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【課題】
【解決手段】
本発明は、以下の工程:分析される試料を提供すること、少なくとも20個の遺伝子座の同時ポリメラーゼ連鎖反応増幅に必要である、試薬、酵素、及びプライマーオリゴヌクレオチドを提供すること、前記遺伝子座を増幅すること、増幅産物を検出すること、を含む、DNAプロファイリングアッセイ法であって、前記増幅産物、及び増幅される前記遺伝子座が、以下の特徴によって特徴付けられる方法:増幅される各遺伝子座は、母集団に存在することが知られる少なくとも1つの欠失-挿入多型によって特徴づけられ、各遺伝子座からの2つの対立遺伝子は、その大きさにおいて2ヌクレオチド超かつ100ヌクレオチド未満だけ異なること、少なくとも2つの異なる遺伝子座から生じ、かつ大きさが約20ヌクレオチドから約300ヌクレオチドの範囲にある、少なくとも2つの増幅産物の第一のセットは、第一の標識を有すること、少なくとも2つの異なる遺伝子座から生じ、かつ大きさが約20ヌクレオチドから約300ヌクレオチドの範囲にある、少なくとも2つの増幅産物の第二のセットは、第二の標識を有すること、少なくとも2つの異なる遺伝子座から生じ、かつ大きさが約20ヌクレオチドから約300ヌクレオチドの範囲にある、少なくとも2つの増幅産物の第三のセットは、第三の標識を有すること、標識1、標識2、及び標識3は、例えば、DNA配列決定装置と組合せたマルチカラー検出器によって区別され、かつ同時に検出され得る、それぞれ異なる蛍光標識であること、に関する。 (もっと読む)


本発明は、核酸増幅、連結及び配列決定反応などの様々な生物学的アッセイにおいて使用するための新規オリゴヌクレオチド化合物に関する。新規オリゴヌクレオチドは、リボ核酸ドメイン及びオリゴヌクレオチドの3’末端の又は3’末端付近のブロッキング基を含む。これらの化合物は、以前に見られなかった特異性の増加したレベルを付与する。核酸増幅、連結及び配列決定を実施するための方法も提供される。さらに、オリゴヌクレオチドを含有するキットも、本明細書に開示されている。 (もっと読む)


【課題】バイオレメディエーションを効率よく促進する技術を提供する。
【解決手段】複数の特定の塩基配列で表されるプライマーからなるロドコッカス属炭化水素分解菌検出用プライマーセット、複数の特定の塩基配列で表されるプライマーからなるゴルドニア属炭化水素分解菌検出用プライマーセット、当該プライマーセットを含む炭化水素分解菌検出用PCRキット、並びに当該プライマーセットを用いた土壌中の炭化水素分解菌の定量方法、土壌中の炭化水素分解菌の挙動解析方法、及び土壌浄化方法からなる。 (もっと読む)


本発明は、偶発的な変形性関節症、変形性関節症の進行、変形性関節症の重症度、関連する身体機能低下、および能力障害の素因を検出し、これらのリスクを決定し、これらの治療法を導くための方法およびキットに関する。一態様では、本発明は、OAの対象にOAの重症疾患進行のリスクを増加させる素因があるか否かを決定するための新規な方法およびキットを提供する。他の態様では、本発明は、対象にOAの重症疾患進行のリスクを減少させる素因があるか否かを決定するための新規な方法およびキットを提供する。 (もっと読む)


【課題】遺伝子発現抑制作用を有するRNA分子と、インビボで塩基対合を形成する標的遺伝子を同定するための方法、ならびにキットの提供。
【解決手段】(i)前記RNA分子を含む細胞から、RISCに組み込まれた前記RNA分子又はその断片がmRNAに塩基対合により結合している、RISC/mRNA複合体を抽出する工程。(ii)前記RISC/mRNA複合体から、前記RNA分子又はその断片がmRNAに塩基対合により結合しているRNA分子/mRNA複合体を得る工程。(iii)前記RNA分子/mRNA複合体を用いて、前記RNA分子又はその断片をプライマーとして、前記mRNAを鋳型とする逆転写反応を行うことにより、前記mRNAの部分塩基配列が逆転写されたDNAに前記RNA分子又はその断片が連結されてなるDNA-RNA分子を得る工程。からなる方法、および、該方法に用いられるキット。 (もっと読む)


【課題】新しいインターロイキン組成物および関連化合物、ならびにそれらの使用方法を提供すること。
【解決手段】哺乳動物由来のサイトカインをコードする精製された遺伝子、それらに関連する試薬(精製されたタンパク質、特異的抗体、およびこの分子をコードする核酸を含む)が提供される。上記の試薬を使用する方法およびキットもまた、提供される。本発明は例えば、配列番号2または配列番号4の成熟ポリペプチドの少なくとも17個の連続するアミノ酸を含む抗原性ポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドを提供する。 (もっと読む)


