【課題】従来法よりもより詳細にもやもや病の発症のリスク、およびその重症度を予測することができる方法を提供する。
【解決手段】被験者のRNF213遺伝子におけるc.14576G>A多型を検出し、ホモ接合性の多型A/Aを持つ場合に、予後不良の重症型である、あるいは発症リスクが高いと判定する、もやもや病の検査方法。 （もっと読む）

【課題】卵巣癌におけるゲノム構造の変化を指標として、卵巣癌の悪性度を含めて検出する手段を提供すること。
【解決手段】卵巣癌におけるゲノム構造の変化を指標として卵巣癌の悪性度を含めた検出を可能にすることを見出した。また、本発明は、卵巣癌において、遺伝子の不活性化を回復することにより、卵巣癌の増殖を抑制することも見出した。 （もっと読む）

【課題】細胞で生じるＤＮＡ損傷を迅速かつ定量的に測定できる解析技術を提供する。
【解決手段】ＤＮＡ解析装置（１）は、ＤＮＡ二本鎖切断箇所に集積する第１の蛍光タンパク質を観察対象の細胞に導入して時系列で撮影された画像を取得する画像取り込み手段（２５）と、取得した画像を解析する画像解析手段（１５）とを備える。画像解析手段（１５）は、時系列で撮影された画像の各々について、各画像に含まれる細胞核の画像の領域を検出し、検出した領域に含まれる、第１の蛍光タンパク質の発光による発光スポットの数をカウントし、さらに、検出した領域に含まれる、第１の蛍光タンパク質の発光による発光領域の面積を求め、時系列で求めた発光スポットのカウント値及び発光領域の面積のデータを解析データとして生成する。 （もっと読む）

【課題】ＤＮＡまたはＲＮＡの個々の塩基を正確かつ有効に識別するためのシステムおよび方法を提供することである。
【解決手段】
電界効果トランジスタ（ＦＥＴ）核酸配列決定装置（１０２）は、ソース（１０６）およびドレイン（１０４）領域ならびにゲート酸化物（１３６）を含む。ソース／ドレイン金属接点（１２３、１４２）に接続されたリード線（１１６）を介して電圧源（１１２）によってソースおよびドレインに電位が印加される。核酸鎖（１１１）がゲート電極領域となる開口部（１１８）を通過すると、核酸塩基（アデニン、チミン、グアニン、またはシトシン）を表す電荷が、チャネル（１１９）を介してソース（１０６）およびドレイン（１０４）間を流れる電流をその間の電界を変えることによって変え、電流計（１１４）によって測定される。 （もっと読む）

【課題】新生物性増殖もしくは細胞増殖または新生物性障害を有するか、または有する素因がある被験体を同定するための方法および組成物を提供する。
【解決手段】分化細胞集団および未分化細胞集団の比の改変が、細胞増殖または新生物性障害を発症するリスクに関する早期指標として使用可能であるという発見に基づいて、被験体から血液または腸組織由来などの生物学的試料を得て、同一または異なる組織における細胞分化レベルを決定することによって、被験体が癌などの細胞増殖または新生物性障害を発症するリスクを決定する方法を特徴とする。 （もっと読む）

【課題】上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）阻害薬の治療的投与が有効であるか有効でないことが予測される癌患者を同定するための、生物マーカー、方法、およびアッセイキットを提供する。
【解決手段】本発明の生物マーカーには、ＥＧＦＲおよびＨＥＲ２の遺伝子の増幅および多染色体性、ＥＧＦＲタンパク質の発現、ＥＧＦＲの突然変異、リン酸化Ａｋｔタンパク質の発現、ならびにこれらの生物マーカーの様々な組合せ、ならびにこれらの生物マーカーの、ＥＧＦＲ遺伝子のチロシンキナーゼ領域における突然変異との組合せの検出が含まれる。ＥＧＦＲ遺伝子のコピー数の増加、ＨＥＲ２遺伝子のコピー数の増加、ＥＧＦＲタンパク質の発現の増加、活性化ＡＫＴタンパク質の発現（リン酸化Ａｋｔ）、およびＥＧＦＲの突然変異は全て、ＥＧＦＲ阻害薬で処置された癌患者の良好な結果と関連する。 （もっと読む）

【課題】 迅速、高感度かつ特異的に、同じ属に属する２種類以上の菌またはウイルスを同定する方法を提供すること。
【解決手段】 同じ属に属するｎ種類（ｎは２以上）の菌またはウイルスに由来する特定核酸中のそれぞれ一部の配列と相補的２本鎖を形成可能なｎ種類のオリゴヌクレオチドプローブを用いて、同じ属に属するｎ種類の菌またはウイルスを同定する方法であって、前記特定核酸の配列は同定する菌またはウイルス間で相同性の高い配列であり、前記オリゴヌクレオチドプローブは前記特定核酸中の一部の配列と相補的２本鎖を形成すると形成前と比較し蛍光特性が変化するプローブであり、前記オリゴヌクレオチドプローブによる蛍光特性の変化量は前記オリゴヌクレオチドプローブで同定する菌またはウイルスにより異なる、同定方法により前記課題を解決する。 （もっと読む）

