抗ＨＩＶ治療化合物を同定するための方法および組成物
カルボキシルエステルまたはホスホネートエステル基で置換された抗ＨＩＶ治療化合物を同定するための方法が提供される。このような化合物のライブラリーが、必要に応じて、新規酵素ＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼを使用してスクリーニングされる。ＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼに関連する組成物および方法がまた提供される。１つの実施形態において、以下：（ａ）非ヌクレオチドプロトタイプ化合物を同定する工程；（ｂ）該プロトタイプ化合物をホスホネート含有基で置換して、候補化合物を生成する工程；および（ｃ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程、を包含する、方法が提供される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
方法であって、以下：
（ａ）非ヌクレオチドプロトタイプ化合物を同定する工程；
（ｂ）該プロトタイプ化合物をホスホネート含有基で置換して、候補化合物を生成する工程；および
（ｃ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
方法であって、以下：
（ａ）少なくとも１つのエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート含有基を含む非ヌクレオチド候補化合物を選択する工程；および
（ｂ）該候補化合物の細胞内持続性またはそのエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート含有基のエステル化分解代謝産物を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の少なくとも１つの組織選択性が決定される、方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の少なくとも１つの細胞内滞在時間が、決定される、方法。
【請求項５】
ＨＩＶプロテアーゼに対する前記代謝産物の少なくとも１つの活性をさらに決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項６】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、カルボン酸である、方法。
【請求項７】
請求項１または２に記載の方法であって、前記候補化合物が、ＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項８】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプが、ＨＩＶに対して治療活性を有することが既に公知である、方法。
【請求項９】
複数の候補化合物の細胞内持続性を選択および決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項１０】
請求項１または２に記載の方法であって、候補化合物でない化合物が、少なくとも１つの候補化合物と並行して試験される、方法。
【請求項１１】
ＧＳ−７３２０エステルヒドロラーゼによって１つ以上の候補の切断を決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項１２】
請求項１または２に記載の方法であって、前記候補が、アミノ酸のカルボキシルがエステル化されるアミノ酸ホスホノアミデートである、方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ＨＩＶプロテアーゼ、ＨＩＶインテグラーゼ、またはＨＩＶ逆転写酵素を阻害することが公知である、方法。
【請求項１４】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、天然に存在するホスフェート含有酵素基質のアナログであることが公知でない、方法。
【請求項１５】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではない、方法。
【請求項１６】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１７】
請求項１に記載の方法であって、細胞内蓄積代謝産物が、試験される、方法。
【請求項１８】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／または細胞内代謝産物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程も包含する、方法。
【請求項１９】
請求項１に記載の方法であって、第１の候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の組織選択性および／または細胞内滞在時間を決定する工程、該第１の候補化合物のさらなるアナログを調製または選択する工程、ならびに該アナログの組織選択性および／または細胞内滞在時間を決定することなく、該さらなるアナログの治療活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２０】
請求項１に記載の方法であって、インビトロ細胞培養物中、酵素アッセイ、動物またはヒトにおける前記候補化合物の安全性および／または抗ＨＩＶ治療活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２１】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ＵＳ ＦＯＯＤ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎによって許可された薬学的生成物である、方法。
【請求項２２】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、本出願の出願日またはそれ以前に、特許または公開された特許出願において、抗ＨＩＶ活性を有することが開示されている化合物である、方法。
【請求項２３】
請求項１に記載の方法であって、ＧＳ−７３２０エステルヒドロラーゼによるカルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対する感受性を決定する工程を包含し、該ヒドロラーゼが、以下
（ｂ）ヒトＰＢＭＣを溶解する工程；
（ｃ）界面活性剤を用いて該溶解された細胞を抽出する工程；
（ｄ）上清から固体を分離し、そして該上清を回収する工程；
（ｅ）該上清をアニオン交換媒体と接触させる工程；
（ｆ）該アニオン交換媒体から該ヒドロラーゼを溶出する工程；
（ｇ）該溶出液を疎水性クロマトグラフィー媒体と接触させる工程；および
（ｈ）該疎水性クロマトグラフィー媒体から該ヒドロラーゼを溶出する工程、
を包含するプロセスによって、ヒトＰＢＭＣから回収され得ることによって特徴付けられる、方法。
【請求項２４】
請求項２３に記載の方法であって、前記ヒドロラーゼが、約７０〜１００ｋＤａのグル濾過クロマトグラフィーでのＭＷを有し、等電点電気泳動によって約４．５〜５．５のｐＩを有し、３，４ジクロロイソクマリンによって阻害され、ブチルセファロースＨＩＣに結合し、アニオン交換媒体Ｑ１５に結合し、そしてヒトＰＢＭＣから回収され得る、方法。
【請求項２５】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内滞在時間が、リンパ組織内の少なくとも１つの細胞内蓄積代謝産物の半減期として決定される、方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、前記リンパ組織が、ＰＢＭＣ、ヘルパー細胞、キラー細胞またはリンパ節である、方法。
【請求項２７】
請求項１に記載の方法であって、抗ＨＩＶ活性を決定する工程が、インビトロアッセイによる、方法。
【請求項２８】
請求項２７に記載の方法であって、前記アッセイが、動物モデルまたは臨床試験で実行される、方法。
【請求項２９】
請求項１または２に記載の方法であって、最終工程から臨床試験化合物を同定する工程、該臨床試験化合物を用いて臨床試験に入る工程、ＨＩＶの処置のために該臨床試験化合物を市販するための監督官庁の許可を得る工程、および該監督官庁の許可の後に、該臨床試験化合物を販売する工程を包含する、方法。
【請求項３０】
請求項２９に記載の方法であって、前記臨床試験化合物が、前記候補化合物と同一ではない、方法。
【請求項３１】
請求項２に記載の方法であって、細胞内持続性が、該前記候補化合物の量および投与のタイミングの決定を包含する臨床試験によって決定される、方法。
【請求項３２】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、ＰＢＭＣにおいて細胞内で差し押さえられる、方法。
【請求項３３】
請求項２に記載の方法であって、１つより多くの代謝産物が、細胞内滞在時間を決定するために試験される、方法。
【請求項３４】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内持続性が、ＰＢＭＣ内で決定される、方法。
【請求項３５】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、代謝産物Ｘのホスホネート基を含む、方法。
【請求項３６】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、非エステル化カルボキシル基を含む、方法。
【請求項３７】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内蓄積代謝産物が、基−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）−を含む、方法。
【請求項３８】
候補非ヌクレオチド抗ＨＩＶ化合物のライブラリーであって、エステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート基を含む抗ＨＩＶ活性を有することが推定される複数の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項３９】
抗ＨＩＶ化合物のライブラリーであって、ヌクレオチドのみからならず、そしてエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート基を含む抗ＨＩＶ活性を有すると推定される複数の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項４０】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、少なくとも約１０個の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項４１】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、前記候補化合物が、（ａ）アミノ酸または有機酸で置換されたホスホネート、または（ｂ）アミノ酸を含み、該アミノ酸または有機酸のカルボキシル基のうちの少なくとも１つが、エステル化される、ライブラリー。
【請求項４２】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、該ライブラリーの化合物が、別個の容器内に保存される、ライブラリー。
【請求項４３】
前記ライブラリー中の少なくとも１つの候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定するために、請求項３９、４０、４１、または４２のライブラリーを試験する工程を包含する方法。
