ＰＳＣＡ及びそれがコードするタンパク質並びにそれらの変異体が開示される。ＰＳＣＡは正常成人組織において組織特異的な発現を示し、表１に掲げられた癌で異常発現する。その結果、ＰＳＣＡは癌の診断、予後、予防及び／又は治療ターゲットを提供する。ＰＳＣＡ遺伝子、それらのフラグメント、又はそれらのコードするタンパク質、それらの変異体若しくはそれらのフラグメントは、液性又は細胞性免疫応答を惹起するために用いることができ、ＰＳＣＡ反応性の抗体又はＴ細胞は能動免疫又は受動免疫に用いることができる。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）図２のタンパク質の８、９、１０又は１１個の連続するアミノ酸からなるペプチド、
ｂ）表８〜表２１のペプチド、
ｃ）表２２〜表４５のペプチド、又は、
ｄ）表４６〜表４９のペプチド、
を含む、から本質的になる、又は、からなる組成物。
【請求項２】
図２のタンパク質と関連するタンパク質を含む請求項１の組成物。
【請求項３】
図２に示した全アミノ酸配列と少なくとも９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、又は、９９％相同である請求項２のタンパク質。
【請求項４】
前記物質が、図２のタンパク質のアミノ酸配列からの、ＣＴＬポリペプチド又はその類似体を含むことを特徴とする請求項１の組成物。
【請求項５】
前記エピトープは図２の全アミノ酸配列ではないという条件によって更に制限される請求項４の組成物。
【請求項６】
前記ポリペプチドは図２のタンパク質の全アミノ酸配列ではないという条件によって更に制限される請求項１の組成物。
【請求項７】
図２のアミノ酸配列からの抗体ポリペプチドエピトープを含む請求項１の組成物。
【請求項８】
前記エピトープは図２の全アミノ酸配列ではないという条件によってされに制限される請求項７の組成物。
【請求項９】
前記抗体エピトープは、当該ペプチドの末端まで任意の整数で増加する図２の少なくとも５アミノ酸のペプチド領域を含み、
前記エピトープは、
ａ）図５の親水性プロファイルの０．５より大きい値を有するアミノ酸位置、
ｂ）図６の疎水性親水性プロファイルの０．５より小さい値を有するアミノ酸位置、
ｃ）図７のパーセント接触可能残基プロファイルの０．５より大きい値を有するアミノ酸位置、
ｄ）図８の平均可動性プロファイルの０．５より大きい値を有するアミノ酸位置、
ｅ）図９のベータ−ターンプロファイルの０．５より大きい値を有するアミノ酸位置、
ｆ）前記ａ）〜ｅ）の少なくとも２つの組合せ、
ｇ）前記ａ）〜ｅ）の少なくとも３つの組合せ、
ｈ）前記ａ）〜ｅ）の少なくとも４つの組合せ、
ｉ）前記ａ）〜ｅ）の５つの組合せ、
から選択されるアミノ酸位置を含むことを特徴とする請求項７の組成物。
【請求項１０】
請求項１のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項１１】
図２に示された核酸分子を含む請求項１０のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記コードされたタンパク質は図２の全アミノ酸配列ではないという条件によって更に制限される請求項１０のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
前記物質が、図２の核酸配列のコード配列を含むポリペプチドを含むことを特徴とする請求項１１の組成物。
【請求項１４】
請求項１の付加的ペプチドをコードする付加的ヌクレオチド配列を更に含む請求項１１のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１０のポリヌクレオチドに完全に相補的なポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１６】
図２のタンパク質に向けられた哺乳類免疫応答を惹起する方法であって、
該方法は、前記哺乳類の免疫系の細胞を、
ａ）ＰＳＣＡ関連タンパク質、及び／又は、
ｂ）該タンパク質をコードするヌクレオチド配列、
の一部に接触させることにより、該タンパク質に対する免疫応答が惹起されることを含む方法。
【請求項１７】
請求項１６の免疫応答惹起方法であって、
少なくとも１つのＴ細胞エピトープ又は少なくとも１つのＢ細胞エピトープを含むＰＳＣＡ関連タンパク質を用意すること、及び、
該エピトープを哺乳類免疫系Ｔ細胞又はＢ細胞の各々に接触させることにより、Ｔ細胞又はＢ細胞が活性化されること、
を含む方法。
【請求項１８】
前記免疫系細胞はＢ細胞であり、そのため活性化されたＢ細胞は、前記ＰＳＣＡ関連タンパク質に特異的に結合する抗体を産生することを特徴とする請求項１７の方法。
【請求項１９】
前記免疫系細胞は細胞障害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）であるＴ細胞であり、そのため活性化されたＣＴＬは、前記ＰＳＣＡ関連タンパク質を発現する自己細胞を死滅することを特徴とする請求項１７の方法。
【請求項２０】
前記免疫系細胞はヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ）であるＴ細胞であり、そのため活性化されたＨＴＬは、細胞障害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の細胞障害活性又はＢ細胞の抗体産生活性を促進するサイトカインを分泌することを特徴とする請求項１７の方法。
【請求項２１】
サンプル中におけるＰＳＣＡ関連タンパク質又はＰＳＣＡ関連ポリヌクレオチドの存在を検出する方法であって、以下のステップ、
前記サンプルをＰＳＣＡ関連タンパク質又はＰＳＣＡ関連ポリヌクレオチドの各々と特異的に結合する物質へ接触させること、及び、
ＰＳＣＡ関連タンパク質と該物質との又はＰＳＣＡ関連ポリヌクレオチドと該物質との複合体の存在を各々判定すること、
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２２】
サンプル中のＰＳＣＡ関連タンパク質の存在を検出するための、請求項２１の方法であって、以下のステップ、
