本発明は、マイクロフルイディック技術を提供し、フェムトリッターからマイクロリッターまでの尺度での反応に対する迅速かつ経済的な操作可能にする。本発明は、非常に多くの数の反応、例えば結晶化またはアッセイを平行して行い、迅速かつ経済的な反応を可能にする方法を提供する。本発明は、タンパク質、生体分子、生体分子と束縛リガンドとの錯体などの結晶化に特に良く適している。本発明は、結晶の回折の質に関する直接的なテストを可能にする。本発明はまた、コンビナトリアルケミストリの分野に適用可能であり得、反応速度および反応生成物の両方のモニタリングを可能にする。
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本発明は、ｔＲＮＡスプライシング経路における１以上の構成要素の活性をモジュレートする化合物のスクリーニング及び同定方法に関する。特に本発明は、ｔＲＮＡスプライシングエンドヌクレアーゼ及び／又はｔＲＮＡスプライシングリガーゼの活性をモジュレートする化合物のスクリーニング及び同定方法に関する。本発明は、動物界のｔＲＮＡスプライシングエンドヌクレアーゼ及び／又は動物界のｔＲＮＡスプライシングリガーゼを阻害する化合物を同定するためのアッセイを提供する。本発明はまた、真菌のｔＲＮＡスプライシングエンドヌクレアーゼ及び／又は真菌のｔＲＮＡスプライシングリガーゼを阻害する化合物を同定するためのアッセイを提供する。本発明の方法は、癌及び／又は真菌感染症を治療及び／又は予防するために有用な医薬品のリードを同定するために、化合物ライブラリーをハイスループットでスクリーニングするための簡便な高感度アッセイを提供する。 （もっと読む）

アポトーシスを刺激する働きをする治療薬の、哺乳類の身体における有効性を評価するための方法は、該アポトーシスを刺激する働きをする治療薬で処置する哺乳類から、腫瘍細胞が存在する身体組織または体液のサンプルを得ること、ここで、該組織または体液はカスパーゼ３の１７ｋＤａ断片を含む可能性があり、この断片はin vivoにおけるカスパーゼ３の特異的切断によって生じたものである；該切断カスパーゼ３の１７ｋＤａ断片の存在量を測定すべく該サンプルをアッセイすること；該治療薬を該哺乳類に投与すること；該哺乳類から、該身体組織または該体液の第二のサンプルを得ること；および該切断カスパーゼ３の１７ｋＤａ断片の存在量を測定すべく該第二のサンプルをアッセイすることを含み、該第一のサンプルで測定された量に対する、該第二のサンプルで測定された該１７ｋＤａ断片の量の増加が、アポトーシス刺激および該治療薬の有効性を示す。 （もっと読む）

配列変化分析用の断片化をベースとした方法及びシステム、特に質量分析方法及びシステムを提供する。 （もっと読む）

【課題】 より生体内に近い状況下での生体高分子間の相互作用を、比較的少量の生体分子高分子を用いて簡便かつ迅速に解析することを可能とする方法を提供すること。
【解決手段】 生体高分子の高次構造の変化、又は生体高分子とリガンドとの相互作用部位に関する情報を取得するための生体高分子の解析方法において、生体高分子の加水分解酵素に対する感受性の変化を測定することによって上記情報を取得することを特徴とする方法。 （もっと読む）

【課題】効率的で正確なＲＮＡの標識および遺伝子発現をモニターするために使用され得る、ＲＮＡ標識合物の提供。
【解決手段】ＲＮＡを含むサンプルを提供する工程；ＲＮＡを構造：


を有する標識試薬に連結する工程（Ｂは、ヘテロ環部分であり；Ｘは、フラグメントの３’ＯＨ基へ核酸標識化合物を連結可能にする官能基であり；Ｙは、−Ｈ、−ＯＨ、−ＯＲ、−ＳＲ、−ＮＨＲまたはハロゲンからなる群より選択され；Ｌは、リンカー基であり；Ｓｉｇは、標識されたＲＮＡを提供する検出可能な部分である）；プローブを有する核酸アレイを提供する工程；ハイブリダイズする工程；ハイブリダイゼーションの程度を決定する工程を含む、ＲＮＡの存在を検出する方法。 （もっと読む）

