結合ポリペプチド及びその使用
本発明は、ＤＲ５及びＨＥＲ-２に対する抗体又はその抗原結合断片を提供する。抗体及び／又はその抗原結合断片は、非常に制限されたアミノ酸配列多様性を含む変異体ＣＤＲを含んでなる。また、本発明は、ファージやウイルスコートタンパク質の少なくとも一部、タグ及びリンカーといった異種性のポリペプチドへの融合ポリペプチドとしてこれらのポリペプチドを提供する。さらに、癌及び免疫関連の症状の治療のための組成物及び使用方法が提供される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＳ及びＹから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２)を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ（配列番号：２３)を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このときＸ１がＲ、Ｙ及びＭから選択され、Ｘ２がＹ及びＲから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ、Ｒ、Ｐ及びＧから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ、Ｓ、Ｒ及びＨから選択され、Ｘ６がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ７がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ８がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ９がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１０がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１１がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１２がＳ、Ｙ、Ｒ、Ｇ及びＡから選択され、Ｘ１３がＧ及びＹから選択され、Ｘ１４がＬ、Ｍ、Ｒ、Ｇ及びＡから選択され、そして、Ｘ１５がＧ、Ｆ及びＬから選択されるかないしは存在せず、そして、Ｘ１６がＦであるかないしは存在しない、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｄ−Ｙ（配列番号：３１）を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２)を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ（配列番号：２３)を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ、及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ （配列番号：２４）を含む、ポリペプチド。
【請求項３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ、及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２６）を含む、ポリペプチド。
【請求項４】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧは位置２６であり、Ｘ１は位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２７）を含む、ポリペプチド。
【請求項５】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択されされるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２８）を含む、ポリペプチド。
【請求項６】
ＣＤＲＨ１が配列番号：５２４−５４０及び１８９−２９４のいずれか一から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項７】
ＣＤＲＨ２が配列番号：５４１−５５７及び２９５−４００から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項８】
ＣＤＲＨ３が配列番号：５５８−５７４及び４０１−５０６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項９】
ＣＤＲＨ３において、Ｘ１のアミノ酸位が位置９５であって、Ｒ及びＹから選択され、Ｘ３が位置９７にあって、Ｓであり、Ｘ８がアミノ酸位１００ｂであって、Ｓであり、Ｘ９がアミノ酸位１００ｃであって、Ｙであり、そして、Ｘ１０がアミノ酸位１００ｄにあって、Ｙ又はＲである、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
ＣＤＲＨ３がアミノ酸配列Ｘ１−Ｒ−Ｓ−Ｙ−Ｒ−Ｙ−Ｇ−Ｓ−Ｙ−Ｘ１０−Ｇ−Ｓ−Ｙ−Ｘ１４−Ｆ−Ｄ−Ｙ（配列番号：５７５）を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
ポリペプチドがヒトのＤＲ５に結合する、請求項１から１０のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
ポリペプチドが抗体である、請求項１１に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYISSSSIH(配列番号：５７６)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGSTYYADSVKG(配列番号：５７７)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列YRSYRYGSYYGSYGFDY(配列番号：５７８)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYIYSSSIH(配列番号：５７９)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGYTSYADSVKG(配列番号：５８０)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列RRSYRYGSYRGSYAFDY(配列番号：５８１)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
ヒト及びマウスのＤＲ５に結合する、請求項１から１４のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
さらに、(i) ＣＤＲＬ３が、Ｘ１が位置９１にあって、Ｙ、Ｈ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ及びＴから選択され、Ｘ４がＹ、Ｓ及びＴから選択され、そして、Ｘ５がＳ、Ｐ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、軽鎖可変ドメインを含んでなる、請求項１から１５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
さらに、アミノ酸配列RASQDVNTAVA(配列番号：２９)を含むＣＤＲＬ１を含んでなる、請求項１６に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
さらに、アミノ酸配列SASSLYS(配列番号：３０)を含むＣＤＲＬ２を含んでなる、請求項１６に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置２８であり、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあり、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、Ｘ５がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ６がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９５にあって、Ｙ及びＲから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ３がＳ、Ｇ、Ｙ及びＨから選択され、Ｘ４がＳ、Ｇ、Ｙ及びＲから選択され、Ｘ５がＧ及びＡから選択され、Ｘ６がＦ、Ｍ、Ｌ及びＡから選択され、そして、Ｘ７がＦ、Ｍ及びＬから選択されるかないしは欠失している、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｄ−Ｙ（配列番号：５８２）を含む、ポリペプチド。
【請求項２０】
ＣＤＲＨ１が配列番号：１８９−１９８から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
ＣＤＲＨ２が配列番号：２９５−３０４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２２】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４０１−４１０から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置２８にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミ ノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２２）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位９５にあって、Ｙ、Ｓ及びＧから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ、Ｇ、Ｒ、Ａ及びＭから選択され、Ｘ３がＧ、Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ４がＧ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ５がＹ、Ｓ、Ｎ及びＧから選択され、Ｘ６がＹ、Ｒ、Ｈ及びＷから選択され、Ｘ７がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ８がＦ、Ｍ、Ｌ及びＩから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｄ−Ｙ（配列番号：５８３）を含む、ポリペプチド。
【請求項２４】
ＣＤＲＨ１が配列番号：１９９−２１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
