本発明は、タンパク分子の同位体／同重体標識化及びその後の親和性選択及び解析のためのキット及び方法に関する。特に、本発明は、タンパク分子の標識化のための、組み合わせによる複数の標識化試薬を含むキットオブパーツであって、各標識化試薬は、同重体標識成分、同位体標識成分及びタンパク分子と反応することができる反応基を含み、同位体標識成分が親和性タグでもある、キットに関する。本発明は更に、タンパク分子の解析のための対応する方法であって、ここに規定されるキットオブパーツを用いることによって存在するタンパク分子の少なくとも１のサブセットを標識化し、その後、標識に含まれる親和性タグを介して親和性精製によって標識化された分子を分離することを含む方法に関する。最後に、本発明は、タンパク質発現プロファイリング又はプロテオーム解析のためのこのような方法の使用に関する。
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【課題】乳癌の診断及び治療法を提供する。
【解決手段】蛍光誘導体化−液体クロマトグラフィー−タンデム質量分析法（ＦＤ−ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ）を用いてプロテオーム解析して同定したヒト乳癌細胞株で発現変動した特定のタンパク質を分子マーカーとして乳癌の診断を行うことを特徴とする乳癌の診断方法、ガレクチン−１とアネキシン−２又はチオドレキシン−１、あるいはアネキシン−２とＥＦ−Ｔｕ、あるいはペルオキシレドキシン−１とＲａｎＧＡＰ、を分子マーカーとして、及びガレクチン−１及び／又はアネキシン−２とトロポミオシン−１のペアを分子マーカーとして乳癌の診断を行うことを特徴とする乳癌の診断方法。
【効果】新しい乳癌の診断及び治療法を提供することができる。 （もっと読む）

【課題】スキャン速度に応じて特性を切り替える電流−電圧変換器の構成を簡素にし且つ切替時の回路の安定性を向上させる。
【解決手段】電流−電圧変換器１１は、演算増幅器Ａ１の非反転入力端と出力端との間に、第１抵抗器Ｒ１と、第２抵抗器Ｒ２とスイッチＳＷ１との並列回路とを直列に接続した回路を挿入する。制御部１０はスキャン速度が速い場合にスイッチＳＷ１を閉成して帰還抵抗を小さくし、ゲインを落とす一方周波数帯域を広げる。電流−電圧変換器１１のスイッチは１個で済むのでコスト低減が図れ、切替え時に帰還ループがオープンにならないので電流−電圧変換器１１の動作が安定になる。 （もっと読む）

【課題】オペレータが全試料あるいは全化合物の面積値の確認と修正を容易に行なえるようなクロマトグラフ質量分析装置を提供する。
【解決手段】化合物を分子の大きさと物性に応じて分離精製するクロマトグラフ装置と、該化合物を電離させたイオンを質量電荷比に応じて分離検出する質量分析装置を直列接続したクロマトグラフ質量分析装置において、測定により得られたマスクロマトグラムのうち、所定の一成分について、観測された複数の異なる試料のマスクロマトグラムを並列に並べて表示する機能を備えたグラフィック・ユーザー・インターフェイスを設けた。 （もっと読む）

【課題】被検物質が有する動脈硬化の改善効果又は将来の発症リスクの低減効果を評価する方法等を提供する。
【解決手段】動脈硬化を発症している動物又は将来の発症リスクが高い動物に被検物質を摂取させ、該動物の体液中における２９種のマーカー物質の少なくとも１つの濃度を基準値と比較し、被検物質が有する動脈硬化の改善効果又は将来の発症リスクの低減効果を評価する。マーカー物質に対する親和性を有する物質を固定化した担体にマーカー物質を捕捉して、体液中のマーカー物質の濃度を算出する構成が推奨される。該評価方法を用いる物質のスクリーニング方法、該評価方法を簡便に行うことができるキットも提供される。 （もっと読む）

【課題】高極性成分を、イオンペア試薬を使用しない逆相液体クロマトグラフィーで分離し、質量分析する。
【解決手段】
〔1〕逆相液体クロマトグラフィーおよび質量分析装置を使用し、当該逆相液体クロマトグラフィーが（１）多官能固定相、および（２）揮発性の塩基および／または塩を含むｐＨ８〜ｐＨ１１の移動相を用いる、高極性内因性代謝物の分析方法の提供および、前記分析方法によって得られた液体クロマトグラフィー保持時間、質量分析ピーク値、および／または質量分析ピーク強度を利用し、統計解析処理を行う。 （もっと読む）

【課題】イオン化プローブへの液体試料の接続部で万一液漏れが発生した場合に、漏出した液体を適切に排出できる大気圧イオン化質量分析装置を提供する。
【解決手段】イオン化プローブ１０を質量分析装置筐体１２に装着するためのフランジ３の上面に隆起する周縁に囲まれた凹部９を備えると共に、この凹部９の底から外部に連通する排液孔８を設ける。これにより、漏出した液体はプローブ筒体１の表面を伝ってフランジ３の凹部９に流下しさらに凹部９の底に設けた排液孔８からドレンポット等へ安全に排出される。 （もっと読む）

