【課題】新規遺伝子９８Ｐ４Ｂ６（ＳＴＥＡＰ−２とも呼ばれる）およびそのコードタンパク質、ならびにその改変体、および、その利用の提供。
【解決手段】９８Ｐ４Ｂ６は、正常な成体組織における組織特異的発現を示し、これは、癌において異常に発現される。その結果、９８Ｐ４Ｂ６は、癌に対する診断的、予後的、予防的および／または治療的な標的となる。９８Ｐ４Ｂ６遺伝子もしくはそのフラグメント、またはそれらのコードタンパク質、それらの改変体もしくはそれらのフラグメントは、体液性免疫応答または細胞性免疫応答を惹起するために使用され、９８Ｐ４Ｂ６と反応性の抗体またはＴ細胞が、動免疫または受動免疫において使用される。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）図２のタンパク質のうちの８個、９個、１０個、または１１個連続するアミノ酸の
ペプチド；
ｂ）表ＶＩＩＩからＸＸＩのペプチド；
ｃ）表ＸＸＩＩ〜ＸＬＶのペプチド；または
ｄ）表ＸＬＶＩ〜ＸＬＩＸのペプチド
を含むか、これらから本質的になるか、またはこれらからなる、組成物。
【請求項２】
図２のタンパク質に関連するタンパク質を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
図２に示されるアミノ酸配列全体に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、
９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％相同である、請求項２に記載の
タンパク質。
【請求項４】
前記物質は、図２のタンパク質のアミノ酸配列に由来するＣＴＬポリペプチドまたはその
アナログを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記エピトープは図２のアミノ酸配列全体ではないという但し書きによってさらに限定さ
れる、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
前記ポリペプチドは図２のタンパク質のアミノ酸配列全体ではないという但し書きによっ
てさらに限定される、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
図２のアミノ酸配列に由来する抗体ポリペプチドエピトープを含む、請求項１に記載の組
成物。
【請求項８】
前記エピトープは図２のアミノ酸配列全体ではないという但し書きによってさらに限定さ
れる、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
前記抗体エピトープは、前記ペプチドの末端までの任意の整数増分にて図２の少なくとも
５アミノ酸のペプチド領域を含む、請求項７に記載の組成物であって、該エピトープは、
ａ）図５の親水性プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｂ）図６のヒドロパシープロフィールにおいて０．５未満の値を有するアミノ酸位置、
ｃ）図７の利用可能残基％プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位
置、
ｄ）図８の平均可撓性プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｅ）図９のβ−ターンプロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｆ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも２つの組み合わせ、
ｇ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも３つの組み合わせ、
ｈ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも４つの組み合わせ、
ｉ）ａ）〜ｅ）のうちの５つの組み合わせ、
から選択されるアミノ酸位置を含む、組成物。
【請求項１０】
請求項１に記載のタンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
図２に示される核酸分子を含む、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記コードされるタンパク質は図２のアミノ酸配列全体ではないという但し書きによって
さらに限定される、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
前記物質は、図２の核酸配列のコード配列を含むポリヌクレオチドを含む、請求項１１に
記載の組成物。
【請求項１４】
請求項１に記載のさらなるペプチドをコードするさらなるヌクレオチド配列をさらに含む
、請求項２２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１０に記載のポリヌクレオチドに完全に相補的なポリヌクレオチドを含む、組成物
。
【請求項１６】
図２のタンパク質に対する哺乳動物免疫応答を生成する方法であって、該方法は、
ａ）９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質、および／または
ｂ）該タンパク質をコードするヌクレオチド配列、
