癌に関与するポリヌクレオチド配列およびポリペプチド配列
本発明は、正常細胞と比較して癌細胞において差次的に発現するポリヌクレオチド配列およびポリペプチド配列に関する。本発明は、より具体的には、癌の診断、予後予測または治療、および癌細胞の検出におけるこれらの配列の使用に関する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるメンバーを含む単離ポリヌクレオチド。
【請求項２】
請求項1に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項３】
前記ベクターが発現ベクターである、請求項2に記載のベクター。
【請求項４】
請求項1に記載の少なくとも1種のメンバーを含むポリヌクレオチドのライブラリー。
【請求項５】
前記ライブラリーが、請求項1に記載の少なくとも2種のメンバーを含む、請求項4に記載のライブラリー。
【請求項６】
請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドを含むアレイ。
【請求項７】
前記アレイが、請求項1に記載の少なくとも2種のポリヌクレオチドを含む、請求項6に記載のアレイ。
【請求項８】
請求項1に記載のポリヌクレオチドまたは請求項2もしくは3に記載のベクターを含む単離細胞。
【請求項９】
請求項1に記載のポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１０】
請求項1に記載のポリヌクレオチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
【請求項１１】
癌細胞の同定もしくは検出用、または卵巣癌細胞の成長の抑制用組成物の製造における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項１２】
癌細胞の同定または検出における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項１３】
前記癌細胞が卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項12に記載の使用。
【請求項１４】
前記卵巣癌細胞が、悪性卵巣癌細胞または低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞である、請求項13に記載の使用。
【請求項１５】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１６】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１７】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１８】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞、正常卵巣細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１９】
前記悪性卵巣癌細胞が、正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項２０】
癌の予後予測または診断における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項２１】
前記癌が、卵巣癌、前立腺癌、乳癌、肺癌、結腸癌、腎臓癌、メラノーマ、白血病、中枢神経系の癌およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項20に記載の使用。
【請求項２２】
前記卵巣癌が、悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項21に記載の使用。
【請求項２３】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、悪性卵巣癌の診断が低悪性度の潜在的卵巣癌の診断より優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２４】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２５】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、後期悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２６】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれかと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
d)a)からc)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるポリヌクレオチド配列の、癌細胞の成長を低下、低減または抑制するための使用。
【請求項２７】
前記癌細胞が、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項25に記載の使用。
【請求項２８】
癌細胞を同定する方法であって、試験細胞、試験細胞試料、試験体液または試験組織を、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択される少なくとも1種のポリヌクレオチド配列と特異的に結合できる試薬と接触させるステップと、試薬およびポリヌクレオチドにより形成される複合体を検出するステップとを含み、複合体の存在から癌細胞が示唆される方法。
【請求項２９】
前記方法が、卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から卵巣癌が示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３０】
複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌細胞または悪性卵巣癌細胞が示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３１】
前記方法が悪性卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌に対して悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３２】
前記悪性卵巣癌が後期悪性卵巣癌である、請求項31に記載の方法。
【請求項３３】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、正常細胞、正常細胞試料、正常体液、正常組織における複合体のレベルまたは基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項28から32のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記正常細胞、細胞試料または組織が、正常卵巣細胞、正常卵巣細胞試料または正常卵巣組織であり、正常体液が癌状態を有さない個体に由来する、請求項33に記載の方法。
【請求項３５】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、低悪性度の潜在的卵巣癌の細胞、細胞試料、体液、組織における複合体のレベル、または低悪性度の潜在的卵巣癌に起因する基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項28から32のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