本発明は、ＸＢＰ−１タンパク質、またはＸＢＰ-１を含むシグナル伝達経路中のタンパク質の発現、プロセシング、翻訳後修飾、および/または活性を調整する方法および組成物を提供する。本発明の方法および組成物を用いて調整し得るＸＢＰ-１活性の例としては、非折り畳みタンパク質の応答（ＵＰＲ）、形質細胞の分化、免疫グロブリン産生、アポトーシスおよびＩＬ−６の産生が挙げられる。本発明はまた、ＸＢＰ−１タンパク質、またはＸＢＰ-１を含むシグナル伝達経路中の分子の発現、プロセシング、翻訳後修飾、および/または活性を調整する化合物を同定する方法に関する。 （もっと読む）

【課題】正確性、信頼性の向上したアポリポタンパクＥ遺伝子多型検出方法、アポリポタンパクＥ遺伝子多型のゲノタイプ判定方法及び試薬を提供する。
【解決手段】アポリポタンパクＥ遺伝子に特異的なプライマー対を用いてＤＮＡを増幅する段階；増幅されたＤＮＡを、アポリポタンパクＥ遺伝子のコドン１１２の一塩基多型部位を認識配列に含む第１の制限酵素と、アポリポタンパクＥ遺伝子のコドン１５８の一塩基多型部位を認識配列に含む第２の制限酵素と、を用いて切断する段階；切断されたＤＮＡ断片を分離する段階；分離されたＤＮＡ断片を検出する段階；を有し、前記プライマー対のうち上流側プライマーは、前記コドン１１２の一塩基多型部位を含む前記第１の制限酵素の認識配列より上流側に前記第１の制限酵素の認識配列を導入する、少なくとも１塩基のミスマッチ配列を有することを特徴とするアポリポタンパクＥ遺伝子多型検出方法が提供される。 （もっと読む）

【課題】プロテアーゼ活性などの加水分解活性を有した化学物質群あるいは加水分解活性に影響を及ぼす化学物質群に対して汎用性が高く、前記化学物質を特異的かつ迅速簡単に検知する方法を提供することを目的とする。
【解決手段】加水分解される基質３が固定化された固相面４を利用し、加水分解活性を有するかあるいは他の加水分解酵素活性を増減させる性質をもった被検知物質を含んだ検体を前記固相面４に反応させ、加水分解されずに固相面４上に残った基質量を検知することで、抗体を用いることなく加水分解活性に依存した被検知物質を特異的に迅速且つ簡単に検知する事のできる検知方法が得られる。 （もっと読む）

本発明は、癌腫およびその前駆病変の検出および処置のための化合物および方法に関する。本発明は、癌腫およびその前駆病変の検出および処置に有用なDNase核酸およびポリペプチドを提供する。本発明はまた、より詳細には、生物学的試料中の１以上のDNase分子の亜細胞局在および／またはレベルの検出を含む癌腫およびその前駆病変の検出方法に関する。さらに、本発明は、癌腫およびその前駆病変の疾患課程の診断、予後およびモニタリングのための方法ならびに該病変の処置のための方法に関する。
（もっと読む）

本発明は、ヌクレオチド配列の検出のために有用な化合物に関する。特に、本発明は、ラベルされたイミダゾール−PEG化合物、例えばその化合物を組込むヌクレオシド、ヌクレオチド及び核酸、及びそのような化合物の利用方法に関する。本発明はさらに、ラベルされたイミダゾール−PEG化合物を含んで成るキットに関する。 （もっと読む）

