核酸レポーターおよびその利用の方法を提供する。核酸レポーターには、細胞膜を介した核酸レポーターの移行を促進するためのタンパク質形質導入ドメインで修飾された分子ビーコンが含まれる。核酸レポーターはまた場合により、特定の細胞、組織、器官、細胞内領域、オルガネラまたは小胞に核酸レポーターを指向するための標的化シグナルで修飾されていてもよい。
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プロテアーゼヘプシンは、卵巣癌およびその他の悪性腫瘍で特異的に過剰発現される。多数のヘプシンペプチドがヘプシンに対する免疫反応を誘導することができ、従って、卵巣癌およびその他の悪性腫瘍に対する免疫療法の監視および開発においてこれらペプチドの潜在能力を実証する。卵巣癌細胞、前立腺癌細胞および腎癌細胞に対するマーカーとして有用なヘプシンタンパク質変異体も提供する。 （もっと読む）

遺伝子の発現を効果的に抑制できる核酸の普遍的検索法、該方法に使用する核酸構築物、ベクター、該方法のためのキットに関する。プロモーター配列、少なくとも２つの遺伝子配列及びポリＡシグナル配列を有する核酸構築物であって、前記少なくとも２つの遺伝子配列は１分子のＲＮＡとして転写され、少なくとも１つの遺伝子配列が翻訳可能な形であり、少なくとも１つの遺伝子配列が実質的に翻訳されない形でコードされる核酸構築物を構築することに特徴を有する。 （もっと読む）

本発明は、病原体を閉じこめたフィブリン凝集体を形成する工程、および分析のために病原体を曝露するフィブリン溶解試薬を導入する工程を含む、血液などの試料から感染性病原体を抽出するための方法および物質に関する。フィブリン溶解試薬は好ましくは、フィブリン溶解試薬が必要とされるまで、一致した関係で冷凍されたプラスミノーゲンおよびストレプトキナーゼによって構成され、それにより、解凍するとすぐにストレプトキナーゼはプラスミノーゲンと酵素的に反応し、プラスミンを形成する。好ましくは冷凍前に、NaClおよびNa₃PO₄を含む食塩水溶液にプラスミノーゲンを懸濁する。
本発明は、核酸組成物を含む試料からATAを効率的に除去するための物質および方法にも関する。本方法は、RT-PCR反応および逆転写酵素が関与するその他の反応が実施できるように十分にATA非含有の核酸組成物を提供する。 （もっと読む）

本発明は、亜硫酸水素塩で処理した核酸サンプルを精製する方法を提供し、この方法は、サイズ排除技術およびサイズ排除デバイスを使用する。本発明は、核酸サンプルを調製する方法であって：少なくとも１つのシトシン核酸塩基を含む核酸を提供する工程；上記核酸を亜硫酸水素塩変換試薬と接触させる工程；および、上記接触した核酸をサイズ排除デバイスを使用して精製し、それにより精製サンプルを形成する工程を包含する、方法を提供する。 （もっと読む）

材料の試料における特定の種類の微生物の存在を確認して定量するための方法および組成物を開示する。最確数および連続希釈法において増殖した培養物中の特定の微生物の存在を確認するために、ハイブリダイゼーションおよびポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の手法を、ブランクおよび対照試料を用いた手法のカリブレーションの後に、適用する。例えば、飼料中に存在する特定のプロバイオティック微生物の量を決定するために、動物飼料の試料を培養し、分析することができる。
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本発明は、遺伝子中のＣｐＧ領域、特にｈＭＬＨ１をコードする遺伝子のプロモーター領域中のＣｐＧ領域のメチル化の有無を簡便に識別できる方法、この方法に用いるためのプライマー、プライマーセット検査用試薬及び検査用試薬キットを提供する。 本発明の方法は、ｈＭＬＨ１遺伝子のような解析対象遺伝子（ＤＮＡ）中のいずれかのＣｐＧ領域のメチル化されたシトシンを特異的に認識するプライマーと、前記メチル化の有無によらず目的遺伝子中のいずれかの領域に結合し、前記いずれかのＣｐＧ領域の存在する領域で核酸増幅により増幅産物を形成するプライマーの少なくとも２種のプライマーを、これらの２種のプライマーと一緒になって前記ＣｐＧ領域を含む領域を増幅することができる別のメチル化非特異的プライマーとともに用いる。 （もっと読む）

