種々の局面において、本教示は、タンパク質発現の絶対定量のためのシステム、方法、アッセイ、およびキットを提供する。種々の局面において、本教示は、１つまたはそれ以上の目的のサンプル中の１つまたはそれ以上の目的のタンパク質の濃度を求める方法を提供する。種々の局面において、本教示は、特徴的タンパク質フラグメントの標準サンプルおよび親−娘イオントランジションモニタリング（ＰＤＩＴＭ）を使用して、タンパク質の１つまたはそれ以上のアイソフォームの絶対濃度を求める方法を提供する。種々の実施形態において、１つのサンプル中の生体分子の複数のアイソフォームの絶対濃度、生物学的プロセスや複数のサンプルを組み合わせたものにおける複数のタンパク質の絶対濃度、またはそれらを組み合わせたものを、本教示を使用した複合的な方法で求めることができる。化学物質に対する生物学的システムの応答を評価する方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】抗原抗体反応のようなタンパク質間相互作用においてその結合部位を効率的に同定する手法を提供すること。
【解決手段】相互作用する第１のタンパク質と第２のタンパク質について、前記第１のタンパク質を支持体上に固定化し、前記第２のタンパク質を断片化して、前記第１のタンパク質に添加し、前記第１のタンパク質に捕捉された前記第２のタンパク質断片を分離し、分離された前記第２のタンパク質断片のアミノ酸配列を質量分析により解析して、前記第１のタンパク質に対する前記第２のタンパク質の結合部位を同定する。 （もっと読む）

【課題】 標識された酸化蛋白質に由来するピークを容易に且つ確実に特定可能とし、高感度且つ迅速な定量が可能な酸化蛋白質の定量方法を提供する。
【解決手段】 酸化変性を受けた酸化蛋白質を標識試薬によって標識し、質量分析により定量する。この時、標識試薬として、酸化蛋白質と反応する第１の標識試薬と、第１の標識試薬と同一の化学構造を有し構成原子の少なくとも一部が当該原子の同位体で置換された第２の標識試薬を用いる。また、第１の標識試薬で標識された酸化蛋白質と第２の標識試薬で標識された酸化蛋白質とを混合し、且つこれらの比率を変えて質量分析を行う。標識試薬としては、例えば２，４−ジニトロフェニルヒドラジン、及びフェニル基の炭素元素を安定同位体（^１３Ｃ）で置換した２，４−ジニトロフェニルヒドラジンを用いる。 （もっと読む）

本発明は、独特な標識試薬又は独特な標識試薬のセットを使用する質量分析によって分析物を調べるための方法、混合物、キット及び／又は組成物に関する。標識試薬は、異性体又は同重体であることができ、標識した分析物の多重分析に適した混合物を製造するのに使用できる。この分析物は、あらゆる分子であることができる。この分析物の非限定的な例としては、以下に限定されないが、タンパク質、ペプチド、オリゴヌクレオチド、糖質、脂質、ステロイド、アミノ酸及び１，５００ダルトン未満の小分子が挙げられる。 （もっと読む）

遺伝子発現分析のための方法およびキットが開示される。本方法は、プローブとして元素タグ付きオリゴヌクレオチドを利用し、それらは元素分析によってその後分析される。ビーズなどの元素標識支持体を用いる生体分子の分析と、その後の元素分析のための方法およびキットも開示される。元素分析は、誘導結合プラズマ質量分析（ＩＣＰ−ＭＳ）を用いて実施することができる。
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本発明は、質量分析法による分析物の決定に関係する方法、混合物、キットおよび組成物に関する。本発明は、質量分析による分析物（単数または複数）の決定に関する。分析物は、関心のあるいずれの分子であってもよい。複合混合物中の分析物の相対および／または絶対定量を可能にする固有の標識試薬を使用して、分析物を決定することができる。これらの標識試薬は、複合サンプル混合物の分析のためにセットで使用することができ、この場合、標識試薬は、異性体のものおよび／または同重体のものであり得る。
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【課題】従来技術の問題点を解決するオリゴマーの末端部分を配列決定するための方法の提供。
【解決手段】以下の工程を包含する、オリゴマーの末端部分を配列決定するための方法：（ａ）オリゴマーの末端に標識を共有結合させそして標識されたオリゴマーを形成するように、該オリゴマーを標識部分と接触させる工程であって、該標識部分は、１７から７７までの原子番号を有している少なくとも１つの元素を含有しており、ただし該元素はイオウまたはリン以外である、工程（ｂ）標識されたオリゴマーフラグメントを生じるように、酵素的、化学分解、または質量分析フラグメンテーション法を使用して、該標識されたオリゴマーをフラグメンテーションする工程；および（ｃ）少なくとも２つの末端残基の配列を決定するために、質量分析フラグメンテーション方法を使用して、該標識されたオリゴマーフラグメントを分析する工程。 （もっと読む）

