【課題】m/z範囲が限定された複数の測定モードが用意された質量分析装置において、インソース分解やクーリング時のイオン分解を利用した擬似ＭＳ³測定を実施する測定対象イオンのm/z範囲を広げることを可能とする。
【解決手段】全m/z範囲をカバーするように設定した複数の測定モードでそれぞれ目的試料に対するＭＳ¹スペクトルを取得するとともに、同試料に対しＭＳ²スペクトルを取得する（Ｓ１、Ｓ２）。そして、ＭＳ²スペクトルに存在するイオンピークと同m/zのピークが全ＭＳ1スペクトルにあるかどうかを判定し、同一m/zのイオンを擬似ＭＳ³測定対象イオンとして抽出する（Ｓ３）。全ＭＳ¹スペクトルの中で擬似ＭＳ³測定対象イオンのピーク強度が最大となる測定モードと該イオンのm/zを測定条件として擬似ＭＳ³測定を実施し、擬似ＭＳ³スペクトルを取得する（Ｓ４、Ｓ５）。 （もっと読む）

【課題】或るMS¹ピークをプリカーサイオンとしたMS²分析を実行する前にそのMS²分析結果を利用した物質同定の確率を定量的に推定することにより、同定作業の効率向上を図る。
【解決手段】同定確率推定モデル構築部３２は、既知試料から得られた多数の分画試料をMS¹、MS²分析し、同定を行った結果（成功／失敗）から、同定成功の確率が高いMS¹ピークのm/z及びSN比を把握し、MS¹ピークを順位付けするパラメータと、その順位に従ってMS²分析及び同定を行った場合の分析累積数と同定成功数との関係を示す同定確率推定モデルを表すパラメータを求め、記憶部３３に記憶しておく。目的試料中の物質同定に際しては、分析により得られたMS1ピークについてMS¹ピーク順位付けパラメータを用いて近似順位を求め、同定確率推定モデルを参照して近似順位から同定確率推定値を求める。例えば同定確率がを基にMS¹ピークを選択しMS²分析することで効率良く網羅的同定が可能である。 （もっと読む）

【課題】前立腺癌を示す健康状態を予測するための方法を提供する。
【解決手段】未決定健康状態を有する患者からの血液試料中の代謝産物と呼ばれる特定の小さい生化学物質の強度を測定し、これらの強度を健常個体の集団で観察される強度、及び／又は、確定された前立腺癌陽性個体の集団で観察された強度と比較する。本方法は、医師が、スクリーニングされた患者が前立腺癌に陽性である確率を決定することを可能にさせる。 （もっと読む）

【課題】試料に含まれる物質を網羅的に同定する際にＭＳ²分析する分画数を抑えることで分析時間を短縮しながら同定の正確性を確保する。
【解決手段】全ての分画試料をＭＳ¹分析した結果に基づき作成した、保持時間、m/z、信号強度を３軸とする３次元グラフに対し（S1-S2）、ωよりも大きな閾値θ_Nで強度を判定してピーク検出を行い、検出されたピークのピークトップが存在する分画試料をＭＳ²分析対象として選択する（S3-S5）。次に、選択された分画試料にピークトップが存在し、強度が閾値ω以上であるピークを検出し、検出されたピークをプリカーサイオン候補として挙げる（S6）。そして、選択された分画試料の含有物質が同定されるまでプリカーサイオン候補についてのＭＳ²分析を順次実行する（S7-S9,S14-S15）。１つの分画試料に対し多くのプリカーサイオン候補が挙げられるので、分画試料の含有物質の同定確率が高まる。 （もっと読む）

【課題】MS/MSイオンサーチやデノボシーケンシングによってペプチドが同定できないような場合でも、高い精度でペプチドの同定を可能とする。
【解決手段】低m/zのプリカーサイオンに対するMSⁿスペクトルは情報量が少ない反面、デノボシーケンシングにより高い信頼度でアミノ酸配列を推定できる。そこで、意図的にm/zが500以下であるプリカーサイオンに対するMSⁿスペクトルを取得し（S2-S6）、該スペクトルに対しデノボシーケンシングを実行してプリカーサイオンのm/zからm/z＝0までの間のアミノ酸配列を推定する。そして、推定されたアミノ酸配列、MSⁿ分析のプリカーサイオンm/z、及びMS²分析のプリカーサイオンm/zを用いてシーケンスタグを生成する（S7）。このタグの信頼度は高く、シーケンスタグサーチではタグが正確であれば正解ペプチドを見逃しなく検索可能であるから、高い精度でペプチド同定又は候補の絞り込みが行える（S8）。 （もっと読む）