ＣＤＲＨ２が配列番号：３０５−３２２から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４１１−４２８から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１は位置２８にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、Ｘ１がアミノ酸位９５であって、Ｙ、Ｓ、Ｒ、Ｇ及びＥから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ、Ｒ及びＧから選択され、Ｘ３がＳ、Ｙ、Ｇ及びＷから選択され、Ｘ４がＳ、Ｙ、Ｇ及びＱから選択され、Ｘ５がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ６がＧ、Ｙ、Ｓ、Ｒ及びＶから選択され、Ｘ７がＳ、Ｙ、Ｇ及びＲから選択され、Ｘ８がＹ、Ｓ、Ｇ、Ｒ、Ｐ及びＶから選択され、Ｘ９がＧ、Ａ，Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ１０がＭ、Ｆ、Ｇ、Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ１１がＡ、Ｙ、Ｓ、Ｇ及びＲから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１２がＩ、Ｍ、Ｆ、Ｌ、Ａ、Ｇ、Ｓ、Ｙ、Ｒ及びＴから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１３がＦ、Ｍ、Ｌ、Ｇ、Ａ、Ｙ、Ｔ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１４がＬ、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｇ、Ｙ、Ａ及びＴから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１５がＭ、Ｌ、Ｙ、Ｇ及びＲから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１６がＹ及びＧから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１７がＲ、Ｍ及びＧから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＰ及びＡから選択されるかないしは存在せず、そして、Ｘ１８がＬであるかないしは存在しない、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ （配列番号：５８４）を含む、ポリペプチド。
【請求項２８】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１−Ｘ５がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ６が位置５０であり、このときＸ６−Ｘ１１がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｘ６−Ｉ−Ｘ７−Ｐ−Ｘ８−Ｘ９−Ｇ−Ｘ１０−Ｔ−Ｘ１１−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１２が位置９５であって、このときｎが重鎖可変ドメインの機能的活性を保持しうる適切な数であり、Ｘ１２−Ｘ１９がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−（Ｘ１７）ｎ−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、ポリペプチド。
【請求項２９】
ｎが１〜１２である、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
Ｘ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３１】
Ｘ６がＹ及びＳから選択され、Ｘ７がＹ及びＳから選択され、Ｘ８がＹ及びＳから選択され、Ｘ９がＹ及びＳから選択され、Ｘ１０がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ１１がＹ及びＳから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３３】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３４】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％私、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ、そして、１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
ＣＤＲＨ１が配列番号：２１７−２９４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３７】
ＣＤＲＨ２が配列番号：３２３−４００から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３８】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４２９−５０６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、位置Ｘ１−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ａ、Ｃ、Ｆ、Ｇ、Ｉ、Ｌ、Ｎ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｗ又はＹのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含む、ポリペプチド。
【請求項４０】
ＣＤＲＨ１が配列番号：８１６−８４２から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４１】
ＣＤＲＨ２が配列番号：８４３−８６９から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
ＣＤＲＨ３が配列番号：８７０−８９６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、このとき位置Ｘ１−Ｘ１９のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含む、ポリペプチド。
【請求項４４】
ＣＤＲＨ１が配列番号：９２４−９５０から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４５】
ＣＤＲＨ２が配列番号：９５１−９７７から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４６】
ＣＤＲＨ３が配列番号：９７８−１００４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４７】
ポリペプチドがヒトのＨＥＲ-２を結合する、請求項２から８又は１６から４６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項４８】
ポリペプチドが抗体である、請求項４７に記載のポリペプチド。
【請求項４９】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSIYSSYIH(配列番号：８２１)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SIYPYSGYTSYADSVKG(配列番号：８４８)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列WWSSAFDY(配列番号：８７５)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５０】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSIWWSWIH(配列番号：９３２)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGWTSYADSVKG(配列番号：９５９)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列WWSSAMDY(配列番号：９８６)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５１】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSISSSYIH(配列番号：９４４)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SIYPYSGYTSYADSVKG(配列番号：９７１)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列YYSYALDY(配列番号：９９８)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５２】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYISnSSSIH(配列番号：２３０)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列YIYPSSGYTSYADSVKG(配列番号：３３６)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列GYYYSYYSGYALDY(配列番号：４４２)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５３】
さらに、軽鎖可変ドメインを含んでなり、i) ＣＤＲＬ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９１にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ３がＹから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、請求項１９から５２のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項５４】
ＣＤＲＬ３配列を含む免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、このときＣＤＲＬ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９１にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ及びＦから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、ポリペプチド。
【請求項５５】
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、このときＣＤＲＬ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含む、ポリペプチド。
【請求項５６】
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＬ１は、対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含み、
