分泌タンパク質ファミリー
本発明は、ファミリーのメンバーとして、上皮成長因子(EGF)フォールド含有ドメインを含み、長さが125〜153アミノ酸であって、8つの保存されたシステイン残基を含む分泌タンパク質として本発明で同定された新規なタンパク質INSP113、INSP114、INSP115、INSP116及びINSP117が挙げられる、SECFAM1ファミリーと名付けられた新規な分泌タンパク質のファミリーに関しており、また疾患の診断、予防及び治療における前記タンパク質及びそのコード遺伝子由来の核酸配列の使用に関する。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
SECFAM1ファミリーのメンバーの同定方法であって、
翻訳された核酸配列又はポリペプチド配列のデータベースを検索して、以下の配列プロファイルにマッチングするポリペプチドを同定することを含む前記方法:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3
(ここで、NCBIが指定するデフォルトパラメーター[Blosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1]を用いて、前記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、SECFAM1ファミリーのメンバーは10-2以下のE-valueを有する)。
【請求項2】
E-valueが10-5以下、10-10以下、10-50以下、最も好ましくは10-70以下である、請求項1記載の方法。
【請求項3】
翻訳された核酸配列のデータベースが、cDNA、EST、mRNA、全体的ゲノム又は部分的ゲノムのデータベースから派生する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項4】
データベースがESTデータベースである、請求項1〜3のいずれか1項記載の方法。
【請求項5】
データベースが、ヒト配列データベースである、請求項1〜4のいずれか1項記載の方法。
【請求項6】
以下の(i)〜(iii)のいずれかの単離ポリペプチド:
(i)NCBIが指定するBlosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1を有するデフォルトパラメーターを用いて、下記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、10-2以下のE-valueを有するポリペプチド配列を含む単離ポリペプチド:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項7】
NCBIが指定するBlosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1を有するデフォルトパラメーターを用いて、下記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、10-2以下のE-valueを有するポリペプチドからなる、請求項6記載のポリペプチド。
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3
【請求項8】
ポリペプチドが、10-2の最大しきい値E-value、より好ましくは10-5以下、10-10以下、10-50以下の最小しきい値E-value、最も好ましくは10-70以下の最小しきい値E-valueを有する、請求項6又は7記載のポリペプチド。
【請求項9】
以下の(i)〜(iii)のいずれかの単離ポリペプチド:
(i)コンセンサスアミノ酸配列
G-T-C-E-[VI]-[VI]-[AT]-[AVL]-[HD]-R-[CD]-[CS]-[NS]-[KRQ]-[NP]-[RK]-[IR]-[ET]-[EI]-[RA]-[SR]-Q-T-[VA]-[KR]-C-[SA]-C-[LFR]-[PSK]-G-[KQ]-[VI]-A-G-T-T-R-[NA]-[RQLAK]-P-[SA]-C-V-[DE]-A-[SAR]-I-[VI]-[IELKR]-[WGQET]-[KR]-[WQ]-W-C-[EHNQD]-M-[ENQL]-P-C-[LV]-[EVLP]-G-E-[DEG]-C-[KRD]-[TVL]-L-[PI]-[DN]-[NYSLR]-[STK]-G-W-[MST]-C-[ASIT]-[TSRQ]-P(0,1)-G-[NHG]-[KR]-[IV]-K-T-T
を満足するポリペプチドを含む単離ポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項10】
コンセンサスアミノ酸配列
G-T-C-E-[VI]-[VI]-[AT]-[AVL]-[HD]-R-[CD]-[CS]-[NS]-[KRQ]-[NP]-[RK]-[IR]-[ET]-[EI]-[RA]-[SR]-Q-T-[VA]-[KR]-C-[SA]-C-[LFR]-[PSK]-G-[KQ]-[VI]-A-G-T-T-R-[NA]-[RQLAK]-P-[SA]-C-V-[DE]-A-[SAR]-I-[VI]-[IELKR]-[WGQET]-[KR]-[WQ]-W-C-[EHNQD]-M-[ENQL]-P-C-[LV]-[EVLP]-G-E-[DEG]-C-[KRD]-[TVL]-L-[PI]-[DN]-[NYSLR]-[STK]-G-W-[MST]-C-[ASIT]-[TSRQ]-P(0,1)-G-[NHG]-[KR]-[IV]-K-T-T
を満足するポリペプチドから成る請求項9記載の単離ポリペプチド。
【請求項11】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項12】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項11記載のポリペプチド:
(i)配列番号26及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項13】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項11又は12記載のポリペプチド:
(i)配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項14】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号2、配列番号4、配列番号37及び/又は配列番号39で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項15】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項14記載のポリペプチド:
(i)配列番号2、配列番号4、配列番号37及び/又は配列番号39で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項16】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号6、配列番号8、配列番号41、配列番号43、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項17】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項16記載のポリペプチド:
(i)配列番号6、配列番号8、配列番号41、配列番号43、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項18】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号10、配列番号12、配列番号45及び/又は配列番号47で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項19】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項18記載のポリペプチド:
(i)配列番号10、配列番号12、配列番号45及び/又は配列番号47で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項20】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号14、配列番号16、配列番号49及び/又は配列番号51で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項21】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項20記載のポリペプチド:
