本発明は、ＩＶタンパク質またはその断片、変異体、あるいは誘導体をコード化する1個あるいはそれ以上の核酸領域から成る少なくとも１個のポリヌクレオチドを、ヒトの一組織へｉｎ ｖｉｖｏ投与することにより、ＩＶ感染に対する保護の必要性のあるヒトの免疫反応を高めることに関する。本発明はさらにまた、少なくとも１個のＩＶタンパク質またはその断片、変異体、あるいは誘導体を、ヒトの一組織へｉｎ ｖｉｖｏ投与することにより、ＩＶ感染に対する保護の必要性のあるヒトの免疫反応を高めることに関する。当該ＩＶタンパク質は、例えば、精製形態であってもよく、または不活性化ＩＶワクチンに存在するような不活性化ＩＶであってもよい。当該ポリヌクレオチドを、ヒトの細胞にｉｎ ｖｉｖｏで組み込み、免疫学的に効果的な量の免疫原性を有するＩＶのエピトープまたはその断片、変異体、あるいは誘導体を、ｉｎ ｖｉｖｏで生産する。当該ＩＶタンパク質（精製形態あるいは不活性化ＩＶワクチン形態）をまた、免疫学的に効果的な量で、投与する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
SEQ ID NO:2の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である前記単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約8個がTTTであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がTTCであり；
前記コード領域の３３個のロイシンコドンのうち約２個がTTAであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がTTGであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がCTTであり、前記ロイシンコドンのうち約６個がCTCであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がCTAであり、さらに前記ロイシンコドンのうち約１３個がCTGであり；
前記コード領域の２６個のイソロイシンコドンのうち約９個がATTであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がATCであり、さらに前記イソロイシンコドンのうち約４個がATAであり；
前記コード領域の２５個のメチオニンコドンがATGであり；
前記コード領域の２３個のバリンコドンのうち約４個がGTTであり、前記バリンコドンのうち約５個がGTGであり、前記バリンコドンのうち約３個がGTAであり、さらに前記バリンコドンのうち約１１個がGTGであり；
前記コード領域の４０個のセリンコドンのうち約７個がTCTであり、前記セリンコドンのうち約９個がTCCであり、前記セリンコドンのうち約６個がTCAであり、前記セリンコドンのうち約２個がTCGであり、前記セリンコドンのうち約６個がAGTであり、さらに前記セリンコドンのうち約１０個がAGCであり；
前記コード領域の１７個のプロリンコドンのうち約５個がCCTであり、前記プロリンコドンのうち約６個がCCCであり、前記プロリンコドンのうち約５個がCCAであり、さらに前記プロリンコドンのうち約２個がCCGであり；
前記コード領域の２８個のスレオニンコドンのうち約７個がACTであり、前記スレオニンコドンのうち約１０個がACCであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がACAであり、さらに前記スレオニンコドンのうち約３個がACGであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がGCTであり、前記アラニンコドンのうち約１６個がGCCであり、前記アラニンコドンのうち約９個がGCAであり、さらに前記アラニンコドンのうち約４個がGCGであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がTATであり前記チロシンコドンのうち約８個がTACであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がCATであり前記ヒスチジンコドンのうち約４個がCACであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がCAAであり前記グルタミンコドンのうち約１６個がCAGであり；
前記コード領域の２６個のアスパラギンコドンのうち約１２個がAATであり前記アスパラギンコドンのうち約１４個がAACであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がAAAであり前記リジンコドンのうち約１２個がAAGであり；
前記コード領域の２２個のアスパラギン酸コドンのうち約１０個がGATであり前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がGACであり；
前記コード領域の２６個のグルタミン酸コドンのうち約１１個がGAAであり前記グルタミン酸コドンのうち約１５個がGAGであり；
前記コード領域の６個のシステインコドンのうち約３個がTGTであり前記システインコドンのうち約３個がTGCであり；６個のトリプトファンコドンがTGGであり；
前記コード領域の４９個のアルギニンコドンのうち約４個がCGTであり、前記アルギニンコドンのうち約９個がCGCであり、前記アルギニンコドンのうち約５個がCGAであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がCGGであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がAGAであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がAGGであり；
前記コード領域の４１つのグリシンコドンのうち約７個がGGTであり、前記グリシンコドンのうち約１４個がGGCであり、前記グリシンコドンのうち約１０個がGGAであり、さらに前記グリシンコドンのうち約１０個がGGGであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項２】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:23を含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項３】
SEQ ID NO:2の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンがTTCであり、前記コード領域の３３個のロイシンコドンがCTGであり、前記コード領域の２６個のイソロイシンコドンがATCであり、前記コード領域の２５個のメチオニンコドンがATGであり、前記コード領域の２３個のバリンコドンがGTGであり、前記コード領域の４０個のセリンコドンがAGCであり、前記コード領域の１７個のプロリンコドンがCCCであり、前記コード領域の２８個のスレオニンコドンがACCであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンがGCCであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンがTACであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンがCACであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンがCAGであり、前記コード領域の２６個のアスパラギンコドンがAACであり、前記コード領域の２１つのリジンコドンがAAGであり、前記コード領域の２２個のアルパラギン酸コドンがGACであり、前記コード領域の３６個のグルタミン酸コドンがGAGであり、前記コード領域の６個のトリプトファンコドンがTGGであり、前記コード領域の４９個のアルギニンコドンがCGG、AGA、及びAGGから成る群から選択されており、さらに前記コード領域の４１つのグリシンコドンがGGCであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項４】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:24を含む、請求項３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
SEQ ID NO:2の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
３３個のロイシンコドンがCTGであり、１７個のプロリンコドンがCCCであり、３９個のアラニンコドンがGCCであり、２１つのグルタミンコドンがCAGであり、２６個のアルパラギンコドンがAACであり、２１つのリジンコドンがAAGであり、３６個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:1のヌクレオチド４６から１５４２から成り；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項６】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:25を含む、請求項５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2の少なくとも５０個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１から６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１から６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2をコードする、請求項８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０】
SEQ ID NO:2に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約8個がTTTであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がTTCであり；
前記コード領域の３３個のロイシンコドンのうち約２個がTTAであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がTTGであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がCTTであり、前記ロイシンコドンのうち約６個がCTCであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がCTAであり、さらに前記ロイシンコドンのうち約１３個がCTGであり；
前記コード領域の２６個のイソロイシンコドンのうち約９個がATTであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がATCであり、さらに前記イソロイシンコドンのうち約４個がATAであり；
前記コード領域の２５個のメチオニンコドンがATGであり；
前記コード領域の２３個のバリンコドンのうち約４個がGTTであり、前記バリンコドンのうち約５個がGTGであり、前記バリンコドンのうち約３個がGTAであり、さらに前記バリンコドンのうち約１１個がGTGであり；
前記コード領域の４０個のセリンコドンのうち約７個がTCTであり、前記セリンコドンのうち約９個がTCCであり、前記セリンコドンのうち約６個がTCAであり、前記セリンコドンのうち約２個がTCGであり、前記セリンコドンのうち約６個がAGTであり、さらに前記セリンコドンのうち約１０個がAGCであり；
前記コード領域の１７個のプロリンコドンのうち約５個がCCTであり、前記プロリンコドンのうち約６個がCCCであり、前記プロリンコドンのうち約５個がCCAであり、さらに前記プロリンコドンのうち約２個がCCGであり；
前記コード領域の２８個のスレオニンコドンのうち約７個がACTであり、前記スレオニンコドンのうち約１０個がACCであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がACAであり、さらに前記スレオニンコドンのうち約３個がACGであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がGCTであり、前記アラニンコドンのうち約１６個がGCCであり、前記アラニンコドンのうち約９個がGCAであり、さらに前記アラニンコドンのうち約４個がGCGであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がTATであり前記チロシンコドンのうち約８個がTACであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がCATであり前記ヒスチジンコドンのうち約４個がCACであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がCAAであり前記グルタミンコドンのうち約１６個がCAGであり；
前記コード領域の２６個のアスパラギンコドンのうち約１２個がAATであり前記アスパラギンコドンのうち約１４個がAACであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がAAAであり前記リジンコドンのうち約１２個がAAGであり；
前記コード領域の２２個のアスパラギン酸コドンのうち約１０個がGATであり前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がGACであり；
前記コード領域の２６個のグルタミン酸コドンのうち約１１個がGAAであり前記グルタミン酸コドンのうち約１５個がGAGであり；
前記コード領域の６個のシステインコドンのうち約３個がTGTであり前記システインコドンのうち約３個がTGCであり；６個のトリプトファンコドンがTGGであり；
前記コード領域の４９個のアルギニンコドンのうち約４個がCGTであり、前記アルギニンコドンのうち約９個がCGCであり、前記アルギニンコドンのうち約５個がCGAであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がCGGであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がAGAであり、さらに前記アルギニンコドンのうち約１０個がAGGであり；
前記コード領域の４１つのグリシンコドンのうち約７個がGGTであり、前記グリシンコドンのうち約１４個がGGCであり、前記グリシンコドンのうち約１０個がGGAであり、さらに前記グリシンコドンのうち約１０個がGGGであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:2に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2をコードする、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
SEQ ID NO:2に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンがTTCであり、前記コード領域の３３個のロイシンコドンがCTGであり、前記コード領域の２６個のイソロイシンコドンがATCであり、前記コード領域の２５個のメチオニンコドンがATGであり、前記コード領域の２３個のバリンコドンがGTGであり、前記コード領域の４０個のセリンコドンがAGCであり、前記コード領域の１７個のプロリンコドンがCCCであり、前記コード領域の２８個のスレオニンコドンがACCであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンがGCCであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンがTACであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンがCACであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンがCAGであり、前記コード領域の２６個のアスパラギンコドンがAACであり、前記コード領域の２１つのリジンコドンがAAGであり、前記コード領域の２２個のアルパラギン酸コドンがGACであり、前記コード領域の３６個のグルタミン酸コドンがGAGであり、前記コード領域の６個のトリプトファンコドンがTGGであり、前記コード領域の４９個のアルギニンコドンがCGG、AGA、及びAGGから成る群から選択されており、前記コード領域の４１つのグリシンコドンがGGCであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１４】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:2に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2をコードする、請求項１４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６】
SEQ ID NO:2に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:2のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
３３個のロイシンコドンがCTGであり、１７個のプロリンコドンがCCCであり、３９個のアラニンコドンがGCCであり、２１つのグルタミンコドンがCAGであり、２６個のアルパラギンコドンがAACであり、２１つのリジンコドンがAAGであり、３６個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:1のヌクレオチド４６から１５４２から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１７】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:2に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2をコードする、請求項１７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項１から１８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項１９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２１】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項２０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２２】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42から成る群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項２１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２３】
SEQ ID NO:43を含む、請求項２２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２４】
前記異種のポリペプチドがインフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインである、請求項２０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２５】
前記インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインがSEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４を含む、請求項２４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に可能にプロモータが附随している、請求項１から２５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２７】
ＲＮＡである、請求項１から２５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２８】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項２７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２９】
請求項１から２８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項３０】
プラスミドである、請求項２９に記載のベクター。
【請求項３１】
請求項１から２８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項３２】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物から成る群から選択される構成成分を含む、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３３】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ (MPL + TDM)；
(c) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(d) CRL1005/BAK
から成る群から選択される、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３４】
前記アジュバントが、((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
から成る群から選択される、請求項３３に記載の組成物。
【請求項３５】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項３４に記載の組成物。
【請求項３６】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３７】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物が、CRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３８】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
