【課題】染色体コピー数情報に基づいて生物体のタイプを判別する技術を提供する。
【解決手段】生物体のタイプを染色体コピー数情報に基づいて判別するためのマーカーを選択するのにあたり、生物体についてタイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報を準備し、生物体についてタイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報に基づいてタイプを判別するためのマーカーを選択するようにする。マーカーの選択は、タイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報に対して、複数個体から選択される一つの個体を判別対象とし、残余の個体を判別器とするLeave-one-out cross-validationを適用して得られる検証結果を利用する。 （もっと読む）

【課題】宿主細胞に対して毒性を有するタンパク質を、遺伝子工学的手法を用いて効率的に大量生産する手法を提供する。
【課題解決手段】
宿主細胞に対して毒性を有するタンパク質、タンパク分解酵素の切断部位および上記該タンパク質の毒性を低下ないしは中和するタンパク質、精製用のタグからなる融合タンパク質をコードする遺伝子を用いて、宿主細胞において上記融合タンパク質を発現させ、得られた融合タンパク質をタンパク分解酵素で切断することにより、上記毒性を有するタンパク質を製造する。
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ヒトおよび非ヒト動物由来の単離、精製されたＭＡＲ配列が、それらに対応するかまたは基づくヌクレオチド配列として開示される。特に、高い転写および／またはタンパク質生成促進活性を有するＭＡＲおよびＭＡＲコンストラクトが開示され、かつ例えばタンパク質の高収率の生成を目的とする、かかるＭＡＲを同定し、かかるＭＡＲコンストラクトを設計し、かつそれらを用いるための方法が開示される。 （もっと読む）

【課題】 水素、エタノール等の合成燃料の生成を含む種々の目的に利用可能な合成ゲノムないし合成細胞の提供。
【解決手段】 合成ゲノムを構築する方法であって、合成ゲノムの部分（複数）を含む核酸カセット（複数）を組立てる工程を含み、該核酸カセットの少なくとも１つは、化学的に合成された核酸成分（複数）から、又は化学的に合成された核酸成分（複数）のコピー（複数）から構築されることを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】コンピュータによって実行される以下の方法。生物リスト中の一種類以上の生物に関連する標的配列のリストを提供すること。それらの標的配列の一つ以上にハイブリダイズすると推定される候補プロトタイプ配列のリストを提供すること。各候補プロトタイプ配列に対応するプローブのコレクションであって、各プローブコレクションが、対応する候補プロトタイプ配列の所定の一定のサブ配列長を有するすべてのサブ配列に対するプローブのセットを有するコレクションを作製すること。
【解決手段】これらのセットは、対応するサブ配列と、対応するサブ配列の中心にあるヌクレオチドを変えることによって形成された、対応するサブ配列のあらゆる変異とからなる。各標的配列に対応する断片のセットであって、各断片セットが、対応する標的配列の所定の一定の断片長を有するすべての断片を有するセットを作製すること。各断片が、その断片の相補配列と結合する自由エネルギーを計算すること。いずれの結合自由エネルギーが上記所定の一定の閾値を超える場合には、その断片を一度に一塩基ずつ延長して、結合自由エネルギーが閾値を下回るか、断片がプローブと同じ長さになるまで、延長断片のセットを作製すること。どの延長断片が、プローブのいずれかに完全に一致するかを決定すること。各候補プロトタイプ配列に対応するベースコール配列を集める。このベースコール配列は、いずれかの延長断片に完全に一致する対応するプロトタイプ配列の各プローブの中央にあるヌクレオチドに対応するベースコールを有するが、完全に一致するプローブを含むプローブのセットの残りメンバーは、いずれの延長断片とも完全には一致せず、別の状況ではベースコールしない。 （もっと読む）

【課題】膜タンパク質は、組換え形態での発現、精製および特徴づけが困難である。これは、少なくとも一部は、その疎水性の特性または部分的に疎水性の特性に起因する。これを解決することが課題である。
【解決手段】膜スカホールドタンパク質（ＭＳＰ）は、標的膜または他の疎水性もしくは部分的に疎水性のタンパク質もしくは膜フラグメントとアセンブルして、そのネイティブの形態および機能を保存する可溶性のナノスケール粒子を形成する。
この粒子は、リポソームまたは界面活性剤ミセルを超えて改善される。リン脂質の存在下で、ＭＳＰは、ナノ範囲のリン脂質二重層ディスクを形成し、ＭＳＰは、二重層ドメインの周辺で、粒子を安定化する。この粒子二重層構造は、溶液中または固体支持体上での組み込まれたタンパク質の操作（走査プローブ顕微鏡または表面プラズモン共鳴のような、表面感受性技術の使用を含む）を可能にする。 （もっと読む）