の一部に、該哺乳動物の免疫系の細胞を曝し、
それによって免疫応答が該タンパク質に対して生成される工程、
を包含する、方法。
【請求項１７】
請求項１６に記載の免疫応答を生成する方法であって、該方法は、
少なくとも１つのＴ細胞エピトープまたは少なくとも１つのＢ細胞エピトープを含む９
８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質を提供する工程；および
該エピトープを、哺乳動物免疫系Ｔ細胞またはＢ細胞それぞれと接触させ、それによっ
て、該Ｔ細胞またはＢ細胞が活性化される工程、
を包含する、方法。
【請求項１８】
請求項１７に記載の方法であって、前記免疫系細胞が、Ｂ細胞であり、それによって前記
誘導されたＢ細胞が、前記９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質に対して特異的に結合する抗体を
産生する、方法。
【請求項１９】
請求項１７に記載の方法であって、前記免疫系細胞が、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）であ
るＴ細胞であって、それによって、前記活性化されたＣＴＬが、前記９８Ｐ４Ｂ６関連タ
ンパク質を発現する自己細胞を殺傷する、方法。
【請求項２０】
請求項１７に記載の方法であって、前記免疫系細胞が、ヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ）である
Ｔ細胞であって、それによって、前記活性化されたＨＴＬが、サイトカインを分泌し、該
サイトカインは、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の細胞傷害性またはＢ細胞の抗体産生活性
を助長する、方法。
【請求項２１】
サンプル中において、９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質または９８Ｐ４Ｂ６関連ポリヌクレオ
チドの存在を検出する方法であって、該方法は、
該サンプルを、該９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質または９８Ｐ４Ｂ６関連ポリヌクレオチ
ドそれぞれに特異的に結合する物質と接触させる工程、および
該物質と該９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質との複合体、または該物質と該９８Ｐ４Ｂ６関
連ポリヌクレオチドとの複合体、それぞれが存在することを決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２２】
サンプル中の９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質の存在を検出するための、請求項２１に記載の
方法であって、該方法は、
該サンプルを抗体またはそのフラグメントと接触させる工程であって、該抗体またはそ
のフラグメントのいずれもが、該９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質と特異的に結合する工程；
および
該抗体またはそのフラグメントと該９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質との複合体が存在する
ことを決定する工程
を包含する、方法。
【請求項２３】
請求項２１に記載の方法であって、
癌に罹患している患者または癌に罹患していることが疑われる患者から前記サンプルを
採取する工程
をさらに包含する、方法。
【請求項２４】
サンプル中の図２のｍＲＮＡのタンパク質の存在を検出するための請求項２１に記載の方
法であって、該方法は、
少なくとも１つのプライマーを用いる逆転写によって該サンプルからｃＤＮＡを産生す
る工程；
該産生されたｃＤＮＡを、センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして９８
Ｐ４Ｂ６ポリヌクレオチドを使用して増幅する工程であって、ここで該センスプライマー
およびアンチセンスプライマーとして使用される９８Ｐ４Ｂ６ポリヌクレオチドが、９８
Ｐ４Ｂ６ ｃＤＮＡを増幅するように作用する、工程；ならびに
該増幅された９８Ｐ４Ｂ６ ｃＤＮＡの存在を検出する工程
を包含する、方法。
【請求項２５】
癌に罹患している患者または癌に罹患していることが疑われる患者に由来する生物学的サ
ンプル中の１つ以上の９８Ｐ４Ｂ６遺伝子産物をモニタリングするための、請求項２１に
記載の方法であって、該方法は、
個体に由来する組織サンプル中の細胞によって発現される１つ以上の９８Ｐ４Ｂ６遺伝
子産物の状態を決定する工程；
該そのように決定された状態を、対応する正常サンプル中の１つ以上の９８Ｐ４Ｂ６遺
伝子産物の状態と比較する工程；および
該正常サンプルに比較して、該サンプル中の１つ以上の９８Ｐ４Ｂ６の異常な遺伝子産
物の存在を同定する工程
を包含する、方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、該方法は、
９８Ｐ４Ｂ６ ｍＲＮＡの増加した遺伝子産物または９８Ｐ４Ｂ６タンパク質が１つ以
上存在するか否かを決定する工程であって、前記正常組織サンプルに対する前記試験サン
プル中の増加した遺伝子産物が１つ以上存在することは、癌の存在または状態を示す工程