【請求項４４】
請求項４３に記載の方法であって、前記候補化合物の少なくとも１つおよび／またはそれらの細胞内代謝産物の少なくとも１つの組織選択性および／または細胞内持続性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項４５】
請求項４３に記載の方法であって、該ライブラリーから臨床試験化合物を同定する工程、該臨床試験化合物を用いて臨床試験に入る工程、ＨＩＶの処置のために該臨床試験化合物を市販するための監督官庁の許可を得る工程、および該監督官庁の許可の後に、該臨床試験化合物を販売する工程を包含する、方法。
【請求項４６】
単離されたＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼ。
【請求項４７】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ゲル濾過クロマトグラフィーにおいて単一の主要バンドに精製されている、ヒドロラーゼ。
【請求項４８】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ヒトＰＢＭＣ細胞から回収され得る、ヒドロラーゼ。
【請求項４９】
請求項４８に記載のヒドロラーゼであって、前記ヒドロラーゼが、約７０〜１００ｋＤａのゲル濾過クロマトグラフィーでの分子量を有する、ヒドロラーゼ。
【請求項５０】
請求項５０に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、等電点電気泳動によって約４．５〜５．５のｐＩを有する、ヒドロラーゼ。
【請求項５１】
請求項５０に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、３，４ジクロロイソクマリンによって阻害される、ヒドロラーゼ。
【請求項５２】
請求項５１に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ブチルセファロースＨＩＣに結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５３】
請求項５２に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、アニオン交換媒体Ｑ１５に結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５４】
請求項５３に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ヒドロキシアパタイトに結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５５】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、不溶性媒体に架橋される、ヒドロラーゼ。
【請求項５６】
方法であって、実質的に純粋な有機分子を得る工程、必要に応じて、該有機分子を別の分子と接触させて、組成物を生成する工程、および請求項４６に記載のヒドロラーゼを該有機分子または組成物と接触させる工程、を包含する、方法。
【請求項５７】
請求項５６に記載の方法であって、前記有機分子が、抗ＨＩＶ化合物である、方法。
【請求項５８】
方法であって、ＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと有機化合物をインビトロでまたは細胞培養環境で接触させる工程を包含する、方法。
【請求項５９】
前記環境が細胞を含まない、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
実質的に純粋な有機化合物および単離されたＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼを含む、組成物。
【請求項６１】
有機化合物およびＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼを、インビトロまたは細胞培養環境で含む、組成物。
【請求項６２】
抗ＨＩＶ治療化合物を同定するための方法であって、改善として、プロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはエステル化カルボキシル基で置換して、候補化合物を生成する工程、およびその抗ＨＩＶ活性について、得られた候補化合物をアッセイする工程を包含する、方法。
【請求項６３】
請求項６１に記載の方法であって、前記候補が、その細胞内持続性についてアッセイされる、方法。
【請求項６４】
請求項６３に記載の方法であって、前記候補が、カルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対してその細胞外安定性についてアッセイされる、方法。
【請求項６５】
請求項６４に記載の方法であって、複数の候補化合物から選択する工程であって、該候補化合物が、エステル分解的に切断されて、抗ＨＩＶ活性を有する細胞内持続性代謝産物を細胞内に生じ、そして該カルボキシルまたはホスホネートエステルの細胞外加水分解に対して実質的にエステル分解的に安定である、方法。
【請求項６６】
請求項６５に記載の方法であって、前記候補が、リンパ組織外のカルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対して実質的に安定である、方法。
【請求項６７】
請求項６２に記載の方法であって、前記候補が、ホスホネート基で置換され、該ホスホネート基が、（ａ）アミノ基を介してリン原子に連結されたアミノ酸または（ｂ）有機酸での一置換を含み、該アミノ酸または有機酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項６８】
請求項６２に記載の方法であって、前記候補が、アミノ酸を含む基で置換され、該アミノ酸のカルボン酸が、エステル化されている、方法。
【請求項６９】
請求項６８に記載の方法であって、前記カルボン酸が、酸素原子を介してリン原子に連結されたヒドロキシ有機酸の残基である、方法。
【請求項７０】
請求項６８または６９に記載の方法であって、前記ヒドロキシ有機酸のヒドロキシル基またはアミノ酸のアミノ基が、α位にある、方法。
【請求項７１】
適切なプロドラッグとしての候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物を、カルボン酸エステルの加水分解を触媒し得る抽出物と接触させる工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、または該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項７２】
請求項７１に記載の方法であって、前記抽出物が、末梢血単核細胞から得られる、方法。
【請求項７３】
適切なプロドラッグとしての候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物を、カルボン酸エステルヒドロラーゼを有する末梢血単核細胞の抽出物と接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）該代謝産物化合物が該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、または該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項７４】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７５】
請求項７４に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、そしてヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項７６】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項７７】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７８】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７９】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８０】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８１】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８２】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８３】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８４】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８５】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８６】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８７】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８８】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８９】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９０】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９１】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９２】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９３】
請求項９０に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９４】
請求項９１に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９５】
請求項９２に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９６】
請求項９３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９７】
請求項９４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９８】
請求項９５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９９】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１００】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０１】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０２】
請求項１０１に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞内の培養物において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０３】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１０４】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、エステル化カルボキシル基を有する有機酸でのエステル化ホスホネート基の一置換をさらに含む、方法。
