本発明は、マイクロアレイを使用する核酸分子の検出の分野に関する。本発明は、マイクロアレイ上に固定されたプローブに細胞溶解物を直接ハイブリダイズさせることによって、核酸精製を全く伴わずに、生物学的サンプル中の標的核酸分子を検出するための方法を提供する。本発明の目的は、さらなる精製を何ら伴わずにマイクロアレイと細胞溶解物を直接ハイブリダイゼーションすることによって、核酸を検出するための迅速な方法を提供することである。この方法は、簡単、低コストで、操作に都合がよく、汚染されず、そして一体化が容易である。
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本発明は、対象の癌の予後を決定する又は癌治療の効果を改善する方法及びキットでのErbB受容体レベルのモニタリングに関する。本発明はまた、対象の癌の臨床的徴候の再発を予測する方法を提供する。一部の実施形態において、本発明は化学療法レジメンに対する耐性発現を予測する方法を提供する。他の実施形態において、本発明は、ErbB-2、ErbB-3及び／又はErbB-4のレベルをモニタリングすることにより、対象の癌治療の効果を改善する方法を提供する。本発明の方法の対象は、ErbB-1陽性腫瘍の化学療法レジメンの治療を以前に受けたことが好ましい。 （もっと読む）

イオンチャネル機能不全に関連する障害に対して素因がある被験体を同定する方法であって、前記被験体におけるイオンチャネルサブユニットをコードする遺伝子の少なくとも１つが、配列番号１〜１３４のうちの１つに示されるような変異事象を含むか否かを確認する工程を包含する方法。 （もっと読む）

本発明は、変形性関節症及び／又は変形性関節症の特定のステージで示差的に発現される新たなバイオマーカーの同定及び選択、並びに新たなバイオマーカーの組み合わせの同定及び選択に関し、同様に新たなバイオマーカーの組み合わせを選択する手段にも関する。本発明のバイオマーカー及びバイオマーカーの組み合わせの産物の発現を測定すると、以下のうち１つ又は複数において特定の利点が示される：（ａ）個体を変形性関節症であると診断すること、（ｂ）変形性関節症（ＯＡ）の２つのステージを区別すること、及び（ｃ）個体を変形性関節症（ＯＡ）の特定のステージであると診断すること。理解されているように、本発明のバイオマーカーの産物を測定するために、本発明のバイオマーカーの産物と特異的に及び／又は選択的にハイブリダイズするポリヌクレオチド及びタンパク質もまた、（ａ）個体を変形性関節症であると診断すること、（ｂ）変形性関節症（ＯＡ）の２つのステージを区別すること、及び（ｃ）個体を変形性関節症（ＯＡ）の特定のステージであると診断することに使用する前記ポリヌクレオチド及びタンパク質を含むキットと同様に本発明の範囲に包含される。個体の疾患の進行をモニターし、治療法の効力をモニターするための、本発明のバイオマーカーの産物と特異的に及び／又は選択的にハイブリダイズするポリヌクレオチド及びタンパク質の使用が、さらに本発明に包含される。本発明はまた、変形性関節症の新たな治療標的の同定における本発明のバイオマーカーの産物の使用を提供する。本発明はまた、本発明の遺伝子と結合し及び／又はその活性をモジュレートする化合物の同定における本発明のバイオマーカーの産物の使用を提供する。そのような方法によって同定された化合物は、変形性関節症及び変形性関節症の進行を研究するアッセイの開発に有用である。さらに、そのような方法によって同定された化合物は、変形性関節症又はその症状の予防、治療、管理及び／又は改善のための予防及び治療用の組成物の開発におけるリード化合物として有用である。 （もっと読む）

HER2アンタゴニストによる成長阻害に対し耐性を有する腫瘍細胞の成長阻害感受性を回復させる方法及び組成物。該方法は、HER2アンタゴニストに対する成長阻害感受性を活性化させるか、又は回復させるのに有効な量でPCDGFアンタゴニストを細胞に投与することを有する。本発明は、また、治療投薬計画、並びにHER2アンタゴニスト及びPCDGFアンタゴニストを含む治療組成物も提供する。 （もっと読む）

