【課題】ｃｉｓ−１，２−ＤＣＥ分解能を有するデハロコッコイデス属細菌を迅速、簡便且つ高感度で検出することを可能にするデハロコッコイデス属細菌検出用プライマーセットを提供する。
【解決手段】標的領域（Ａ）をＬＡＭＰ法により増幅させるプライマーセット（Ｉ）と、標的配列（Ｂ）をＬＡＭＰ法により増幅させるプライマーセット（ＩＩ）及び標的配列（Ｃ）をＬＡＭＰ法により増幅させるプライマーセット（ＩＩＩ）から選ばれる少なくとも一方のプライマーセットと、を含むデハロコッコイデス属細菌検出用プライマーセット。 （もっと読む）

【課題】好気・嫌気両条件下でベンゼンを分解できるAzoarucs sp. DN11株を複合生物系から正確、迅速、かつ簡便に検出し、定量する手段を提供すること。
【解決手段】Azoarucssp. DN11株の保有するベンゼンモノオキシゲナーゼ遺伝子の特異的な領域の配列をもとに設計したプライマーおよびプローブを用いてAzoarucssp. DN11株を検出および定量する方法。 （もっと読む）

【課題】土壌伝染性のダイズ黒根腐病菌を迅速に検出する。
【解決手段】圃場の表面から深さ5cmまでの土壌から土壌試料を採取し、通風乾燥機を用いて60℃で乾燥する。乾燥した土壌試料約0.5ｇから土壌ＤＮＡ抽出キットを用いて、全土壌ＤＮＡを抽出する。抽出した全土壌ＤＮＡをテンプレートとし、ダイズ黒根腐病菌のマーカー遺伝子（β-tubulin遺伝子）に特異的なプライマーセットを用いてＰＣＲ増幅する。増幅産物をアガロースゲルで電気泳動して、泳動ゲルのＤＮＡバンドにより、ダイズ黒根腐病菌マーカー遺伝子を検出する。検出したＤＮＡバンドによりダイズ黒根腐病菌の存在を検出し、バンドの濃さから菌密度を半定量する。 （もっと読む）

【課題】珪藻類被殻の有無を直接又は珪藻類被殻をトラップしたＤＮＡから間接的に検出する、安全で簡便な珪藻類検出方法の提供。
【解決手段】カオトロピックイオン存在溶液中に珪藻類被殻と共にシリカコートビーズを又はこれに短鎖ＤＮＡをコーティングして容れ、短鎖ＤＮＡコーティングビーズの場合はそのまま結合させ、シリカコートビーズの場合はそのまま或いは長鎖ＤＮＡ、ビオチン・蛍光標識ＤＮＡ、コーティング短鎖ＤＮＡとは配列の異なる短鎖ＤＮＡ又は無標識ＤＮＡを添加して珪藻類被殻に不可逆的に結合してＢ/Ｆ分離洗浄し当該ＤＮＡを染色して検鏡し、或いは前記解離した珪藻類被殻に結合した短鎖ＤＮＡや長鎖ＤＮＡをPCR増幅して検量線を得て、珪藻類被殻を定量的に検出し、又は前記解離した珪藻類被殻に結合したビオチン・蛍光標識ＤＮＡの蛍光強度を測定して珪藻類被殻を定量的に検出する珪藻類の検出方法。 （もっと読む）

【課題】 高検出感度で核内受容体のリガンドの分析が可能な形質転換酵母を提供する。
【解決手段】 本発明の形質転換酵母は、核内受容体遺伝子およびレポーター遺伝子が発現可能に導入されており、かつ核内受容体リガンドと核内受容体との複合体を認識して前記レポーター遺伝子を発現し得る形質転換酵母であって、さらに、細胞壁タンパク質の機能および排出ポンプタンパク質の機能の少なくとも一方が欠損されたことを特徴とする。本発明の形質転換酵母を使用すれば、核内受容体のリガンドを高感度で分析可能である。前記核内受容体遺伝子は、例えば、ヒト核内受容体のコード遺伝子であることが好ましい。 （もっと読む）