【請求項１０５】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ基を介してリン原子に連結されるアミノ酸でのエステル化ホスホネート基の一置換をさらに含む、方法。
【請求項１０６】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１０７】
請求項１０６に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１０８】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１０９】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１１０】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１１１】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１２】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１３】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１４】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１５】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１６】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１７】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１８】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１９】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２０】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２１】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２２】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２３】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２４】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２５】
請求項１２２に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２６】
請求項１２３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２７】
請求項１２４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２８】
請求項１２５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２９】
請求項１２６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１３０】
請求項１２７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１３１】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３２】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３３】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３４】
請求項１３３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３５】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１３６】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸基で置換された候補化合物を提供する工程を包含し、前記アミノ酸が、エステル化カルボキシル基を有する、方法。
【請求項１３７】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１３８】
請求項１３７に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１３９】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１４０】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１４１】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１４２】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４３】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４４】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４５】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４６】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４７】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４８】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４９】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５０】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５１】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５２】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５３】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５４】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５５】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５６】
請求項１５３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５７】
請求項１５４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５８】
請求項１５５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５９】
請求項１５６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１６０】
請求項１５７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１６１】
請求項１５８に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１６２】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６３】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６４】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６５】
請求項１６４に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞の培養物内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６６】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をカルボン酸エステルヒドロラーゼ活性を有するが、α−ナフチルアセテートを切断しない末梢血単核細胞の抽出物と接触させて、代謝活性化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１６７】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１６８】
請求項１６７に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１６９】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１７０】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１７１】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１７２】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７３】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７４】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７５】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７６】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７７】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７８】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７９】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８０】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８１】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８２】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８３】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８４】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８５】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８６】
請求項１８３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８７】
請求項１８４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８８】
