核酸、それらのポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ペプチド、変異体、バリアント及び活性型断片を含むＳＴＩＮＧと名付けられた新規分子は、被験者の自然及び獲得免疫を変調する。ＳＴＩＮＧ組成物は免疫関連障害を治療するために有用であり、免疫を変調することによって感染を治療及び予防することを含む。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１又は２に列挙される配列か、それらの活性型断片又はバリアントかを含む、免疫応答を変調するタンパク質又はペプチドをエンコードすることを特徴とする、単離された核酸配列。
【請求項２】
前記活性型断片がヒトの少なくとも３８０個の連続的なアミノ酸残基の長さであり、ｉｎ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｔｒｏで免疫応答を誘導又は増大することを特徴とする、請求項１に記載の単離された核酸配列。
【請求項３】
配列番号１又は２か、それらの活性断片かの発現が、ｉｎ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｔｒｏで細胞、組織又は器官でＩ型ＩＦＮを誘導することを特徴とする、請求項１に記載の単離された核酸配列。
【請求項４】
配列番号１又は２の発現が、ｉｎ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｔｒｏで抗ウイルス性の免疫応答を誘導することを特徴とする、請求項１に記載の単離された核酸配列。
【請求項５】
配列番号１又は２に列挙される単離された核酸か、それらの活性型断片又はバリアントかによってエンコードされることを特徴とする、ペプチド、ポリペプチド又はタンパク質。
【請求項６】
前記ペプチドは、少なくとも３８０個の連続するアミノ酸残基の長さであることを特徴とする、請求項５に記載のペプチド、ポリペプチド又はタンパク質。
【請求項７】
１個又は２個以上のアミノ酸分子が、非天然分子で任意に置換されることを特徴とする、請求項５に記載のペプチド。
【請求項８】
配列番号１又は２に列挙される単離された核酸か、それらの活性型断片又はバリアントかによってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質を含むことを特徴とする、免疫調節組成物。
【請求項９】
前記タンパク質又はペプチド活性断片は、第２番目のドメインに連結又は融合されることを特徴とする、請求項８に記載の免疫調節組成物。
【請求項１０】
前記第２番目のドメインは、抗原結合ドメイン、ホルモン、酵素、サイトカイン、毒物、放射性分子、検出可能な分子、膜移行配列、シグナルペプチド、有機分子又は無機分子のうち、少なくとも１つを含むことを特徴とする、請求項９に記載の免疫調節組成物。
【請求項１１】
配列番号１又は２に列挙されるポリヌクレオチド、それらのバリアント、変異体又は活性型断片を含むことを特徴とする、ベクター。
【請求項１２】
配列番号１又は２、それらのバリアント、変異体又は活性型断片の発現が、抗ウイルス活性、免疫応答、免疫シグナル伝達又は細胞内Ｂ型ＤＮＡのうち、少なくとも１つを含む、ｉｎ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｔｒｏで応答を誘導することを特徴とする、請求項１１に記載のベクター。
【請求項１３】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列か、それらの活性型断片又はバリアントかを含むことを特徴とする、単離された細胞。
【請求項１４】
前記配列番号１又は２に列挙される核酸配列か、それらの活性型断片又はバリアントかは前記細胞で発現することを特徴とする、請求項１３に記載の単離された細胞。
【請求項１５】
前記細胞は哺乳類の細胞であることを特徴とする、請求項１３に記載の単離された細胞。
【請求項１６】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列か、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かを含むことを特徴とする、ワクチン。
【請求項１７】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質を含むことを特徴とする、ワクチン。
【請求項１８】
免疫調節組成物を治療上の有効量でそれを必要とする患者に投与するステップと、
前記免疫応答を変調するステップとを含むことを特徴とする、ｉｎ ｖｉｖｏで免疫応答を変調する方法。
【請求項１９】
免疫変調組成物が、配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体を含むことを特徴とする、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記免疫変調組成物は、配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質を含むことを特徴とする、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
治療上の有効量で免疫調節組成物を被験者に投与するステップと、