【課題】レシピエントと将来のドナーの輸血抗原遺伝子型（血液型の遺伝子型も）を交差試験することを基盤にした２つの血液型間の適合性を確立する方法、表現及びアルゴリズムを提供する。
【解決手段】適合性を決定するために、ハプロタイプを基礎とするセットと関連した発現条件によって血液型遺伝子型は対応する表現型にマッピングされ、適合性は組成表現型の組み合わせとして構築された血液型の適合性を確立することにより確立される。ビット記号列は合致し、アルゴリズム演算式を用いることが好ましい。遺伝子型をハプロタイプへマッピングすることにおける曖昧さが存在する場合、サンプル集合におけるハプロタイプの発生頻度に基づいて減ずることが、又は配偶子相によって解決することができる。 （もっと読む）

【課題】抗生物質等の「抗菌活性を有する薬剤」の標的たんぱく質を同定する方法を提供すること、及び、薬剤耐性を得る原因になった塩基置換の同定方法を提供すること。
【解決手段】抗菌活性を有する薬剤の標的たんぱく質を同定する方法であって、該薬剤に対する薬剤耐性変異株の中から温度感受性変異株を単離し、該温度感受性変異株におけるアミノ酸変異が導入されたたんぱく質を同定し、該アミノ酸変異が導入される前のたんぱく質を、該抗菌活性を有する薬剤の標的たんぱく質であると同定することを特徴とする標的たんぱく質の同定方法。 （もっと読む）

【課題】ＨＧＦ遺伝子のｐｏｌｙ Ａ ｒｅｐｅａｔ数変異を正確に判別することができる多型検出用プローブを提供する。
【解決手段】多型検出用プローブは、ＨＧＦ遺伝子の多型を検出するためのプローブであって、（Ｐ１−１）および（Ｐ１’−１）等のいずれかの少なくとも１種の蛍光標識オリゴヌクレオチドからなる。例えば（Ｐ１−１）は、特定の塩基との間に挟まれる１〜３１塩基のいずれかの個数の連続するＴからなる塩基配列と、を含む８〜９４塩基の塩基配列に相補的な塩基配列であり、特定の塩基に対応する塩基がシトシンであるという条件で、特定の塩基配列に対して少なくとも８０％以上の同一性を有し、特定の塩基番に対応する塩基が蛍光色素で標識されている、蛍光標識オリゴヌクレオチドである。 （もっと読む）

【課題】ＡＢＣＧ２遺伝子の多型検出用プローブを提供する。
【解決手段】ＡＢＣＧ２遺伝子の多型検出用プローブを、特定な配列からなる塩基配列において３０１番目〜３１１番目の塩基を含む塩基長１１〜５０の塩基配列に相補的で且つ少なくとも８０％以上の同一性を有し３１１番目の塩基に対応する塩基が蛍光色素で標識されているオリゴヌクレオチド等を含んで構成する。 （もっと読む）

【課題】特定の標的ＤＮＡ配列を高感度で迅速に検知する。
【解決手段】ナノチューブ装置は、標的ＤＮＡ配列用電子センサーとして設計させる。ナノチューブのフィルムは、基板１４０上の電極を覆うように沈着される。単鎖ＤＮＡ溶液を、標的ＤＮＡ配列に対して相補的になるように調製する。このＤＮＡ溶液を電極が覆われるように付着させ、乾燥後、付着物を基板から除去する（但し、電極間の領域を除く）。得られる構造体は、対置する電極間のナノチューブに直接的に接触する所望のＤＮＡ配列鎖を保有し、標的ＤＮＡ鎖の存在に対して電気的に応答するセンサーを構成する。ｓｓＤＮＡプローブをナノチューブセンサー装置へ結合させるリンカー基を用いる別のアッセイ態様も提供される。 （もっと読む）

【課題】本発明の目的は、高いハイブリ効率かつ高スループットな単分子シークエンス法の提供に関する。
【解決手段】高いハイブリ効率かつ高スループットな単分子シークエンス法のためには、総プローブ数が一定であることと、光学分解能以上の距離に最低限の数の反応場がある必要がある。従って、本発明では、複数のプローブが固定された反応場を複数備えており、１個の標的核酸が反応場のプローブのいずれかにハイブリするようにする。ただし、各反応場間の距離は、単分子計測を行うために光学分解能以上離れている必要がある。標的核酸と反応場の比を１０倍以上にすることで、全ての標的核酸がプローブとハイブリした場合でも、９０％以上の標的核酸は反応場に１個だけハイブリし、複数の標的核酸が１つの反応場にハイブリする確率は１０％以下となる。 （もっと読む）