請求項１８５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８９】
請求項１８６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９０】
請求項１８７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９１】
請求項１８８に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９２】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９３】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９４】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９５】
請求項１９４に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞の培養物内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９６】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、前記候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９７】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９８】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９９】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項２００】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０１】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０２】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０３】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０４】
請求項２００に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０５】
請求項２０１に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０６】
請求項２０２に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０７】
請求項２０３に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０８】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、前記エステル化ホスホネート基が、酸素原子を介してリン原子に連結されたヒドロキシ有機酸で一置換されている、候補化合物。
【請求項２０９】
請求項１３３に記載の候補化合物であって、前記ヒドロキシ有機酸のヒドロキシル基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２１０】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１１】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１２】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１３】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１４】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１５】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１６】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１７】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１８】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２１９】
請求項２１５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２０】
請求項２１６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２１】
請求項２１７に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２２】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２３】
請求項２１５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２４】
請求項２１６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２５】
請求項２１７に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２６】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２７】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２８】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２９】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３０】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３１】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３２】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３３】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３４】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３５】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３６】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３７】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３８】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２３９】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、インビトロアッセイによって実行される、方法。
【請求項２４０】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４１】
請求項２４０に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるカルボン酸化合物である、方法。
【請求項２４２】
請求項２４０に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるホスホン酸化合物である、方法。
【請求項２４３】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２４４】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４５】
請求項２４４に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるカルボン酸化合物である、方法。
【請求項２４６】
請求項２４４に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるホスホン酸化合物である、方法。
【請求項２４７】
請求項２４４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４８】
請求項２４７に記載の方法であって、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程において、該リンパ組織が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、および末梢血単核細胞からなる群より選択される、方法。
【請求項２４９】
請求項２１４に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２５０】
請求項２４９に記載の方法であって、前記工程（ｄ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１】
方法であって、以下：
（ａ）非ヌクレオチドプロトタイプ化合物を同定する工程；
（ｂ）該プロトタイプ化合物をホスホネート含有基で置換して、候補化合物を生成する工程；および
（ｃ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
方法であって、以下：
（ａ）少なくとも１つのエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート含有基を含む非ヌクレオチド候補化合物を選択する工程；および
（ｂ）該候補化合物の細胞内持続性またはそのエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート含有基のエステル化分解代謝産物を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の少なくとも１つの組織選択性が決定される、方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の少なくとも１つの細胞内滞在時間が、決定される、方法。
【請求項５】
ＨＩＶプロテアーゼに対する前記代謝産物の少なくとも１つの活性をさらに決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項６】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、カルボン酸である、方法。
【請求項７】
請求項１または２に記載の方法であって、前記候補化合物が、ＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項８】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプが、ＨＩＶに対して治療活性を有することが既に公知である、方法。
【請求項９】
複数の候補化合物の細胞内持続性を選択および決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項１０】
請求項１または２に記載の方法であって、候補化合物でない化合物が、少なくとも１つの候補化合物と並行して試験される、方法。
【請求項１１】
ＧＳ−７３２０エステルヒドロラーゼによって１つ以上の候補の切断を決定する工程を包含する、請求項２に記載の方法。