【課題】被験剤使用前後の毛髪脂質組成の情報から、被験剤の髪質改善剤としての有効性（髪質改善効果）を的確且つ迅速に評価する方法を提供する。
【解決手段】髪質改善剤使用前後における毛髪の毛根部又は頭皮近傍の毛元部分から調製した試料を液体クロマトグラフ−質量分析法で分離検出して毛髪脂質分子の組成情報を得、髪質改善剤使用前後での前記毛髪脂質分子の組成情報と髪質改善剤の使用による毛髪の髪質改善効果とを関連付ける、髪質改善剤の評価方法。 （もっと読む）

尿試料中の少なくとも３種のポリペプチドマーカーの有無または強度を測定する工程を含み、該ポリペプチドマーカーが表１の分子量および移動時間の値によって特徴付けられるマーカーから選択される、腎尿細管の損傷および疾患の診断のための方法。
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【課題】脱溶媒管やイオンガイドへ印加する最適電圧を決める自動調整において、標準試料以外の低成分濃度の試料を用いた場合でも適切な電圧が設定されるようにする。
【解決手段】初めに設定した条件に従ってイオンガイド等への印加電圧が変更される毎に、試料に対する特定のm/z値におけるマスクロマトグラムが取得される。それに基づき、電圧値とピーク面積値との関係を示すグラフ６１が作成され、これを含む最適化結果が表示画面上に表示される。同時に各電圧におけるクロマトグラム６２も表示される。通常、最大の面積値を与える電圧が最適電圧値として設定されるが、オペレータはこの結果を見て、測定に異常等があって自動的に決まった最適電圧値が適当でないと判断すると、クリック操作により最適電圧値を変更する。そして、ボタン６４をクリック操作すると、変更された電圧値がそのm/z値に対する電圧値としてＳＩＭ測定用分析条件に設定される。 （もっと読む）

【課題】多数の多重極やイオン輸送光学素子に印加する電圧の走査制御に関するＣＰＵの負担を軽減するとともに、その電圧設定の柔軟性を高める。
【解決手段】第１段四重極、コリジョンセル及び第３段四重極をそれぞれ中心とするイオン光学系への印加電圧に対応した制御データを時系列的に記述したＱ１系、ＣＣ系、Ｑ３系の３つのテーブルをＣＰＵで生成し、ＤＭＡ転送により外部メモリに保持する。各テーブルからのデータ読み出しを行うFPGAにより構成される回路は、カウンタによりそれぞれ（時間d1,d2）遅延されたタイミングで読出しを開始する。読み出されたデータはそれぞれ対応するＤ／Ａ変換部に送られ、全てのＤ／Ａ変換部にデータが揃うと共通の同期信号により同時にラッチされ、アナログ電圧が一斉に出力される。ＣＰＵは分析開始前にテーブルを作成した後、走査開始信号等を送るだけでよく、負担が少なくて済む。 （もっと読む）

【課題】ＧＰＣや順相ＨＰＬＣ等で非極性溶媒を用いた場合でも、液体クロマトグラフ装置から溶出した成分の質量スペクトルを得ることが可能で、試料混合物の分析を精度良く且つ迅速に行える方法を提供する。
【解決手段】試料へのレーザー照射で質量スペクトルを得ることを可能とする活性化物質１を全面又は線状に分布させたターゲット２を準備し、液体クロマトグラフ装置３から溶出する試料溶液を線状に動かしながらターゲット２に塗布し、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳ装置７でターゲット２の全面のマススペクトル又は試料溶液が線状に塗布された部分のマススペクトルを測定して、特定の質量数を有するイオンの２次元分布の画像を得ることを特徴とする液体クロマトグラフ溶出液の質量スペクトル測定方法である。 （もっと読む）

先行技術の方法よりも有意に短い時間で処理試料を得るために圧力と所定の因子とを利用して、プロテオミクス分析用の試料を得るための方法およびシステムであって、調製プロセスを通じて処理試料の完全性を維持する、方法およびシステムを提供する。本発明の一態様において、試料と酵素とを組み合わせて、好ましくは0〜35 kpsiの間で変動する圧力サイクル幅で、好ましくは60秒未満の時間、圧力に供する。このプロセスにより、質量分析機器または他の装置などの別の分析機器に好ましくは導入される、分析に適した試料が産生される。

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本発明は、PI3Kを含むタンパク質調製物をフェニルチアゾールリガンド1と共にインキュベートすることによってPI3K相互作用化合物を同定する方法に関する。 （もっと読む）

