本発明は、24例の膵臓腫瘍において改変された遺伝子を解析することによる、膵癌の病因に対する新しい洞察に関する。第1に、本発明者らは、これらの腫瘍に由来するDNA中の20,583個のタンパク質コード遺伝子に相当する、23,781個の転写物の配列を決定した。第2に、本発明者らは、各試料において100万個の一塩基多型を検索するマイクロアレイを用いて、ホモ接合性欠失および増幅を探索した。第3に、本発明者らは、SAGE技術および次世代の合成による配列決定技術を用いて、同じ試料のトランスクリプトームを解析した。本発明者らは、膵癌が平均63個の遺伝的改変を含み、その内の49個が点変異であり、8個がホモ接合性欠失であり、6個が増幅であることを発見した。さらなる解析により、試料の70％〜100％においてそれぞれ遺伝的に改変されている12個の調節プロセスまたは経路からなる中心的セットが明らかになった。このデータから、経路のこの中心的セットの調節不全が、膵臓腫瘍形成の主要な特徴の原因であることが示唆される。 （もっと読む）

【課題】２４Ｐ４Ｃ１２を発現する種々のガン、特に前立腺癌の管理において有用な診断および治療方法および組成物を提供する。
【解決手段】複数の特定の配列からなるポリヌクレオチド、ヌクレオチド残基番号６〜ヌクレオチド残基番号２１３８までの、特定の配列で示される配列を有するポリヌクレオチドまたは２４Ｐ４Ｃ１２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであって、該ポリペプチド配列が、アメリカンタイプカルチャーコレクションにそれぞれ受託番号２０７１２９および２０７０８４として寄託されたｐ２４Ｐ４Ｃ１２−ＧＴＥ５またはｐ２４Ｐ４Ｃ１２−ＧＴＥ９と称されるプラスミドに含まれるｃＤＮＡによりコードされる、ポリヌクレオチドからなる。 （もっと読む）

組換えクローンが誘導物質の存在下で蛍光を示すか、または色を示すことを特徴とする、ベクターのマルチクローニングサイトの上流に終止コドンを有するレポーター遺伝子を含む修飾されたベクター。修飾されたベクターを含む組換えクローンであって、興味ある遺伝子と関連する終止コドンの適当なサプレッサー株において蛍光または色を示す組換えクローンの同定および選択のための方法。興味ある遺伝子および修飾されたベクターを含む組換えクローンの製造方法であって、レポーター遺伝子で使用される終止コドンと異なる終止コドンを含む特定のプライマーを使用して、興味ある遺伝子を増幅し；修飾されたベクターに増幅された興味ある遺伝子をクローニングし、クローン化された修飾されたベクターにて終止コドンサプレッサー宿主細胞を形質転換することを含み、該終止コドンサプレッサー宿主細胞は興味ある遺伝子で使用される終止コドンに対して特異的であり、該組換えクローンは使用されるレポーター遺伝子に依存して蛍光または色のいずれかを示す方法。 （もっと読む）

本開示の各種実施形態は、一般に、標的核酸(DNA、RNA、cDNAなどの)分子を配列決定するための分子生物学的プロトコール、装置、および試薬に関する。
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【課題】被検試料における核酸の分離・精製等の前処理を必要とせず、簡易に高感度で検出し得る特定遺伝子、具体的には、特定ウイルスまたは特定微生物の検出方法を提供することである。
【解決手段】表面処理された不溶性担体の上にキャプチャーＤＮＡ鎖を固定化させてチューブ状のＤＮＡ固定化担体を作製する第１工程と、被検試料のなかで、被検試料から微生物由来遺伝子またはウイルス由来遺伝子を遊離して、遺伝子溶解溶液を作製する第２工程と、ＤＮＡ固定化担体の上に遺伝子溶解溶液を添加し、キャプチャーＤＮＡ鎖と遺伝子溶解溶液中のＤＮＡ鎖またはＲＮＡ鎖とをハイブリダイズさせて、ＤＮＡ鎖断片またはＲＮＡ鎖断片を分離する第３工程と、ＤＮＡ固定化担体に対して直接、ＤＮＡ鎖断片またはＲＮＡ鎖断片を増幅する第４工程とを備える特定遺伝子の検出方法に関する。 （もっと読む）

