【課題】ＨＣＶの感染増殖性を簡便に評価することが可能なＣ型肝炎ウイルスの感染増殖性の評価方法、およびその利用を提供する。
【解決手段】Ｃ型肝炎ウイルスが感染した細胞の培養上清中に漏出した前記細胞由来の成分を検出する検出工程を有する。 （もっと読む）

HIV試料集団中のそれぞれのRNA分子からcDNA種を生成する工程；該cDNA種から少なくとも1つの第1アンプリコンを増幅する工程、それぞれの第1アンプリコンは複数の増幅されたコピーを含み、第1アンプリコンの座を規定する一対の核酸プライマーで増幅される；第1アンプリコンの増幅されたコピーをクローン増幅して、複数の第2アンプリコンを生成する工程、複数の第2アンプリコンは、第1アンプリコンの増幅されたコピーの1つに由来する実質的に同じコピーの固定された集団を含む；少なくとも100の固定された集団に由来する実質的に同じコピーの核酸配列組成を、単一基材上で並行して決定する工程；および少なくとも100の固定された集団の核酸配列組成中で5%以下の頻度で存在する1つ以上の配列バリアントを検出する工程；および検出された配列バリアントをHIV親和性に関連のある変形と相関する工程を含む、低出現頻度の薬物耐性に関わる1つ以上のHIV配列バリアントを検出するための方法の態様が記載される。
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【課題】本発明は、より安定的かつ容易に核酸を抽出可能な核酸抽出方法を提供する。
【解決手段】本発明による核酸抽出方法は、管状のチューブ内にヒドロゲルカラムを形成するヒドロゲルカラムの作製ステップと、細胞を破壊して細胞溶解物を得る細胞溶解物の作製ステップと、核酸をヒドロゲルカラムを通過して排出させる核酸のフィルタリングステップと、ヒドロゲルカラムを通過した核酸を外部に抽出する核酸の抽出ステップとを含むことができる。 （もっと読む）

【課題】ウイルス血症サンプル中のＡ型肝炎ウイルスを検出するための信頼できる診断試験法を提供する。
【解決手段】Ａ型肝炎ウイルス特異的プライマー、およびＡ型肝炎ウイルスゲノムの保存領域から誘導されるプローブが、開示される。捕捉オリゴヌクレオチド、プライマー、およびプローブを使用する、核酸ベースのアッセイもまた、開示される。長さ６０ヌクレオチド以下の単離されたオリゴヌクレオチドが開示され、この単離されたオリゴヌクレオチドは、（ａ）特定な配列からなる群より選択される配列の少なくとも１０個連続するヌクレオチドのヌクレオチド配列；（ｂ）（ａ）のヌクレオチド配列2体して９０％配列同一性を有するヌクレオチド配列；または（ｃ）（ａ）の相補体および（ｂ）の相補体；を含む。 （もっと読む）

【課題】ＨＩＶ−１核酸配列の増幅・検出方法を提供する。
【解決手段】ＨＩＶ−１群Ｍ、Ｎ及びＯ、並びに前記群内ないし前記群に由来する各種サブタイプを含めたＨＩＶ−１変異体を特異的且つ高感度で増幅・検出するためのオリゴヌクレオチドプライマーセット、プローブ、及び前記したプライマーセットとプローブの組合せ及び試薬を用意して、試験サンプル中のＨＩＶ−１標的配列を増幅・検出を行う。高感受性でＨＩＶ−１を検出することが出来る。 （もっと読む）

試料中のウイルス又はその抗原の濃度を決定する方法であって、ウイルス抗原又はウイルス抗原類似体を固定化したセンサー表面を用意する段階、試料をウイルス抗原に対する抗体の既知量と混合して、試料混合物中に抗原に対する抗体の所定濃度を得る段階、試料混合物をセンサー表面に接触させて、混合物中の遊離抗体をセンサー表面に結合させる段階、遊離抗体の結合に対するセンサー表面の応答を測定する段階、並びに所定濃度の抗体及び様々な濃度のウイルスを含む混合物に関して得られる応答を測定することで作成された校正曲線から試料中のウイルス又は抗原の濃度を決定する段階を含んでなる方法が提供される。 （もっと読む）

【課題】量的変化が正確にわかる遺伝子変異検出システムを提供する。
【解決手段】特定部位用プライマーを用いて、第1のPCRで核酸配列の特定部位を幅して特定部位を含む第1の増幅産物を取得し、制限酵素の認識部位を含む認識部位導入用プライマーを用いて、第2のPCRで第1の増幅産物を増幅して制限酵素の認識部位で挟まれた特定部位を含む第2の増幅産物を取得し、制限酵素を用いて第2の増幅産物から切り出された特定部位を含むオリゴヌクレオチド断片の質量スペクトルを生成するスペクトル生成機構301、質量スペクトルにおける、特定部位の野生型配列のピーク、及び特定部位の変異型配列のピークの面積比の算出値を算出する面積比算出機構302、予め取得された面積比と野生型配列及び変異型配列の存在比との関係に基づいて、面積比の算出値から野生型配列及び変異型配列の存在比の測定値を求める存在比算出機構303を備える。 （もっと読む）

本発明は、遺伝子配列検出のためにサンプルを回収および処理して、ＤＮＡおよびＲＮＡを遊離および処置するための方法、キットならびにシステムに関する。本明細書に記載の方法は、組織および細胞材料からのＤＮＡおよびＲＮＡの迅速かつ簡便な遊離、ならびに回収を提供する。 （もっと読む）

【課題】ペルオキシダーゼ酵素によるフェノール基質の生成物への変換を高める方法を提供する。
【解決手段】検出可能に標識されたフェノール含有分子を含む結合体とペルオキシダーゼ酵素とを、
次式、


示される有機化合物を含む促進試薬の存在下に反応させる。 （もっと読む）

本開示は、生物を同定する方法を特徴とする。この方法は、（ａ）核酸サンプルを生物から得る工程；（ｂ）上記核酸を画像化する工程；（ｃ）上記核酸の制限マップを得る工程；および、（ｄ）上記核酸の制限マップと、制限マップデータベースとを相関させることによって、上記生物を同定する工程、を包含する。詳細な制限マップデータベースを使用すると、上記生物は、属レベルおよび種レベルでのみならず、亜種レベル（株、亜株、および／もしくは単離物レベル）でも、同定かつ分類され得る。 （もっと読む）

【課題】ＡＴＬＬの予後推定、具体的にはＨＴＬＶ-Ｉのキャリアーの発症可能性、aggressive病型への進展の予測に利用できる予後推定用データを提供するデータの作成方法およびそのための予後推定検査用キットを提供すること。
【解決手段】対象とする遺伝子として単離された末梢血単核細胞のＳＨＰ1遺伝子、ｐ15遺伝子、ｐ16遺伝子、ｐ73遺伝子、ｈＭＬＨ１遺伝子、ＭＧＭＴ遺伝子、ＤＡＰＫ遺伝子およびＨＣＡＤ遺伝子よりなる遺伝子群から２種以上の遺伝子を選択し、それらの遺伝子のプロモーター領域におけるＣｐＧ島のメチル化プロファイル、およびそれに基づくＣＩＭＰを求め、それらよりATLL発症・進展危険度スコアを算出し前記予後推定用のデータとする、予後推定用データの作成方法および該方法に用いられる予後推定検査用キット。 （もっと読む）

チクングニヤウイルスの核酸を検出するための組成物、方法およびキット。核酸増幅を用いて非常に低いレベルのウイルス核酸を検出するための方法が、特に記載される。具体的には、本発明の一態様は、核酸を含む試験試料中にチクングニヤウイルス（ＣＨＩＫＶ）核酸配列が存在するかどうかを決定するための方法に関する。先ず、試験試料の核酸を１セットの増幅オリゴヌクレオチドと接触させる工程がある。次に、増幅オリゴヌクレオチドセットと一緒に試験試料の核酸を鋳型として用いて、インビトロの核酸増幅反応を実施する工程がある。試験試料がＣＨＩＫＶ核酸配列を含むならば、増幅生成物が生成される。最後に、本発明の方法は、インビトロの核酸増幅反応で生成されている可能性のある増幅生成物のいずれかを検出する工程を含む。
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本発明は、病原体において発現された小ペプチドファミリーの濃度増加の比またはサイクルを特定することによって、病原体の毒性、罹患率および／または死亡率の増加、あるいは、領域内での、または新しい領域への病原体集団の拡大を予測する方法を提供し、また、病原体大発生の処理および予防のためのこの小ペプチドを含む化合物を提供する。 （もっと読む）