(i)配列番号14、配列番号16、配列番号49及び/又は配列番号51で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか、又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項22】
請求項6〜21のいずれか1項の(iii)に記載の機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列に相同的であり且つEGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであることを特徴とする、前記ポリペプチド。
【請求項23】
請求項6〜22のいずれか1項に記載のフラグメント又は機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列と80%を超える配列同一性を有するか、又はそれらの活性なフラグメントと好ましくは85%、90%、95%、98%若しくは99%の配列同一性を有する、前記ポリペプチド。
【請求項24】
請求項6〜23のいずれか1項に記載の機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドと有意な構造相同性を示す、前記ポリペプチド。
【請求項25】
請求項6〜21及び請求項23のいずれか1項に記載のフラグメントであるポリペプチドであって、
請求項6〜21のいずれか1項に記載の(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有し、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列に由来する7以上のアミノ酸残基から成る、前記ポリペプチド。
【請求項26】
凝固因子Xと同様の生物学的活性を有する、請求項1〜25のいずれか1項に記載のポリペプチド。
【請求項27】
請求項1〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードしている、精製核酸分子。
【請求項28】
配列番号1、配列番号3、配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11、配列番号13、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、配列番号23、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号36、配列番号38、配列番号40、配列番号42、配列番号44、配列番号46、配列番号48、配列番号50、配列番号52及び配列番号54で示される核酸配列を含むか、又は前記核酸配列の余剰的等価物若しくはフラグメントである、請求項27記載の精製核酸分子。
【請求項29】
配列番号1、配列番号3、配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11、配列番号13、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、配列番号23、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号36、配列番号38、配列番号40、配列番号42、配列番号44、配列番号46、配列番号48、配列番号50、配列番号52及び/又は配列番号54で示される核酸配列から成るか、又は前記核酸配列の余剰的等価物若しくはフラグメントである、請求項27記載の精製核酸分子。
【請求項30】
高ストリンジェンシー条件下で、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子とハイブリダイズする、精製核酸分子。
【請求項31】
請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項32】
請求項31に記載のベクターで形質転換されている、宿主細胞。
【請求項33】
EGFドメイン含有タンパク質ファミリーである請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する、リガンド。
【請求項34】
抗体である、請求項33記載のリガンド。
【請求項35】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの発現レベル又は活性レベルを増加又は減少させる化合物。
【請求項36】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドに、前記ポリペプチドの生物学的作用のいずれをも誘導することなく結合する、請求項35記載の化合物。
【請求項37】
天然の又は改変されている、基質、リガンド、酵素、受容体、構造的模倣体又は機能的模倣体である、請求項36記載の化合物。
【請求項38】
疾患の治療又は診断に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、又は請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物。
【請求項39】
患者の疾患を診断する方法であって、
前記患者由来の組織において、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする天然遺伝子の発現レベルを評価するか又は請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの活性を評価すること;及び
前記発現又は活性のレベルをコントロールレベルと比較すること;
を含み、このとき前記コントロールレベルと異なるレベルが疾患を示唆している、前記方法。
【請求項40】
in vitroで実施される、請求項39記載の方法。
【請求項41】
(a)請求項33又は34記載のリガンドを、リガンド-ポリペプチド複合体の形成に適する条件下で、生物学的サンプルと接触させる工程;及び
(b)前記複合体を検出する工程;
を含む請求項39又は40記載の方法。
【請求項42】
(a)患者由来の組織サンプルと核酸プローブとを、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子と前記プローブとの間でハイブリッド複合体の形成を可能にするストリンジェントな条件下で接触させる工程;
(b)コントロールサンプルを、工程(a)で用いるのと同じ条件下で前記プローブと接触させる工程;及び
(c)前記サンプルのハイブリッド複合体の存在を検出する工程;
を含み、このときコントロールサンプルのハイブリッド複合体のレベルと異なる患者サンプルのハイブリッド複合体のレベルの検出が疾患を示唆している、請求項39又は40記載の方法。
【請求項43】
(a)患者の組織由来の核酸サンプルと核酸プライマーとを、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子と前記プライマーとの間でハイブリッド複合体の形成を可能にするストリンジェントな条件下で接触させる工程;
(b)コントロールサンプルを、工程(a)で用いられるのと同じ条件下で前記プライマーと接触させる工程;
(c)前記サンプルの核酸を増幅させる工程;及び、
(d)患者サンプル及びコントロールサンプルの両サンプルから、増幅核酸レベルを検出する工程;
を含み、このときコントロールサンプルの増幅核酸レベルと有意に異なる患者サンプルの増幅核酸レベルの検出が疾患を示唆している、請求項39又は40記載の方法。
【請求項44】
(a)疾患について検査される患者から、組織サンプルを入手する工程;
(b)前記組織サンプルから、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を単離する工程;及び、
(c)疾患に附随する変異の存在を、前記疾患の指標として前記核酸分子中で検出することによって、前記疾患について患者を診断する工程;
を含む請求項39又は40記載の方法。
【請求項45】
核酸分子を増幅させて増幅産物を生成すること及び前記増幅産物中の変異の有無を検出することをさらに含む、請求項44記載の方法。
【請求項46】
核酸分子をその核酸分子にハイブリダイズする核酸プローブとストリンジェントな条件下で接触させて、前記核酸プローブ鎖の疾患に附随する変異に対応する任意の部分でハイブリダイズしていない部分を有するハイブリッド二本鎖分子を形成させること;及び
疾患に附随する変異の有無の指標として、前記プローブ鎖のハイブリダイズしていない部分の有無を検出すること;
によって、前記患者における変異の有無を検出する、請求項44又は45記載の方法。