被験者の疾患又は障害を予防又は治療するステップとを含むことを特徴とする、それを必要とする被験者の疾患又は障害を予防又は治療する方法。
【請求項２２】
前記免疫変調組成物は、配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体を含むことを特徴とする、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記免疫変調組成物は、配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質を含むことを特徴とする、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
前記疾患又は障害は、免疫障害、自己免疫、癌、炎症、悪液質、神経変性疾患又は障害、神経性疾患又は障害、心不全、移植、又は、感染を含むことを特徴とする、請求項２１に記載の方法。
【請求項２５】
ゲノムが、配列番号１又は２に列挙される機能的ＳＴＩＮＧ遺伝子、それらの種バリアント又は変異体を欠損することを特徴とする、非ヒトトランスジェニック哺乳類。
【請求項２６】
非ヒト哺乳類がマウスであることを特徴とする、請求項２５に記載の非ヒトトランスジェニック哺乳類。
【請求項２７】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質の１種類又は２種類以上の抗原性エピトープに特異的であることを特徴とする、モノクローナル又はポリクローナルの抗体。
【請求項２８】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かを候補治療剤と接触するステップと、
（ｉ）前記薬剤は、前記ペプチドの機能か、パートナー分子と前記ペプチドとの相互作用かを変調するか、（ｉｉ）前記薬剤は、前記核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）の発現及び／又は機能を変調するかどうかを決定するステップと、
治療剤を同定するステップとを含むことを特徴とする、治療剤を同定する方法。
【請求項２９】
前記治療剤は、対照基準線と比較して前記ペプチド又は核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）の機能を抑制又は増大することを特徴とする、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記ペプチド又は核酸配列は、対照基準線と比較して免疫応答を抑制又は増大することを特徴とする、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
パートナー分子が、ＲＩＧ−Ｉ、Ｓｓｒ２、ＴＲＡＰ、ＳＥＣ６１、ＮＫ−ｋＢ、ＴＢＫ、ＩＰＳ−１、ＭＡＭ成分、エクソシスト成分、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩ及びクラスＩＩ成分、ＧＡＲＰ成分、トランスロコン成分、エンドソーム成分又はＩＲＦ３、ＩＲＦ７を含む、少なくとも１種類又は２種類以上の分子を含むことを特徴とする、請求項２８に記載の方法。
【請求項３２】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かを含むことを特徴とする、アジュバント。
【請求項３３】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かの治療上の有効量を前記患者に投与するステップと、
患者においてＤＮＡで誘導される自然免疫応答を変調するステップとを含むことを特徴とする、それを必要とする患者においてＤＮＡで誘導される自然免疫応答を変調する方法。
【請求項３４】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かの治療上の有効量を前記患者に投与するステップと、
患者においてウイルス感染を治療するステップとを含むことを特徴とする、患者においてウイルス感染を治療する方法。
【請求項３５】
オリゴヌクレオチドが特異的にハイブリダイゼーションし、ｉｎ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｔｒｏでＳＴＩＮＧの発現及び／又は機能を変調することを特徴とする、配列番号１又は２に列挙される核酸配列に相補的な少なくとも５個の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチド。
【請求項３６】
ホスフォチオエートヌクレオチド間結合と、アルキルホスホネート、ホスフォロジチオエート、アルカリホスフォノチオエート、ホスフォロアミダート、カルバメート、カルボナート、リン酸トリエステル、アセタミデート、カルボキシメチルエステル及び／又はそれらの組み合わせからなるグループから選択される少なくとも１つのヌクレオチド間結合との組み合わせを含むことを特徴とする、請求項３５に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３７】
前記オリゴヌクレオチドは、ペプチド核酸、固定核酸（ＬＮＡ）分子、アナログ、誘導体及び／又はそれらの組み合わせを含む少なくとも１つの改変された核酸塩基を任意に含むことを特徴とする、請求項３５に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３８】