【課題】前処理をすることなく、長期に亘って、安価且つ簡便にトルエンを検出することができるトルエン検出方法の提供。
【解決手段】嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。 （もっと読む）

【課題】 線虫に関する専門的技術及び知識を持たない者であっても、土壌から線虫を簡便かつ迅速に分離出来る手段を提供する。
【解決手段】 軟質チューブに比重液を入れてピンチコックで止める。土壌分散液を比重液の上部に入れてピンチコックをはずし、土壌を沈降させる。チューブを横置きに静置して軟質チューブを巻き取って分離した線虫の溶液を排出取得し、沈降した土壌はチューブ内に残留させることを特徴とする線虫の分離方法。 （もっと読む）

【課題】安水処理活性汚泥の状態を簡便に診断できる診断方法及びこれを用いた安水処理活性汚泥の操業管理方法を提供する。
【解決手段】安水処理活性汚泥から抽出、精製したＤＮＡを鋳型として、特定の塩基配列からなる核酸分子をプライマーとして用いたＰＣＲにより、前記安水処理活性汚泥に含まれるカテコール分解酵素の遺伝子を検出し、安水処理活性汚泥の状態を診断する、安水処理活性汚泥の診断方法。 （もっと読む）

プロピオニバクテリウム・アクネスの感染に対して有効なワクチンを提供するため、特定のアミノ酸配列からなるペプチド、または特定のアミノ酸配列の１または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入または付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、免疫応答によって、プロピオニバクテリウム・アクネス感染により惹起される炎症を抑制するペプチドを提供する。 （もっと読む）

【課題】実汚染土壌の浄化に好適なバイオレメディエーション技術を提供すること。
【解決手段】ロドコッカス（Rhodococcus）属又はゴルドニア（Gordonia）属に属する微
生物であって、土壌から採取した試料単位重量あたりのDNA量に基づき求められる土壌バ
クテリア数を一定値以上とする能力を有する、土壌浄化微生物。土壌から採取した試料単位重量当りのDNA量に基づいて求められる土壌バクテリア数を指標として微生物の評価を
行う土壌浄化微生物のスクリーニング方法。並びに、土壌から採取した試料単位重量当りのDNA量に基づいて求められる土壌バクテリア数を指標として、土壌浄化処理を行う土壌
浄化方法。 （もっと読む）

【課題】シアン化合物の酸化分解機構に関与する微生物を簡便かつ高精度に検出する方法を提供すること。
【解決手段】種々の微生物のシアニドジヒドラターゼに存在する保存性の高いアミノ酸配列から設計したセンスプライマーとアンチセンスプライマーを用いてPCR又はリアルタイムPCRを行い、シアニドジヒドラターゼ遺伝子の増幅産物を検出することを特徴とする、シアン化合物酸化分解能を有する微生物の検出方法。 （もっと読む）

【課題】土壌中の他の微生物との拮抗作用を考慮しつつも短時間で結果を得ることができる土壌の健全性の評価方法を提供する。
【解決手段】（ｉ）評価対象の土壌の試料にペクチンを添加して培養し、培養後の試料のペクチン分解酵素活性を測定し；（ｉｉ）評価対象の土壌の試料にペクチンを添加せずに培養し、培養後の試料のペクチン分解酵素活性を測定し；（ｉｉｉ）（ｉ）で測定されたペクチン分解酵素活性と（ｉｉ）で測定されたペクチン分解酵素活性との差をとり、この差を評価対象の土壌のペクチン分解酵素誘導活性とし；及び（ｉｖ）評価対象の土壌のペクチン分解酵素誘導活性を、予め算出された健全土壌のペクチン分解酵素誘導活性と比較し、評価対象の土壌のペクチン分解酵素誘導活性が健全土壌のペクチン分解酵素誘導活性より一定割合以上高い場合、評価対象の土壌は不健全であると判断。 （もっと読む）