(ii) ＣＤＲＬ２は、対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含み、そして、
(iii) ＣＤＲＬ３は、Ｘ１−Ｘ６がシステイン以外の天然に生じる任意のアミノ酸であり、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１である、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−（Ｘ４）ｎ−Ｘ５−Ｘ６−Ｔを含む、ポリペプチド。
【請求項５７】
カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＰ及びＬから選択され、そして、Ｘ６がＦ、Ｌ、Ｉ及びＶから選択される、請求項５６に記載のポリペプチド。
【請求項５８】
ｎが１〜３である、請求項５６に記載のポリペプチド。
【請求項５９】
ＣＤＲＬ３が配列番号：８３−１８８、７８９−８１５及び８９７−９２３から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項５４から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６０】
さらに、アミノ酸配列RASQDVNTAVA(配列番号：２９)を含むＣＤＲＬ１を含んでなる、請求項５４から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６１】
さらに、アミノ酸配列SASSLYS(配列番号：３０)を含むＣＤＲＬ２を含んでなる、請求項５４から５８及び５５及び５６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６２】
請求項１から５３のずれか一に記載の免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含むポリペプチドと、請求項５４から６１のいずれか一に記載の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含むポリペプチドとを含んでなる抗体。
【請求項６３】
少なくとも２の抗体可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(a) 請求項１から５３のいずれかに記載のポリペプチドを含む重鎖抗体可変ドメインと、
(b) 請求項５４から６１のいずれかに記載のポリペプチドを含む軽鎖抗体可変ドメインとを含んでなる、ポリペプチド。
【請求項６４】
単鎖Ｆｖである、請求項１から６３のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６５】
Ｆａｂポリペプチドである、請求項１から６３のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６６】
完全なヒトのポリペプチドである、請求項１から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６７】
さらに、変異体ＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３及び／又はＣＤＲＬ３に対応するポリペプチド可変ドメインについてフレームワーク領域ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３及び／又はＦＲ４を含んでなり、該フレームワーク領域が単一ポリペプチド鋳型から得られる、請求項１から６６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６８】
各々のフレームワーク領域がポリペプチド４Ｄ５のフレームワーク領域アミノ酸配列(配列番号：１及び２)に対応するアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載のポリペプチド。
【請求項６９】
抗体が変異体４Ｄ５抗体フレームワーク領域のアミノ酸配列(配列番号：１４−１７及び１８−２１)に対応するフレームワーク領域を含む請求項６７に記載のポリペプチド。
【請求項７０】
さらに、重鎖ポリペプチド可変ドメインのＣ末端領域に連結される二量体化ドメインを含んでなる、請求項１から６９のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項７１】
二量体化ドメインがロイシンジッパードメイン又は少なくとも１のシステイン残基を含む配列を含んでなる、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７２】
二量体化ドメインがポリペプチドのヒンジ領域及びロイシンジッパーを含んでなる、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７３】
二量体化ドメインが単一のシステインである、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７４】
ポリペプチド可変ドメインがウイルスコートタンパク質の少なくとも一部に融合される、請求項１から７３のいずれか一に記載のポリペプチドを含んでなる融合ポリペプチド。
【請求項７５】
ウイルスコートタンパク質が、タンパク質ｐIII、主要なコートタンパク質ｐVIII、Ｓｏｃ、Ｈｏｃ、ｇｐＤ、ｐｖ１及びその変異体からなる群から選択される、請求項７４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７６】
さらに、可変ドメインとウイルスコートタンパク質との間に二量体化ドメインを含む、請求項７５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７７】
さらに、ペプチドタグを含んでなる、請求項７４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７８】
ペプチドタグがｇＤ、ｃ-ｍｙｃ、ポリ-ｈｉｓ、蛍光タンパク質及びＢ−ガラクトシダーゼからなる群から選択される、請求項７７に記載の融合タンパク質。
【請求項７９】
請求項１から７８のいずれか一に記載のポリペプチドと担体を含んでなる組成物。
【請求項８０】
請求項１から７８のいずれか一に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項８１】
請求項８０のポリヌクレオチドを含んでなるベクター。
【請求項８２】
請求項８１に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項８３】
ポリペプチドの産生に適切な条件下で請求項８２の宿主細胞を培養して、ポリペプチド又はその抗原結合断片を回収することを含んでなる、ポリペプチドの産生方法。
【請求項８４】
少なくとも１×１０４の異なる抗体可変ドメイン配列を有する、請求項１から７８のいずれか一に記載の複数のポリペプチドを含んでなるライブラリ。
【請求項８５】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、位置Ｘ１−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ａ、Ｃ、Ｆ、Ｇ、Ｉ、Ｌ、Ｎ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｗ又はＹのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含むＣＤＲＨ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項８６】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、そして、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、このとき位置Ｘ１−Ｘ１９のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項８７】
さらに、
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ６がＹ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ７がＰ及びＬから選択され、Ｘ８がＦ、Ｌ、Ｉ及びＶから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｔを含むＣＤＲＬ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項８８】
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項８９】
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳとＹ、Ｗ、Ｒ及びＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項９０】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＳ及びＹから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ、及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９１】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９２】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧは位置２６であり、Ｘ１は位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含むＣＤＲＨ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９３】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択されされるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含むＣＤＲＨ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９４】
さらに、
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項９０から９３のいずれか一に記載の方法。
【請求項９５】
第一コンセンサス高頻度可変配列がカバットコンセンサスＣＤＲＬ１配列を含む、請求項８７から８９及び９４のいずれか一に記載の方法。
【請求項９６】
第一コンセンサス高頻度可変配列がＲ−Ａ−Ｓ−Ｑ−Ｄ−Ｖ−Ｎ−Ｔ−Ａ−Ｖ−Ａ （配列番号：２９）である、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
第二コンセンサス高頻度可変配列がカバットコンセンサスＣＤＲＬ２配列を含む、請求項８７から８９及び９４のいずれか一に記載の方法。
【請求項９８】