【請求項47】
疾患としては、不妊症を含む生殖に関する障害;新生物、メラノーマ、肺腫瘍、結腸直腸腫瘍、乳房腫瘍、膵臓腫瘍、頭頚部腫瘍及び他の固形腫瘍を含む細胞増殖性疾患;白血病、非ホジキンリンパ腫、白血球減少症、血小板減少症、脈管形成障害、カポジ肉腫のような骨髄増殖性疾患;アレルギー、炎症性腸疾患、関節炎、乾癬及び呼吸器管炎症、喘息、及び臓器移植拒絶反応を含む自己免疫/炎症性疾患;高血圧症、浮腫、狭心症、アテローム性動脈硬化症、血栓症、敗血症、ショック、再潅流傷害、及び虚血症を含む心臓血管障害;中枢神経系疾患、アルツハイマー病、脳損傷、筋萎縮性側索硬化症、及び疼痛を含む神経障害;発達障害;糖尿病、骨粗しょう症、及び肥満症を含む代謝障害;AIDS及び腎疾患;ウイルス感染症、細菌感染症、真菌感染症及び寄生虫感染症を含む感染症;
が挙げられるが、これらに限定されるものではない、請求項39〜46のいずれか1項に記載の方法。
【請求項48】
疾患が、リンパ球抗原が関与する疾患である、請求項39〜46のいずれか1項に記載の方法。
【請求項49】
EGFドメイン含有タンパク質としての、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項50】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、又は請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物を含む、医薬組成物。
【請求項51】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を含む、ワクチン組成物。
【請求項52】
不妊症を含む繁殖障害;新生物、メラノーマ、肺腫瘍、結腸直腸腫瘍、乳房腫瘍、膵臓腫瘍、頭頚部腫瘍及び他の固形腫瘍を含む細胞増殖性疾患;白血病、非ホジキンリンパ腫、白血球減少症、血小板減少症、脈管形成障害、カポジ肉腫のような骨髄増殖性疾患;アレルギー、炎症性腸疾患、関節炎、乾癬及び呼吸器管炎症、喘息、及び臓器移植拒絶反応を含む自己免疫/炎症性疾患;高血圧症、浮腫、狭心症、アテローム性動脈硬化症、血栓症、敗血症、ショック、再潅流傷害、及び虚血症を含む心臓血管障害;中枢神経系疾患、アルツハイマー病、脳損傷、筋萎縮性側索硬化症、及び疼痛を含む神経障害;発達障害;糖尿病、骨粗しょう症、及び肥満症を含む代謝障害;AIDS及び腎疾患;ウイルス感染症、細菌感染症、真菌感染症及び寄生虫感染症を含む感染症及び他の病的状態の治療用医薬品の製造に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項53】
リンパ球抗原が関与する疾患の治療用医薬品の製造に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項54】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物を患者に投与することを含む、患者の疾患を治療する方法。
【請求項55】
罹病患者における天然遺伝子の発現又はポリペプチドの活性が健常な対象者における発現又は活性のレベルと比較した場合に低い疾患に対し、前記患者に投与されるポリペプチド、核酸分子、ベクター、リガンド、化合物又は組成物がアゴニストである、請求項54記載の方法。
【請求項56】
罹病患者における天然遺伝子の発現又はポリペプチドの活性が健常な対象者における発現又は活性のレベルと比較した場合に高い疾患に対し、前記患者に投与されるポリペプチド、核酸分子、ベクター、リガンド、化合物又は組成物がアンタゴニストである、請求項54記載の方法。
【請求項57】
患者において疾患の治療をモニターする方法であって、
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの発現若しくは活性のレベル又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子の発現レベルを、ある期間にわたって前記患者に由来する組織でモニターすることを含み、
前記期間にわたる発現又は活性のレベルがコントロールレベルに対して変化することは、前記疾患の後退の指標である、前記方法。
【請求項58】
疾患の治療及び/又は診断に有効な化合物を同定する方法であって、
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を、前記ポリペプチド又は前記核酸分子に対し結合親和性を有すると疑われる1又は2以上の化合物と接触させること;及び
前記ポリペプチド又は前記核酸分子と特異的に結合する化合物を選択すること;
を含む前記方法。
【請求項59】
ストリンジェントな条件下で、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子とハイブリダイズする核酸プローブを含む、第1の容器;
前記核酸分子を増幅するのに有用なプライマーを含む、第2の容器;及び、
疾患の診断を容易にするための、前記プローブ及びプライマーの使用説明書;
を含む、疾患の診断に有用なキット。
【請求項60】
ハイブリダイズしないRNAを消化するための薬剤を保有する第3の容器をさらに含む、請求項59記載のキット。
【請求項61】
核酸分子のアレイを含むキットであって、
前記核酸分子の少なくとも1つが請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子である前記キット。
【請求項62】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドと結合する、1又は2以上の抗体;及び
前記抗体と前記ポリペプチドとの間の結合反応を検出するのに有用な試薬;
を含むキット。
【請求項63】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドを、より高いレベル若しくはより低いレベルで発現するように又は発現しないように形質転換されている、非ヒトトランスジェニック動物又は非ヒトノックアウト動物。
【請求項64】
請求項63記載の非ヒトトランスジェニック動物を候補化合物と接触させること、及び前記動物の疾患に対する前記化合物の作用を決定することによる、疾患の治療に有効な化合物をスクリーニングする方法。
【請求項65】
IVFで使用するため又は避妊薬として使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項66】
避妊薬の製造で使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項67】
関節炎、リウマチ性関節炎(RA)、乾癬性関節炎、変形性関節症、全身性エリテマトーデス(SLE)、全身性硬化症、強皮症、多発性筋炎、糸球体腎炎、線維症、肺線維症及び肺炎、アレルギー疾患又は過敏性疾患、皮膚炎、喘息、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、炎症性腸疾患(IBD)、クローン病、潰瘍性大腸炎、多発性硬化症、敗血症性ショック、HIV感染、移植拒絶反応、創傷治癒、転移、子宮内膜症、肝炎、肝臓線維症、癌、無痛覚症、並びに、アテローム性動脈硬化症、クローン病、アトピー性の皮膚炎及び乾癬のような炎症性皮膚疾患、シェーグレン症候群及び/又は重症筋無力症に関連している脈管炎症の治療用医薬品の製造で使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項1】
SECFAM1ファミリーのメンバーの同定方法であって、
翻訳された核酸配列又はポリペプチド配列のデータベースを検索して、以下の配列プロファイルにマッチングするポリペプチドを同定することを含む前記方法:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3
(ここで、NCBIが指定するデフォルトパラメーター[Blosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1]を用いて、前記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、SECFAM1ファミリーのメンバーは10-2以下のE-valueを有する)。
【請求項2】
E-valueが10-5以下、10-10以下、10-50以下、最も好ましくは10-70以下である、請求項1記載の方法。
【請求項3】
翻訳された核酸配列のデータベースが、cDNA、EST、mRNA、全体的ゲノム又は部分的ゲノムのデータベースから派生する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項4】
