本発明は、生物マーカーを使用して癌を検出する方法を提供する。本発明は、１つには、タンパク質、核酸、多型、代謝産物、およびその他の分析物などの、ある生物学的マーカー（本明細書では、「ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ」と呼ぶ）、ならびにある生理学的条件および状態が、転移性腫瘍を発症するリスクの高い被験体において存在し、または変化するという発見に関する。したがって、一態様では、本発明は、被験体における転移性腫瘍を発症するリスクを評価するための方法を提供する。
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【課題】本研究において、ブタ特異的リアルタイムＰＣＲアッセイを、ハラール認証のために開発する。
【解決手段】３種の肉試料：ブタ、ウシ及びトリを用いた。マレーシアでは、これら３種の家禽肉が一般的に消費される肉であり、市場で容易に利用できる。各生肉試料からのＤＮＡを、ＤＮイージー（登録商標）ブラッド＆ティッシュキット（ＤＮｅａｓｙ Ｂｌｏｏｄ ＆ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）（Ｑｉａｇｅｎ、ヒルデン、ドイツ）を使用して抽出することに成功した。抽出されたＤＮＡの濃度を、バイオフォトメーター（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ ＡＧ、ハンブルグ、ドイツ）を使用してＵＶ吸光光度分析により評価した後、リアルタイムＰＣＲ反応を行う。プライマーのアニーリング温度は、５８℃である。設計されたプライマーの特異性を検証するために、他の２種の肉試料に対してプライマーを試験するための反応を実施して、交差反応の可能性を検出した。この反応は、Ｃｔ±２２．８３においてブタのＤＮＡのみを増幅した。本明細書に記載のリアルタイムＰＣアッセイは、試料を試験した場合、非常に感度が高く、検出限界が低いことが証明されている。このアッセイを、１００ｎｇＤＮＡから出発した１０倍連続希釈を調製することによって実施し、この反応の感度を測定するために使用した。この感度の閾値はブタＤＮＡ０．００１ｎｇまでであった。従来のＰＣＲを使用した検出限界はブタＤＮＡ０．１ｎｇであることが報告されている。この状況から、本方法は食品中のブタＤＮＡの検出において有用であると思われる。 （もっと読む）

本出願は、抗ウイルス療法が有効であるかどうかを決定するための方法に関する。特に本出願は、肝臓のウイルス感染がある対象が、インターフェロン（ＩＦＮ）活性の刺激を含む抗ウイルス療法に応答する可能性を決定するための、ｍｉＲＮＡ、例えばｍｉＲ−１２２またはｍｉＲ−２９６−５ｐを使用する方法、および前記決定の実施のためのキットを提供する。 （もっと読む）

本発明は、SlMYB12転写因子のダウンレギュレーションがトマト果実の無色の果皮y表現形をもたらすことを開示する。本発明は、無色の果皮表現形を有するトマト草木の繁殖および変更したフラボノイド含量を有する遺伝形質転換草木の生産に有用なトマトSlMYB12転写因子をコードするポリヌクレオチドおよびそれに由来した遺伝子マーカーを提供する。 （もっと読む）

【課題】トビウオ類あるいは加工食品等に含まれるトビウオ類の特異的検出法の提供。
【解決手段】トビウオ類のミトコンドリア１６ＳリボソームＲＮＡをコードする遺伝子を含むＤＮＡ、トビウオ類に特異的な配列を有するＤＮＡプライマー、該プライマーを用いて、トビウオ類あるいは加工食品等に含まれるトビウオ類のミトコンドリア１６ＳリボソームＲＮＡをコードする遺伝子を含むＤＮＡを増幅するトビウオ類の検出方法。 （もっと読む）

【課題】栽培品種化（家畜化）植物または動物における商業的にもしくは審美的に価値のある形質を制御するポリヌクレオチドを同定する方法を提供することが本発明の課題である。
【解決手段】本発明は、栽培品種化（家畜化）植物または動物における商業的にもしくは審美的に重要な形質に関連することもあり得るポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を同定するための方法を提供する。当該方法は、進化的に有意の変化および進化的に中立の変化を同定するために、当該栽培化生物およびその祖先からの相同遺伝子の比較を用いる。このように同定された配列は、栽培化生物またはそれらの祖先における商業的にもしくは審美的に望ましい形質を増強するのに役立つことも可能である。 （もっと読む）

【課題】本願発明は、幼若ホルモン（JH）に応答して転写を誘導するJH応答エレメント（JHRE）、JHREを用いたJHアゴニストおよびアンタゴニストのアッセイおよびスクリーニング方法、ならびにJHアゴニストおよびアンタゴニストを用いた遺伝子発現制御システムを提供する。また本発明は、JHに高い応答性を有する遺伝子、蛋白質、並びにそれらの利用等を提供する。
【解決手段】JHに対して顕著な応答性を有し、下流の遺伝子の転写をJHに応答して誘導することができる配列（JHRE）を同定した。このJHREは、JHおよびそのアナログに対して用量依存的な転写誘導活性を示し、異種プロモーターと組み合わせて使用することも可能であった。またこのJHREを用いて、哺乳動物細胞を用いたJH誘導発現系を構築することにも成功した。本発明を利用すれば、培養細胞等を用いて、JHアゴニストおよびアンタゴニストのアッセイやスクリーニングを効率よく実施することが可能となる。 （もっと読む）

