本発明は、植物中へ効率的により多くのＤＮＡを送達するのに有用な、鋭利な炭素質担体に包埋されたＤＮＡ担持金ナノ粒子に関する。ナノ金が包埋されたこれらの炭素マトリックスは、生体細胞内金ナノ粒子の熱処理によって調製される。ＤＮＡ送達効率は、モデル植物で試験されている。これらの材料は、単位面積当たりにより多くの数のＧＵＳフォーカスを生じさせて、輸送材料の良好な分散を示す。合成担体の追加利点は、プラスミドおよび金を少量しか必要としないことである。調製された炭素支持粒子による植物細胞損傷はごくわずかであり、それは、市販のマイクロメートル大の金粒子の植物再生および形質転換効率と比較した植物再生および形質転換効率の増大から判断することができる。これは、わずかな損傷でより優れた穿孔能力をもたらす、炭素支持体が有する鋭利な先端に原因があると考えられる。 （もっと読む）

本発明は、サンプル中の糞便指標菌の迅速なアセスメントのための方法および組成物に関する。サンプル中のこれらの生物の存在の、特に定量ＰＣＲ法を用いる検出に使用するための新規プライマーおよびプローブ組成物を、本明細書において提供する。配列番号１〜４、７および８に示すプライマーならびに配列番号５、６および９に示す新規オリゴヌクレオチドプローブ配列を含む、新規オリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブ、ならびにサンプル中の糞便指標菌、特にエンテロコッカス種（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．）および糞便バクテロイデス種（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｓｐｐ．）、または検体処理対照の検出および／または定量のためのこれらのプライマーおよびプローブの使用方法を、本明細書において提供する。 （もっと読む）

本発明は、血管内皮増殖因子受容体(VEGFR-1)遺伝子の1つ以上の対立遺伝子バリアントの存在を決定することにより、ベバシズマブなどの脈管系性インヒビターを用いて治療して、悪性疾患または、生理学的および病理学的脈管形成に関連する疾患に苦しむ患者の全生存を改善する方法に関する。本発明はさらに、VEGFR-1遺伝子の1つ以上の対立遺伝子バリアントの存在を決定することにより、ベバシズマブなどの脈管形成インヒビターを用いて治療して、悪性疾患または生理学的および病理学的脈管形成に関連する疾患に苦しむ患者の無進行生存を向上する方法を提供する。本発明はまた、VEGFR-1遺伝子の1つ以上のバリアントの存在を決定することにより、脈管形成インヒビターに対する患者の応答性を評価する方法も提供する。 （もっと読む）

本発明は、試料中の生物学的または化学的な活性の検出のためのアッセイツールを提供する。本発明のアッセイツールは、アッセイツールの面上で発生した正のシグナルを使用した直接検出を提供する。これらのアッセイツールは、試料中の複数の作用剤（例えば酵素）を検出および／または同定するための、このような作用剤の基質特異性を分析するための、ならびにこのような作用剤の結合親和性および特異性を分析するための改善した方法を提供する。活性に際して、第１の固定された構築物から構成要素が遊離し、これが捕獲面により捕獲される。少なくとも２つの異なる固定された構築物を使用する。
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本発明はアッセイを行うための方法及び装置に関する。詳細には、本発明は、アッセイ（特に多工程アッセイ）を行うために用いることができる回転可能プラットフォームに関する。本発明は、回転可能プラットフォームであって、その表面の一以上の個別領域に第１の結合パートナーを固定化するようになっているか、又は該個別領域に第２の結合パートナーを選択的に固定化するようになっているプラットフォームを提供する。また、本発明は、アッセイを行うための方法、装置、キット及び該回転可能プラットフォームの使用にも関する。特に、本発明は、主にパイロシークエンシングによる核酸の配列決定に用いるために開発されたものであるが、本発明はこの分野に限定されない。
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【課題】 従来のマイクロチップでは、マイクロチップ内で複数試薬を混合する場合に層流同士の界面で拡散による混合が行われてきた。そのため混合必要時間が長いという課題が存在していた。このため、マイクロチップの開発とともにマイクロチップ内での溶液混合必要時間の短縮が強く求められてきた。
【解決手段】 生化学反応システムで使用するマイクロチップ内で複数の溶液を混合する場合に、溶液上流流路に溶液内の溶質濃度分布を変化させる電界発生領域を設ける。そして溶質濃度の高い領域を他の溶液と接触させることで溶液間の拡散を促進する。その結果、溶液混合必要時間を短縮できる。 （もっと読む）