【請求項１２】
請求項１または２に記載の方法であって、前記候補が、アミノ酸のカルボキシルがエステル化されるアミノ酸ホスホノアミデートである、方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ＨＩＶプロテアーゼ、ＨＩＶインテグラーゼ、またはＨＩＶ逆転写酵素を阻害することが公知である、方法。
【請求項１４】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、天然に存在するホスフェート含有酵素基質のアナログであることが公知でない、方法。
【請求項１５】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではない、方法。
【請求項１６】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１７】
請求項１に記載の方法であって、細胞内蓄積代謝産物が、試験される、方法。
【請求項１８】
請求項１に記載の方法であって、前記候補化合物および／または細胞内代謝産物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程も包含する、方法。
【請求項１９】
請求項１に記載の方法であって、第１の候補化合物および／またはその細胞内蓄積代謝産物の組織選択性および／または細胞内滞在時間を決定する工程、該第１の候補化合物のさらなるアナログを調製または選択する工程、ならびに該アナログの組織選択性および／または細胞内滞在時間を決定することなく、該さらなるアナログの治療活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２０】
請求項１に記載の方法であって、インビトロ細胞培養物中、酵素アッセイ、動物またはヒトにおける前記候補化合物の安全性および／または抗ＨＩＶ治療活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２１】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ＵＳ ＦＯＯＤ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎによって許可された薬学的生成物である、方法。
【請求項２２】
請求項１に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、本出願の出願日またはそれ以前に、特許または公開された特許出願において、抗ＨＩＶ活性を有することが開示されている化合物である、方法。
【請求項２３】
請求項１に記載の方法であって、ＧＳ−７３２０エステルヒドロラーゼによるカルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対する感受性を決定する工程を包含し、該ヒドロラーゼが、以下
（ｂ）ヒトＰＢＭＣを溶解する工程；
（ｃ）界面活性剤を用いて該溶解された細胞を抽出する工程；
（ｄ）上清から固体を分離し、そして該上清を回収する工程；
（ｅ）該上清をアニオン交換媒体と接触させる工程；
（ｆ）該アニオン交換媒体から該ヒドロラーゼを溶出する工程；
（ｇ）該溶出液を疎水性クロマトグラフィー媒体と接触させる工程；および
（ｈ）該疎水性クロマトグラフィー媒体から該ヒドロラーゼを溶出する工程、
を包含するプロセスによって、ヒトＰＢＭＣから回収され得ることによって特徴付けられる、方法。
【請求項２４】
請求項２３に記載の方法であって、前記ヒドロラーゼが、約７０〜１００ｋＤａのグル濾過クロマトグラフィーでのＭＷを有し、等電点電気泳動によって約４．５〜５．５のｐＩを有し、３，４ジクロロイソクマリンによって阻害され、ブチルセファロースＨＩＣに結合し、アニオン交換媒体Ｑ１５に結合し、そしてヒトＰＢＭＣから回収され得る、方法。
【請求項２５】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内滞在時間が、リンパ組織内の少なくとも１つの細胞内蓄積代謝産物の半減期として決定される、方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、前記リンパ組織が、ＰＢＭＣ、ヘルパー細胞、キラー細胞またはリンパ節である、方法。
【請求項２７】
請求項１に記載の方法であって、抗ＨＩＶ活性を決定する工程が、インビトロアッセイによる、方法。
【請求項２８】
請求項２７に記載の方法であって、前記アッセイが、動物モデルまたは臨床試験で実行される、方法。
【請求項２９】
請求項１または２に記載の方法であって、最終工程から臨床試験化合物を同定する工程、該臨床試験化合物を用いて臨床試験に入る工程、ＨＩＶの処置のために該臨床試験化合物を市販するための監督官庁の許可を得る工程、および該監督官庁の許可の後に、該臨床試験化合物を販売する工程を包含する、方法。
【請求項３０】
請求項２９に記載の方法であって、前記臨床試験化合物が、前記候補化合物と同一ではない、方法。
【請求項３１】
請求項２に記載の方法であって、細胞内持続性が、該前記候補化合物の量および投与のタイミングの決定を包含する臨床試験によって決定される、方法。
【請求項３２】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、ＰＢＭＣにおいて細胞内で差し押さえられる、方法。
【請求項３３】
請求項２に記載の方法であって、１つより多くの代謝産物が、細胞内滞在時間を決定するために試験される、方法。
【請求項３４】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内持続性が、ＰＢＭＣ内で決定される、方法。
【請求項３５】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、代謝産物Ｘのホスホネート基を含む、方法。
【請求項３６】
請求項２に記載の方法であって、前記代謝産物が、非エステル化カルボキシル基を含む、方法。
【請求項３７】
請求項２に記載の方法であって、前記細胞内蓄積代謝産物が、基−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）−を含む、方法。
【請求項３８】
候補非ヌクレオチド抗ＨＩＶ化合物のライブラリーであって、エステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート基を含む抗ＨＩＶ活性を有することが推定される複数の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項３９】
抗ＨＩＶ化合物のライブラリーであって、ヌクレオチドのみからならず、そしてエステル化カルボキシルまたはエステル化ホスホネート基を含む抗ＨＩＶ活性を有すると推定される複数の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項４０】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、少なくとも約１０個の候補化合物を含む、ライブラリー。
【請求項４１】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、前記候補化合物が、（ａ）アミノ酸または有機酸で置換されたホスホネート、または（ｂ）アミノ酸を含み、該アミノ酸または有機酸のカルボキシル基のうちの少なくとも１つが、エステル化される、ライブラリー。
【請求項４２】
請求項３８または３９に記載のライブラリーであって、該ライブラリーの化合物が、別個の容器内に保存される、ライブラリー。
【請求項４３】
前記ライブラリー中の少なくとも１つの候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定するために、請求項３９、４０、４１、または４２のライブラリーを試験する工程を包含する方法。
【請求項４４】
請求項４３に記載の方法であって、前記候補化合物の少なくとも１つおよび／またはそれらの細胞内代謝産物の少なくとも１つの組織選択性および／または細胞内持続性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項４５】
請求項４３に記載の方法であって、該ライブラリーから臨床試験化合物を同定する工程、該臨床試験化合物を用いて臨床試験に入る工程、ＨＩＶの処置のために該臨床試験化合物を市販するための監督官庁の許可を得る工程、および該監督官庁の許可の後に、該臨床試験化合物を販売する工程を包含する、方法。
【請求項４６】
単離されたＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼ。
【請求項４７】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ゲル濾過クロマトグラフィーにおいて単一の主要バンドに精製されている、ヒドロラーゼ。
【請求項４８】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ヒトＰＢＭＣ細胞から回収され得る、ヒドロラーゼ。
【請求項４９】
請求項４８に記載のヒドロラーゼであって、前記ヒドロラーゼが、約７０〜１００ｋＤａのゲル濾過クロマトグラフィーでの分子量を有する、ヒドロラーゼ。
【請求項５０】
請求項５０に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、等電点電気泳動によって約４．５〜５．５のｐＩを有する、ヒドロラーゼ。
【請求項５１】
請求項５０に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、３，４ジクロロイソクマリンによって阻害される、ヒドロラーゼ。
【請求項５２】
請求項５１に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ブチルセファロースＨＩＣに結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５３】
請求項５２に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、アニオン交換媒体Ｑ１５に結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５４】
請求項５３に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、ヒドロキシアパタイトに結合する、ヒドロラーゼ。
【請求項５５】
請求項４６に記載のヒドロラーゼであって、該ヒドロラーゼが、不溶性媒体に架橋される、ヒドロラーゼ。
【請求項５６】
方法であって、実質的に純粋な有機分子を得る工程、必要に応じて、該有機分子を別の分子と接触させて、組成物を生成する工程、および請求項４６に記載のヒドロラーゼを該有機分子または組成物と接触させる工程、を包含する、方法。
【請求項５７】
請求項５６に記載の方法であって、前記有機分子が、抗ＨＩＶ化合物である、方法。
【請求項５８】
方法であって、ＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと有機化合物をインビトロでまたは細胞培養環境で接触させる工程を包含する、方法。
【請求項５９】
前記環境が細胞を含まない、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
実質的に純粋な有機化合物および単離されたＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼを含む、組成物。
【請求項６１】
