域は、約１８から約２３のヌクレオチドを含み、
前記アンチセンス領域は、センス領域のヌクレオチドに相補的である少なくとも約１８のヌクレオチドを含む請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項８】
前記ｓｉＮＡ分子は、センス領域およびアンチセンス領域を含み、
前記アンチセンス領域は、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部と相補的であるヌクレオチド配列を含み、
前記センス領域は、前記アンチセンス領域と相補的であるヌクレオチド配列を含む請求項１記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項９】
前記ｓｉＮＡ分子は、２つの別々のオリゴヌクレオチド断片から構成され、
第１の断片は、前記ｓｉＮＡ分子のセンス領域を含み、
第２に断片は、前記ｓｉＮＡ分子のアンチセンス領域を含む請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１０】
前記センス領域は、リンカー分子を介してアンチセンス領域に接続されている請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１１】
前記リンカー分子は、ポリヌクレオチドリンカーである請求項１０記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１２】
前記リンカー分子は、非ヌクレオチドリンカーである請求項１０記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１３】
センス領域におけるピリミジンヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチルピリミジンヌクレオチドである請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１４】
センス領域におけるプリンヌクレオチドは、２’−デオキシプリンヌクレオチドである請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１５】
センス領域に存在するピリミジンヌクレオチドは、２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１６】
前記センス領域を含む断片は、前記センス領域を含む断片の５’末端、３’末端、または、５’末端及び３’末端の両方に、末端キャップ部分を含む請求項９記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１７】
前記末端キャップ部分は、逆位デオキシ脱塩基の部分である請求項１６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１８】
前記アンチセンス領域におけるピリミジンヌクレオチドは、２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項１９】
前記アンチセンス領域におけるプリンヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２０】
前記アンチセンス領域に存在するプリンヌクレオチドは、２’−デオキシ−プリンヌクレオチドを含む請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２１】
前記アンチセンス領域は、前記アンチセンス領域の３’末端にホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む請求項１８記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２２】
前記アンチセンス領域は、前記アンチセンス領域の３’末端にグリセリル修飾を含む請求項６記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２３】
前記ｓｉＮＡ分子の２つの断片の各々は、約２１ヌクレオチドを含む請求項９記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２４】
ｓｉＮＡ分子の各断片の約１９ヌクレオチドは、ｓｉＮＡ分子の他方の断片の相補ヌクレオチドに対して塩基対形成し、
ｓｉＮＡ分子の各断片の３’末端ヌクレオチドは、ｓｉＮＡ分子の他方の断片のヌクレオチドに対して塩基対形成しない請求項２３記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２５】
ｓｉＮＡ分子の各断片の３’末端ヌクレオチドは、２’−デオキシピリミジンである請求項２４記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２６】
前記２’−デオキシピリミジンは、２’−デオキシチミジンである請求項２５記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２７】
ｓｉＮＡ分子の各断片の約２１ヌクレオチドの全ては、ｓｉＮＡ分子の他方の断片の相補ヌクレオチドに対して塩基対形成する請求項２３記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２８】
アンチセンス領域の約１９ヌクレオチドは、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部に対して塩基対形成する請求項２３記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項２９】
アンチセンス領域の約２１ヌクレオチドは、前記発現偽遺伝子標的ＲＮＡのヌクレオチド配列またはその一部に対して塩基対形成する請求項２３記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項３０】
前記アンチセンス領域を含む断片の５’末端は、任意にリン酸基を含む請求項９記載のｓｉＮＡ分子。
【請求項３１】
請求項１記載のｓｉＮＡ分子を、薬理学的に許容できる担体または希釈液中に含む組成物。
【請求項３２】
前記発現偽遺伝子標的は、疾患に関連する発現偽遺伝子である請求項１記載のｓｉＮＡ分子。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１４Ｃ】

【図１４Ｄ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【公表番号】特表２００８−５０６３５１（Ｐ２００８−５０６３５１Ａ）
【公表日】平成２０年３月６日（２００８．３．６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５３６６１３（Ｐ２００６−５３６６１３）
【出願日】平成１６年８月２０日（２００４．８．２０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２７４０３
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０４４９８１
【国際公開日】平成１７年５月１９日（２００５．５．１９）
【出願人】（５００２０３６８４）サーナ・セラピューティクス・インコーポレイテッド (28)
【氏名又は名称原語表記】Ｓｉｒｎａ　Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．
【Ｆターム（参考）】