【課題】生物学的物質の細胞溶解、精製を効果的に行う。
【解決手段】生物学的物質の細胞溶解および生成の方法であって、サンプルを高圧にすることを含む。さらに、この方法を実施する装置に特徴がある。少なくとも2つの電極20,30,70,80を含み、圧力チャンバ内に位置する相と接触する導電性の流体を収容し、前記電極を接続する導管40,60,75,90を含む。 (もっと読む)


本発明は、5’末端の特定の化学的な部分が異なる所望のクラスのRNA分子に選択的に5’ライゲーションによりタグを付加するための、RNA5’ポリホスファターゼ、RNA5’モノホスファターゼ、キャッピング酵素、デキャッピング酵素、核酸に対するピロホスファターゼおよびRNAリガーゼ、ならびに他の酵素を使用する新規な組成物、キットおよび方法を提供する。5’にタグが付加されたRNA分子は、種々の用途に使用するタグが付加された第一鎖cDNA、二本鎖cDNA、およびセンスRNAまたはアンチセンスRNAを合成するために用いることができる。
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【課題】本発明の課題は、高転移性胃癌をはじめとする各種癌のマーカーとなりうる遺伝子を同定し、癌の判定法及びそのためのキットや、癌抑制剤のスクリーニング方法を提供することにある。
【解決手段】ヒト胃癌細胞株から、高度の腹膜転移能を持つ高転移型ヒト胃癌培養細胞株を作製し、転移能獲得前と獲得後の株とのmRNA発現を、エクソンマイクロアレイを用いて網羅的に比較検討した。その結果、細胞接着に関与する遺伝子である、BHMT(betaine-homocysteine methyltransferase)、EPSTI1(epithelial stromal interaction 1, (breast))及びNEBL(nebulette)の新規エクソン配列を同定した。さらに、上記BHMT、EPSTI1及びNEBLの新規スプライシングバリアントが、胃癌細胞及び大腸癌細胞に発現することを見い出した。 (もっと読む)


本開示は、特定の核酸配列の迅速な単一温度(等温)検出のための方法およびプローブに関する。上記方法およびプローブは、細菌およびウイルスを含む生物因子を検出するための単純な方法、ならびに任意の核酸配列上の特定の遺伝的マーカーの検出を提供する。記載される方法は、一定温度において溶液中で切断されたポリヌクレオチドプローブの量の幾何的増加を媒介するように作用する。この切断は、特定の標的ヌクレオチド配列の存在によって誘発される。同時に、上記プローブの逆相補体のフラグメントのコピー数の増加もまた、達成される。それによって、上記方法は、上記プローブの切断をモニターするか、または逆相補体ポリヌクレオチドのフラグメントの蓄積をモニターするかのいずれかによって、等温条件下で、上記標的配列を検出する目的で使用され得る。
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アナライト用の標識セットであって、前記標識が磁性物質又は磁化可能物質に付着し、前記標識が、(a)前記標識を前記アナライトに付着させるための認識部分と、(b)前記磁性物質又は前記磁化可能物質の結合乃至内封部分とを含み、前記磁性物質又は前記磁化可能物質の結合乃至内封部分が、金属結合タンパク質、ポリペプチド、又はペプチドを含む標識セットを提供する。 (もっと読む)


【課題】サンプルDNAの長さや配列に制限されることなく、遺伝子分析を行うことができる遺伝子分析方法を提供する。
【解決手段】標識剤により修飾された第1のサンプルDNAと、前記第1のサンプルDNAの特異的な配列に対して相補的な配列を持つプローブDNAにおもりとなる物質を結合したコンジュゲートDNAを混合して、得られた混合液を所定の値で加熱し、室温に戻す過程で前記第1のサンプルDNAと前記コンジュゲートDNAを結合させて複合体を形成させ、得られた複合体と複合体を形成しないものを電気泳動で分子量の差により分離する。 (もっと読む)


【課題】簡便にDNAを定量又は検出する方法を提供する。
【解決手段】生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAを定量又は検出する方法であって、生物由来検体中に含まれる目的とするDNA領域を有するゲノムDNA由来の二本鎖DNAを一本鎖DNAに分離する第一工程、前記一本鎖DNAと、メチル化DNA抗体と、該一本鎖DNA中のメチル化された領域と該メチル化DNA抗体との結合を阻害しない塩基配列又はその相補配列と結合しうる特定オリゴヌクレオチドと、を混合して、該一本鎖DNAと該メチル化DNA抗体と該特定オリゴヌクレオチドとの複合体を形成する第二工程、前記複合体に含まれるメチル化DNA抗体又は特定オリゴヌクレオチドを、その機能により定量又は検出する第三工程、を有する方法。 (もっと読む)


