本発明は、新規のタンパク質を含む組成物と、免疫関連疾患の診断と治療のためのその組成物の使用法とに関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
図１（配列番号１）、図３（配列番号３）、図５（配列番号５）、図７（配列番号７）、図９（配列番号９）、図１１（配列番号１１）、図１３Ａ−Ｂ（配列番号１３）、図１５（配列番号１５）、図１７（配列番号１７）、図１９（配列番号１９）、図２１（配列番号２１）、図２３（配列番号２３）、図２５（配列番号２５）、図２７（配列番号２７）、図２９（配列番号２９）、図３１Ａ−Ｂ（配列番号３１）、図３３（配列番号３３）、図３５（配列番号３５）、図３７（配列番号３７）、図３９Ａ−Ｂ（配列番号３９）、図４１Ａ−Ｃ（配列番号４１）、図４３（配列番号４３）、図４５（配列番号４５）、図４７（配列番号４７）、図４９（配列番号４９）、図５１（配列番号５１）、図５３（配列番号５３）、図５５（配列番号５５）、図５７（配列番号５７）、図５９Ａ−Ｂ（配列番号５９）、図６１Ａ−Ｂ（配列番号６１）又は図６３（配列番号６３）に示すヌクレオチド配列に対して、少なくとも８０％の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項２】
図１（配列番号１）、図３（配列番号３）、図５（配列番号５）、図７（配列番号７）、図９（配列番号９）、図１１（配列番号１１）、図１３Ａ−Ｂ（配列番号１３）、図１５（配列番号１５）、図１７（配列番号１７）、図１９（配列番号１９）、図２１（配列番号２１）、図２３（配列番号２３）、図２５（配列番号２５）、図２７（配列番号２７）、図２９（配列番号２９）、図３１Ａ−Ｂ（配列番号３１）、図３３（配列番号３３）、図３５（配列番号３５）、図３７（配列番号３７）、図３９Ａ−Ｂ（配列番号３９）、図４１Ａ−Ｃ（配列番号４１）、図４３（配列番号４３）、図４５（配列番号４５）、図４７（配列番号４７）、図４９（配列番号４９）、図５１（配列番号５１）、図５３（配列番号５３）、図５５（配列番号５５）、図５７（配列番号５７）、図５９Ａ−Ｂ（配列番号５９）、図６１Ａ−Ｂ（配列番号６１）又は図６３（配列番号６３）に示すヌクレオチド配列の完全長コード化配列からなるヌクレオチド配列に対して、少なくとも８０％の核酸配列同一性を有する単離された核酸。
【請求項３】
図１（配列番号１）、図３（配列番号３）、図５（配列番号５）、図７（配列番号７）、図９（配列番号９）、図１１（配列番号１１）、図１３Ａ−Ｂ（配列番号１３）、図１５（配列番号１５）、図１７（配列番号１７）、図１９（配列番号１９）、図２１（配列番号２１）、図２３（配列番号２３）、図２５（配列番号２５）、図２７（配列番号２７）、図２９（配列番号２９）、図３１Ａ−Ｂ（配列番号３１）、図３３（配列番号３３）、図３５（配列番号３５）、図３７（配列番号３７）、図３９Ａ−Ｂ（配列番号３９）、図４１Ａ−Ｃ（配列番号４１）、図４３（配列番号４３）、図４５（配列番号４５）、図４７（配列番号４７）、図４９（配列番号４９）、図５１（配列番号５１）、図５３（配列番号５３）、図５５（配列番号５５）、図５７（配列番号５７）、図５９Ａ−Ｂ（配列番号５９）、図６１Ａ−Ｂ（配列番号６１）又は図６３（配列番号６３）に示すヌクレオチド配列からなる単離された核酸。
【請求項４】
請求項１に記載の核酸を含んでなるベクター。
【請求項５】
ベクターで形質転換された宿主細胞によって認識されるコントロール配列に作用可能に結合している請求項４に記載のベクター。
【請求項６】
請求項４に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項７】
ＣＨＯ細胞、大腸菌、又は酵母細胞である、請求項６に記載の宿主細胞。
【請求項８】
ＰＲＯポリペプチドの製造方法において、前記ＰＲＯポリペプチドの発現に適した条件下で請求項６に記載の宿主細胞を培養し、細胞培養物から前記ＰＲＯポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項９】
図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図６（配列番号６）、図８（配列番号８）、図１０（配列番号１０）、図１２（配列番号１２）、図１４（配列番号１４）、図１６（配列番号１６）、図１８（配列番号１８）、図２０（配列番号２０）、図２２（配列番号２２）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図３２（配列番号３２）、図３４（配列番号３４）、図３６（配列番号３６）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２Ａ−Ｂ（配列番号４２）、図４４（配列番号４４）、図４６（配列番号４６）、図４８（配列番号４８）、図５０（配列番号５０）、図５２（配列番号５２）、図５４（配列番号５４）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８）、図６０（配列番号６０）、図６２Ａ−Ｂ（配列番号６２）又は図６４（配列番号６４）に示すポリペプチドのアミノ酸配列の何れか一つに対して少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項１０】