、
をさらに包含する、方法。
【請求項２７】
前記癌が、表Ｉに示される組織に存在する、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
ａ）図２のタンパク質の状態を調節する物質、または
ｂ）図２のタンパク質によって調節される分子
を含み、図２のタンパク質を発現する細胞の状態が調節される、組成物。
【請求項２９】
生理学的に受容可能なキャリアをさらに含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
ヒト単位投与形態で請求項２８に記載の組成物を含有する、薬学的組成物。
【請求項３１】
前記物質が、抗体またはそのフラグメントを含み、該抗体またはそのフラグメントは、図
２のタンパク質に特異的に結合する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３２】
モノクローナルである、請求項３１に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項３３】
ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体である、請求項３１に記載の抗体。
【請求項３４】
請求項３１に記載の抗体を産生する、非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項３５】
請求項３２に記載の抗体を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項３６】
図２のタンパク質を発現する細胞に対して細胞毒性薬剤または診断剤を送達する方法であ
って、該方法は、
請求項４に記載の抗体またはそのフラグメントに結合されている細胞毒性薬剤または診
断剤を提供する工程；および、
該細胞を、該抗体−薬剤結合体またはフラグメント−薬剤結合体に曝露する工程、
を包含する、方法。
【請求項３７】
前記物質が、抗体またはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチドを含有し、該抗
体またはそのフラグメントのいずれもが、図２のタンパク質に免疫特異的に結合する、請
求項２８に記載の組成物。
【請求項３８】
前記物質が、
ａ）９８Ｐ４Ｂ６コード配列を有するポリヌクレオチドを切断するリボザイム、または
ｂ）該リボザイムをコードする核酸分子と；
生理学的に受容可能なキャリアと、
を含有する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３９】
前記物質が、ヒトＴ細胞を含み、ここで、該Ｔ細胞は、特定のＨＬＡ分子の状況で、９８
Ｐ４Ｂ６ペプチド部分配列を特異的に認識する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項４０】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する方法であって、該方法は、
請求項２８に記載の組成物を該細胞に投与する工程
を包含する、方法。
【請求項４１】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の方法であって、
該方法は、
抗体またはそのフラグメントを該細胞に投与する工程
を包含し、該抗体またはそのフラグメントのいずれもが、９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質に
特異的に結合する、方法。
【請求項４２】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の方法であって、
該方法は、
９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質を該細胞に投与する工程
を包含する、方法。
【請求項４３】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の方法であって、
該方法は、
９８Ｐ４Ｂ６関連タンパク質のコード配列を含むポリヌクレオチド、または９８Ｐ４Ｂ
６関連タンパク質のコード配列に相補的であるポリヌクレオチドを、該細胞に投与する工
程
を包含する、方法。
【請求項４４】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の方法であって、
該方法は、
図２のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを切断するリボザイムを該細胞に投与
する工程
を包含する、方法。
【請求項４５】
図２のタンパク質および特定のＨＬＡ分子を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０
に記載の方法であって、該方法は、
ヒトＴ細胞を該癌細胞に投与する工程
を包含し、ここで、該Ｔ細胞は、図２のタンパク質のペプチド部分配列を特異的に認識す
る一方で、該部分配列は、該特定のＨＬＡ分子の状況下に存在する、方法。
【請求項４６】
請求項４０に記載の方法であって、該方法は、
単鎖モノクローナル抗体をコードするヌクレオチドを送達するベクターを投与し、それ
によって該コードされる単鎖抗体が、図２のタンパク質を発現する癌細胞内で細胞内発現
される工程
を包含する、方法。