【課題】酵素とセルロースを含むバイオマスとを反応させて糖化液を得るにあたり、酵素の有効利用を図ること。
【解決手段】酵素７とセルロース１とを含むバイオマスとを反応させて糖化液を得るにあたって、第１反応槽２１においてバイオマスと酵素７とを反応させて酵素７が分散した糖化液及び酵素７が吸着した未反応のバイオマスを含む残渣を生成させ、次いでこれらの糖化液と残渣とを分離して、当該残渣に対して第２反応槽２２においてｐＨ調整液を供給して前記糖化液よりも糖濃度の低い希薄溶液を調製し、この希薄溶液中において前記残渣とこの残渣に吸着した酵素７とを反応させて糖化液を生成させる。 （もっと読む）

【課題】所定量の液体試料混合物を収容した少なくとも１つの試料管内におけるポリメラーゼ連鎖反応の、制御装置付自動遂行装置の提供。
【解決手段】所定量の液体試料混合物を収容した少なくとも１つの試料管内におけるポリメラーゼ連鎖反応の、制御装置付自動遂行装置であって、ａ）前記少なくとも１つの試料管用の少なくとも１つのウェルを備えた試料ブロック、ｂ）所定時間に亙る前記試料ブロックの温度の関数として前記液体試料混合物の温度を決定する手段を備えたコンピュータ、ｃ）前記試料ブロックの温度を変化させるために前記コンピュータによって制御される加熱及び冷却手段、及び、ｄ）前記試料ブロックへ熱的に連結され、前記所定時間に亙る該試料ブロックの温度を前記コンピュータへ送るブロック温度センサ、を具備した装置。 （もっと読む）

本発明は、逆転写反応及びホットスタートＰＣＲから核酸汚染を除去する方法を提供し、前記ホットスタートＰＣＲはバリアーホットスタートＰＣＲ設定である及び／又はホットスタートＤＮＡポリメラーゼを含み、これらの方法は、５分間約５０℃の温度での加熱によって実質的に不可逆的不活性化され、二本鎖ＤＮＡに対して実質的に特異的であるＤＮａｓｅの使用を含む。本発明は、５分間約５０℃の温度での加熱によって実質的に不可逆的不活性化され、二本鎖ＤＮＡに対して実質的に特異的であるＤＮａｓｅ、前記ＤＮａｓｅをコードする核酸、及び前記ＤＮａｓｅ又は前記核酸を含むキット又は組成物をさらに提供する。 （もっと読む）

【課題】１種類のノズルチップのみで液体計量装置を構成させるとき、プランジャと液との間にある空気が、微量な液を吸引・吐出する場合に影響を及ぼすことを防止した液体計量装置を提供する。
【解決手段】往復運動により液を吸引・吐出するプランジャ１と、プランジャ１にて吸引された液を収容するノズルチップ３と、ノズルチップ３を保持するノズル２を有する液体計量装置において、ノズルチップ３の中にノズルチップ３内の液の収容スペースを減らすべく所定の体積を有する部材５を設けることにより、プランジャ１と液との間にある空気の体積を減少させる。 （もっと読む）