前記オリゴヌクレオチドは、２’−Ｏ−メトキシエチルで改変された糖原子団、２’−Ｏ−メトキシで改変された糖原子団、２’−Ｏ−アルカリで改変された糖原子団又は二環糖原子団を含む改変された糖原子団を含むことを特徴とする、請求項３５に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３９】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの断片、バリアント又は変異体を含むことを特徴とする、バイオマーカー。
【請求項４０】
配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチド、ポリペプチド又はタンパク質を含むことを特徴とする、バイオマーカー。
【請求項４１】
配列番号３ないし５のいずれか１つを含むことを特徴とする、アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項４２】
配列番号３ないし５のいずれか１つが、前記配列番号１及び２に列挙される核酸配列に特異的にハイブリダイゼーションすることを特徴とする、請求項４１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項４３】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かの治療上の有効量を前記患者に投与するステップと、
患者において癌を治療するステップとを含むことを特徴とする、癌を治療する方法。
【請求項４４】
（ｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列、それらの活性型断片、バリアント又は変異体によってエンコードされるペプチドか、（ｉｉ）配列番号１又は２に列挙される核酸配列（Ｓｔｉｎｇ）、それらの活性型断片、バリアント又は変異体かの治療上の有効量を前記細胞又は患者に投与するステップと、
細胞又は患者においてＳＴＩＮＧを再構築するステップとを含むことを特徴とする、細胞又は患者においてＳＴＩＮＧを再構築する方法。
【請求項４５】
前記細胞は、トランスフォーメーションされた細胞、腫瘍細胞、感染された細胞又はそれらの組み合わせを含む異常な細胞であることを特徴とする、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
患者が、自己免疫疾患又は障害、炎症応答、癌、病原体による感染、遺伝性疾患、神経性疾患又は障害を含む症状に罹患していることを特徴とする、請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
ＳＴＩＮＧ、その断片、バリアント又は変異体を含むことを特徴とする、予後バイオマーカー。
【請求項４８】
ＳＴＩＮＧが、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド又はその組み合わせを含むことを特徴とする、請求項４７に記載の予後バイオマーカー。
【請求項４９】
対照と比較してＳＴＩＮＧを検出すること、又は、存在しないことが、初期疾患状態の予後指標であることを特徴とする、請求項４７に記載の予後バイオマーカー。
【請求項５０】
ＳＴＩＮＧ、ＴＲＡＰ−β、ＳＳＲ２、ＳＳＲ４、ＳＳＲ１、ＳＳＲ３、ＳＲＰＲ、ＴＲＡＭ１、ＤＤＯＳＴ、ＲＰＮ２、ＳＥＣ６１Ｂ、ＳＥＣ１１Ａ、ＳＲＰ１９、ＳＥＣ６１Ｇ、ＳＲＰ９、ＤＡＤ１、ＳＲＰ６８、ＳＰＣＳ２、ＳＥＣ１１Ｃ、ＳＴＴ３Ｂ、ＳＥＣ６１Ａ１、ＳＥＣ６１Ａ２、ＳＲＰ７２、ＥＲＯ１Ｌ、ＩＮＳ、ＲＰＮ１、ＳＰＣＳ１、ＳＰＣＳ３、ＳＲＰ１４、ＳＲＰ５４、ＳＲＰＲＢ、ＴＲＡＭ２、ＳＳＲ１、ＳＥＣ６１Ｇ、ＳＥＣ６１Ａ１、ＴＲＡＭ１、ＳＲＰ６８、ＳＲＰ１９、ＳＲＰ７２、ＳＲＰＲ、ＳＴＴ３Ｂ、ＤＥＲＬ２、ＤＥＲＬ３、ＥＤＥＭ１、ＳＥＣ６２、ＢＣＡＰ３１、ＥＢＩ−１７８８８１９、ＥＢＩ−７７６８３、ＥＸＯＣ２／Ｓｅｃ ５ ＳＥＲＧＥＦ、ＥＸＯＣ３、ＥＸＯＣ８、ＲＡＬＡ、ＥＸＯＣ７、ＥＸＯＣ４、ＥＸＯＣ５、ＲＡＬＢ、ＥＸＯＣ６、ＥＸＯＣ１、ＡＲＦ６、ＤＰＨ３、ＲＨＯＱ、ＴＲＩＰ１０、それらの断片、バリアント、変異体又は組み合わせを含むことを特徴とする、組成物。
【請求項５１】
ＴＲＡＰ−β、ＳＳＲ２、ＳＳＲ４、ＳＳＲ１、ＳＳＲ３、ＳＲＰＲ、ＴＲＡＭ１、ＤＤＯＳＴ、ＲＰＮ２、ＳＥＣ６１Ｂ、ＳＥＣ１１Ａ、ＳＲＰ１９、ＳＥＣ６１Ｇ、ＳＲＰ９、ＤＡＤ１、ＳＲＰ６８、ＳＰＣＳ２、ＳＥＣ１１Ｃ、ＳＴＴ３Ｂ、ＳＥＣ６１Ａ１、ＳＥＣ６１Ａ２、ＳＲＰ７２、ＥＲＯ１Ｌ、ＩＮＳ、ＲＰＮ１、ＳＰＣＳ１、ＳＰＣＳ３、ＳＲＰ１４、ＳＲＰ５４、ＳＲＰＲＢ、ＴＲＡＭ２、ＳＳＲ１、ＳＥＣ６１Ｇ、ＳＥＣ６１Ａ１、ＴＲＡＭ１、ＳＲＰ６８、ＳＲＰ１９、ＳＲＰ７２、ＳＲＰＲ、ＳＴＴ３Ｂ、ＤＥＲＬ２、ＤＥＲＬ３、ＥＤＥＭ１、ＳＥＣ６２、ＢＣＡＰ３１、ＥＢＩ−１７８８８１９、ＥＢＩ−７７６８３、ＥＸＯＣ２／Ｓｅｃ ５ ＳＥＲＧＥＦ、ＥＸＯＣ３、ＥＸＯＣ８、ＲＡＬＡ、ＥＸＯＣ７、ＥＸＯＣ４、ＥＸＯＣ５、ＲＡＬＢ、ＥＸＯＣ６、ＥＸＯＣ１、ＡＲＦ６、ＤＰＨ３、ＲＨＯＱ、ＴＲＩＰ１０、それらの断片、バリアント、変異体又は組み合わせを含むことを特徴とする、ＳＴＩＮＧと直接的又は間接的に相互作用又は会合する単離された分子。

