受容体リガンド同定法
【課題】 本発明の課題の１つは、核内受容体を調節する化合物を同定することにある。
【解決手段】 上記課題は、核内受容体を調節する化合物を同定する方法であって、該方法は：Ａ）候補化合物を提供する工程；およびＢ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程を包含する、方法を提供することによって解決される。
【解決手段】 上記課題は、核内受容体を調節する化合物を同定する方法であって、該方法は：Ａ）候補化合物を提供する工程；およびＢ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程を包含する、方法を提供することによって解決される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法であって、該方法は：
Ａ）候補化合物を提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
前記システインは、リガンド結合ドメインに存在する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記核内受容体は、ＰＰＡＲα、ＰＰＡＲβ／δ、ＰＰＡＲγ１、ＰＰＡＲγ２、ＥＲＲ１、ＥＲＲ２、ＥＲＲ３、ＨＮＦ４α、ＨＮＦ４β、ＲＡＲα、ＲＡＲβ、ＲＡＲγ１、ＲＡＲγ２、ＲＸＲα、ＲＸＲβ、ＲＸＲγ、ＲＯＲα、ＲＯＲβ、ＲＯＲγ、ＬＲＨ１、ＳＦ１、ＴＬＸおよびＯ４２４５受容体からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記核内受容体は、ＰＰＡＲγである、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記システインの位置は、以下の表
【表１】
に示される配列番号中のアミノ酸番号で示される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記候補化合物は、ＲＡ−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−ＲＢ−またはＲＡ−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−ＲＢ−という置換基を有する化合物を含み、ここで、ＲＡは、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ＲＢは、二価の炭化水素基である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記共有結合の測定は、蛍光標識マレイミドという化合物を用いて行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
さらに、前記候補化合物が、前記核内受容体のリガンド結合ドメインにあるヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸と水素結合するかどうかを判定する工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記ヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸の残基番号は、
【表２】
に示される配列番号中のアミノ酸番号で示されるアルギニンまたはチロシンを含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記ヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸は、配列番号４２に示すアミノ酸配列の４７３位チロシンまたは配列番号４４に示すアミノ酸配列の５０１位チロシンを含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記特定のアミノ酸との水素結合は、核磁気共鳴装置（ＮＭＲ）、またはＸ線回折装置という手段により測定される、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
前記特定のアミノ酸との共有結合は、質量分析装置またはＳＤＳ−ＰＡＧＥという手段により測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記調節は、阻害である、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記調節は、促進である、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物であって、該化合物は、以下の式：
（化１）
Ｒ１−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、化合物。
【請求項１６】
前記化合物において、
Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜９個を有する、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の炭化水素基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が６〜１２個である、請求項１５に記載の化合物。
【請求項１７】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物を含む核内受容体の調節のための組成物であって、該化合物は、以下の式：
（化２）
Ｒ１−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、組成物。
【請求項１８】
前記構造は、
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３であり、
前記化合物において、
Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜９個を有する置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が６〜１４個であり、
その組み合わせは、
【表３】
に記載される配列番号に示すアミノ酸配列を有する核内受容体に対して、右列の炭素数を有する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項１９】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物を含む、核内受容体に起因する疾患、障害または状態の処置、予防または予後のための組成物であって、該化合物は、以下の式：
（化３）
Ｒ１−Ｃ＝Ｃ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−Ｃ＝Ｃ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、組成物。