第二コンセンサス高頻度可変配列がＳ−Ａ−Ｓ−Ｓ−Ｌ−Ｙ−Ｓ(配列番号：３０)である、請求項９７に記載の方法。
【請求項９９】
複数のポリペプチドが複数のポリヌクレオチドによってコードされる、請求項８５から９８のいずれか一に記載の方法。
【請求項１００】
抗体可変ドメインのライブラリの標的抗原に結合する抗原結合可変ドメインを選別する方法であって、
(a) 請求項８４に記載のライブラリを標的抗原と接触させ、
(b) 標的抗原に特異的に結合しないポリペプチドから標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを分離し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、そして、およそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの濃度の減少した量の標的抗原を含む一連の溶液中で標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドをインキュベートし、そして、
(c) 最も低い濃度の標的抗原に結合することができる、又はおよそ０．１ｎＭ〜およそ２００ｎＭの親和性を有する、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを選別する、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０１】
標的抗原がＨＥＲ２又はＤＲ５である、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０２】
標的抗原の濃度がおよそ１００〜およそ２５０ｎＭである、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０３】
標的抗原の濃度がおよそ２５〜およそ１００ｎＭである、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０４】
ポリペプチドのライブラリから標的抗原に結合するポリペプチドを選別する方法であって、
(a) 請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを複数含むライブラリに固定した標的抗原を結合に適した条件下で接触させることによって標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離し、
(b) 標的抗原に特異的に結合しないポリペプチドから標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを分離し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を得て、そして、
(c) 場合によって、前の選別ラウンドから得られた標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を用いて(a)−(b)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０５】
さらに、
(d) 結合に適した条件下で、混合物を形成するためにおよそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの範囲の標識した標的抗原の濃縮物とともにサブ集団をインキュベートし、
(e) 標的抗原上の標識に結合する固定した作用剤を該混合物に接触させ；
(f) 標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを検出して、標識した標的抗原から標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、そして、
(g) 場合によって、前の選別ラウンドから得られた標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団と、以前の選別ラウンドよりも低い濃度の標識した標的抗原を用いて(d)−(f)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０６】
さらに、過剰量の非標識標的抗原を混合物に加え、十分な時間該混合物をインキュベートして、親和性の低い標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収することを含んでなる、請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
親和性の高い標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離する方法であって、
(a) 請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを複数含むライブラリに少なくともおよそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの濃度の標的抗原を接触させて、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離し、
(b) 標的抗原から標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を得て、そして、
(c) 場合によって、前の選別ラウンドから得られたサブ集団と、最も低い濃度の標的抗原で標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離するために以前のラウンドで用いた標的抗原の低い濃度を用いて(a)及び(b)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０８】
請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを哺乳動物に投与することを含んでなる、哺乳動物の癌の治療方法。
【請求項１０９】
癌が、乳癌、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、非ホジキンリンパ腫(ＮＨＬ)、腎癌、前立腺癌、肝臓癌、頭頸部癌、メラノーマ、卵巣癌、中皮腫、及び多発性骨髄腫から選択される、請求項１０８に記載の方法。
【請求項１１０】
抗体が抗ＨＥＲ２抗体である、請求項１０８又は１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
抗体が抗ＤＲ５抗体である、請求項１０８又は１０９に記載の方法。
【請求項１１２】
さらに、治療が抗体とともに第二の治療薬を同時ないしは順次投与する工程を含んでなる、請求項１０８から１１１のいずれか一に記載の方法。
【請求項１１３】
第二治療薬が、抗血管新生薬、抗新生物薬、化学療法薬及び細胞障害性薬から選択される、請求項１１２に記載の方法。
【請求項１１４】
抗血管新生薬が抗ｈＶＥＧＦ抗体である、請求項１１３に記載の方法。
【請求項１１５】
請求項１から１７のいずれか一に記載の抗体によって哺乳動物を治療する工程を含んでなる、炎症性又は免疫性の疾患に罹患しているか又は該疾患を発達させるリスクにある哺乳動物の治療方法。
【請求項１１６】
炎症性又は免疫性の疾患が関節リウマチである、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１７】
抗体が抗ＤＲ５抗体である、請求項１１５又は１１６に記載の方法。
【請求項１】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＳ及びＹから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２)を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ（配列番号：２３)を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このときＸ１がＲ、Ｙ及びＭから選択され、Ｘ２がＹ及びＲから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ、Ｒ、Ｐ及びＧから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ、Ｓ、Ｒ及びＨから選択され、Ｘ６がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ７がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ８がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ９がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１０がＲ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１１がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ１２がＳ、Ｙ、Ｒ、Ｇ及びＡから選択され、Ｘ１３がＧ及びＹから選択され、Ｘ１４がＬ、Ｍ、Ｒ、Ｇ及びＡから選択され、そして、Ｘ１５がＧ、Ｆ及びＬから選択されるかないしは存在せず、そして、Ｘ１６がＦであるかないしは存在しない、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｄ−Ｙ（配列番号：３１）を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２)を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ（配列番号：２３)を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ、及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ （配列番号：２４）を含む、ポリペプチド。
【請求項３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ、及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２６）を含む、ポリペプチド。
【請求項４】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧは位置２６であり、Ｘ１は位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２７）を含む、ポリペプチド。
【請求項５】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択されされるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ（配列番号：２８）を含む、ポリペプチド。
【請求項６】
ＣＤＲＨ１が配列番号：５２４−５４０及び１８９−２９４のいずれか一から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項７】