から成る群から選択される濃度で存在する、請求項３７に記載の組成物。
【請求項３９】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、及びポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項３７あるいは請求項３８に記載の組成物。
【請求項４０】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項１から２９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項４１】
SEQ ID NO:4の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の７個のフェニルアラニンコドンのうち約３個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約4個がＴＴＣであり；
前記コード領域の２６個のロイシンコドンのうち約２個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１１個がＣＴＧであり；
前記コード領域の１１つのイソロイシンコドンのうち約４個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約５個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約２個がＡＴＡであり；
前記コード領域の１４個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の１６個のバリンコドンのうち約３個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約４個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約２個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約８個がＧＴＧであり；
前記コード領域の１８個のセリンコドンのうち約３個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約４個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約３個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約１個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約３個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約４個がＡＧＣであり；
前記コード領域の８個のプロリンコドンのうち約２個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約３個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約１個がＣＣＧであり；
前記コード領域の１８個のスレオニンコドンのうち約４個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約７個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約５個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約２個がＡＣＧであり；
前記コード領域の２５個のアラニンコドンのうち約７個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約１０個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約６個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約３個がＧＣＧであり；
前記コード領域の５個のチロシンコドンのうち約２個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約３個がＴＡＣであり；
前記コード領域の５個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約３個がＣＡＣであり；
前記コード領域の１５個のグルタミンコドンのうち約４個がＣＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１１個がＣＡＧであり；
前記コード領域の１１つのアスパラギンコドンのうち約５個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約６個がＡＡＣであり；
前記コード領域の１３個のリジンコドンのうち約５個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約８個がＡＡＧであり；
前記コード領域の６個のアスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＣであり；
前記コード領域の１７個のグルタミン酸コドンのうち約７個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約１０個がＧＡＧであり；
前記コード領域の３個のシステインコドンのうち約１個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約２個がＴＧＣであり；
前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の１７個のアルギニンコドンのうち約１個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約２個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約４個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＡＧＧであり；および
前記コード領域の１６個のグリシンコドンのうち約３個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約６個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約４個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約４個がＧＧＧであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項４２】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:26を含む、請求項４１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４３】
SEQ ID NO:4の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の７個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の２６個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の１１つのイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の１４個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の１６個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の１８個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の１８個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の２５個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の５個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の１５個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の１１つのアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の１３個のリジンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の６個のアスパラギン酸はＧＡＣであり、前記コード領域の１７個のグルタミン酸はＧＡＧであり、前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の１７個のアルギニンコドンはＣＧＧ，ＡＧＡ及びＡＧＧからなる群から選択され、前記コード領域の１６個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項４４】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:27を含む、請求項４３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４５】
SEQ ID NO:4の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
２６個のロイシンコドンがCTGであり、８個のプロリンコドンがCCCであり、２５個のアラニンコドンがGCCであり、１５個のグルタミンコドンがCAGであり、１１つのアルパラギンコドンがAACであり、１３個のリジンコドンがAAGであり、１７個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:3のヌクレオチド２６から７８４から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項４６】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:28を含む、請求項４５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4の少なくとも５０個の連続したアミノ酸をコードする、請求項４１から４６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項４１から４７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４９】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4をコードする、請求項４１から４８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５０】
SEQ ID NO:4に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の７個のフェニルアラニンコドンのうち約３個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約4個がＴＴＣであり；
前記コード領域の２６個のロイシンコドンのうち約２個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１１個がＣＴＧであり；
前記コード領域の１１つのイソロイシンコドンのうち約４個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約５個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約２個がＡＴＡであり；
前記コード領域の１４個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の１６個のバリンコドンのうち約３個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約４個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約２個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約８個がＧＴＧであり；
前記コード領域の１８個のセリンコドンのうち約３個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約４個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約３個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約１個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約３個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約４個がＡＧＣであり；
前記コード領域の８個のプロリンコドンのうち約２個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約３個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約１個がＣＣＧであり；
前記コード領域の１８個のスレオニンコドンのうち約４個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約７個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約５個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約２個がＡＣＧであり；
前記コード領域の２５個のアラニンコドンのうち約７個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約１０個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約６個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約３個がＧＣＧであり；
前記コード領域の５個のチロシンコドンのうち約２個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約３個がＴＡＣであり；
前記コード領域の５個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約３個がＣＡＣであり；
前記コード領域の１５個のグルタミンコドンのうち約４個がＣＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１１個がＣＡＧであり；
前記コード領域の１１つのアスパラギンコドンのうち約５個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約６個がＡＡＣであり；
前記コード領域の１３個のリジンコドンのうち約５個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約８個がＡＡＧであり；
前記コード領域の６個のアスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＣであり；
前記コード領域の１７個のグルタミン酸コドンのうち約７個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約１０個がＧＡＧであり；
前記コード領域の３個のシステインコドンのうち約１個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約２個がＴＧＣであり；
前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の１７個のアルギニンコドンのうち約１個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約２個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約４個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＡＧＧであり；および
前記コード領域の１６個のグリシンコドンのうち約３個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約６個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約４個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約４個がＧＧＧであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項５１】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:2に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項５０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５２】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4をコードする、請求項５１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５３】
SEQ ID NO:4に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の７個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の２６個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の１１つのイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の１４個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の１６個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の１８個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の１８個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の２５個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の５個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の１５個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の１１つのアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の１３個のリジンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の６個のアスパラギン酸はＧＡＣであり、前記コード領域の１７個のグルタミン酸はＧＡＧであり、前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の１７個のアルギニンコドンはＣＧＧ，ＡＧＡ，ＡＧＧであり、前記コード領域の１６個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項５４】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:4に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項５３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５５】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4をコードする、請求項５４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５６】
SEQ ID NO:4に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:4のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
２６個のロイシンコドンがCTGであり、８個のプロリンコドンがCCCであり、２５個のアラニンコドンがGCCであり、１５個のグルタミンコドンがCAGであり、１１つのアルパラギンコドンがAACであり、１３個のリジンコドンがAAGであり、１７個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:3のヌクレオチド２６から７８４から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:4に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項５７】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:4に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項５６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:4をコードする、請求項５７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５９】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項４１から５８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６０】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項５９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６１】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項６０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６２】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６３】