【課題】小スケールの操作、速度、感度、特異性、および製造の容易な酵素活性センサーを提供する。
【解決手段】 本発明は、酵素のための基質を含む平板導波管を備える酵素活性センサーに関し、この酵素活性センサーにおいて、（１）上記基質が検出可能な標識を含むか；または（２）上記酵素の活性が、基質を該検出可能な標識を含むように改変する。本発明はまた、酵素活性を検出する方法に関し、この方法は、（ａ）上記酵素活性センサーの平板導波管を、上記酵素が基質に対し作用することを許容する条件下で試験サンプルに曝す工程；（ｂ）減衰場を生成するために上記平板導波管を照射する工程、および（ｃ）前記検出可能な標識の存在について該減衰場を検査する工程を包含する。 （もっと読む）

【課題】遺伝子組換えや、遺伝子解析などの遺伝子工学の分野で有用なヌクレアーゼ簡便に見出し、更に迅速に解析する技術を提供する。
【解決手段】候補遺伝子を無細胞タンパク質合成法にて合成し、そのヌクレアーゼ活性の有無を調べることを特徴とする、新規なヌクレアーゼのスクリーニング方法。 （もっと読む）

【課題】DNaseγのDNase活性を阻害する阻害方法、DNaseγのDNase活性を阻害する阻害物質のスクリーニング方法、及びDNaseγのDNase活性を阻害する阻害物質を提供すること。
【解決手段】DNase Iが２本鎖DNAを解離しながらDNAを切断する際、DNase Iの酵素活性中心と結合する１本鎖DNAと異なる側の１本鎖DNAが結合するDNA結合ポケットに対応するDNaseγのドメインに物質を結合させることにより、DNaseγのDNase活性を阻害することができる。このような阻害方法を利用して、DNaseγのドメインに結合する化合物を化合物ライブラリーから選択し、DNaseγのDNase活性を阻害することができるかどうかを確認するというスクリーニングを行う。これにより得られた物質は、DNaseγのDNase活性を阻害することができる。 （もっと読む）

本発明は、高感受性を有する組換えエンドヌクレアーゼを生産する方法、当該方法により得られるエンドヌクレアーゼ調製物、及び特にミスマッチの検出のためのそれらの使用に関する。

【配列表】
SEQUENCE LISTING

<110> GENOPLANTE-VALOR
INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE
BENDAHMANE, Abdelhafid
STURBOIS, Benedicte
TRIQUES, Karine
CABOCHE, Michel

<120> METHOD FOR PRODUCING HIGHLY SENSITIVE ENDONUCLEASES, NOVEL
PREPARATIONS OF ENDONUCLEASES AND USES THEREOF.

<130> MJP/bv1516-19

<150> PCT/EP2004/009159
<151> 2004-07-30

<150> PCT/EP2004/009166
<151> 2004-07-30

<160> 25

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1
<211> 2640
<212> DNA
<213> Arabidopsis thaliana