【課題】肝臓（特にクッパー細胞）を標的としたＤＤＳのための薬物キャリアとして機能し、かつ本来の構造及び機能を保持した均一な糖鎖含有アルブミンの提供。
【解決手段】アルブミンをコードするＤＮＡを、真核細胞による糖鎖修飾を受け得る部分アミノ酸配列、好ましくはＮ結合型糖鎖のコンセンサス配列を含む変異型アルブミンをコードするように変異させ、該変異ＤＮＡを含む発現ベクターを宿主真核細胞、好ましくは高マンノース型糖鎖を付加し得る宿主細胞に導入し、得られる形質転換体を培養して得られる培養物から糖鎖含有アルブミン蛋白質を回収することにより、肝臓（特にクッパー細胞）を標的としたＤＤＳのための薬物キャリアとしての糖鎖含有アルブミンが提供される。 （もっと読む）

インビボの細胞において非コード調節ＲＮＡ（ｎｃＲＮＡ、例えばｍｉｃｒｏＲＮＡ）の遺伝子発現プロフィールを生成する方法は、（ａ）細胞から少なくとも１つのｍＲＮＡ−タンパク質（ＲＮＰ）複合体を分離することであって、前記ＲＮＰ複合体は、（ｉ）ＲＮＡ結合タンパク質（ＲＮＡＢＰ）またはＲＮＡ会合タンパク質、（ｉｉ）前記タンパク質と結合または会合した少なくとも１つのｍＲＮＡ、および（ｉｉｉ）前記タンパク質と結合または会合した少なくとも１つのｎｃＲＮＡを含み、そしてその後（ｂ）少なくとも１つのＲＮＰ複合体中の少なくとも１つのｎｃＲＮＡを同定し、それによりＲＮＰ複合体中のｎｃＲＮＡの固有情報を含む遺伝子発現プロフィールを作製することにより実行される。 （もっと読む）

【課題】有機スズ化合物を特異的に検出できる方法を実施するのに必要な検出物質を提供することを目的とする。
【解決手段】核内受容体スーパーファミリーに属するレチノイドＸ受容体(retinoid X receptor; RXR)において極性官能基が結合する領域に変異を加えることによって、有機スズ化合物と特異的に結合し、かつ、極性官能基を有する内因性リガンドおよびその類似体が結合しない変異型ＲＸＲを作製し、有機スズ化合物のみを高い感度で検出する。 （もっと読む）

【課題】双方向性プロモーター、特に双方向の遺伝子の発現レベルが比較的近く、しかも両者の発現レベルが十分に高い双方向性プロモーターを提供する。
【解決手段】動物細胞内で双方向性プロモーターとして作用する能力を有するDNA断片。 （もっと読む）

本発明は、蛋白質発現の誘導および／または抑制のためのシステム、方法、および装置に関する。より具体的には、本発明は色素体中で蛋白質の発現を誘導および／または抑制するシステム、方法、および装置に関する。代表的な実施形態には、本明細書に記載された方法、システム、および装置を用いて水素ガスの産生を促進するための、水素産生に関与する蛋白質の発現制御が含まれる。 （もっと読む）

本発明は、酵素反応における試料中のｃＤＮＡの合成のための方法であって、該方法は、以下：ポリアデニル化活性を有する第１の酵素、逆転写酵素活性を有する第２の酵素、緩衝液、少なくとも１つのリボヌクレオチド、少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチド、アンカーオリゴヌクレオチドを同時に準備する工程、リボ核酸を含む試料を添加する工程、および第１の酵素および第２の酵素が活性を示すように選択される１または複数の温度工程で前の工程の作用物質をインキュベートする工程を含む、方法に関する。本発明は、さらに、ポリアデニル化活性を有する第１の酵素、逆転写酵素活性を有する第２の酵素、任意選択的に緩衝液、任意選択的に少なくとも１つのリボヌクレオチド、任意選択的に少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチド、および任意選択的にアンカーオリゴヌクレオチドを含む反応混合物に関する。さらに、本発明は、対応する反応混合物を含むキットに関する。
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本発明は、第１および第２ＤＮＡ配列を含み、第１配列は第３配列に相同、かつ第２配列は第４配列に相同であり、第３および第４配列は染色体ＤＮＡ配列であり、そして第３および第４配列の近接端部が少なくとも１ヌクレオチド対によって隔てられている、ドナーベクターを提供する。 （もっと読む）

