【課題】植物分子生物学の分野に関し、植物に昆虫抵抗性を付与するＤＮＡ構築物、昆虫抵抗性トウモロコシ植物ＤＡＳ−５９１２２−７、そしてサンプルおよびその組成物中におけるトウモロコシ植物ＤＡＳ−５９１２２−７のＤＮＡの存在を検出するアッセイを提供する。
【解決手段】トウモロコシ植物ＤＡＳ−５９１２２−７のＤＮＡ植物発現構築物。ＤＡＳ−５９１２２−７特異的領域を検出する、生物学的サンプル中のイベントＤＡＳ−５９１２２−７を同定するためのキット、プライマー。 （もっと読む）

【課題】ＡＢＣＧ２遺伝子の多型検出用プローブを提供する。
【解決手段】ＡＢＣＧ２遺伝子の多型検出用プローブを、特定な配列からなる塩基配列において３０１番目〜３１１番目の塩基を含む塩基長１１〜５０の塩基配列に相補的で且つ少なくとも８０％以上の同一性を有し３１１番目の塩基に対応する塩基が蛍光色素で標識されているオリゴヌクレオチド等を含んで構成する。 （もっと読む）

【課題】前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）の細胞外ドメインを特異的に結合する抗体およびその抗原結合性フラグメントを提供すること。
【解決手段】本発明は、ＰＳＭＡの細胞外ドメイン上のコンフォメーショナルエピトープに特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性フラグメント、そのような抗体の１つもしくは組み合わせまたは抗体もしくは抗原結合性フラグメントを含む組成物、抗体を産生するハイブリドーマ細胞株、および癌の診断および処置のための抗体もしくはその抗原結合性フラグメントを使用する方法を含む。本発明はまた、ＰＳＭＡタンパク質のオリゴマー形態、マルチマーを含む組成物、および選択的にマルチマーと結合する抗体を含む。 （もっと読む）

【課題】オリゴヌクレオチド、合成ＤＮＡ及び合成ＲＮＡ等の合成により製造された生体分子の限外濾過による精製と濃縮の方法を提供する。
【解決手段】約０．５ＫＤ〜約１０ＫＤの公称分子量カットオフ（ＮＭＷＣＯ）をもち、膜４表面が正電荷又は負電荷をもつ限外濾過（ＵＦ）膜を使用し、その荷電表面を使用して合成生体分子を跳ね返して残液に保持するか又は合成生体分子を膜濾過に優先的に吸引することにより合成生体分子を精製濃縮する。 （もっと読む）

【課題】核酸分子の塩基対の安定性を制御する新規技術及びその利用を提供する。
【解決手段】下記一般式（１）で示されるイオン液体を含む溶液中において、第１の核酸分子と第２の核酸分子とを接触させる工程を含み、前記第１の核酸分子と第２の核酸分子とがハイブリダイズした際に形成される２本鎖核酸分子に含まれるＧ−Ｃ塩基対を不安定化させる、及び／又は、Ａ−Ｔ塩基対（あるいはＡ−Ｕ塩基対）を安定化させる方法。
【化１】


（式（１）中、Ｒ_１〜Ｒ_３は、それぞれ独立して水素原子又は置換されていてもよい炭素数１〜１０のアルキル基等を表し、ｎは０〜１０の整数であり、Ｘはアニオンを示し、Ｙは水素原子又は水酸基を表す。） （もっと読む）

【課題】 簡便且つ高い信頼性を保持した遺伝子同定方法および発現解析方法、並びにそこで使用される網羅的フラグメント解析のためのデータベース構築方法を提供する。
【解決手段】 試料に含まれるゲノムDNAまたは転写産物から得られたcDNAを断片化し、識別可能な指標配列を付与してフラグメントDNA混合液を得る段階、前記フラグメントDNA混合液の一部分を高速DNAシーケンシングし、そこに含まれる全フラグメントDNAについてリード配列データを取得する段階、前記の全リード配列データについて前記指標配列部分の有無を検査し、前記指標配列を有するリード配列データを抽出する段階、前記抽出された全リード配列データについて、配列類似性と配列長のパラメータにより配列のクラスタリング・アッセンブリング処理を行い、複数のクラスタを形成し、前記クラスタについて、当該クラスタの構成配列数、コンセンサス配列およびコンセンサス配列長、並びにアライメント情報を取得する段階を具備するデータベース構築方法。 （もっと読む）

