【課題】S.pneumoniaeのゲノムを特徴付ける必要性およびこの生物のポリヌクレオチドの提供。
【解決手段】単離された核酸。ならびに、コンピュータ読み出し可能な媒体であって、特定の配列で表記されたヌクレオチド配列、その代表的なフラグメント、または特定の配列に表記されたヌクレオチド配列と少なくとも95％同一なヌクレオチド配列を、該媒体上に記録されて有する、媒体；またはコンピュータ読み出し可能な媒体であって、特定の配列のフラグメントのいずれかひとつ、またはその縮重変異体を、該媒体上に記録されて有する、媒体。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸分子であって、
（ａ）表１に示されたポリヌクレオチドのアミノ酸の配列のいずれかをコードするヌクレオチド配列；または
（ｂ）（ａ）のヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列
からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一である核酸配列を有するポリヌクレオチド
を含む、核酸分子。
【請求項２】
単離された核酸分子であって、請求項１の（ａ）または（ｂ）のヌクレオチド配列に同一であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含み、
ここで、該ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにストリンジェントなハイブリダイゼーション条件でハイブリダイズしない、核酸分子。
【請求項３】
請求項１の（ａ）におけるアミノ酸を有するポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子。
【請求項４】
請求項３に記載の単離された核酸分子であって、前記ポリペプチドのエピトープ保有部分が、表２に列挙されたアミノ酸配列を有する、核酸分子。
【請求項５】
請求項１に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する、組換えベクターを作製するための方法。
【請求項６】
請求項５に記載される方法によって生成される組換えベクター。
【請求項７】
請求項６に記載される組換えベクターを宿主細胞に導入する工程を包含する、組換え宿主細胞を作製する方法。
【請求項８】
請求項７に記載の方法によって作製される組換え宿主細胞。
【請求項９】
請求項１に記載の核酸分子によってコードされるポリペプチドを生成するための方法であって、その異種ポリペプチドを発現するのに好ましい条件下で請求項８に記載の宿主細胞を培養する工程を包含する、方法。
【請求項１０】
請求項９に記載される方法により作製されるポリペプチド。
【請求項１１】
単離されたポリペプチドであって、表１に記載されるポリペプチドのいずれかのアミノ酸配列からなる群より選択される配列に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１２】
表２に示されたＳ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのエピトープのアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド抗原。
【請求項１３】
請求項９に記載のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項１４】
請求項１１に記載のポリペプチドに特異的に結合する単離された抗体。
【請求項１５】
請求項１４に記載の抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項１６】
ワクチンであって、
（１）表１で同定されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含むポリペプチドからなる群より選択される
１以上のＳ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅポリペプチド；および
（２）薬学的に受容可能である、希釈剤、担体、または賦形剤
を含み、ここで、該ポリペプチドが、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ属にメンバーに対し、動物において防御抗体を惹起するのに十分な量で存在する、
ワクチン。
【請求項１７】
Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ属にメンバーにより動物において引き起こされる感染を予防するかまたは弱毒化する方法であって、
請求項１１に記載のポリペプチドを該動物に投与する工程
を包含し、ここで、該ポリペプチドは、該感染を予防または弱毒化するのに効果的な量で投与される、方法。
【請求項１８】
Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓペプチドをコードするサンプル中における1以上の核酸配列をアッセイにするのに関連して、生物学的サンプルにおいてＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓの核酸を検出するための方法であって、
（ａ）ハイブリダイゼーションが生じるような条件下で該サンプルを1以上の上述したような核酸プローブと接触させる工程；および
（ｂ）該生物学的サンプルにおいて存在する1以上のＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ核酸配列に対する該1以上の核酸プローブのハイブリダイゼーションを検出する工程
を包含する、方法。
【請求項１９】
動物から得た生物学的サンプル中でＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ核酸を検出する方法であって、
（ａ）ポリメラーゼ連鎖反応を使用して該サンプル中の1以上のＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ核酸配列を増幅する工程；および
（ｂ）該増幅したＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ核酸を検出する工程
を包含する、方法。
【請求項２０】
動物から得た生物学的サンプル中でＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ抗体を検出するためのキットであって、
（ａ）固体支持体に結合している請求項１２に記載のポリペプチド；および
（ｂ）検出手段
を備える、キット。
【請求項２１】
動物から得た生物学的サンプル中でＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ抗体を検出するための方法であって、
（ａ）請求項１２に記載のポリペプチドと該サンプルを接触させる工程；および
（ｂ）抗体−抗原複合体を検出する工程
を包含する、方法。

【図１】

【図２】

【公開番号】特開２００８−３５８６５（Ｐ２００８−３５８６５Ａ）
【公開日】平成２０年２月２１日（２００８．２．２１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−２１１１７１（Ｐ２００７−２１１１７１）
【出願日】平成１９年８月１３日（２００７．８．１３）
【分割の表示】特願平１０−５２０７１８の分割
【原出願日】平成９年１０月３０日（１９９７．１０．３０）
【出願人】（５９７０１８３８１）ヒューマン　ジノーム　サイエンシーズ，　インコーポレイテッド (44)
【氏名又は名称原語表記】Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｏｍｅ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，　Ｉｎｃ．
【住所又は居所原語表記】９４１０　Ｋｅｙ　Ｗｅｓｔ　Ａｖｅｎｕｅ，　Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，　Ｍａｒｙｌａｎｄ　２０８５０，　Ｕｎｉｔｅｄ　Ｓｔａｔｅｓ　ｏｆ　Ａｍｅｒｉｃａ
【Ｆターム（参考）】