<220>
<221> misc#feature
<223> ENDO 1 Gene At1g11190

<400> 1
aaattcgatg aggttgttat agacaagaga agacattttt atacaaaaga gtttatcatt 60

atataagttt caaactttga agatatggca tcggctttta gatcatccac gaggttgatt 120

cttgtattag gtatactgat tttgtgttcg gtttcttctg tccgaagctg gagcaaagaa 180

ggtcatattc ttacttgtag aattgctcag gtaattaagt taatgatcta ttgtttgaag 240

caactatttt ggttattctt gtcttatata tgtattagtg agatatacct acaaattttt 300

aattaggatt gacttttaaa ttgctatacg ttaccatgcc taacatctca tgtagatgat 360

catgaataca aacatgtcta atggcatatc aaattccaag tttttttggt agagatctga 420

gtcatttgac cgttataaga ttcataacaa aagttcgtat gtgtgtgttt ttgtggtgtg 480

accagaatct tttagaagcc ggaccagcac atgtagtaga gaatctgtta ccggattacg 540

tgaaaggaga tttatcagca ttgtgtgtgt ggcctgacca gatccgacat tggtacaagt 600

atcgttggac cagccatctc cattacatcg acactcccga ccaagcctgc tcttacgaat 660

actctagtaa gtcacaaccg agacattttc agataacctt aatccgtttt ctaattatct 720

tgaaccggag ttaaccaaaa aatcaattac aaataccaaa ccggattaaa aacaggggat 780

tgtcatgatc aacatggatt gaaggatatg tgtgtggatg gagcaatcca gaatttcacg 840

tctcagcttc agcattacgg tgaaggaaca tctgatcgta gatgtatgtc atcattttca 900

tttatttcat ataatgatga tatccaaagt gtaactgcgt attttgtatt ttgatgcata 960

acttaagttt ttaaaattat aatatatcct tgttcaatca catagataac atgaccgaag 1020

cccttttgtt cttgtctcat ttcatgggag atattcatca ggtttattac tcatcatcga 1080

ttcatttcac acctccacac atatagctct atttccatgt taaatattta attaacatgg 1140

tttttttttt tttccttaaa aagccgatgc atgtgggatt cacaagtgat gaaggaggaa 1200

acacgataga tttacgttgg tacaaacaca aatccaatct acatcatgta agcttcttct 1260

tttgtctctt tcaactttaa atttcatcat gaaaacaaaa aaaaaattaa cgaaggaaac 1320

aaaatatgta ggtatgggat agagagatca ttctcacggc tctaaaagaa aactacgaca 1380

agaacttgga tcttctccaa gaggatcttg agaagaacat caccaatgta atagacacta 1440

atttattcat attttactat aattttaaga atctttataa tggttatcat atattaggga 1500

ttatggcacg acgatctatc ttcgtggaca gaatgcaacg atcttatcgc ttgtccacac 1560

aagtaagttt taaattactt ggtttaagat tggcttgacg ctcgtttgaa gctagctaca 1620

aattttgata ctttttctgg tccaaaaatc ttacaaagat actgaaaata aaataatagg 1680

ttttaaactt ttaatttatt tggagttgga taggattaag tttcactaac ttccaattca 1740

aagtcaatta atagtagttt accatgatta gtgggttgac taatgtacca tatatattac 1800

cttatatcac atcttatttc cgatgtgaga tttcttatga aacataatta gactcgaacc 1860

ttttgtgttt cgatatatgt agtgtattca tgatcagaat cttattaagt ttacaactga 1920

aaactaaaat attaacatca taattataga ttcttaagta ggttttgttt gggtggagaa 1980

aatatccaat ttcgaataac attatataaa atattgaact aattttaatt gtatacgcag 2040

gtatgcttca gagagtataa agttagcttg taaatgggga tacaaaggcg tcaagtctgg 2100

tgaaacgtta tcaggtacgt tgtttgcttc ttctttttct cgtacgctaa caaaaatatt 2160

taaaaataaa cccgaccaaa tgaagtttaa ttaatcggat taatgatttt taatagtcac 2220

tacttttttt gtgtgggata tatgactgtc taatatataa ttttataaga aagctaaagg 2280

atttgtttaa taatttccga taaataattt tgcagaagaa tatttcaata caaggttgcc 2340

aatagtgatg aagagaatag ttcagggagg agttagacta gccatgatac taaaccgggt 2400

ttttagtgac gatcatgcta ttgctggtgt tgctgccact tgaaccaaac ccgacatacc 2460

ggggcatcaa agcatttgat taagagatta tttgatacat tcacaaaatt aattaaggct 2520

gatcagacat tcttttcttt tagtagcttt atctatgtga cagctaatgc ctgtggactg 2580

ctttgtttag aagtgtttag cattagatca tatgctaatt caatgttatt aattcatcgt 2640


<210> 2
<211> 305
