分泌及び膜貫通ポリペプチドとそれをコードする核酸
【課題】ヒト組織由来の新規なポリペプチド及びそのポリペプチドをコードする核酸分子を提供する。
【解決手段】特定のアミノ酸配列を有するポリペプチド及びそのポリペプチドをコードする特定の核酸配列を有するポリヌクレオチドが提供され、更にその核酸分子配列を含むベクター及び宿主細胞、異種性ポリペプチド配列に融合したポリペプチドを含むキメラポリペプチド分子、ポリペプチドに結合する抗体及びポリペプチドを製造する方法も提供される。
【解決手段】特定のアミノ酸配列を有するポリペプチド及びそのポリペプチドをコードする特定の核酸配列を有するポリヌクレオチドが提供され、更にその核酸分子配列を含むベクター及び宿主細胞、異種性ポリペプチド配列に融合したポリペプチドを含むキメラポリペプチド分子、ポリペプチドに結合する抗体及びポリペプチドを製造する方法も提供される。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図15(配列番号:23)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図23(配列番号:40)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図31(配列番号:57)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)及び図73(配列番号:138)に示したヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項3】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図15(配列番号:23)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図23(配列番号:40)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図31(配列番号:57)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)及び図73(配列番号:138)に示したヌクレオチド配列の全長コード配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項4】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項5】
請求項1ないし4の何れか1項に記載の核酸を含んでなるベクター。
【請求項6】
ベクターで形質転換された宿主細胞に認識されるコントロール配列に作用可能に結合した請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項5に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
前記細胞がCHO細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
前記細胞が大腸菌である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項10】
前記細胞が酵母細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項11】
請求項7に記載の宿主細胞を、前記PROポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記PROポリペプチドを回収することを含んでなるPROポリペプチドの製造方法。
【請求項12】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項13】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較したとき少なくとも80%のポジティブのスコアを示す単離されたポリペプチド。
【請求項14】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項15】
異種アミノ酸配列に融合した請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項16】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項17】
前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのFc領域である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項18】
請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項19】
前記抗体がモノクローナル抗体、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である請求項18に記載の抗体。
【請求項20】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを伴うヌクレオチド配列;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項21】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチド;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを伴うポリペプチドの細胞外ドメイン;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチドの細胞外ドメイン;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項22】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを含有すると思われる試料中の、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドと接触させ、前記試料中のA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が前記試料中のA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項23】
前記試料がA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項22に記載の方法。
【請求項24】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項22に記載の方法。
【請求項25】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが固体支持体に付着している請求項22に記載の方法。
【請求項26】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを含有すると思われる試料中の、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと接触させ、前記試料中におけるA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が該試料中のJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項27】
前記試料がJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項26に記載の方法。
【請求項28】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項26に記載の方法。
【請求項29】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが固体支持体に付着している請求項26に記載の方法。
【請求項30】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項31】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項30に記載の方法。
【請求項32】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項30に記載の方法。
【請求項33】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項34】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項33に記載の方法。
【請求項35】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項33に記載の方法。
【請求項36】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチド、又は抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド、又は前記抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体を前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項37】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【請求項38】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチド、又は抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体、又はA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項39】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)に示したヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項3】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)に示したヌクレオチド配列の全長コード配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項4】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項5】
請求項1ないし4の何れか1項に記載の核酸を含んでなるベクター。
【請求項6】
ベクターで形質転換された宿主細胞に認識されるコントロール配列に作用可能に結合した請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項5に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
前記細胞がCHO細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
前記細胞が大腸菌である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項10】
前記細胞が酵母細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項11】
請求項7に記載の宿主細胞を、前記PROポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記PROポリペプチドを回収することを含んでなるPROポリペプチドの製造方法。
【請求項12】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項13】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較したとき少なくとも80%のポジティブのスコアを示す単離されたポリペプチド。
【請求項14】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項15】
異種アミノ酸配列に融合した請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項16】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項17】
前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのFc領域である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項18】
請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項19】
前記抗体がモノクローナル抗体、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である請求項18に記載の抗体。
【請求項20】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを伴うヌクレオチド配列;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項21】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチド;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを伴うポリペプチドの細胞外ドメイン;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチドの細胞外ドメイン;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項22】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを含有すると思われる試料中の、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドと接触させ、前記試料中のA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が前記試料中のA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項23】