ＣＤＲＨ２が配列番号：５４１−５５７及び２９５−４００から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項８】
ＣＤＲＨ３が配列番号：５５８−５７４及び４０１−５０６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１から５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項９】
ＣＤＲＨ３において、Ｘ１のアミノ酸位が位置９５であって、Ｒ及びＹから選択され、Ｘ３が位置９７にあって、Ｓであり、Ｘ８がアミノ酸位１００ｂであって、Ｓであり、Ｘ９がアミノ酸位１００ｃであって、Ｙであり、そして、Ｘ１０がアミノ酸位１００ｄにあって、Ｙ又はＲである、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
ＣＤＲＨ３がアミノ酸配列Ｘ１−Ｒ−Ｓ−Ｙ−Ｒ−Ｙ−Ｇ−Ｓ−Ｙ−Ｘ１０−Ｇ−Ｓ−Ｙ−Ｘ１４−Ｆ−Ｄ−Ｙ（配列番号：５７５）を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
ポリペプチドがヒトのＤＲ５に結合する、請求項１から１０のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
ポリペプチドが抗体である、請求項１１に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYISSSSIH(配列番号：５７６)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGSTYYADSVKG(配列番号：５７７)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列YRSYRYGSYYGSYGFDY(配列番号：５７８)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYIYSSSIH(配列番号：５７９)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGYTSYADSVKG(配列番号：５８０)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列RRSYRYGSYRGSYAFDY(配列番号：５８１)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
ヒト及びマウスのＤＲ５に結合する、請求項１から１４のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
さらに、(i) ＣＤＲＬ３が、Ｘ１が位置９１にあって、Ｙ、Ｈ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ及びＴから選択され、Ｘ４がＹ、Ｓ及びＴから選択され、そして、Ｘ５がＳ、Ｐ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、軽鎖可変ドメインを含んでなる、請求項１から１５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
さらに、アミノ酸配列RASQDVNTAVA(配列番号：２９)を含むＣＤＲＬ１を含んでなる、請求項１６に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
さらに、アミノ酸配列SASSLYS(配列番号：３０)を含むＣＤＲＬ２を含んでなる、請求項１６に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置２８であり、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあり、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、Ｘ５がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ６がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９５にあって、Ｙ及びＲから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ３がＳ、Ｇ、Ｙ及びＨから選択され、Ｘ４がＳ、Ｇ、Ｙ及びＲから選択され、Ｘ５がＧ及びＡから選択され、Ｘ６がＦ、Ｍ、Ｌ及びＡから選択され、そして、Ｘ７がＦ、Ｍ及びＬから選択されるかないしは欠失している、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｄ−Ｙ（配列番号：５８２）を含む、ポリペプチド。
【請求項２０】
ＣＤＲＨ１が配列番号：１８９−１９８から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
ＣＤＲＨ２が配列番号：２９５−３０４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２２】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４０１−４１０から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１９に記載のポリペプチド。
【請求項２３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置２８にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミ ノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２２）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位９５にあって、Ｙ、Ｓ及びＧから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ、Ｇ、Ｒ、Ａ及びＭから選択され、Ｘ３がＧ、Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ４がＧ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ５がＹ、Ｓ、Ｎ及びＧから選択され、Ｘ６がＹ、Ｒ、Ｈ及びＷから選択され、Ｘ７がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ８がＦ、Ｍ、Ｌ及びＩから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｄ−Ｙ（配列番号：５８３）を含む、ポリペプチド。
【請求項２４】
ＣＤＲＨ１が配列番号：１９９−２１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
ＣＤＲＨ２が配列番号：３０５−３２２から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４１１−４２８から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２３に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けに従ってＸ１は位置２８にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈ（配列番号：２２）を含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けに従ってＸ１がアミノ酸位５０にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ及びＹから選択され、Ｘ３がＳ及びＹから選択され、Ｘ４がＳ及びＹから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇ （配列番号：２３）を含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、Ｘ１がアミノ酸位９５であって、Ｙ、Ｓ、Ｒ、Ｇ及びＥから選択され、Ｘ２がＹ、Ｓ、Ｒ及びＧから選択され、Ｘ３がＳ、Ｙ、Ｇ及びＷから選択され、Ｘ４がＳ、Ｙ、Ｇ及びＱから選択され、Ｘ５がＧ、Ｙ及びＳから選択され、Ｘ６がＧ、Ｙ、Ｓ、Ｒ及びＶから選択され、Ｘ７がＳ、Ｙ、Ｇ及びＲから選択され、Ｘ８がＹ、Ｓ、Ｇ、Ｒ、Ｐ及びＶから選択され、Ｘ９がＧ、Ａ，Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ１０がＭ、Ｆ、Ｇ、Ｙ、Ｓ及びＲから選択され、Ｘ１１がＡ、Ｙ、Ｓ、Ｇ及びＲから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１２がＩ、Ｍ、Ｆ、Ｌ、Ａ、Ｇ、Ｓ、Ｙ、Ｒ及びＴから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１３がＦ、Ｍ、Ｌ、Ｇ、Ａ、Ｙ、Ｔ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１４がＬ、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｇ、Ｙ、Ａ及びＴから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１５がＭ、Ｌ、Ｙ、Ｇ及びＲから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１６がＹ及びＧから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１７がＲ、Ｍ及びＧから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＰ及びＡから選択されるかないしは存在せず、そして、Ｘ１８がＬであるかないしは存在しない、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙ （配列番号：５８４）を含む、ポリペプチド。
【請求項２８】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１−Ｘ５がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ６が位置５０であり、このときＸ６−Ｘ１１がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｘ６−Ｉ−Ｘ７−Ｐ−Ｘ８−Ｘ９−Ｇ−Ｘ１０−Ｔ−Ｘ１１−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１２が位置９５であって、このときｎが重鎖可変ドメインの機能的活性を保持しうる適切な数であり、Ｘ１２−Ｘ１９がシステイン以外の天然に生じるアミノ酸である、アミノ酸配列Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−（Ｘ１７）ｎ−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、ポリペプチド。
【請求項２９】