本発明は、複雑性の高い核酸サンプル中の核酸ポリマー配列を増幅するための組成物および方法を提供する。本発明の特有の組成物は、DNA合成のための2種類のプライマーの混合物から構成されるプライマーセットを含む。片方の方向への伸長には、プライマーは全て、DNAポリメラーゼによってコピーされうるテンプレートとなる能力を破壊する修飾を含む。反対方向への伸長のために、このセットは、全長に渡ってDNAポリメラーゼによって複製される、テンプレートとなりうる少なくとも1つのプライマーを含む。本方法は、増幅反応混合物中で関心対象の核酸ポリマー配列をDNA合成プライマーのセットと混合することによって実施されうる。次いで、反応混合物をPCR反応の温度サイクリングと類似の温度サイクリングに供する。プライマーセットの少なくとも1つのプライマーが核酸ポリマーにハイブリダイズする。複製不能プライマーが核酸ポリマーにハイブリダイズして伸長し、複製可能プライマーが次にハイブリダイズする核酸ポリマー由来の配列を含む伸長産物を産生することが好ましい。もちろん、核酸ポリマーが二本鎖であれば、複製可能および複製不能プライマーの両方がハイブリダイズし、DNAポリメラーゼにより伸長される。 （もっと読む）

本発明は、生検または体液試料または癌細胞培養のような細胞集団において遺伝子異常を検出するため、異なる種のシンテニー染色体鎖を比較するため、これによって、アレイをベースとするゲノムハイブリダイゼーションの実行を最適化するための、アレイ、アレイをベースとする方法、装置およびキットを提供する。 （もっと読む）

本発明は、配列特異的エンドヌクレアーゼのような核酸結合タンパク質を使用して核酸分子を分析するための方法、生成物およびシステムに関連する。本方法は、上記核酸分子についての配列情報を得るために使用され得る。本発明は、核酸分子を分析するための方法であって、核酸分子と検出可能な配列特異的エンドヌクレアーゼとを、非切断条件下で、配列特異的様式で該配列特異的エンドヌクレアーゼが該核酸分子に結合するのに十分な時間接触させる工程、および該結合された配列特異的エンドヌクレアーゼを検出する工程を包含する、方法を提供する。
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ヒトＭＡＲＫ遺伝子はＰＴＥＮ経路のモジュレーターとして同定されており、したがってこれらは欠陥ＰＴＥＮ機能に関連する疾患の治療上の標的である。ＭＡＲＫの活性を調節する作用剤を探すためにスクリーニングすることを含む、ＰＴＥＮのモジュレーターを同定する方法が提供される。 （もっと読む）

生物医学研究の多くの領域は、個々の遺伝子または転写産物におけるまれな変異の分析に依存している。ここで、本発明者らは、これまで達成できなかった規模および容易さでそのような変異を定量することができる方法を記載する。そのような分子のコレクションにおける各DNA分子は、配列においてオリジナルと同一であるDNAの何千個というコピーが結合している単一粒子へ変換される。そしてこのビーズの集団は、出発DNA分子の1対1の表示に対応する。DNA分子のオリジナルの集団内の変異はその後、フローサイトメトリーにより蛍光標識された粒子を数えることにより簡単に評価されうる。何百万個という個々のDNA分子が標準的実験装置でこの様式で評価されうる。さらに、特定の変異体がフローソーティングにより単離され、さらなる実験のために用いられうる。このアプローチは、まれな突然変異の同定および定量のために、加えて特定の集団または組織における遺伝子配列または転写産物における変異を研究するために用いられうる。 （もっと読む）

２つの非同一ポリヌクレオチドからヘテロ二重鎖ポリヌクレオチドを調製し、一方の鎖の塩基対ミスマッチ部位またはその近傍にニックを導入し、ニックが生じたミスマッチ部位からミスマッチ塩基を除去し、除去した塩基を第１鎖中の塩基を補完する塩基で置き換えるために、反対鎖をテンプレートとして使用することによって、非同一ポリヌクレオチド配列間で配列変異を再分配するインビトロ法を記載する。この方法により、ミスマッチの部位で、一方の鎖から他方の鎖へと情報が伝達される。 （もっと読む）

本発明は、ＲＮＡ結合ペプチドを提供し、具体的には、次式Ｉ：Ｒ−Ｑ−Ｒ−Ｘ（Ｉ） （ＸはＲ以外のアミノ酸残基を表す。）で示されるアミノ酸配列を含むペプチド、その誘導体又はこれらの塩を提供する。 （もっと読む）