有機化合物およびＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼを、インビトロまたは細胞培養環境で含む、組成物。
【請求項６２】
抗ＨＩＶ治療化合物を同定するための方法であって、改善として、プロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはエステル化カルボキシル基で置換して、候補化合物を生成する工程、およびその抗ＨＩＶ活性について、得られた候補化合物をアッセイする工程を包含する、方法。
【請求項６３】
請求項６１に記載の方法であって、前記候補が、その細胞内持続性についてアッセイされる、方法。
【請求項６４】
請求項６３に記載の方法であって、前記候補が、カルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対してその細胞外安定性についてアッセイされる、方法。
【請求項６５】
請求項６４に記載の方法であって、複数の候補化合物から選択する工程であって、該候補化合物が、エステル分解的に切断されて、抗ＨＩＶ活性を有する細胞内持続性代謝産物を細胞内に生じ、そして該カルボキシルまたはホスホネートエステルの細胞外加水分解に対して実質的にエステル分解的に安定である、方法。
【請求項６６】
請求項６５に記載の方法であって、前記候補が、リンパ組織外のカルボキシルまたはホスホネートエステルの加水分解に対して実質的に安定である、方法。
【請求項６７】
請求項６２に記載の方法であって、前記候補が、ホスホネート基で置換され、該ホスホネート基が、（ａ）アミノ基を介してリン原子に連結されたアミノ酸または（ｂ）有機酸での一置換を含み、該アミノ酸または有機酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項６８】
請求項６２に記載の方法であって、前記候補が、アミノ酸を含む基で置換され、該アミノ酸のカルボン酸が、エステル化されている、方法。
【請求項６９】
請求項６８に記載の方法であって、前記カルボン酸が、酸素原子を介してリン原子に連結されたヒドロキシ有機酸の残基である、方法。
【請求項７０】
請求項６８または６９に記載の方法であって、前記ヒドロキシ有機酸のヒドロキシル基またはアミノ酸のアミノ基が、α位にある、方法。
【請求項７１】
適切なプロドラッグとしての候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物を、カルボン酸エステルの加水分解を触媒し得る抽出物と接触させる工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、または該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項７２】
請求項７１に記載の方法であって、前記抽出物が、末梢血単核細胞から得られる、方法。
【請求項７３】
適切なプロドラッグとしての候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物を、カルボン酸エステルヒドロラーゼを有する末梢血単核細胞の抽出物と接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）該代謝産物化合物が該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、または該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項７４】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７５】
請求項７４に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、そしてヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項７６】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項７７】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７８】
請求項７３に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項７９】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８０】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８１】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８２】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８３】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８４】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８５】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８６】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８７】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８８】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項８９】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９０】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９１】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９２】
請求項７３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項９３】
請求項９０に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９４】
請求項９１に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９５】
請求項９２に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９６】
請求項９３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９７】
請求項９４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９８】
請求項９５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項９９】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１００】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０１】
請求項７３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０２】
請求項１０１に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞内の培養物において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１０３】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１０４】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、エステル化カルボキシル基を有する有機酸でのエステル化ホスホネート基の一置換をさらに含む、方法。
【請求項１０５】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ基を介してリン原子に連結されるアミノ酸でのエステル化ホスホネート基の一置換をさらに含む、方法。
【請求項１０６】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１０７】
請求項１０６に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１０８】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１０９】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１１０】
請求項１０３に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１１１】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１２】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１３】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１４】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１５】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１６】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１７】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１８】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１１９】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２０】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２１】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２２】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２３】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２４】
請求項１０３に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１２５】
請求項１２２に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２６】
請求項１２３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２７】
請求項１２４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２８】
請求項１２５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１２９】
請求項１２６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１３０】
請求項１２７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１３１】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３２】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３３】