【図１Ａ】

【図１Ｂ】

【図１Ｃ】

【図１Ｄ】

【図１Ｅ】

【図１Ｆ】

【図２Ａ】

【図２Ｂ】

【図２Ｃ】

【図２Ｄ】

【図２Ｅ】

【図２Ｆ】

【図２Ｇ】

【図２Ｈ】

【図２Ｉ】

【図２Ｊ】

【図２Ｋ】

【図２Ｌ】

【図２Ｍ】

【図２Ｎ】

【図２Ｏ】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図３Ｃ】

【図３Ｄ】

【図３Ｅ】

【図３Ｆ】

【図３Ｇ】

【図３Ｈ】

【図３Ｉ】

【図３Ｊ】

【図３Ｋ】

【図３Ｌ】

【図３Ｍ】

【図３Ｎ】

【図３Ｏ】

【図４Ａ】

【図４Ｂ】

【図４Ｃ】

【図４Ｄ】

【図４Ｅ】

【図４Ｆ】

【図４Ｇ】

【図４Ｈ】

【図４Ｉ】

【図４Ｊ】

【図４Ｋ】

【図４Ｌ】

【図５Ａ】

【図５Ｂ】

【図５Ｃ】

【図５Ｄ】

【図６Ａ】

【図６Ｂ】

【図７Ａ】

【図７Ｂ】

【図７Ｃ】

【図７Ｄ】

【図７Ｅ】

【図８Ａ】

【図８Ｂ】

【図９Ａ】

【図９Ｂ】

【図９Ｃ】

【図１０Ａ】

【図１０Ｂ】

【図１１】

【図１２Ａ】

【図１２Ｂ】

【図１２Ｃ】

【図１３Ａ】

【図１３Ｂ】

【図１３Ｃ】

【図１３Ｄ】

【図１３Ｅ】

【図１３Ｆ】

【図１３Ｇ】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１４Ｃ】

【図１４Ｄ】

【図１４Ｅ】

【図１４Ｆ】

【図１４Ｋ】

【図１５Ａ】

【図１５Ｂ】

【図１５Ｃ】

【図１５Ｄ】

【図１６Ａ】

【図１６Ｂ】

【図１６Ｃ】

【図１６Ｄ】

【図１６Ｅ】

【図１６Ｆ】

【図１６Ｇ】

【図１６Ｈ】

【図１６Ｉ】

【図１７】

【図１８Ａ】

【図１８Ｂ】

【図１８Ｃ】

【図１８Ｄ】

【図１８Ｅ】

【図１８Ｆ】

【図１９Ａ】

【図１９Ｂ】

【図１９Ｃ】

【図２０】

【図２１Ａ】

【図２１Ｂ】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９Ａ】

【図２９Ｂ】

【図３０Ａ】

【図３０Ｂ】

【図３０Ｃ】

【図３０Ｄ】

【図３０Ｅ】

【図３０Ｆ】

【図３０Ｇ】

【図３０Ｈ】

【図３０Ｉ】

【図３０Ｊ】

【図３０Ｋ】

【図３１Ａ】

【図３１Ｂ】

【図３１Ｃ】

【図３１Ｄ】

【図３２Ａ】

【図３２Ｂ】

【図３２Ｃ】

【図３２Ｄ】

【図３２Ｅ】

【図３２Ｆ】

【図３２Ｇ】

【図３２Ｈ】

【図３２Ｉ】

【図３３Ａ】

【図３３Ｂ】

【図３４Ａ】

【図３４Ｂ】

【図３４Ｃ】

【図３４Ｄ】

【図３４Ｅ】

【図３４Ｆ】

【図３５Ａ】

【図３５Ｂ】

【公表番号】特表２０１１−５２９７０８（Ｐ２０１１−５２９７０８Ａ）
【公表日】平成２３年１２月１５日（２０１１．１２．１５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５２２１９９（Ｐ２０１１−５２２１９９）
【出願日】平成２１年８月４日（２００９．８．４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０５２７６７
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０１７２４８
【国際公開日】平成２２年２月１１日（２０１０．２．１１）
【出願人】（３０７０２２０４４）ユニバーシティ　オブ　マイアミ (3)
【Ｆターム（参考）】