本発明は、相同組換えに使用される欠損カセットを4段階連続的PCR、4段階ブロックPCR、または遺伝子合成方法を用いて効率よく製造し、これを用いて分裂酵母(Schizosaccharomyces pombe)を形質転換して、遺伝子標的化分裂酵母菌株を製造する方法に関する。また本発明は、前記方法によって製造された遺伝子標的化分裂酵母ヘテロ接合菌株および遺伝子標的化分裂酵母ヘテロ接合菌株ライブラリーに関する。また本発明は、前記ライブラリーを用いた薬物作用点の探索方法および前記ライブラリーを含む薬物スクリーニングキットに関する。 (もっと読む)


本発明は、高容量化学療法及び幹細胞レスキューによって処置された92人の新規に診断された多発性骨髄腫患者の集団由来のCD138分別されたプラズマ細胞における高分解度全ゲノム比較ゲノムハイブリダイゼーション及び遺伝子発現プロファイリングによって産出されたデータに対して新規なバイオインフォマティクスおよびコンピュータ方法論を適用する方法を開示する。その結果は、第1染色体のq腕獲得およびp腕喪失が本染色体中の常駐遺伝子の発現変化と高度に相関し、これらの変化が1)疾患進行による死亡リスク、2)遺伝子発現に依拠した増殖インデックス、および3)最近述べられた遺伝子発現に依拠した高リスクインデックスと強く相関することを明らかにした。重要なことに、強い相関は8q24のコピー数獲得とマイクロRNAの発現及び成熟の主要制御因子をコードする遺伝子であるArgonate 2 (AGO2)の発現上昇との間において見出され、転帰とも有意に相関していた。これらの新規知見は、多発性骨髄腫のゲノム構造及びその臨床転帰との関係の理解を有意に改善する。 (もっと読む)


【課題】核酸試料中の核酸の標的塩基の塩基種を判別するために用いられるプライマーであって、擬陽性の可能性が少なく、かつ明確に標的塩基を判別することができる標的塩基特異性プライマー、及び該標的塩基特異性プライマーを用いた標的塩基判別方法の提供。
【解決手段】 標的塩基の塩基種が複数ある場合に、核酸試料中の標的塩基を含む標的塩基配列を有する核酸の、標的塩基の塩基種を判別するために用いられるプライマーであって、前記標的塩基として予想される塩基と相補的な塩基である標的塩基対応塩基を有し、前記標的塩基対応塩基の5’側に隣接する塩基をミスマッチ塩基とし、かつ、前記標的塩基配列上の前記標的塩基の3’側に隣接する塩基をミスマッチ対応塩基とした場合に、前記ミスマッチ塩基の塩基種が特定の塩基種であることを特徴とする標的塩基特異性プライマー、及び該標的塩基特異性プライマーを用いた標的塩基判別方法。 (もっと読む)


【課題】乳癌分子標的治療の新規ターゲット分子を同定し、該標的分子の発現や機能を制御することによる乳癌の新規治療手段を提供すること、並びに、該標的分子を用いた癌治療薬のスクリーニング法を提供すること。
【解決手段】BCG01蛋白質またはその部分ペプチド、あるいはそれをコードする塩基配列を含む核酸を含有してなる、癌(特に乳癌)の治療・予防(癌の進展/浸潤・転移の抑制)剤。BCG01蛋白質を産生する細胞に被験物質を接触させ、該蛋白質の発現もしくは活性を増強する物質を選択することを特徴とする、癌(特に乳癌)の治療・予防(癌の進展/浸潤・転移の抑制)物質のスクリーニング方法。 (もっと読む)


【課題】関節リウマチに対する処置剤の有効成分の候補となる物質を、簡便、迅速、効率的かつ高精度にスクリーニングする方法を提供すること。
【解決手段】次のステップを少なくとも含むことを特徴とする、関節リウマチに対する処置剤の有効成分の候補となる物質のスクリーニング方法;「関節リウマチに罹患している動物の細胞において、これに罹患していない動物の細胞に比して発現が変化しているタンパク質キナーゼ」の活性を阻害する作用を有する物質を選択するステップ。このステップの前に、さらに次のステップを含むことが好ましい;「関節リウマチに罹患している動物の細胞において、これに罹患していない動物の細胞に比して発現が変化しているタンパク質キナーゼ」を選択するステップ。またこのステップは、遺伝子サブトラクション法によって行われることが好ましい。 (もっと読む)


【課題】シスプラチン投与による治療効果の有無を判定する。
【解決手段】診断対象者から採取した生体由来試料における、AKR1C1遺伝子、AKR1C2遺伝子、AKR1C3遺伝子、AKR1C4遺伝子、AKR1B10遺伝子、ALDH3A1遺伝子、CA2遺伝子、CRAT遺伝子、CRIP2遺伝子、HTRA3遺伝子、MYADM遺伝子及びPPP1R14C遺伝子からなる遺伝子群から選ばれる少なくとも1以上の遺伝子の発現を測定し、測定の結果として得られた遺伝子の発現量に基づいてシスプラチンの投与効果を判定する。 (もっと読む)



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