説明

肺炎連鎖球菌抗原

本発明は、肺炎連鎖球菌由来の過免疫血清反応性抗原またはその断片をコードする核酸分子および過免疫血清反応性抗原またはその断片、かかる抗原の単離方法およびその特定の使用を開示する。


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【特許請求の範囲】
【請求項1】
以下からなる群から選択される核酸配列を含む過免疫血清反応性抗原またはその断片をコードする単離核酸分子:
a)配列番号 1、101-144から選択される核酸分子に対して少なくとも 70%の配列同一性を有する核酸分子、
b) a)の核酸分子に相補的な核酸分子、
c) a)またはb)の核酸分子の少なくとも15の連続する塩基を含む核酸分子、
d) a)、b)、またはc)の核酸分子とストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でアニールする核酸分子、
e)遺伝暗号の縮重がなければ、a)、b)、c)またはd)の核酸分子とハイブリダイズしうる核酸分子。
【請求項2】
配列同一性が少なくとも 80%、好ましくは少なくとも95%、特に100%である、請求項 1の単離核酸分子。
【請求項3】
以下からなる群から選択される核酸配列を含む過免疫血清反応性抗原またはその断片をコードする単離核酸分子:
a)配列番号 2-6、8、10-16、18-23、25-31、34、36、38-42、44、47-48、51、53、55-62、64、67、71-76、78-79、81-94、96-100から選択される核酸分子に対して少なくとも 96%の配列同一性を有する核酸分子、
b) a)の核酸分子に相補的な核酸分子、
c) a)またはb)の核酸分子の少なくとも15の連続する塩基を含む核酸分子、
d) a)、b)、またはc)の核酸分子とストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でアニールする核酸分子、
e)遺伝暗号の縮重がなければ、a)、b)、c) またはd)の核酸とハイブリダイズしうる核酸分子。
【請求項4】
以下からなる群から選択される核酸配列を含む単離核酸分子:
a) 配列番号 9、17、24、32、37、43、52、54、65-66、70、80から選択される核酸分子、
b) a)の核酸と相補的な核酸分子、
c)遺伝暗号の縮重がなければ、a)、b)、c) またはd)の核酸とハイブリダイズしうる核酸分子。
【請求項5】
核酸が DNAである、請求項1、2、3または4のいずれかの核酸分子。
【請求項6】
核酸がRNAである、請求項1、2、3、4、または5のいずれかの核酸分子。
【請求項7】
核酸分子がゲノムDNA、特に肺炎連鎖球菌ゲノムDNAから単離されたものである、請求項1〜5のいずれかの単離核酸分子。
【請求項8】
請求項1〜7のいずれかの核酸分子を含むベクター。
【請求項9】
請求項1〜7のいずれかの核酸分子によってコードされる過免疫血清反応性抗原またはその断片の組換え発現に適したものである、請求項 8のベクター。
【請求項10】
請求項 8 または9のベクターを含む宿主細胞。
【請求項11】
請求項1、2、5、6または 7のいずれかの核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含む過免疫血清反応性抗原およびその断片であって、該アミノ酸配列が配列番号 145、245-288からなる群から選択される過免疫血清反応性抗原およびその断片。
【請求項12】
請求項3、5、6、または7のいずれかの核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含む過免疫血清反応性抗原およびその断片であって、該アミノ酸配列が、配列番号 146-150、152、154-160、162-167、169-175、178、180、182-186、188、191-192、195、197、199-206、208、211、215-220、222-223、225-238、240-244からなる群から選択される過免疫血清反応性抗原およびその断片。
【請求項13】
請求項4、5、6、または 7のいずれかの核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含む過免疫血清反応性抗原およびその断片であって、該アミノ酸配列が配列番号 153、161、168、176、181、187、196、198、209-210、214、224からなる群から選択される過免疫血清反応性抗原およびその断片。
【請求項14】
表2の列「予測免疫原性アミノ酸」および「同定された免疫原性領域の位置」; 表2の血清反応性エピトープのアミノ酸配列を含むペプチド、特に以下のアミノ酸を含むペプチドからなる群から選択される過免疫血清反応性抗原の断片; 4-11、35-64、66-76、101-108、111-119 および 57-114 (配列番号 145); 5-27、32-64、92-102、107-113、119-125、133-139、148-162、177-187、195-201、207-214、241-251、254-269、285-300、302-309、317-324、332-357、365-404、411-425、443-463、470-477、479-487、506-512、515-520、532-547、556-596、603-610、616-622、624-629、636-642、646-665、667-674、687-692、708-720、734-739、752-757、798-820、824-851、856-865 および 732-763 (配列番号 146); 14-21、36-44、49-66、102-127、162-167、177-196、45-109 および 145-172 (配列番号 147); 17-35、64-75、81-92、100-119、125-172、174-183、214-222、230-236、273-282、287-303、310-315、331-340、392-398、412-420、480-505、515-523、525-546、553-575、592-598、603-609、617-625、631-639、644-651、658-670、681-687、691-704、709-716、731-736、739-744、750-763、774-780、784-791、799-805、809-822、859-870、880-885、907-916、924-941、943-949、973-986、1010-1016、1026-1036、1045-1054、1057-1062、1082-1088、1095-1102、1109-1120、1127-1134、1140-1146、1152-1159、1169-1179、1187-1196、1243-1251、1262-1273、1279-1292、1306-1312、1332-1343、1348-1364、1379-1390、1412-1420、1427-1436、1458-1468、1483-1503、1524-1549、1574-1588、1614-1619、1672-1685、1697-1707、1711-1720、1738-1753、1781-1787、1796-1801、1826-1843、132-478、508-592 および 1753-1810 (配列番号 148); 15-43、49-55、71-77、104-110、123-130、162-171、180-192、199-205、219-227、246-254、264-270、279-287、293-308、312-322、330-342、349-356、369-377、384-394、401-406、416-422、432-439、450-460、464-474、482-494、501-508、521-529、536-546、553-558、568-574、584-591、602-612、616-626、634-646、653-660、673-681、688-698、705-710、720-726、736-749、833-848、1-199、200-337、418-494 および 549-647 (配列番号 149); 9-30、65-96、99-123、170-178 および 1-128 (配列番号 150); 7-32、34-41、96-106、127-136、154-163、188-199、207-238、272-279、306-312、318-325、341-347、353-360、387-393、399-406、434-440、452-503、575-580、589-601、615-620、635-640、654-660、674-680、696-701、710-731、1-548 および 660-691 (配列番号 151); 4-19、35-44、48-59、77-87、93-99、106-111、130-138、146-161 および 78-84 (配列番号 152); 24-30、36-43、64-86、93-99、106-130、132-145、148-165、171-177、189-220、230-249、251-263、293-300、302-312、323-329、338-356、369-379、390-412 