異種アミノ酸配列と融合した請求項９に記載のポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項１１】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列又はイムノグロブリンのＦｃ領域である、請求項９に記載のキメラ分子。
【請求項１２】
請求項９に記載のポリペプチドと特異的に結合する抗体。
【請求項１３】
モノクローナル抗体、ヒト化抗体、又は一本鎖抗体である、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１４】
（ａ）請求項９に記載のポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアゴニスト、（ｃ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、或いは（ｄ）前記ポリペプチドと結合する抗体、を担体と組み合わせてなる組成物。
【請求項１５】
前記担体が製薬的に許容可能な担体である、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
（ａ）、（ｂ）、（ｃ）又は（ｄ）の治療的有効量を含む、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１７】
容器；
前記容器上のラベル；並びに
（ａ）請求項９に記載のポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアゴニスト、（ｃ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、或いは（ｄ）前記ポリペプチドと結合する抗体を含有し、前記容器に含められる組成物
を含む製造品であって、前記容器上のラベルによって前記組成物が乾癬の治療に使用可能であることが示される、製造品。
【請求項１８】
図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図６（配列番号６）、図８（配列番号８）、図１０（配列番号１０）、図１２（配列番号１２）、図１４（配列番号１４）、図１６（配列番号１６）、図１８（配列番号１８）、図２０（配列番号２０）、図２２（配列番号２２）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図３２（配列番号３２）、図３４（配列番号３４）、図３６（配列番号３６）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２Ａ−Ｂ（配列番号４２）、図４４（配列番号４４）、図４６（配列番号４６）、図４８（配列番号４８）、図５０（配列番号５０）、図５２（配列番号５２）、図５４（配列番号５４）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８）、図６０（配列番号６０）、図６２Ａ−Ｂ（配列番号６２）又は図６４（配列番号６４）に示すＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子の発現を阻害する化合物の同定方法であって、通常は前記ポリペプチドを発現する細胞を候補化合物に接触させ、前記遺伝子の発現の欠如を決定することを含んでなる方法。
【請求項１９】
前記候補化合物がアンチセンス核酸である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２０】
症状の軽減が必要な哺乳動物の乾癬を軽減する方法において、（ａ）図８（配列番号８）、図１８（配列番号１８）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図３２（配列番号３２）、図３４（配列番号３４）、図３６（配列番号３６）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４４（配列番号４４）、図４６（配列番号４６）、図４８（配列番号４８）、図５０（配列番号５０）、図５２（配列番号５２）、図５４（配列番号５４）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８)又は図６０（配列番号６０)に示すポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、又は（ｃ）前記ポリペプチドと結合する抗体の治療的有効量を前記哺乳動物へ投与することを含んでなる方法。
【請求項２１】
哺乳動物の乾癬を診断する方法であって、（ａ）哺乳動物から得た組織細胞の試験試料、及び（ｂ）同じ細胞型の既知の正常組織細胞のコントロール試料中における、図８（配列番号８）、図１８（配列番号１８）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図３２（配列番号３２）、図３４（配列番号３４）、図３６（配列番号３６）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４４（配列番号４４）、図４６（配列番号４６）、図４８（配列番号４８）、図５０（配列番号５０）、図５２（配列番号５２）、図５４（配列番号５４）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８)又は図６０（配列番号６０)に示すＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを検出することを含んでなり、コントロール試料と比較して試験試料における前記遺伝子の発現レベルが高いか又は低い場合に試験組織細胞を採取した哺乳動物における乾癬の存在が示される方法。
