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【課題】Kankファミリーの一種であるKank3遺伝子の疾病治療及び診断並びに創薬への利用を提供すること。
【解決手段】Kank3遺伝子は、従来知られていたKank遺伝子とは異なる有用性を見出し、以下の(a)または(b)のタンパク質を提供する。(a) 特定のアミノ酸配列からなるタンパク質。(b) (a)のアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列を含み、かつKank3タンパク質の有する癌細胞運動(移動)抑制機能と同等の機能を有するタンパク質。 (もっと読む)


【課題】 標的SNP塩基の3’側にすぐ隣接する塩基がTであり、もう一塩基隣の塩基がCであるときに、擬陽性の可能性が極めて低く、かつ明確にSNP判別が可能なアレル特異性プライマーを提供する。
【解決手段】 3’末端塩基をSNP対応塩基とし、かつ3’末端から2番目の塩基はGとし、かつ3’末端から3番目の塩基はAかTかCのいずれかとし、かつ3’末端から4番目の塩基から5’末端の塩基までの塩基配列を、標的SNP塩基から3’側に対して三塩基隣の塩基から所望の塩基までの配列に対して相補的に設計する。 (もっと読む)


【要約書】
本発明は、候補核酸配列中の特定のヌクレオチドに対して、正又は負の優先又は「加重」を提供するスコア化及び/又は順位決定工程を採用することによって、複数の標的核酸バリアントとハイブリッド形成するために最適化されるポリヌクレオチドプライマー及びプローブを設計するための方法を提供する。実行される具体的なスコア化又は順位決定工程は、プライマー及び/又はプローブに関して企図される使用、具体的な標的核酸配列及び前記標的核酸配列のバリアント数に依存する。本発明の方法は、先行技術におけるプライマー及びプローブよりも多くの標的核酸バリアントとハイブリッド形成するため、最適なプライマー及びプローブ配列を提供する。 (もっと読む)


多型と乳癌との間の相関関係を提供する。乳癌を診断、予後判定、および処置する方法を提供する。乳癌を診断、予後判定、および処置するためのシステムおよびキットを提供する。乳癌モジュレーターを同定する方法も記載する。上記方法は、生物またはそれに由来する生物学的サンプルについて乳癌の表現型を同定する方法であって、該方法が、図1または図2の多型から選択され、乳癌の表現型と関係がある多型またはそれと密接に連鎖している遺伝子座を該生物または生物学的サンプルにおいて検出する工程;および該多型または遺伝子座を該表現型と関連付ける工程;を含む。 (もっと読む)


【課題】 本発明の課題は、術後に再発した肺腺癌を判別する手段を提供することである。
【解決手段】 下記(i)〜(v)の工程により決定された遺伝子セットに含まれる遺伝子の発現を検出することを含む、肺腺癌の再発を予測する方法:
(i)術後に再発した肺腺癌特異的に発現した遺伝子群の発現データを標準化する;
(ii)高判別能遺伝子の順位付けを行い、高判別能遺伝子リストを作成する;
(iii)高判別能遺伝子リストから遺伝子セットを選択する;
(iv)工程(iii)の遺伝子セットの判別能力評価を行う;
(v)判別能力を有する遺伝子セットを決定する。 (もっと読む)


本発明は核酸の検出方法を提供するものであって、当該方法は、サンプルがマイクロ流体の流路内を往復し、核酸の量が核酸のUV吸収に基づいて決定されるマイクロ流体デバイスにおいてPCR反応を実施することを含む。 (もっと読む)


【課題】 標的SNP塩基の3’側にすぐ隣接する塩基がCであり、もう一塩基隣の塩基がAであるときに、擬陽性の可能性が極めて低く、かつ明確にSNP判別が可能なアレル特異性プライマーを提供する。
【解決手段】 3’末端塩基をSNP対応塩基とし、かつ3’末端から2番目および3番目の塩基からなる配列が、5’-AT-3’、5’-GT-3’、5’-CA-3’、5’-CT-3’のいずれかとし、かつ3’末端から4番目の塩基から5’末端の塩基までの塩基配列を、標的SNP塩基から3’側に対して三塩基隣の塩基から所望の塩基までの配列に対して相補的に設計する。 (もっと読む)