少なくとも2種の複合体の存在が検出される、請求項28から35のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
前記試薬が、請求項28に記載のポリヌクレオチドと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチドである、請求項28から35のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
前記細胞、細胞試料、体液または組織が、卵巣癌を有する、または有することが疑われる個体に由来する、請求項28に記載の方法。
【請求項３９】
前記卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項38に記載の方法。
【請求項４０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌である、請求項38に記載の方法。
【請求項４１】
必要とする個体において、癌細胞の成長を低下または遅延させる方法であって、前記個体に、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれかと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
d)a)からc)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるポリヌクレオチド配列を投与するステップを含む方法。
【請求項４２】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、および
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド
からなる群から選択される核酸の発現を低減させるsiRNAまたはshRNA分子。
【請求項４３】
癌の診断または予後予測の方法であって、個体から得た試料中における少なくとも1種のポリヌクレオチド配列の有無を確定するステップを含み、前記ポリヌクレオチドが、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択され、ポリヌクレオチドの存在から癌細胞の存在が示唆される方法。
【請求項４４】
請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチド、または請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドと特異的に結合できる試薬を含む、癌の診断用キット。
【請求項４５】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれかに1つよりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択される単離ポリペプチド。
【請求項４６】
前記類似体が、アミノ酸配列中に少なくとも1個のアミノ酸の置換、欠失または挿入を含む、請求項45に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４７】
前記置換が保存的または非保存的である、請求項46に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４８】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドを含むポリペプチドライブラリー。
【請求項４９】
請求項45に記載の少なくとも2種のポリペプチドを含むポリペプチドライブラリー。
【請求項５０】
請求項45に記載のポリペプチドを含む単離細胞。
【請求項５１】
請求項45に記載のポリペプチドを含む組成物。
【請求項５２】
請求項45に記載のポリペプチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
【請求項５３】
癌細胞の同定または検出用組成物の製造における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリぺプチドの使用。
【請求項５４】
癌細胞の同定または検出における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの使用。
【請求項５５】
前記癌細胞が卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項54に記載の使用。
【請求項５６】
前記卵巣癌細胞が、悪性卵巣癌細胞または低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞である、請求項55に記載の使用。
【請求項５７】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項５８】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項５９】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６０】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍、正常卵巣細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６１】
前記悪性卵巣癌細胞が、正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６２】
癌の予後予測または診断における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの使用。
【請求項６３】
前記癌が卵巣癌である、請求項62に記載の使用。
【請求項６４】
前記卵巣癌が、悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項63に記載の使用。
【請求項６５】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、悪性卵巣癌の診断が低悪性度の潜在的卵巣癌診断より優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６６】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６７】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、後期悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６８】
癌細胞の同定方法であって、試験細胞、試験細胞試料、試験体液または試験組織を、請求項45に記載のポリペプチドと特異的に結合できる試薬と接触させるステップと、ポリペプチドおよび試薬により形成される複合体を検出するステップを含み、複合体の存在から癌細胞が示唆される方法。
【請求項６９】
前記方法が、卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から卵巣癌が示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７０】
複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌または悪性卵巣癌が示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７１】