【請求項２２】
哺乳動物の乾癬を診断する方法であって、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、図８（配列番号８）、図１８（配列番号１８）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図３２（配列番号３２）、図３４（配列番号３４）、図３６（配列番号３６）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４４（配列番号４４）、図４６（配列番号４６）、図４８（配列番号４８）、図５０（配列番号５０）、図５２（配列番号５２）、図５４（配列番号５４）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８)又は図６０（配列番号６０)に示すＰＲＯポリペプチドの抗ＰＲＯ抗体とを接触させ、（ｂ）抗体と試験試料中のポリペプチドの間の複合体の形成を検出することを含んでなり、前記複合体の形成により、試験組織細胞を採取した哺乳動物における乾癬の存在が示される方法。
【請求項２３】
症状の軽減が必要な哺乳動物のクローン病を軽減する方法において、前記哺乳動物に対し、治療的有効量の（ａ）図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図１２（配列番号１２）、図１６（配列番号１６）、図１８（配列番号１８）、図２０（配列番号２０）、図３２（配列番号３２）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８）、又は図６４（配列番号６４)に示すポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、又は（ｃ）前記ポリペプチドに結合する抗体を投与することを含んでなる方法。
【請求項２４】
哺乳動物のクローン病を診断する方法において、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、（ｂ）同じ細胞型の既知の正常組織細胞のコントロール試料中における、図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図１２（配列番号１２）、図１６（配列番号１６）、図１８（配列番号１８）、図２０（配列番号２０）、図３２（配列番号３２）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８）、又は図６４（配列番号６４)に示すＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを決定することを含んでなり、コントロール試料と比較して試験試料における前記遺伝子の発現レベルが高いか又は低い場合に試験組織細胞を採取した哺乳動物におけるクローン病の存在が示される方法。
【請求項２５】
哺乳動物のクローン病を診断する方法であって、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図１２（配列番号１２）、図１６（配列番号１６）、図１８（配列番号１８）、図２０（配列番号２０）、図３２（配列番号３２）、図３８（配列番号３８）、図４０（配列番号４０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５６（配列番号５６）、図５８（配列番号５８）、又は図６４（配列番号６４)に示すＰＲＯポリペプチドの抗ＰＲＯ抗体とを接触させ、（ｂ）抗体と試験試料中のポリペプチドの間の複合体の形成を検出することを含んでなり、前記複合体の形成により、試験組織細胞を採取した哺乳動物におけるクローン病の存在が示される方法。
【請求項２６】
症状の軽減が必要な哺乳動物の潰瘍性大腸炎を軽減する方法において、前記哺乳動物に対し、治療的有効量の（ａ）図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図６（配列番号６）、図８（配列番号８）、図１０（配列番号１０）、図１６（配列番号１６）、図２２（配列番号２２）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５２（配列番号５２）、又は図６４（配列番号６４)に示すポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、又は（ｃ）前記ポリペプチドに結合する抗体を投与することを含んでなる方法。
【請求項２７】
哺乳動物の潰瘍性大腸炎を診断する方法において、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、（ｂ）同じ細胞型の既知の正常組織細胞のコントロール試料中における、図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図６（配列番号６）、図８（配列番号８）、図１０（配列番号１０）、図１６（配列番号１６）、図２２（配列番号２２）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５２（配列番号５２）、又は図６４（配列番号６４)に示すＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを決定することを含んでなり、コントロール試料と比較して試験試料における前記遺伝子の発現レベルが高いか又は低い場合に試験組織細胞を採取した哺乳動物における潰瘍性大腸炎の存在が示される方法。