請求項１０３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３４】
請求項１３３に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１３５】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させて、代謝産物化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１３６】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸基で置換された候補化合物を提供する工程を包含し、前記アミノ酸が、エステル化カルボキシル基を有する、方法。
【請求項１３７】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１３８】
請求項１３７に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１３９】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１４０】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１４１】
請求項１３５に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１４２】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４３】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４４】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４５】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４６】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４７】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４８】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１４９】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５０】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５１】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５２】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５３】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５４】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５５】
請求項１３５に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１５６】
請求項１５３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５７】
請求項１５４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５８】
請求項１５５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１５９】
請求項１５６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１６０】
請求項１５７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１６１】
請求項１５８に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１６２】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６３】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６４】
請求項１３５に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６５】
請求項１６４に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞の培養物内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１６６】
適切なプロドラッグとして候補化合物を同定するための方法であって、以下：
（ａ）エステル化ホスホネート基またはエステル化カルボキシル基を有する候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物をカルボン酸エステルヒドロラーゼ活性を有するが、α−ナフチルアセテートを切断しない末梢血単核細胞の抽出物と接触させて、代謝活性化合物を生成する工程；および
（ｃ）代謝産物化合物が、該候補化合物のエステル化ホスホネート基の代わりに、ホスホン酸基を有するか、該候補化合物のエステル化カルボキシル基の代わりに、カルボン酸基を有する場合、該候補化合物を適切なプロドラッグとして同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１６７】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、抗ＨＩＶ治療活性を有することが公知のプロトタイプ化合物をエステル化ホスホネートまたはカルボキシル基で置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１６８】
請求項１６７に記載の方法であって、前記プロトタイプ化合物が、ヌクレオシドではなく、ヌクレオシド塩基を含まない、方法。
【請求項１６９】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、アミノ酸ホスホノアミデートである候補化合物を提供する工程を包含し、ここで、該アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されている、方法。
【請求項１７０】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１７１】
請求項１６６に記載の方法であって、前記提供する工程が、プロトタイプ化合物を置換することによって形成される候補化合物を提供する工程を包含する、方法。
【請求項１７２】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７３】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７４】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および代謝産物化合物の細胞内持続性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７５】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７６】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７７】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７８】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶプロテアーゼ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１７９】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の抗ＨＩＶ阻害能力を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８０】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８１】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８２】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８３】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８４】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８５】
請求項１６６に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物および前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８６】
請求項１８３に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８７】
請求項１８４に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８８】
請求項１８５に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の細胞内滞在時間を決定する工程が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１８９】
請求項１８６に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９０】
請求項１８７に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９１】
請求項１８８に記載の方法であって、前記代謝産物化合物の半減期を決定する工程が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、または末梢血単核細胞内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程を包含する、方法。
【請求項１９２】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞を含まない環境において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９３】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、インビトロで、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９４】
請求項１６６に記載の方法であって、前記接触させる工程が、細胞培養物中において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９５】
請求項１９４に記載の方法であって、前記接触させる工程が、末梢血単核細胞の培養物内において、前記候補化合物をＧＳ−７３４０エステルヒドロラーゼと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１９６】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、前記候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９７】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９８】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項１９９】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸ホスホノアミデートである、候補化合物。