データベースがESTデータベースである、請求項1〜3のいずれか1項記載の方法。
【請求項5】
データベースが、ヒト配列データベースである、請求項1〜4のいずれか1項記載の方法。
【請求項6】
以下の(i)〜(iii)のいずれかの単離ポリペプチド:
(i)NCBIが指定するBlosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1を有するデフォルトパラメーターを用いて、下記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、10-2以下のE-valueを有するポリペプチド配列を含む単離ポリペプチド:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項7】
NCBIが指定するBlosum 62 マトリックス;ギャップオープンペナルティー=11及びギャップ伸長ペナルティー=1を有するデフォルトパラメーターを用いて、下記プロファイルを検索プログラムBLASTにクエリー配列として入力した場合、10-2以下のE-valueを有するポリペプチドからなる、請求項6記載のポリペプチド。
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
2 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -1
3 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 1
4 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -1
5 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 0
6 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -1
7 Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -1
8 K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 2
9 A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 0
10 T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -1
11 Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -1
12 G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -2
13 K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -2
14 L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -1
15 L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 2
16 I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 1
17 I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0
18 I 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 0
19 F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -1
20 I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 2
21 V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 0
22 T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 0
23 L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 1
24 W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -1
25 G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 0
26 K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -1
27 A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 1
28 V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 2
29 S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -1
30 S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -1
31 A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
32 N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 0
33 H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1
34 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -1
35 K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -2
36 A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -1
37 H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -2
38 H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1
39 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 2
40 R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
41 T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -1
42 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
43 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
44 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
45 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
46 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
47 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
48 A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 0
49 L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 1
50 H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3
51 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
52 C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2
53 C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -1
54 N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -3
55 K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
56 N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -3