【課題】原核宿主細胞で異種ポリペプチドを産する方法を提供する。
【解決手段】原核生物にとって異種であるポリペプチドを産するためのベクターが、（１）遺伝子内転写終結を阻害する抗−終結核酸と非−ラムダプロモーター、及び（２）核酸から産せられた抗−終結タンパク質と結合するためのＲＮＡ認識部位が、ポリペプチドをコードするＲＮＡの５’に位置している、非−ラムダプロモーターを有するポリペプチドをコードするＲＮＡを含んでなるベクターからなる。 （もっと読む）

【課題】メダカの神経細胞又はグリア細胞で発現可能なプロモーターを提供する。
【解決手段】Ubiquitin C-terminal Hydrolase L1（UCHL1）遺伝子、Tyrosine Hydroxylase（TH）遺伝子、Growth Associated Protein 43（GAP43）遺伝子およびProteolipid protein 1（PLP1）遺伝子からなる群から選ばれるメダカ由来遺伝子のプロモーター領域を含むDNA断片。 （もっと読む）

本願発明は、生体分子の酵素過程を観察するための方法及び装置を提供する。酵素過程とは、とりわけ、核酸の増幅（例えばＰＣＲ）におけるポリメラーゼ活性である。センサーの表面に付着した磁性粒子の量を測定することを、酵素過程の最中に少なくとも１回行うことによって、この観察を行う。本願発明の実施例による方法及び装置を使って、酵素過程を時間の関数として観察してもよい。
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本発明は、ポリヌクレオチド変異体を調製する方法を提供する。本発明の一態様において、本方法は、a)少なくとも一部が部分的および/または完全に2本鎖である、2種以上の関連するポリヌクレオチドのプールを少なくとも1種の切断酵素に暴露する段階と、b)前記少なくとも1種の切断酵素を除去する、および/またはその活性を阻害する段階と、c)前記ポリヌクレオチドを変性させる段階と、d)変性したポリヌクレオチドに少なくとも部分的に2本鎖のポリヌクレオチドを形成させる段階と、e)段階d)において形成された2本鎖ポリヌクレオチドをリガーゼに暴露する段階とを含む。所望の特性を有するポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチドを製造する方法もまた提供される。 （もっと読む）

本発明は、Ｌ−スレオニンの生産能を有した微生物であって、前記微生物によるＬ−スレオニンの生合成経路において、アスパルテートセミアルデヒドデヒドロゲナーゼの酵素活性をコーディングする遺伝子ｕｓｇの発現を増加させて、Ｌ−スレオニンの生産効率が増加されたことを特徴とする微生物、及びこれを用いたＬ−スレオニンの生産方法に関する。
【代表図】図１
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【課題】新規ヘモポヘチン受容体およびそれをコードする核酸の提供。また、上記受容体のリガンドの検出及び受容体とリガンドの相互作用の解明により機能するアゴニスト、アンタゴニスト、治療剤等の提供。
【解決手段】マウス由来の新規ヘモポエチン受容体ＮＲ４。上記受容体のリガンドとしてのインターロイキン１３（ＩＬ−１３）及びインターロイキン１３と構造的類似性の高いインターロイキン４（ＩＬ−４）とその受容体との複合体と上記ヘモポエチン受容体との間の相互作用に係わる核酸分子、該核酸分子を含む遺伝子構築物、組換えポリペプチド。 （もっと読む）

【課題】特定の細胞で選択的に核酸を機能/発現させる。
【解決手段】細胞内シグナル応答の酵素の基質となるアミノ酸配列と生理的条件下で正電荷を有する官能基を含む親水性高分子と核酸の複合体をＢ型肝炎ウイルスタンパク質またはその改変体を構成要素とする中空バイオナノ粒子に封入してなり、かつ、前記中空バイオナノ粒子が細胞認識部位を有する複合粒子。 （もっと読む）