【課題】本発明は、サンプル分子についての反応性基へのサンプル分子の共有結合を可能にする条件下で、サンプル分子と、切断可能な官能基、１つ以上の官能基、および反応性基を含む化学基に結合された固体支持体とを接触させること；および切断可能な官能基を切断し、これにより１つ以上の官能基（これらは、タグであり得る）を含むサンプル分子を放出することによって分子を標識する方法を提供すること。
【解決手段】上記方法。本発明はまた、切断可能な官能基、質量分析タグおよびサンプル分子に共有結合するための反応性基を含む化学基に共有結合された固体支持体を提供し、ここで切断可能な官能基、タグおよび反応性基は、切断可能な官能基の切断の際に、サンプル分子へのタグの移動を可能にするように互いに対して配置されている。 （もっと読む）

【課題】従来の毒性試験では予測が困難であった、ヒト特異的肝毒性を発現させる化合物について、その肝毒性を高精度で予測することが可能であり、かつ複数種のバイオマーカーを利用することによって、汎用性の高い、ヒトに対する肝毒性の少ない化合物をスクリーニングする方法を提供する。
【解決手段】メタボロミクスを用いた肝毒性評価において、当該肝毒性評価の各工程を好適な組合せにすることによって、ヒトに対する肝毒性の少ない化合物をスクリーニングすることができる。さらに、肝毒性標品化合物として、４−ヒドロキシアニソールおよびニメスリドなどを用いて特定された共通でかつ複数種のバイオマーカーを利用し、当該メタボロミクスを用いた肝毒性評価を行なうことによって、上記課題を解決することが可能となった。 （もっと読む）

【課題】 本発明は、膵臓癌の検出に有用な新規腫瘍マーカー（膵臓癌マーカー）及びこれを用いた特異性の高い膵臓癌判定方法の提供を課題とする。
【解決手段】 本発明は、（１）ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より184番目のアスパラギン又は／及び211番目のアスパラギンに結合している、フコシル化糖鎖を検出することを特徴とする膵臓癌判定方法、（２）ヒトハプトグロビンに存在する下記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含み、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中の少なくとも１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されている膵臓癌マーカー


及び（３）生体由来試料中に存在する上記（２）に記載の膵臓癌マーカーを検出することを特徴とする膵臓癌判定方法に関する。 （もっと読む）

【課題】 従来のMS/MS分析方法では、スループットと前駆体イオンの質量分解能の両立ができないという課題を有していた。
【解決手段】 特定の質量範囲のイオンを排出するイオントラップと、イオントラップから排出されたイオンを解離させる衝突解離部と、衝突解離部から排出されたイオンの質量分析を行う質量分析部を有した質量分析装置によって、イオントラップに導入、蓄積されたイオンを質量選択的に共鳴排出する。衝突解離部への入射エネルギーが低い条件で測定を行い前駆体イオンのイオントラップ部の質量軸でのプロファイルと質量分析部でのプロファイルの組を取得する。次に衝突解離部への入射エネルギーが高い条件で測定を行い、得られた２次元質量スペクトルのイオントラップ部の質量軸でのプロファイルを質量分析部の質量軸でのプロファイルに置き換える。以上の方法により前駆体イオンとフラグメントイオンの両方のm/zを高い質量分解能で決定することができる。 （もっと読む）

複合混合物の化学成分の組成を決定するためのシステム、方法、及びコンピュータ読み取り可能な媒体が開示される。一の態様によれば、複合混合物の化学成分の組成の決定方法は、分離技術及び質量分析装置を用い、サンプルの分離及び質量分析データを生成し、ここで分離データはピーク情報を含み、かつ質量分析データは１次及び２次質量分析データを含む。生成された分離及び質量分析データを含む解析結果は収集及び格納される。解析結果を化学物質の特性を示す情報のライブラリと比較することにより、サンプルの化学成分が決定され、比較は分離及び質量分析データに基づいている。情報のライブラリは分離技術及び質量分析装置によって生成されるデータを含み、さらに同定され又は同定されていない化学物質の分離及び質量分析データを含む。サンプルの化学成分の表示は、人間がアクセス可能な形で利用できるようになされる。
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【課題】マーカー探索に利用できる定量的なシアロ糖鎖のアミド化方法を提供する。
【解決手段】シアロ糖鎖と求核剤とを混合し、これに縮合剤を添加して行われるシアル酸残基のカルボキシル基のアミド化方法において、前記縮合反応を、ｐＨ３以下で行うことを特徴とするものであり、好ましい求核剤及び縮合剤として、それぞれ、ヒドラジド基を有する化合物及びカルボジイミドが用いられる。生体成分を化学修飾することで、従来困難であった質量分析法によるシアロ糖鎖の高感度かつ定量的な検出、及びシアロ糖鎖を有するバイオマーカーの比較定量解析が可能となる。 （もっと読む）