本発明は、a) 定量されるアレルゲンに見出される配列と同一であり、かつ任意に特有であるアミノ酸配列を有する1又は複数のアレルゲン校正標準ペプチドの既知量を準備し、該アレルゲン校正標準ペプチドを任意に標識し、b) アレルゲンサンプルを分解してペプチドの混合物を得て、該ペプチドを1又は複数の標識物質で任意に標識し、ここで、少なくとも、分解されたアレルゲンサンプル中のペプチド又は校正標準ペプチドが標識され、分解されたアレルゲンサンプル中のペプチド及びアレルゲン校正標準ペプチドの両方が標識される場合、アレルゲン校正標準ペプチドの標識に用いられる標識物質が、分解されたアレルゲンサンプルのペプチドの標識に用いられる標識物質とは異なり、c) アレルゲン校正標準ペプチドの量を、分解されたアレルゲンサンプルの対応するペプチドの量と質量解析により相関させることにより、アレルゲンの絶対量を定量することを含む、アレルゲンサンプル中のアレルゲンの絶対量を定量する方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】本発明の目的は、ペプチドの選択的単離及び標識に基づく複雑なタンパク質試料を比較分析する改良した方法を提供することである。
【解決手段】質量標識体のグループを複数含む質量標識体セットであって、セット内の前記質量標識体は、それぞれ、切断可能なリンカーを介して質量正規化部に結合している質量マーカー部を有し、セット内の前記質量標識体は、互いに質量が同じであり、グループ内の前記質量標識体において、前記質量マーカー部の質量は同じであり、グループ間の前記質量標識体において、前記質量マーカー部の質量が異なり、前記質量マーカー部は、２つ以上のフラグメントにフラグメンテーション可能であり、グループ内の前記質量標識体間で、前記質量マーカー部の少なくとも１つの前記フラグメントの質量が異なることを特徴とする質量標識体セットの提供。 （もっと読む）

【課題】ＤＮＡの塩基配列、特にＤＮＡ固定化担体に固定されたＤＮＡの塩基配列を、短時間で簡便な処理によって解析するための手段を提供することを目的とする。
【解決手段】ＤＮＡの５´末端のリン酸基に、一般式（Ｉ）で表されるＣｅ^４＋配位子を結合させて、前記ＤＮＡの５´末端の塩基と該塩基に隣接する塩基との間のホスホジエステル結合を切断し、切断された末端塩基を、質量分析法により解析することを特徴とするＤＮＡの塩基配列解析方法。 （もっと読む）

【課題】 バイオアッセイに用いるプローブ分子の固定化に利用される微細な粒子状の基体等、微小な物体に対しても、必要に応じて多数種の標識を付す際に有効な物体の標識方法の提供。されには上記標識が施された物体の提供。
【解決手段】 微小な物体に対しても、それを構成する材料の一部として、予め選択される複数種の原子の種類数（ｎ）と、前記選択された原子個々の含有量の有無、あるいは、含有量の水準とを利用して、少なくとも二進法ｎ桁の数値情報に相当する、含有原子の組成条件に従って調製される標識用材料を用いることで、必要に応じて多数種の標識を付すが可能となる。さらには上記標識方法によって標識された物体によって、上記バイオアッセイが可能となる。 （もっと読む）

【課題】質量分析において生物分子を標識し検出するための質量標識体を提供する。
【解決手段】該質量標識体は、以下の構造
Ｘ−Ｌ−Ｍ
（式中、Ｘは質量マーカー部分である）からなり、Ｘは以下の基


（式中、環状ユニットは芳香族又は脂肪族であり、隣接した任意の２原子間の独立した０−３の二重結合からなり；各Ｚは独立してＮ、Ｎ（Ｒ^１）、Ｃ（Ｒ^１）、ＣＯ、ＣＯ（Ｒ^１）、Ｃ（Ｒ^１）_２、Ｏ又はＳであり；ＸはＮ、Ｃ又はＣ（Ｒ^１）であり；各Ｒ^１は独立してＨ、置換又は未置換の直鎖又は分岐Ｃ_１−Ｃ_６アルキル基、置換又は未置換環状脂肪族基、置換又は未置換芳香族基、又は置換又は未置換複素環基であり；及びｙは０−１０の整数であり、Ｌはアミド結合からなる開裂可能リンカーであり、Ｍは質量正規化部分である）からなる。 （もっと読む）