【課題】HIV-1のＯタイプ（またはサブタイプ）のレトロウイルス抗原のヌクレオチド配列を提供する。
【解決手段】HIV-1のＯタイプVAU株、またはHIV-1のＯタイプ（またはサブタイプ）のDUR株による感染により得られる血清から単離できる抗体により認識されうる、HIV-1のＯタイプ（またはサブタイプ）のレトロウイルスの、タンパク質、または天然、若しくは合成の、ポリペプチド、若しくはペプチドである。 （もっと読む）

本発明は、光学センサ装置の導電性材料表面において行われる表面プラズモン共鳴技術を用いる、所定の細菌宿主株に感染可能なバクテリオファージを検出および／または定量化するための方法およびシステムに関する。また、本発明は、上記方法を実施するマイクロ電子センサ装置に関し、さらに、バクテリオファージを検出および／または定量化するためのマイクロ電子センサ装置の使用に関する。
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【課題】短時間でより簡便、且つ安価にHBVの薬剤耐性株を検出可能な核酸プライマーセット、アッセイキットおよびB型肝炎ウィルスの薬剤耐性株の検出方法を提供する。
【解決手段】プライマーセットを用いて試料溶液中のＢ型肝炎ウイルス核酸をＬＡＭＰ増幅し増幅産物を得る工程と、
前記増幅産物と、薬剤耐性株由来のポリヌクレオチドを含むプローブおよび非薬剤耐性株由来のポリヌクレオチドを含むプローブとをハイブリダイゼーションさせ、Ｂ型肝炎ウィルスの薬剤耐株を検出する工程とを具備するＢ型肝炎ウィルスの薬剤耐株の検出方法。 （もっと読む）

請求項に記載の方法、システム、および装置は、所望のバクテリオファージを検出するために、電極の界面において生成されるインピーダンスの変化の測定に基づく。この電極の界面上に宿主株からの細菌を予め付着させておく。電極と細菌との界面において生じる変化は、マイクロ電子センサ装置の作用電極の表面に付着する細菌におけるバクテリオファージのファージ作用に由来する。
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【課題】単純疱疹ヘルペスウイルス（HSV-1）を標的とするアプタマーを取得し、HSV-1に対して有効でかつ副作用のない抗ウイルス剤、及び該ウイルス検査薬を新たに提供する。
【解決手段】HSV-1単純疱疹ヘルペスウイルス（HSV-1）のｇＤプロテインに結合能を有するＲＮＡ分子アプタマーをＳＥＬＥＸ法を用いて作成するとともに、さらにこれは短縮化してアプタマーとする．このアプタマーは、ＨＳＶ-１に対し特異的であり、該ウイルスの宿主細胞への侵入を阻害する。 （もっと読む）

生物材料を構成する液状媒体Ｍ内に存在する感染性化合物の検出及び／又は定量及び／又は同定のためのインビトロの方法であって、マイクロビーズの液状懸濁媒体中懸濁液を調製し、前記マイクロビーズにβ２ＧＰＩタンパク質を導入し、少なくとも１種類の酸化性金属のイオンを添加しつつ、前記導入された前記マイクロビーズを液状媒体Ｍと接触させることにより、前記β２ＧＰＩタンパク質に感染性化合物を結合させ、前記により調製されたマイクロビーズを懸濁媒体から分離して残渣を得、前記残渣から感染性化合物を検出及び／又は定量及び／又は同定する。 （もっと読む）

【課題】遺伝子型の異なる種々のＨＣＶについて測定が可能で、かつ、ウイルス濃度が極めて少ない検体においても、定量的で高い増幅産物量を得ることができるプライマーとプローブとのセット、リアルタイム検出ＰＣＲ法によるＣ型肝炎ウイルスＲＮＡ検出用キット、ならびにリアルタイム検出ＰＣＲ法によるＣ型肝炎ウイルスＲＮＡの検出方法の提供。
【解決手段】プライマーとプローブとのセットは、特定の塩基配列と９０％以上の相同性を有する塩基数１４〜２２のオリゴヌクレオチドからなるフォワード側プライマーと、特定の塩基配列と９０％以上の相同性を有する塩基数１４〜２２のオリゴヌクレオチドからなるリバース側プライマーと、ドナー蛍光色素およびアクセプター蛍光色素が結合した、特定の塩基配列と９０％以上の相同性を有する塩基数１６〜２７のオリゴヌクレオチドからなる蛍光プローブとのセットである。 （もっと読む）