57 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
58 I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 1
59 E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -1
60 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0
61 R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
62 S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
63 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
64 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
65 V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 4
66 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
67 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
68 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
69 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
70 F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -1
71 P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -2
72 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
73 Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2
74 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
75 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
76 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
77 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
78 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
79 R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3
80 A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
81 A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2
82 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
83 S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -1
84 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
85 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
86 D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
87 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0
88 S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -2
89 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 2
90 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
91 E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0
92 Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -2
93 K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
94 W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -3
95 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
96 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
97 H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -3
98 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 0
99 Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1
100 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2
101 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
102 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1
103 E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0
104 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
105 E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
106 E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3
107 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
108 K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
109 V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4
110 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0
111 P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0
112 D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3
113 R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1
114 K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2
115 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
116 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3
117 S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1
118 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1
119 S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0
120 S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2
121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3
122 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3
123 K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
124 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4
125 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2
126 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
127 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0
128 R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2
129 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5
130 T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1
131 H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3
【請求項8】
ポリペプチドが、10-2の最大しきい値E-value、より好ましくは10-5以下、10-10以下、10-50以下の最小しきい値E-value、最も好ましくは10-70以下の最小しきい値E-valueを有する、請求項6又は7記載のポリペプチド。
【請求項9】
以下の(i)〜(iii)のいずれかの単離ポリペプチド:
(i)コンセンサスアミノ酸配列
G-T-C-E-[VI]-[VI]-[AT]-[AVL]-[HD]-R-[CD]-[CS]-[NS]-[KRQ]-[NP]-[RK]-[IR]-[ET]-[EI]-[RA]-[SR]-Q-T-[VA]-[KR]-C-[SA]-C-[LFR]-[PSK]-G-[KQ]-[VI]-A-G-T-T-R-[NA]-[RQLAK]-P-[SA]-C-V-[DE]-A-[SAR]-I-[VI]-[IELKR]-[WGQET]-[KR]-[WQ]-W-C-[EHNQD]-M-[ENQL]-P-C-[LV]-[EVLP]-G-E-[DEG]-C-[KRD]-[TVL]-L-[PI]-[DN]-[NYSLR]-[STK]-G-W-[MST]-C-[ASIT]-[TSRQ]-P(0,1)-G-[NHG]-[KR]-[IV]-K-T-T
を満足するポリペプチドを含む単離ポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項10】
コンセンサスアミノ酸配列
G-T-C-E-[VI]-[VI]-[AT]-[AVL]-[HD]-R-[CD]-[CS]-[NS]-[KRQ]-[NP]-[RK]-[IR]-[ET]-[EI]-[RA]-[SR]-Q-T-[VA]-[KR]-C-[SA]-C-[LFR]-[PSK]-G-[KQ]-[VI]-A-G-T-T-R-[NA]-[RQLAK]-P-[SA]-C-V-[DE]-A-[SAR]-I-[VI]-[IELKR]-[WGQET]-[KR]-[WQ]-W-C-[EHNQD]-M-[ENQL]-P-C-[LV]-[EVLP]-G-E-[DEG]-C-[KRD]-[TVL]-L-[PI]-[DN]-[NYSLR]-[STK]-G-W-[MST]-C-[ASIT]-[TSRQ]-P(0,1)-G-[NHG]-[KR]-[IV]-K-T-T
を満足するポリペプチドから成る請求項9記載の単離ポリペプチド。
【請求項11】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項12】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項11記載のポリペプチド:
(i)配列番号26及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項13】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項11又は12記載のポリペプチド:
(i)配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28及び/又は配列番号30で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項14】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号2、配列番号4、配列番号37及び/又は配列番号39で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項15】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項14記載のポリペプチド:
(i)配列番号2、配列番号4、配列番号37及び/又は配列番号39で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項16】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号6、配列番号8、配列番号41、配列番号43、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項17】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項16記載のポリペプチド:
(i)配列番号6、配列番号8、配列番号41、配列番号43、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項18】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号10、配列番号12、配列番号45及び/又は配列番号47で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項19】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項18記載のポリペプチド:
(i)配列番号10、配列番号12、配列番号45及び/又は配列番号47で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項20】
以下の(i)〜(iii)のいずれかのポリペプチド:
(i)配列番号14、配列番号16、配列番号49及び/又は配列番号51で示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項21】
以下の(i)〜(iii)のいずれかである、請求項20記載のポリペプチド:
(i)配列番号14、配列番号16、配列番号49及び/又は配列番号51で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチド;
(ii)EGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであるか、又は(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する、(i)のフラグメント;又は
(iii)(i)又は(ii)の機能的等価物。
【請求項22】
請求項6〜21のいずれか1項の(iii)に記載の機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列に相同的であり且つEGFドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであることを特徴とする、前記ポリペプチド。
【請求項23】
請求項6〜22のいずれか1項に記載のフラグメント又は機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列と80%を超える配列同一性を有するか、又はそれらの活性なフラグメントと好ましくは85%、90%、95%、98%若しくは99%の配列同一性を有する、前記ポリペプチド。
【請求項24】
請求項6〜23のいずれか1項に記載の機能的等価物であるポリペプチドであって、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドと有意な構造相同性を示す、前記ポリペプチド。
【請求項25】
請求項6〜21及び請求項23のいずれか1項に記載のフラグメントであるポリペプチドであって、
請求項6〜21のいずれか1項に記載の(i)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有し、
