付加環化を用いたモノマーおよびオリゴヌクレオチドの化学修飾
本発明は、式ＩまたはＩＩの化合物を特徴とする。一実施形態において、本発明はリガンドとオリゴヌクレオチドとを共役させるための化合物およびプロセスに関する。本発明は、さらに、ウイルス感染、細菌感染、寄生虫感染、癌、アレルギー、自己免疫疾病、免疫不全、および免疫抑制等の様々な疾患および疾病を治療するための方法に関する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
式（Ｉ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１】
式中、
Ｘは、Ｏ、Ｓ、ＮＲＮまたはＣＲＰ２であり、
Ｂは、水素、任意に置換された天然もしくは非天然核酸塩基、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾール、ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−Ｃ（ＣＨ２Ｂ１）３、ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ２Ｂ１）３であり、Ｂ１は、独立してハロゲン、メシル酸塩、Ｎ３、ＣＮ、任意に置換されたトリアゾールもしくは任意に置換されたテトラゾールであり、前記核酸塩基は、−Ｊ−リンカー−Ｎ３、−Ｊ−リンカー−ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８、−Ｊ−リンカー−シクロアルキン、−Ｊ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−Ｑ−ＲＬ、または−Ｊ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬによってさらに置換され、
Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、およびＲ５は、それぞれ独立してＨ、ＯＲ６、Ｆ、Ｎ（ＲＮ）２、Ｎ３、ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｎ３、−Ｊ−リンカー−ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８、−Ｊ−リンカー−シクロアルキン、−Ｊ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−Ｑ−ＲＬ、もしくは−Ｊ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬであり、
Ｊは存在しないか、Ｏ、Ｓ、ＮＲＮ、ＯＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）、ＮＨＳＯ、ＮＨＳＯ２、ＮＨＳＯ２ＮＨ、ＯＣ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、ＯＣ（Ｏ）Ｏ、ＮＨＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）Ｏ、またはＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）であり、
Ｒ６は、水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
ＲＰは、独立してＨ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、または任意に置換されたヘテロアリールであり、
Ｑは、
【化２】
であり、
ＲＬは、水素またはリガンドであり、
Ｒ８は、ＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであるが、但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、−Ｃ≡Ｒ８、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾールが、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、式（Ｉ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項２】
式（ＩＩ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化３】
式中、ＡおよびＢはそれぞれ独立して水素、保護基、任意に置換された脂肪族、任意に置換されたアリール、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、または−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、Ｚ１およびＺ２はそれぞれ存在ごとに独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
Ｊ１およびＪ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、ＮＲＮ、任意に置換されたアルキル、ＯＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）、ＯＣ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、ＯＣ（Ｏ）Ｏ、ＮＨＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）Ｏ、またはＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）であり、
【化４】
は、環式基または非環式基であり、
ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
ＲＰは、独立してＨ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、または任意に置換されたヘテロアリールであり、
Ｑは、
【化５】
であり、
Ｌ１０およびＬ１１は、独立して存在しないかまたはリンカーである、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項３】
式（ＩＩＩ）で表され、
【化６】
式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、およびＢは、請求項１ですでに定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項４】
式（ＩＶ）で表され、
【化７】
式中、Ｒ１０およびＲ２０は、それぞれ独立して水素、任意に置換された脂肪族、任意に置換されたアリール、または任意に置換されたヘテロアリールであり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、およびＸは、請求項１ですでに定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項５】
式（Ｖ）で表され、
【化８】
式中、Ｂ１は、ハロゲン、Ｎ３、ＣＮ、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾールであり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、およびＲ５は請求項１で定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項６】