被験者において潰瘍性大腸炎などの胃腸関連疾患に対する標的治療の適合性を評価するための方法は、試料中の２０個又は５個のメンバー遺伝子パネルの１つ以上の遺伝子の発現の存在、欠如、及び／又は規模を評価する。本方法は、患者に対してかかる治療を開始する前に、標的となる治療法の有効性の同定を可能にする。
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【課題】従来、科学的な土壌の診断方法としては、土壌中の陽イオン交換容量やリン酸吸収係数、ｐＨ、養分含量などを分析する化学的診断方法や、土壌硬度や孔げき率、水分保持能力などを分析する物理的診断方法などがあるが、これらの診断方法は、土壌の性質を一面的に評価するに限られ、より多面的に診断する為には複数の土壌診断方法を併用して行う必要があった。そこで、診断対象の土壌中に生息する微生物を利用して生物学的方法による土壌の診断方法を提供する。
【解決手段】被測定土壌の懸濁液を微生物サンプルとして生成するサンプル生成ステップと、生成した微生物サンプルである懸濁液を少なくとも一部は微生物種によって消費速度が異なる複数の栄養源に滴下する滴下ステップと、滴下後、微生物による各栄養源の累積消費量を観察する観察ステップからなる土壌の作物育成度数測定を行う。 （もっと読む）

ＨＣＶ−１ａに感染した患者のインターフェロン処置に対する応答を予測するための方法。本発明の一局面において、本発明は、ＨＣＶ−１ａに感染した患者を、インターフェロンベースの処置で治療するための方法を包含する。上記方法は、ａ）上記患者の部分的もしくは完全なＨＣＶ ＮＳ５Ａ遺伝子を分析する工程；およびｂ）上記インターフェロンベースの処置に対する陽性応答の可能性を推定するための基準を決定する工程であって、上記基準は、以下の要素：ｉ）標準的ＮＳ５Ａアミノ酸配列と比較した場合、上記患者のＨＣＶ ＮＳ５Ａアミノ酸配列のインターフェロン感受性決定領域（ＩＳＤＲ）における変化の数；およびｉｉ）上記患者のＨＣＶ ＮＳ５Ａアミノ酸配列の２２６位におけるアミノ酸残基の配列、のうちの１つ以上を含む、工程を包含する。 （もっと読む）

【課題】差次的に発現される遺伝子を用いる、非小細胞肺癌の検出のための方法を提供する。
【解決手段】対象由来の生物試料における非小細胞肺癌関連遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、対象における非小細胞肺癌または非小細胞肺癌を発症する素因の診断方法からなり、該レベルの、該遺伝子の正常対照レベルと比較した増加または低下により、対象が非小細胞肺癌に罹患していること、または非小細胞肺癌を発症するリスクを有することが示される方法からなる。 （もっと読む）

【課題】粒子（例えば、細胞、ウイルス、オルガネラ、ビーズおよび／または小胞）の微小流体操作および／または分析のための新規な方法を提供する。
【解決手段】細胞および／またはビーズの様な粒子の、微小流体操作および／または検出のための装置、方法およびキットを備える。細胞、ウイルス、オルガネラ、ビーズ、および／または小胞のような粒子の微小流体操作および／または分析のための装置、方法およびキットを備え、これらの操作および分析を実行するための微小流体メカニズム。これらのメカニズムは、粒子のコントロールされたインプット、移動／配置、保持／局在化、処理、測定、放出、および／またはアウトプットを可能にする。さらに、これらのメカニズムは、システム中で任意の適切な順序で組み合わされ得、任意の適切な回数利用される。 （もっと読む）

【課題】
コンタミネーションを防止することができる増幅された生体高分子の検査方法の提供すること。
【解決手段】
本発明にかかる生体高分子検査装置は、標的生体高分子及び試薬をカプセル皮膜で密封しカプセルを成形するカプセル成形手段と、前記カプセルを搬送する搬送手段と、前記標的生体高分子を前記カプセルに内包した状態で増幅する増幅反応手段と、増幅された前記標的生体高分子を前記カプセルに内包した状態で検出する検出手段とを備えたことを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】精神遅滞を伴う多発性奇形症候群の疾患について、ヒト染色体の増幅あるいは欠失の有無を解析しその原因を明らかにし、本疾患の判別法を提供する。
【解決手段】ヒト染色体の10q24.31-10q25.1の領域のヘミ接合体欠失を検出することにより、精神遅滞を伴う多発性奇形症候群を判別する方法。好適には、当該10q24.31-10q25.1の領域の一部を含む核酸と検体核酸とのハイブリダイゼーションにより、当該染色体領域のヘミ接合体欠失に基づいて発生するシグナルを検出することにより行われる。 （もっと読む）

【課題】1つまたは複数の相同蛋白質／（ポリ）ペプチドのコレクションをコードする合成DNA配列、ならびにこれらのDNA配列のライブラリーを作製および適用する方法を提供する。
【解決手段】ヒトのゲノム中にコードされる抗体の構造的レパートリーをカバーする合成コンセンサス配列を使用して、ヒト由来の抗体遺伝子ライブラリーを調製する。さらに高度に多様化した抗体ライブラリーの普遍的フレームワークとしての、単一のコンセンサス抗体遺伝子を使用する。 （もっと読む）