SEQ ID NO:41を含む、請求項６２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６４】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項４１から６３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６５】
ＲＮＡである、請求項４１から６３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６６】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項６５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６７】
請求項４１から６６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドから成るベクター。
【請求項６８】
プラスミドである、請求項６７に記載のベクター。
【請求項６９】
請求項４１から６６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項７０】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される構成要素から成る、請求項６９に記載の組成物。
【請求項７１】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジコリノミコレートＡＦ (MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７２】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項７１に記載の組成物。
【請求項７３】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項７２に記載の組成物。
【請求項７４】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７５】
前記アジュバントあるいは形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）から成る、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７６】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項７５に記載の組成物。
【請求項７７】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせることにより製剤化した、請求項７５あるいは請求項７６に記載の組成物。
【請求項７８】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項４１から６６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項７９】
SEQ ID NO:5の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の４個のフェニルアラニンコドンのうち約２個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約２個がＴＴＣであり；
前記コード領域の１０個のロイシンコドンのうち約１個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の８個のイソロイシンコドンのうち約３個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約４個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約１個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の４個のバリンコドンのうち約１個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約１個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約０個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約２個がＧＴＧであり；
前記コード領域の７個のセリンコドンのうち約１個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約１個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約０個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約１個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約２個がＡＧＣであり；
前記コード領域の４個のプロリンコドンのうち約１個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約１個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約０個がＣＣＧであり；
前記コード領域の４個のスレオニンコドンのうち約１個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約１個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約０個がＡＣＧであり；
前記コード領域の５個のアラニンコドンのうち約１個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約２個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約１個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約１個がＧＣＧであり；
前記コード領域の３個のチロシンコドンのうち約１個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約２個がＴＡＣであり；
前記コード領域の２個のヒスチジンコドンのうち約１個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約１個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２個のグルタミンコドンのうち約１個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１個がＣＡＧであり；
前記コード領域の３個のアスパラギンコドンのうち約１個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約２個がＡＡＣであり；
前記コード領域の５個のリジンコドンのうち約２個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約３個がＡＡＧであり；
前記コード領域の５個のアスパラギン酸コドンのうち約２個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＣであり；
前記コード領域の９個のグルタミン酸コドンのうち約４個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約５個がＧＡＧであり；
前記コード領域の３個のシステインコドンのうち約１個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約２個がＴＧＣである；前記コード領域の２個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の７個のアルギニンコドンのうち約１個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＡＧＧであり；
前記コード領域の８個のグリシンコドンのうち約１個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約３個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約２個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約２個がＧＧＧであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項８０】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:29を含む、請求項７９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８１】
SEQ ID NO:5の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の４個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の１０個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の８個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の７個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の４個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の４個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の５個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の３個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の２個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の３個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の５個のリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の５個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の２個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の７個のアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ，あるいはＡＧＧであり、さらに前記コード領域の８個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項８２】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:30を含む、請求項８１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８３】
SEQ ID NO:5の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
１０個のロイシンコドンがCTGであり、４個のプロリンコドンがCCCであり、５個のアラニンコドンがGCCであり、２個のグルタミンコドンがCAGであり、３個のアルパラギンコドンがAACであり、５個のリジンコドンがAAGであり、さらに９個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域が、NO:3のヌクレオチド７４０から１００７にフレーム内で融合されているSEQ ID NO:3のヌクレオチド２６から５１から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項８４】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:31を含む、請求項８３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８５】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４をコードする、請求項７９から８３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８６】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5の少なくとも５０個のアミノ酸をコードする、請求項７９から８１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項７９から８６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5をコードする、請求項７９から８７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項８９】
SEQ ID NO:5に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の４個のフェニルアラニンコドンのうち約２個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約２個がＴＴＣであり；
前記コード領域の１０個のロイシンコドンのうち約１個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約１個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の８個のイソロイシンコドンのうち約３個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約４個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約１個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の４個のバリンコドンのうち約１個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約１個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約０個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約２個がＧＴＧであり；
前記コード領域の７個のセリンコドンのうち約１個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約１個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約０個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約１個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約２個がＡＧＣであり；
前記コード領域の４個のプロリンコドンのうち約１個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約１個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約０個がＣＣＧであり；
前記コード領域の４個のスレオニンコドンのうち約１個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約１個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約０個がＡＣＧであり；
前記コード領域の５個のアラニンコドンのうち約１個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約２個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約１個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約１個がＧＣＧであり；
前記コード領域の３個のチロシンコドンのうち約１個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約２個がＴＡＣであり；
前記コード領域の２個のヒスチジンコドンのうち約１個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約１個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２個のグルタミンコドンのうち約１個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１個がＣＡＧであり；
前記コード領域の３個のアスパラギンコドンのうち約１個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約２個がＡＡＣであり；
前記コード領域の５個のリジンコドンのうち約２個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約３個がＡＡＧであり；
前記コード領域の５個のアスパラギン酸コドンのうち約２個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約３個がＧＡＣであり；
前記コード領域の９個のグルタミン酸コドンのうち約４個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約５個がＧＡＧであり；
前記コード領域の３個のシステインコドンのうち約１個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約２個がＴＧＣである；前記コード領域の２個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の７個のアルギニンコドンのうち約１個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１個がＡＧＧであり；
前記コード領域の８個のグリシンコドンのうち約１個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約３個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約２個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約２個がＧＧＧであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項９０】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:5に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項８９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９１】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5をコードする、請求項９０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９２】
SEQ ID NO:5に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の４個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の１０個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の８個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の７個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の４個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の４個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の５個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の３個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の２個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の３個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の５個のリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の５個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の２個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の７個のアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ及びＡＧＧからなる群から選択され、前記コード領域の８個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項９３】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:5に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項９２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９４】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5をコードする、請求項９３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９５】
SEQ ID NO:5に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:5のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