式（ＶＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化９】
式中、Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｒ１６、Ｒ１７、およびＲ１８は、それぞれ独立してＨ、ＣＨ２ＯＲａ、またはＯＲｂであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１０】
であり、
ＲＬは、リガンド、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８であり、
Ｒ８は、ＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は、−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、独立してＨ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８が、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項７】
式（ＶＩＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１１】
式中、
Ｗは存在しないか、Ｏ、Ｓ、およびＮ（ＲＮ）であり、ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１２】
であり、
ＲＬはリガンドであり、
Ｒ８はＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、独立してＨ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
ｒ、ｓ、およびｔは、それぞれ独立して０、１、２、または３であるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８は、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項８】
式（ＶＩＩＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１３】
式中、Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１４】
であり、
ＲＬはリガンドであり、
Ｒ８はＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は、−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、Ｈ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
ｒおよびｓは、それぞれ独立して０、１、２、または３であるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８は、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項９】
前記リガンドが、甲状腺刺激ホルモン、メラニン細胞刺激ホルモン、レクチン、糖タンパク質、サーファクタントタンパク質Ａ、ムチン糖鎖、多価ラクトース、多価ガラクトース、Ｎ−アセチル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチル−グルコサミン多価マンノース、多価フコース、グリコシル化ポリアミノ酸、多価ガラクトース、トランスフェリン、ビスホスホネート、ポリグルタミン酸塩、ポリアスパラギン酸塩、脂質、コレステロール、ステロイド、胆汁酸、葉酸、ビタミンＢ１２、ビオチン、ＲＧＤペプチド、ＲＧＤペプチド模倣薬、およびアプタマーからなる群から選択される、請求項１または２に記載の化合物。
【請求項１０】
前記リンカーが、構造−［Ｐ−Ｑ１−Ｒ］ｑ−Ｔ−で表され、
式中、
Ｐ、Ｒ、およびＴは、それぞれ独立して存在しないか、ＣＯ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＯＣ（Ｏ）、ＮＨＣ（Ｏ）、ＣＨ２、ＣＨ２ＮＨ、ＣＨ２Ｏ、ＮＨＣＨ（Ｒａ）Ｃ（Ｏ）、−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ（Ｒａ）−ＮＨ−、−Ｃ（Ｏ）−（任意に置換されたアルキル）−ＮＨ−、ＣＨ＝Ｎ−Ｏ、
【化１５】
であり、
Ｑ１は存在しないか、−（ＣＨ２）ｎ−、−Ｃ（Ｒ１００）（Ｒ２００）（ＣＨ２）ｎ−、−（ＣＨ２）ｎＣ（Ｒ１００）（Ｒ２００）−、−（ＣＨ２ＣＨ２Ｏ）ｍＣＨ２ＣＨ２−、または−（ＣＨ２ＣＨ２Ｏ）ｍＣＨ２ＣＨ２ＮＨ−であり、
Ｒａは、Ｈまたはアミノ酸側鎖であり、
Ｒ１００およびＲ２００は、それぞれ独立してＨ、ＣＨ３、ＯＨ、ＳＨ、またはＮ（ＲＸ）２であり、
ＲＸは、独立してＨ、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、またはベンジルであり、
ｑは０〜２０の整数であり、
ｎは１〜２０の整数であり、
ｍは０〜５０の整数であるが、
但し、Ｐ、Ｒ、Ｔ、およびＱ１のうちの少なくとも１つは、前記リンカー中に存在する、請求項１または２に記載の化合物。
【請求項１１】
前記環式基は、ピロリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、［１，３］ジオキソラン、オキサゾリジニル、イソオキサゾリジニル、モルホリニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、キノキサリニル、ピリダジノニル、テトラヒドロフリル、およびデカリンからなる群から選択され、前記非環式基は、セリノールまたはジエタノールアミンの誘導体である、請求項２に記載の化合物。
【請求項１２】
請求項１〜１１のうちのいずれか１項に記載の化合物から調製される、オリゴヌクレオチド。
【請求項１３】
前記オリゴヌクレオチドは一本鎖オリゴヌクレオチドである、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
前記一本鎖オリゴヌクレオチドは一本鎖ｓｉＲＮＡである、請求項１３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１５】
前記一本鎖オリゴヌクレオチドはマイクロＲＮＡである、請求項１３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１６】
前記オリゴヌクレオチドは二本鎖オリゴヌクレオチドである、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
前記二本鎖オリゴヌクレオチドは二本鎖ｓｉＲＮＡである、請求項１６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
生物における標的特異性ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を活性化する方法であって、
請求項１４または１７に記載のｓｉＲＮＡを前記生物に投与することを含み、
前記ｓｉＲＮＡは、前記標的ｍＲＮＡの分解を発生するために十分な量で投与され、それによって前記生物における標的特異性ＲＮＡｉを活性化する、方法。
【請求項１９】
前記標的ｍＲＮＡは、ヒト疾病または疾患に関与するか、または関与することが予想されるタンパク質の前記アミノ酸配列を特定する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記疾病または疾患は、ウイルス感染、細菌感染、寄生虫感染、癌、アレルギー、自己免疫疾病、免疫不全、および免疫抑制から選択される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