および 179-193 (配列番号 153); 30-39、61-67、74-81、90-120、123-145、154-167、169-179、182-197、200-206、238-244、267-272 および 230-265 (配列番号 154); 14-20、49-65、77-86 および 2-68 (配列番号 155); 4-9、26-35、42-48、53-61、63-85、90-101、105-111、113-121、129-137、140-150、179-188、199-226、228-237、248-255、259-285、299-308、314-331、337-343、353-364、410-421、436-442 および 110-144 (配列番号 156); 36-47、55-63、94-108、129-134、144-158、173-187、196-206、209-238、251-266、270-285、290-295、300-306、333-344、346-354、366-397、404-410、422-435、439-453、466-473、515-523、529-543、554-569、571-585、590-596、607-618、627-643、690-696、704-714、720-728、741-749、752-767、780-799、225-247 および 480-507 (配列番号 157); 16-25、36-70、80-93、100-106 および 78-130 (配列番号 158); 18-27、41-46、50-57、65-71、79-85、93-98、113-128、144-155、166-178、181-188、201-207、242-262、265-273、281-295、303-309、318-327 および 36-64 (配列番号 159); 7-29、31-44、50-59、91-96、146-153、194-201、207-212、232-238、264-278、284-290、296-302、326-353、360-370、378-384、400-405、409-418、420-435、442-460、499-506、529-534、556-562、564-576、644-651、677-684、687-698、736-743、759-766、778-784、808-814、852-858、874-896、920-925、929-935、957-965、1003-1012、1021-1027、1030-1044、1081-1087、1101-1111、1116-1124、1148-1159、1188-1196、1235-1251、1288-1303、1313-1319、1328-1335、1367-1373、1431-1437、1451-1458、1479-1503、1514-1521、1530-1540、1545-1552、1561-1568、1598-1605、1617-1647、1658-1665、1670-1676、1679-1689、1698-1704、1707-1713、1732-1738、1744-1764、1-70、154-189、922-941、1445-1462 および 1483-1496 (配列番号 160); 6-51、81-91、104-113、126-137、150-159、164-174、197-209、215-224、229-235、256-269、276-282、307-313、317-348、351-357、376-397、418-437、454-464、485-490、498-509、547-555、574-586、602-619 および 452-530 (配列番号 161); 25-31、39-47、49-56、99-114、121-127、159-186、228-240、253-269、271-279、303-315、365-382、395-405、414-425、438-453 および 289-384 (配列番号 162); 9-24、41-47、49-54、68-78、108-114、117-122、132-140、164-169、179-186、193-199、206-213、244-251、267-274、289-294、309-314、327-333、209-249 および 286-336 (配列番号 163); 9-28、53-67、69-82、87-93、109-117、172-177、201-207、220-227、242-247、262-268、305-318、320-325 および 286-306 (配列番号 164); 4-10、26-39、47-58、63-73、86-96、98-108、115-123、137-143、148-155、160-176、184-189、194-204、235-240、254-259、272-278 および 199-283 (配列番号 165); 4-26、33-39、47-53、59-65、76-83、91-97、104-112、118-137、155-160、167-174、198-207、242-268、273-279、292-315、320-332、345-354、358-367、377-394、403-410、424-439、445-451、453-497、511-518、535-570、573-589、592-601、604-610 および 202-242 (配列番号 166); 8-30、36-45、64-71、76-82、97-103、105-112、134-151、161-183、211-234、253-268、270-276、278-284、297-305、309-315、357-362、366-372、375-384、401-407、409-416、441-455、463-470、475-480、490-497、501-513、524-537、552-559、565-576、581-590、592-600、619-625、636-644、646-656 および 316-419 (配列番号 167); 4-17、52-58、84-99、102-110、114-120、124-135、143-158、160-173、177-196、201-216、223-250、259-267、269-275 および 1-67 (配列番号 168); 6-46、57-67、69-80、82-133、137-143、147-168、182-187、203-209、214-229、233-242、246-280 および 53-93 (配列番号 169); 7-40、50-56、81-89、117-123、202-209、213-218、223-229、248-261、264-276、281-288、303-308、313-324、326-332、340-346、353-372、434-443、465-474、514-523、556-564、605-616、620-626、631-636、667-683、685-699、710-719、726-732、751-756、760-771、779-788、815-828、855-867、869-879、897-902、917-924、926-931、936-942、981-1000、1006-1015、1017-1028、1030-1039、1046-1054、1060-1066、1083-1092、1099-1112、1122-1130、1132-1140、1148-1158、1161-1171、1174-1181、1209-1230、1236-1244、1248-1254、1256-1267、1269-1276、1294-1299、1316-1328、1332-1354、1359-1372、1374-1380、1384-1390、1395-1408、1419-1425、1434-1446、1453-1460、1465-1471、1474-1493、1505-1515、1523-1537、1547-1555、1560-1567、1577-1605、1633-1651、1226-1309、1455-1536 および 1538-1605 (配列番号 170); 4-10、31-39、81-88、106-112、122-135、152-158、177-184、191-197、221-227、230-246、249-255、303-311、317-326、337-344、346-362、365-371、430-437、439-446、453-462、474-484 および 449-467 (配列番号 171); 9-15、24-35、47-55、122-128、160-177、188-196、202-208、216-228、250-261、272-303、318-324、327-339、346-352、355-361、368-373、108-218 および 344-376 (配列番号 172); 6-14、17-48、55-63、71-90、99-109、116-124、181-189、212-223、232-268、270-294、297-304、319-325、340-348、351-370、372-378、388-394、406-415、421-434 