１０個のロイシンコドンがCTGであり、４個のプロリンコドンがCCCであり、５個のアラニンコドンがGCCであり、２個のグルタミンコドンがCAGであり、３個のアルパラギンコドンがAACであり、５個のリジンコドンがAAGであり、９個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域が、NO:3のヌクレオチド７４０から１００７にフレーム内で融合されているSEQ ID NO:3のヌクレオチド２６から５１から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:5に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項９６】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:2に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項９５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:5をコードする、請求項９６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９８】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項７９から９７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９９】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項９８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１００】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項９９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０１】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項１００に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０２】
前記異種のポリペプチドがＡ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質である、請求項１００に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０３】
前記Ａ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質がSEQ ID NO:2から成る、請求項１０２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０４】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項７９から１０３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０５】
ＲＮＡである、請求項７９から１０３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０６】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項１０５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０７】
請求項７９から１０６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドから成るベクター。
【請求項１０８】
プラスミドである、請求項１０７に記載のベクター。
【請求項１０９】
請求項７９から１０６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項１１０】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される構成成分を含む、請求項１０９に記載の組成物。
【請求項１１１】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよび [mono-phosphoryl lipid A] およびトレハロースジコリノミコレートＡＦ[trehalosedicorynomycolate AF] (MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項１１０に記載の組成物。
【請求項１１２】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項１１１に記載の組成物。
【請求項１１３】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項１１２に記載の組成物。
【請求項１１４】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項１１０に記載の組成物。
【請求項１１５】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項１１０に記載の組成物。
【請求項１１６】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１１７】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせることにより製剤化した、請求項１１５あるいは請求項１１６に記載の組成物。
【請求項１１８】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法で、請求項７９から１０６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項１１９】
SEQ ID NO:7の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:7のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約８個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＣであり；
前記コード領域の３５個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約７個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンのうち約１０個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約4個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の２４個のバリンコドンのうち約4個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約６個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約３個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１１個がＧＴＧであり；
前記コード領域の４３個のセリンコドンのうち約８個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
前記コード領域の１８個のプロリンコドンのうち約５個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約６個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約５個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＧであり；
前記コード領域の３０個のスレオニンコドンのうち約７個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がＧＧＴ^＊９であり、前記アラニンコドンのうち約１６個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約４個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１６個がＣＡＧであり；
前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１５個がＡＡＣであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約１２個がＡＡＧであり；
前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンのうち約１１個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がＧＡＣであり；
前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンのうち約１６個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約２３個がＧＡＧであり；
前記コード領域の８個のシステインコドンのうち約４個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約４個がＴＧＣであり；
前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の５１つのアルギニンコドンのうち約４個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＧであり；
前記コード領域の４３個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:7に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１２０】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:32を含む、請求項１１９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２１】
SEQ ID NO:7の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:7のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３５個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の２４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４３個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の１８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３０個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の２１つのリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の５１つのアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ又はＡＧＧであり、前記コード領域の４３個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:7に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１２２】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:33を含む、請求項１２１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２３】
前記核酸断片がSEQ ID NO:7の少なくとも５０個のアミノ酸をコードする、請求項１１９から１２２のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２４】
前記核酸断片がSEQ ID NO:7の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１１９から１２３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２５】
SEQ ID NO:7に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:7のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約８個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＣであり；
前記コード領域の３５個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約７個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンのうち約１０個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約4個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の２４個のバリンコドンのうち約４個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約６個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約３個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１１個がＧＴＧであり；
前記コード領域の４３個のセリンコドンのうち約８個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
前記コード領域の１８個のプロリンコドンのうち約５個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約６個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約５個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＧであり；
前記コード領域の３０個のスレオニンコドンのうち約７個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がＧＧＴであり、前記アラニンコドンのうち約１６個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約４個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１６個がＣＡＧであり；
前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１５個がＡＡＣであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約１２個がＡＡＧであり；
前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンのうち約１１個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がＧＡＣであり；
前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンのうち約１６個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約２３個がＧＡＧであり；
前記コード領域の８個のシステインコドンのうち約４個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約４個がＴＧＣであり；
前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の５１つのアルギニンコドンのうち約４個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＧであり；
前記コード領域の４３個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:7に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１２６】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:7に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１２５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:7をコードする、請求項１２６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２８】
SEQ ID NO:5^＊４２に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:7のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３５個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の２４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４３個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の１８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３０個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の２１つのリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の５１つのアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ，あるいはＡＧＧであり、さらに前記コード領域の４３個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:7に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１２９】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:7に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１２８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３０】
前記核酸断片がSEQ ID NO:7をコードする、請求項１２９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３１】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項１１９から１３０のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３２】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項１３１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３３】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項１３２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３４】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項１３３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３５】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項１１９から１３４のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３６】
ＲＮＡである、請求項１１９から１３４のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３７】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項１３６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３８】
請求項１１９から１３７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドから成るベクター。
【請求項１３９】
プラスミドである、請求項１３８に記載のベクター。
【請求項１４０】
請求項１１９から１３７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項１４１】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される構成成分を含む、請求項１４０に記載の組成物。
【請求項１４２】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド) ((±)-N-(3-aminopropyl)-N,N-dimethyl-2,3-bis(syn-9-tetradeceneyloxy)-1-propanaminium bromide)]（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジコリノミコレートＡＦ (MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項１４１に記載の組成物。
【請求項１４３】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項１４２に記載の組成物。
【請求項１４４】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項１４３に記載の組成物。
【請求項１４５】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミドを含む、請求項１４１に記載の組成物。
【請求項１４６】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項１４１に記載の組成物。
【請求項１４７】
前記CRL1005およびBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項１４６に記載の組成物。
【請求項１４８】