【課題】 糖尿病の素因を効率的かつ確実に診断するための手段および方法の提供。
【解決手段】 本発明は、糖尿病の素因を有している疑いのある被験者の被験サンプル中の少なくとも１種の代謝物質を測定することと、該少なくとも１種の代謝物質を参照と比較することにより糖尿病の素因を診断することと、を含む、糖尿病の素因の診断方法に関する。さらに、本発明は、一群の代謝物質と、代謝物質の特性値を含むデータ集合と、該データ集合を含む記憶媒体と、を包含する。そのうえさらに、本発明はまた、サンプルの代謝物質の特性値を比較するための手段をデータ記憶媒体に作動的にリンクして含むシステムに関する。本発明にさらに包含されるのは、少なくとも１種の代謝物質を含む診断手段と、糖尿病の素因を診断するための診断手段を作製するための該少なくとも１種の代謝物質の使用と、である。最後に、本発明は、糖尿病関連代謝物質の同定方法に関する。 （もっと読む）

【課題】ガスクロマトグラフィと連結された質量分析計を含む質量分析計に関し、質量分析計を調整して、その性能を改善または回復させる。
【解決手段】質量分析計またはガスクロマトグラフ／質量分析計システムにおいて、水素等の調整ガスを添加して、イオン源等の質量分析計の１つ以上の構成要素または領域を調整または洗浄する。調整ガスは質量分析計の上流、試料入口またはクロマトグラフカラムの中に添加されてもよく、または質量分析計の中に直接添加されてもよい。調整ガスは質量分析計が試料を分析していないとき、オフラインで添加されてもよく、または試料分析中にオンラインで添加されてもよい。オンラインで添加されるとき、調整ガスはヘリウム等のキャリアガスと混合されてもよい。別の実施形態では、調整ガスはまたカラムを通るキャリアガスとして機能し、ヘリウムなどの別のガスがキャリアガス流に添加されてもよい。 （もっと読む）

【課題】MSⁿ分析によって得られたデータを基に未知物質の構造推定を容易に行うことのできる質量分析データ解析方法を提供する。
【解決手段】未知物質のプリカーサイオンの質量電荷比からその組成式を推定し（Ｓ１２）、該未知物質に類似する既知物質の構造式と所定の構造変化パターンを組み合わせることで該組成式と同様の組成式が得られる構造候補を作成する（Ｓ１４）。該構造候補から発生するフラグメントイオンピークを推定し（Ｓ１５）、それを基に前記構造候補を蓋然性の高い順にランク付けする(Ｓ１６）。次に、未知物質と既知物質のマススペクトルを比較し、両者に共通するフラグメントイオンピークを探索する（Ｓ１９）、共通するピークが存在した場合には該ピークに対応する既知物質の部分構造が未知物質にも含まれているものと推定し、該部分構造情報を基に上記構造候補の絞り込みを行う（Ｓ２１）。 （もっと読む）

【課題】翻訳後修飾を受けたタンパク質の同定を可能としたシステムにおいて非修飾タンパク質の同定性能の低下を防止するとともに同定時間の短縮化を図る。
【解決手段】公的なアミノ酸配列データベース等の登録情報など、既知のタンパク質のアミノ酸配列情報と翻訳後修飾情報とに基づいて、既知の修飾タンパク質のアミノ酸配列を含む同定用ＤＢ５を予め構築する。この際に、修飾されたアミノ酸を通常のアミノ酸と重複しない特定の記号で表記する。検索条件入力部４４から同定対象のデータと翻訳後修飾を含む検索条件が指定されると、ＤＢ検索部４３は指定されたデータを同定用ＤＢ５と照合してペプチドの候補を抽出する。修飾タンパク質は既知のものに限られるため検索空間はそれほど拡大しない。それによって、高い同定性能を確保しながら検索時間を短縮することができる。 （もっと読む）

【課題】夾雑物等の影響により目的化合物由来のプリカーサイオンピークにほかのピークが重なっているような場合でも、ＭＳ²スペクトル上のピークの中から目的化合物由来のプロダクトイオンピークを的確に選出し化合物同定等に供する。
【解決手段】取得したイメージングＭＳ²データからピクセル（測定点位置）とm/zとを行及び列とし強度値を要素とするデータマトリクスを作成し、目的化合物由来のプリカーサイオンの空間強度分布と類似した空間強度分布を示すm/z値を基準ピークとして選出する。目的化合物由来のプロダクトイオンは基準ピークと類似した空間強度分布を示す筈であるから、上記データマトリクスにおいて基準ピークと他ピークとのデータの相関計数を計算する。順相関で大きな相関係数値を与えるピークがプロダクトイオンピークであると判断し、該ピークのm/z値を選出して組成解析や同定処理に供する。 （もっと読む）