<212> PRT
<213> Arabidopsis thaliana


<220>
<221> misc#feature
<223> Protein ENDO 1 At1g11190

<400> 2

Met Ala Ser Ala Phe Arg Ser Ser Thr Arg Leu Ile Leu Val Leu Gly
1 5 10 15


Ile Leu Ile Leu Cys Ser Val Ser Ser Val Arg Ser Trp Ser Lys Glu
20 25 30


Gly His Ile Leu Thr Cys Arg Ile Ala Gln Asn Leu Leu Glu Ala Gly
35 40 45


Pro Ala His Val Val Glu Asn Leu Leu Pro Asp Tyr Val Lys Gly Asp
50 55 60


Leu Ser Ala Leu Cys Val Trp Pro Asp Gln Ile Arg His Trp Tyr Lys
65 70 75 80


Tyr Arg Trp Thr Ser His Leu His Tyr Ile Asp Thr Pro Asp Gln Ala
85 90 95


Cys Ser Tyr Glu Tyr Ser Arg Asp Cys His Asp Gln His Gly Leu Lys
100 105 110


Asp Met Cys Val Asp Gly Ala Ile Gln Asn Phe Thr Ser Gln Leu Gln
115 120 125


His Tyr Gly Glu Gly Thr Ser Asp Arg Arg Tyr Asn Met Thr Glu Ala
130 135 140


Leu Leu Phe Leu Ser His Phe Met Gly Asp Ile His Gln Pro Met His
145 150 155 160


Val Gly Phe Thr Ser Asp Glu Gly Gly Asn Thr Ile Asp Leu Arg Trp
165 170 175


Tyr Lys His Lys Ser Asn Leu His His Val Trp Asp Arg Glu Ile Ile
180 185 190


Leu Thr Ala Leu Lys Glu Asn Tyr Asp Lys Asn Leu Asp Leu Leu Gln
195 200 205


Glu Asp Leu Glu Lys Asn Ile Thr Asn Gly Leu Trp His Asp Asp Leu
210 215 220


Ser Ser Trp Thr Glu Cys Asn Asp Leu Ile Ala Cys Pro His Lys Tyr
225 230 235 240


Ala Ser Glu Ser Ile Lys Leu Ala Cys Lys Trp Gly Tyr Lys Gly Val
245 250 255


Lys Ser Gly Glu Thr Leu Ser Glu Glu Tyr Phe Asn Thr Arg Leu Pro
260 265 270


Ile Val Met Lys Arg Ile Val Gln Gly Gly Val Arg Leu Ala Met Ile
275 280 285


Leu Asn Arg Val Phe Ser Asp Asp His Ala Ile Ala Gly Val Ala Ala
290 295 300


Thr
305


<210> 3
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4-960

<400> 3
gtgtttgtcc agtaatagtg tcagcata 28


<210> 4
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4-721

<400> 4
aggaacctga gaaaagactc gccagc 26


<210> 5
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence

<220>
<223> CEL N Terminal

<400> 5
tatcgttcta gagggaatga cgcgattata ttctgtgttc 40


<210> 6
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> CEL C Terminal

<400> 6
tatctgaatt catgccaaag aatgatc 27


<210> 7
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> CEL C terminal 8 His

<400> 7
aattcaatgg tgatggtggt gatggtgatg tgccaaagaa tgatctgcgg 50


<210> 8
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer (R21)

<400> 8
gacatatgga ctacagaagc ttggg 25


<210> 9
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer (R22)

<400> 9
gttcacgggt cacatcatgc attcc 25


<210> 10
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4m118

<400> 10
ttggttggac ttcactttga gc 22


<210> 11
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4m984

<400> 11
cacaacaatc agcaatgaca gc 22


<210> 12
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4-347

<400> 12
gtgattgctc cacctccgcc acc 23


<210> 13
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer 4-134

<400> 13
tacagcgatt gatataatat aaaattatcc 30


<210> 14
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer le 2462

<400> 14
tgatattgtc gtgcaatatg atgaaac 27


<210> 15
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Primer le 3082

<400> 15
atacctattt agcccacttg gacac 25


<210> 16
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Forward Primer for ENDO5