【請求項２８】
哺乳動物の潰瘍性大腸炎を診断する方法であって、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、図２（配列番号２）、図４（配列番号４）、図６（配列番号６）、図８（配列番号８）、図１０（配列番号１０）、図１６（配列番号１６）、図２２（配列番号２２）、図２４（配列番号２４）、図２６（配列番号２６）、図２８（配列番号２８）、図３０（配列番号３０）、図４２A-B（配列番号４２）、図４８（配列番号４８）、図５２（配列番号５２）、又は図６４（配列番号６４)に示すＰＲＯポリペプチドの抗ＰＲＯ抗体とを接触させ、（ｂ）抗体と試験試料中のポリペプチドの間の複合体の形成を検出することを含んでなり、前記複合体の形成により、試験組織細胞を採取した哺乳動物における潰瘍性大腸炎の存在が示される方法。
【請求項２９】
症状の軽減が必要な哺乳動物のリウマチ様関節炎を軽減する方法において、前記哺乳動物に対し、治療的有効量の（ａ）図１０（配列番号１０）、図１４（配列番号１４)、図１８（配列番号１８)、図３４（配列番号３４)、図３６（配列番号３６)、図４０（配列番号４０)、図４２Ａ−Ｂ（配列番号４２)、図４４（配列番号４４)、図４６（配列番号４６)、図４８（配列番号４８)、図５０（配列番号５０)、図５２（配列番号５２)、図５８（配列番号５８)、図６０（配列番号６０)、又は図６２Ａ−Ｂ（配列番号６２)に示すポリペプチド、（ｂ）前記ポリペプチドのアンタゴニスト、又は（ｃ）前記ポリペプチドに結合する抗体を投与することを含んでなる方法。
【請求項３０】
哺乳動物のリウマチ様関節炎を診断する方法において、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、（ｂ）同じ細胞型の既知の正常組織細胞のコントロール試料中における、図１０（配列番号１０）、図１４（配列番号１４)、図１８（配列番号１８)、図３４（配列番号３４)、図３６（配列番号３６)、図４０（配列番号４０)、図４２Ａ−Ｂ（配列番号４２)、図４４（配列番号４４)、図４６（配列番号４６)、図４８（配列番号４８)、図５０（配列番号５０)、図５２（配列番号５２)、図５８（配列番号５８)、図６０（配列番号６０)、又は図６２Ａ−Ｂ（配列番号６２)に示すＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを決定することを含んでなり、コントロール試料と比較して試験試料における前記遺伝子の発現レベルが高いか又は低い場合に試験組織細胞を採取した哺乳動物におけるリウマチ様関節炎の存在が示される方法。
【請求項３１】
哺乳動物のリウマチ様関節炎を診断する方法であって、（ａ）前記哺乳動物から採取した組織細胞の試験試料と、図１０（配列番号１０）、図１４（配列番号１４)、図１８（配列番号１８)、図３４（配列番号３４)、図３６（配列番号３６)、図４０（配列番号４０)、図４２Ａ−Ｂ（配列番号４２)、図４４（配列番号４４)、図４６（配列番号４６)、図４８（配列番号４８)、図５０（配列番号５０)、図５２（配列番号５２)、図５８（配列番号５８)、図６０（配列番号６０)、又は図６２Ａ−Ｂ（配列番号６２)に示すＰＲＯポリペプチドの抗ＰＲＯ抗体とを接触させ、（ｂ）抗体と試験試料中のポリペプチドの間の複合体の形成を検出することを含んでなり、前記複合体の形成により、試験組織細胞を採取した哺乳動物におけるリウマチ様関節炎の存在が示される方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３Ａ】

【図１３Ｂ】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１Ａ】

【図３１Ｂ】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【図３９Ａ】

【図３９Ｂ】

【図４０】

【図４１Ａ】

【図４１Ｂ】

【図４１Ｃ】

【図４２Ａ】

【図４２Ｂ】

【図４３】

【図４４】

【図４５】

【図４６】

【図４７】

【図４８】

【図４９】

【図５０】

【図５１】

【図５２】

【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【図５８】

【図５９Ａ】

【図５９Ｂ】

【図６０】

【図６１Ａ】

【図６１Ｂ】

【図６２Ａ】

【図６２Ｂ】

【図６３】

【図６４】

【公表番号】特表２００６−５２１８１０（Ｐ２００６−５２１８１０Ａ）
【公表日】平成１８年９月２８日（２００６．９．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５０７２０１（Ｐ２００６−５０７２０１）
【出願日】平成１６年３月１０日（２００４．３．１０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／００７８６２
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０８１１９９
【国際公開日】平成１６年９月２３日（２００４．９．２３）
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】