検出又は検定のために微生物を捕捉又は濃縮するプロセスは、（ａ）吸着緩衝液改質無機濃縮剤であって、（１）少なくとも１つの無機濃縮剤を少なくとも１つのカチオン含有塩溶液と接触させて、無機濃縮剤の少なくとも一部分を湿らせることと、（２）結果として得られる少なくとも部分的に湿った無機濃縮剤を乾燥させることと、を含むプロセスによって調製される、吸着緩衝液改質無機濃縮剤を準備することと、（ｂ）少なくとも１つの微生物株を含む試料を準備することと、（ｃ）少なくとも１つの微生物株の少なくとも一部分が、吸着緩衝液改質無機濃縮剤に結合されるか、又はそれによって捕捉されるように、吸着緩衝液改質無機濃縮剤を試料と接触させることと、を含む。 （もっと読む）

【課題】有機塩素化合物で汚染された土壌や地下水を、微生物よって浄化するバイオレメディエーション法では、微生物活性化のために添加する浄化処理剤の効果が土質の違い等によって異なるが、従来は浄化処理剤の浄化処理能力適応性を処理対象箇所と等しい条件で行うことができなかった。
【解決手段】本発明のバイオレメディエーションに用いる浄化剤の事前効果判定試験方法は、浄化処理対象箇所をボーリングし、ボーリング孔を利用して地中から土壌と地下水とを採取し、それぞれ断気状態で保持する工程、両者を混合槽に移送して断気状態で混合する工程、混合槽内の土壌、地下水混合物を密閉バックに分取して被検浄化処理剤を加え、一定温度に保持する工程、密閉バック内の有機塩素化合物量を経時的に測定し、被検浄化処理剤の効果を確認する工程とからなることを特徴とする。 （もっと読む）

本発明は、サンプル又は該サンプルから単離したDNAを、下記の標的遺伝子stx1、stx2、eae及び/又はespkに由来する一対のプライマーと接触させる工程を含んでなる、腸管出血性大腸菌(EHEC)を含有すると疑われるサンプルについて分子的リスク評価(MRA)を行う方法に関し、ここで、該方法は、第１の工程において標的遺伝子の各々について増幅産物が検出された場合に、第２の工程で、前記サンプル又は該サンプルから単離したDNAを、下記の標的遺伝子nleB、nleH1-2、nleE、ent/espL2、eaeサブタイプγ、β、ε及びθ並びに標的遺伝子rfbE(0157)、wbdl(O111)、wzx(026)；ihp1(0145)、wzx(0103)に由来する一対のプライマーと接触させ；標的遺伝子の各々について増幅産物の存否を決定することを特徴とする。 （もっと読む）

本発明は、ニトロレダクターゼ活性の検出及びｐＨ変化の指示薬のための酵素基質としての、以下の式（Ｉ）の化合物：


［式中、
・Ｗ_１、Ｗ_２、Ｗ_３及びＷ_４は、独立にＨ、Ｂｒ、Ｃｌ、Ｆ、Ｉ、アルキル、アルコキシ、チオメチル、ペルフルオロアルキル、ニトロ、シアノ、カルボキシル（そのエステルまたはアミドを含む）またはそれらの任意の組合せである、
・ｎ＝０、１または２、
・Ｕ及びＶはＮ、Ｎ^＋Ｒ、ＣＺ_４であり、ＲはＨ、アルキル、アラルキル、アリール、アルカノイル又はアルキルスルホニルである。好ましくは、ＵがＣＺ_４である場合、ＶはＮまたはＮ^＋Ｒである；ＶがＣＺ_４である場合、ＵはＮまたはＮ^＋Ｒである、
・Ｚ_１、Ｚ_２、Ｚ_３及びＺ_４は、独立にＨ、Ｂｒ、Ｃｌ、Ｆ、Ｉ、アルキル、アリール、アルコキシ、ペルフルオロアルキル、ニトロ、シアノ、カルボキシル、スルホニル（カルボキシルまたはスルホニルのエステルまたはアミドを含む）である］
及びその塩類の使用に関する。
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核酸の増幅、検出、および遺伝子型決定の技術のための方法および組成物を開示する。一つの態様において、標的特異的プライマー配列；標的特異的プライマー配列の5'にあるアンチタグ配列；アンチタグ配列の5'にあるタグ配列；およびアンチタグ配列とタグ配列との間にあるブロッカーを有する核酸分子を開示する。そのような核酸分子を含有している組成物、およびそのような核酸分子を使用する方法も、開示する。 （もっと読む）