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号37、配列番号39、配列番号41、配列番号43、配列番号45、配列番号47、配列番号49、配列番号51、配列番号53及び/又は配列番号55で示されるアミノ酸配列に由来する7以上のアミノ酸残基から成る、前記ポリペプチド。
【請求項26】
凝固因子Xと同様の生物学的活性を有する、請求項1〜25のいずれか1項に記載のポリペプチド。
【請求項27】
請求項1〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードしている、精製核酸分子。
【請求項28】
配列番号1、配列番号3、配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11、配列番号13、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、配列番号23、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号36、配列番号38、配列番号40、配列番号42、配列番号44、配列番号46、配列番号48、配列番号50、配列番号52及び配列番号54で示される核酸配列を含むか、又は前記核酸配列の余剰的等価物若しくはフラグメントである、請求項27記載の精製核酸分子。
【請求項29】
配列番号1、配列番号3、配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11、配列番号13、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、配列番号23、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号36、配列番号38、配列番号40、配列番号42、配列番号44、配列番号46、配列番号48、配列番号50、配列番号52及び/又は配列番号54で示される核酸配列から成るか、又は前記核酸配列の余剰的等価物若しくはフラグメントである、請求項27記載の精製核酸分子。
【請求項30】
高ストリンジェンシー条件下で、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子とハイブリダイズする、精製核酸分子。
【請求項31】
請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項32】
請求項31に記載のベクターで形質転換されている、宿主細胞。
【請求項33】
EGFドメイン含有タンパク質ファミリーである請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドに特異的に結合する、リガンド。
【請求項34】
抗体である、請求項33記載のリガンド。
【請求項35】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの発現レベル又は活性レベルを増加又は減少させる化合物。
【請求項36】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドに、前記ポリペプチドの生物学的作用のいずれをも誘導することなく結合する、請求項35記載の化合物。
【請求項37】
天然の又は改変されている、基質、リガンド、酵素、受容体、構造的模倣体又は機能的模倣体である、請求項36記載の化合物。
【請求項38】
疾患の治療又は診断に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、又は請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物。
【請求項39】
患者の疾患を診断する方法であって、
前記患者由来の組織において、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする天然遺伝子の発現レベルを評価するか又は請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの活性を評価すること;及び
前記発現又は活性のレベルをコントロールレベルと比較すること;
を含み、このとき前記コントロールレベルと異なるレベルが疾患を示唆している、前記方法。
【請求項40】
in vitroで実施される、請求項39記載の方法。
【請求項41】
(a)請求項33又は34記載のリガンドを、リガンド-ポリペプチド複合体の形成に適する条件下で、生物学的サンプルと接触させる工程;及び
(b)前記複合体を検出する工程;
を含む請求項39又は40記載の方法。
【請求項42】
(a)患者由来の組織サンプルと核酸プローブとを、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子と前記プローブとの間でハイブリッド複合体の形成を可能にするストリンジェントな条件下で接触させる工程;
(b)コントロールサンプルを、工程(a)で用いるのと同じ条件下で前記プローブと接触させる工程;及び
(c)前記サンプルのハイブリッド複合体の存在を検出する工程;
を含み、このときコントロールサンプルのハイブリッド複合体のレベルと異なる患者サンプルのハイブリッド複合体のレベルの検出が疾患を示唆している、請求項39又は40記載の方法。
【請求項43】
(a)患者の組織由来の核酸サンプルと核酸プライマーとを、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子と前記プライマーとの間でハイブリッド複合体の形成を可能にするストリンジェントな条件下で接触させる工程;
(b)コントロールサンプルを、工程(a)で用いられるのと同じ条件下で前記プライマーと接触させる工程;
(c)前記サンプルの核酸を増幅させる工程;及び、
(d)患者サンプル及びコントロールサンプルの両サンプルから、増幅核酸レベルを検出する工程;
を含み、このときコントロールサンプルの増幅核酸レベルと有意に異なる患者サンプルの増幅核酸レベルの検出が疾患を示唆している、請求項39又は40記載の方法。
【請求項44】
(a)疾患について検査される患者から、組織サンプルを入手する工程;
(b)前記組織サンプルから、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を単離する工程;及び、
(c)疾患に附随する変異の存在を、前記疾患の指標として前記核酸分子中で検出することによって、前記疾患について患者を診断する工程;
を含む請求項39又は40記載の方法。
【請求項45】
核酸分子を増幅させて増幅産物を生成すること及び前記増幅産物中の変異の有無を検出することをさらに含む、請求項44記載の方法。
【請求項46】
核酸分子をその核酸分子にハイブリダイズする核酸プローブとストリンジェントな条件下で接触させて、前記核酸プローブ鎖の疾患に附随する変異に対応する任意の部分でハイブリダイズしていない部分を有するハイブリッド二本鎖分子を形成させること;及び
疾患に附随する変異の有無の指標として、前記プローブ鎖のハイブリダイズしていない部分の有無を検出すること;
によって、前記患者における変異の有無を検出する、請求項44又は45記載の方法。
【請求項47】
疾患としては、不妊症を含む生殖に関する障害;新生物、メラノーマ、肺腫瘍、結腸直腸腫瘍、乳房腫瘍、膵臓腫瘍、頭頚部腫瘍及び他の固形腫瘍を含む細胞増殖性疾患;白血病、非ホジキンリンパ腫、白血球減少症、血小板減少症、脈管形成障害、カポジ肉腫のような骨髄増殖性疾患;アレルギー、炎症性腸疾患、関節炎、乾癬及び呼吸器管炎症、喘息、及び臓器移植拒絶反応を含む自己免疫/炎症性疾患;高血圧症、浮腫、狭心症、アテローム性動脈硬化症、血栓症、敗血症、ショック、再潅流傷害、及び虚血症を含む心臓血管障害;中枢神経系疾患、アルツハイマー病、脳損傷、筋萎縮性側索硬化症、及び疼痛を含む神経障害;発達障害;糖尿病、骨粗しょう症、及び肥満症を含む代謝障害;AIDS及び腎疾患;ウイルス感染症、細菌感染症、真菌感染症及び寄生虫感染症を含む感染症;
が挙げられるが、これらに限定されるものではない、請求項39〜46のいずれか1項に記載の方法。
【請求項48】
疾患が、リンパ球抗原が関与する疾患である、請求項39〜46のいずれか1項に記載の方法。
【請求項49】
EGFドメイン含有タンパク質としての、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項50】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、又は請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物を含む、医薬組成物。