【請求項２０】
１）標的生体分子と、リガンドとを混合して混合物を生成する工程；
２）蛍光標識マレイミドを該混合物に加える工程；
３）該混合物において、該標的生体分子と該蛍光標識マレイミドとの結合を検出する工程
を包含する、該標的生体分子に対するリガンドの結合能を定量する方法。
【請求項２１】
前記結合は、共有結合であり、該共有結合の定量を行う工程をさらに包含し、該定量は、前記リガンドに関し少なくとも２つの量を測定することにより達成される、請求項２０の方法。
【請求項２２】
前記共有結合の定量は、不可逆的に共有結合するリガンドをプローブとして用いて行われ、ここで、共有結合しないリガンドの結合が定量される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記リガンドは、共有結合するものまたは共有結合しないものを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記生体分子は、核内受容体である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２５】
前記生体分子は、核内受容体であり、前記不可逆的に共有結合するリガンドは、インドメタシン、１５−デオキシ−Δ１２，１４−プロスタグランジンＪ２（１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，９，１２Ｅ，１４Ｚ−テトラエン−１−オイック酸；１５ｄ−ＰＧＪ２）、１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，１２Ｅ，１４Ｚ−トリエン−１−オイック酸（ＣＡＹ１０４１０）、５−オキソ−６Ｅ，８Ｚ，１１Ｚ，１４Ｚ−エイコサテトラエン酸（５−オキソＯＤＥ）、９−オキソ−１０Ｅ，１２Ｚ−オクタデカノジエン酸（９−オキソＯＤＥ）、１３−オキソ−９Ｚ，１１Ｅ−オクタデカノジエン酸（１３−オキソＯＤＥ）および１５−オキソ−５Ｚ，８Ｚ，１１Ｚ，１３Ｅ−エイオコサテトラエン酸（５−オキソＥＴＥ）からなる群より選択される構造を有する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
核内受容体を調節する化合物を同定するシステムであって、該システムは：
Ａ）候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する手段；および
Ｂ）共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると算出する手段、
を備える、システム。
【請求項２７】
核内受容体を調節する化合物を同定するために用いられる、化合物と、該核内受容体との共有結合を測定するためのキットであって、
Ａ）該核内受容体と不可逆的に共有結合することが分かっているリガンド；および
Ｂ）共有結合しないリガンドの結合を測定するための手順を記載する指示書、
を備える、キット。
【請求項２８】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法をコンピュータに実行させるプログラムであって、該方法は：
Ａ）候補化合物の立体構造データを提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、プログラム。
【請求項２９】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法をコンピュータに実行させるプログラムを格納する記録媒体であって、該方法は：
Ａ）候補化合物の立体構造データを提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、記録媒体。
【請求項３０】
インドメタシン、１５−デオキシ−Δ１２，１４−プロスタグランジンＪ２（１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，９，１２Ｅ，１４Ｚ−テトラエン−１−オイック酸；１５ｄ−ＰＧＪ２）、１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，１２Ｅ，１４Ｚ−トリエン−１−オイック酸（ＣＡＹ１０４１０）、５−オキソ−６Ｅ，８Ｚ，１１Ｚ，１４Ｚ−エイコサテトラエン酸（５−オキソＯＤＥ）、９−オキソ−１０Ｅ，１２Ｚ−オクタデカノジエン酸（９−オキソＯＤＥ）、１３−オキソ−９Ｚ，１１Ｅ−オクタデカノジエン酸（１３−オキソＯＤＥ）および１５−オキソ−５Ｚ，８Ｚ，１１Ｚ，１３Ｅ−エイオコサテトラエン酸（５−オキソＥＴＥ）からなる群より選択される化合物を含む、核内受容体の調節剤。
【請求項３１】
候補化合物が、核内受容体のアゴニストであるかまたはアンタゴニストであるかどうかを判定する方法であって、該方法は：
Ａ）候補化合物を提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定し、共有結合すると判定された候補化合物を選択する工程；
Ｃ）転写因子認識配列と作動可能に連結されるレポーターをコードする核酸配列を含む核酸構築物と、該選択された核内受容体とを含む系において、該候補化合物の活性を判定する工程であって、該レポーターの発現が増強される場合、該候補化合物は該核内受容体のアゴニストと判定し、該レポーターの発現が減少する場合、該候補化合物は該核内受容体のアンタゴニストと判定する、工程、
を包含する、方法。
【請求項３２】
前記レポーターは、ルシフェラーゼである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記系は、細胞である、請求項３１に記載の方法。
【請求項１】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法であって、該方法は：
Ａ）候補化合物を提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
前記システインは、リガンド結合ドメインに存在する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記核内受容体は、ＰＰＡＲα、ＰＰＡＲβ／δ、ＰＰＡＲγ１、ＰＰＡＲγ２、ＥＲＲ１、ＥＲＲ２、ＥＲＲ３、ＨＮＦ４α、ＨＮＦ４β、ＲＡＲα、ＲＡＲβ、ＲＡＲγ１、ＲＡＲγ２、ＲＸＲα、ＲＸＲβ、ＲＸＲγ、ＲＯＲα、ＲＯＲβ、ＲＯＲγ、ＬＲＨ１、ＳＦ１、ＴＬＸおよびＯ４２４５受容体からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記核内受容体は、ＰＰＡＲγである、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記システインの位置は、以下の表