曇点より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせることにより製剤化した、請求項１４６あるいは請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１４９】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項１１９から１３７のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項１５０】
SEQ ID NO:9の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:9のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約８個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＣであり；
前記コード領域の３５個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約７個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンのうち約１０個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約4個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の２４個のバリンコドンのうち約4個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約６個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約３個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１１個がＧＴＧであり；
前記コード領域の４３個のセリンコドンのうち約８個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
前記コード領域の１８個のプロリンコドンのうち約５個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約６個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約５個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＧであり；
前記コード領域の３０個のスレオニンコドンのうち約７個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がＧＧＴ^＊９であり、前記アラニンコドンのうち約１６個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約４個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１６個がＣＡＧであり；
前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１５個がＡＡＣであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約１２個がＡＡＧであり；
前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンのうち約１１個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がＧＡＣであり；
前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンのうち約１６個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約２３個がＧＡＧであり；
前記コード領域の８個のシステインコドンのうち約４個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約４個がＴＧＣであり；
前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の５１つのアルギニンコドンのうち約４個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＧであり；
前記コード領域の４３個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:9に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１５１】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:34を含む、請求項１５０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５２】
SEQ ID NO:9の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:9のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３５個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の２４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４３個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の１８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３０個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の２１つのリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の５１つのアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ又はＡＧＧであり、前記コード領域の４３個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:9に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１５３】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:35を含む、請求項１５２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５４】
前記核酸断片がSEQ ID NO:9の少なくとも５０個のアミノ酸をコードする、請求項１５０から１５３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５５】
前記核酸断片がSEQ ID NO:9の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１５０から１５４のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５６】
SEQ ID NO:9に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:9のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンのうち約８個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＣであり；
前記コード領域の３５個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約４個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約７個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約２個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１４個がＣＴＧであり；
前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンのうち約１０個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１３個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約4個がＡＴＡであり；
前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
前記コード領域の２４個のバリンコドンのうち約４個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約６個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約３個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１１個がＧＴＧであり；
前記コード領域の４３個のセリンコドンのうち約８個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、前記セリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
前記コード領域の１８個のプロリンコドンのうち約５個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約６個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約５個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約２個がＣＣＧであり；
前記コード領域の３０個のスレオニンコドンのうち約７個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約８個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
前記コード領域の３９個のアラニンコドンのうち約１０個がＧＧＴ^＊９であり、前記アラニンコドンのうち約１６個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
前記コード領域の１５個のチロシンコドンのうち約７個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；
前記コード領域の６個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約４個がＣＡＣであり；
前記コード領域の２１つのグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１６個がＣＡＧであり；
前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１５個がＡＡＣであり；
前記コード領域の２１つのリジンコドンのうち約９個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約１２個がＡＡＧであり；
前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンのうち約１１個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１２個がＧＡＣであり；
前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンのうち約１６個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約２３個がＧＡＧであり；
前記コード領域の８個のシステインコドンのうち約４個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約４個がＴＧＣであり；
前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
前記コード領域の５１つのアルギニンコドンのうち約４個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１１個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約１０個がＡＧＧであり；
前記コード領域の４３個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:9に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１５７】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:9に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１５６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:9をコードする、請求項１５７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５９】
SEQ ID NO:9に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドで、前記核酸断片がSEQ ID NO:9のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の１８個のフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３５個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の２７個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２６個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の２４個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４３個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の１８個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３０個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の３９個のアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１５個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の６個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の２１つのグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２８個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の２１つのリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の２３個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３９個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の７個のトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の５１つのアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ及びＡＧＧであり、さらに前記コード領域の４３個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:9に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１６０】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:9に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１５９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６１】
前記核酸断片がSEQ ID NO:9をコードする、請求項１６０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６２】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項１５０から１６１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６３】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項１６２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６４】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項１６３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６５】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項１６４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６６】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項１５０から１６５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６７】
ＲＮＡである、請求項１５０から１６５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６８】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項１６７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６９】
請求項１５０から１６８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドから成るベクター。
【請求項１７０】
プラスミドである、請求項１６９に記載のベクター。
【請求項１７１】
請求項１５０から１６８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと担体とを含む組成物。
【請求項１７２】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される構成成分を含む、請求項１７１に記載の組成物。
【請求項１７３】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項１７２に記載の組成物。
【請求項１７４】
前記アジュバントが、((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b)1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項１７３に記載の組成物。
【請求項１７５】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項１７４に記載の組成物。
【請求項１７６】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項１７２に記載の組成物。
【請求項１７７】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項１７２に記載の組成物。
【請求項１７８】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項１７２に記載の組成物。
【請求項１７９】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項１７６あるいは請求項１７８に記載の組成物。
【請求項１８０】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項１５０から１６８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項１８１】
SEQ ID NO:16の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:16のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
２１つのフェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１２個がＴＴＣであり；
３９個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約８個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１６個がＣＴＧであり；
３８個のイソロイシンコドンのうち約１４個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１８個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約６個がＡＴＡであり；
２７個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
３２個のバリンコドンのうち約６個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約８個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約４個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１５個がＧＴＧであり；
４０個のセリンコドンのうち約７個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、ｖセリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