および 177-277 (配列番号 173); 21-39、42-61、65-75、79-85、108-115 および 11-38 (配列番号 174); 4-17、26-39、61-76、103-113、115-122、136-142、158-192、197-203、208-214、225-230、237-251 および 207-225 (配列番号 175); 5-11、27-36、42-53、62-70、74-93、95-104、114-119、127-150、153-159、173-179、184-193、199-206、222-241、248-253、257-280、289-295、313-319、322-342、349-365、368-389、393-406、408-413、426-438、447-461、463-470、476-495、532-537、543-550 および 225-246 (配列番号 176); 4-29、68-82、123-130、141-147、149-157、178-191、203-215、269-277、300-307、327-335、359-370、374-380、382-388、393-400、410-417、434-442、483-492、497-503、505-513、533-540、564-569、601-607、639-647、655-666、693-706、712-718、726-736、752-758、763-771、774-780、786-799、806-812、820-828、852-863、884-892、901-909、925-932、943-948、990-996、1030-1036、1051-1059、1062-1068、1079-1086、1105-1113、1152-1162、1168-1179、1183-1191、1204-1210、1234-1244、1286-1295、1318-1326、1396-1401、1451-1460、1465-1474、1477-1483、1488-1494、1505-1510、1514-1521、1552-1565、1593-1614、1664-1672、1677-1685、1701-1711、1734-1745、1758-1770、1784-1798、1840-1847、1852-1873、1885-1891、1906-1911、1931-1939、1957-1970、1977-1992、2014-2020、2026-2032、2116-2134、1-348、373-490、573-767、903-1043、1155-1198、1243-1482、1550-1595、1682-1719、1793-1921 および 2008-2110 (配列番号 177); 10-35、39-52、107-112、181-188、226-236、238-253、258-268、275-284、296-310、326-338、345-368、380-389、391-408、410-418、420-429、444-456、489-505、573-588、616-623、637-643、726-739、741-767、785-791、793-803、830-847、867-881、886-922、949-956、961-980、988-1004、1009-1018、1027-1042、1051-1069、1076-1089、1108-1115、1123-1135、1140-1151、1164-1179、1182-1191、1210-1221、1223-1234、1242-1250、1255-1267、1281-1292、1301-1307、1315-1340、1348-1355、1366-1373、1381-1413、1417-1428、1437-1444、1453-1463、1478-1484、1490-1496、1498-1503、1520-1536、1538-1546、1548-1570、1593-1603、1612-1625、1635-1649、1654-1660、1670-1687、1693-1700、1705-1711、1718-1726、1729-1763、1790-1813、1871-1881、1893-1900、1907-1935、1962-1970、1992-2000、2006-2013、2033-2039、2045-2051、2055-2067、2070-2095、2097-2110、2115-2121、2150-2171、2174-2180、2197-2202、2206-2228 および 1526-1560 (配列番号 178); 4-17、35-48、54-76、78-107、109-115、118-127、134-140、145-156、169-174、217-226、232-240、256-262、267-273、316-328、340-346、353-360、402-409、416-439、448-456、506-531、540-546、570-578、586-593、595-600、623-632、662-667、674-681、689-705、713-724、730-740、757-763、773-778、783-796、829-835、861-871、888-899、907-939、941-955、957-969、986-1000、1022-1028、1036-1044、1068-1084、1095-1102、1118-1124、1140-1146、1148-1154、1168-1181、1185-1190、1197-1207、1218-1226、1250-1270、1272-1281、1284-1296、1312-1319、1351-1358、1383-1409、1422-1428、1438-1447、1449-1461、1482-1489、1504-1510、1518-1527、1529-1537、1544-1551、1569-1575、1622-1628、1631-1637、1682-1689、1711-1718、1733-1740、1772-1783、1818-1834、1859-1872、1-64 および 128-495 (配列番号 179); 8-28、32-37、62-69、119-125、137-149、159-164、173-189、200-205、221-229、240-245、258-265、268-276、287-293、296-302、323-329 および
1-95 (配列番号 180); 9-18、25-38、49-63、65-72、74-81、94-117、131-137、139-146、149-158、162-188、191-207、217-225、237-252、255-269、281-293、301-326、332-342、347-354、363-370、373-380、391-400、415-424、441-447 および 75-107 (配列番号 181); 4-24、64-71、81-87、96-116、121-128、130-139、148-155、166-173、176-184、203-215、231-238、243-248、256-261、280-286、288-306、314-329 および 67-148 (配列番号 182); 4-10、19-37、46-52、62-81、83-89、115-120、134-139、141-151、168-186、197-205、209-234、241-252、322-335、339-345、363-379、385-393、403-431、434-442、447-454、459-465、479-484、487-496 および 404-420 (配列番号 183); 10-35、46-66、71-77、84-93、96-122、138-148、154-172、182-213、221-233、245-263、269-275、295-301、303-309、311-320、324-336、340-348、351-359、375-381 および 111-198 (配列番号 184); 14-25、30-42、47-61、67-75、81-91、98-106、114-122、124-135、148-193、209-227 および 198-213 (配列番号 185); 5-18、45-50、82-90、97-114、116-136、153-161、163-171、212-219、221-227、240-249、267-281、311-317、328-337、375-381、390-395、430-436、449-455、484-495、538-543、548-554、556-564、580-586、596-602 および 493-606 (配列番号 186); 9-25、28-34、37-44、61-68、75-81、88-96、98-111、119-133、138-150、152-163、168-182、186-194、200-205、216-223、236-245、257-264、279-287、293-304、311-318、325-330、340-346、353-358、365-379、399-409、444-453 および 303-391 (配列番号 187); 16-36、55-61、66-76、78-102、121-130、134-146、150-212、221-239、255-276、289-322、329-357 および 29-59 (配列番号 188); 8-27、68-74、77-99、110-116、124-141、171-177、202-217、221-228、259-265、275-290、293-303、309-325、335-343、345-351、365-379、384-394、406-414、423-437、452-465、478-507、525-534、554-560、611-624、628-651、669-682、742-747、767-778、782-792、804-812、820-836、79-231 および 359-451 (配列番号 189); 5-28、39-45、56-62、67-74、77-99、110-117、124-141、168-176、200-230、237-244、268-279、287-299、304-326、329-335、348-362、370-376、379-384、390-406、420-429、466-471、479-489、495-504、529-541、545-553、561-577、598-604、622-630、637-658、672-680、682-688、690-696、698-709、712-719、724-736、738-746、759-769、780-786、796-804、813-818、860-877、895-904、981-997、1000-1014、1021-1029、1-162、206-224、254-350、414-514 および 864-938 (配列番号 190); 4-11、19-49、56-66、68-101、109-116、123-145、156-165、177-185、204-221、226-234、242-248、251-256、259-265、282-302、307-330、340-349、355-374、377-383、392-400、422-428、434-442、462-474 および 266-322 (配列番号 191); 14-43、45-57、64-74、80-87、106-127、131-142、145-161、173-180、182-188、203-210、213-219、221-243、245-254、304-311、314-320、342-348、354-365、372-378、394-399、407-431、436-448、459-465、470-477、484-490、504-509、531-537、590-596、611-617、642-647、723-734、740-751、754-762、764-774、782-797、807-812、824-831、838-845、877-885、892-898、900-906、924-935、940-946、982-996、1006-1016、1033-1043、1051-1056、1058-1066、1094-1108、1119-1126、1129-1140、1150-1157、1167-1174、1176-1185、1188-1201、1209-1216、1220-1228、1231-1237、1243-1248、1253-1285、1288-1297、1299-1307、1316-1334、1336-1343、1350-1359、1365-1381、1390-1396、1412-1420、1427-1439、1452-1459、1477-1484、1493-1512、1554-1559、1570-1578、1603-1608、1623-1630、1654-1659、1672-1680、1689-1696、1705-1711、1721-1738、1752-1757、1773-1780、1817-1829、1844-1851、1856-1863、1883-1895、1950-1958、1974-1990、172-354、384-448、464-644、648-728 および 1357-1370 (配列番号 192); 8-27、68-74、77-99、110-116、124-141、169-176、201-216、220-227、258-264、274-289、292-302、308-324、334-342、344-350、364-372、377-387、399-407、416-429、445-458、471-481、483-500、518-527、547-553、604-617、621-644、662-675、767-778、809-816、15-307、350-448 および 496-620 (配列番号 193); 4-17、24-29、53-59、62-84、109-126、159-164、189-204、208-219、244-249、274-290、292-302、308-324、334-342、344-350、378-389、391-397、401-409、424-432、447-460、470-479、490-504、521-529、538-544、549-555、570-577、583-592、602-608、615-630、635-647、664-677、692-698、722-731、733-751、782-790、793-799、56-267、337-426 および 495-601 (配列番号 194); 12-22、49-59、77-89、111-121、136-148、177-186、207-213、217-225、227-253、259-274、296-302、328-333、343-354、374-383、424-446、448-457、468-480、488-502、507-522、544-550、553-560、564-572、587-596、604-614、619-625、629-635、638-656、662-676、680-692、697-713、720-738、779-786、833-847、861-869、880-895、897-902、911-917、946-951、959-967、984-990、992-1004、1021-1040、1057-1067、1073-1080 および 381-403 (配列番号 195); 4-10、26-31、46-56、60-66、70-79、86-94、96-102、109-118、132-152、164-187、193-206、217-224 および 81-149 (配列番号 196); 4-21、26-37、48-60、71-82、109-117、120-128、130-136、142-147、181-187、203-211、216-223、247-255、257-284、316-325、373-379、395-400、423-435、448-456、479-489、512-576、596-625、641-678、680-688、692-715 および 346-453 (配列番号 197); 10-16、25-31、34-56、58-69、71-89、94-110、133-176、186-193、208-225、240-250、259-266、302-307、335-341、376-383、410-416 および 316-407 (配列番号 198); 11-29、42-56、60-75、82-88、95-110、116-126、132-143、145-160、166-172、184-216 および 123-164 (配列番号 199); 11-29、54-63、110-117、139-152、158-166、172-180、186-193、215-236、240-251、302-323、330-335、340-347、350-366、374-381 および 252-299 (配列番号 200); 18-27、35-42、50-56、67-74、112-136、141-153、163-171、176-189、205-213、225-234、241-247、253-258、269-281、288-298、306-324、326-334、355-369、380-387 および 289-320 (配列番号 201); 7-15、19-41、56-72、91-112、114-122、139-147、163-183、196-209、258-280、326-338、357-363、391-403、406-416 および 360-378 (配列番号 202); 11-18、29-41、43-49、95-108、142-194、204-212、216-242、247-256、264-273 および 136-149 (配列番号 203); 18-24、33-40、65-79、89-102、113-119、130-137、155-161、173-179、183-203、205-219、223-231、245-261、267-274、296-306、311-321、330-341、344-363、369-381、401-408、415-427、437-444、453-464、472-478、484-508、517-524、526-532、543-548 および 59-180 (配列番号 204); 