【解決手段】 ユビキチンリガーゼ及びユビキチンリガーゼモジュレーターを同定する方法が開示される。この方法は、ユビキチン化反応の成分を結合する工程、及びユビキチン化の検出におけるユビキチン化部位を認識するモチーフを含むタンパク質を使用する工程を有する。
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【課題】単一もしくは複数のヌクレオチド変異を検出するために種々の方法が使用されている。多くの方法は、分析前に一般にＰＣＲによりターゲット配列を増幅することに依存している。従って、対立遺伝子の変異の位置に関する有意な情報は失われてしまう。この欠点を補う検出法の提供。
【解決手段】錠型プローブとハイブリダイズする部位の近傍もしくは好ましくはその部位でターゲット核酸を切断し、これにより切断されたターゲット核酸の３’端が、錠型プローブのローリングサークル複製のためのプライマーとして機能することを含む。それぞれがオリゴヌクレオチド標識を有する二つのアフィニティープローブおよび二つのアフィニティープローブと結合したローリングサークル複製のための錠型プローブを利用することにより、ポリエピトープ・ターゲットをアッセイする方法も含まれる。 （もっと読む）

【課題】新規の移動度改変ポリマーを提供すること。
【解決手段】ポリマー部分およびホスホルアミダイト部分を含む移動度改変ホスホルアミダイト官能化試薬、ヌクレオ塩基ポリマー官能化試薬、移動度改変配列特異的ヌクレオ塩基ポリマー、複数の移動度改変配列特異的ヌクレオ塩基ポリマーを含む組成物、ならびに種々のアッセイ、例えば、１つ以上の標的核酸中の複数の選択されたヌクレオチド配列の検出のためのアッセイにおけるこのようなポリマーおよび組成物の使用。 （もっと読む）

本開示により、酵素反応を含む、配列特異的核酸標的捕捉のための方法およびシステムが提供される。本開示は、基材、例えばマイクロアレイスライド上、および溶液形式で、flapエンドヌクレアーゼ、リガーゼおよび/またはさらなる酵素、タンパク質または化合物を用いる、標的核酸配列の捕捉およびその後の検出のための複数のオリゴヌクレオチドプローブに関する。
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【課題】糖尿病性腎症の発症や進行を予防しまたは治療するための有効成分となりえる物質を探索する方法の提供。尿病性腎症を発症する潜在的危険性の高い患者を選択する方法、ならびに当該方法に有効に利用することのできる試薬キットの提供。
【解決手段】抗糖尿病性腎症剤の有効成分のスクリーニングに際して、下記の工程を行う：
（１）被験物質とＡＣＣ-β遺伝子を発現可能な細胞とを接触させる工程、
（２）被験物質を接触させた細胞のＡＣＣ-β遺伝子の発現量を測定する工程、及び
（３）上記の測定量が、被験物質を接触させない対照細胞のＡＣＣ-β遺伝子の発現量よりも小さい被験物質を選択する工程。 （もっと読む）

非相補領域と相補領域（非相補領域は第一の増幅プライマー部位と第二の増幅プライマー部位とを含み、かつ相補領域は配列決定プライマー部位と1個または複数個のイノシン種とを含む）とを含む半相補二本鎖核酸アダプターを含む、効率的な標的加工のためのアダプター要素の態様が、記載される。

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１つ以上の種のＲＮＡ分子を検出するための組成物、方法およびキットが、開示される。１つの実施形態において、第１アダプターおよび第２アダプターは、二本鎖特異的ＲＮＡリガーゼ活性を含むポリペプチドを用いて、介在する精製工程を行うことなく、ＲＮＡ分子に連結される。その連結産物は、逆転写され、次いで、その逆転写産物中のリボヌクレオシドのうちの少なくとも一部が、除去される。プライマーが加えられ、そして増幅産物が生成される。ある特定の実施形態では、少なくとも１種の増幅産物の少なくとも一部の配列が決定され、そして対応するＲＮＡ分子の少なくとも一部が、決定される。いくつかの実施形態において、増幅産物種のうちの少なくとも一部が、直接または間接的に検出されることにより、目的のＲＮＡ分子の存在および／または量の測定が可能になる。 （もっと読む）

【課題】DNAとの結合性および反応活性が向上した耐熱性DNAリガーゼを得る。
【解決手段】好熱性細菌、超好熱性細菌、好熱性古細菌または超好熱性古細菌由来の耐熱性DNAリガーゼのC末端ヘリックス部分のN末端側に存在する負の荷電性アミノ酸（たとえば、配列番号１の540番目のアスパラギン酸に対応するアミノ酸）を負の電荷を持たないアミノ酸（たとえば、アラニン、セリン、アルギニン、またはリジン等）に置換して得られる、野生型よりもDNA結合性が向上していることを特徴とする改変型耐熱性DNAリガーゼ。 （もっと読む）

【課題】高い精度で、迅速かつ簡便に組み込み型ＨＰＶの有無を判定することができる組み込み型ＨＰＶの有無の判定方法を提供すること。
【解決手段】被験者の細胞から抽出されたＤＮＡを含有する第一試料を得、該ＤＮＡを、エキソヌクレアーゼ活性を有する酵素で処理して得られた第二試料を得、第一試料中に含まれるＨＰＶのＤＮＡの量に関する第一情報と、第二試料中に含まれるＨＰＶのＤＮＡの量に関する第二情報とを取得し、第一情報と第二情報とに基づいて、前記細胞中の組み込み型ＨＰＶの有無を判定する組み込み型ＨＰＶの有無の判定方法。 （もっと読む）

本発明は、例えばタンパク質 相補性 アッセイに有用な、ハイブリッド融合タンパク質をコードするベクター及び異なるハイブリッド融合タンパク質をコードするベクターセットを提供する。 （もっと読む）