【表１】
に示される配列番号中のアミノ酸番号で示される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記候補化合物は、ＲＡ−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−ＲＢ−またはＲＡ−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−ＲＢ−という置換基を有する化合物を含み、ここで、ＲＡは、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ＲＢは、二価の炭化水素基である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記共有結合の測定は、蛍光標識マレイミドという化合物を用いて行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
さらに、前記候補化合物が、前記核内受容体のリガンド結合ドメインにあるヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸と水素結合するかどうかを判定する工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記ヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸の残基番号は、
【表２】
に示される配列番号中のアミノ酸番号で示されるアルギニンまたはチロシンを含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記ヘリックス１２またはヘリックス５内のアミノ酸は、配列番号４２に示すアミノ酸配列の４７３位チロシンまたは配列番号４４に示すアミノ酸配列の５０１位チロシンを含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記特定のアミノ酸との水素結合は、核磁気共鳴装置（ＮＭＲ）、またはＸ線回折装置という手段により測定される、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
前記特定のアミノ酸との共有結合は、質量分析装置またはＳＤＳ−ＰＡＧＥという手段により測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記調節は、阻害である、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記調節は、促進である、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物であって、該化合物は、以下の式：
（化１）
Ｒ１−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、化合物。
【請求項１６】
前記化合物において、
Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜９個を有する、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の炭化水素基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が６〜１２個である、請求項１５に記載の化合物。
【請求項１７】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物を含む核内受容体の調節のための組成物であって、該化合物は、以下の式：
（化２）
Ｒ１−ＣＨ＝ＣＨ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、組成物。
【請求項１８】
前記構造は、
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ−Ｒ２−Ｒ３であり、
前記化合物において、
Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜９個を有する置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が６〜１４個であり、
その組み合わせは、
【表３】
に記載される配列番号に示すアミノ酸配列を有する核内受容体に対して、右列の炭素数を有する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項１９】
請求項１に記載される方法によって、特定された化合物を含む、核内受容体に起因する疾患、障害または状態の処置、予防または予後のための組成物であって、該化合物は、以下の式：
（化３）
Ｒ１−Ｃ＝Ｃ−（Ｃ＝Ｏ）−Ｒ２−Ｒ３または
Ｒ１−（Ｃ＝Ｏ）−Ｃ＝Ｃ−Ｒ２−Ｒ３
という構造を有し、ここで、Ｒ１は、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が１〜１３個の、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ２は、置換されていてもよい飽和または不飽和の炭化水素基であり、Ｒ３は、水素または置換されていてもよい、カルボニル基、水酸基、アミド基およびチオール基からなる群より選択される置換基を含む一価の置換基であり、ここでＲ２とＲ３とは、含まれる炭素について、最短距離を結ぶ炭素数の最大値が４〜１４個である、組成物。
【請求項２０】
１）標的生体分子と、リガンドとを混合して混合物を生成する工程；
２）蛍光標識マレイミドを該混合物に加える工程；
３）該混合物において、該標的生体分子と該蛍光標識マレイミドとの結合を検出する工程
を包含する、該標的生体分子に対するリガンドの結合能を定量する方法。
【請求項２１】
前記結合は、共有結合であり、該共有結合の定量を行う工程をさらに包含し、該定量は、前記リガンドに関し少なくとも２つの量を測定することにより達成される、請求項２０の方法。
【請求項２２】
前記共有結合の定量は、不可逆的に共有結合するリガンドをプローブとして用いて行われ、ここで、共有結合しないリガンドの結合が定量される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記リガンドは、共有結合するものまたは共有結合しないものを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記生体分子は、核内受容体である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２５】