5-13、52-65、67-73、97-110、112-119、134-155 および 45-177 (配列番号 205); 6-28、34-43、57-67、75-81、111-128、132-147、155-163、165-176、184-194、208-216、218-229、239-252、271-278、328-334、363-376、381-388、426-473、481-488、492-498、507-513、536-546、564-582、590-601、607-623、148-269、420-450 および 610-648 (配列番号 206); 4-12、20-38、69-75、83-88、123-128、145-152、154-161、183-188、200-213、245-250、266-272、306-312、332-339、357-369、383-389、395-402、437-453、455-470、497-503 および 1-112 (配列番号 207); 35-59、74-86、111-117、122-137 および 70-154 (配列番号 208); 26-42、54-61、65-75、101-107、123-130、137-144、148-156、164-172、177-192、213-221、231-258 および 157-249 (配列番号 209); 29-38、61-67、77-87、94-100、105-111、118-158 および 1-97 (配列番号 210); 7-21、30-48、51-58、60-85、94-123、134-156、160-167、169-183、186-191、216-229、237-251、257-267、272-282、287-298 および 220-243 (配列番号 211); 6-29、34-47、56-65、69-76、83-90、123-134、143-151、158-178、197-203、217-235、243-263、303-309、320-333、338-348、367-373、387-393、407-414、416-427、441-457、473-482、487-499、501-509、514-520、530-535、577-583、590-602、605-612、622-629、641-670、678-690、37-71 および 238-307 (配列番号 212); 7-40、121-132、148-161、196-202、209-215、221-235、248-255、271-280、288-295、330-339、395-409、414-420、446-451、475-487、556-563、568-575、580-586、588-595、633-638、643-648、652-659、672-685、695-700、710-716、737-742、749-754、761-767、775-781、796-806、823-835、850-863、884-890、892-900、902-915、934-941 および 406-521 (配列番号 213); 9-18、24-46、51-58、67-77、85-108、114-126、129-137、139-146、152-165、173-182、188-195、197-204、217-250、260-274、296-313、343-366、368-384、427-434、437-446、449-455、478-484、492-506、522-527、562-591、599-606、609-618、625-631、645-652 および 577-654 (配列番号 214); 13-20、26-37、41-53、56-65、81-100、102-114、118-127、163-188、196-202、231-238、245-252、266-285、293-298、301-306 および 19-78 (配列番号 215); 10-23、32-42、54-66、73-91、106-113、118-127、139-152、164-173、198-207、210-245、284-300、313-318、330-337、339-346、354-361、387-393、404-426、429-439、441-453、467-473、479-485、496-509、536-544、551-558、560-566、569-574、578-588、610-615、627-635、649-675、679-690、698-716、722-734、743-754、769-780、782-787 および 480-550 (配列番号 216); 6-39、42-50、60-68、76-83、114-129、147-162、170-189、197-205、217-231、239-248、299-305、338-344、352-357、371-377、380-451、459-483、491-499、507-523、537-559、587-613、625-681、689-729、737-781、785-809、817-865、873-881、889-939、951-975、983-1027、1031-1055、1063-1071、1079-1099、1103-1127、1151-1185、1197-1261、1269-1309、1317-1333、1341-1349、1357-1465、1469-1513、1517-1553、1557-1629、1637-1669、1677-1701、1709-1725、1733-1795、1823-1849、1861-1925、1933-1973、1981-2025、2029-2053、2061-2109、2117-2125、2133-2183、2195-2219、2227-2271、2275-2299、2307-2315、2323-2343、2347-2371、2395-2429、2441-2529、2537-2569、2577-2601、2609-2625、2633-2695、2699-2737、2765-2791、2803-2867、2889-2913、2921-2937、2945-2969、2977-2985、2993-3009、3023-3045、3073-3099、3111-3167、3175-3215、3223-3267、3271-3295、3303-3351、3359-3367、3375-3425、3437-3461、3469-3513、3517-3541、3549-3557、3565-3585、3589-3613、3637-3671、3683-3747、3755-3795、3803-3819、3827-3835、3843-3951、3955-3999、4003-4039、4043-4115、4123-4143、4147-4171、4195-4229、4241-4305、4313-4353、4361-4377、4385-4393、4401-4509、4513-4557、4561-4597、4601-4718、4749-4768、74-171、452-559 および 2951-3061 (配列番号 217); 16-22、30-51、70-111、117-130、137-150、171-178、180-188、191-196 および 148-181 (配列番号 218); 6-19、21-46、50-56、80-86、118-126、167-186、189-205、211-242、244-267、273-286、290-297、307-316、320-341 および 34-60 (配列番号 219); 5-26、33-43、48-54、58-63、78-83、113-120、122-128、143-152、157-175、185-192、211-225、227-234、244-256、270-281、284-290、304-310、330-337、348-355、362-379、384-394、429-445、450-474、483-490、511-520、537-546、548-554、561-586、590-604、613-629、149-186、285-431 および 573-659 (配列番号 220); 5-26、49-59、61-67、83-91、102-111、145-157、185-192、267-272、279-286、292-298、306-312、134-220、235-251 および 254-280 (配列番号 221); 5-19