線状ジペプチドの合成におけるCDSの使用、並びに対応するポリヌクレオチドを用いる線状ジペプチド、特にPhe-Leu、Leu-Phe、Phe-Phe、Phe-Tyr、Tyr-Phe、Leu-Leu、Leu-Tyr、Tyr-Leu、Phe-Met、Met-Phe、Leu-Met、Met-Leu、Tyr-Met、Met-Tyr、Met-Met、Tyr-Tyr、Ile-Met、Met-Ile、Leu-Ile、Ile-Leuのインビボ及びインビトロ合成のためのその応用。 （もっと読む）

分析物を検出および定量するための方法、キットおよび組成物が提供される。典型的には、本方法では、分析物特異的結合剤と分析物との間で複合体が形成される。分析物特異的結合剤は、結合分子および分析物の存在を示すＰＣＲ鋳型を生成する活性を有する酵素を含んでいる。ＰＣＲ鋳型の増幅および検出は、分析物濃度の感受性および定量的測定を生じさせる。
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【課題】核酸のようなポリマー分子の物理的特性、例えばサイズおよび重量、を測定する方法の提供。
【解決手段】変形可能な分子または変形不能な分子に、コンホメーションの変化または位置の変化を起こさせる外部力をかけて、その変化を測定する。適した方法としては、１）混乱させる力(perturbing force)の向きを変えるときに分子が新たな方向に向くようになる速度を測定する、２）外部力の終了後に変形可能な分子が緩和状態にもどる速度を測定する、３）分子が回転する速度を測定する、４）分子が部分的に伸長するとき、その分子の長さを測定する、または５）球形もしくは楕円形の分子の直径を測定することが含まれる。これらの測定は画像情報処理装置または分光学的装置に接続した光学顕微鏡を使って行うことができる。核酸の制限酵素消化物のサイズを決定してその位置をマッピングするのに使用することができる。 （もっと読む）

【課題】高感度かつ簡便に遺伝子の発現、もしくはその定量を可能にする核酸増幅法の提供。
【解決手段】標的遺伝子１に対して、標的遺伝子を認識する塩基配列部分と、標的遺伝子とは無関係な塩基配列１３，２３とを有する２種類のオリゴヌクレオチドプローブ２１を作用させ、ＤＮＡライゲースを用いて２種類のオリゴヌクレオチドプローブにライゲーションを行い、生じた一本鎖オリゴヌクレオチドに対してＬＡＭＰ増幅を行うことを特徴とする核酸増幅法。 （もっと読む）

【課題】塩基の変更、挿入、欠失または転座により、多数標的ヌクレオチド配列と相違している、少数標的ヌクレオチド配列を、両配列を含むサンプル中で検出する方法の提供。
【解決手段】少数鋳型を正常鋳型の過剰の存在下に熱安定性リガーゼで識別するのに、リガーゼ検出反応を用いる方法。この方法は、変異リガーゼ、熱安定性リガーゼまたは修飾オリゴヌクレオチドプローブで実施でき、特に癌関連変異の検出に有用である。また少数鋳型の量および比率の測定を可能とする利点を有する。 （もっと読む）

【課題】複数のポリヌクレオチドの並行配列決定のための方法を提供する。
【解決手段】方法は、（ａ）微粒子の集団を用意する工程であって、各微粒子がただ１種のポリヌクレオチドを結合させている工程と、（ｂ）前記微粒子の集団を平面基板上に分散させる工程と、（ｃ）標識された配列決定試薬を用いて、処理および検出の連続的なサイクルを通じて、各微粒子からのヌクレオチドの配列を並行して同定する工程（前記処理操作は標識ヌクレオチドとポリメラーゼまたはリガーゼを用いて行う。）と、を含む。 （もっと読む）

本発明は、癌を発症するように遺伝子的に改変されたトランスジェニックな非ヒト哺乳類動物を特徴とする。本発明はまた、染色体的に不安定な動物モデルを用いてヒトの癌に潜在的に関連する遺伝子または遺伝子エレメントを同定するための方法に関する。そのような遺伝子的改変に関する情報を使用して、癌治療の結果を予測し、治療効果を最大限にするために患者集団を階層化することができる。１つの態様において、本発明は、癌を発症するように遺伝子的に改変された非ヒトトランスジェニック哺乳類を提供し、この非トランスジェニック哺乳類は、この哺乳類に由来する癌細胞のゲノムが、遺伝子改変を有さない哺乳類における染色体構造異常の頻度よりも少なくとも５倍高い頻度において染色体構造異常を含む。
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本発明は、炭化水素および炭化水素中間体の合成に関与する単離核酸および単離ポリペプチドを提供する。炭化水素および炭化水素中間体の合成に関与する核酸のホモログ、保存的変異体、およびかかる核酸と少なくとも約 35%の配列同一性を有する配列も提供される。本発明はさらに、脂肪族ケトンまたは炭化水素を生産する方法、ならびに、炭化水素の生産に有用な酵素を同定する方法も提供する。
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本発明は、Ｓｅｐｔ４タンパク質のパーキン媒介性のユビキチン化を測定する、パーキン活性についてのインビトロ、エクスビボおよびインビボアッセイを提供する。該アッセイはパーキンタンパク質のリガーゼ活性を調節する剤についてスクリーニングするのに使用しうる。 （もっと読む）

【課題】本発明の目的は、添加剤を検討し、−３０℃保存で少なくとも一週間凍結しないリガーゼ組成物、および使用方法を提供することである。また、それらを含有する試薬・キットおよび製造法を提供することである。
【解決手段】−３０℃保存で少なくとも１週間凍結しない、ＤＮＡリガーゼ反応組成物であって、好ましくはベタイン及びグリセロールを含有する組成物。 （もっと読む）