本発明は、ゲノミクスおよび核酸配列決定の分野に属する。本発明は、生物学的材料を配列決定し、そして短いストリングの配列決定情報をリアルタイムで確率的にマッチングして、前記生物学的材料中に存在するすべての種を同定する、新規方法を伴う。本発明は、配列情報のリアルタイム確率的マッチングに、そしてより詳細には、配列情報が生成されるのと同じ速さで、そして連続配列情報生成または収集と平行して、増幅されているかまたはされていない、化学的に合成されたかまたは物理的に調べられた、単一分子核酸の複数の配列の短いストリングを比較することに関する。
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本出願は、第１流路部分と第２流路部分との間の流路にセンサ構成要素を含む検出装置の実施形態を開示する。説明された実施形態では、センサ構成要素は、重合組成物中に受容体を含む。受容体は、試験試料中の検体と結合するように構成される。結合した際、センサ構成要素は、検体の受容体との相互作用に応じて検出可能な変化を受ける。
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本発明の実施形態は、自動化された微生物の同定（ＩＤ）および抗菌感受性定量（ＡＳＴ）システムにおいて、微生物のマクロライド−リンコサミド−ストレプトグラミンｂ（ｉＭＬＳｂ）に対する誘導型耐性を検出するための試験パネルおよび方法を提供する。複数ウェル試験パネルのウェルは、マクロライド薬、リンコサミド薬、およびマクロライド薬とリンコサミド薬の組合せを含む。試験パネルには、培養液で懸濁された微生物が接種され、自動化された微生物の同定（ＩＤ）および抗菌感受性定量（ＡＳＴ）システム中に配置される。試験パネルはシステム内で培養され、ウェルでは微生物の成長が監視される。
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【課題】微生物以外の混入物が混在した試料でも、簡便且つ迅速に微生物を検出できる検出方法を提供する。
【解決手段】孔径１〜１０μｍの第一フィルター２、該フィルター２を収容すると共に該フィルター２を通じて液体を通過させるハウジング３、および該ハウジング３に固定された振動子４を備えるろ過装置１を用いて、振動子４を作動させて、前記第一フィルター２に、そのろ過面に対して略垂直方向へ０．１〜１００Ｈｚの振動を加えながら、細胞および検出対象の微生物を含有する液体試料５０を第一フィルター２でろ過し、前記細胞が除去されたろ液を回収する。 （もっと読む）

本発明は、分析試験するための、酵母およびカビ細胞を含む食品または飲料サンプルの改善した調製方法である。食品サンプルは濾過可能な液体の形態に調製され、次いでガラスマイクロファイバーフィルターを使用して濾過される。次いで、真菌細胞保持物を含むフィルターを破砕容器中に入れ、そしてガラスマイクロファイバーフィルターが懸濁液中ガラスファイバーに完全に破砕されるまで、ビーズ破砕する。次いで、アリコートをサンプルの核酸由来のＰＣＲ増幅産物の融解曲線分析を使用して直接試験し、サンプルからの真菌細胞の存在を検出する。 （もっと読む）

本発明は１つまたは複数の細胞死−安定タンパク質または酵素活性を検出することにより、培養細胞の生存率を測定する方法を提供する。本発明により提供される方法は、生存率を細胞培養物の細胞を含む画分および細胞を含まない画分における酵素活性の相対レベルに相関させる。
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【課題】細胞内及び組織内におけるプロテアーゼの存在又はその阻害剤を検出又はスクリーニングするためのキメラタンパク質を提供する。
【解決手段】キメラタンパク質は、１）少なくとも１つの隠蔽されたシグナルタンパク質；２）少なくとも１つのプロテアーゼ特異的切断部位；及び３）少なくとも１つの検出可能なアミノ酸配列を有する。 （もっと読む）

本願は、Ａｘｉｎ安定化剤を投与することによって、Ｗｎｔシグナル伝達を制御または調節（例えばアンタゴナイズまたは阻害）する方法を開示する。本願はまた、Ｗｎｔシグナル伝達関連障害の処置、診断、予防および／改善のための、本明細書に記載のＡｘｉｎ安定化剤を用いる方法を開示する。 （もっと読む）

【課題】ＤＮＡメチルトランスフェラーゼ３に結合することができ、ＤＮＡメチルトランスフェラーゼ３による癌特異的ＤＮＡメチル化の生理的な抑制因子を提供する。
【解決手段】（ａ）特定のアミノ酸配列からなるタンパク質、又は（ｂ）前記特定のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、ＤＮＡメチルトランスフェラーゼ３Ａ又はＤＮＡメチルトランスフェラーゼ３Ｂと結合することができるジンクフィンガータンパク質のいずれかのタンパク質。 （もっと読む）

サンプル調製装置が開示される。サンプル調製装置は第１の開口部および第２の開口部の間の経路を規定するハウジング；および前記経路の一部分を閉めるサンプルフィルターを含む。サンプルフィルターは核酸と特異的に結合するモノリス吸着剤を含有する。目的の分析物と特異的に結合する捕捉剤によってコーティングされたガラスフリットを収容するサンプルフィルター、細胞膜を溶解する薬品が含浸された親水性基剤を収容するサンプルフィルター、カートリッジベースおよび一体型サンプル調製カートリッジも開示される。
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【課題】SARS 3CLプロテアーゼに対する阻害物質の効率的なスクリーニング方法が求められていた。
【解決手段】天然型SARS 3CLプロテアーゼのアミノ酸配列のうち第188番目のアミノ酸が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列、又は前記置換されたアミノ酸配列のうち第188番目のアミノ酸を除く１若しくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び／又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつ3CLプロテアーゼ活性を有する、組換えタンパク質に候補物質を接触させ、候補物質の中から前記組換えタンパク質の3CLプロテアーゼ活性を阻害する物質をスクリーニングする方法。 （もっと読む）