【課題】増幅対象核酸がループを介して連続的に配列した増幅産物を得る核酸増幅法において融解曲線解析を行う際に、高い核酸の増幅反応効率および融解曲線解析の解析精度を得るための技術の提供。
【解決手段】増幅対象核酸と二本鎖を形成し得るプローブ核酸の存在下で増幅対象核酸の増幅反応を行い、増幅対象核酸がループを介して連続的に配列した増幅産物を得る手順と、前記増幅産物と前記プローブ核酸の融解曲線解析を行う手順と、を含み、前記プローブ核酸として、前記増幅反応の温度よりも融解温度が低いプローブ核酸を用いる核酸塩基配列解析方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】 高価な手段を用いて流体の保持位置を補正する必要のない、流路を有する流体デバイスを用いて熱処理を行う装置、および該デバイス内での流体の移動を制限する方法を提供する。
【解決手段】 少なくとも一の流路を有する流体デバイス（４）を用いて熱処理を行う装置であって、前記流路の一部を温度変化させる第一の温度変化手段（１）と、前記第一の温度変化手段による前記流路内の流体の膨張または収縮を前記流路の他の一部の流体の収縮または膨張で緩衝させるための第二の温度変化手段（２）と、を有する。 （もっと読む）

【課題】 ウシの品種判別方法を提供すること。
【解決手段】 被検ウシ個体から単離したゲノムＤＮＡにおいて、黒毛和種と、ホルスタイン種との品種間でアリル頻度の差が大きい１８個のＳＮＰのいずれか４個以上における塩基を決定することにより、そのウシ個体の品種を判別することができる。 （もっと読む）

【課題】乳癌患者に対して優れた治療効果をもたらす化学療法を提供する。
【解決手段】ＣＴＰＳの発現量を指標とする乳癌患者におけるテガフール・ギメラシル・オテラシルカリウム配合剤及びタキサン系薬剤を用いた併用化学療法の治療効果を予測する方法。 （もっと読む）

【課題】アセトアルデヒド脱水素酵素２(ALDH2)の遺伝子多型のrs671及びアルコール脱水素酵素２(ADH2)の遺伝子多型のrs1229984を検出するのに有効なプローブを特定し、これらの遺伝子多型を同時に検出する方法、およびそのためのキットを提供する。
【解決手段】アセトアルデヒド脱水素酵素２(ALDH2)の遺伝子多型のrs671及びアルコール脱水素酵素２(ADH2)の遺伝子多型のrs1229984を含む特定の領域に基づいてプローブ。 （もっと読む）

【課題】コムギの発芽抑制をもたらす遺伝子変異を有するヘテロ接合体を判別できる変異検出方法の提供。
【解決手段】被験コムギ由来のゲノムDNAを鋳型として、
(i)アブシジン酸8'位水酸化酵素遺伝子の第３イントロン内に位置する所定の塩基配列上の連続した少なくとも15塩基の塩基配列を含むオリゴヌクレオチドフォワードプライマーと、
(ii)アブシジン酸8'位水酸化酵素遺伝子の第４エクソン又は第４イントロン内に位置する所定の塩基配列上の連続した少なくとも15塩基の塩基配列の相補配列を含むオリゴヌクレオチドリバースプライマーと、
を含むプライマーセットを用いた核酸増幅を行い、Aゲノムのアブシジン酸8'位水酸化酵素遺伝子における挿入欠失変異を検出することを含む、被験コムギのAゲノムのアブシジン酸8'位水酸化酵素遺伝子の機能抑制変異を検出する方法。 （もっと読む）

【課題】核酸を含む生体試料から核酸を回収するときに、核酸の回収量を推定することができる核酸回収量推定装置等を提供する。
【解決手段】核酸回収量推定装置１００は、核酸を含む試料２００を吐出吸引する吐出吸引部１１０と、試料２００を吐出吸引部１１０で吐出吸引することによって、核酸を回収する回収部１２０と、試料２００を吐出するときの吐出圧力と試料２００を吸引するときの吸引圧力とを測定し、吐出圧力と吸引圧力との差分である差分圧力を測定する圧力測定部１３０と、差分圧力に基づいて、回収した核酸の回収量を推定する推定部１４０と、を備える。 （もっと読む）