前記方法が悪性卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌に対して悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７２】
前記悪性卵巣癌が後期悪性卵巣癌である、請求項71に記載の方法。
【請求項７３】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、正常細胞、正常細胞試料、正常体液、正常組織における複合体レベルまたは基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項68から72のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、低悪性度の潜在的卵巣癌の細胞、細胞試料、体液または組織における複合体のレベル、または低悪性度の潜在的卵巣癌に起因する基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項68から72のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
正常細胞、細胞試料または組織が、正常卵巣細胞、正常卵巣細胞試料または正常卵巣組織である、請求項73に記載の方法。
【請求項７６】
少なくとも2種の複合体の存在が検出される、請求項68から75のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７７】
前記試薬が抗体またはその抗体断片である、請求項68から75のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織が、卵巣癌を有する、または有することが疑われる個体に由来する、請求項68に記載の方法。
【請求項７９】
前記卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項69に記載の方法。
【請求項８０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌である、請求項69に記載の方法。
【請求項８１】
癌の診断または予後予測のための方法であって、請求項70に記載の少なくとも1種のポリペプチドの有無を確定するステップを含み、ポリペプチドの存在から癌細胞の存在が示唆される方法。
【請求項８２】
少なくとも2種のポリぺプチドの有無を確定する、請求項81に記載の方法。
【請求項８３】
ポリペプチドの存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌が示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８４】
ポリペプチドの存在から、悪性卵巣癌が示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８５】
ポリペプチドの存在から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８６】
癌の診断または予後予測のための方法であって、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの発現レベルを確定するステップを含む方法。
【請求項８７】
得られたレベルを、少なくとも1つの基準のレベルまたは値と比較するステップをさらに含む、請求項86に記載の方法。
【請求項８８】
基準のレベルまたは値が、低悪性度の潜在的卵巣癌および/または正常細胞に由来する、請求項87に記載の方法。
【請求項８９】
正常細胞に関する基準のレベルまたは値と比較して、卵巣細胞、卵巣組織または卵巣起源の試料において測定される高いレベルから卵巣癌が示唆される、請求項88に記載の方法。
【請求項９０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項89に記載の方法。
【請求項９１】
LMP細胞、LMP起源の試料のLMP組織またはLMPからの基準のレベルまたは値と比較して、卵巣細胞、卵巣組織または卵巣起源の試料において測定される高いレベルから悪性卵巣癌が示唆される、請求項88に記載の方法。
【請求項９２】
測定される高いレベルを、正常細胞に関する基準のレベルまたは値とも比較する、請求項91に記載の方法。
【請求項９３】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドまたは請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドと特異的に結合できる試薬を含む癌の診断用キット。
【請求項９４】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含む、またはからなるポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれかに1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる、単離または精製抗体およびその抗原結合断片。
【請求項９５】
前記抗体が、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる、請求項94に記載の抗体。
【請求項９６】
前記抗体が、配列番号14、19、22、37、41、45、46、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる、請求項95に記載の抗体。
【請求項９７】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含むポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生するハイブリドーマ細胞。
【請求項９８】
前記ハイブリドーマが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生する、請求項97に記載のハイブリドーマ。
【請求項９９】
ハイブリドーマが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生する、請求項98に記載のハイブリドーマ。
【請求項１００】
請求項95、96または97のいずれか一項に記載の抗体を含む組成物。
【請求項１０１】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含む、またはからなるポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドの免疫原性断片で非ヒト動物を免疫感作するステップを含む、抗体の作製方法。
【請求項１０２】
前記ポリペプチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49のいずれか1つによりコードされる、請求項101に記載の方法。
【請求項１０３】
前記ポリペプチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49のいずれか1つによりコードされる、請求項139に記載の方法。
【請求項１０４】
配列番号51から89および170のいずれか1つからなる群から選択されるポリペプチド、または配列番号1から49および169のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列を含むポリペプチドの活性または機能を抑制する化合物を同定する方法であって、前記ポリペプチドを推定上の化合物と接触させるステップと、上述のポリペプチドのいずれか1種と特異的に結合できる化合物を単離または同定するステップとを含む方法。