ｎが１〜１２である、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
Ｘ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３１】
Ｘ６がＹ及びＳから選択され、Ｘ７がＹ及びＳから選択され、Ｘ８がＹ及びＳから選択され、Ｘ９がＹ及びＳから選択され、Ｘ１０がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ１１がＹ及びＳから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３３】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３４】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
位置Ｘ１２−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％私、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ、そして、１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
ＣＤＲＨ１が配列番号：２１７−２９４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３７】
ＣＤＲＨ２が配列番号：３２３−４００から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３８】
ＣＤＲＨ３が配列番号：４２９−５０６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２７から３５のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、位置Ｘ１−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ａ、Ｃ、Ｆ、Ｇ、Ｉ、Ｌ、Ｎ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｗ又はＹのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含む、ポリペプチド。
【請求項４０】
ＣＤＲＨ１が配列番号：８１６−８４２から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４１】
ＣＤＲＨ２が配列番号：８４３−８６９から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
ＣＤＲＨ３が配列番号：８７０−８９６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３９に記載のポリペプチド。
【請求項４３】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、このとき位置Ｘ１−Ｘ１９のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含む、ポリペプチド。
【請求項４４】
ＣＤＲＨ１が配列番号：９２４−９５０から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４５】
ＣＤＲＨ２が配列番号：９５１−９７７から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４６】
ＣＤＲＨ３が配列番号：９７８−１００４から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項４３に記載のポリペプチド。
【請求項４７】
ポリペプチドがヒトのＨＥＲ-２を結合する、請求項２から８又は１６から４６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項４８】
ポリペプチドが抗体である、請求項４７に記載のポリペプチド。
【請求項４９】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSIYSSYIH(配列番号：８２１)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SIYPYSGYTSYADSVKG(配列番号：８４８)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列WWSSAFDY(配列番号：８７５)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５０】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSIWWSWIH(配列番号：９３２)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SISPSSGWTSYADSVKG(配列番号：９５９)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列WWSSAMDY(配列番号：９８６)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５１】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFSISSSYIH(配列番号：９４４)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列SIYPYSGYTSYADSVKG(配列番号：９７１)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列YYSYALDY(配列番号：９９８)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５２】
重鎖可変ドメインが、
i) アミノ酸配列GFYISnSSSIH(配列番号：２３０)を含むＣＤＲＨ１と、
ii) アミノ酸配列YIYPSSGYTSYADSVKG(配列番号：３３６)を含むＣＤＲＨ２と、
iii) アミノ酸配列GYYYSYYSGYALDY(配列番号：４４２)を含むＣＤＲＨ３とを含んでなる、請求項３９又は４０に記載のポリペプチド。
【請求項５３】
さらに、軽鎖可変ドメインを含んでなり、i) ＣＤＲＬ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９１にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ３がＹから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、請求項１９から５２のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項５４】
ＣＤＲＬ３配列を含む免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、このときＣＤＲＬ３は、カバット番号付けに従ってＸ１が位置９１にあって、Ｓ及びＹから選択され、Ｘ２がＳ、Ｙ及びＦから選択され、Ｘ３がＹ、Ｓ及びＦから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＳ及びＹから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔ （配列番号：２５）を含む、ポリペプチド。
【請求項５５】
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、このときＣＤＲＬ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含む、ポリペプチド。
【請求項５６】
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(i) ＣＤＲＬ１は、対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含み、
(ii) ＣＤＲＬ２は、対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含み、そして、
(iii) ＣＤＲＬ３は、Ｘ１−Ｘ６がシステイン以外の天然に生じる任意のアミノ酸であり、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１である、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−（Ｘ４）ｎ−Ｘ５−Ｘ６−Ｔを含む、ポリペプチド。
【請求項５７】
カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＰ及びＬから選択され、そして、Ｘ６がＦ、Ｌ、Ｉ及びＶから選択される、請求項５６に記載のポリペプチド。
【請求項５８】
ｎが１〜３である、請求項５６に記載のポリペプチド。
【請求項５９】
ＣＤＲＬ３が配列番号：８３−１８８、７８９−８１５及び８９７−９２３から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項５４から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６０】
さらに、アミノ酸配列RASQDVNTAVA(配列番号：２９)を含むＣＤＲＬ１を含んでなる、請求項５４から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６１】
さらに、アミノ酸配列SASSLYS(配列番号：３０)を含むＣＤＲＬ２を含んでなる、請求項５４から５８及び５５及び５６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６２】
請求項１から５３のずれか一に記載の免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含むポリペプチドと、請求項５４から６１のいずれか一に記載の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含むポリペプチドとを含んでなる抗体。
【請求項６３】
少なくとも２の抗体可変ドメインを含んでなるポリペプチドであって、
(a) 請求項１から５３のいずれかに記載のポリペプチドを含む重鎖抗体可変ドメインと、
(b) 請求項５４から６１のいずれかに記載のポリペプチドを含む軽鎖抗体可変ドメインとを含んでなる、ポリペプチド。
【請求項６４】
単鎖Ｆｖである、請求項１から６３のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６５】
Ｆａｂポリペプチドである、請求項１から６３のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６６】
完全なヒトのポリペプチドである、請求項１から５８のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６７】