【課題】がんゲノム解析において、従来の解析結果における１塩基変異の誤認を簡便に除去し、計算機に負荷をかけずに１塩基変異解析の精度を向上させる技術を開発する。
【解決手段】本発明は、（１）大規模シーケンシングで得られた対象配列を参照配列と照合して、割り付けるステップと、（２）前記対象配列を前記参照配列と比較して、該参照配列と整列させて、１塩基変異かｉｎｄｅｌ変異かの第１の判断を行うステップと、（３）第１の判断で１塩基変異と判断された対象配列について、１塩基変異と判断された塩基以外の塩基配列が参照配列と一致するタグの数を計数するステップと、（４）前記タグ数が２個または３個以上のとき、１塩基変異であるとする第２の判断を行うステップと、（５）第２の判断の１塩基変異を出力するステップとを含む、がんゲノム解析における大規模塩基配列解析方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】ゲノム配列決定のような迅速DNA配列決定を行うための装置および方法を提供する。
【解決手段】大きなテンプレート核酸分子を断片化して、複数の断片化核酸を産出する工程；断片化核酸を油中水型エマルジョン中の水性マイクロリアクター中に送達する工程；マイクロリアクター中の断片化核酸を増幅して、該核酸の増幅コピーを形成し、増幅コピーをマイクロリアクター中のビーズに結合させる工程；ビーズを、平坦表面上の少なくとも10,000個の反応チャンバーのアレイに送達する工程であって、複数の反応チャンバーが、単一のビーズのみを含む、工程；および複数の反応チャンバーにおいて配列決定反応を同時に実行する工程を含む、核酸の配列を決定する方法、および装置。 （もっと読む）

【課題】食品成分を摂取する者の感受性の個体差や感受性の変化を評価する方法、またはその感受性を見ることで他の成分の摂取に与える影響の予測などの評価方法を提供する。
【解決手段】所定の遺伝子群のうち１又は複数の遺伝子に対する被験物質の作用を判定する方法であって、被験物質が接触、摂取又は投与された被験生物から採取された試料から、下記の遺伝子群から選ばれる少なくとも１つの遺伝子を検出し、得られた検出結果を、前記被験物質の作用と関連づけることを特徴とする前記方法。 （もっと読む）

【課題】FTO遺伝子多型のrs9939609を検出するのに有効なプローブを特定し、FTO遺伝子多型のrs9939609を検出する方法、およびそのためのキットを提供する。
【解決手段】FTO遺伝子の多型を検出するためのプローブであって、特定の塩基配列において塩基番号401〜410を含む10〜65塩基長の塩基配列であり、410番目の塩基に対応する塩基がシトシンである以外は特定の塩基配列に相同性を有し、塩基番号410に対応する塩基が蛍光色素で標識されているオリゴヌクレオチドからなることを特徴とする多型検出用プローブ。 （もっと読む）

【課題】迅速かつ超高感度にｄＣ、ｍｄＣ、及び／又はｈｍｄＣを測定する方法の提供。
【解決手段】ｄＣ、ｍｄＣ及び／又はｈｍｄＣを測定する方法であって、内部標準、及び、１００ｎｇ以下のＤＮＡ断片あるいは細胞１００〜１０００個から調製されたＤＮＡ断片を含むサンプルを、液体クロマトグラフィー−質量分析に供し、液体クロマトグラフィーの移動相は、ｐＨ６．０〜８．０の緩衝液に対してｌｏｇＰ値−０．７〜−０．３の有機溶媒を１０〜３０％（ｖ／ｖ）の範囲内とし、デオキシリボースの開裂に基づいて測定するｄＣ、ｍｄＣ及び／又はｈｍｄＣを測定する方法。 （もっと読む）

【課題】化学反応および／または生体反応に関する測定を行う情報システムおよび方法を提供する。
【解決手段】化学反応および／または生体反応の最初に存在する分析物の量を測定するための方法およびシステム、ならびに増幅反応の数学的もしくは図式的解析を含む解析の一部を自動化するためのコンピュータ実行による方法およびシステム。
【効果】変動し得る閾値やＣｔ値を計算する必要なく、試験サンプル中に存在する標的の量を客観的に定量することが可能となる。さらに、Ｃｔ後のサイクルでのデータなどの以前は無視されていたデータなどのＰＣＲ増幅曲線の形状を解析することで、反応における阻害程度を求める上で利用可能な情報を用いることができる。 （もっと読む）

【課題】アザチオプリンを投与した場合に、該薬剤の代謝物の血中濃度が高濃度で維持されるという表現型に関与するジェネティックバイオマーカーの提供。
【解決手段】アザチオプリンを投与された被験体において発現量に違いが生じる１５種類の遺伝子における、発現量の違いを判定することができる遺伝子多型をin vitroで検出し、アザチオプリンを投与する被験体におけるアザチオプリンの血中濃度の安定性を予測する方法。 （もっと読む）