【請求項１０５】
ポリペプチドの活性または機能が、前記化合物と結合することによって影響を受けるかどうかを確定するステップをさらに含む、請求項104に記載の方法。
【請求項１０６】
卵巣癌細胞の成長に対する推定上の化合物の効果を確定するステップをさらに含む、請求項104または105に記載の方法。
【請求項１０７】
請求項1に記載のポリヌクレオチドもしくはベクターで形質転換された、または請求項45に記載のポリペプチドの外来型を含む細胞。
【請求項１０８】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択される、請求項107に記載の細胞。
【請求項１０９】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択される、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１０】
前記ポリペプチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされる、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１１】
前記ポリペプチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされる、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１２】
前記細胞が非卵巣細胞である、請求項107から111のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１３】
配列番号1から50および169のいずれか1つからなる群から選択されるポリヌクレオチドの発現を抑制する化合物を同定する方法であって、前記ポリヌクレオチドを発現できる細胞を、推定上の化合物と接触させるステップと、前記推定上の化合物の存在下でポリヌクレオチドの発現レベルを定量化するステップを含む方法。
【請求項１１４】
前記細胞が、前記ポリヌクレオチドを内因的に発現する卵巣癌細胞である、請求項113に記載の方法。
【請求項１１５】
前記細胞が、ポリヌクレオチドの外来型を含む、請求項113に記載の方法。
【請求項１１６】
前記細胞が、前記ポリヌクレオチドを内因的に発現しない、請求項115に記載の方法。
【請求項１１７】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択される、請求項113に記載の方法。
【請求項１１８】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択される、請求項113に記載の方法。
【請求項１１９】
推定化合物が存在しない場合と比較した前記ポリヌクレオチドの発現の減少から、前記ポリヌクレオチドの発現を下方制御できる化合物が示唆される、請求項113から118のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２０】
ポリペプチドと特異的に結合する抗体を検出するための、請求項45に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１２１】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドと特異的に結合する抗体を検出するための免疫測定法であって、
a)哺乳動物由来の生体液試料の試料を、前記ポリペプチドと接触させるステップと、
b)前記試料における、前記ポリペプチドと抗体との免疫複合体の形成を検出するステップと
を含む免疫測定法。
【請求項１２２】
a)配列番号50を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号50の転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号50の翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択される少なくとも1種のポリペプチドの、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出における、またはその成長抑制のための使用。
【請求項１２３】
a)配列番号89を含むポリペプチド、
b)配列番号50によりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択される少なくとも1種のポリペプチドの、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出のための、または成長抑制のための使用。
【請求項１２４】
a)配列番号89を含むポリペプチド、
b)配列番号50によりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドに特異的な少なくとも1種の抗体の、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出のための、または成長抑制のための使用。
【請求項１２５】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる抗体の、癌の治療における使用。
【請求項１２６】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドの抑制因子の、癌の治療における使用。
【請求項１】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるメンバーを含む単離ポリヌクレオチド。
【請求項２】
請求項1に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項３】
前記ベクターが発現ベクターである、請求項2に記載のベクター。
【請求項４】
請求項1に記載の少なくとも1種のメンバーを含むポリヌクレオチドのライブラリー。
【請求項５】
前記ライブラリーが、請求項1に記載の少なくとも2種のメンバーを含む、請求項4に記載のライブラリー。
【請求項６】
請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドを含むアレイ。
【請求項７】
前記アレイが、請求項1に記載の少なくとも2種のポリヌクレオチドを含む、請求項6に記載のアレイ。
【請求項８】
請求項1に記載のポリヌクレオチドまたは請求項2もしくは3に記載のベクターを含む単離細胞。
【請求項９】
請求項1に記載のポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１０】
請求項1に記載のポリヌクレオチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
【請求項１１】
癌細胞の同定もしくは検出用、または卵巣癌細胞の成長の抑制用組成物の製造における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項１２】
癌細胞の同定または検出における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項１３】
前記癌細胞が卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項12に記載の使用。
【請求項１４】
前記卵巣癌細胞が、悪性卵巣癌細胞または低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞である、請求項13に記載の使用。
