腫瘍の診断と治療のための組成物と方法
【課題】哺乳動物における腫瘍の存在を検出することができ、腫瘍性細胞成長を効果的に阻害することがそれぞれできる更なる診断及び治療薬を提供する。
【解決手段】正常な非癌細胞の一又は複数のタイプと比較して、癌細胞の一又は複数のタイプでより多く発現される様々な細胞性ポリペプチド(及びそれらのコード核酸又はその断片)。該ポリペプチドは、腫瘍関連キナーゼポリペプチド(「TASK」ポリペプチド)と呼ばれ、哺乳動物における癌の治療と診断の効果的な標的となることが期待される。また、腫瘍関連抗原性標的ポリペプチド又はその断片(「TASK」ポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を有する単離された核酸分子。
【解決手段】正常な非癌細胞の一又は複数のタイプと比較して、癌細胞の一又は複数のタイプでより多く発現される様々な細胞性ポリペプチド(及びそれらのコード核酸又はその断片)。該ポリペプチドは、腫瘍関連キナーゼポリペプチド(「TASK」ポリペプチド)と呼ばれ、哺乳動物における癌の治療と診断の効果的な標的となることが期待される。また、腫瘍関連抗原性標的ポリペプチド又はその断片(「TASK」ポリペプチド)をコードするヌクレオチド配列を有する単離された核酸分子。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
を含んでなる単離された核酸。
【請求項3】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
にハイブリダイズする単離された核酸。
【請求項4】
ストリンジェントな条件でハイブリダイゼーションが生じる、請求項3に記載の核酸。
【請求項5】
請求項1に記載の核酸を含む発現ベクター。
【請求項6】
ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に連結する、請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項6に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
CHO細胞、大腸菌細胞又は酵母細胞である、請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
ポリペプチドの産生方法において、請求項7に記載の宿主細胞を、前記ポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項10】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項11】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を有する単離されたポリペプチド。
【請求項12】
異種ポリペプチドに融合した請求項10に記載のポリペプチドを含んでなるキメラポリペプチド。
【請求項13】
前記異種ポリペプチドが免疫グロブリンのFc領域又はエピトープタグ配列である、請求項12に記載のキメラポリペプチド。
【請求項14】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに特異的に結合する単離された抗体。
【請求項15】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに特異的に結合する、請求項14に記載の抗体。
【請求項16】
モノクローナル抗体である、請求項14に記載の抗体。
【請求項17】
抗体断片である、請求項14に記載の抗体。
【請求項18】
キメラ又はヒト化抗体である、請求項14に記載の抗体。
【請求項19】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項14に記載の抗体。
【請求項20】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項14に記載の抗体。
【請求項21】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項20に記載の抗体。
【請求項22】
細胞毒性剤が毒素である、請求項20に記載の抗体。
【請求項23】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項22に記載の抗体。
【請求項24】
毒素がメイタンシノイドである、請求項22に記載の抗体。
【請求項25】
細菌中で産生される、請求項14に記載の抗体。
【請求項26】
CHO細胞中で産生される、請求項14に記載の抗体。
【請求項27】
結合する細胞の死を誘導する、請求項14に記載の抗体。
【請求項28】
検出可能に標識される、請求項14に記載の抗体。
【請求項29】
請求項14に記載の抗体をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸。
【請求項30】
ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に連結する、請求項29に記載の核酸を含む発現ベクター。
【請求項31】
請求項30に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項32】
CHO細胞、大腸菌細胞又は酵母細胞である、請求項31に記載の宿主細胞。
【請求項33】
抗体の産生方法において、請求項31に記載の宿主細胞を、前記抗体の発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記抗体を回収することを含んでなる方法。
【請求項34】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合する単離されたオリゴペプチド。
【請求項35】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに結合する請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項36】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項37】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項38】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項37に記載のオリゴペプチド。
【請求項39】
細胞毒性剤が毒素である、請求項37に記載のオリゴペプチド。
【請求項40】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項39に記載のオリゴペプチド。
【請求項41】
毒素がメイタンシノイドである、請求項39に記載のオリゴペプチド。
【請求項42】
結合する細胞の死を誘導する、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項43】
検出可能に標識される、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項44】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合するTASK結合有機分子。
【請求項45】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに結合する、請求項44に記載の有機分子。
【請求項46】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項44に記載の有機分子。
【請求項47】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項44に記載の有機分子。
【請求項48】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項47に記載の有機分子。
【請求項49】
細胞毒性剤が毒素である、請求項47に記載の有機分子。
【請求項50】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項49に記載の有機分子。
【請求項51】
毒素がメイタンシノイドである、請求項49に記載の有機分子。
【請求項52】
結合する細胞の死を誘導する、請求項44に記載の有機分子。
【請求項53】
検出可能に標識される、請求項44に記載の有機分子。
【請求項54】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
に対して少なくとも80%の配列同一性を有する核酸に結合するTASK結合干渉RNA(siRNA)。
【請求項55】
請求項54に記載のsiRNAを含んでなる発現ベクター。
【請求項56】
前記siRNAがベクターが形質移入された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に結合する、請求項55に記載の発現ベクター。
【請求項57】
請求項56に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項58】
担体との組み合わせで、(a)請求項10に記載のポリペプチド、(b)請求項12に記載のキメラポリペプチド、(c)請求項14に記載の抗体、(d)請求項34に記載のオリゴペプチド、又は(e)請求項54に記載のsiRNA、又は(e)請求項44に記載のTASK結合有機分子を含有する物質の組成物。
【請求項59】
前記担体が製薬的に許容可能な担体である、請求項58に記載の物質の組成物。
【請求項60】
(a)容器と、(b)前記容器内に含まれる請求項58に記載の物質の組成物を含む、製造品。
【請求項61】
癌の治癒的処置又は診断的検出のための前記物質の組成物の用途に言及する、前記容器に貼付されたラベル、又は前記容器内に収容されたパッケージ挿入物を更に含んでなる、請求項60に記載の製造品。
【請求項62】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドを発現する癌細胞の成長を阻害する方法であって、前記癌細胞を、前記癌細胞中の前記ポリペプチドに結合する抗体、オリゴヌクレオチド、siRNA、オリゴペプチド、又は有機分子に接触させて、前記癌細胞の成長を阻害する方法。
【請求項63】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項62に記載の方法。
【請求項64】
前記抗体が抗体断片である、請求項62に記載の方法。
【請求項65】
前記抗体がキメラ又はヒト化抗体である、請求項62に記載の方法。
【請求項66】
前記抗体、オリゴヌクレオチド、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項62に記載の方法。
【請求項67】
前記抗体、オリゴヌクレオチド、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項62に記載の方法。
【請求項68】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項67に記載の方法。
【請求項69】
細胞毒性剤が毒素である、請求項67に記載の方法。
【請求項70】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項69に記載の方法。
【請求項71】
毒素がメイタンシノイドである、請求項69に記載の方法。
【請求項72】
細菌中で産生される、請求項62に記載の方法。
【請求項73】
CHO細胞中で産生される、請求項62に記載の方法。
【請求項74】
前記癌細胞が放射線治療又は化学療法薬に更にさらされる、請求項62に記載の方法。
【請求項75】
前記癌細胞が、乳癌細胞、結腸直腸癌細胞、腎臓癌細胞、肺癌細胞、卵巣癌細胞、中枢神経系癌細胞、肝臓癌細胞、膀胱癌細胞、膵臓癌細胞、子宮頚癌細胞、メラノーマ細胞及び白血病細胞からなる群から選択される、請求項62に記載の方法。
【請求項76】
前記癌細胞が、同一組織由来の正常細胞と比較して上記ポリペプチドを過剰発現する、請求項62に記載の方法。
【請求項77】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドを発現する細胞を含む腫瘍を有する哺乳動物を治癒的に処置する方法であって、前記ポリペプチドに結合する治療的有効量の抗体、オリゴペプチド(siRNA)又は有機分子を前記哺乳動物に投与して、前記哺乳動物を効果的に治療する方法。