該サンプルをＰＳＣＡ関連タンパク質と特異的に結合する抗体又はそのフラグメントの何れかと接触させること、及び、
ＰＳＣＡ関連タンパク質と該抗体又はそのフラグメントとの複合体の存在を判定すること、
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２３】
癌を有する又は癌を有することが推測される患者からサンプルを得ることを、更に含むことを特徴とする請求項２１の方法。
【請求項２４】
サンプル中の図２のタンパク質のｍＲＮＡの存在を検出する請求項２１の方法であって、
少なくとも一つのプライマーを用いた逆転写により該サンプルからｃＤＮＡを合成すること、
そのように合成されたｃＤＮＡを、センス及びアンチセンスプライマーとしてＰＳＣＡポリヌクレオチドを用いて増幅すること（但し、センス及びアンチセンスプライマーとして使用されるＰＳＣＡポリヌクレオチドはＰＳＣＡ ｃＤＮＡの増幅に供される）、及び、
ＰＳＣＡ ｃＤＮＡの存在を検出すること、
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２５】
癌を有する又は癌を有することが推測される患者からの生物学的サンプル中の１又は２以上のＰＳＣＡ遺伝子産物をモニターするための請求項２１の方法であって：
個体からの組織サンプル中の細胞によって発現された１又は２以上のＰＳＣＡ遺伝子産物の状態を決定すること、
そのように決定されたＰＳＣＡ遺伝子産物の状態と対応する正常サンプルにおける１又は２以上のＰＳＣＡ遺伝子産物の状態とを比較すること、及び、
正常サンプルに対しサンプル中における１又は２以上の異常なＰＳＣＡ遺伝子産物の存在を同定すること、
を含むことからなる方法。
【請求項２６】
１又は２以上の増加したＰＳＣＡ ｍＲＮＡ又はＰＳＣＡタンパク質の遺伝子産物が存在するか否かを決定するステップを更に含み、前記正常組織サンプルに対する前記被検サンプル中における１又は２以上の増加した遺伝子産物の存在が癌の存在又は状態の指標であることを特徴とする請求項２５の方法。
【請求項２７】
癌が表１に示された組織において生じていることを特徴とする請求項２６の方法。
【請求項２８】
図２のタンパク質を発現する細胞の状態を調節する組成物であって、
ａ）図２のタンパク質を発現する細胞の状態を調節する物質、又は、
ｂ）図２のタンパク質によって調節される分子、
を含む組成物。
【請求項２９】
生理学的に許容可能な担体を更に含む請求項２８の組成物。
【請求項３０】
ヒト最小投薬単位形態の請求項２８の組成物を含む医薬組成物。
【請求項３１】
前記物質が、図２のタンパク質と特異的に結合する抗体又はそのフラグメントを含むことを特徴とする請求項２８の組成物。
【請求項３２】
モノクローナルである請求項３１の抗体又はそのフラグメント。
【請求項３３】
ヒト抗体、ヒト化抗体又はキメラ抗体である請求項３１の抗体。
【請求項３４】
請求項３１の抗体を産生する非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項３５】
請求項３２の抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項３６】
図２のタンパク質を発現する細胞に細胞障害性薬剤又は診断薬を送達する方法であって、
請求項４の抗体又はそのフラグメントとコンジュゲートされた細胞障害性薬剤又は診断薬を与えること、及び、
前記細胞と、前記抗体−剤コンジュゲート又はフラグメント−剤コンジュゲートとを接触させること、
を含む方法。
【請求項３７】
図２のタンパク質と免疫特異的に結合する抗体又はそのフラグメントの何れかをコードするポリヌクレオチドを含む物質である請求項２８の組成物。
【請求項３８】
前記物質が、ａ）ＰＳＣＡコード配列を有するポリヌクレオチドを切断するリボザイム、又は、ｂ）リボザイムをコードする核酸分子；及び、生理学的に許容可能な担体とを含む請求項２８の組成物。
【請求項３９】
ヒトＴ細胞を含む物質であることを特徴とする請求項２８の組成物であって、該Ｔ細胞がＰＳＣＡペプチド配列を特定のＨＬＡ分子の意味において特異的に認識する組成物。
【請求項４０】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する方法であって、請求項２８の組成物を細胞に投与することを含む方法。
【請求項４１】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する請求項４０の方法であって、ＰＳＣＡ関連タンパク質に特異的に結合する抗体又はそのフラグメントを該細胞に投与するステップを含む方法。
【請求項４２】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する請求項４０の方法であって、ＰＳＣＡ関連タンパク質を該細胞に投与するステップを含む方法。
【請求項４３】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する請求項４０の方法であって、ＰＳＣＡ関連タンパク質のコード配列を含むポリペプチド又はＰＳＣＡ関連タンパク質のコード配列に相補的なポリペプチドを含むポリペプチドを該細胞に投与するステップを含む方法。
【請求項４４】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する請求項４０の方法であって、図２のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを切断するリボザイムを該細胞に投与するステップを含む方法。
【請求項４５】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を抑制する請求項４０の方法であって、図２のタンパク質のペプチド配列を特異的に認識するヒトＴ細胞を該癌細胞に投与するステップを含む方法（但し、該配列は特定のＨＬＡ分子の意味における）。
【請求項４６】
請求項４０の方法であって、一本鎖モノクローナル抗体をコードするヌクレオチドを送達するベクターを該細胞に投与し、それによりコードされた一本鎖抗体が図２のタンパク質を発現する癌細胞の細胞内で発現されることを特徴とする方法。