【請求項１５】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１６】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１７】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１８】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞、正常卵巣細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項１９】
前記悪性卵巣癌細胞が、正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項14に記載の使用。
【請求項２０】
癌の予後予測または診断における、請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドの使用。
【請求項２１】
前記癌が、卵巣癌、前立腺癌、乳癌、肺癌、結腸癌、腎臓癌、メラノーマ、白血病、中枢神経系の癌およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項20に記載の使用。
【請求項２２】
前記卵巣癌が、悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項21に記載の使用。
【請求項２３】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、悪性卵巣癌の診断が低悪性度の潜在的卵巣癌の診断より優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２４】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２５】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリヌクレオチドの検出から、後期悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項22に記載の使用。
【請求項２６】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれかと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
d)a)からc)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるポリヌクレオチド配列の、癌細胞の成長を低下、低減または抑制するための使用。
【請求項２７】
前記癌細胞が、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項25に記載の使用。
【請求項２８】
癌細胞を同定する方法であって、試験細胞、試験細胞試料、試験体液または試験組織を、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択される少なくとも1種のポリヌクレオチド配列と特異的に結合できる試薬と接触させるステップと、試薬およびポリヌクレオチドにより形成される複合体を検出するステップとを含み、複合体の存在から癌細胞が示唆される方法。
【請求項２９】
前記方法が、卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から卵巣癌が示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３０】
複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌細胞または悪性卵巣癌細胞が示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３１】
前記方法が悪性卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌に対して悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項28に記載の方法。
【請求項３２】
前記悪性卵巣癌が後期悪性卵巣癌である、請求項31に記載の方法。
【請求項３３】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、正常細胞、正常細胞試料、正常体液、正常組織における複合体のレベルまたは基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項28から32のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記正常細胞、細胞試料または組織が、正常卵巣細胞、正常卵巣細胞試料または正常卵巣組織であり、正常体液が癌状態を有さない個体に由来する、請求項33に記載の方法。
【請求項３５】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、低悪性度の潜在的卵巣癌の細胞、細胞試料、体液、組織における複合体のレベル、または低悪性度の潜在的卵巣癌に起因する基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項28から32のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
少なくとも2種の複合体の存在が検出される、請求項28から35のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
前記試薬が、請求項28に記載のポリヌクレオチドと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチドである、請求項28から35のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
前記細胞、細胞試料、体液または組織が、卵巣癌を有する、または有することが疑われる個体に由来する、請求項28に記載の方法。
【請求項３９】
前記卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項38に記載の方法。
【請求項４０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌である、請求項38に記載の方法。
【請求項４１】
必要とする個体において、癌細胞の成長を低下または遅延させる方法であって、前記個体に、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれかと実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
d)a)からc)のいずれか1つの断片
からなる群から選択されるポリヌクレオチド配列を投与するステップを含む方法。
【請求項４２】
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、および
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド
からなる群から選択される核酸の発現を低減させるsiRNAまたはshRNA分子。
【請求項４３】
癌の診断または予後予測の方法であって、個体から得た試料中における少なくとも1種のポリヌクレオチド配列の有無を確定するステップを含み、前記ポリヌクレオチドが、
a)配列番号1から配列番号50または配列番号169のいずれか1つを含むポリヌクレオチド、