前記試料がA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項22に記載の方法。
【請求項24】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項22に記載の方法。
【請求項25】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが固体支持体に付着している請求項22に記載の方法。
【請求項26】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを含有すると思われる試料中の、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと接触させ、前記試料中におけるA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が該試料中のJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項27】
前記試料がJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項26に記載の方法。
【請求項28】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項26に記載の方法。
【請求項29】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが固体支持体に付着している請求項26に記載の方法。
【請求項30】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項31】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項30に記載の方法。
【請求項32】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項30に記載の方法。
【請求項33】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項34】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項33に記載の方法。
【請求項35】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項33に記載の方法。
【請求項36】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチド、又は抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド、又は前記抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体を前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項37】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【請求項38】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチド、又は抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体、又はA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項1】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図15(配列番号:23)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図23(配列番号:40)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図31(配列番号:57)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)及び図73(配列番号:138)に示したヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項3】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図15(配列番号:23)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図23(配列番号:40)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図31(配列番号:57)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)及び図73(配列番号:138)に示したヌクレオチド配列の全長コード配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項4】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項5】
請求項1ないし4の何れか1項に記載の核酸を含んでなるベクター。
【請求項6】
ベクターで形質転換された宿主細胞に認識されるコントロール配列に作用可能に結合した請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項5に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
前記細胞がCHO細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
前記細胞が大腸菌である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項10】
前記細胞が酵母細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項11】
請求項7に記載の宿主細胞を、前記PROポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記PROポリペプチドを回収することを含んでなるPROポリペプチドの製造方法。
【請求項12】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項13】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較したとき少なくとも80%のポジティブのスコアを示す単離されたポリペプチド。
【請求項14】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項15】
異種アミノ酸配列に融合した請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項16】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項17】
前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのFc領域である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項18】
請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項19】
前記抗体がモノクローナル抗体、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である請求項18に記載の抗体。
【請求項20】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを伴うヌクレオチド配列;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項21】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチド;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを伴うポリペプチドの細胞外ドメイン;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図14(配列番号:22)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図20(配列番号:32)、図22(配列番号:39)、図24(配列番号:41)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、図72(配列番号:137)又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチドの細胞外ドメイン;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項22】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを含有すると思われる試料中の、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドと接触させ、前記試料中のA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が前記試料中のA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項23】
前記試料がA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項22に記載の方法。
【請求項24】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項22に記載の方法。
【請求項25】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが固体支持体に付着している請求項22に記載の方法。
【請求項26】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを含有すると思われる試料中の、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと接触させ、前記試料中におけるA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が該試料中のJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項27】
前記試料がJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項26に記載の方法。
【請求項28】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項26に記載の方法。
【請求項29】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが固体支持体に付着している請求項26に記載の方法。
【請求項30】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項31】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項30に記載の方法。
【請求項32】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項30に記載の方法。
【請求項33】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項34】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項33に記載の方法。
【請求項35】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項33に記載の方法。
【請求項36】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチド、又は抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド、又は前記抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体を前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項37】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【請求項38】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチド、又は抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体、又はA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項39】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項2】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)に示したヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項3】
