インスリン様成長因子−１受容体キナーゼ阻害剤に対する抗癌反応を予測する生物学的マーカー
本発明は、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での癌患者の治療の有効性を予測するための診断および予後診断法を提供する。上皮および／又は間葉バイオマーカーの発現レベルを測定することによって腫瘍細胞が上皮間葉移行（ＥＭＴ）を起こしているか否かを評価することを含む（ＥＭＴを起こしている腫瘍細胞は実質的にＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対して感受性が低い。）、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対して腫瘍細胞増殖の感受性を予測するための方法が提供される。上記方法を組み込むＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤により癌患者を治療するための改良法も提供される。さらに、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する腫瘍の反応性を予測する新しいバイオマーカーの同定のための方法が提供される。さらに、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する、ＥＭＴを起こしている腫瘍細胞の感受性を回復させる薬剤の同定のための方法も提供される。ｐＥｒｋ、ＨＥＲ３およびｐＨＥＲもまた、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する腫瘍細胞の感受性を予測するための有効なバイオマーカーであることが示される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；および
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測すること（腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、
ならびに間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される。）
を含む方法。
【請求項２】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーのレベルを評価すること（２以上の間葉バイオマーカーは、Ｓｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される。）；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、腫瘍細胞による間葉バイオマーカーの何れか１つの高レベル発現がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関する、方法。
【請求項３】
評価される腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌおよびＺｅｂ１である、請求項２の方法。
【請求項４】
評価される腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーがＳｉｐ１およびＺｅｂ１である、請求項２の方法。
【請求項５】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベル評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比率が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される、方法。
【請求項６】
上皮バイオマーカーがＥ−カドヘリンを含む、請求項５の方法。
【請求項７】
上皮バイオマーカーがＢｒｋを含む、請求項５の方法。
【請求項８】
上皮バイオマーカーがγ−カテニンを含む、請求項５の方法。
【請求項９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階：およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含み、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階が、Ｓｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される間葉バイオマーカーのレベルを評価することを含むＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するための方法を使用することにより行われる、方法。
【請求項１０】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するための方法が、請求項１、請求項２および請求項５の方法から選択される、請求項９の方法。
【請求項１１】
１以上のさらなる抗癌剤がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤とともに同時に又は逐次的に併用投与される、請求項９の方法。
【請求項１２】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１の方法。
【請求項１３】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項２の方法。
【請求項１４】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項５の方法。
【請求項１５】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項９の方法。
【請求項１６】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーが、腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子のプロモーターのメチル化である、方法。
【請求項１７】
腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子がＥ−カドヘリンである、請求項１６の方法。