さらに、変異体ＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３及び／又はＣＤＲＬ３に対応するポリペプチド可変ドメインについてフレームワーク領域ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３及び／又はＦＲ４を含んでなり、該フレームワーク領域が単一ポリペプチド鋳型から得られる、請求項１から６６のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項６８】
各々のフレームワーク領域がポリペプチド４Ｄ５のフレームワーク領域アミノ酸配列(配列番号：１及び２)に対応するアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載のポリペプチド。
【請求項６９】
抗体が変異体４Ｄ５抗体フレームワーク領域のアミノ酸配列(配列番号：１４−１７及び１８−２１)に対応するフレームワーク領域を含む請求項６７に記載のポリペプチド。
【請求項７０】
さらに、重鎖ポリペプチド可変ドメインのＣ末端領域に連結される二量体化ドメインを含んでなる、請求項１から６９のいずれか一に記載のポリペプチド。
【請求項７１】
二量体化ドメインがロイシンジッパードメイン又は少なくとも１のシステイン残基を含む配列を含んでなる、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７２】
二量体化ドメインがポリペプチドのヒンジ領域及びロイシンジッパーを含んでなる、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７３】
二量体化ドメインが単一のシステインである、請求項７０に記載のポリペプチド。
【請求項７４】
ポリペプチド可変ドメインがウイルスコートタンパク質の少なくとも一部に融合される、請求項１から７３のいずれか一に記載のポリペプチドを含んでなる融合ポリペプチド。
【請求項７５】
ウイルスコートタンパク質が、タンパク質ｐIII、主要なコートタンパク質ｐVIII、Ｓｏｃ、Ｈｏｃ、ｇｐＤ、ｐｖ１及びその変異体からなる群から選択される、請求項７４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７６】
さらに、可変ドメインとウイルスコートタンパク質との間に二量体化ドメインを含む、請求項７５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７７】
さらに、ペプチドタグを含んでなる、請求項７４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７８】
ペプチドタグがｇＤ、ｃ-ｍｙｃ、ポリ-ｈｉｓ、蛍光タンパク質及びＢ−ガラクトシダーゼからなる群から選択される、請求項７７に記載の融合タンパク質。
【請求項７９】
請求項１から７８のいずれか一に記載のポリペプチドと担体を含んでなる組成物。
【請求項８０】
請求項１から７８のいずれか一に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項８１】
請求項８０のポリヌクレオチドを含んでなるベクター。
【請求項８２】
請求項８１に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項８３】
ポリペプチドの産生に適切な条件下で請求項８２の宿主細胞を培養して、ポリペプチド又はその抗原結合断片を回収することを含んでなる、ポリペプチドの産生方法。
【請求項８４】
少なくとも１×１０４の異なる抗体可変ドメイン配列を有する、請求項１から７８のいずれか一に記載の複数のポリペプチドを含んでなるライブラリ。
【請求項８５】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、位置Ｘ１−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ａ、Ｃ、Ｆ、Ｇ、Ｉ、Ｌ、Ｎ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｗ又はＹのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含むＣＤＲＨ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項８６】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、そして、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であって、このとき位置Ｘ１−Ｘ１９のそれぞれのアミノ酸がＳ及び、Ｙ、Ｗ、Ｒ又はＦのいずれか一から選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＦ、Ｌ、Ｉ及びＭから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９を含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項８７】
さらに、
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ６がＹ及びＳから選択されるかないしは存在せず、Ｘ７がＰ及びＬから選択され、Ｘ８がＦ、Ｌ、Ｉ及びＶから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｔを含むＣＤＲＬ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項８８】
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３、とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項８９】
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、位置Ｘ１−Ｘ５のそれぞれのアミノ酸がＳとＹ、Ｗ、Ｒ及びＦのいずれか一から選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項８５又は８６に記載の方法。
【請求項９０】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＳ及びＹから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ、及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が５０％ Ｙ、２５％ Ｓ及び２５％ Ｇのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９１】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) ＣＤＲＨ１は、カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含み、
(ii) ＣＤＲＨ２は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含み、
(iii) ＣＤＲＨ３は、カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２５％ Ｙ、５０％ Ｓ及び２５％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、このときＸ１８がＧ及びＡから選択され、そして、Ｘ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含む、複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９２】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧは位置２６であり、Ｘ１は位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そしてＸ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が３８％ Ｙ、２５％ Ｓ、２５％ Ｇ及び１２％ Ｒのモル比のアミノ酸のプールから選択されるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含むＣＤＲＨ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９３】
複数のポリペプチドを含んでなる組成物の生成方法であって、
(a) (i) カバット番号付けシステムに従ってＧが位置２６であり、Ｘ１が位置２８であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｇ−Ｆ−Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｉ−Ｈを含むＣＤＲＨ１と、
(ii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置５０であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、Ｘ５がＹ及びＳから選択され、そして、Ｘ６がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｐ−Ｘ３−Ｘ４−Ｇ−Ｘ５−Ｔ−Ｘ６−Ｙ−Ａ−Ｄ−Ｓ−Ｖ−Ｋ−Ｇを含むＣＤＲＨ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９５であり、このとき位置Ｘ１−Ｘ６のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択され、位置Ｘ７−Ｘ１７のそれぞれのアミノ酸が２０％ Ｙ、２６％ Ｓ、２６％ Ｇ、１３％ Ｒ、１％ Ａ、１％ Ｄ、１％ Ｅ、１％ Ｆ、１％ Ｈ、１％ Ｉ、１％ Ｋ、１％ Ｌ、１％ Ｍ、１％ Ｎ、１％ Ｐ、１％ Ｑ、１％ Ｔ、１％ Ｖ及び１％ Ｗのモル比のアミノ酸のプールから選択されされるかないしは存在せず、Ｘ１８がＧ及びＡから選択され、そしてＸ１９がＩ、Ｍ、Ｌ及びＦから選択される、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２−Ｘ１３−Ｘ１４−Ｘ１５−Ｘ１６−Ｘ１７−Ｘ１８−Ｘ１９−Ｄ−Ｙを含むＣＤＲＨ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる方法。
【請求項９４】
さらに、
(b) (i) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第一コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ１と、
(ii) 対応するコンセンサス高頻度可変配列と比較して一又は複数の位置に置換を含む第二コンセンサス高頻度可変配列ないしはその変異体を含むＣＤＲＬ２と、