図1(配列番号:3)、図3(配列番号:8)、図5(配列番号:10)、図7(配列番号:12)、図9(配列番号:14)、図11(配列番号:16)、図13(配列番号:21)、図17(配列番号:28)、図19(配列番号:31)、図21(配列番号:38)、図25(配列番号:51)、図27(配列番号:53)、図29(配列番号:55)、図33(配列番号:62)、図35(配列番号:64)、図37(配列番号:72)、図39(配列番号:77)、図41(配列番号:79)、図43(配列番号:83)、図45(配列番号:85)、図47(配列番号:90)、図49(配列番号:98)、図51(配列番号:103)、図53(配列番号:105)、図55(配列番号:107)、図57(配列番号:109)、図59(配列番号:114)、図61(配列番号:120)、図63(配列番号:125)、図67A-B(配列番号:129)、図69(配列番号:131)、図71(配列番号:136)に示したヌクレオチド配列の全長コード配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項4】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項5】
請求項1ないし4の何れか1項に記載の核酸を含んでなるベクター。
【請求項6】
ベクターで形質転換された宿主細胞に認識されるコントロール配列に作用可能に結合した請求項5に記載のベクター。
【請求項7】
請求項5に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項8】
前記細胞がCHO細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項9】
前記細胞が大腸菌である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項10】
前記細胞が酵母細胞である請求項7に記載の宿主細胞。
【請求項11】
請求項7に記載の宿主細胞を、前記PROポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、細胞培養物から前記PROポリペプチドを回収することを含んでなるPROポリペプチドの製造方法。
【請求項12】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項13】
図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、及び図74(配列番号:139)に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較したとき少なくとも80%のポジティブのスコアを示す単離されたポリペプチド。
【請求項14】
表10に示されたATCC受託番号で寄託されたDNAの全長コード配列によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項15】
異種アミノ酸配列に融合した請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項16】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項17】
前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのFc領域である請求項15に記載のキメラ分子。
【請求項18】
請求項12ないし14の何れか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項19】
前記抗体がモノクローナル抗体、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である請求項18に記載の抗体。
【請求項20】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを伴うヌクレオチド配列;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示したポリペプチドの細胞外ドメインをコードし、その関連シグナルペプチドを欠くヌクレオチド配列;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項21】
(a)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチド;
(b)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを伴うポリペプチドの細胞外ドメイン;又は
(c)図2(配列番号:4)、図4(配列番号:9)、図6(配列番号:11)、図8(配列番号:13)、図10(配列番号:15)、図12(配列番号:17)、図16(配列番号:24)、図18(配列番号:29)、図22(配列番号:39)、図26(配列番号:52)、図28(配列番号:54)、図30(配列番号:56)、図32(配列番号:58)、図34(配列番号:63)、図36(配列番号:65)、図38(配列番号:73)、図40(配列番号:78)、図42(配列番号:80)、図44(配列番号:84)、図46(配列番号:86)、図48(配列番号:91)、図50(配列番号:99)、図52(配列番号:104)、図54(配列番号:106)、図56(配列番号:108)、図58(配列番号:110)、図60(配列番号:115)、図62(配列番号:121)、図66(配列番号:128)、図68(配列番号:130)、図70(配列番号:132)、又は図74(配列番号:139)に示され、その関連シグナルペプチドを欠くポリペプチドの細胞外ドメイン;
と少なくとも80%の核酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項22】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを含有すると思われる試料中の、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドと接触させ、前記試料中のA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が前記試料中のA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項23】
前記試料がA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項22に記載の方法。
【請求項24】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項22に記載の方法。
【請求項25】
前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドが固体支持体に付着している請求項22に記載の方法。
【請求項26】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを含有すると思われる試料中の、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを検出する方法において、前記試料をA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと接触させ、前記試料中におけるA/J、B/K、C/L、C/M、C/N、C/J、D/O、E/P、F/Q、G/R、H/S又はI/Tポリペプチド抱合体の形成を測定することを含んでなり、ここで前記抱合体の形成が該試料中のJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドの存在を示すものであり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項27】
前記試料がJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドを発現すると思われる細胞を含んでいる請求項26に記載の方法。
【請求項28】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが検出可能な標識で標識されている請求項26に記載の方法。
【請求項29】
前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドが固体支持体に付着している請求項26に記載の方法。
【請求項30】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したJ、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項31】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項30に記載の方法。
【請求項32】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項30に記載の方法。
【請求項33】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞に生物活性分子を結合させる方法において、前記生物活性分子と結合したA、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されるポリペプチドと前記細胞を接触させ、前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIと前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTとを互いに結合させ、よって前記細胞に前記生物活性分子を結合させることを含んでなり、AがPRO533ポリペプチド、BがPRO301ポリペプチド、CがPRO187ポリペプチド、DがPRO337ポリペプチド、EがPRO1411ポリペプチド、FがPRO10096ポリペプチド、GがPRO246ポリペプチド、HがPRO6307ポリペプチド、IがPRO6003ポリペプチド、JがFGFR-4ポリペプチド、KがPRO301ポリペプチド、LがFGFR-3ポリペプチド、MがFGFR-1ポリペプチド、NがFGFR-2ポリペプチド、OがPRO6004ポリペプチド、PがPRO4356ポリペプチド、QがPRO2630ポリペプチド、RがPRO246ポリペプチド、SがPRO265ポリペプチド及びTがPRO941ポリペプチドである方法。
【請求項34】
前記生物活性分子が毒素、放射標識又は抗体である請求項33に記載の方法。
【請求項35】
前記生物活性分子が細胞死を引き起こす請求項33に記載の方法。
【請求項36】
A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチド、又は抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド、又は前記抗-A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチド抗体を前記A、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【請求項37】
前記細胞を死亡させる請求項36に記載の方法。
【請求項38】
J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTと命名されたポリペプチドを発現する細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節する方法において、A、B、C、D、E、F、G、H又はIと命名されたポリペプチド、又は抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体と前記細胞を接触させ、前記抗-J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチド抗体、又はA、B、C、D、E、F、G、H又はIポリペプチドを、前記J、K、L、M、N、O、P、Q、R、S又はTポリペプチドに結合させ、よって前記細胞の少なくとも一つの生物学的活性を調節することを含む方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42】
【図43】
【図44】
【図45】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図61】
【図62】
【図63】
【図64】
【図65】
【図66】
【図67】
【図68】
【図69】
【図70】
【図71】
【図72】
【図73】
【図74】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
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【図44】
【図45】
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【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図61】
【図62】
【図63】
【図64】
【図65】
【図66】
【図67】
【図68】
【図69】
【図70】
【図71】
【図72】
【図73】
【図74】
【公開番号】特開2006−68006(P2006−68006A)
【公開日】平成18年3月16日(2006.3.16)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2005−235120(P2005−235120)
【出願日】平成17年8月15日(2005.8.15)
【分割の表示】特願2001−503894(P2001−503894)の分割
【原出願日】平成12年5月22日(2000.5.22)
【公序良俗違反の表示】
(特許庁注:以下のものは登録商標)
1.UNIX
2.Macintosh
【出願人】(596168317)ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】GENENTECH,INC.
【Fターム(参考)】
【公開日】平成18年3月16日(2006.3.16)
【国際特許分類】
【出願日】平成17年8月15日(2005.8.15)
【分割の表示】特願2001−503894(P2001−503894)の分割
【原出願日】平成12年5月22日(2000.5.22)
【公序良俗違反の表示】
(特許庁注:以下のものは登録商標)
1.UNIX
2.Macintosh
【出願人】(596168317)ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】GENENTECH,INC.
【Fターム(参考)】
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