【請求項１８】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１６の方法。
【請求項１９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階：およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含み、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階が、腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することにより行われ、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーが、腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子のプロモーターのメチル化である、方法。
【請求項２０】
腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子がＥ−カドヘリンである、請求項１９の方法。
【請求項２１】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１９の方法。
【請求項２２】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤とともに同時に又は逐次的に１以上のさらなる抗癌剤が併用投与される、請求項１９の方法。
【請求項２３】
癌患者が、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による治療に効果的に反応する腫瘍を患っているか否かを予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；および
腫瘍がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応するか否かを予測することを含み、腫瘍細胞上皮バイオマーカーの高発現レベルが、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応する腫瘍と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎおよびホスホ−ＳＨＣ１から選択される、方法。
【請求項２４】
癌患者がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に効果的に反応する腫瘍を患っているか否かを予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；および
腫瘍がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応するか否かを予測することを含み、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高発現レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対する反応性がより低い腫瘍と相関し、間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシルＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−ＲｏｎおよびＳＨＣ１から選択される、方法。
【請求項２５】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン１、ラミニンα−５およびＳＴ１４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−ＲｏｎおよびＳＨＣ１から選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎおよびホスホ−ＳＨＣ１から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３およびエピモルフィンから選択される、
方法。
【請求項２６】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン１、ラミニンα−５、ＳＴ１４、ＳＥＲＣＡ２、ＣＤ４４抗原、ＥＲＯ１−Ｌα、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＧＰＣＲ ＲＡＩＧ−３、ジヒドロリポイルリジンスクシニルトランスフェラーゼ、ペルオキシレドキシン２、レティキュロカルビン−１、ホスホ−４０Ｓリボソームタンパク質Ｓ１５（ＲＩＧタンパク質）および腫瘍タンパク質Ｄ５４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ホスホ−α−インターネキシン、レチナールデヒドロゲナーゼ１、脂肪アルデヒドデヒドロゲナーゼ、アスパラギンシンテターゼ、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、ホスホ−ＡＲＦ、ＧＴＰａｓｅ−活性化タンパク質、マゴナシタンパク質ホモローグ２、ホスホ−ＥＲＫ−２、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ＮＡＤ（Ｐ）Ｈデヒドロゲナーゼ、ホスホ−ＰＤＧＦ−Ｒ−α、ホスホ−プロゲステロン−誘導性阻止因子１、ピリン、プロフィリン−１、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、ホスホ−ＴＡＦ（ＩＩ）６８、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼ、チオレドキシンレダクターゼ１、ＵＤＰ−Ｎ−アセチルへキソサミンピロホスホリラーゼ、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼおよびジキシンから選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、ＳＥＲＣＡ２、ＣＤ４４抗原、ＥＲＯ１−Ｌα、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＧＰＣＲ ＲＡＩＧ−３、ジヒドロリポイルリジンスクシニルトランスフェラーゼ、ペルオキシレドキシン２、レティキュロカルビン−１、ホスホ−４０Ｓリボソームタンパク質Ｓ１５（ＲＩＧタンパク質）および腫瘍タンパク質Ｄ５４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３、エピモルフィン、ホスホ−α−インターネキシン、レチナールデヒドロゲナーゼ１、脂肪アルデヒドデヒドロゲナーゼ、アスパラギンシンテターゼ、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、ホスホ−ＡＲＦ、ＧＴＰａｓｅ−活性化タンパク質、マゴナシタンパク質ホモローグ２、ホスホ−ＥＲＫ−２、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ＮＡＤ（Ｐ）Ｈデヒドロゲナーゼ、ホスホ−ＰＤＧＦ−Ｒ−α、ホスホ−プロゲステロン−誘導性阻止因子１、ピリン、プロフィリン−１、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、ホスホ−ＴＡＦ（ＩＩ）６８、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼ、チオレドキシンレダクターゼ１、ＵＤＰ−Ｎ−アセチルへキソサミンピロホスホリラーゼ、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼおよびジキシンから選択される、
方法。
【請求項２７】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン（ｓｔｒａｔａｆｉｎ）１、ラミニンα−５、ＳＴ１４、１４−３−３β／α、ホスホ−Ｒｈｏ ＧＥＦ−７（ｐ８５ＣＯＯＬ−１）、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、フィラミンＡ、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ホスホ−パキシリン、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、Ｃ−ｒｅｔ、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼおよびユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼから選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、酸性ロイシンリッチ核リンタンパク質３２Ｂ、ＣＤ４４抗原、カルシウム結合Ａｒａｌａｒ２、２，４−ジエノイル−ＣｏＡレダクターゼ、電子伝達フラボタンパク質、脂肪酸−結合タンパク質（Ｅ−ＦＡＢＰ）、ＲＮＡ−結合タンパク質ＦＵＳ、Ｋ−グルタミナーゼ、ミトコンドリアクレアチンキナーゼ、ホスホ−ロイパキシン、ミリストイル化アラニンリッチＣ−キナーゼ基質、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−２Ａ、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−７、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｐ−１ｂ、ホスホ−Ｃ−ｒｅｔおよびＳＴＡＴ３から選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、１４−３−３β／α、ホスホ−Ｒｈｏ ＧＥＦ−７（ｐ８５ＣＯＯＬ−１）、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、フィラミンＡ、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ホスホ−パキシリン、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、Ｃ−ｒｅｔ、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼおよびユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼから選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３、エピモルフィン、酸性ロイシンリッチ核リンタンパク質３２Ｂ、ＣＤ４４抗原、カルシウム結合Ａｒａｌａｒ２、２，４−ジエノイル−ＣｏＡレダクターゼ、電子伝達フラボタンパク質、脂肪酸−結合タンパク質（Ｅ−ＦＡＢＰ）、ＲＮＡ−結合タンパク質ＦＵＳ、Ｋ−グルタミナーゼ、ミトコンドリアクレアチンキナーゼ、ホスホ−ロイパキシン、ミリストイル化アラニンリッチＣ−キナーゼ基質、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−２Ａ、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−７、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｐ−１ｂ、ホスホ−Ｃ−ｒｅｔおよびＳＴＡＴ３から選択される、
方法。
【請求項２８】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２３に記載の方法を用いてＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項２９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２４に記載の方法を用いることによってＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３０】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２５に記載の方法を用いることによってＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３１】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行（ＥＭＴ）を起こしているか否かを示すバイオマーカーのレベルを評価することにより、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階；患者の腫瘍におけるＩＧＦ−１および／又はＩＧＦ−２のレベルを評価する段階；および患者がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に反応性を有する可能性があると診断され、ならびに腫瘍がＩＧＦ−１および／又はＩＧＦ−２を有すると判定された場合、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３２】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項９の方法。