【課題】ハイスループット、かつ、目的の細胞を確実に選別することができる技術を提供する。
【解決手段】特定分子を発現する真核細胞を分離する細胞ピッキングシステムであって、前記真核細胞は前記特定分子と結合可能な結合分子により複合体を形成し、この複合体の形成に基づき特定分子を発現する真核細胞が検出装置により検出され、検出された真核細胞が検出装置と連動したマニピュレータにより自動的に回収されることを特徴とする細胞ピッキングシステム。 （もっと読む）

本発明は、（ｉ）デオキシリボヌクレオシドキナーゼ依存性薬を用いて患者試料若しくは細胞株又はその一部分を処理する工程；（ｉｉ）工程（ｉ）由来の患者試料又は細胞株の細胞を溶解する工程；（ｉｉｉ）必要に応じて、工程（ｉｉ）由来の細胞溶解物の一部分とデオキシリボヌクレオシドキナーゼをコードする遺伝子を組み込んだ生物発光レポーター細菌とを混合する工程；（ｉｖ）（ｉｉ）由来の細胞溶解物の一部分と、デオキシリボヌクレオシドキナーゼをコードする遺伝子を組み込んだ生物発光レポーター細菌、及びデオキシリボヌクレオシドキナーゼ転写プロモーターとを混合する工程；（ｖ）工程（ｉｉ）由来の細胞溶解物の一部分と、デオキシリボヌクレオシドキナーゼをコードする遺伝子を組み込んだ生物発光レポーター細菌、デオキシリボヌクレオシドキナーゼ転写プロモーター、及び脱リン酸化剤とを混合する工程；並びに（ｖｉ）工程（ｉｉｉ）〜工程（ｖ）由来の混合物の各々の生物発光を測定する工程（ここで、該混合物の各々の生物発光の比較レベルは、前記薬に対する耐性又は感受性の尺度をもたらす。）を含む、デオキシリボヌクレオシドキナーゼ依存性薬に対する細胞株又は患者試料の耐性又は感受性を決定するインビトロの方法を提供する。

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【課題】目的細胞を回収用の容器に移し変えることなく、目的細胞以外の細胞を正確かつ迅速に基板上から排除し、目的細胞のみを基板上に確実に残すことができる、目的細胞の取得方法を提供すること。
【解決手段】細胞培養液を保持する親水性領域と、該親水性領域の周縁部を包囲し、細胞培養液の拡散を防止する撥水性領域とを備えた基板上において、細胞を培養液中で培養し、細胞を基板上に接着させる第一の工程と、基板上の細胞を観察し、目的細胞以外の細胞を基板上から排除し、これにより目的細胞のみを基板上に残す第二の工程とを含む目的細胞の取得方法。 （もっと読む）

本発明は、所望の特徴を有するポリペプチドをインビトロで特定するために有用な方法および組成物を提供する。

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【課題】簡便にＤＮＡを定量又は検出する方法を提供する。
【解決手段】検体中に含まれる目的とするＤＮＡ領域を有するＤＮＡを定量又は検出する方法であって、（１）目的とするＤＮＡ領域を有するＤＮＡを検体中から取得する第一工程、（２）第一工程で取得した目的とするＤＮＡ領域を有するＤＮＡをＤＮＡメチル化酵素で処理する第二工程、（３）第二工程で取得したＤＮＡメチル化酵素で処理された目的とするＤＮＡ領域を有するＤＮＡから、目的とするＤＮＡ領域を有する一本鎖メチル化ＤＮＡを取得し、該一本鎖メチル化ＤＮＡに検出オリゴヌクレオチドを結合させて被検ＤＮＡ複合体を取得する第三工程、（４）第三工程で取得した被検ＤＮＡ複合体に固定化メチル化ＤＮＡ抗体を結合させて検出複合体を取得する第四工程等を有することを特徴とする方法。 （もっと読む）

【課題】機能性生体分子が強化された生体分子ライブラリーを作製する方法を提供する。
【解決手段】組換えポリペプチド、および／または、核酸の中へより効率的に多様性を設計するための方法と装置を提供する。例えば、アミノ酸配列、またはヌクレオチド配列中の潜在的交叉部位を選択、および／または、評価する様々な方法、ならびに得られたキメラ産物配列を提供する。これらの方法には、例えば、組換えに用いるための配列および交叉部位の選択および評価における、構造的、機能的、および／または、統計的なデータの考慮が含まれる。 （もっと読む）

【課題】
本発明は、食中毒原因菌として重要なビブリオを簡易かつ正確に検出することができるビブリオ検出用培地を提供する。
【解決手段】
本発明は、培地中にポリペプチド系抗生物質を含有させることにより、ビブリオ・アルギノリティカスの生育のみを選択的に抑制し、かつ腸炎ビブリオ、ビブリオ・コレラ、ビブリオ・バルニフィカスの３種を同時に検出することができるビブリオ検出用培地。 （もっと読む）