本発明は、核酸試料中に存在する標的デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）を検出または濃縮する方法であって、（ａ）核酸試料を断片化して、前記標的ＤＮＡを含有する標的断片を包含する核酸断片を生成させるステップと、（ｂ）前記標的断片を包含する前記断片を少なくとも部分的に一本鎖とするステップであって、一本鎖部分が末端部分を包含し、かつ、前記一本鎖部分の長さが、前記標的断片の前記一本鎖部分の少なくとも一部を、ステップ（ｃ）のプローブとハイブリダイズさせるのに十分であるステップと、（ｃ）ステップ（ｂ）の少なくとも部分的に一本鎖の断片を、単一の標的特異的核酸プローブのオリゴヌクレオチドＡおよびＢと接触させるステップであって、（ｉ）オリゴヌクレオチドＡが、前記標的断片の前記一本鎖部分の少なくとも一部と配列が相補的な少なくとも１０ヌクレオチドを含む、標的特異的な第１の部分を一方の末端において含み、かつ、プローブのオリゴヌクレオチドＢの一方の末端を包含する少なくとも一部と相補的なヌクレオチド配列を含む非標的特異的な第２の部分を他方の末端において含む、一本鎖オリゴヌクレオチドであり、（ｉｉ）オリゴヌクレオチドＢが、前記標的断片を検出および／または濃縮するための少なくとも１つのエレメントを含有または保有する一本鎖オリゴヌクレオチドであり、その一方の末端を包含する少なくとも一部が、オリゴヌクレオチドＡの非標的特異的な第２の部分と配列が相補的であり、それにより、前記標的断片が、オリゴヌクレオチドＡの標的特異的な第１の部分とハイブリダイズすることにより、前記プローブにアニーリングし、その結果として、１つの標的断片当たり１つの標的特異的プローブ結合イベントだけがもたらされる、ステップと、（ｄ）前記プローブのオリゴヌクレオチドＢを、前記プローブのオリゴヌクレオチドＡとハイブリダイズする前記標的断片の一本鎖部分の一部にライゲーションして、プローブ−標的断片ハイブリッドを作製するステップと、（ｅ）前記プローブ−標的断片ハイブリッドを検出または濃縮するステップとを含む方法を提供する。また、本発明の方法において用いられるキットも提供される。 （もっと読む）

【課題】診断目的のためにバイオチップの形態にある小型化された分析システムを提供する。
【解決手段】固体マトリクス１のサンプルキャリヤｂを有し、上記サンプルキャリヤの表面はマイクロ域に細分化され、上記表面には分析されるべき、生物学的生物から生ずるサンプル材料２が結合される、診断目的用のバイオチップであって、上記生物学的サンプル材料は、上記サンプルキャリヤの上記マトリクスの上記表面に直接的に結合され、上記サンプルキャリヤの上記マトリクス又は表面は、上記サンプル材料に対する上記表面の結合容量を改善するために化学的若しくは物理的方法によって好ましくは事前に処置されることを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】三次元ＤＮＡネットワークを構築する。
【解決手段】２枚の基板間にＤＮＡをＤＮＡ固定化因子で不溶化したＤＮＡの分散液をしみ込ませる（Ｓ１〜Ｓ３）。さらに基板間にネットワーク連結手構成因子の溶液をしみ込ませ、その状態で所定時間放置する（Ｓ４〜Ｓ５）。これによって、三次元ＤＮＡネットワークを構築させる。 （もっと読む）

本発明は、核酸配列の存在に基づいての大腸菌細菌血清型O157:H7の検出及びキャラクタリゼーションの迅速な方法、特に、PCRに基づく検出方法、並びにそれに有用なオリゴヌクレオチド分子及び試薬及びキットに関する。この方法は、好ましくは、ビーフエンリッチメントなどの、食物又は水サンプル中の大腸菌O157:H7を検出するために用いられる。本発明は、さらに、本発明の方法を行うための複製組成物及びキットに関する。 （もっと読む）