【図１】

【図２Ａ−１】

【図２Ａ−２】

【図２Ｂ−１】

【図２Ｂ−２】

【図２Ｂ−３】

【図２Ｃ−１】

【図２Ｃ−２】

【図２Ｄ−１】

【図２Ｄ−２】

【図２Ｄ−３】

【図２Ｅ−１】

【図２Ｅ−２】

【図２Ｆ−１】

【図２Ｆ−２】

【図２Ｆ−３】

【図２Ｇ−１】

【図２Ｇ−２】

【図２Ｇ−３】

【図２Ｈ−１】

【図２Ｈ−２】

【図２Ｈ−３】

【図２Ｈ−４】

【図２Ｈ−５】

【図２Ｉ−１】

【図２Ｉ−２】

【図２Ｊ−１】

【図２Ｊ−２】

【図２Ｊ−３】

【図２Ｋ−１】

【図２Ｋ−２】

【図２Ｌ−１】

【図２Ｌ−２】

【図２Ｌ−３】

【図２Ｍ−１】

【図２Ｍ−２】

【図２Ｍ−３】

【図２Ｎ−１】

【図２Ｎ−２】

【図２Ｏ−１】

【図２Ｏ−２】

【図２Ｏ−３】

【図２Ｐ−１】

【図２Ｐ−２】

【図２Ｐ−３】

【図２Ｑ−１】

【図２Ｑ−２】

【図２Ｒ−１】

【図２Ｒ−２】

【図２Ｒ−３】

【図２Ｓ−１】

【図２Ｓ−２】

【図２Ｓ−３】

【図２Ｔ−１】

【図２Ｔ−２】

【図２Ｕ−１】

【図２Ｕ−２】

【図２Ｕ−３】

【図２Ｖ−１】

【図２Ｖ−２】

【図２Ｖ−３】

【図２Ｗ−１】

【図２Ｗ−２】

【図２Ｘ−１】

【図２Ｘ−２】

【図２Ｘ−３】

【図２Ｙ−１】

【図２Ｙ−２】

【図２Ｙ−３】

【図２Ｙ−４】

【図２Ｚ−１】

【図２Ｚ−２】

【図２Ｚ−３】

【図２Ｚ−４】

【図２ＡＡ−１】

【図２ＡＡ−２】

【図２ＡＡ−３】

【図２ＡＡ−４】

【図２ＡＢ−１】

【図２ＡＢ−２】

【図２ＡＢ−３】

【図２ＡＢ−４】

【図２ＡＢ−５】

【図２ＡＣ−１】

【図２ＡＣ−２】

【図２ＡＣ−３】

【図２ＡＣ−４】

【図２ＡＤ−１】

【図２ＡＤ−２】

【図２ＡＤ−３】

【図２ＡＤ−４】

【図２ＡＤ−５】

【図２ＡＥ−１】

【図２ＡＥ−２】

【図２ＡＥ−３】

【図２ＡＥ−４】

【図２ＡＦ−１】

【図２ＡＦ−２】

【図２ＡＦ−３】

【図２ＡＦ−４】

【図２ＡＦ−５】

【図２ＡＧ−１】

【図２ＡＧ−２】

【図２ＡＧ−３】

【図２ＡＧ−４】

【図２ＡＨ−１】

【図２ＡＨ−２】

【図２ＡＨ−３】

【図２ＡＨ−４】

【図２ＡＨ−５】

【図２ＡＩ−１】

【図２ＡＩ−２】

【図２ＡＩ−３】

【図２ＡＩ−４】

【図２ＡＪ−１】

【図２ＡＪ−２】

【図２ＡＪ−３】

【図２ＡＪ−４】

【図２ＡＫ−１】

【図２ＡＫ−２】

【図２ＡＫ−３】

【図２ＡＫ−４】

【図２ＡＬ−１】

【図２ＡＬ−２】

【図２ＡＬ−３】

【図２ＡＬ−４】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図３Ｃ】

【図３Ｄ】

【図３Ｅ】

【図３Ｆ】

【図３Ｇ】

【図３Ｈ−１】

【図３Ｈ−２】

【図３Ｉ】

【図３Ｊ】

【図４Ａ】

【図４Ｂ−１】

【図４Ｂ−２】

【図４Ｃ】

【図４Ｄ】

【図５ａ】

【図５ｂ】

【図５ｃ】

【図５ｄ】

【図５ｅ】

【図６ａ】

【図６ｂ】

【図６ｃ】

【図６ｄ】

【図６ｅ】

【図７ａ】

【図７ｂ】

【図７ｃ】

【図７ｄ】

【図７ｅ】

【図８ａ】

【図８ｂ】

【図８ｃ】

【図８ｄ】

【図８ｅ】

【図９ａ】

【図９ｂ】

【図９ｃ】

【図９ｄ】

【図９ｅ】

【図１０ａ−１】

【図１０ａ−２】

【図１０ｂ】

【図１０ｃ−１】

【図１０ｃ−２】

【図１０ｃ−３】

【図１１−１】

【図１１−２】

【図１２−１】

【図１２−２】

【図１３−１】

【図１３−２】

【図１３−３】

【図１３−４】

【図１３−５】

【図１３−６】

【図１３−７】

【図１３−８】

【図１３−９】

【図１３−１０】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８Ａ】

【図１８Ｂ】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【公開番号】特開２０１０−２２０６２１（Ｐ２０１０−２２０６２１Ａ）
【公開日】平成２２年１０月７日（２０１０．１０．７）
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願２０１０−１１２７０２（Ｐ２０１０−１１２７０２）
【出願日】平成２２年５月１４日（２０１０．５．１４）
【分割の表示】特願２００４−５３４２２５（Ｐ２００４−５３４２２５）の分割
【原出願日】平成１５年６月１１日（２００３．６．１１）
【出願人】（５００５５３６５９）アジェンシス，インコーポレイテッド (35)
【Ｆターム（参考）】