【図１】

【図２Ａ】

【図２Ｂ】

【図２Ｃ】

【図２Ｄ】

【図２Ｅ】

【図２Ｆ】

【図２Ｇ】

【図２Ｈ】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図３Ｃ】

【図３Ｄ】

【図３Ｅ】

【図３Ｆ】

【図３Ｇ】

【図３Ｈ】

【図３Ｉ】

【図３Ｊ】

【図３Ｋ】

【図３Ｌ】

【図４】

【図５Ａ】

【図５Ｂ】

【図５Ｃ】

【図６Ａ】

【図６Ｂ】

【図６Ｃ】

【図７Ａ】

【図７Ｂ】

【図７Ｃ】

【図８Ａ】

【図８Ｂ】

【図８Ｃ】

【図９Ａ】

【図９Ｂ】

【図９Ｃ】

【図１０】

【図１１Ａ】

【図１１Ｂ−１】

【図１１Ｂ−２】

【図１２Ａ−１】

【図１２Ａ−２】

【図１２Ａ−３】

【図１２Ｂ−１】

【図１２Ｂ−２】

【図１２Ｂ−３】

【図１３Ａ】

【図１３Ｂ】

【図１３Ｃ】

【図１３Ｄ】

【図１３Ｅ】

【図１３Ｆ】

【図１３Ｇ】

【図１３Ｈ】

【図１３Ｉ】

【図１３Ｊ】

【図１３Ｋ】

【図１３Ｌ】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１５Ａ】

【図１５Ｂ】

【公表番号】特表２００７−５２５１９６（Ｐ２００７−５２５１９６Ａ）
【公表日】平成１９年９月６日（２００７．９．６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５１５０５６（Ｐ２００６−５１５０５６）
【出願日】平成１６年５月２８日（２００４．５．２８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１７２３１
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１４７８０
【国際公開日】平成１７年２月１７日（２００５．２．１７）
【出願人】（５０１３９８０６４）アジェンシス，　インコーポレイテッド (13)
【Ｆターム（参考）】