【請求項３３】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項１９の方法。
【請求項３４】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項３１の方法。
【請求項１】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；および
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測すること（腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、
ならびに間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される。）
を含む方法。
【請求項２】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーのレベルを評価すること（２以上の間葉バイオマーカーは、Ｓｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される。）；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、腫瘍細胞による間葉バイオマーカーの何れか１つの高レベル発現がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関する、方法。
【請求項３】
評価される腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌおよびＺｅｂ１である、請求項２の方法。
【請求項４】
評価される腫瘍細胞により発現される２以上の間葉バイオマーカーがＳｉｐ１およびＺｅｂ１である、請求項２の方法。
【請求項５】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベル評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比率が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーがＳｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される、方法。
【請求項６】
上皮バイオマーカーがＥ−カドヘリンを含む、請求項５の方法。
【請求項７】
上皮バイオマーカーがＢｒｋを含む、請求項５の方法。
【請求項８】
上皮バイオマーカーがγ−カテニンを含む、請求項５の方法。
【請求項９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階：およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含み、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階が、Ｓｎａｉｌ、Ｚｅｂ１、Ｔｗｉｓｔ、Ｓｉｐ１およびＳｌｕｇから選択される間葉バイオマーカーのレベルを評価することを含むＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するための方法を使用することにより行われる、方法。
【請求項１０】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するための方法が、請求項１、請求項２および請求項５の方法から選択される、請求項９の方法。
【請求項１１】
１以上のさらなる抗癌剤がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤とともに同時に又は逐次的に併用投与される、請求項９の方法。
【請求項１２】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１の方法。
【請求項１３】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項２の方法。
【請求項１４】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項５の方法。
【請求項１５】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項９の方法。
【請求項１６】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーが、腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子のプロモーターのメチル化である、方法。
【請求項１７】
腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子がＥ−カドヘリンである、請求項１６の方法。
【請求項１８】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１６の方法。
【請求項１９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階：およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含み、腫瘍細胞が上皮間葉移行を起こしているか否かを評価することによりＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階が、腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することにより行われ、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する低感受性と相関し、ならびに間葉バイオマーカーが、腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子のプロモーターのメチル化である、方法。