【請求項78】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項77に記載の方法。
【請求項79】
前記抗体が抗体断片である、請求項77に記載の方法。
【請求項80】
前記抗体がキメラ又はヒト化抗体である、請求項77に記載の方法。
【請求項81】
前記抗体、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項77に記載の方法。
【請求項82】
前記抗体、オリゴペプチド、干渉RNA(siRNA)又は有機分子を細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項77に記載の方法。
【請求項83】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項82に記載の方法。
【請求項84】
細胞毒性剤が毒素である、請求項82に記載の方法。
【請求項85】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項84に記載の方法。
【請求項86】
毒素がメイタンシノイドである、請求項84に記載の方法。
【請求項87】
前記抗体が細菌中で産生される、請求項77に記載の方法。
【請求項88】
前記抗体がCHO細胞中で産生される、請求項77に記載の方法。
【請求項89】
前記腫瘍が放射線治療又は化学療法薬に更にさらされる、請求項77に記載の方法。
【請求項90】
前記腫瘍が、乳房腫瘍、結腸直腸腫瘍、肺腫瘍、卵巣腫瘍、中枢神経系腫瘍、肝臓腫瘍、膀胱腫瘍、膵臓腫瘍又は子宮頚腫瘍である、請求項77に記載の方法。
【請求項91】
ポリペプチドを含んでいることが疑われる試料中のポリペプチドの存在を決定する方法であって、前記ポリペプチドが、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有し、前記ポリペプチドに結合する抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子に前記試料をさらし、前記試料中の前記ポリペプチドに対する前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子の結合を決定することを含む方法。
【請求項92】
前記試料が前記ポリペプチドを発現することが疑われる細胞を含む、請求項91に記載の方法。
【請求項93】
前記細胞が癌細胞である、請求項92に記載の方法。
【請求項94】
前記抗体、オリゴペプチド又は有機分子を検出可能に標識する、請求項92に記載の方法。
【請求項95】
哺乳動物における腫瘍の存在を診断する方法において、前記哺乳動物から得られた組織細胞の試験試料中と同一の組織由来の既知の正常細胞のコントロール試料中において、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出し、コントロール試料と比較して、試験試料中の前記ポリペプチドのより高い発現レベルが、試験試料が得られた哺乳動物中における腫瘍の存在を示している方法。
【請求項96】
前記ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出する工程が、インサイツハイブリダイゼーション又はRT−PCR分析においてオリゴヌクレオチドを用いることを含む、請求項95に記載の方法。
【請求項97】
前記ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出する工程が、免疫組織化学分析において抗体を用いることを含む、請求項95に記載の方法。
【請求項98】
哺乳動物における腫瘍の存在を診断する方法において、前記哺乳動物から得られた組織細胞の試験試料を、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;又は
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合する抗体、オリゴペプチド又は有機分子に接触させ、試験試料中の前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子と前記ポリペプチドの間の複合体の生成を検出することを含み、複合体の生成が前記哺乳動物中における腫瘍の存在を示している方法。
【請求項99】
前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子を検出可能に標識する、請求項98に記載の方法。
【請求項100】
組織細胞の前記試験試料を、癌性腫瘍を有することが疑われる個体から得る、請求項98に記載の方法。
【請求項101】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;又は
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドの発現又は活性の増加に関連する細胞増殖性疾患を治療又は予防する方法であって、有効量のTASKポリペプチドアンタゴニストを、治療を必要とする患者に投与することを含み、好ましくは細胞増殖性疾患が癌である方法。
【請求項102】
前記アンタゴニストが抗TASKポリペプチド抗体、TASK結合オリゴペプチド、TASKsiRNA、TASK結合有機分子又はアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項101に記載の方法。
【請求項1】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
を含んでなる単離された核酸。
【請求項3】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;又は
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
にハイブリダイズする単離された核酸。
【請求項4】
ストリンジェントな条件でハイブリダイゼーションが生じる、請求項3に記載の核酸。