前記生体分子は、核内受容体であり、前記不可逆的に共有結合するリガンドは、インドメタシン、１５−デオキシ−Δ１２，１４−プロスタグランジンＪ２（１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，９，１２Ｅ，１４Ｚ−テトラエン−１−オイック酸；１５ｄ−ＰＧＪ２）、１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，１２Ｅ，１４Ｚ−トリエン−１−オイック酸（ＣＡＹ１０４１０）、５−オキソ−６Ｅ，８Ｚ，１１Ｚ，１４Ｚ−エイコサテトラエン酸（５−オキソＯＤＥ）、９−オキソ−１０Ｅ，１２Ｚ−オクタデカノジエン酸（９−オキソＯＤＥ）、１３−オキソ−９Ｚ，１１Ｅ−オクタデカノジエン酸（１３−オキソＯＤＥ）および１５−オキソ−５Ｚ，８Ｚ，１１Ｚ，１３Ｅ−エイオコサテトラエン酸（５−オキソＥＴＥ）からなる群より選択される構造を有する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
核内受容体を調節する化合物を同定するシステムであって、該システムは：
Ａ）候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する手段；および
Ｂ）共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると算出する手段、
を備える、システム。
【請求項２７】
核内受容体を調節する化合物を同定するために用いられる、化合物と、該核内受容体との共有結合を測定するためのキットであって、
Ａ）該核内受容体と不可逆的に共有結合することが分かっているリガンド；および
Ｂ）共有結合しないリガンドの結合を測定するための手順を記載する指示書、
を備える、キット。
【請求項２８】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法をコンピュータに実行させるプログラムであって、該方法は：
Ａ）候補化合物の立体構造データを提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、プログラム。
【請求項２９】
核内受容体を調節する化合物を同定する方法をコンピュータに実行させるプログラムを格納する記録媒体であって、該方法は：
Ａ）候補化合物の立体構造データを提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定する工程であって、共有結合すると判定された候補化合物を、核内受容体を調節する化合物であると同定する、工程、
を包含する、記録媒体。
【請求項３０】
インドメタシン、１５−デオキシ−Δ１２，１４−プロスタグランジンＪ２（１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，９，１２Ｅ，１４Ｚ−テトラエン−１−オイック酸；１５ｄ−ＰＧＪ２）、１１−オキソ−プロスタ−５Ｚ，１２Ｅ，１４Ｚ−トリエン−１−オイック酸（ＣＡＹ１０４１０）、５−オキソ−６Ｅ，８Ｚ，１１Ｚ，１４Ｚ−エイコサテトラエン酸（５−オキソＯＤＥ）、９−オキソ−１０Ｅ，１２Ｚ−オクタデカノジエン酸（９−オキソＯＤＥ）、１３−オキソ−９Ｚ，１１Ｅ−オクタデカノジエン酸（１３−オキソＯＤＥ）および１５−オキソ−５Ｚ，８Ｚ，１１Ｚ，１３Ｅ−エイオコサテトラエン酸（５−オキソＥＴＥ）からなる群より選択される化合物を含む、核内受容体の調節剤。
【請求項３１】
候補化合物が、核内受容体のアゴニストであるかまたはアンタゴニストであるかどうかを判定する方法であって、該方法は：
Ａ）候補化合物を提供する工程；および
Ｂ）該候補化合物が、該核内受容体中のシステインと共有結合するかどうかを判定し、共有結合すると判定された候補化合物を選択する工程；
Ｃ）転写因子認識配列と作動可能に連結されるレポーターをコードする核酸配列を含む核酸構築物と、該選択された核内受容体とを含む系において、該候補化合物の活性を判定する工程であって、該レポーターの発現が増強される場合、該候補化合物は該核内受容体のアゴニストと判定し、該レポーターの発現が減少する場合、該候補化合物は該核内受容体のアンタゴニストと判定する、工程、
を包含する、方法。
【請求項３２】
前記レポーターは、ルシフェラーゼである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記系は、細胞である、請求項３１に記載の方法。
【図１】
【図２−１】
【図２−２】
【図２−３】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３Ａ】
【図１３Ｂ】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２−１】
【図２−２】
【図２−３】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３Ａ】
【図１３Ｂ】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【公開番号】特開２００６−３００３７（Ｐ２００６−３００３７Ａ）
【公開日】平成１８年２月２日（２００６．２．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００４−２１０８６８（Ｐ２００４−２１０８６８）
【出願日】平成１６年７月１６日（２００４．７．１６）
【国等の委託研究の成果に係る記載事項】（出願人による申告）「国等の委託研究の成果に係る特許出願（平成１６年度独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構「基盤技術研究促進事業（民間基盤技術研究支援制度）／プロテインネットワーク／超分子複合体機能構造の解析と制御による創薬等産業基盤技術の開発」、産業活力再生特別措置法 第３０条の適用を受ける特許出願）」
【出願人】（５０２０５５４８１）技術研究組合 生物分子工学研究所 (4)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成１８年２月２日（２００６．２．２）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年７月１６日（２００４．７．１６）
【国等の委託研究の成果に係る記載事項】（出願人による申告）「国等の委託研究の成果に係る特許出願（平成１６年度独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構「基盤技術研究促進事業（民間基盤技術研究支援制度）／プロテインネットワーク／超分子複合体機能構造の解析と制御による創薬等産業基盤技術の開発」、産業活力再生特別措置法 第３０条の適用を受ける特許出願）」
【出願人】（５０２０５５４８１）技術研究組合 生物分子工学研究所 (4)
【Ｆターム（参考）】
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