【課題】極微量の液体分注を簡易な機械構成で可能にする加圧分注方法において、特に試薬導出部と反応液が接触する場合に、目的外の核酸基質が混入する危険性を低減し、パイロシーケンシング法による遺伝子解析装置を実現するために必要な技術を提供する。
【解決手段】本発明は、試薬導出部を具備しかつ試薬を収める試薬容器を保持する試薬容器保持手段と、試薬容器保持手段を上下方向に移動させる上下移動手段と、試薬容器から試薬の供給を受けるための反応槽と、加圧により試薬容器から反応槽へ試薬を供給するための圧力印加手段と、試薬導出部の内部に気体層を設けるための陰圧発生手段と、反応槽に振動を印加する振動印加手段と、反応槽について光学的に検出する検出器とを備える分析装置であって、圧力印加手段により試薬を供給した後に圧力を排出するための排出口を有し、排出口が開口する圧力が、試薬導出部の内径から予め決まる圧力以下であることを特徴とする前記分析装置に関する。 （もっと読む）

【課題】ウシの採卵性を遺伝子レベルで簡便に判定し得る手段を提供すること。
【解決手段】採卵性の良いウシ集団と悪いウシ集団を用いてゲノム連鎖解析を行ない、ポジショナルクローニング法により、採卵性と密接に関連するウシGRIA1遺伝子を同定した。該遺伝子はイオンチャネルをコードし、そのチャネル活性が低下する変異（例えばaa306のアミノ酸置換）を有するウシ個体では、該変異を有さないウシと比較して、過排卵処理後の回収卵数が減少する。従って、GRIA1遺伝子の変異を指標とすれば、ウシの採卵性を判定することができる。 （もっと読む）

【課題】核酸配列および核酸配列の変化を検出し特徴づけるための手段、および、核酸配列を検出し特徴づけるための改良された開裂手段の提供。
【解決手段】Pyrococcus、Methanococcus、Methanobacterium、ArchaeoglobusのＦＥＮ−１エンドヌクレアーゼ種々の構造特異的ヌクレアーゼ、および、これらの構造特異的ヌクレアーゼの標的依存性の開裂構造体を開裂し、それにより特異的核酸配列またはその特異的変異の存在を示すための使用。 （もっと読む）

【課題】対象タンパク質が核局在シグナル配列を含む場合であっても、タンパク質間相互作用の動態を精度よく解析することができ、その結果、実験の再現性を改善することができる、タンパク質相互作用解析方法を提供することを課題とする。
【解決手段】本発明は、互いに結合することにより発光酵素活性が回復するよう分割させたＮ末側発光酵素とＣ末側発光酵素を調整し、Ｎ末側発光酵素と融合させた一方のタンパク質、および、Ｃ末側発光酵素と融合させた他方のタンパク質を含む細胞を作製し、作製した細胞に当該細胞外から所定の発光基質を添加し、所定の発光基質が与えられた細胞の発光画像を撮像し、撮像した発光画像に基づいて、細胞内におけるタンパク質の相互作用の動態を解析する方法において、作製工程において、少なくとも一方のタンパク質の核局在シグナル配列を変異させることを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】簡易に合成することができ、かつ標識の多様性に優れたＰＣＲ用プライマー、並びに、該プライマーを用いて標的核酸及び標的生体分子を検出する方法の提供。
【解決手段】ＰＣＲ（Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ）に用いられるプライマーであって、プライマー領域と、前記プライマー領域の５’側にＰＣＲ阻害領域と、前記ＰＣＲ阻害領域の５’側にアプタマー領域とを有し、前記ＰＣＲ阻害領域が、ヘアピンループ構造又はシュードノット構造を有することを特徴とする、ＰＣＲ用プライマー、該プライマーを用いて標的塩基配列を有する標的核酸を検出する方法、及び該プライマーを用いて試料溶液中の標的生体分子を検出する方法。 （もっと読む）

【課題】簡便にＤＮＡを定量又は検出する方法を提供する。
【解決手段】（１）検体中に含まれるＤＮＡから、目的とする領域の塩基配列を含むＤＮＡを取得する第一工程、（２）第一工程で得られた前記ＤＮＡをメチル化酵素で処理し、メチル化ＤＮＡを取得する第二工程、（３）第二工程で得られた前記メチル化ＤＮＡから、一本鎖メチル化ＤＮＡをを取得する第三工程、（４）第三工程で選択された前記一本鎖メチル化ＤＮＡと、固定化メチル化ＤＮＡ抗体と、を結合させて、該メチル化された目的とするＤＮＡ領域を含む一本鎖メチル化ＤＮＡと、該固定化メチル化ＤＮＡ抗体と、の複合体を形成させて、該複合体を取得する第四工程等を含む検体中に含まれるＤＮＡ中の目的とする領域のメチル化されたＤＮＡの含量を定量または検出する方法等を提供する。 （もっと読む）