請求項１〜１１のうちのいずれか１項に記載の化合物、および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
【請求項２２】
請求項２１に記載される医薬組成物、および使用説明書を含む、薬学的キット。
【請求項２３】
脊椎動物におけるウイルス感染、細菌感染、寄生虫感染、腫瘍、多発性硬化症、アレルギー、自己免疫疾病、免疫抑制、および免疫不全からなる群から選択される疾病および／または疾患を防止および／または治療するための細菌ＲＮＡの調製のための、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチドの使用。
【請求項２４】
標識付パッケージ中に請求項１２に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記パッケージ上の前記標識が、前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのウイルスに対して使用することができることを示す、キット。
【請求項１】
式（Ｉ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１】
式中、
Ｘは、Ｏ、Ｓ、ＮＲＮまたはＣＲＰ２であり、
Ｂは、水素、任意に置換された天然もしくは非天然核酸塩基、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾール、ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−Ｃ（ＣＨ２Ｂ１）３、ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ２Ｂ１）３であり、Ｂ１は、独立してハロゲン、メシル酸塩、Ｎ３、ＣＮ、任意に置換されたトリアゾールもしくは任意に置換されたテトラゾールであり、前記核酸塩基は、−Ｊ−リンカー−Ｎ３、−Ｊ−リンカー−ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８、−Ｊ−リンカー−シクロアルキン、−Ｊ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−Ｑ−ＲＬ、または−Ｊ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬによってさらに置換され、
Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、およびＲ５は、それぞれ独立してＨ、ＯＲ６、Ｆ、Ｎ（ＲＮ）２、Ｎ３、ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｎ３、−Ｊ−リンカー−ＣＮ、−Ｊ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８、−Ｊ−リンカー−シクロアルキン、−Ｊ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−Ｑ−ＲＬ、もしくは−Ｊ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬであり、
Ｊは存在しないか、Ｏ、Ｓ、ＮＲＮ、ＯＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）、ＮＨＳＯ、ＮＨＳＯ２、ＮＨＳＯ２ＮＨ、ＯＣ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、ＯＣ（Ｏ）Ｏ、ＮＨＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）Ｏ、またはＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）であり、
Ｒ６は、水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
ＲＰは、独立してＨ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、または任意に置換されたヘテロアリールであり、
Ｑは、
【化２】
であり、
ＲＬは、水素またはリガンドであり、
Ｒ８は、ＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであるが、但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、−Ｃ≡Ｒ８、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾールが、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、式（Ｉ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項２】
式（ＩＩ）の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化３】
式中、ＡおよびＢはそれぞれ独立して水素、保護基、任意に置換された脂肪族、任意に置換されたアリール、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、または−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、Ｚ１およびＺ２はそれぞれ存在ごとに独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
Ｊ１およびＪ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、ＮＲＮ、任意に置換されたアルキル、ＯＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｏ）、ＯＣ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、ＯＣ（Ｏ）Ｏ、ＮＨＣ（Ｏ）ＮＨ、ＮＨＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＣ（Ｓ）ＮＨ、ＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）Ｏ、またはＯＰ（Ｎ（ＲＰ）２）であり、
【化４】
は、環式基または非環式基であり、
ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
ＲＰは、独立してＨ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、または任意に置換されたヘテロアリールであり、
Ｑは、
【化５】
であり、
Ｌ１０およびＬ１１は、独立して存在しないかまたはリンカーである、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項３】
式（ＩＩＩ）で表され、
【化６】
式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、およびＢは、請求項１ですでに定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項４】
式（ＩＶ）で表され、
【化７】