本発明は、化学分析装置及び方法に関し、特に、分子、例えばペプチド、及び/又は短悪質などの生物分子を、溶液中の分子の混合体から抽出し、そして分析装置に提示する前に抽出された分子にサンプル処理を行うための特異的な装置に関する。試料の分析方法は、複合試料処理及び試料保持装置を使用する。当該装置は、各アレイ位置に位置するコンパートメントの各々に繋がれた１の側に試料を受け入れるための入口を有するプレートを含み、ここで当該コンパートメントの各々は、プレートを通して液体が流れることを可能にする出口と繋がっている。当該方法は、外部容器にサンプルを供給し；場合により当該サンプルを、外部容器内で第一処理にかけ、当該複合試料処理及び試料保持装置に移し、そして当該試料を装置を通した液体の流れを利用して、第二処理にかけ（ここで媒質が装置内に保持される）工程を含む。
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【解決手段】本発明は、ＲＮＡ分子を用いた細胞特性の改変に関する。特に、本発明は、細胞が動員、遊走、統合、増殖及び／又は分化する能力の改変に関する。例えば、本発明は、遊走、統合及び増殖する能力の獲得を含む、幹細胞の分化の誘導に関する。また、本発明は、in vivoでの幹細胞の動員、遊走、統合、増殖及び／又は分化の誘導にも関する。従って、本発明は、幹細胞仲介による機能的修復の促進に関する。また、本発明は、分化細胞の逆分化にも関する。これらの効果は全て、所望の細胞型を有する細胞から抽出できるＲＮＡ配列を有する単離ＲＮＡを細胞の集団に、細胞特性の改変が達成される条件下で提供することによってもたらすことができる。 （もっと読む）

本発明は、組織または血液試料から患者における卵巣癌の存在を検出するためのゲノム解析の使用およびこの測定を実施するためのキットに関するものである。さらに本発明は、卵巣癌患者の処置方法に関するものである。 （もっと読む）

本発明は、試料中に含有される物質の直接定量的in vitro 決定の装置および方法に関する。本発明による装置は、表面上に固定化された物質検出因子、遊離物質-放出体複合体、および表面上に固定化された放出体検出因子を含んでなる。使用する装置の放出体は、放出体検出因子との相互作用において放出特性の変化と反応する部分を含んでなる。本発明による装置により、抗原、例えば、タンパク質、ペプチド、核酸、オリゴヌクレオチド、血液成分、血清成分、脂質、薬剤および低分子量化合物または、他の設計において、抗体および抗体フラグメントから選択される物質を、例えば、全血試料において、直接定量的に決定することができる。 （もっと読む）

多能性の胚性幹（ES）細胞に基づく、胚毒性／催奇形性スクリーニングを目的とした、ならびに、成長および組織促進因子のような医薬品の同定のための、胚の発生および分化に対する化学的に誘導された効果のインビトロおよびインビボ検出のための手段と方法が提供される。アッセイは、トランスジェニックES細胞と、そのようなES細胞またはその派生物からなる非ヒト動物との使用に基づき、前記ES細胞が、分泌レポータータンパク質、特に分泌胚性アルカリホスファターゼ（SEAP）の分化依存性発現を特徴とする。 （もっと読む）

本発明は、プライマー核酸を延長し、そして標的核酸を配列決定するための方法を提供する。前記方法は、鎖終結をもたらすためへの2’−ターミネーターヌクレオチドの使用を包含する。関連する反応混合物及びキットの他に、本発明はまた、コンピューター読み取り媒体も提供する。 （もっと読む）

短いRNA断片を保護する方法は、短いRNA断片を検出可能な白金化合物で標識して標識した小さなRNA断片を形成すること含んでいる。得られた標識した短いRNA断片を捕捉オリゴヌクレオチドにさらす。捕捉オリゴヌクレオチドは、短いRNA断片ヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列の少なくとも2つの複製物を含んでいる。標識した短いRNA断片と捕捉オリゴヌクレオチド配列は、ハイブリダイゼーション条件下で接触させる。ハイブリダイゼーションにおいて、ハイブリダイズし標識した小さなRNA断片-捕捉オリゴヌクレオチド結合体上にマーカー部分が検出される。短いRNA断片の検出アレイは、複数のスポットを有する基質を含み、第1スポットは第1の短いRNA断片に相補的なヌクレオチド配列の少なくとも2つの複製物を含む第1捕捉オリゴヌクレオチドを共通なコントローラ又はスペーサとして機能する追加のヌクレオチド配列と共に含んでいる。アレイ上の他のスポットは、第2の短いRNA断片に相補的な配列の少なくとも2つの複製物を有する第2捕捉オリゴヌクレオチドを共通なコントローラ又はスペーサとして機能する追加の配列と共に含んでいる。溶離と任意の白金化合物のそれからの除去によって配列を移動させた後に証明された小さなRNA断片も得られる。 （もっと読む）

ヒトＭＹＬＫ遺伝子は分枝形態形成のモジュレーターとして同定されており、したがってこれらは欠陥分枝形態形成機能に関連する疾患の治療上の標的である。ＭＹＬＫの活性を調節する作用剤をスクリーニングすることを含む、分枝形態形成のモジュレーターを同定する方法が提供される。 （もっと読む）