b)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号1から50または配列番号169のいずれか1つの翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択され、ポリヌクレオチドの存在から癌細胞の存在が示唆される方法。
【請求項４４】
請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチド、または請求項1に記載の少なくとも1種のポリヌクレオチドと特異的に結合できる試薬を含む、癌の診断用キット。
【請求項４５】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれかに1つよりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択される単離ポリペプチド。
【請求項４６】
前記類似体が、アミノ酸配列中に少なくとも1個のアミノ酸の置換、欠失または挿入を含む、請求項45に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４７】
前記置換が保存的または非保存的である、請求項46に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４８】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドを含むポリペプチドライブラリー。
【請求項４９】
請求項45に記載の少なくとも2種のポリペプチドを含むポリペプチドライブラリー。
【請求項５０】
請求項45に記載のポリペプチドを含む単離細胞。
【請求項５１】
請求項45に記載のポリペプチドを含む組成物。
【請求項５２】
請求項45に記載のポリペプチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
【請求項５３】
癌細胞の同定または検出用組成物の製造における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリぺプチドの使用。
【請求項５４】
癌細胞の同定または検出における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの使用。
【請求項５５】
前記癌細胞が卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項54に記載の使用。
【請求項５６】
前記卵巣癌細胞が、悪性卵巣癌細胞または低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞である、請求項55に記載の使用。
【請求項５７】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項５８】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項５９】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍の細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６０】
前記悪性卵巣癌細胞が、低悪性度の潜在的卵巣腫瘍、正常卵巣細胞および少なくとも1種の非卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６１】
前記悪性卵巣癌細胞が、正常卵巣細胞より優先的に検出される、請求項56に記載の使用。
【請求項６２】
癌の予後予測または診断における、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの使用。
【請求項６３】
前記癌が卵巣癌である、請求項62に記載の使用。
【請求項６４】
前記卵巣癌が、悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項63に記載の使用。
【請求項６５】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、悪性卵巣癌の診断が低悪性度の潜在的卵巣癌診断より優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６６】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６７】
個体由来の細胞、組織、試料または体液における前記ポリペプチドの検出から、後期悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項64に記載の使用。
【請求項６８】
癌細胞の同定方法であって、試験細胞、試験細胞試料、試験体液または試験組織を、請求項45に記載のポリペプチドと特異的に結合できる試薬と接触させるステップと、ポリペプチドおよび試薬により形成される複合体を検出するステップを含み、複合体の存在から癌細胞が示唆される方法。
【請求項６９】
前記方法が、卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から卵巣癌が示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７０】
複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌または悪性卵巣癌が示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７１】
前記方法が悪性卵巣癌細胞の検出用であり、複合体の存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌に対して悪性卵巣癌が優先的に示唆される、請求項68に記載の方法。
【請求項７２】
前記悪性卵巣癌が後期悪性卵巣癌である、請求項71に記載の方法。
【請求項７３】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、正常細胞、正常細胞試料、正常体液、正常組織における複合体レベルまたは基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項68から72のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織に存在する少なくとも1種の複合体のレベルを、低悪性度の潜在的卵巣癌の細胞、細胞試料、体液または組織における複合体のレベル、または低悪性度の潜在的卵巣癌に起因する基準値と定性的または定量的に比較するステップをさらに含む、請求項68から72のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
正常細胞、細胞試料または組織が、正常卵巣細胞、正常卵巣細胞試料または正常卵巣組織である、請求項73に記載の方法。
【請求項７６】
少なくとも2種の複合体の存在が検出される、請求項68から75のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７７】
前記試薬が抗体またはその抗体断片である、請求項68から75のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記試験細胞、試験試料、試験体液または試験組織が、卵巣癌を有する、または有することが疑われる個体に由来する、請求項68に記載の方法。
【請求項７９】
前記卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項69に記載の方法。
【請求項８０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌である、請求項69に記載の方法。
【請求項８１】