【課題】細胞核内における特定のタンパク質の存在量や局在等を指標として、ｉＰＳ細胞と正常な分化細胞と癌化した細胞とを識別する方法の提供。
【解決手段】誘導多能性幹細胞を識別する方法であって、ＳＰ１（Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）、カハールボディに含まれているタンパク質、核ラミナに含まれているタンパク質、傍核小体コンパートメントに含まれているタンパク質、及びＰＭＬボディに含まれているタンパク質から選択される１種以上のマーカータンパク質の細胞核内の存在量、前記マーカータンパク質を含む構造体の細胞核内における数量、又は前記マーカータンパク質を含む構造体の細胞核内における形状を識別用指標とし、１種又は２種類以上の前記識別用指標に基づいて、被検細胞が、誘導多能性幹細胞、正常な分化細胞、又は癌化した細胞のいずれであるかを識別することを特徴とする誘導多能性幹細胞の識別方法。 （もっと読む）

【課題】ＩＲに基づく技法を用いて、サンプル中の１つまたは複数の生体分子を定量する方法、そのような方法で用いられるサンプルホルダーデバイスならびにそのようなサンプルホルダーデバイスを製造する方法を提供する。
【解決手段】（ａ）サンプルを封じ込めるための、疎水性領域でとり囲まれた親水性領域を含む多孔膜を備えるサンプルホルダーを提供するステップ；（ｂ）膜の親水性領域をサンプル体積と接触させるステップ；（ｃ）膜上の前記サンプル体積を乾燥させるステップ；（ｄ）膜上の前記サンプル体積を４０００−４００ｃｍ−１のスペクトル範囲内の１つの波長または前記スペクトル範囲の任意の部分を含む赤外線ビームに曝露するステップを含み、こうして赤外線吸収スペクトル内の１つまたは複数の吸収ピーク面積が、サンプル中の１つまたは複数の生体分子の量と相関性を有する前記赤外線吸収スペクトルを得る。 （もっと読む）

【課題】消化管間質腫瘍(GIST)患者の予後予測のためのキット及び方法を提供する。
【解決手段】GISTをもつ患者の生物学的検体においてREC8遺伝子及びPAX3遺伝子のうちの少なくとも１つの遺伝子のメチル化の有無を測定し、該遺伝子がメチル化されている場合予後不良であり、一方メチル化されていない場合予後良好であると決定することを含む、該患者の予後をインビトロで予測する方法、ならびに、GIST検査用キット。 （もっと読む）

【課題】核酸アプタマーと特異的に結合する標的分子を検出し定量する方法を提供する。
【解決手段】標的分子に結合しない核酸アプタマー、および、標的分子に特異的に結合する核酸アプタマーに標的分子を含むサンプルを加えた後、両者の核酸アプタマーを一緒にヌクレアーゼで処理し、両者の核酸アプタマーの量比を調べることにより、標的分子の定量を行うことを含む、標的分子の定量方法。 （もっと読む）

【課題】精子機能の評価に有用な、精度が高く且つ簡便で安価な検査方法を提供すること。
【解決手段】精子核ＤＮＡ断片化を高い精度で検出する方法を見出し、精子機能を簡便に解析するために有用なデータ分類方法および精子機能検査方法を確立し、さらに、精子頭部空胞により精子機能を評価する方法およびその評価のためのデータ解析方法を確立し、これら方法に基づいて、精子核ＤＮＡ断片化を指標とする精子機能検査方法、精子頭部空胞を指標とする精子機能検査方法、およびこれら検査方法を組み合わせてなる精子機能検査方法、並びに精子核ＤＮＡ断片化検出方法、精子頭部空胞測定方法、男性不妊症の診断方法、および精子選別方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】薬物もしくは他の治療に耐性を示す変異型ＨＣＶまたは他のウイルスを同定し、そしてこれらの変異型ウイルスに対して有効である新規なウイルス治療を提供する。
【解決手段】本発明は、ＨＣＶ改変体、および関連の方法および組成物を提供する。特に、ＶＸ−９５０のような１種以上のプロテアーゼインヒビターに対する感受性が低下している、ＨＣＶ改変体および改変体ＨＣＶプロテアーゼが、提供される。１つの局面において、本発明は、単離されたＨＣＶ ＮＳ３プロテアーゼをコードするＨＣＶポリヌクレオチド、その生物学的に活性なアナログ、またはその生物学的に活性なフラグメントを提供する。 （もっと読む）

【課題】 本発明の課題は、溶媒中での高分子化合物と化合物の結合に関する自由エネルギー差の計算を高速化することを目的とする。
【解決手段】 上記課題は、コンピュータが化合物間の自由エネルギー差を予測する自由エネルギー差予測方法であって、該コンピュータが、記憶部に格納される、標的化合物と該標的化合物と結合する第１候補化合物間の結合状態を指定する結合定数の値毎の部分自由エネルギー差を参照することによって、前記結合定数の領域から前記部分自由エネルギー差が所定変化値以上となる変化領域を特定し、第２候補化合物の前記変化領域の前記部分自由エネルギー差を、前記前後領域について求めた前記部分自由エネルギー差に基づいて、近似関数を用いて補間することを特徴とする自由エネルギー差予測方法により達成される。 （もっと読む）