【課題】実汚染土壌の浄化に好適なバイオレメディエーション技術を提供すること。
【解決手段】ロドコッカス(Rhodococcus)属又はゴルドニア(Gordonia)属に属する微生物であって、土壌から採取した試料単位重量あたりのDNA量に基づき求められる土壌バクテリア数を一定値以上とする能力を有する、土壌浄化微生物。土壌から採取した試料単位重量当りのDNA量に基づいて求められる土壌バクテリア数を指標として微生物の評価を行う土壌浄化微生物のスクリーニング方法。並びに、土壌から採取した試料単位重量当りのDNA量に基づいて求められる土壌バクテリア数を指標として、土壌浄化処理を行う土壌浄化方法。 (もっと読む)


反応混合物内での光損傷緩和剤の混和および/または光損傷の閾値期間より短い期間における反応混合物の異なる観察領域の問い合わせのうちの1つもしくは複数により、照明された分析反応物内の1種もしくは複数種の反応物の光損傷を低減しおよび/または阻止するための組成物、デバイス、システムおよび方法に関する。 (もっと読む)


イヌに存在する1つまたはそれ以上のMHC対立遺伝子を同定するための方法であって、(a)表4〜6のいずれか1つにおける1つまたはそれ以上のMHC対立遺伝子について特定された多形性位置にもしくは各々の多形性位置に存在するヌクレオチドを決定するか、または表4〜6に特定される1つまたはそれ以上の多形性位置と連鎖不平衡にある多形性位置に存在するヌクレオチドを決定する工程と;(b)それから、このイヌにおける1つまたはそれ以上のMHC対立遺伝子の有無を同定する工程とを含む、方法。 (もっと読む)


【課題】
サルモネラO9群を特異的、高感度かつ迅速に検出する方法を提供すること。
【解決手段】
サルモネラO9群のインサーション・エレメント(Insertion Element)遺伝子に由来する塩基配列に着目し、サルモネラO9群の塩基配列と特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプライマーの塩基配列と、その組み合わせを見いだした。このプライマーを用いて、特異的、高感度かつ迅速にサルモネラO9群を検出する方法を確立し、サルモネラO9群検出用キットを開発した。 (もっと読む)


本発明は、新規な、試料中の核酸標的の複合的検出法に関連する。これは、線状化のための固有切断部位、および試料からパドロックプローブを単離するための結合対の第一の要素を含む新規のパドロックプローブを使用することにより達成される。三つの異なるパドロックプローブの設計が記載され、かつ、ライゲーション、増幅、ならびに定性的および定量的検出のための実施例が示される。これらの特徴の組み合わせにより、迅速、正確、かつ特異的な複合的検出アッセイが提供される。

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【課題】簡易な構造で、反応前にプローブ固定担体のプローブ部分への気泡の影響がなく、プローブと試料との信頼性の高い反応を行うことにより精度良い検査が可能となる反応装置を提供すること。
【解決手段】プローブ固定担体と試料とを反応させる反応場を反応室内に設けた反応装置に、反応室内の気体量を測定し、その測定値に基づいて反応場での反応環境の良否を判定する手段を設ける。 (もっと読む)


【課題】 遺伝子の特定部位を識別するアレル特異的プライマーに組み込んだ特異配列と蛍光標識プローブとを反応させ、発した蛍光の種類にとって遺伝子の塩基置換をリアルタイムに検査する方法。
【解決手段】 遺伝子の各塩基置換に対応したアレル特異的プライマーの5’側に特定の塩基配列をしたオリゴヌクレオチドを結合させ、同じ塩基配列を持つ蛍光標識プローブを混合してポリメラーゼ連鎖反応(PCR反応)を行い、蛍光標識プローブのFRET効果によって発した蛍光を検出することで、遺伝子の塩基置換をリアルタイムに検査する方法。 (もっと読む)