癌の診断または予後予測のための方法であって、請求項70に記載の少なくとも1種のポリペプチドの有無を確定するステップを含み、ポリペプチドの存在から癌細胞の存在が示唆される方法。
【請求項８２】
少なくとも2種のポリぺプチドの有無を確定する、請求項81に記載の方法。
【請求項８３】
ポリペプチドの存在から、低悪性度の潜在的卵巣癌が示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８４】
ポリペプチドの存在から、悪性卵巣癌が示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８５】
ポリペプチドの存在から、悪性卵巣癌が低悪性度の潜在的卵巣癌より優先的に示唆される、請求項81または82に記載の方法。
【請求項８６】
癌の診断または予後予測のための方法であって、請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドの発現レベルを確定するステップを含む方法。
【請求項８７】
得られたレベルを、少なくとも1つの基準のレベルまたは値と比較するステップをさらに含む、請求項86に記載の方法。
【請求項８８】
基準のレベルまたは値が、低悪性度の潜在的卵巣癌および/または正常細胞に由来する、請求項87に記載の方法。
【請求項８９】
正常細胞に関する基準のレベルまたは値と比較して、卵巣細胞、卵巣組織または卵巣起源の試料において測定される高いレベルから卵巣癌が示唆される、請求項88に記載の方法。
【請求項９０】
前記卵巣癌が悪性卵巣癌または低悪性度の潜在的卵巣癌である、請求項89に記載の方法。
【請求項９１】
LMP細胞、LMP起源の試料のLMP組織またはLMPからの基準のレベルまたは値と比較して、卵巣細胞、卵巣組織または卵巣起源の試料において測定される高いレベルから悪性卵巣癌が示唆される、請求項88に記載の方法。
【請求項９２】
測定される高いレベルを、正常細胞に関する基準のレベルまたは値とも比較する、請求項91に記載の方法。
【請求項９３】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドまたは請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドと特異的に結合できる試薬を含む癌の診断用キット。
【請求項９４】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含む、またはからなるポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれかに1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる、単離または精製抗体およびその抗原結合断片。
【請求項９５】
前記抗体が、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる、請求項94に記載の抗体。
【請求項９６】
前記抗体が、配列番号14、19、22、37、41、45、46、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる、請求項95に記載の抗体。
【請求項９７】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含むポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生するハイブリドーマ細胞。
【請求項９８】
前記ハイブリドーマが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生する、請求項97に記載のハイブリドーマ。
【請求項９９】
ハイブリドーマが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、もしくは49のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列または前記ポリペプチドの少なくとも6個のアミノ酸の断片を含むポリペプチドと特異的に結合できる抗体を産生する、請求項98に記載のハイブリドーマ。
【請求項１００】
請求項95、96または97のいずれか一項に記載の抗体を含む組成物。
【請求項１０１】
a)配列番号51から89および170のいずれか1つを含む、またはからなるポリペプチド、および
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列を含むポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドの免疫原性断片で非ヒト動物を免疫感作するステップを含む、抗体の作製方法。
【請求項１０２】
前記ポリペプチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49のいずれか1つによりコードされる、請求項101に記載の方法。
【請求項１０３】
前記ポリペプチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49のいずれか1つによりコードされる、請求項139に記載の方法。
【請求項１０４】
配列番号51から89および170のいずれか1つからなる群から選択されるポリペプチド、または配列番号1から49および169のいずれか1つによりコードされるポリペプチド配列を含むポリペプチドの活性または機能を抑制する化合物を同定する方法であって、前記ポリペプチドを推定上の化合物と接触させるステップと、上述のポリペプチドのいずれか1種と特異的に結合できる化合物を単離または同定するステップとを含む方法。
【請求項１０５】
ポリペプチドの活性または機能が、前記化合物と結合することによって影響を受けるかどうかを確定するステップをさらに含む、請求項104に記載の方法。
【請求項１０６】
卵巣癌細胞の成長に対する推定上の化合物の効果を確定するステップをさらに含む、請求項104または105に記載の方法。
【請求項１０７】
請求項1に記載のポリヌクレオチドもしくはベクターで形質転換された、または請求項45に記載のポリペプチドの外来型を含む細胞。
【請求項１０８】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択される、請求項107に記載の細胞。
【請求項１０９】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択される、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１０】
前記ポリペプチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされる、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１１】
前記ポリペプチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされる、請求項107に記載の細胞。
【請求項１１２】
前記細胞が非卵巣細胞である、請求項107から111のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１３】
配列番号1から50および169のいずれか1つからなる群から選択されるポリヌクレオチドの発現を抑制する化合物を同定する方法であって、前記ポリヌクレオチドを発現できる細胞を、推定上の化合物と接触させるステップと、前記推定上の化合物の存在下でポリヌクレオチドの発現レベルを定量化するステップを含む方法。
【請求項１１４】