伸びている核酸ストランドの３’末端に導入された蛍光ヌクレオチドアナログの同一性を検出することによる核酸配列決定システム及び方法が提供される。一方法は、（ａ）鋳型核酸、該鋳型にハイブリダイズするように構成されたプライマー及びポリメラーゼを含有する複数の複合体を、基板の複数の光検出部位に固定し、ここで、基板は導波路ベース光学的スキャニングシステムの一部であり；（ｂ）ポリメラーゼ伸長反応を使用してポリメラーゼ及び一又は複数の蛍光ヌクレオチドアナログを用いてプライマーを単一ヌクレオチドだけ伸長させ、ここで、各蛍光ヌクレオチドアナログの各タイプは更なるプライマー伸長を阻害するように構成されていてもよい独特の蛍光タグ及び／又はブロッキング剤を３’末端に含み、蛍光ヌクレオチドアナログの導入はポリメラーゼ伸長反応を可逆的に終結させ；（ｃ）光学的スキャニングシステムを使用して基板を光学的にスキャンすることにより蛍光ヌクレオチドアナログの独特のタグを検出して、ポリメラーゼ反応により導入された蛍光ヌクレオチドアナログを同定し；（ｄ）基板の光学的スキャニングの結果を記録し；（ｅ）光開裂光パルスを基板の光検出部位の一又は複数に供給することによってポリメラーゼ伸長反応の終結を逆転させて、蛍光タグ又はブロッキング剤を切断し；（ｆ）工程（ｂ）から（ｅ）を繰り返す、工程を含む。
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哺乳動物における状態の診断および／または分析する方法ならびに組成物を、微小胞からのＲＮＡを増殖および分化させて、微小胞を得た組織または臓器の状態の指標である結果を得ることを開示する。特に好ましい実施形態において、前記状態はヒトの腫瘍疾患であり、１個以上の異なるＲＮＡの分画分析によって特定および段階分けし、任意に微小胞の非ＲＮＡ成分の特定および分析を伴うことができる。 （もっと読む）

本発明の目的は、完全な５’末端配列を含む未知の配列を含む、増幅した二本鎖核酸の混合物を製造する方法を提供することである。該方法は、増幅した二本鎖核酸の混合物を製造する方法であって、（ａ）一本鎖アダプター１、一本鎖核酸断片及び一本鎖アダプター２を含む一本鎖核酸を調製すること、及び（ｂ）工程（ａ）において調製した前記一本鎖核酸、プライマー１、及びプライマー２を用いてＰＣＲを行い、二本鎖核酸を増幅することを含む、方法である。 （もっと読む）

【課題】ＨＩＶ−１核酸配列の増幅・検出方法を提供する。
【解決手段】ＨＩＶ−１群Ｍ、Ｎ及びＯ、並びに前記群内ないし前記群に由来する各種サブタイプを含めたＨＩＶ−１変異体を特異的且つ高感度で増幅・検出するためのオリゴヌクレオチドプライマーセット、プローブ、及び前記したプライマーセットとプローブの組合せ及び試薬を用意して、試験サンプル中のＨＩＶ−１標的配列を増幅・検出を行う。高感受性でＨＩＶ−１を検出することが出来る。 （もっと読む）

本発明はSWI5遺伝子、それに対応するmRNA、特異的なプローブ、プライマーおよびそれに関連したオリゴヌクレオチド、並びに真菌および酵母種の検出および/または識別用の診断アッセイへの使用に関する。 （もっと読む）

本発明は、ループスの感受性を診断または検出するのに役立つバイオマーカーを提供する。本発明はまた、良好な特異性および選択性を伴いループスの感受性を診断し、または検出する際に役立つバイオマーカーのパネルを提供する。また、前記バイオマーカーおよび前記バイオマーカーのパネルは、ループスの進行または退行をモニターすることに、病気のフレアの進行、またはフレアから鎮静への移行をモニターすることに、またはループスの治療上の薬剤の有効性をモニターすることにおいて有用でもある。 （もっと読む）

本明細書では、核酸を増幅するための方法および組成物が提供される。これらの方法は、核酸増幅反応における、３’置換ヌクレオシド５’−三リン酸、または３’置換終結プライマーの使用を伴う。特定の態様において、該方法は、核酸増幅において有用性をもたらす、３’置換ＮＴＰおよび／または３’置換終結プライマーを用いることにより達成される。好ましい実施形態において、該ＮＴＰおよび／またはプライマーは、３’位置において、エーテル、エステル、または炭酸エステルなど、特定の熱不安定性の化学基により置換される。
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