【課題】実測のＭＳ³スペクトルの情報を有効且つ的確に活用してペプチド同定の精度を向上させるとともに、同定したペプチドの信頼度を示す正確な定量情報を併せて提供する。
【解決手段】被検試料に対する実測ＭＳ²スペクトルに基づくデータベース検索により、複数の候補ペプチドを選出する。候補ペプチド一つ一つについて、理論ＭＳ³フラグメントの質量を求め、該質量の中で、対応するピークが実測ＭＳ³スペクトルに存在するが実測ＭＳ²スペクトルには存在しないものを抽出し、このピークを元の実測ＭＳ²スペクトルによるピークリストに追加する。そして、修正されたピークリストに基づいて候補ペプチドのスコアを再計算する。全ての候補ペプチドのスコアを再計算した後に、それを比較してスコア１位となる候補ペプチドが正解ペプチドであると判断し、スコアやスコア分布から計算される期待値とともに同定結果を出力する。 （もっと読む）

【課題】窒素原子含有量が大きい有機化合物のフラグメントイオンの炭素原子数を精度良く推定する方法。
【解決手段】第一の有機化合物を、また、第一の有機化合物の炭素原子数を変化させることにより得られる第二の有機化合物をイオン化させたイオンよりも質量電荷比が１大きい第一の、また、第二のプリカーサーイオンから生成するプロダクトイオンを質量分析する工程と、第一のプリカーサーイオンから生成するプロダクトイオンを質量分析することにより得られる、第一のフラグメントイオン及び第一のフラグメントイオンよりも質量電荷比が１小さい第二のフラグメントイオンのピークの高さの比を求める工程と、第二のプリカーサーイオンから生成するプロダクトイオンを質量分析することにより得られる、第一のフラグメントイオンに対応するフラグメントイオン及び第二のフラグメントイオンに対応するフラグメントイオンのピークの高さの比を求める工程を有する。 （もっと読む）

【課題】測定可能な時間が制限されている場合であっても、物質の有無の判定、種類の同定、又は物質の種類ごとの定量を高精度に行うことが可能な質量分析システムを提供する。
【解決手段】質量分析システムに、(1) 予め与えられた測定可能時間に応じ、MS分析及びMSⁿ分析（ただしn≧2）の組み合わせにより与えられる測定スケジュールを決定する動作計画部と、(2) 測定スケジュールを構成する各測定動作の実行により得られる各質量スペクトルを出力するタンデム型質量分析機能を有する質量分析部を搭載する。 （もっと読む）

【課題】Ｎ末端アミノ酸残基がグルタミンやカルバミドメチル化したシステインである場合、優先的な環化によってＮＨ₃やＨ₂Ｏが脱離するためにm/zずれが生じてペプチド同定が困難になる。本発明はこのようなＮ-結合型糖ペプチドに対しても高い精度でペプチドを同定することを目的とする。
【解決手段】ＭＳ²スペクトルに現れる糖鎖組成を示すピーク列についてデノボシーケンス処理を実施する際に、そのピークの１つとＭＳ²プリカーサとの質量電荷比差からＮＨ₃又はＨ₂Ｏ脱離によるm/zずれの有無を推定する（Ｓ４、Ｓ５）。さらに、ＭＳ²スペクトル上のＮ-結合型糖ペプチドに特徴的なトリプレットピークとＭＳ¹スペクトル上のトリプレットピークとの質量電荷比差からも同様のm/zずれの有無を推定する（Ｓ６、Ｓ７）。Ｎ末端アミノ酸残基の環化ありと判断されたならば、それをデータベース検索の際の検索条件の１つとすることでペプチドの同定精度を高める。 （もっと読む）

【課題】 イオン化効率やイオントラップに導入される測定対象物質の量の変動を補正して定量する。
【解決手段】 標準物質のイオンと測定対象物質のイオンを、イオントラップに同時にトラップし、質量選択的に排出した標準物質のイオンの信号強度と、測定対象物質のフラグメントイオンの信号強度から、測定対象物質の濃度を定量する。 （もっと読む）