【課題】本発明の課題は、唾液検体などの生物学的試料中に存在するアミラーゼ活性をより簡便に測定する手段を提供することであり、特に、高濃度にアミラーゼを含有する試料を測定する測定キット及びキットを用いた測定方法を提供しようとするものである。
【解決手段】アミラーゼ活性測定用キットに関し、検体採取部が担持された担体と該担体を装填可能なホルダを基本構成とする。検体採取部及び試薬保持部が同一又は別々の担体上に担持されており、唾液などの検体を検体採取部で採取し、ホルダにおいて検体採取部と試薬保持部を接触させ、試薬及び／又は検体を移動（転写）させ、検体中のアミラーゼの基質に対する作用を導き、反応後の基質反応物を測定する方法による。この発明により、唾液等の検体の測定器への付着及び汚染が排除され、測定後の用具の洗浄という煩雑性を解除することができる。 （もっと読む）

殺生物剤の嫌気性有機体に対する殺生物効果を評価するための高処理量の方法を提供する。該方法は：１つ以上の嫌気性生物サンプルを、マルチチャンネルピペットに接続可能な第１の組の複数の容器の中に準備するステップ；１つ以上の殺生物サンプルを、１つまたは複数の既知濃度で、マルチチャンネルピペットに接続可能な第２の組の複数の容器の中に準備するステップ；該１つ以上の殺生物サンプルと該嫌気性生物サンプルとの混合物をマルチチャンネルピペットによって形成するステップ；殺生物サンプルと嫌気性生物サンプルとの間の反応を可能にするように混合物をインキュベートするステップ；１つ以上の殺生物サンプルの各々の嫌気性生物に対する致死（殺生物）有効性を、１つまたは複数の選択された時間間隔で評価するステップ；を含み、１つ以上の殺生物サンプルを準備するステップ以外の各ステップを嫌気性条件下で実施する。 （もっと読む）

第ＩＩ相解毒酵素又は抗酸化酵素の転写のＮｒｆ２（ＳＫＮ−１）活性化を増強する方法及び組成物（植物抽出物（例えばヤナギ抽出物）又はその活性画分を含む）と、それらの酵素のＮｒｆ２調節を増加するさらなる化合物を同定する方法とが提供される。 （もっと読む）

本発明は、樹状細胞またはその前駆体、特に抗原を提示している樹状細胞の細胞表面に位置するタンパク質の同定に関する。特に、本発明は、これらのタンパク質と結合する抗体などの化合物に関する。これらの化合物は、樹状細胞またはその前駆体のサブセットを検出および／または濃縮するために用いることができる。これらの化合物はまた、抗原に対する体液性および／もしくはT細胞媒介性免疫応答を調節する目的で樹状細胞もしくはその前駆体に対して抗原をターゲティングさせるために用いること、または罹患状態に関与する樹状細胞もしくはその前駆体に対して細胞傷害性物質をターゲティングさせるために用いることができる。 （もっと読む）

本発明は、代謝産物濃度を検出し監視するための方法であって、リガンド結合時の蛍光共鳴エネルギー移動の検出および測定を含む方法を提供する。本発明の方法は、生細胞培養物における代謝産物レベルの変化のリアルタイム監視に役立つ。
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新規な抗菌性化合物の設計と同定のための方法が提供される。これらの抗菌性化合物を含む医薬品組成物も提供される。の抗菌性化合物は原核生物の一本鎖ＤＮＡ結合蛋白質のポリペプチドへの結合を禁止する。いくつかの例では、原核生物の一本鎖ＤＮＡ結合蛋白質は原核生物のエキソヌクレアーゼＩである。 （もっと読む）

【課題】従来では、インターカレーター及び標識プローブを用いる核酸検出方法では、増幅阻害が生じるため、迅速な核酸検出と高感度な核酸検出は両立しなかった。本発明では、これらの問題点を克服し、標的核酸の検出をより迅速に、より高感度に行うことを課題とした。
【解決手段】標的核酸の存在または量を確認したい試料と少なくともインターカレーターと標識プローブとプライマーの存在下、連続的または間欠的にインターカレーターの励起波長の光を与えかつ標識プローブからの蛍光を測定しながら、高速ＰＣＲを行い、該標的核酸の存在または量を調べることを特徴とする検出方法。 （もっと読む）

【課題】細菌の形状が「く」の字の縦方向につぶれたような形状の場合でも太さを計測することが可能な細菌判別装置を提供する。
【解決手段】
光を照射して検体を蛍光させ、検体からの蛍光を含む画像を撮像し、画像から蛍光された領域を抽出し、領域における面積が所定面積未満となるまで、領域の分割を反復し、領域を分割するための各分割線分の長さに基づいて、検体の太さを算出し、太さに基づいて、検体が細菌であるか否かを判定する。この分割処理では、領域の重心の位置を算出し、領域の輪郭を算出しと、輪郭を形成する輪郭点のうち、重心の位置からの距離が所定距離以下となる対象輪郭点を算出し、重心の位置と対象輪郭点とを通る直線を算出し、直線上において、２つの輪郭点を結ぶ線分のうちの１つを分割線分として算出し、分割線分で領域を分割し、分割された領域における面積が所定面積未満であるか否かを判定する。 （もっと読む）

本発明は微生物学的分析のための液体サンプルの採取及び濃縮のための手動装置、及びこれらそれぞれの使用方法に関する。手動装置は、サンプルを含む本体、取り外し可能な支持体、微小多孔性膜、及びプランジャを含む。本発明はまた、微生物学的分析のために、微小多孔性膜に液体サンプルを採取及び濃縮する方法も対象とする。
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