【課題】カドミウムのような土壌中の汚染物質への暴露に対して高感度で発現が誘導されるような遺伝子を同定し、環境汚染の診断ツールを提供する。
【解決手段】以下のポリペプチドをコードするＤＮＡ：(a)トビムシ由来の特定アミノ酸配列から成るポリペプチド；(b)該アミノ酸配列において、１個又は数個のアミノ酸が置換、欠失、又は挿入されたアミノ酸配列から成るポリペプチドであって、トビムシへのカドミウム暴露に対してポリペプチド(a)と実質的に同じ程度の発現レベルの上昇が誘導されるポリペプチド；(c)上記アミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するポリペプチドであって、トビムシへのカドミウム暴露に対してポリペプチド(a)と実質的に同じ程度の発現レベルの上昇が誘導されるポリペプチド。 （もっと読む）

本発明は、溶液中に存在する分析物を検出及び定量する方法であって、持ち運び可能で、迅速で、安価で、選択的で、超高感度である、方法を提供する。この目的のために、本発明の主題は、母液から得られる液体の検体１中における目的の分析物２を検出及び定量する方法であって、該液体は規定の蒸発条件下において雰囲気Ａｔｍ中で蒸発することが可能であり、該方法は、以下の工程：ｂ）検体１を、分析物捕捉プローブを規定するマイクロ構造化又はナノ構造化された表面２０を有する基板１０上に置く工程であって、液体検体が基板の構造化された表面を少なくとも部分的に覆うように、置く工程、ｃ）検体に、液体／基板／雰囲気の三重線Ｔの近傍Ｖ_Ｔにおいて制御された蒸発５を行わせる工程であって、液体が雰囲気中に蒸発するにつれてこの三重線が基板の構造化された表面上を制御された速度で移動するように、並びに対流による集合及び有向性毛細管作用によってプローブにより標的分析物が捕捉されるように、行わせる工程、並びにｄ）工程ｃ）の後に得られる基板の構造化された表面を分析する工程を含む、方法である。 （もっと読む）

【課題】バイオオーグメンテーションの実施において、投入した炭化水素分解菌が環境に与える影響を適切に評価すること。
【解決手段】炭化水素分解菌の土壌投入が環境に与える影響の評価方法であって、
（1）汚染土壌について、
（1-1）炭化水素分解菌を投入し、
（1-2）前記（1-1）の投入後の土壌からDNAを抽出し、
（1-3）前記（1-2)で抽出したDNAを用いて下記（1a）〜（1c）：
（1a）土壌バクテリア数、
（1b）Real-time PCR法により得られる炭化水素分解菌数、及び、
（1c）PCR-DGGE法により得られる土壌バクテリアDNAのバンドパターン
を測定し、
（1-4）前記（1-3）で得られた（1a）〜（1c）の測定結果に基づき、汚染土壌における環境浄化又は回復効果を評価する工程、
かつ、
（2）非汚染土壌について、
（2-1）炭化水素分解菌を投入し、
（2-2）前記（2-1）の投入後の土壌からDNAを抽出し、
（2-3）前記（2-2）で抽出したDNAを用いて、下記（2a）〜（2c）：
（2a）土壌バクテリア数、
（2b）Real-time PCR法により得られる炭化水素分解菌数、及び、
（2c）PCR-DGGE法により得られる土壌バクテリアDNAのバンドパターン
を測定し、
（2-4）前記（2-3）で得られた（2a）〜（2c）の測定結果に基づき、非汚染土壌における環境影響を評価する工程
を有することを特徴とする環境影響評価方法、並びに、前記評価方法により得られる結果を用いた汚染土壌の浄化又は回復方法、及び炭化水素分解菌のスクリーニング方法。 （もっと読む）