前記細胞が、前記ポリヌクレオチドを内因的に発現する卵巣癌細胞である、請求項113に記載の方法。
【請求項１１５】
前記細胞が、ポリヌクレオチドの外来型を含む、請求項113に記載の方法。
【請求項１１６】
前記細胞が、前記ポリヌクレオチドを内因的に発現しない、請求項115に記載の方法。
【請求項１１７】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号1、14、16、19、20、22、28、37、41、45、46、47、または49からなる群から選択される、請求項113に記載の方法。
【請求項１１８】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号14、19、22、37、41、45、46、または49からなる群から選択される、請求項113に記載の方法。
【請求項１１９】
推定化合物が存在しない場合と比較した前記ポリヌクレオチドの発現の減少から、前記ポリヌクレオチドの発現を下方制御できる化合物が示唆される、請求項113から118のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２０】
ポリペプチドと特異的に結合する抗体を検出するための、請求項45に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１２１】
請求項45に記載の少なくとも1種のポリペプチドと特異的に結合する抗体を検出するための免疫測定法であって、
a)哺乳動物由来の生体液試料の試料を、前記ポリペプチドと接触させるステップと、
b)前記試料における、前記ポリペプチドと抗体との免疫複合体の形成を検出するステップと
を含む免疫測定法。
【請求項１２２】
a)配列番号50を含むポリヌクレオチド、
b)配列番号50の転写部分または転写可能部分を含むポリヌクレオチド、
c)配列番号50の翻訳部分または翻訳可能部分を含むポリヌクレオチド、
d)a)、b)またはc)と実質的に同一な配列を含むポリヌクレオチド、
e)a)、b)またはc)と実質的に相補的な配列を含むポリヌクレオチド、および
f)a)からe)のいずれか1つの断片
からなる群から選択される少なくとも1種のポリペプチドの、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出における、またはその成長抑制のための使用。
【請求項１２３】
a)配列番号89を含むポリペプチド、
b)配列番号50によりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択される少なくとも1種のポリペプチドの、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出のための、または成長抑制のための使用。
【請求項１２４】
a)配列番号89を含むポリペプチド、
b)配列番号50によりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドに特異的な少なくとも1種の抗体の、前立腺癌細胞、乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、腎臓癌細胞、メラノーマ由来の細胞、白血病細胞、中枢神経系の癌由来の細胞およびこれらの組合せからなる群から選択される癌細胞の同定、検出のための、または成長抑制のための使用。
【請求項１２５】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドと特異的に結合できる抗体の、癌の治療における使用。
【請求項１２６】
a)配列番号51から89または170のいずれか1つを含むポリペプチド、
b)請求項1に記載のポリヌクレオチド配列のいずれか1つによりコードされるポリペプチド、
c)a)またはb)のいずれか1つの断片、
d)a)またはb)のいずれか1つの誘導体、および
e)a)またはb)のいずれか1つの類似体
からなる群から選択されるポリペプチドの抑制因子の、癌の治療における使用。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３３】
【図３４】
【図３６】
【図３７】
【図３８】
【図４０】
【図４２】
【図４３】
【図４６】
【図４７】
【図４９】
【図５０】
【図５３】
【図５６】
【図５７】
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【図５９】
【図６０】
【図６１】
【図６２】
【図６３】
【図６４】
【図６５】
【図６６】
【図６７】
【図６８】
【図６９】
【図７０】
【図７１】
【図７２】
【図７３】
【図７４】
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【図７６】
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【図７９】
【図８０】
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【図９０】
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【図９３】
【図９４】
【図９５】
【図９６】
【図９７】
【図９８】
【図９９】
【図１００】
【図１０１】
【図１０２】
【図１０３】
【図１０４】
【図１０５】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図３２】
【図３５】
【図３９】
【図４１】
【図４４】
【図４５】
【図４８】
【図５１】
【図５２】
【図５４】
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【図４】
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【図１０２】
【図１０３】
【図１０４】
【図１０５】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図３２】
【図３５】
【図３９】
【図４１】
【図４４】
【図４５】
【図４８】
【図５１】
【図５２】
【図５４】
【図５５Ａ】
【図５５Ｂ】
【公表番号】特表２００９−５４０８０３（Ｐ２００９−５４０８０３Ａ）
【公表日】平成２１年１１月２６日（２００９．１１．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−５１５６８３（Ｐ２００９−５１５６８３）
【出願日】平成１９年６月２２日（２００７．６．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＣＡ２００７／００１１３４
【国際公開番号】ＷＯ２００７／１４７２６５
【国際公開日】平成１９年１２月２７日（２００７．１２．２７）
【出願人】（５０７１９６４９１）アレシア・バイオセラピューティクス・インコーポレーテッド (7)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年１１月２６日（２００９．１１．２６）
【国際特許分類】
【出願日】平成１９年６月２２日（２００７．６．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＣＡ２００７／００１１３４
【国際公開番号】ＷＯ２００７／１４７２６５
【国際公開日】平成１９年１２月２７日（２００７．１２．２７）
【出願人】（５０７１９６４９１）アレシア・バイオセラピューティクス・インコーポレーテッド (7)
【Ｆターム（参考）】
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