【請求項２０】
腫瘍細胞でのＥＭＴの結果として転写が抑制される遺伝子がＥ−カドヘリンである、請求項１９の方法。
【請求項２１】
腫瘍細胞がＮＳＣＬ、結腸、乳房、頭頸部又は膵臓腫瘍細胞である、請求項１９の方法。
【請求項２２】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤とともに同時に又は逐次的に１以上のさらなる抗癌剤が併用投与される、請求項１９の方法。
【請求項２３】
癌患者が、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による治療に効果的に反応する腫瘍を患っているか否かを予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；および
腫瘍がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応するか否かを予測することを含み、腫瘍細胞上皮バイオマーカーの高発現レベルが、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応する腫瘍と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎおよびホスホ−ＳＨＣ１から選択される、方法。
【請求項２４】
癌患者がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に効果的に反応する腫瘍を患っているか否かを予測する方法であって、
腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；および
腫瘍がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤での治療に効果的に反応するか否かを予測することを含み、腫瘍細胞間葉バイオマーカーの高発現レベルがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対する反応性がより低い腫瘍と相関し、間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシルＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−ＲｏｎおよびＳＨＣ１から選択される、方法。
【請求項２５】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン１、ラミニンα−５およびＳＴ１４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−ＲｏｎおよびＳＨＣ１から選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎおよびホスホ−ＳＨＣ１から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３およびエピモルフィンから選択される、
方法。
【請求項２６】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン１、ラミニンα−５、ＳＴ１４、ＳＥＲＣＡ２、ＣＤ４４抗原、ＥＲＯ１−Ｌα、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＧＰＣＲ ＲＡＩＧ−３、ジヒドロリポイルリジンスクシニルトランスフェラーゼ、ペルオキシレドキシン２、レティキュロカルビン−１、ホスホ−４０Ｓリボソームタンパク質Ｓ１５（ＲＩＧタンパク質）および腫瘍タンパク質Ｄ５４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ホスホ−α−インターネキシン、レチナールデヒドロゲナーゼ１、脂肪アルデヒドデヒドロゲナーゼ、アスパラギンシンテターゼ、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、ホスホ−ＡＲＦ、ＧＴＰａｓｅ−活性化タンパク質、マゴナシタンパク質ホモローグ２、ホスホ−ＥＲＫ−２、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ＮＡＤ（Ｐ）Ｈデヒドロゲナーゼ、ホスホ−ＰＤＧＦ−Ｒ−α、ホスホ−プロゲステロン−誘導性阻止因子１、ピリン、プロフィリン−１、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、ホスホ−ＴＡＦ（ＩＩ）６８、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼ、チオレドキシンレダクターゼ１、ＵＤＰ−Ｎ−アセチルへキソサミンピロホスホリラーゼ、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼおよびジキシンから選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、ＳＥＲＣＡ２、ＣＤ４４抗原、ＥＲＯ１−Ｌα、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＧＰＣＲ ＲＡＩＧ−３、ジヒドロリポイルリジンスクシニルトランスフェラーゼ、ペルオキシレドキシン２、レティキュロカルビン−１、ホスホ−４０Ｓリボソームタンパク質Ｓ１５（ＲＩＧタンパク質）および腫瘍タンパク質Ｄ５４から選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３、エピモルフィン、ホスホ−α−インターネキシン、レチナールデヒドロゲナーゼ１、脂肪アルデヒドデヒドロゲナーゼ、アスパラギンシンテターゼ、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、ホスホ−ＡＲＦ、ＧＴＰａｓｅ−活性化タンパク質、マゴナシタンパク質ホモローグ２、ホスホ−ＥＲＫ−２、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ＮＡＤ（Ｐ）Ｈデヒドロゲナーゼ、ホスホ−ＰＤＧＦ−Ｒ−α、ホスホ−プロゲステロン−誘導性阻止因子１、ピリン、プロフィリン−１、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、ホスホ−ＴＡＦ（ＩＩ）６８、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼ、チオレドキシンレダクターゼ１、ＵＤＰ−Ｎ−アセチルへキソサミンピロホスホリラーゼ、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼおよびジキシンから選択される、