２６個のプロリンコドンのうち約７個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約９個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約７個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約３個がＣＣＧであり；３８個のスレオニンコドンのうち約９個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１４個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
４１つのアラニンコドンのうち約１１個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約１７個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
１４個のチロシンコドンのうち約６個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；４個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＣであり；
１９個のグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１４個がＣＡＧであり；２５個のアスパラギンコドンのうち約１２個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＣであり；５２個のリジンコドンのうち約２２個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約３０個がＡＡＧであり；
３４個のアスパラギン酸コドンのうち約１６個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１８個がＧＡＣであり；
３０個のグルタミン酸コドンのうち約１２個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約１８個がＧＡＧであり；
５個のシステインコドンのうち約２個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約３個がＴＧＣであり；
単一のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
３０個のアルギニンコドンのうち約２個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＡＧＧであり；
４４個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１８２】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:36を含む、請求項１８１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８３】
SEQ ID NO:16の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:16のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の２１つのフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３９個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の３８個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２７個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の３２個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４０個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の２６個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３８個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の４１つのアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１４個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の４個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の１９個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２５個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の５２個のリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の３４個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３０個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の３０個のアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ及びＡＧＧ（ヒトゲノムにおけるこれら3個のコドンの使用頻度にはあまり差異がない）からなる群から選択され、さらに前記コード領域の４４個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１８４】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:37を含む、請求項１８３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８５】
SEQ ID NO:16の少なくとも２０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片はSEQ ID NO:16のポリペプチドのコドン最適化コード領域の核酸断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
３９個のロイシンコドンがCTGであり、２６個のプロリンコドンがCCCであり、４１つのアラニンコドンがGCCであり、１９個のグルタミンコドンがCAGであり、２５個のアルパラギンコドンがAACであり、５２個のリジンコドンがAAGであり、３０個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:1のヌクレオチド１から１６８０から成り；
前記の少なくとも２０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:16に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１８６】
前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:38を含む、請求項１８５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:16の少なくとも５０個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１８１から１８６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:16の少なくとも１００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項１８１から１８６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８９】
前記核酸断片がSEQ ID NO:16をコードする、請求項１８８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９０】
SEQ ID NO:16に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:2^＊４４のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
２１つのフェニルアラニンコドンのうち約１０個がＴＴＴであり、前記フェニルアラニンコドンのうち約１２個がＴＴＣであり；
３９個のロイシンコドンのうち約３個がＴＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＴＴＧであり、前記ロイシンコドンのうち約５個がＣＴＴであり、前記ロイシンコドンのうち約８個がＣＴＣであり、前記ロイシンコドンのうち約３個がＣＴＡであり、前記ロイシンコドンのうち約１６個がＣＴＧであり；
３８個のイソロイシンコドンのうち約１４個がＡＴＴであり、前記イソロイシンコドンのうち約１８個がＡＴＣであり、前記イソロイシンコドンのうち約６個がＡＴＡであり； ２７個のメチオニンコドンはＡＴＧであり；
３２個のバリンコドンのうち約６個がＧＴＴであり、前記バリンコドンのうち約８個がＧＴＧであり、前記バリンコドンのうち約４個がＧＴＡであり、前記バリンコドンのうち約１５個がＧＴＧであり；
４０個のセリンコドンのうち約７個がＴＣＴであり、前記セリンコドンのうち約９個がＴＣＣであり、前記セリンコドンのうち約６個がＴＣＡであり、前記セリンコドンのうち約２個がＴＣＧであり、セリンコドンのうち約６個がＡＧＴであり、前記セリンコドンのうち約１０個がＡＧＣであり；
２６個のプロリンコドンのうち約７個がＣＣＴであり、前記プロリンコドンのうち約９個がＣＣＣであり、前記プロリンコドンのうち約７個がＣＣＡであり、前記プロリンコドンのうち約３個がＣＣＧであり；３８個のスレオニンコドンのうち約９個がＡＣＴであり、前記スレオニンコドンのうち約１４個がＡＣＣであり、前記スレオニンコドンのうち約１１個がＡＣＡであり、前記スレオニンコドンのうち約４個がＡＣＧであり；
４１つのアラニンコドンのうち約１１個がＧＣＴであり、前記アラニンコドンのうち約１７個がＧＣＣであり、前記アラニンコドンのうち約９個がＧＣＡであり、前記アラニンコドンのうち約４個がＧＣＧであり；
１４個のチロシンコドンのうち約６個がＴＡＴであり、前記チロシンコドンのうち約８個がＴＡＣであり；４個のヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＴであり、前記ヒスチジンコドンのうち約２個がＣＡＣであり；
１９個のグルタミンコドンのうち約５個がＣＡＡであり、前記グルタミンコドンのうち約１４個がＣＡＧであり；２５個のアスパラギンコドンのうち約１２個がＡＡＴであり、前記アスパラギンコドンのうち約１３個がＡＡＣであり；５２個のリジンコドンのうち約２２個がＡＡＡであり、前記リジンコドンのうち約３０個がＡＡＧであり；
３４個のアスパラギン酸コドンのうち約１６個がＧＡＴであり、前記アスパラギン酸コドンのうち約１８個がＧＡＣであり；
３０個のグルタミン酸コドンのうち約１２個がＧＡＡであり、前記グルタミン酸コドンのうち約１８個がＧＡＧであり；
５個のシステインコドンのうち約２個がＴＧＴであり、前記システインコドンのうち約３個がＴＧＣであり；
単一のトリプトファンコドンはＴＧＧであり；
３０個のアルギニンコドンのうち約２個がＣＧＴであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＣであり、前記アルギニンコドンのうち約３個がＣＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＣＧＧであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＡＧＡであり、前記アルギニンコドンのうち約６個がＡＧＧであり；
４４個のグリシンコドンのうち約７個がＧＧＴであり、前記グリシンコドンのうち約１５個がＧＧＣであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＡであり、前記グリシンコドンのうち約１１個がＧＧＧであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１９１】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:16に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１９０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９２】
前記核酸断片がSEQ ID NO:16をコードする、請求項１９１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９３】
SEQ ID NO:16に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記核酸断片がSEQ ID NO:16のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である単離ポリヌクレオチドにおいて；
前記コード領域の２１つのフェニルアラニンコドンはＴＴＣであり、前記コード領域の３９個のロイシンコドンはＣＴＧであり、前記コード領域の３８個のイソロイシンコドンはＡＴＣであり、前記コード領域の２７個のメチオニンコドンはＡＴＧであり、前記コード領域の３２個のバリンコドンはＧＴＧであり、前記コード領域の４０個のセリンコドンはＡＧＣであり、前記コード領域の２６個のプロリンコドンはＣＣＣであり、前記コード領域の３８個のスレオニンコドンはＡＣＣであり、前記コード領域の４１つのアラニンコドンはＧＣＣであり、前記コード領域の１４個のチロシンコドンはＴＡＣであり、前記コード領域の４個のヒスチジンコドンはＣＡＣであり、前記コード領域の１９個のグルタミンコドンはＣＡＧであり、前記コード領域の２５個のアスパラギンコドンはＡＡＣであり、前記コード領域の５２個のリシンコドンはＡＡＧであり、前記コード領域の３４個のアスパラギン酸コドンはＧＡＣであり、前記コード領域の３０個のグルタミン酸コドンはＧＡＧであり、前記コード領域の１つのトリプトファンコドンはＴＧＧであり、前記コード領域の３０個のアルギニンコドンはＣＧＧ、ＡＧＡ又はＡＧＧ（ヒトゲノムにおけるこれら3個のコドンの使用頻度にはあまり差異がない）であり、さらに前記コード領域の４４個のグリシンコドンはＧＧＣであり；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:2に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１９４】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:16に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１９３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９５】
前記核酸断片がSEQ ID NO:16をコードする、請求項１９４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９６】
SEQ ID NO:16に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片から成る単離ポリヌクレオチドで、前記核酸断片がSEQ ID NO:16のポリペプチドのコドン最適化コード領域の変異体断片である前記単離ポリヌクレオチドにおいて；
３３個のロイシンコドンがCTGであり、１７個のプロリンコドンがCCCであり、３９個のアラニンコドンがGCCであり、２１つのグルタミンコドンがCAGであり、２６個のアルパラギンコドンがAACであり、２１つのリジンコドンがAAGであり、３６個のグルタミン酸コドンがGAGであることを除いて、前記コドン最適化コード領域がSEQ ID NO:1のヌクレオチド１から１６８０から成り；
前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:16に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項１９７】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:16に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項１９６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:2をコードする、請求項１９７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９９】
前記核酸断片を異種の核酸に連結した、請求項１８１から１９８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２００】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項１９９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０１】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項２００に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０２】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項２０１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０３】
SEQ ID NO:43を含む、請求項２０２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０４】
前記異種のポリペプチドがインフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインである、請求項２００に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０５】
前記インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインがSEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４を含む、請求項２０４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０６】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項１８１から２０５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０７】
ＲＮＡである、請求項１８１から２０５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０８】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項２０７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０９】
請求項１８１から２０８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２１０】
プラスミドである、請求項２０９に記載のベクター。
【請求項２１１】
請求項１８１から２０８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項２１２】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項２１１に記載の組成物。
【請求項２１３】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項２１２に記載の組成物。
【請求項２１４】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項２１３に記載の組成物。
【請求項２１５】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項２１４に記載の組成物。
【請求項２１６】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項２１２に記載の組成物。
【請求項２１７】
前記アジュバントあるいは形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項２１２に記載の組成物。
【請求項２１８】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項２１７に記載の組成物。
【請求項２１９】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項２１７又は２１８に記載の組成物。
【請求項２２０】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法で、請求項１８１から２０９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドをそのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項２２１】
さらに、不活性化ウィルス、弱毒化ウィルス、単離インフルエンザウィルスポリペプチドを発現するウィルスベクター、およびインフルエンザウィルスタンパク質／またはその断片／変異体あるいは誘導体に由来する単離ポリペプチドからなる群から選択される従来のワクチン構成要素から成る、請求項３１から３９、６９から７７、１０９から１１７、１４０から１４８、１７１から１７９、又は２１１から２１９のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項２２２】
前記単離ポリペプチドが、Ａ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、Ａ型インフルエンザウィルスＭ１タンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、インフルエンザＭ２タンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、Ａ型インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインに融合されたＡ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質を含むポリペプチド、Ａ型インフルエンザウィルスＭ２タンパク質に融合されたＡ型インフルエンザウィルスＭ１タンパク質を含むポリペプチド、並びにＢ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体からなる群から選択される任意の単離インフルエンザウィルスポリペプチド断片又はその変異体若しくは誘導体である、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２３】