限定された量の遺伝子データが入手可能な、1つのまたは小さな組の細胞についての、または断片DNAからの、および数学的モデルを用いてありそうな表現型結果を予測するための遺伝子データ、および個体の所与の遺伝子、表現型および/または臨床的データ、および密接に関連する患者亜集団からの遺伝子型、表現型および/または臨床的データよりなる関連集合医療的データを判断するためのシステムおよび方法。標的個体についての遺伝子データを公知の方法を用いて獲得し、増幅し、貧弱に測定された塩基対、失われた対立遺伝子、および失われた領域を、標的ゲノムおよび遺伝的に関連する対象のゲノムの間の予測された同様性を用いて復元する。
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【課題】GSベクターが挿入された遺伝子を特定するため実用的な方法、個体の特定の表現型に関連する遺伝子を網羅的に同定する方法、並びに当該方法により酸化ストレスに対する抵抗性に関連する遺伝子及びそれがコードしているタンパク質を提供する。
【解決手段】遺伝子探索ベクター(GSベクター)が挿入されたゲノムにおける遺伝子を同定し、該遺伝子をゲノムに挿入された動物の中から、特定の表現型を有する個体を選別し、挿入されたゲノムにおける遺伝子を網羅的に同定する。また、特定された17種の酸化ストレス感受性遺伝子、及びそれがコードするタンパク質。さらに、特定された17種の遺伝子のうちの少なくとも1種の遺伝子が欠損した動物、及び当該動物を用いた抗酸化物質のスクリーニング方法。 (もっと読む)


本発明が提供するヌクレオチド・アナログ群は、例えば、二つ以上の塩基の反復を有したホモポリマー領域を含む核酸配列に有用であり、本発明は、このヌクレオチド・アナログを利用した配列法に関する。本発明が提供する方法および組成物は、テンプレート依存型の配列反応に単一の塩基を一回ずつ導入することが可能である。本発明により、標的核酸のホモポリマー領域を含む全領域についてテンプレート依存型の合成配列が可能になる。このため、さらに本発明により、ホモポリマー領域に存在するヌクレオチドの数が測定される。 (もっと読む)


【課題】固相担体表面を隔壁等で区画することなく多数個の検体に対して利用できる反応アレイを提供する。
【解決手段】固相担体2上に、二種以上の成分を液媒体を介して反応させるための反応単位であって、前記二種以上の成分のうち少なくとも一つの成分を前記固相担体表面に保持する複数個の反応単位20と、複数個の反応単位20を互いに隔離する隔離領域40と、を備え、隔離領域40は、反応単位20に供給された反応のための反応液を隣接する他の反応単位20に供給された反応液と分離して自立した液滴として保持できる程度の液媒体に対する非親和性を有する非親和性の表面を備えるようにする。 (もっと読む)


本発明は、構造P=N-Acc(式中、Accは、電子受容体または残基Rで置換された電子受容体であり、Rは任意の有機置換基である)を少なくとも1回含む修飾オリゴヌクレオチドおよびその作製方法に関する。 (もっと読む)


【課題】想定品種の複数の米粒中に混入した異品種の米粒割合を短時間で判定する方法を提供する。
【解決手段】被検査用の複数の米粒サンプルを粉砕した米粒粉砕物からDNAを抽出し、抽出されたDNAを増幅してこれをマイクロチップ電気泳動法に掛けた際に検出されたピークから、想定品種と異品種の各ピーク及びピーク強度値をそれぞれ特定する。即ち、前記DNAを増幅する際に複数の米粒品種に対して共通位置(塩基サイズb.p.)にピークが検出されるように設計した前記ポジティブプライマーを添加して検出されるピーク(陽性対照)のピーク強度値と、異品種のピーク強度値との割合(除算値)を算出するとともに、除算値と異品種混入割合との関係を表した検量線を予め求めておいて、該検量線に基づいて、前記算出した除算値に対応する値(異品種混入割合)を判定するものである。 (もっと読む)


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