(iii) カバット番号付けシステムに従ってＸ１が位置９１であり、このときＸ１がＹ及びＳから選択され、Ｘ２がＹ及びＳから選択され、Ｘ３がＹ及びＳから選択され、Ｘ４がＹ及びＳから選択され、そしてＸ５がＹ及びＳから選択される、アミノ酸配列Ｑ−Ｑ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｐ−Ｘ５−Ｔを含むＣＤＲＬ３とを含んでなる複数のポリペプチドを生成することを含んでなる、請求項９０から９３のいずれか一に記載の方法。
【請求項９５】
第一コンセンサス高頻度可変配列がカバットコンセンサスＣＤＲＬ１配列を含む、請求項８７から８９及び９４のいずれか一に記載の方法。
【請求項９６】
第一コンセンサス高頻度可変配列がＲ−Ａ−Ｓ−Ｑ−Ｄ−Ｖ−Ｎ−Ｔ−Ａ−Ｖ−Ａ （配列番号：２９）である、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
第二コンセンサス高頻度可変配列がカバットコンセンサスＣＤＲＬ２配列を含む、請求項８７から８９及び９４のいずれか一に記載の方法。
【請求項９８】
第二コンセンサス高頻度可変配列がＳ−Ａ−Ｓ−Ｓ−Ｌ−Ｙ−Ｓ(配列番号：３０)である、請求項９７に記載の方法。
【請求項９９】
複数のポリペプチドが複数のポリヌクレオチドによってコードされる、請求項８５から９８のいずれか一に記載の方法。
【請求項１００】
抗体可変ドメインのライブラリの標的抗原に結合する抗原結合可変ドメインを選別する方法であって、
(a) 請求項８４に記載のライブラリを標的抗原と接触させ、
(b) 標的抗原に特異的に結合しないポリペプチドから標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを分離し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、そして、およそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの濃度の減少した量の標的抗原を含む一連の溶液中で標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドをインキュベートし、そして、
(c) 最も低い濃度の標的抗原に結合することができる、又はおよそ０．１ｎＭ〜およそ２００ｎＭの親和性を有する、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを選別する、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０１】
標的抗原がＨＥＲ２又はＤＲ５である、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０２】
標的抗原の濃度がおよそ１００〜およそ２５０ｎＭである、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０３】
標的抗原の濃度がおよそ２５〜およそ１００ｎＭである、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０４】
ポリペプチドのライブラリから標的抗原に結合するポリペプチドを選別する方法であって、
(a) 請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを複数含むライブラリに固定した標的抗原を結合に適した条件下で接触させることによって標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離し、
(b) 標的抗原に特異的に結合しないポリペプチドから標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを分離し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を得て、そして、
(c) 場合によって、前の選別ラウンドから得られた標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を用いて(a)−(b)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０５】
さらに、
(d) 結合に適した条件下で、混合物を形成するためにおよそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの範囲の標識した標的抗原の濃縮物とともにサブ集団をインキュベートし、
(e) 標的抗原上の標識に結合する固定した作用剤を該混合物に接触させ；
(f) 標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを検出して、標識した標的抗原から標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、そして、
(g) 場合によって、前の選別ラウンドから得られた標識した標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団と、以前の選別ラウンドよりも低い濃度の標識した標的抗原を用いて(d)−(f)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０６】
さらに、過剰量の非標識標的抗原を混合物に加え、十分な時間該混合物をインキュベートして、親和性の低い標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収することを含んでなる、請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
親和性の高い標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離する方法であって、
(a) 請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを複数含むライブラリに少なくともおよそ０．１ｎＭ〜およそ１０００ｎＭの濃度の標的抗原を接触させて、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離し、
(b) 標的抗原から標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを回収し、標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドについて濃縮されたサブ集団を得て、そして、
(c) 場合によって、前の選別ラウンドから得られたサブ集団と、最も低い濃度の標的抗原で標的抗原に特異的に結合する一又は複数のポリペプチドを単離するために以前のラウンドで用いた標的抗原の低い濃度を用いて(a)及び(b)の工程を少なくとも２度繰り返す、
ことを含んでなる方法。
【請求項１０８】
請求項１から７９のいずれか一に記載のポリペプチドを哺乳動物に投与することを含んでなる、哺乳動物の癌の治療方法。
【請求項１０９】
癌が、乳癌、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、非ホジキンリンパ腫(ＮＨＬ)、腎癌、前立腺癌、肝臓癌、頭頸部癌、メラノーマ、卵巣癌、中皮腫、及び多発性骨髄腫から選択される、請求項１０８に記載の方法。
【請求項１１０】
抗体が抗ＨＥＲ２抗体である、請求項１０８又は１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
抗体が抗ＤＲ５抗体である、請求項１０８又は１０９に記載の方法。
【請求項１１２】
さらに、治療が抗体とともに第二の治療薬を同時ないしは順次投与する工程を含んでなる、請求項１０８から１１１のいずれか一に記載の方法。
【請求項１１３】
第二治療薬が、抗血管新生薬、抗新生物薬、化学療法薬及び細胞障害性薬から選択される、請求項１１２に記載の方法。
【請求項１１４】
抗血管新生薬が抗ｈＶＥＧＦ抗体である、請求項１１３に記載の方法。
【請求項１１５】
請求項１から１７のいずれか一に記載の抗体によって哺乳動物を治療する工程を含んでなる、炎症性又は免疫性の疾患に罹患しているか又は該疾患を発達させるリスクにある哺乳動物の治療方法。
【請求項１１６】
炎症性又は免疫性の疾患が関節リウマチである、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１７】
抗体が抗ＤＲ５抗体である、請求項１１５又は１１６に記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９Ａ】
【図９Ｂ】
【図９Ｃ】
【図９Ｄ】
【図１０】
【図１１Ａ】
【図１１Ｂ】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図２０Ａ】
【図２０Ｂ】
【図２０Ｃ】
【図２０Ｄ】
【図２０Ｅ】
【図２０Ｆ】
【図２０Ｇ】
【図２０Ｈ】
【図２０Ｉ】
【図２０Ｊ】
【図２０Ｋ】
【図２０Ｌ】
【図２１Ａ】
【図２１Ｂ】
【図２２】
【図２３】
【図２４Ａ】
【図２４Ｂ】
【図２５】
【図２６Ａ】
【図２６Ｂ】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９Ａ】
【図９Ｂ】
【図９Ｃ】
【図９Ｄ】
【図１０】
【図１１Ａ】
【図１１Ｂ】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図２０Ａ】
【図２０Ｂ】
【図２０Ｃ】
【図２０Ｄ】
【図２０Ｅ】
【図２０Ｆ】
【図２０Ｇ】
【図２０Ｈ】
【図２０Ｉ】
【図２０Ｊ】
【図２０Ｋ】
【図２０Ｌ】
【図２１Ａ】
【図２１Ｂ】
【図２２】
【図２３】
【図２４Ａ】
【図２４Ｂ】
【図２５】
【図２６Ａ】
【図２６Ｂ】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【公表番号】特表２００９−５１８０１１（Ｐ２００９−５１８０１１Ａ）
【公表日】平成２１年５月７日（２００９．５．７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５４３４９９（Ｐ２００８−５４３４９９）
【出願日】平成１８年１２月１日（２００６．１２．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４６０４６
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０９４８４２
【国際公開日】平成１９年８月２３日（２００７．８．２３）
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年５月７日（２００９．５．７）
【国際特許分類】
【出願日】平成１８年１２月１日（２００６．１２．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４６０４６
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０９４８４２
【国際公開日】平成１９年８月２３日（２００７．８．２３）
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
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