蛍光発光分光法データおよび蛍光寿命画像顕微法データの分析のための方法およびシステムを記載する。正確な分解へと収束する任意の形式の蛍光強度減衰のための一意的なラゲール展開を、従来の方法よりも高速に求めることができる。ラゲール展開手法は、固有の蛍光寿命と大いに相関する展開係数を含むので、蛍光動力学を直接特徴付けることが可能になる。複雑系については、離散的指数成分に関して蛍光強度減衰の従来の分析は、内在する蛍光動力学の正しい表示を容易には提供することができない。ラゲール展開手法を活用して、多様な系からの時間分解蛍光データの分析のための代替のノンパラメトリック法を記載し、それは、試料の特徴付けおよび識別を促進する。蛍光寿命画像化の分析のための超高速な方法も記載し、試料の組成変化および機能変化のリアルタイムでの分析が、光顕レベルまたは巨視レベルで促進される。 （もっと読む）

ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ２の発現を調節するために、化合物、組成物および方法が提供される。該組成物は、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ２をコードする核酸を標的とするオリゴヌクレオチドを含有する。ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ２発現を調節するため、ならびにジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ２の発現に関連した疾患および状態の診断および治療のためにこれらの化合物の使用方法が提供される。 （もっと読む）

本発明は，Porphyromonas gingivalisおよびを検出するための，およびP. gingivalisにより引き起こされる疾病および感染を治療および予防するための組成物および方法を提供する。 （もっと読む）

本発明は、表面増強ラマン分光法(SERS)によって検出可能な改変分子ビーコン、および関連する材料、製造方法および使用を提供する。方法例は、サンプル核酸における標的ヌクレオチド配列の存在または不存在を決定するための方法であって、
(a) 検出剤を提供する工程であって、検出剤が:
(i)標的配列に相補的な標的相補配列(TCS)、および、TCSに隣接する第一および第二オリゴヌクレオチドアームを含むプローブであって、
前記第一および第二オリゴヌクレオチドアームはステム二本鎖を形成し、
かつ、前記第一アームには、SERS（例えば、フルオレセイン色素）によって検出可能な第一標識部分が組み込まれ、
かつ、前記第二アームは、SERSによって検出可能な第二標識部分で終止し、
ここで、前記第二アームは、増強表面への第二標識の会合を促進することが可能な表面探索基(SSG、アゾ-ベンゾトリアゾール)をさらに含むプローブ、
(ii)前記第一および第二標識部分が、互いに、かつ増強表面に対して近接するように、前記プローブに前記SSGを介して会合した増強表面、
を含む工程と、
(b)サンプルを検出剤に曝露する工程と、
(c)サンプル中に存在する任意の標的配列へのTCSのハイブリダイゼーションを、前記剤のSERSスペクトルの変化によって検出する工程と、
を含む方法である。 （もっと読む）

生物システムの状態のプロファイルを作製するための方法およびシステムが開示される。このプロファイルは、複数のデータセット間の類似性、相違、および／または相関の識別に基づく。このデータセットは、１つ以上の生体分子成分のタイプ、１つ以上の生物学的サンプルのタイプ、および／または１つ以上の測定のタイプから算出される。本発明の１つの局面において、生物システムの状態（例えば、疾患状態）のプロファイルを作製するために、複雑な生物学的サンプルに関する複数の測定が実施される。その後、相関分析およびネットワークモデリングと組み合わせた、遺伝子、遺伝子転写物、タンパク質、および／または代謝産物についての包括的なプロファイリングが、システムレベルでの生物システムへの洞察を提供する。
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本発明は、HIG2 siRNAまたはHIG2抗体からなる組成物を細胞に接触させることによって、癌（特に腎細胞癌）の細胞の成長を阻害する方法を提供する。本発明では、腎細胞癌の診断法も提供する。 （もっと読む）

本発明は、新規ヒトLXRαバリアントポリペプチドおよびかかるポリペプチドをコードする核酸を提供する。本発明は、治療上、診断上、および研究上の使用ならびにかかるポリヌクレオチドおよびポリペプチドの産生も提供する。この要約は研究者またはその他の読者が迅速に開示された技術の対象を確認することを可能とする要約書に要求される規則に合致するために提供されることを強調する。要約書は請求項の意味の範囲を解釈または限定するために用いてはならないという理解の上で提出する。