【請求項２００】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０１】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０２】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０３】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記アミノ酸のカルボキシル基がエステル化されているアミノ酸基で置換されている、候補化合物。
【請求項２０４】
請求項２００に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０５】
請求項２０１に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０６】
請求項２０２に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０７】
請求項２０３に記載の候補化合物であって、前記アミノ酸のアミノ基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２０８】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、前記エステル化ホスホネート基が、酸素原子を介してリン原子に連結されたヒドロキシ有機酸で一置換されている、候補化合物。
【請求項２０９】
請求項１３３に記載の候補化合物であって、前記ヒドロキシ有機酸のヒドロキシル基が、α位置にある、候補化合物。
【請求項２１０】
請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１１】
請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１２】
請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１３】
請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物であって、該候補化合物が、前記エステル化基の細胞外加水分解に対して実質的に安定である、候補化合物。
【請求項２１４】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項７１に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１５】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１０３に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１６】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１３４に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１７】
抗ＨＩＶ治療剤としての適切性について候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
（ａ）請求項１６４に記載の方法によって同定される候補化合物を提供する工程；
（ｂ）該候補化合物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程；および
（ｃ）該候補化合物の細胞内持続性を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１８】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２１９】
請求項２１５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２０】
請求項２１６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２１】
請求項２１７に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、ＨＩＶプロテアーゼに対する候補化合物の活性を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２２】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２３】
請求項２１５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２４】
請求項２１６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２５】
請求項２１７に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２６】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２７】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２８】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２２９】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶプロテアーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３０】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３１】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３２】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３３】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶインテグラーゼを阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３４】
請求項２２２に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３５】
請求項２２３に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３６】
請求項２２４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３７】
請求項２２５に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物がＨＩＶ逆転写酵素を阻害する能力を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２３８】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物に対するＨＩＶの耐性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２３９】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、インビトロアッセイによって実行される、方法。
【請求項２４０】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｂ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の抗ＨＩＶ活性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４１】
請求項２４０に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるカルボン酸化合物である、方法。
【請求項２４２】
請求項２４０に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるホスホン酸化合物である、方法。
【請求項２４３】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、前記候補化合物の細胞内滞在時間を決定する工程を包含する、方法。
【請求項２４４】
請求項２１４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の細胞内滞在時間を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４５】
請求項２４４に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるカルボン酸化合物である、方法。
【請求項２４６】
請求項２４４に記載の方法であって、前記酸代謝産物が、前記候補化合物のエステル分解的加水分解によって形成されるホスホン酸化合物である、方法。
【請求項２４７】
請求項２４４に記載の方法であって、前記工程（ｃ）が、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２４８】
請求項２４７に記載の方法であって、リンパ組織内の代謝産物化合物の半減期を決定する工程において、該リンパ組織が、ヘルパー細胞、キラー細胞、リンパ節、および末梢血単核細胞からなる群より選択される、方法。
【請求項２４９】
請求項２１４に記載の方法であって、（ｄ）前記候補化合物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２５０】
請求項２４９に記載の方法であって、前記工程（ｄ）が、前記候補化合物の酸代謝産物の組織選択性を決定する工程をさらに包含する、方法。
【公表番号】特表２００６−５０８６３４（Ｐ２００６−５０８６３４Ａ）
【公表日】平成１８年３月１６日（２００６．３．１６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００３−５８７３３０（Ｐ２００３−５８７３３０）
【出願日】平成１５年４月２５日（２００３．４．２５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０１２９４３
【国際公開番号】ＷＯ２００３／０９０６９１
【国際公開日】平成１５年１１月６日（２００３．１１．６）
【出願人】（５０００２９４２０）ギリアード サイエンシーズ， インコーポレイテッド (141)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１８年３月１６日（２００６．３．１６）
【国際特許分類】
【出願日】平成１５年４月２５日（２００３．４．２５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０１２９４３
【国際公開番号】ＷＯ２００３／０９０６９１
【国際公開日】平成１５年１１月６日（２００３．１１．６）
【出願人】（５０００２９４２０）ギリアード サイエンシーズ， インコーポレイテッド (141)
【Ｆターム（参考）】
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