、72-79、83-92、119-124、140-145、160-165、167-182、224-232、240-252、259-270、301-310、313-322、332-343、347-367、384-398、416-429、431-446、454-461 および 1-169 (配列番号 222); 8-17、26-31、56-62、75-83、93-103、125-131、135-141、150-194、205-217、233-258、262-268、281-286 および 127-168 (配列番号 223); 6-12、69-75、108-115、139-159、176-182、194-214 および 46-161 (配列番号 224); 6-13、18-27、39-48、51-59、66-73、79-85、95-101、109-116、118-124、144-164、166-177、183-193、197-204、215-223、227-236、242-249、252-259、261-270、289-301、318-325 および 12-58 (配列番号 225); 4-10、26-32、48-60、97-105、117-132、138-163、169-185、192-214、219-231、249-261、264-270、292-308、343-356、385-392、398-404、408-417、435-441 および 24-50 (配列番号 226); 10-40、42-48、51-61、119-126 および 1-118 (配列番号 227); 5-17、40-58、71-83、103-111、123-140、167-177、188-204 および 116-128 (配列番号 228); 4-9、11-50、57-70、112-123、127-138 および 64-107 (配列番号 229); 9-39、51-67 および 1-101 (配列番号 230); 5-14、17-25、28-46、52-59、85-93、99-104、111-120、122-131、140-148、158-179、187-197、204-225、271-283、285-293 および 139-155 (配列番号 231); 42-70、73-90、92-108、112-127、152-164、166-172、181-199、201-210、219-228、247-274、295-302、322-334、336-346、353-358、396-414、419-425、432-438、462-471、518-523、531-536、561-567、576-589、594-612、620-631、665-671、697-710、718-731、736-756、765-771、784-801 および 626-653 (配列番号 232); 8-28、41-51、53-62、68-74、79-85、94-100、102-108、114-120、130-154、156-162、175-180、198-204、206-213、281-294、308-318、321-339、362-368、381-386、393-399、407-415 および 2-13 (配列番号 233); 4-39、48-65、93-98、106-112、116-129 および 10-36 (配列番号 234); 25-32、35-50、66-71、75-86、90-96、123-136、141-151、160-179、190-196、209-215、222-228、235-242、257-263、270-280 および 209-247 (配列番号 235); 5-29、31-38、50-57、62-75、83-110、115-132、168-195、197-206、216-242、249-258、262-269、333-340、342-350、363-368、376-392、400-406、410-421、423-430、436-442、448-454、460-466、471-476、491-496、511-516、531-536、551-556、571-576、585-591、599-605、27-70、219-293、441-504 および 512-584 (配列番号 236); 4-12、14-34、47-75、83-104、107-115、133-140、148-185、187-196、207-212、224-256、258-265、281-287、289-296、298-308、325-333、345-355、365-371、382-395、424-435、441-457、465-472、483-491、493-505、528-534、536-546、552-558、575-584、589-600、616-623 および 576-591 (配列番号 237); 4-76、 78-89、 91-126、 142-148、 151-191、 195-208、 211-223、 226-240、 256-277、 279-285、 290-314、 317-323、 358-377、 381-387、 391-396、 398-411、 415-434、 436-446、 454-484、 494-512、 516-523、 538-552、 559-566、 571-577、 579-596、 599-615、 620-627、 635-644、 694-707、 720-734、 737-759、 761-771 および 313-329 (配列番号 238); 7-38、44-49、79-89、99-108、117-123、125-132、137-146、178-187、207-237、245-255、322-337、365-387、398-408、445-462、603-608、623-628、644-650、657-671、673-679 および 111-566 (配列番号 239); 6-20、22-35、39-45、58-64、77-117、137-144、158-163、205-210、218-224、229-236、239-251、263-277、299-307、323-334、353-384、388-396、399-438、443-448、458-463、467-478、481-495、503-509、511-526、559-576、595-600、612-645、711-721、723-738、744-758、778-807 および 686-720 (配列番号 240); 10-33、35-41、72-84、129-138、158-163、203-226、243-252、258-264、279-302、322-329、381-386、401-406、414-435 および 184-385 (配列番号 241); 4-9、19-24、41-47、75-85、105-110、113-146 および 45-62 (配列番号 242); 4-25、52-67、117-124、131-146、173-180、182-191、195-206、215-221、229-236、245-252、258-279、286-291、293-302、314-320、327-336、341-353、355-361、383-389 および 1-285 (配列番号 243); 14-32、38-50、73-84、93-105、109-114 および 40-70 (配列番号 244); 5-26 および 22-34 (配列番号 245); 23-28 および 13-39 (配列番号 246); 8-14 および 21-34 (配列番号 247); 4-13、20-29、44-50、59-74 および 41-69 (配列番号 248); 4-9、 19-42、 48-59、 71-83 および 57-91 (配列番号 249); 4-14 および 10-28 (配列番号 250); 22-28、32-42、63-71、81-111、149-156、158-167、172-180、182-203、219-229 および 27-49 (配列番号 251); 17-27 および 23-32 (配列番号 252); 18-24 および 28-38 (配列番号 253); 9-15 および 13-27 (配列番号 254); 13-22 および 18-29 (配列番号 255); 17-26 および 2-11 (配列番号 256); 4-33 および 16-32 (配列番号 257); 4-10、37-43、54-84、92-127 および 15-62 (配列番号 258); 4-14、20-32、35-60、69-75、79-99、101-109、116-140 および 124-136 (配列番号 259); 2-13 (配列番号 260); 4-13、28-42 および 42-57 (配列番号 261); 4-14、27-44 および 14-35 (配列番号 262); 4-12 および 1-27 (配列番号 263); 4-18、39-45、47-74 および 35-66 (配列番号 264); 8-20、43-77 および 17-36 (配列番号 265); 4-30、35-45、51-57 および 35-49 (配列番号 266); 4-24、49-57 および 15-34 (配列番号 267); 4-22 および 8-27 (配列番号 268); 13-25、32-59、66-80 および 21-55 (配列番号 269); 4-10、24-33、35-42、54-65、72-82、98-108 および 15-30 (配列番号 270); 8-19 および 17-47 (配列番号 271); 12-18、40-46 および 31-52 (配列番号 272); 4-20、35-78、83-102、109-122 および 74-86 (配列番号 273); 7-17、21-41、46-63 および 2-20 (配列番号 274); 30-37 および 2-33 (配列番号 275); 4-13、17-25 および 1-15 (配列番号 276); 