【請求項51】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を含む、ワクチン組成物。
【請求項52】
不妊症を含む繁殖障害;新生物、メラノーマ、肺腫瘍、結腸直腸腫瘍、乳房腫瘍、膵臓腫瘍、頭頚部腫瘍及び他の固形腫瘍を含む細胞増殖性疾患;白血病、非ホジキンリンパ腫、白血球減少症、血小板減少症、脈管形成障害、カポジ肉腫のような骨髄増殖性疾患;アレルギー、炎症性腸疾患、関節炎、乾癬及び呼吸器管炎症、喘息、及び臓器移植拒絶反応を含む自己免疫/炎症性疾患;高血圧症、浮腫、狭心症、アテローム性動脈硬化症、血栓症、敗血症、ショック、再潅流傷害、及び虚血症を含む心臓血管障害;中枢神経系疾患、アルツハイマー病、脳損傷、筋萎縮性側索硬化症、及び疼痛を含む神経障害;発達障害;糖尿病、骨粗しょう症、及び肥満症を含む代謝障害;AIDS及び腎疾患;ウイルス感染症、細菌感染症、真菌感染症及び寄生虫感染症を含む感染症及び他の病的状態の治療用医薬品の製造に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項53】
リンパ球抗原が関与する疾患の治療用医薬品の製造に使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項54】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物、又は請求項50記載の医薬組成物を患者に投与することを含む、患者の疾患を治療する方法。
【請求項55】
罹病患者における天然遺伝子の発現又はポリペプチドの活性が健常な対象者における発現又は活性のレベルと比較した場合に低い疾患に対し、前記患者に投与されるポリペプチド、核酸分子、ベクター、リガンド、化合物又は組成物がアゴニストである、請求項54記載の方法。
【請求項56】
罹病患者における天然遺伝子の発現又はポリペプチドの活性が健常な対象者における発現又は活性のレベルと比較した場合に高い疾患に対し、前記患者に投与されるポリペプチド、核酸分子、ベクター、リガンド、化合物又は組成物がアンタゴニストである、請求項54記載の方法。
【請求項57】
患者において疾患の治療をモニターする方法であって、
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドの発現若しくは活性のレベル又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子の発現レベルを、ある期間にわたって前記患者に由来する組織でモニターすることを含み、
前記期間にわたる発現又は活性のレベルがコントロールレベルに対して変化することは、前記疾患の後退の指標である、前記方法。
【請求項58】
疾患の治療及び/又は診断に有効な化合物を同定する方法であって、
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド又は請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子を、前記ポリペプチド又は前記核酸分子に対し結合親和性を有すると疑われる1又は2以上の化合物と接触させること;及び
前記ポリペプチド又は前記核酸分子と特異的に結合する化合物を選択すること;
を含む前記方法。
【請求項59】
ストリンジェントな条件下で、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子とハイブリダイズする核酸プローブを含む、第1の容器;
前記核酸分子を増幅するのに有用なプライマーを含む、第2の容器;及び、
疾患の診断を容易にするための、前記プローブ及びプライマーの使用説明書;
を含む、疾患の診断に有用なキット。
【請求項60】
ハイブリダイズしないRNAを消化するための薬剤を保有する第3の容器をさらに含む、請求項59記載のキット。
【請求項61】
核酸分子のアレイを含むキットであって、
前記核酸分子の少なくとも1つが請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子である前記キット。
【請求項62】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドと結合する、1又は2以上の抗体;及び
前記抗体と前記ポリペプチドとの間の結合反応を検出するのに有用な試薬;
を含むキット。
【請求項63】
請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチドを、より高いレベル若しくはより低いレベルで発現するように又は発現しないように形質転換されている、非ヒトトランスジェニック動物又は非ヒトノックアウト動物。
【請求項64】
請求項63記載の非ヒトトランスジェニック動物を候補化合物と接触させること、及び前記動物の疾患に対する前記化合物の作用を決定することによる、疾患の治療に有効な化合物をスクリーニングする方法。
【請求項65】
IVFで使用するため又は避妊薬として使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項66】
避妊薬の製造で使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【請求項67】
関節炎、リウマチ性関節炎(RA)、乾癬性関節炎、変形性関節症、全身性エリテマトーデス(SLE)、全身性硬化症、強皮症、多発性筋炎、糸球体腎炎、線維症、肺線維症及び肺炎、アレルギー疾患又は過敏性疾患、皮膚炎、喘息、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、炎症性腸疾患(IBD)、クローン病、潰瘍性大腸炎、多発性硬化症、敗血症性ショック、HIV感染、移植拒絶反応、創傷治癒、転移、子宮内膜症、肝炎、肝臓線維症、癌、無痛覚症、並びに、アテローム性動脈硬化症、クローン病、アトピー性の皮膚炎及び乾癬のような炎症性皮膚疾患、シェーグレン症候群及び/又は重症筋無力症に関連している脈管炎症の治療用医薬品の製造で使用するための、請求項6〜26のいずれか1項に記載のポリペプチド、請求項27〜30のいずれか1項に記載の核酸分子、請求項31記載のベクター、請求項32記載の宿主細胞、請求項33若しくは34記載のリガンド、請求項35〜37のいずれか1項に記載の化合物又は請求項50記載の医薬組成物。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図14】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42】
【図43】
【図44】
【図45】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図61】
【図62】
【図63】
【図64】
【図65】
【図66】
【図67】
【図68】
【図69】
【図70】
【図71】
【図72】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図14】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42】
【図43】
【図44】
【図45】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図61】
【図62】
【図63】
【図64】
【図65】
【図66】
【図67】
【図68】
【図69】
【図70】
【図71】
【図72】
【公表番号】特表2007−527203(P2007−527203A)
【公表日】平成19年9月27日(2007.9.27)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2006−506003(P2006−506003)
【出願日】平成16年3月24日(2004.3.24)
【国際出願番号】PCT/GB2004/001248
【国際公開番号】WO2004/085469
【国際公開日】平成16年10月7日(2004.10.7)
【出願人】(504238862)アレス トレイディング ソシエテ アノニム (24)
【Fターム(参考)】
【公表日】平成19年9月27日(2007.9.27)
【国際特許分類】
【出願日】平成16年3月24日(2004.3.24)
【国際出願番号】PCT/GB2004/001248
【国際公開番号】WO2004/085469
【国際公開日】平成16年10月7日(2004.10.7)
【出願人】(504238862)アレス トレイディング ソシエテ アノニム (24)
【Fターム(参考)】
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