【請求項5】
請求項1に記載の核酸を含む発現ベクター。
【請求項6】
ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に連結する、請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項6に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
CHO細胞、大腸菌細胞又は酵母細胞である、請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
ポリペプチドの産生方法において、請求項7に記載の宿主細胞を、前記ポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項10】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項11】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を有する単離されたポリペプチド。
【請求項12】
異種ポリペプチドに融合した請求項10に記載のポリペプチドを含んでなるキメラポリペプチド。
【請求項13】
前記異種ポリペプチドが免疫グロブリンのFc領域又はエピトープタグ配列である、請求項12に記載のキメラポリペプチド。
【請求項14】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに特異的に結合する単離された抗体。
【請求項15】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに特異的に結合する、請求項14に記載の抗体。
【請求項16】
モノクローナル抗体である、請求項14に記載の抗体。
【請求項17】
抗体断片である、請求項14に記載の抗体。
【請求項18】
キメラ又はヒト化抗体である、請求項14に記載の抗体。
【請求項19】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項14に記載の抗体。
【請求項20】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項14に記載の抗体。
【請求項21】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項20に記載の抗体。
【請求項22】
細胞毒性剤が毒素である、請求項20に記載の抗体。
【請求項23】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項22に記載の抗体。
【請求項24】
毒素がメイタンシノイドである、請求項22に記載の抗体。
【請求項25】
細菌中で産生される、請求項14に記載の抗体。
【請求項26】
CHO細胞中で産生される、請求項14に記載の抗体。
【請求項27】
結合する細胞の死を誘導する、請求項14に記載の抗体。
【請求項28】
検出可能に標識される、請求項14に記載の抗体。
【請求項29】
請求項14に記載の抗体をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸。
【請求項30】
ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に連結する、請求項29に記載の核酸を含む発現ベクター。
【請求項31】
請求項30に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項32】
CHO細胞、大腸菌細胞又は酵母細胞である、請求項31に記載の宿主細胞。
【請求項33】
抗体の産生方法において、請求項31に記載の宿主細胞を、前記抗体の発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記抗体を回収することを含んでなる方法。
【請求項34】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合する単離されたオリゴペプチド。
【請求項35】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに結合する請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項36】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項37】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項38】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項37に記載のオリゴペプチド。
【請求項39】
細胞毒性剤が毒素である、請求項37に記載のオリゴペプチド。
【請求項40】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項39に記載のオリゴペプチド。
【請求項41】
毒素がメイタンシノイドである、請求項39に記載のオリゴペプチド。
【請求項42】
結合する細胞の死を誘導する、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項43】
検出可能に標識される、請求項34に記載のオリゴペプチド。
【請求項44】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合するTASK結合有機分子。
【請求項45】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列によってコードされるアミノ酸配列;
を含んでなるポリペプチドに結合する、請求項44に記載の有機分子。
【請求項46】
成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項44に記載の有機分子。
【請求項47】
細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項44に記載の有機分子。