17-31、44-51 および 20-51 (配列番号 277); 20-30 および 5-23 (配列番号 278); 13-33、48-71 および 92-110 (配列番号 279); 4-9、50-69、76-88、96-106、113-118 および 12-34 (配列番号 280); 4-24 および 6-26 (配列番号 281); 7-26 および 14-30 (配列番号 282); 9-39、46-68、75-82、84-103 および 26-44 (配列番号 283); 4-30、33-107 および 58-84 (配列番号 284); 4-12 および 9-51 (配列番号 285); 12-18、29-37 および 6-37 (配列番号 286); 4-21、33-52、64-71 および 16-37 (配列番号 287); 9-19 および 2-30 (配列番号 288); 20-37 (配列番号 245); 8-27 (配列番号 246); 10-27 (配列番号 247); 42-59 および 52-69 (配列番号 248); 63-80 および 74-91 (配列番号 249); 11-28 (配列番号 250); 28-49 (配列番号 251); 15-32 (配列番号 252); 4-20 (配列番号 253); 10-27 (配列番号 254); 17-34 (配列番号 255); 1-18 (配列番号 256); 16-33 (配列番号 257); 16-36、30-49 および 43-62 (配列番号 258); 122-139 (配列番号 259); 1-18 (配列番号 260); 41-58 (配列番号 261); 15-35 (配列番号 262); 2-27 (配列番号 263); 18-36 (配列番号 265); 34-51 (配列番号 266); 9-27 (配列番号 268); 22-47 (配列番号 269); 18-36 および 29-47 (配列番号 271); 32-52 (配列番号 272); 72-89 (配列番号 273); 3-20 (配列番号 274); 3-21 および 15-33 (配列番号 275); 1-18 (配列番号 276); 6-23 (配列番号 278); 93-110 (配列番号 279); 13-34 (配列番号 280); 7-26 および 9-26 (配列番号 281); 16-33 (配列番号 282); 27-44 (配列番号 283); 67-84 (配列番号 284); 10-33 および 26-50 (配列番号 285); 7-25 および 19-37 (配列番号 286); 17-37 (配列番号 287); 3-20 および 13-30 (配列番号 288); 62-80 および 75-93 (配列番号 145); 92-108 (配列番号 147); 332-349、177-200 および 1755-1777 (配列番号 148); 109-133、149-174、260-285 および 460-485 (配列番号 149); 26-47 および 42-64 (配列番号 150); 22-41、35-54、115-130、306-325、401-420 および 454-478 (配列番号 151); 22-45 (配列番号 155); 156-174、924-940、1485-1496、1447-1462 および 1483-1498 (配列番号 160); 457-475 (配列番号 161); 302-325 (配列番号 163); 288-305 (配列番号 164); 244-266 および 260-282 (配列番号 165); 204-225 および 220-241 (配列番号 166); 324-345、340-361、356-377、372-393 および 388-408 (配列番号 167); 39-64 (配列番号 168); 54-76 および 70-92 (配列番号 169); 1227-1247、1539-1559、1554-1574、1569-1589、1584-1604、1242-1262、1272-1292、1287-1308、1456-1477、1472-1494、1488-1510 および 1505-1526 (配列番号 170); 351-368 (配列番号 172); 179-200、195-216、211-232、227-248 および 243-263 (配列番号 173); 13-37 (配列番号 174); 208-224 (配列番号 175); 42-64、59-81、304-328、323-348、465-489、968-992、1399-1418、1412-1431 および 2092-2111 (配列番号 177); 1528-1547 および 1541-1560 (配列番号 178); 184-200、367-388、382-403、409-429、425-444 および 438-457 (配列番号 179); 27-50 および 45-67 (配列番号 180); 114-131 および 405-419 (配列番号 183); 113-134、129-150、145-166、161-182 および 177-198 (配列番号 184); 495-515 (配列番号 186); 346-358 (配列番号 187); 208-224 (配列番号 190); 178-194、202-223、217- 238、288-308 および 1355-1372 (配列番号 192); 57-78 (配列番号 194); 347-369、364-386、381-403、398-420、415-437 および 432-452 (配列番号 197); 347-372 (配列番号 198); 147-163 (配列番号 199); 263-288 (配列番号 200); 361-377 (配列番号 202); 82-104、99-121、116-138、133-155 および 150-171 (配列番号 204); 110-130 および 125-145 (配列番号 205); 613-631、626-644 および 196-213 (配列番号 206); 78-100、95-117、112-134 および 129-151 (配列番号 208); 158-180、175-197、192-214、209-231 および 226-248 (配列番号 209); 30-50、45-65 および 60-79 (配列番号 210); 431-455 および 450-474 (配列番号 213); 579-601、596-618、613-635 および 630-653 (配列番号 214); 920-927、98-119、114-135、130-151、146-167 および 162-182 (配列番号 217); 36-59 (配列番号 219); 194-216 および 381-404 (配列番号 220); 236-251 および 255-279 (配列番号 221); 80-100 および 141-164 (配列番号 222); 128-154 (配列番号 223); 82-100、95-116 および 111-134 (配列番号 224); 55-76、71-92 および 87-110 (配列番号 227); 91-106 (配列番号 229); 74-96 (配列番号 230); 140-157 (配列番号 231); 4-13 (配列番号 233); 41-65 および 499-523 (配列番号 236); 122-146、191-215、288-313、445-469 および 511-535 (配列番号 239); 347-368 (配列番号 241); 46-61 (配列番号 242); 15-37、32-57、101-121、115-135、138-158、152-172、220-242 および 236-258 (配列番号 243)。
【請求項15】
請求項 1〜 7のいずれかの核酸分子を発現させることを含む、請求項11〜14のいずれかの肺炎連鎖球菌過免疫血清反応性抗原またはその断片の生産方法。
【請求項16】
請求項 8または請求項 9のベクターで好適な宿主細胞を形質転換または形質移入することを含む、請求項11〜14のいずれかの肺炎連鎖球菌過免疫血清反応性抗原またはその断片を発現する細胞の生産方法。
【請求項17】
請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片または請求項 1〜 7のいずれかの核酸分子を含む、医薬組成物、特にワクチン。
【請求項18】
好ましくは、ポリカチオン性ポリマー、特にポリカチオン性ペプチド、免疫賦活性デオキシヌクレオチド(ODN)、少なくとも2つのLysLeuLysモチーフを含むペプチド、向神経活性化合物、特にヒト成長ホルモン、ミョウバン、フロイント完全または不完全アジュバントまたはそれらの組み合わせを含む群から選択される免疫賦活性物質をさらに含むことを特徴とする、請求項 17の医薬組成物、特にワクチン。
【請求項19】
医薬調製物の製造、特に、肺炎連鎖球菌感染症に対するワクチンの製造のための請求項 1〜 7のいずれかの核酸分子または請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の使用。