前記単離ポリペプチドが、脊椎動物に免疫応答を誘導することができる免疫原性を有するエピトープを少なくとも１つ含む、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２４】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドが同一の製剤に含まれている、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２５】
前記組成物が組み合わせポリヌクレオチドワクチン組成物又は単一製剤異種プライム−ブーストワクチン組成物である、請求項２２４に記載の組成物。
【請求項２２６】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとが異なった製剤に含まれており、前記異なった製剤が連続して又は同時に投与される、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２７】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、個々の構成要素を単独で投与した場合に比べて、同等の又はそれより高い免疫応答を提供する、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２８】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせがより広範囲の免疫応答を提供する、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２２９】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、個々の構成要素を単独で投与した場合に得られる治療効果に比べて、より少ない投与量で治療効果を提供する、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２３０】
前記コドン最適化核酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、ポリペプチドを単独で投与した場合に比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％少ない単離ポリペプチド投与量で治療効果を提供する、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３１】
前記コドン最適化核酸組成物及び前記単離ポリペプチドの組み合わせが、個々の構成成分を単独で投与した場合に得られる治療効果に比べて、より少ない投与量でより広範囲の免疫応答を提供する、請求項２２１に記載の組成物。
【請求項２３２】
請求項３２から３９、７０から７８、１１１から１１９、１４３から１５１、１７５から１８３のいずれか１項に記載されている前記組成物、或いはインフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを投与することにより得られる免疫応答に比べて、前記免疫応答が同等であるかあるいはより高い、請求項２２１に記載の組成物を投与することにより免疫応答を誘導する方法。
【請求項２３３】
前記免疫応答がより広範囲の免疫応答である、請求項２３２に記載の方法。
【請求項２３４】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを、節約された投与量で投与することにより、前記免疫応答が達成され、前記節約された投与量が従来投与濃度より低い濃度である、請求項２３２に記載の方法。
【請求項２３５】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを、節約された投与量で投与することにより、前記免疫応答が達成され、さらに前記免疫応答がより広範囲の免疫応答である、請求項２３４に記載の方法。
【請求項２３６】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドの節約された投与量が、ポリペプチドを単独で投与した場合に比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、又は少なくとも７０％少ない、請求項２３４に記載の方法。
【請求項２３７】
前記免疫応答が、高められた細胞性免疫応答である、請求項２３２に記載の方法。
【請求項２３８】
前記免疫応答が、高められた体液性免疫応答である、請求項２３２に記載の方法。
【請求項２３９】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、そのような治療又は予防を必要としている脊椎動物に、請求項１から２８、４１から６６、７９から１０６、１５０から１６８のいずれか１項に記載されているポリヌクレオチドあるいは請求項３１から３９、６９から７７、１０９から１１７、１７１から１７９、２２１から２３１のいずれか１項に記載されている組成物を、請求項１８１から２０８に記載されている任意のポリヌクレオチド又は請求項２１１から２１９に記載されている任意の成分との組み合わせ又は置換による形態で、投与することを含む方法。
【請求項２４０】
SEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列の少なくとも２０個の連続したアミノ酸を含む単離ポリペプチドであって、前記の少なくとも１５０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:76に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリペプチド。
【請求項２４１】
前記ポリペプチドが、SEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列の少なくとも２００個の連続したアミノ酸を含む、請求項２４０に記載のポリペプチド。
【請求項２４２】
前記ポリペプチドが、SEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列の少なくとも２５０個の連続したアミノ酸を含む、請求項２４０に記載のポリペプチド。
【請求項２４３】
SEQ ID NO:76に少なくとも９０％は同一であるアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:76に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリペプチド。
【請求項２４４】
前記アミノ酸がSEQ ID NO:76に少なくとも９５％は同一である、請求項２４３に記載のポリペプチド。
【請求項２４５】
前記ポリペプチドがSEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列を含む、請求項２４０に記載のポリペプチド。
【請求項２４６】
さらに、前記ポリペプチドに連結された異種のポリペプチドを含む、請求項２４０から２４５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２４７】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項２４６に記載のポリペプチド。
【請求項２４８】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40及びSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項２４７に記載のポリペプチド。
【請求項２４９】
前記異種のポリペプチドが少なくとも、インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインを含む、請求項２４６に記載のポリペプチド。
【請求項２５０】
前記インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインが、SEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４およびSEQ ID NO:78のアミノ酸１から２４から成る群から選択される、請求項２４９に記載のポリペプチド。
【請求項２５１】
請求項２４０から２５０のいずれか１項に記載のポリペプチドと、担体とを含む組成物。
【請求項２５２】
さらに、アジュバントを含む、請求項２５１に記載の組成物。
【請求項２５３】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項２４０から２５０のいずれか１項に記載のポリペプチドを、そのような治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む方法。
【請求項２５４】
SEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列の少なくとも１５０個の連続したアミノ酸をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記の少なくとも１５０個の連続したアミノ酸が、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:76に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項２５５】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:76の少なくとも２００個の連続したアミノ酸をコードする、請求項２５４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２５６】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:76の少なくとも２５０個の連続したアミノ酸をコードする、請求項２５５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２５７】
SEQ ID NO:76に少なくとも９０％は同一であるポリペプチドをコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドであって、前記ポリペプチドが、脊椎動物に投与された場合に、SEQ ID NO:76に対する検知可能な免疫応答を誘導することを特徴とする前記単離ポリヌクレオチド。
【請求項２５８】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:76に少なくとも９５％は同一であるポリペプチドをコードする、請求項２５７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２５９】
前記核酸断片がSEQ ID NO:76のコンセンサスアミノ酸配列をコードする、請求項２５４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６０】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:76のポリペプチドに対するコドン最適化コード領域の断片である、請求項２５４から２５９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６１】
前記核酸断片がSEQ ID NO:75を含む、請求項２６０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６２】
さらに、前記核酸断片に連結された異種の核酸を含む、請求項２５４から２６１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６３】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合された異種のポリペプチドをコードする、請求項２６２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６４】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項２６３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６５】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40 及び SEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項２６４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６６】
SEQ ID NO:43を含む、請求項２６５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６７】
前記異種のポリペプチドが少なくともインフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外領域を含む、請求項２６３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６８】
前記インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインが、SEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４及びSEQ ID NO:78のアミノ酸１から２４から成る群から選択される、請求項２６７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６９】
ＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項２５４から２６８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２７０】
ＲＮＡである、請求項２５４から２６８のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２７１】
メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項２７０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２７２】
請求項２５４から２７１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２７３】
前記ベクターがプラスミドである、請求項２７２に記載のベクター。
【請求項２７４】
請求項２５４から２９２のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドと、担体とを含む組成物。
【請求項２７５】
さらに、アジュバント及び形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項２７４に記載の組成物。
【請求項２７６】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項２７５に記載の組成物。
【請求項２７７】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項２７６に記載の組成物。
【請求項２７８】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項２７７に記載の組成物。
【請求項２７９】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項２７５に記載の組成物。
【請求項２８０】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物が、CRL1005及び塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項２７５に記載の組成物。
【請求項２８１】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項２８０に記載の組成物。
【請求項２８２】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、及びポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項２８０又は請求項２８２に記載の組成物。
【請求項２８３】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項２５４から２７１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項２８４】
脊椎動物に投与されると前記アミノ酸配列を発現しSEQ ID NO:77に対する検知可能な免疫応答を誘導する、SEQ ID NO:77のコンセンサスアミノ酸配列をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２８５】
前記核酸断片が、SEQ ID NO:77のポリペプチドに対するコドン最適化コード領域の断片である、請求項２８４に記載のベクター。
【請求項２８６】
前記核酸断片がSEQ ID NO:79を含む、請求項２８５に記載のベクター。
【請求項２８７】
さらに、前記核酸断片に連結された異種の核酸を含む、請求項２８４から２８６のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２８８】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項２８７に記載のベクター。
【請求項２８９】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項２８８に記載のベクター。
【請求項２９０】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40及びSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項２８９に記載のベクター。
【請求項２９１】
前記異種のポリペプチドがインフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインである、請求項２８７に記載のベクター。
【請求項２９２】
前記インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインが、SEQ ID NO:5のアミノ酸１から２４及びSEQ ID NO:78のアミノ酸１から２４から成る群から選択されている、請求項２９１に記載のベクター。
【請求項２９３】
前記ポリヌクレオチドがＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項２８４から２９２のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２９４】
前記ポリヌクレオチドがＲＮＡである、請求項２８４から２９２のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２９５】
前記ポリヌクレオチドがメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項２９４に記載のベクター。
【請求項２９６】
プラスミドである、請求項２８４から２９３のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２９７】
請求項２８４から２９６のいずれか１項に記載のベクターと、担体とを含む組成物。
【請求項２９８】
さらに、アジュバント及び形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項２９７に記載の組成物。
【請求項２９９】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項２９８に記載の組成物。
【請求項３００】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項２９９に記載の組成物。
【請求項３０１】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項３００に記載の組成物。
【請求項３０２】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項２９８に記載の組成物。
【請求項３０３】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005および塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項２９８に記載の組成物。
【請求項３０４】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項３０３に記載の組成物。
【請求項３０５】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項３０３又は請求項３０４に記載の組成物。
【請求項３０６】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項２８４から２９６のいずれか１項に記載のベクターを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む方法。
【請求項３０７】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、SEQ ID NO:77のコンセンサスアミノ酸配列を含むポリペプチドを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することかを含む方法。
【請求項３０８】
前記ポリペプチドが、SEQ ID NO:77のポリペプチドに対するコドン最適化コード領域を含む核酸断片によりコードされる、請求項３０７に記載の方法。
【請求項３０９】
前記ポリペプチドが、SEQ ID NO:79を含む核酸断片によりコードされる、請求項３０８に記載の方法。
【請求項３１０】
脊椎動物に投与されると前記アミノ酸配列を発現しSEQ ID NO:78に対する検知可能な免疫応答を誘導する、SEQ ID NO:78のコンセンサスアミノ酸配列をコードする核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドから成るベクター。
【請求項３１１】
前記核酸断片がSEQ ID NO:78のポリペプチドに対するコドン最適化コード領域の断片である、請求項３１０に記載のベクター。