式中、Ｒ１０およびＲ２０は、それぞれ独立して水素、任意に置換された脂肪族、任意に置換されたアリール、または任意に置換されたヘテロアリールであり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、およびＸは、請求項１ですでに定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項５】
式（Ｖ）で表され、
【化８】
式中、Ｂ１は、ハロゲン、Ｎ３、ＣＮ、任意に置換されたトリアゾール、または任意に置換されたテトラゾールであり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、およびＲ５は請求項１で定義された通りである、請求項１に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項６】
式（ＶＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化９】
式中、Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｒ１６、Ｒ１７、およびＲ１８は、それぞれ独立してＨ、ＣＨ２ＯＲａ、またはＯＲｂであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１０】
であり、
ＲＬは、リガンド、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８であり、
Ｒ８は、ＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は、−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、独立してＨ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８が、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項７】
式（ＶＩＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１１】
式中、
Ｗは存在しないか、Ｏ、Ｓ、およびＮ（ＲＮ）であり、ＲＮは、Ｈ、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたヘテロアリール、またはアミノ保護基であり、
Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１２】
であり、
ＲＬはリガンドであり、
Ｒ８はＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、独立してＨ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
ｒ、ｓ、およびｔは、それぞれ独立して０、１、２、または３であるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８は、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項８】
式（ＶＩＩＩ）の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグであって、
【化１３】
式中、Ｅは存在しないか、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）Ｏ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ、Ｃ（Ｓ）、Ｃ（Ｓ）ＮＨ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＳＯ２ＮＨであり、
ＲａおよびＲｂは、それぞれ独立して水素、ヒドロキシル保護基、任意に置換されたアルキル、任意に置換されたアリール、任意に置換されたシクロアルキル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたアルケニル、任意に置換されたヘテロアリール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、ホスホン酸塩、ホスホノチオエート、ホスホノジチオエート、ホスホロチオエート、ホスホロチオレート、ホスホロジチオエート、ホスホロチオロチオネート、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、活性化されたリン酸基、活性化された亜リン酸基、ホスホラミダイト、固形支持体、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｚ２）−式（Ｉ）、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（Ｏ−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−ヌクレオシド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−ヌクレオシド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、（Ｚ１）（−リンカー−ＲＬ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｎ３）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、−Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−ＣＮ）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、Ｐ（Ｚ１）（−リンカー−Ｃ≡Ｒ８）−Ｏ−オリゴヌクレオチド、またはＰ（Ｚ１）（−リンカー−シクロアルキン）−Ｏ−オリゴヌクレオチドであり、
Ｒ３０は、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
Ｑは、
【化１４】
であり、
ＲＬはリガンドであり、
Ｒ８はＮまたはＣＲ９であり、
Ｒ９は、Ｈ、任意に置換されたアルキル、またはシリルであり、
Ｒ３１は、−Ｃ（Ｏ）ＣＨ（Ｎ（Ｒ３２）２）（ＣＨ２）ｈＮ（Ｒ３２）２であり、
Ｒ３２は、Ｈ、−リンカー−Ｑ−リンカー−ＲＬ、またはＲ３１であり、
ｈは、１〜２０の整数であり、
Ｚ１およびＺ２は、それぞれ独立してＯ、Ｓ、または任意に置換されたアルキルであり、
ｒおよびｓは、それぞれ独立して０、１、２、または３であるが、
但し、Ｑ、−Ｎ３、−ＣＮ、または−Ｃ≡Ｒ８は、前記化合物中に少なくとも１つ存在する、化合物またはその薬学的に許容される塩もしくはプロドラッグ。
【請求項９】
前記リガンドが、甲状腺刺激ホルモン、メラニン細胞刺激ホルモン、レクチン、糖タンパク質、サーファクタントタンパク質Ａ、ムチン糖鎖、多価ラクトース、多価ガラクトース、Ｎ−アセチル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチル−グルコサミン多価マンノース、多価フコース、グリコシル化ポリアミノ酸、多価ガラクトース、トランスフェリン、ビスホスホネート、ポリグルタミン酸塩、ポリアスパラギン酸塩、脂質、コレステロール、ステロイド、胆汁酸、葉酸、ビタミンＢ１２、ビオチン、ＲＧＤペプチド、ＲＧＤペプチド模倣薬、およびアプタマーからなる群から選択される、請求項１または２に記載の化合物。
【請求項１０】
前記リンカーが、構造−［Ｐ−Ｑ１−Ｒ］ｑ−Ｔ−で表され、
式中、