【請求項20】
請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の選択された部分に少なくとも結合する、抗体、または少なくともその有効な部分。
【請求項21】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項 20の抗体。
【請求項22】
該有効な部分がFab 断片を含む、請求項 20または21の抗体。
【請求項23】
抗体がキメラ抗体である、請求項20〜 22のいずれかの抗体。
【請求項24】
抗体がヒト化抗体である、請求項20〜23のいずれかの抗体。
【請求項25】
請求項20〜24のいずれかの抗体を生産するハイブリドーマ細胞株。
【請求項26】
以下の工程を特徴とする請求項 20の抗体の生産方法:
請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片を非ヒト動物に投与することにより、非ヒト動物において免疫応答を開始させる工程、
該動物から抗体を含有する体液を取り出す工程、および、
該抗体を含有する体液をさらなる精製工程に供することにより、抗体を生産する工程。
【請求項27】
以下の工程を特徴とする請求項 21の抗体の生産方法:
請求項 12 〜 15のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片を、非ヒト動物に投与することによって、非ヒト動物において免疫応答を開始させる工程、
該動物から脾臓または脾臓細胞を取り出す工程、
該脾臓または脾臓細胞のハイブリドーマ細胞を作る工程、
該過免疫血清反応性抗原またはその断片に特異的なハイブリドーマ細胞を選択およびクローン化する工程、
クローン化したハイブリドーマ細胞の培養および所望によりさらなる精製工程により、抗体を生産する工程。
【請求項28】
肺炎連鎖球菌感染症の治療または予防用医薬の調製のための請求項20〜 24のいずれかの抗体の使用。
【請求項29】
請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片に結合するアンタゴニスト。
【請求項30】
以下の工程を含む、請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片に結合することができるアンタゴニストの同定方法:
a)単離または固定化された請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片と、候補アンタゴニストとを、該候補アンタゴニストの該過免疫血清反応性抗原または断片への結合を可能とする条件下で、該過免疫血清反応性抗原またはその断片に対する候補アンタゴニストの結合に応答して検出可能なシグナルを提供することができる成分の存在下で、接触させる工程;および、
b)アンタゴニストの、過免疫血清反応性抗原またはその断片に対する結合に応答して生成したシグナルの存在または不在を検出する工程。
【請求項31】
以下の工程を含む、請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の、その相互作用パートナーに対する相互作用活性を低減または阻害することができるアンタゴニストの同定方法:
a) 請求項 11-14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその過免疫断片を提供する工程、
b)該過免疫血清反応性抗原またはその断片に対する相互作用パートナー、特に、請求項20〜 24のいずれかの抗体を提供する工程、
c)該過免疫血清反応性抗原またはその断片と該相互作用パートナーとを相互作用させ相互作用複合体を形成させる工程、
d)候補アンタゴニストを提供する工程、
e)候補アンタゴニストと相互作用複合体の間で競合反応を起こさせる工程、
f)候補アンタゴニストが、過免疫血清反応性抗原またはその断片と相互作用パートナーとの相互作用活性を阻害または低減するかを判定する工程。
【請求項32】
該過免疫血清反応性抗原またはその断片の相互作用パートナーの単離および/または精製および/または同定のための、請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の使用。
【請求項33】
請求項 1〜 7 のいずれかの過免疫血清反応性抗原および断片をコードする核酸配列の存在または請求項 11-14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の存在を判定することを含む、請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の発現に関連する疾患のインビトロ診断方法。
【請求項34】
請求項 1〜 7のいずれかの過免疫血清反応性抗原および断片をコードする核酸配列の存在または請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の存在を分析することを含む、細菌感染症、特に肺炎連鎖球菌感染症のインビトロ診断方法。
【請求項35】
過免疫血清反応性抗原またはその断片に結合するペプチドの作成のための請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の使用、ここで該ペプチドがアンチカリンを含む群から選択される。
【請求項36】
機能的核酸の製造のための請求項 11〜14のいずれかの過免疫血清反応性抗原またはその断片の使用、ここで該機能的核酸がアプタマーおよびスピーゲルマーを含む群から選択される。
【請求項37】
機能的リボ核酸の製造のための請求項 11〜14のいずれかの核酸分子の使用、ここで該機能的リボ核酸がリボザイム、アンチセンス核酸および siRNAを含む群から選択される。

【図1】
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【図1】
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【図1】
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【図2】
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【図3】
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【図4】
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【図5】
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【図6】
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【図7】
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【図8】
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【図8】
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【図9】
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【図10】
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【図11】
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【図12】
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【図13】
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【図14】
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【図14】
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【図14】
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【公表番号】特表2007−525157(P2007−525157A)
【公表日】平成19年9月6日(2007.9.6)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2006−505135(P2006−505135)
【出願日】平成16年4月15日(2004.4.15)
【国際出願番号】PCT/EP2004/003984
【国際公開番号】WO2004/092209
【国際公開日】平成16年10月28日(2004.10.28)
【出願人】(502270718)インターツェル・アクチェンゲゼルシャフト (26)
【氏名又は名称原語表記】INTERCELL AG
【Fターム(参考)】