【課題】分析部で選択イオンを変更するタイミングの制御を容易化することができる質量分析装置を提供すること。
【解決手段】蓄積部２０は、イオン源１０で生成されたイオンを蓄積し、蓄積したイオンをイオンパルスとして排出し、第１分析部３０は、蓄積部２０が排出するイオンパルスから、質量電荷比に基づいて第１の目的イオンを選択し、コリジョンセル３０は、第１の目的イオンの一部又は全部を開裂させてプロダクトイオンを生成し、第２分析部５０は、第１の目的イオン及びプロダクトイオンから、質量電荷比に基づいて第２の目的イオンを選択し、検出器６０は、第２の目的イオンを検出する。制御部９０は、第１分析部３０では質量が大きい第１の目的イオンほど光軸方向の運動エネルギーを高くし、第２分析部５０では質量が大きい第２の目的イオンほど光軸方向の運動エネルギーを高くするように制御する。 （もっと読む）

【課題】測定中に分析条件を変化させた場合でも、異なる条件間でマススペクトルを比較することができる液体クロマトグラフ質量分析装置を提供する。
【解決手段】本発明に係る液体クロマトグラフ質量分析装置では、ＬＣ／ＭＳ分析部１０から取得される検出信号に基づいてマススペクトルを作成するマススペクトル作成部１２と、作成されたマススペクトルの全イオン強度を各時刻毎に算出してトータルイオンクロマトグラムを作成するＴＩＣ作成部１３と、ＴＩＣ作成部１３で作成されたＴＩＣからピークを検出するピーク検出部１４と、各ピーク内に含まれる複数の時刻のマススペクトルを、全イオン強度を基準に正規化するマススペクトル正規化部１５と、を有する。 （もっと読む）

【課題】本発明は、個体差を含む試料に対する高い精度の計量や前処理を必要とせず、また、質量分析に関する専門的な知識・経験を有しない者が分析を行った場合においても、安定した同定を可能とし、オンサイト分析の実現を目的とする。
【解決手段】本発明の質量分析装置は、試料をイオン化するイオン化部５と、質量対電荷比（ｍ／ｚ）に応じてイオンを分離する質量分析部６と、質量分析部６で分離されたイオンを検出するイオン検出部７と、目的イオンの質量数とそのイオンのイオン強度の閾値を予め格納する測定・検出条件格納記憶部８を有し、質量分析（ＭＳ１）を行った際に、前記質量数のピークのイオン強度が、前記イオン強度を超える場合に、そのイオンを親イオンとして解離し、質量分析（ＭＳ２）を行う。 （もっと読む）

【課題】イオントラップからイオンを出射する際のターンアラウンドタイムを短縮することにより質量分解能を改善する。
【解決手段】イオン出射前のクーリング行程の最終段階で、捕捉電場を形成するためにリング電極に印加する矩形波電圧の周波数を数周期の期間だけ上昇させる。これにより、イオントラップ内部の閉じ込めポテンシャルが浅くなり、捕捉されているイオンの速度が下がる。そのため、矩形波電圧の印加が停止され加速電場が形成された際のイオンのターンアラウンドタイムが短くなり、同一質量電荷比のイオンの飛行時間のばらつきが小さくなる。閉じ込めポテンシャルが浅くなることでイオンは空間的に拡がるが、その拡がりがＴＯＦＭＳにおいて補正可能なエネルギ幅内に収まるように周波数を上昇させる時間を定めておくことにより、質量分解能を改善することができる。 （もっと読む）

【課題】ＭＳ²スペクトル上で観測されるイオンピークに目的化合物に由来しないピークが混じることを防止し、データベース検索による化合物同定の信頼性を向上させる。
【解決手段】ペプチドに対し質量分析を行って得られたマススペクトル上で、所定の選択条件に照らしてプリカーサイオンを選択しＭＳ²分析を実行する（Ｓ１〜Ｓ３）。取得されたＭＳ²スペクトル上でプリカーサイオンピークのm/z（Ｍp）とそれより５７[Da]低いm/z（Ｍp-５７）との範囲内にＭp−１７又はＭp−１８以外のイオンピークが存在したならば（Ｓ５、Ｓ６）、同位体ピーククラスタの一部が外れるように選択条件を変更した上でプリカーサイオンの選択を行い、再びＭＳ²分析を実行する（Ｓ８、Ｓ２−Ｓ３）。これにより、同位体ピーククラスタに重畳している夾雑ピークをプリカーサイオンから除外し、純度の高いＭＳ²スペクトルを取得することができる。 （もっと読む）