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本発明は特に、メチル化可変CpG位置(MVP)とゲノムDNAサンプルタイプとの間の相関を含む全ゲノム的なエピゲノム地図(epigenomic map)を生成させる新規な方法に関する。MVPはサンプルタイプ間で定量的メチル化レベルに差が生じやすいCpG位置である。特定の関心ゲノム領域(ROI)は好ましくは近接した複数のMVPを含む、サンプルタイプの識別に役立つ好ましい新規のマーカー配列をもたらす。該エピゲノム地図は、たとえばサンプルタイプの特定またはサンプルタイプ間の鑑別など、幅広い用途分野がある。特定の好ましい実施態様では、エピゲノム地図は主要組織適合性遺伝子複合体(MHC)内のメチル化可変領域(MVP)に基づき、またたとえばゲノムDNAの由来源としての細胞または組織を特定したり、単数または複数の細胞または組織タイプを他の細胞または組織タイプから識別したりするのに役立つ。本発明のエピゲノム地図に基づく単数または複数の核酸配列の新規なエピジェネティク特性の分析は、該核酸の由来源の特定を可能にする。
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本発明は、マイクロアレイを使用する核酸分子の検出の分野に関する。本発明は、マイクロアレイ上に固定されたプローブに細胞溶解物を直接ハイブリダイズさせることによって、核酸精製を全く伴わずに、生物学的サンプル中の標的核酸分子を検出するための方法を提供する。本発明の目的は、さらなる精製を何ら伴わずにマイクロアレイと細胞溶解物を直接ハイブリダイゼーションすることによって、核酸を検出するための迅速な方法を提供することである。この方法は、簡単、低コストで、操作に都合がよく、汚染されず、そして一体化が容易である。
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本発明は、標的ポリヌクレオチドの存在または量を検出する方法に関する。ポリヌクレオチド、標的核酸類似体および色素を組み合わせ、混合物を形成する。色素の光学特性を、既知量の標的ポリヌクレオチド／核酸類似体ハイブリッドを含む、類似の混合物における色素の光学特性における変化率の基準値指標と比較し、光学特性における変化の相対比率を決定する。混合物中の色素の光学特性における変化の相対比率は、サンプル中の特定の標的ポリヌクレオチドの存在または量と相関関係がある。 （もっと読む）

本発明は、核酸サンプルを調製する方法に関する。本発明に係る方法は、実質的に全転写産物に相当するサンプルを調製するのに特に適している。本方法は、マイクロアレイによる発現解析法とともに使用するのに特に適している。本発明の一態様において、ＲＮＡ転写産物に相当する核酸サンプルを調製する方法が提供される。本方法は、エキソンや選択的スプライシングなど、転写産物の特徴を検出するために使用されるサンプルを調製するのに特に適している。本方法は、そのような転写産物を定量的、半定量的、または定性的に検出するのに適している。本方法は、選択的スプライシングを受けた転写産物など、あらゆるタイプの変異配列を含む多数の転写産物を観察するために使用することができる。 （もっと読む）

【課題】 信号を記録する技法を提供することにある。
【解決手段】 本発明の一態様では、信号を記録する方法は以下のステップを有する。信号に応答してポリマーの合成中に１つまたは複数の誤りが選択的に導入される。合成ポリマー内の１つまたは複数の誤りの１回または複数の発生が記録される。ポリマーの合成は、信号に応答して１つまたは複数の誤りを選択的に導入できるポリマー・シンセターゼを有することができる。信号を分析する方法も提供される。 （もっと読む）

生物学的、生化学的または化学的反応を実施する際に支持体として使用する、多孔性無機性基板を提供する。着色剤を用いて基板の多孔性層に色を付けたところ、この多孔性基板の自己蛍光バックグラウンドは、従来から使用されている「白色」多孔性基板と比較して約15〜20％減少した。色を付けた多孔性層は、シグナルのノイズに対する比が向上したが、このことは、生物学的または化学的結合アッセイを行う場合の検出測定において重要である。多孔性層を官能化すると、プローブ分子を多孔性層の上部または内部に固定し、マイクロアレイを作成することができる。該マイクロアレイは、従来から用いられている非多孔性無機性基板よりもプローブ濃度および保持能力が高く、非着色多孔性基板に共通の現象である比較的高い自己蛍光およびその他の損害に妨げられることもない。
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