方法。
【請求項２７】
ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測する方法であって、腫瘍細胞により発現される上皮バイオマーカーのレベルを評価すること；腫瘍細胞により発現される間葉バイオマーカーのレベルを評価すること；およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測することを含み、間葉バイオマーカー発現レベルに対する上皮バイオマーカーの比が高いことがＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する高感受性と相関し、
上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ−２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、Ｅ−カドヘリン、Ｂｒｋ、γ−カテニン、α１−カテニン、α２−カテニン、α３−カテニン、ケラチン８、ケラチン１８、コネキシン３１、プラコフィリン３、ストラタフィン（ｓｔｒａｔａｆｉｎ）１、ラミニンα−５、ＳＴ１４、１４−３−３β／α、ホスホ−Ｒｈｏ ＧＥＦ−７（ｐ８５ＣＯＯＬ−１）、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、フィラミンＡ、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ホスホ−パキシリン、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、Ｃ−ｒｅｔ、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼおよびユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼから選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、酸性ロイシンリッチ核リンタンパク質３２Ｂ、ＣＤ４４抗原、カルシウム結合Ａｒａｌａｒ２、２，４−ジエノイル−ＣｏＡレダクターゼ、電子伝達フラボタンパク質、脂肪酸−結合タンパク質（Ｅ−ＦＡＢＰ）、ＲＮＡ−結合タンパク質ＦＵＳ、Ｋ−グルタミナーゼ、ミトコンドリアクレアチンキナーゼ、ホスホ−ロイパキシン、ミリストイル化アラニンリッチＣ−キナーゼ基質、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−２Ａ、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−７、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｐ−１ｂ、ホスホ−Ｃ−ｒｅｔおよびＳＴＡＴ３から選択されるか、
あるいは、上皮バイオマーカーが、ホスホ−１４−３−３ε、１４−３−３γ（ＫＣＩＰ−１）、１４−３−３σ（ストラチフィン（Ｓｔｒａｔｉｆｉｎ））、１４−３−３ζ／δ、ホスホ−セリン／スレオニンホスファターゼ２Ａ、４Ｆ２ｈｃ（ＣＤ９８抗原）、アデニンヌクレオチド輸送体２、アネキシンＡ３、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−インスリン受容体基質ｐ５３／ｐ５４、バシジン（ＣＤ１４７抗原）、ホスホ−ＣＲＫ−結合基質（ｐ１３０Ｃａｓ）、Ｂｃｌ−Ｘ、ホスホ−Ｐ−カドヘリン、ホスホ−カルモジュリン（ＣａＭ）、カルパイン−２触媒サブユニット、カテプシンＤ、コフィリン−１、カルパイン小サブユニット１、カテニンβ−１、カテニンδ−１（ｐ１２０カテニン）、シスタチンＢ、ホスホ−ＤＡＺ−結合タンパク質１、カルボニルレダクターゼ［ＮＡＤＰＨ］、ダイアファナス関連ホルミン１（ＤＲＦ１）、デスモグレイン−２、伸長因子１−δ、ホスホ−ｐ１８５ｅｒｂＢ２、エズリン（ｐ８１）、ホスホ−焦点接着キナーゼ１、ホスホ−ｐ９４−ＦＥＲ（ｃ−ＦＥＲ）、フィラミンＢ、ホスホ−ＧＲＢ２関連結合タンパク質１、Ｒｈｏ−ＧＤＩα、ホスホ−ＧＲＢ２、ＧＲＰ７８、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼＰ、３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＨＳＰ９０−α、ＨＳＰ７０．１、ｅＩＦ３ｐ１１０、ｅＩＦ−４Ｅ、白血球エラスターゼ阻害剤、インポーチン−４、インテグリンα−６、インテグリンβ−４、ホスホ−サイトケラチン１７、サイトケラチン１９、サイトケラチン７、カゼインキナーゼＩ、α、タンパク質キナーゼＣ、δ、ピルビン酸キナーゼ、アイソザイムＭ１／Ｍ２、ホスホ−エルビン、ＬＩＭおよびＳＨ３ドメインタンパク質１（ＬＡＳＰ−１）、４Ｆ２ｌｃ（ＣＤ９８軽鎖）、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＡ鎖、ガレクチン−３、ガレクチン−３結合タンパク質、ホスホ−ＬＩＮ−７ホモローグＣ、ＭＡＰ（ＡＰＣ−結合タンパク質ＥＢ１）、マスピン前駆体（プロテアーゼ阻害剤５）、ホスホ−Ｍｅｔチロシンキナーゼ（ＨＧＦ受容体）、混合血統白血病タンパク質２、モノカルボン酸トランスポーター４、ホスホ−Ｃ−Ｍｙｃ結合タンパク質（ＡＭＹ−１）、ミオシン−９、ミオシン軽鎖ポリペプチド６、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニバン様タンパク質（Ｍｅｇ−３）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、ホスホ−オクルディン、ユビキチンチオールエステラーゼ、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼＩＢβサブユニット、ホスホ−区画−欠損型（ｐａｒｔｉｔｉｏｎｉｎｇ−ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ）３（ＰＡＲ−３）、ホスホ−プログラム細胞死６−結合タンパク質、ホスホ−プログラム細胞死タンパク質６、タンパク質ジスルフィド−イソメラーゼ、ホスホ−プラコフィリン−２、ホスホ−プラコフィリン−３、タンパク質ホスファターゼ１、ペルオキシレドキシン５、プロテアソーム活性化因子複合体サブユニット１、プロサイモシンα、レチノイン酸誘導性タンパク質３、ホスホ−ＤＮＡ修復タンパク質ＲＥＶ１、リボヌクレアーゼ阻害剤、ＲｕｖＢ−様１、Ｓ−１００Ｐ、Ｓ−１００Ｌ、カルサイクリン、Ｓ１００Ｃ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ａ、ホスホ−Ｓｅｃ２３Ｂ、ライソソーム膜タンパク質ＩＩ（ＬＩＭＰ ＩＩ）、ｐ６０−Ｓｒｃ、ホスホ−アンプラキシン（ＥＭＳ１）、ＳＬＰ−２、γ−シヌクレイン、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質１、腫瘍カルシウムシグナル伝達物質２、トランスゲリン−２、トランスアルドラーゼ、チューブリンβ−２鎖、翻訳調節（ＴＣＴＰ）、組織トランスグルタミナーゼ、膜貫通タンパク質Ｔｍｐ２１、ユビキチン結合酵素Ｅ２Ｎ、ＵＤＰ−グルコシルトランスフェラーゼ１、ホスホ−ｐ６１−Ｙｅｓ、ホスホ−密着結合タンパク質ＺＯ−１、ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ホスホ−ＡＴＰシンターゼβ鎖、ホスホ−ＡＴＰシンターゼδ、低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、デスモプラキンＩＩＩ、プレクチン１、ホスホ−ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ホスホ−ｐ１８５−Ｒｏｎ、ホスホ−ＳＨＣ１、１４−３−３β／α、ホスホ−Ｒｈｏ ＧＥＦ−７（ｐ８５ＣＯＯＬ−１）、脳酸可溶性タンパク質１、ホスホ−カベオリン−１、フィラミンＡ、ホスホ−ｐ３８α、ヌクレオシドジホスフェートキナーゼＢ、ホスホ−パキシリン、ホスホ−チロシン−タンパク質ホスファターゼＳＨＰ−２、Ｃ−ｒｅｔ、ＳＴＡＴ３、アスパラギニル−ｔＲＮＡシンテターゼおよびユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼから選択され、
ならびに間葉バイオマーカーが、ＭＨＣクラスＩ抗原Ａ＊１、アシル−ＣｏＡデサチュラーゼ、ＬＡＮＰ−様タンパク質（ＬＡＮＰ−Ｌ）、アネキシンＡ６、ＡＴＰシンターゼγ鎖、ＢＡＧ−ファミリー分子シャペロン調節因子−２、ホスホ−水疱性類天疱瘡抗原、ホスホ−タンパク質Ｃ１ｏｒｆ７７、ＣＤＫ１（ｃｄｃ２）、ホスホ−クラスリン重鎖１、コンデンシン複合体サブユニット１、３，２−トランス−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼ、ＤＥＡＨ−ｂｏｘタンパク質９、基本ホモローグのホスホ−エンハンサー（ｐｈｏｓｐｈｏ−Ｅｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｒｕｄｉｍｅｎｔａｒｙ ｈｏｍｏｌｏｇ）、ホスホ−フィブリラリン、ＧＡＰＤＨ筋肉、ＧＡＰＤＨ肝臓、シナプス糖タンパク質ＳＣ２、ホスホ−ヒストンＨ１．０、ホスホ−ヒストンＨ１．２、ホスホ−ヒストンＨ１．３、ホスホ−ヒストンＨ１．４、ホスホ−ヒストンＨ１．５、ホスホ−ヒストンＨ１ｘ、ホスホ−ヒストンＨ２ＡＦＸ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｏ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｑ、ホスホ−ヒストンＨ２Ａ．ｚ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｊ、ホスホ−ヒストンＨ２Ｂ．ｒ、ホスホ−ヒストンＨ４、ホスホ−ＨＭＧ−１７様３、ホスホ−ＨＭＧ−１４、ホスホ−ＨＭＧ−１７、ホスホ−ＨＭＧＩ−Ｃ、ホスホ−ＨＭＧ−Ｉ／ＨＭＧ−Ｙ、ホスホ−甲状腺受容体結合タンパク質７（ＴＲＩＰ７）、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｈ３、ｈｎＲＮＰ Ｃ１／Ｃ２、ｈｎＲＮＰ Ｆ、ホスホ−ｈｎＲＮＰ Ｇ、ｅＩＦ−５Ａ、ＮＦＡＴ４５ｋＤａ、インポーチンβ−３、ｃＡＭＰ−依存性ＰＫ１ａ、ラミンＢ１、ラミンＡ／Ｃ、ホスホ−ラミニンα−３鎖、Ｌ−乳酸デヒドロゲナーゼＢ鎖、ガレクチン−１、ホスホ−Ｆｅｚ１、ヒアルロナン結合タンパク質１、ホスホ−微小管−アクチン架橋因子１、メラノーマ関連抗原４、マトリン−３、リン酸輸送体タンパク質、ミオシン−１０、ホスホ−Ｎ−アシルノイラミン酸シチジリルトランスフェラーゼ、ホスホ−ＮＨＰ２−様タンパク質１、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質サブユニット１、核小体リンタンパク質ｐ１３０、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｎｏｖａ−２、ヌクレオフォスミン（ＮＰＭ）、ＮＡＤＨ−ユビキノンオキシドレダクターゼ３９ｋＤａサブユニット、ホスホ−ポリアデニル酸−結合タンパク質２、プロヒビチン、プロヒビチン−２、スプライシング因子Ｐｒｐ８、ポリピリミジントラクト−結合タンパク質１、パラサイモシン、Ｒａｂ−２Ａ、ホスホ−ＲＮＡ−結合タンパク質Ｒａｌｙ、推定ＲＮＡ−結合タンパク質３、ホスホ−６０Ｓリボソームタンパク質Ｌ２３、ｈｎＲＮＰ Ａ０、ｈｎＲＮＰ Ａ２／Ｂ１、ｈｎＲＮＰ Ａ／Ｂ、Ｕ２小核リボ核タンパク質Ｂ、ホスホ−リアノジン受容体３、ホスホ−スプライシング因子３Ａサブユニット２、ｓｎＲＮＰコアタンパク質Ｄ３、ネスプリン−１、チロシン−ｔＲＮＡリガーゼ、ホスホ−タンキラーゼ１−ＢＰ、チューブリンβ−３、アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ、ホスホ−ｂＺＩＰ促進因子ＢＥＦ（Ａｌｙ／ＲＥＦ；Ｔｈｏ４）、ユビキチン、ユビキチンカルボキシル末端ヒドロラーゼ５、ユビキノール−チトクロムｃレダクターゼ、液胞タンパク質選別１６、ホスホ−亜鉛フィンガータンパク質６４、ホスホ−ＡＨＮＡＫ（デスモヨーキン）、ＡＴＰシンターゼβ鎖、ＡＴＰシンターゼδ鎖、ホスホ−低温ショックドメインタンパク質Ｅ１、ホスホ−プレクチン１、ネクチン２（ＣＤ１１２抗原）、ｐ１８５−Ｒｏｎ、ＳＨＣ１、ビメンチン、フィブロネクチン、フィブリリン−１、フィブリリン−２、コラーゲンα−２（ＩＶ）、コラーゲンα−２（Ｖ）、ＬＯＸＬ１、ナイドジェン、Ｃ１１ｏｒｆ９、テネイシン、Ｎ−カドヘリン、胚性ＥＤＢ＋フィブロネクチン、チューブリンα−３、エピモルフィン、酸性ロイシンリッチ核リンタンパク質３２Ｂ、ＣＤ４４抗原、カルシウム結合Ａｒａｌａｒ２、２，４−ジエノイル−ＣｏＡレダクターゼ、電子伝達フラボタンパク質、脂肪酸−結合タンパク質（Ｅ−ＦＡＢＰ）、ＲＮＡ−結合タンパク質ＦＵＳ、Ｋ−グルタミナーゼ、ミトコンドリアクレアチンキナーゼ、ホスホ−ロイパキシン、ミリストイル化アラニンリッチＣ−キナーゼ基質、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−２Ａ、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｂ−７、Ｒａｓ関連タンパク質Ｒａｐ−１ｂ、ホスホ−Ｃ−ｒｅｔおよびＳＴＡＴ３から選択される、
方法。
【請求項２８】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２３に記載の方法を用いてＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項２９】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２４に記載の方法を用いることによってＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３０】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤による阻害に対する腫瘍細胞増殖の感受性を予測するために、請求項２５に記載の方法を用いることによってＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤を用いた治療に対して有効な反応を示す可能性がある者として患者を同定する段階、およびＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３１】
患者において腫瘍又は腫瘍転移を治療するための方法であって、腫瘍細胞が上皮間葉移行（ＥＭＴ）を起こしているか否かを示すバイオマーカーのレベルを評価することにより、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に対する患者の推定反応性を診断する段階；患者の腫瘍におけるＩＧＦ−１および／又はＩＧＦ−２のレベルを評価する段階；および患者がＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤に反応性を有する可能性があると診断され、ならびに腫瘍がＩＧＦ−１および／又はＩＧＦ−２を有すると判定された場合、ＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤の治療的有効量を該患者に投与する段階を含む、方法。
【請求項３２】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項９の方法。
【請求項３３】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項１９の方法。
【請求項３４】
投与されるＩＧＦ−１Ｒキナーゼ阻害剤がＯＳＩ−９０６である、請求項３１の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７−Ａ】
【図７−Ｂ】
【図７−Ｃ】
【図７−Ｄ】
【図７−Ｅ】
【図７−Ｆ】
【図７−Ｇ】
【図７−Ｈ】
【図７−Ｉ】
【図７−Ｊ】
【図７−Ｋ】
【図７−Ｌ】
【図７−Ｍ】
【図７−Ｎ】
【図７−Ｏ】
【図７−Ｐ】
【図７−Ｑ】
【図７−Ｒ】
【図７−Ｓ】
【図７−Ｔ】
【図７−Ｕ】
【図７−Ｖ】
【図８】
【図９】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７−Ａ】
【図７−Ｂ】
【図７−Ｃ】
【図７−Ｄ】
【図７−Ｅ】
【図７−Ｆ】
【図７−Ｇ】
【図７−Ｈ】
【図７−Ｉ】
【図７−Ｊ】
【図７−Ｋ】
【図７−Ｌ】
【図７−Ｍ】
【図７−Ｎ】
【図７−Ｏ】
【図７−Ｐ】
【図７−Ｑ】
【図７−Ｒ】
【図７−Ｓ】
【図７−Ｔ】
【図７−Ｕ】
【図７−Ｖ】
【図８】
【図９】
【公表番号】特表２０１１−５０１６６０（Ｐ２０１１−５０１６６０Ａ）
【公表日】平成２３年１月１３日（２０１１．１．１３）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−５２７９６４（Ｐ２０１０−５２７９６４）
【出願日】平成２０年９月２９日（２００８．９．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０１１２９９
【国際公開番号】ＷＯ２００９／０４５３８９
【国際公開日】平成２１年４月９日（２００９．４．９）
【出願人】（５０６３３０５７５）オーエスアイ・ファーマスーティカルズ・インコーポレーテッド (25)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２３年１月１３日（２０１１．１．１３）
【国際特許分類】
【出願日】平成２０年９月２９日（２００８．９．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０１１２９９
【国際公開番号】ＷＯ２００９／０４５３８９
【国際公開日】平成２１年４月９日（２００９．４．９）
【出願人】（５０６３３０５７５）オーエスアイ・ファーマスーティカルズ・インコーポレーテッド (25)
【Ｆターム（参考）】
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