<400> 16
aaggatccga aagctctgtg tttcaga 27


<210> 17
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Reverse Primer for ENDO5

<400> 17
ggagttgtta cgtgggttct caaggatc 28


<210> 18
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Forward Primer for ENDO4

<400> 18
ctggatccct gtttttaact ttggaaag 28


<210> 19
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Reverse Primer for ENDO4

<400> 19
ggatgttcaa gtgattctcc tggatc 26


<210> 20
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Forward Primer for ENDO3

<400> 20
aaggatccat tcgacaaact ttgtaac 27


<210> 21
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Reverse Primer for ENDO3

<400> 21
agagtggtct tgggaatatt tatctcag 28


<210> 22
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Forward Primer for ENDO2

<400> 22
acggatccca tttcaaagaa ctctga 26


<210> 23
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Reverse Primer for ENDO2

<400> 23
gaccaatcat tatgctgtaa cttcag 26


<210> 24
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Forward Primer for ENDO1

<400> 24
caggatccaa gtttcaaact tgaag 25


<210> 25
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial sequence

<220>
<223> Reverse Primer for ENDO1

<400> 25
cggtatgtcg ggtttggttc aagtgg 26 （もっと読む）

本発明は、ペプチドおよびタンパク質サンプルの変化および変動を測定およびモニターするためのスタンダードの使用方法に関する。より具体的には、本発明は、サンプルの質の変化、特にサンプルの収集後、処理中および保存中の変化を測定およびモニターする方法に関する。 （もっと読む）

ショットガン・ライブラリから得られるマップを使用し、オープンリーディングフレームのどちらかの側のクローン開始部位におけるギャップの存在を決定することにより、毒性タンパク質をコードする遺伝子を検出する方法を記載する。本方法は、以前は未知であった制限エンドヌクレアーゼ遺伝子を同定することにより例証されている。
（もっと読む）

増幅アーティファクトを最小限にする複数の標的配列を増殖する方法を提供する。各フラグメントが少なくとも１つの定められた末端配列を有する標的配列を含むようにフラグメントを断片化する。プライマーペアモチーフ及び標的配列を含んでいるフラグメントの定められた配列に相補的な１つ又は２つの突出末端を全て含むセレクター構築物をフラグメントに接触させる。結合のあと、選択された標的配列はセレクターに共通するプライマーペアモチーフに特異的なプライマーペアを用いて同時に増幅させる。 （もっと読む）

37℃での開裂活性が増強されたI-DmoI誘導体、該変異形は、I-DmoIエンドヌクレアーゼの変異形又は第一I-DmoIドメインを少なくとも含むそのキメラ5誘導体の配列を含み、該配列は少なくとも：(i) 上記の第一I-DmoIドメインの位置4、20、49、52、92、94及び／又は95の残基の1つ、及び／又は(ii) I-DmoIのリンカー又は第二ドメインの始めの位置101、102及び／又は109の残基の1つ（存在する場合）の置換を含む。10上記の誘導体をコードするポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドを含む細胞、動物又は植物及び新規なDNA標的特異性を有するメガヌクレアーゼを単離するためのそれらの使用。 （もっと読む）

エフェクター又は補助因子を検出するセンサーシステムは、（a）核酸酵素；（b）第一のポリヌクレオチドを含む、前記核酸酵素の基質；（c）前記基質と少なくとも部分的に相補的である第二のポリヌクレオチドを含む第一の粒子セット（前記ポリヌクレオチドはその3'末端で前記粒子に付着している）；及び（d）前記基質と少なくとも部分的に相補的である第三のポリヌクレオチドを含む第二の粒子セット（前記ポリヌクレオチドはその5'末端で前記粒子に付着している）を含む。
（もっと読む）