本発明は、マイクロ流体装置においてＤＮＡを単離し、その後、そのマイクロ流体装置においてＤＮＡを分析する方法及びシステムに関する。より詳細には、本発明の実施の形態は、マイクロ流体装置において患者試料からＤＮＡを単離する方法及びシステム、並びにマイクロ流体装置においてＰＣＲ等の増幅反応及び熱融解分析等の検出を行うためのＤＮＡの使用に関する。
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例えば癌を含む血管形成性疾患の診断及び治療に有用な方法及び組成物をここに開示する。
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【課題】血液サンプルにおける遺伝子発現プロファイルを解析することにより、インフリキシマブ投与の有効性の有無を遺伝子レベルで効果的且つ有効に判別する方法を提供する。
【解決手段】関節リウマチ患者におけるインフリキシマブ薬効の有効性を、複数の指標から選択される１若しくはそれ以上の指標を用いて判別する方法であって、関節リウマチ患者の血液中の特定の群から選択される１若しくはそれ以上の遺伝子の発現量を測定する工程と、前記測定した発現量を、予め用意された遺伝子発現プロファイルを用いて解析する工程と、前記解析した結果に基づき、前記関節リウマチ患者におけるインフリキシマブ薬効の有効性を判別する工程と、を有することを特徴とする、方法。 （もっと読む）

【課題】標的分子相互作用物質の結合量が多く、標的分子との相互作用を効果的に行なうことができ、中性条件下でも全体的に均一な構造を有する標的分子相互作用物質固定化担体を提供。
【解決手段】固相担体と、該固相担体に固定化された互いに結合してなる標的分子相互作用物質と水溶性重合体とを含む構造体、とを含む標的分子相互作用物質固定化担体。製造方法としては、（１）ホスホリルコリン類似基を有する所定のエチレン系不飽和重合性モノマーと、標的分子相互作用物質を共有結合するための官能基がスペーサーを介して結合している所定のエチレン系不飽和重合性モノマーとを共重合させて水溶性重合体を合成し、（２）該水溶性重合体と標的分子と相互作用する分子を混合し、（３）該混合物を、前記官能基又は標的分子相互作用物質を共有結合するための官能基を有する固相表面に供給して標的分子相互作用物質固定化担体を製造する。 （もっと読む）

【課題】標的核酸断片との結合力を向上させることのできるプローブ、プローブ設計装置、プローブ設計プログラムを提供すること。
【解決手段】ＤＮＡプローブ設計処理（Ｓ５）では、グラフィック表示機能を利用して設計された任意プローブと標的核酸分子との二重鎖構造に作用する力を古典分子力場計算に従って算出する（Ｓ５９）。そして、算出された力が所定の閾値以下となるまで各原子位置を調整して安定な二重鎖構造とし、その任意プローブの結合エネルギーを結合エネルギー解析処理（Ｓ６２）によって算出する。算出された任意プローブの結合エネルギーと、判定値メモリに記憶されている標準プローブの結合エネルギーとは、識別情報と共にＬＣＤに出力される。故に、ユーザは、設計したプローブのハイブリダイズ能力を端的に把握することができ、結合力を向上させたプローブを設計できる。 （もっと読む）

本発明は、肺がん予後の検出において、および医薬の調製においての2つのマイクロRNAsの使用に関する。本発明は特に、2つの小RNA分子のマイクロRNA-150およびマイクロRNA-886-3pを含む組成物、肺がん予後の検出において、および哺乳類および人間の肺がん転移を抑制するための薬の調製において用いられる組成物を含むデバイスに関する。とりわけ、マイクロRNA-150およびマイクロRNA-886-3pの発現レベルを肺がん予後の予知基準として用いることができ、そこでは、遺伝子の組み合わせの高い発現レベルは、有利な治療上の効果を示す。本発明はまた哺乳類および人間の肺がんにおけるマイクロRNA-150およびマイクロRNA-886-3pの発現レベルを検出するデバイスおよび試料におけるマイクロRNA-150およびマイクロRNA-886-3pの発現レベルを検出するための方法に関する。
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