Ｐ、Ｒ、およびＴは、それぞれ独立して存在しないか、ＣＯ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＯＣ（Ｏ）、ＮＨＣ（Ｏ）、ＣＨ２、ＣＨ２ＮＨ、ＣＨ２Ｏ、ＮＨＣＨ（Ｒａ）Ｃ（Ｏ）、−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ（Ｒａ）−ＮＨ−、−Ｃ（Ｏ）−（任意に置換されたアルキル）−ＮＨ−、ＣＨ＝Ｎ−Ｏ、
【化１５】
であり、
Ｑ１は存在しないか、−（ＣＨ２）ｎ−、−Ｃ（Ｒ１００）（Ｒ２００）（ＣＨ２）ｎ−、−（ＣＨ２）ｎＣ（Ｒ１００）（Ｒ２００）−、−（ＣＨ２ＣＨ２Ｏ）ｍＣＨ２ＣＨ２−、または−（ＣＨ２ＣＨ２Ｏ）ｍＣＨ２ＣＨ２ＮＨ−であり、
Ｒａは、Ｈまたはアミノ酸側鎖であり、
Ｒ１００およびＲ２００は、それぞれ独立してＨ、ＣＨ３、ＯＨ、ＳＨ、またはＮ（ＲＸ）２であり、
ＲＸは、独立してＨ、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、またはベンジルであり、
ｑは０〜２０の整数であり、
ｎは１〜２０の整数であり、
ｍは０〜５０の整数であるが、
但し、Ｐ、Ｒ、Ｔ、およびＱ１のうちの少なくとも１つは、前記リンカー中に存在する、請求項１または２に記載の化合物。
【請求項１１】
前記環式基は、ピロリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、［１，３］ジオキソラン、オキサゾリジニル、イソオキサゾリジニル、モルホリニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、キノキサリニル、ピリダジノニル、テトラヒドロフリル、およびデカリンからなる群から選択され、前記非環式基は、セリノールまたはジエタノールアミンの誘導体である、請求項２に記載の化合物。
【請求項１２】
請求項１〜１１のうちのいずれか１項に記載の化合物から調製される、オリゴヌクレオチド。
【請求項１３】
前記オリゴヌクレオチドは一本鎖オリゴヌクレオチドである、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
前記一本鎖オリゴヌクレオチドは一本鎖ｓｉＲＮＡである、請求項１３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１５】
前記一本鎖オリゴヌクレオチドはマイクロＲＮＡである、請求項１３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１６】
前記オリゴヌクレオチドは二本鎖オリゴヌクレオチドである、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
前記二本鎖オリゴヌクレオチドは二本鎖ｓｉＲＮＡである、請求項１６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
生物における標的特異性ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を活性化する方法であって、
請求項１４または１７に記載のｓｉＲＮＡを前記生物に投与することを含み、
前記ｓｉＲＮＡは、前記標的ｍＲＮＡの分解を発生するために十分な量で投与され、それによって前記生物における標的特異性ＲＮＡｉを活性化する、方法。
【請求項１９】
前記標的ｍＲＮＡは、ヒト疾病または疾患に関与するか、または関与することが予想されるタンパク質の前記アミノ酸配列を特定する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記疾病または疾患は、ウイルス感染、細菌感染、寄生虫感染、癌、アレルギー、自己免疫疾病、免疫不全、および免疫抑制から選択される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
請求項１〜１１のうちのいずれか１項に記載の化合物、および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
【請求項２２】
請求項２１に記載される医薬組成物、および使用説明書を含む、薬学的キット。
【請求項２３】
脊椎動物におけるウイルス感染、細菌感染、寄生虫感染、腫瘍、多発性硬化症、アレルギー、自己免疫疾病、免疫抑制、および免疫不全からなる群から選択される疾病および／または疾患を防止および／または治療するための細菌ＲＮＡの調製のための、請求項１２に記載のオリゴヌクレオチドの使用。
【請求項２４】
標識付パッケージ中に請求項１２に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記パッケージ上の前記標識が、前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのウイルスに対して使用することができることを示す、キット。
【図１】
【図２】
【図３】
【図６】
【図１４】
【図１５】
【図１７】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３ａ】
【図２３ｂ】
【図２３ｃ】
【図４】
【図５】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１６】
【図１８】
【図２４】
【図２】
【図３】
【図６】
【図１４】
【図１５】
【図１７】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３ａ】
【図２３ｂ】
【図２３ｃ】
【図４】
【図５】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１６】
【図１８】
【図２４】
【公表番号】特表２０１２−５１３９５３（Ｐ２０１２−５１３９５３Ａ）
【公表日】平成２４年６月２１日（２０１２．６．２１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５２９１８８（Ｐ２０１１−５２９１８８）
【出願日】平成２１年９月２３日（２００９．９．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０５８０８４
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０３９５４８
【国際公開日】平成２２年４月８日（２０１０．４．８）
【出願人】（５０６３３６７２８）アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド (13)
【氏名又は名称原語表記】ＡＬＮＹＬＡＭ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２４年６月２１日（２０１２．６．２１）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年９月２３日（２００９．９．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０５８０８４
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０３９５４８
【国際公開日】平成２２年４月８日（２０１０．４．８）
【出願人】（５０６３３６７２８）アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド (13)
【氏名又は名称原語表記】ＡＬＮＹＬＡＭ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
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