【請求項48】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項47に記載の有機分子。
【請求項49】
細胞毒性剤が毒素である、請求項47に記載の有機分子。
【請求項50】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項49に記載の有機分子。
【請求項51】
毒素がメイタンシノイドである、請求項49に記載の有機分子。
【請求項52】
結合する細胞の死を誘導する、請求項44に記載の有機分子。
【請求項53】
検出可能に標識される、請求項44に記載の有機分子。
【請求項54】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列;
(c)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列の完全長コード化配列;
(d)(a)、(b)、(c)の相補鎖;
に対して少なくとも80%の配列同一性を有する核酸に結合するTASK結合干渉RNA(siRNA)。
【請求項55】
請求項54に記載のsiRNAを含んでなる発現ベクター。
【請求項56】
前記siRNAがベクターが形質移入された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に結合する、請求項55に記載の発現ベクター。
【請求項57】
請求項56に記載の発現ベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項58】
担体との組み合わせで、(a)請求項10に記載のポリペプチド、(b)請求項12に記載のキメラポリペプチド、(c)請求項14に記載の抗体、(d)請求項34に記載のオリゴペプチド、又は(e)請求項54に記載のsiRNA、又は(e)請求項44に記載のTASK結合有機分子を含有する物質の組成物。
【請求項59】
前記担体が製薬的に許容可能な担体である、請求項58に記載の物質の組成物。
【請求項60】
(a)容器と、(b)前記容器内に含まれる請求項58に記載の物質の組成物を含む、製造品。
【請求項61】
癌の治癒的処置又は診断的検出のための前記物質の組成物の用途に言及する、前記容器に貼付されたラベル、又は前記容器内に収容されたパッケージ挿入物を更に含んでなる、請求項60に記載の製造品。
【請求項62】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドを発現する癌細胞の成長を阻害する方法であって、前記癌細胞を、前記癌細胞中の前記ポリペプチドに結合する抗体、オリゴヌクレオチド、siRNA、オリゴペプチド、又は有機分子に接触させて、前記癌細胞の成長を阻害する方法。
【請求項63】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項62に記載の方法。
【請求項64】
前記抗体が抗体断片である、請求項62に記載の方法。
【請求項65】
前記抗体がキメラ又はヒト化抗体である、請求項62に記載の方法。
【請求項66】
前記抗体、オリゴヌクレオチド、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項62に記載の方法。
【請求項67】
前記抗体、オリゴヌクレオチド、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項62に記載の方法。
【請求項68】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項67に記載の方法。
【請求項69】
細胞毒性剤が毒素である、請求項67に記載の方法。
【請求項70】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項69に記載の方法。
【請求項71】
毒素がメイタンシノイドである、請求項69に記載の方法。
【請求項72】
細菌中で産生される、請求項62に記載の方法。
【請求項73】
CHO細胞中で産生される、請求項62に記載の方法。
【請求項74】
前記癌細胞が放射線治療又は化学療法薬に更にさらされる、請求項62に記載の方法。
【請求項75】
前記癌細胞が、乳癌細胞、結腸直腸癌細胞、腎臓癌細胞、肺癌細胞、卵巣癌細胞、中枢神経系癌細胞、肝臓癌細胞、膀胱癌細胞、膵臓癌細胞、子宮頚癌細胞、メラノーマ細胞及び白血病細胞からなる群から選択される、請求項62に記載の方法。
【請求項76】
前記癌細胞が、同一組織由来の正常細胞と比較して上記ポリペプチドを過剰発現する、請求項62に記載の方法。
【請求項77】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドを発現する細胞を含む腫瘍を有する哺乳動物を治癒的に処置する方法であって、前記ポリペプチドに結合する治療的有効量の抗体、オリゴペプチド(siRNA)又は有機分子を前記哺乳動物に投与して、前記哺乳動物を効果的に治療する方法。
【請求項78】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項77に記載の方法。
【請求項79】
前記抗体が抗体断片である、請求項77に記載の方法。
【請求項80】
前記抗体がキメラ又はヒト化抗体である、請求項77に記載の方法。
【請求項81】
前記抗体、オリゴペプチド、siRNA又は有機分子を成長阻害剤にコンジュゲートさせた、請求項77に記載の方法。
【請求項82】
前記抗体、オリゴペプチド、干渉RNA(siRNA)又は有機分子を細胞毒性剤にコンジュゲートさせた、請求項77に記載の方法。
【請求項83】
毒性剤が毒素、抗生物質、放射性同位元素及び核酸分解酵素からなる群から選択される、請求項82に記載の方法。
【請求項84】
細胞毒性剤が毒素である、請求項82に記載の方法。
【請求項85】
毒素が、メイタンシノイド及びカリケアマイシンからなる群から選択される、請求項84に記載の方法。
【請求項86】
毒素がメイタンシノイドである、請求項84に記載の方法。
【請求項87】
前記抗体が細菌中で産生される、請求項77に記載の方法。
【請求項88】
前記抗体がCHO細胞中で産生される、請求項77に記載の方法。
【請求項89】
前記腫瘍が放射線治療又は化学療法薬に更にさらされる、請求項77に記載の方法。