【請求項３１２】
前記核酸断片がSEQ ID NO:80を含む、請求項３１１に記載のベクター。
【請求項３１３】
さらに、前記核酸断片に連結された異種の核酸を含む、請求項３１０から３１２のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３１４】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項３１３に記載のベクター。
【請求項３１５】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項３１４に記載のベクター。
【請求項３１６】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40及びSEQ ID NO:42からなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項３１５に記載のベクター。
【請求項３１７】
前記異種のポリペプチドが、インフルエンザウィルスＭ１タンパク質又はその断片である、請求項３１３に記載のベクター。
【請求項３１８】
前記ポリヌクレオチドがＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項３１０から３１８のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３１９】
前記ポリヌクレオチドがＲＮＡである、請求項３１０から３１８のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３２０】
前記ポリヌクレオチドがメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項３１９に記載のベクター。
【請求項３２１】
プラスミドである、請求項３１０から３１８のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３２２】
請求項３１０から３２１のいずれか１項に記載のベクターと、担体とを含む組成物。
【請求項３２３】
さらに、アジュバントおよび形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項３２２に記載の組成物。
【請求項３２４】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項３２３に記載の組成物。
【請求項３２５】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項３２４に記載の組成物。
【請求項３２６】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項３２５に記載の組成物。
【請求項３２７】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項３２３に記載の組成物。
【請求項３２８】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005及び塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項３２３に記載の組成物。
【請求項３２９】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項３２８に記載の組成物。
【請求項３３０】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項３２８又は３２９に記載の組成物。
【請求項３３１】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項３１０から３２１のいずれか１項に記載のベクターを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む方法。
【請求項３３２】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、SEQ ID NO:78のコンセンサスアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む前記方法。
【請求項３３３】
前記ポリペプチドが、SEQ ID NO:78のポリペプチドに対するコドン最適化コード領域を含む核酸断片によりコードされる、請求項３３２に記載の方法。
【請求項３３４】
前記ポリペプチドがSEQ ID NO:80を含む核酸断片によりコードされる、請求項３３３に記載の方法。
【請求項３３５】
SEQ ID NO:60の核酸断片を含む単離ポリヌクレオチドを含有するベクターであって、前記核酸断片が脊椎動物に投与された場合にSEQ ID NO:77、SEQ ID NO:78及びそれらの混合物からなる群から選択されるポリペプチドの断片を発現し、前記ポリペプチドの断片がSEQ ID NO:77、SEQ ID NO:78及びそれらの混合物からなる群から選択される前記ポリペプチドに対する検知可能な免疫応答を誘導する、前記ベクター。
【請求項３３６】
前記核酸断片がコドン最適化されている、請求項３３５に記載のベクター。
【請求項３３７】
前記核酸断片がSEQ ID NO:79を含む、請求項３３６に記載のベクター。
【請求項３３８】
前記核酸断片がSEQ ID NO:80を含む、請求項３３６に記載のベクター。
【請求項３３９】
前記核酸断片がSEQ ID NO:61を含む、請求項３３６に記載のベクター。
【請求項３４０】
さらに、前記核酸断片に連結された異種の核酸を含む、請求項３３５から３３９のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３４１】
前記異種の核酸が、前記核酸断片によりコードされるポリペプチドに融合されている異種のポリペプチドをコードする、請求項３４０に記載のベクター。
【請求項３４２】
前記異種のポリペプチドがＢ型肝炎コア抗原である、請求項３４１に記載のベクター。
【請求項３４３】
前記Ｂ型肝炎コア抗原が、SEQ ID NO:40及びSEQ ID NO:42を含む群から選択されるポリペプチドの少なくとも５０個のアミノ酸を含む、請求項３４２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項３４４】
前記ポリヌクレオチドがＤＮＡであり、前記核酸断片に作動可能にプロモータが附随している、請求項３３５から３４３のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３４５】
前記ポリヌクレオチドがＲＮＡである、請求項３３５から３４３のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３４６】
前記ポリヌクレオチドがメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）である、請求項３４５に記載のベクター。
【請求項３４７】
プラスミドである、請求項３３５から３４４のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３４８】
請求項３３５から３４７のいずれか１項に記載のベクターと、担体とを含む組成物。
【請求項３４９】
さらに、アジュバント及び形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項３４８に記載の組成物。
【請求項３５０】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジミクリノコレートＡＦ(MPL + TDM)；
(d) 溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e) CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項３４９に記載の組成物。
【請求項３５１】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項３５０に記載の組成物。
【請求項３５２】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項３５１に記載の組成物。
【請求項３５３】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項３４９に記載の組成物。
【請求項３５４】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物がCRL1005及び塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項３４９に記載の組成物。
【請求項３５５】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項３５４に記載の組成物。
【請求項３５６】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK、およびポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項３５４又は請求項３５５に記載の組成物。
【請求項３５７】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項３３５から３４７のいずれか１項に記載のベクターを、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む方法。
【請求項３５８】
さらに、不活性化ウィルス、弱毒化ウィルス、単離インフルエンザウィルスポリペプチドを発現するウィルスベクター、及びインフルエンザウィルスタンパク質／又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する単離ポリペプチドからなる群から選択される従来のワクチン構成成分を含む、請求項２５１、２５２、２７４から２８２、２９７から３０５、３２２から３３０、又は３４８から３５６のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項３５９】
前記単離ポリペプチドが、Ａ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、Ａ型インフルエンザウィルスＭ１タンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、インフルエンザＭ２タンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体、Ａ型インフルエンザウィルスＭ２タンパク質の細胞外ドメインに融合されたＡ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質を含むポリペプチド、Ａ型インフルエンザウィルスＭ２タンパク質に融合されたＡ型インフルエンザウィルスＭ１タンパク質を含むポリペプチド、及びＢ型インフルエンザウィルスＮＰタンパク質断片又はその変異体若しくは誘導体からなる群から選択される任意の単離インフルエンザウィルスポリペプチド断片又はその変異体若しくは誘導体である、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６０】
前記単離ポリペプチドが、脊椎動物に免疫応答を誘導することができる免疫原性を有するエピトープを少なくとも１つ含む、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６１】
前記コンセンサスアミノ酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとが同一の製剤に含まれている、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６２】
前記組成物が組み合わせポリヌクレオチドワクチン組成物又は単一製剤異種プライム−ブーストワクチン組成物である、請求項３６１に記載の組成物。
【請求項３６３】
前記コンセンサスアミノ酸組成物と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとが異なった製剤に含まれており、前記異なった製剤が連続して又は同時に投与される、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６４】
前記コンセンサスアミノ酸組成と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、個々の構成成分を単独で投与した場合に比べて、同等の又はそれより高い免疫応答を提供する、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６５】
前記コンセンサスアミノ酸組成と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせがより広範囲の免疫応答を提供する、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６６】
前記コンセンサスアミノ酸組成と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、個々の構成成分を単独で投与した場合に得られる治療効果に比べて、より少ない投与量で治療効果を提供する、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６７】
前記コンセンサスアミノ酸組成と、インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体／誘導体に由来する前記単離ポリペプチドとの組み合わせが、ポリペプチドを単独で投与した場合に比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、又は少なくとも７０％少ない単離ポリペプチド投与量で治療効果を提供する、請求項３６６に記載の組成物。
【請求項３６８】
前記コンセンサスアミノ酸組成および前記単離ポリペプチドの組み合わせが、個々の構成要素を単独で投与した場合に得られる治療効果に比べて、より少ない投与量でより広範囲の免疫応答を提供する、請求項３５８に記載の組成物。
【請求項３６９】
請求項２５１、２５２、２７４から２８２、２９７から３０５、３２２から３３０、３４８から３５６のいずれか１項に記載されている前記組成物、或いはインフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを投与することにより得られる免疫応答に比べて、前記免疫応答が同等であるかあるいはより高い、請求項３５８に記載の組成物を投与することにより免疫応答を誘導する方法。
【請求項３７０】
前記免疫応答がより広範囲の免疫応答である、請求項３６９に記載の方法。
【請求項３７１】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを、節約された投与量で投与することにより、前記免疫応答が達成され、さらに前記節約された投与量が従来投与濃度より低い濃度である、請求項３６９に記載の方法。
【請求項３７２】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドを、節約された投与量で投与することにより、前記免疫応答が達成され、さらに前記免疫応答がより広範囲の免疫応答である、請求項３７１に記載の方法。
【請求項３７３】
インフルエンザウィルスタンパク質、又はその断片／変異体若しくは誘導体に由来する前記単離ポリペプチドの節約された投与量が、ポリペプチドを単独で投与した場合に比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、又は少なくとも７０％少ない、請求項３７１に記載の方法。
【請求項３７４】
前記免疫応答が、高められた細胞性免疫応答である、請求項３７０に記載の方法。
【請求項３７５】
前記免疫応答が、高められた体液性免疫応答である、請求項３７０に記載の方法。
【請求項３７６】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、そのような治療又は予防するを必要としている脊椎動物に、請求項２５４から２７１のいずれか１項に記載されているポリヌクレオチド又は請求項２４０から２５０のいずれか１項に記載されているポリペプチドを、請求項２５１、２５２、２７４から２８２、２９７から３０５、３２２から３３０、又は３４８から３５６に記載されている任意の組成物との組み合わせ又は置換による形態で、投与することを含む当該方法。
【請求項３７７】
プラスミドバックボーンがVR10551バックボーン、VR10682バックボーン及びVR10686バックボーンから成る群から選択される、請求項３０、６８、１０８、１３９、１７０、２１０、２７３、３２１および３４７のいずれか１項に記載のプラスミド。
【請求項３７８】
前記プラスミドバックボーンが、ヒトサイトメガロウィルスプロモータ、ニワトリ肉腫ウィルスプロモータ、プラスミドVCL1005由来の修飾ニワトリ肉腫ウィルスプロモータ、及びヒトＴ−細胞白血病ウィルス-I RU5因子に融合したニワトリ肉腫ウィルスプロモータからなる群から選択されるプロモータを含む、請求項３０、６８、１０８、１３９、１７０、２１０、２７３、３２１および３４７のいずれか１項に記載のプラスミド。
【請求項３７９】
さらに、付加的なプロモータを含む、請求項３０、６８、１０８、１３９、１７０、２１０、２７３、３２１および３４７のいずれか１項に記載のプラスミド。
【請求項３８０】
さらに、請求項１から２６、４１から６４、７９から１０４、１１９から１３５、１５０から１６６、１８１から２０６および２５４から２６９のいずれか１項に記載の付加的なポリヌクレオチドを含む、請求項３７９に記載のプラスミド。
【請求項３８１】
さらに、SEQ ID NO:60；SEQ ID NO:61；SEQ ID NO:77；SEQ ID NO:78；SEQ ID NO:79；及びSEQ ID NO:80から成る群から選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項３７９に記載のプラスミド。
【請求項３８２】
請求項３７７から３８１のいずれか１項に記載のプラスミドを含む組成物。
【請求項３８３】
さらに、アジュバント及び形質移入促進化合物からなる群から選択される成分を含む、請求項３８２に記載の組成物。
【請求項３８４】
前記アジュバントが、
(a) ((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）及び中性脂質；
(b) サイトカイン；
(c) モノリン酸リピドAおよびトレハロースジクリノミコレートＡＦ (MPL + TDM)；
(d)溶解モノリン酸リピドA [mono-phosphoryl lipid A]製剤；および
(e)CRL1005/BAK
からなる群から選択される、請求項３８３に記載の組成物。
【請求項３８５】
前記アジュバントが((±)-N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(シン-9-テトラデセニールオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド)（GAP-DMORIE）を含み、
前記中性脂質が
(a) 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；
(b) 1,2-ジフィタノイル-sn-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＰｙＰＥ）；および
(c) 1,2-ジミリストイル-グリセロ-3-ホスフォエタノールアミン（ＤＭＰＥ）
からなる群から選択される、請求項３８４に記載の組成物。
【請求項３８６】
前記中性脂質がＤＰｙＰＥである、請求項３８５に記載の組成物。
【請求項３８７】
形質移入促進化合物(±)-N-(2-ヒドロキシエチル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(テトラデシルオキシ)-1-プロパンアミニウムブロミド（DMRIE）を含む、請求項３８３に記載の組成物。
【請求項３８８】
前記アジュバント又は形質移入促進化合物が、CRL1005及び塩化ベンザルコニウム（ＢＡＫ）を含む、請求項３８３に記載の組成物。
【請求項３８９】
前記CRL1005及びBAKが
(a) 0.3mM BAK及び7.5mg/ml CRL 1005；
(b) 0.3mM BAK及び34mg/ml CRL 1005；および
(c) 0.3mM BAK及び50mg/ml CRL 1005
からなる群から選択される濃度で存在する、請求項３８８に記載の組成物。
【請求項３９０】
曇点（ｃｌｏｕｄ ｐｏｉｎｔ）より高い温度でのサーマルサイクルを行わずに、CRL1005、BAK及びポリヌクレオチドを曇点より低い温度で組み合わせる（ｃｏｍｂｉｎｉｎｇ）ことにより製剤化した、請求項３８８あるいは請求項３８９に記載の組成物。
【請求項３９１】
さらに、不活性化ウィルス、弱毒化ウィルス、単離インフルエンザウィルスポリペプチドを発現するウィルスベクター、及びインフルエンザウィルスタンパク質／またはその断片／変異体若しくは誘導体に由来する単離ポリペプチドからなる群から選択される従来のワクチン構成成分を含む、請求項３８２から３９０のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項３９２】
脊椎動物におけるインフルエンザ感染を治療又は予防する方法であって、請求項３７７から３８０のいずれか１項に記載のベクター又は請求項３８２から３９１のいずれか１項に記載の組成物を、そのようなインフルエンザ感染に対する治療又は予防を必要としている脊椎動物に投与することを含む方法。

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９Ａ】

【図９Ｂ】

【図１０Ａ】

【図１０Ｂ】

【図１１Ａ】

【図１１Ｂ】

【図１２−１】

【図１２−２】

【図１２−３】

【図１２−４】

【図１４】

【図１５】

【図１３】

【公表番号】特表２００８−５０５６６０（Ｐ２００８−５０５６６０Ａ）
【公表日】平成２０年２月２８日（２００８．２．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−５２７３４８（Ｐ２００７−５２７３４８）
【出願日】平成１７年５月１８日（２００５．５．１８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０１７１５７
【国際公開番号】ＷＯ２００５／１１６２７０
【国際公開日】平成１７年１２月８日（２００５．１２．８）
【出願人】（５０５２３５７８３）バイカル　インコーポレイテッド (9)
【Ｆターム（参考）】