【課題】本発明は、ポリペプチドを修飾し、それによって、以前には質量分析法による検出から免れていたポリペプチドの質量分析法を用いた検出を可能にする、新規の分子を提供することを目的とする。
【解決手段】本発明は、以下の一般式の化合物、およびイオン化修飾剤としての該化合物の使用に関する：


式中、R、R'、R''、R'''、R''''、Xおよびnは本明細書ならびに特許請求の範囲に規定した通りである。本発明はさらに、以下の段階を含む、ポリペプチドまたはそれらのフラグメントを、標識形および非標識形の該ポリペプチドを含有する供給源から定量するための方法に関する：（a)イオン化修飾剤により、単離されたポリペプチドを修飾する段階、（b)調製されたポリペプチドまたはそれらのフラグメントを質量分析法によって分析し、それによりポリペプチドまたはそれらのフラグメントの供給源内に存在したポリペプチドまたはそれらのフラグメントの量を決定する段階。 （もっと読む）

一つ以上の翻訳後修飾を特定することによってcsPCNAの存在を検出する方法および組成物が開示される。メチルエステル化を含む翻訳後修飾を通じてcsPCNA異性体を特定する方法が開示される。 （もっと読む）

式（I）のイオンを形成する方法を提供する。該方法は、（ｉ）式（IIa）
の化合物を、Ｍと反応して共有結合を形成する能力を有する少なくとも１つの基を有するバイオポリマーＢ_Ｐと反応させて、式（IIIａ）のバイオポリマー誘導体を提供する工程；および（ｉｉ）Ｘと式（IIIa）の誘導体のα-炭素原子の間のＣ−Ｘ結合を開裂させて、式（II）のイオンを形成させる工程；を含み、式中、（IV）は正の単一電荷または負の単一電荷を持つ炭素原子であり；Ｘはα-炭素原子から切断されて式（I）のイオンを形成する能力を持つα-炭素に直接結合したチオエーテル硫黄原子を含む基である。

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【課題】プロテオーム解析のための迅速で、効率的でかつ費用効率的な方法の提供。
【解決手段】ポリペプチドを同定する方法であって、以下：（ａ）ポリペプチドの集団由来の親ポリペプチドのサブセットの質量と該親ポリペプチドのサブセットのフラグメントの質量を同時に決定する工程；（ｂ）注釈されたポリペプチドインデックスと該決定された質量を比較する工程；および（ｃ）該決定された質量を有する該注釈されたポリペプチドインデックスの１つ以上のポリペプチドを同定する工程、を包含する方法など。 （もっと読む）

本発明は、コレステロール逆輸送（ＲＣＴ）を測定するための生化学的方法に関する。具体的には、ＲＣＴの３つの成分（流出成分、血漿成分および排出成分）を、同位体標識コレステロールまたはコレステロール関連分子もしくはコレステロール関連複合体を投与するステップ、および続いて種々のコレステロールまたはコレステロール関連分子もしくはコレステロール関連複合体での同位体の希釈または出現、ならびにステロール最終産物（ＲＣＴの一部分である）中への回収を測定するステップにより、ｉｎ ｖｉｖｏで測定する。生体で初めて、組織から血中へのコレステロール流出速度と血液から体外へのコレステロール排出速度との組み合わせを表す、包括的ＲＣＴ流（Global RCT flux）のパラメータが作成される。そのような方法は、創薬および薬物開発、アテローム硬化その他の血管疾患および症状の診断および予後診断、疾患治療のための適正な用量の選択、ならびにＲＣＴ流を標的とする治療法のための被験体の選択に用いられる。 （もっと読む）

本発明は、（ａ）分子中の１つ以上の遊離アミノ基は、アミノ基と反応可能な反応性官能基、及び反応性官能基と結合する３級アミノ基を含む質量タグ試薬と反応する、及び（ｂ）分子を質量分析装置で特徴決定する１つ以上の遊離アミノ基を含む分子を質量分析装置で特徴決定する方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】 ハイブリダイゼーションプローブアレイ、プローブアレイのハイブリダイゼーションを検知する方法、ｃＤＮＡ特徴づける方法、および核酸の塩基配列を決定する方法を提供する。
【解決手段】 その各々が所定の鎖長の既知の塩基配列に結合された質量標識を有し、アレイの各々の質量標識を、必要に応じて既知の塩基配列と共に、質量分析法によりその塩基配列と関連づけることが可能である、ハイブリダイゼーションプローブアレイ。
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以下の工程：ａ）試料の調製、ｂ）場合により行われる、調製された試料希釈、ｃ）場合により希釈された試料の高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）／タンデム質量分析（ＭＳ／ＭＳ）による直接的な分析を含む、試料の５ｍｇ／ｋｇ以下の量で存在する１つ又はそれ以上の殺虫性化合物を分析するための方法。 （もっと読む）