【請求項90】
前記腫瘍が、乳房腫瘍、結腸直腸腫瘍、肺腫瘍、卵巣腫瘍、中枢神経系腫瘍、肝臓腫瘍、膀胱腫瘍、膵臓腫瘍又は子宮頚腫瘍である、請求項77に記載の方法。
【請求項91】
ポリペプチドを含んでいることが疑われる試料中のポリペプチドの存在を決定する方法であって、前記ポリペプチドが、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有し、前記ポリペプチドに結合する抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子に前記試料をさらし、前記試料中の前記ポリペプチドに対する前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子の結合を決定することを含む方法。
【請求項92】
前記試料が前記ポリペプチドを発現することが疑われる細胞を含む、請求項91に記載の方法。
【請求項93】
前記細胞が癌細胞である、請求項92に記載の方法。
【請求項94】
前記抗体、オリゴペプチド又は有機分子を検出可能に標識する、請求項92に記載の方法。
【請求項95】
哺乳動物における腫瘍の存在を診断する方法において、前記哺乳動物から得られた組織細胞の試験試料中と同一の組織由来の既知の正常細胞のコントロール試料中において、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出し、コントロール試料と比較して、試験試料中の前記ポリペプチドのより高い発現レベルが、試験試料が得られた哺乳動物中における腫瘍の存在を示している方法。
【請求項96】
前記ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出する工程が、インサイツハイブリダイゼーション又はRT−PCR分析においてオリゴヌクレオチドを用いることを含む、請求項95に記載の方法。
【請求項97】
前記ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出する工程が、免疫組織化学分析において抗体を用いることを含む、請求項95に記載の方法。
【請求項98】
哺乳動物における腫瘍の存在を診断する方法において、前記哺乳動物から得られた組織細胞の試験試料を、
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;又は
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドに結合する抗体、オリゴペプチド又は有機分子に接触させ、試験試料中の前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子と前記ポリペプチドの間の複合体の生成を検出することを含み、複合体の生成が前記哺乳動物中における腫瘍の存在を示している方法。
【請求項99】
前記抗体、オリゴペプチド、siRNA、オリゴヌクレオチド又は有機分子を検出可能に標識する、請求項98に記載の方法。
【請求項100】
組織細胞の前記試験試料を、癌性腫瘍を有することが疑われる個体から得る、請求項98に記載の方法。
【請求項101】
(a)図2(配列番号2)、図4(配列番号4)又は図6(配列番号6)に示されたアミノ酸配列;又は
(b)図1(配列番号1)、図3(配列番号3)又は図5(配列番号5)に示されたヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列;
に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドの発現又は活性の増加に関連する細胞増殖性疾患を治療又は予防する方法であって、有効量のTASKポリペプチドアンタゴニストを、治療を必要とする患者に投与することを含み、好ましくは細胞増殖性疾患が癌である方法。
【請求項102】
前記アンタゴニストが抗TASKポリペプチド抗体、TASK結合オリゴペプチド、TASKsiRNA、TASK結合有機分子又はアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項101に記載の方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9A】
【図9B】
【図10A】
【図10B】
【図11A】
【図11B】
【図11C】
【図11D】
【図11E】
【図11F】
【図11G】
【図11H】
【図11I】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9A】
【図9B】
【図10A】
【図10B】
【図11A】
【図11B】
【図11C】
【図11D】
【図11E】
【図11F】
【図11G】
【図11H】
【図11I】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【公開番号】特開2010−131015(P2010−131015A)
【公開日】平成22年6月17日(2010.6.17)
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願2009−293524(P2009−293524)
【出願日】平成21年12月24日(2009.12.24)
【分割の表示】特願2004−536115(P2004−536115)の分割
【原出願日】平成15年9月5日(2003.9.5)
【出願人】(509012625)ジェネンテック, インコーポレイテッド (357)
【Fターム(参考)】
【公開日】平成22年6月17日(2010.6.17)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2009−293524(P2009−293524)
【出願日】平成21年12月24日(2009.12.24)
【分割の表示】特願2004−536115(P2004−536115)の分割
【原出願日】平成15年9月5日(2003.9.5)
【出願人】(509012625)ジェネンテック, インコーポレイテッド (357)
【Fターム(参考)】
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