【課題】複数の診断アッセイを同時に実行するための自動化分析器およびプロセスを提供すること。
【解決手段】核酸に基づく増幅反応を実施するためのプロセスであって、該プロセスは、ａ）処理デッキ上の第一位置に配置された分離ステーションにおいて、標的核酸を、流体試料中に存在する他の材料から分離する工程；ｂ）該処理デッキ上の第二位置に配置された増幅ステーションにおいて、前記分離された標的核酸を、反応受容器中で１つ以上の増幅試薬とともに、該標的核酸中に含まれる標的配列を増幅させるのに十分な時間および条件下でインキュベートする工程；ｃ）該分離された標的核酸を含む反応受容器を、工程ｂ）の前に該増幅ステーションへと運搬する工程、を包含する、プロセス。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
核酸に基づく増幅反応を実施するためのプロセスであって、該プロセスは、以下：
ａ）処理デッキ上の第一位置に配置された分離ステーションにおいて、標的核酸を、流体試料中に存在する他の材料から分離する工程；
ｂ）該処理デッキ上の第二位置に配置された増幅ステーションにおいて、前記分離された標的核酸を、反応受容器中で１つ以上の増幅試薬とともに、該標的核酸中に含まれる標的配列を増幅させるのに十分な時間および条件下でインキュベートする工程；
ｃ）該分離された標的核酸を含む反応受容器を、工程ｂ）の前に該増幅ステーションへと運搬する工程、
を包含する、プロセス。
【請求項２】
前記反応受容器に、プローブを、該プローブを、前記標的配列または該標的配列もしくはその相補体を含むアンプリコンにハイブリダイズするのに十分な時間および条件下で、提供する自動化工程をさらに包含する、請求項１に記載のプロセス。
【請求項３】
前記プローブが、検出可能な標識を含む、請求項２に記載のプロセス。
【請求項４】
前記標識が、蛍光色素または化学発光化合物である、請求項３に記載のプロセス。
【請求項５】
前記流体試料中の生物またはウイルスの標的群のメンバーの存在または不存在の指標として、前記標的配列または該標的配列もしくはその相補体を含むアンプリコンにハイブリダイズされた前記プローブの存在または不存在を検出する自動化工程をさらに包含し、該標的群は、少なくとも１つの生物またはウイルスからなる、請求項２〜４のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項６】
前記検出する工程が、前記流体試料中の生物またはウイルスの標的群のメンバーの存在または不存在の指標として、前記反応受容器から発生した光の量を決定することを含む、請求項５に記載のプロセス。
【請求項７】
前記流体試料中の生物またはウイルスの標的群のメンバーの量を決定する自動化工程をさらに包含する、請求項５または請求項６に記載のプロセス。
【請求項８】
請求項２〜７のいずれか一項に記載のプロセスであって、該プロセスは、前記プローブを、前記反応受容器に提供する前に、該反応受容器を、前記増幅ステーションから、前記処理デッキ上の第三位置において配置された温度制御ハイブリダイゼーションステーションに運搬する自動化工程をさらに包含する、プロセス。
【請求項９】
前記プローブが、前記反応受容器の前記増幅ステーションから前記ハイブリダイゼーションステーションへの運搬の後に、該反応受容器に提供される、請求項８に記載のプロセス。
【請求項１０】
請求項８または請求項９に記載のプロセスであって、該プロセスは、前記反応受容器を前記ハイブリダイゼーションステーションから前記処理デッキ上の第四位置に配置された検出ステーションに運搬する自動化工程をさらに包含し、ここで、ハイブリダイズされたプローブの存在または量が、該検出ステーションにおいて決定される、プロセス。
【請求項１１】
前記検出ステーションが、前記反応受容器の内容物により発生した光の量を決定するための照度計を備える、請求項１０に記載のプロセス。
【請求項１２】
前記増幅ステーションへの前記反応受容器の運搬の前に、該反応受容器の内容物の温度を上昇または降下させる自動化工程をさらに包含する、請求項１〜１１のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項１３】
前記増幅ステーションおよび前記ハイブリダイゼーションステーションのうち少なくとも１つへの前記反応受容器の運搬の前に、該反応受容器の内容物の温度を上昇または降下させる自動化工程をさらに包含する、請求項８〜１２のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項１４】
前記反応受容器中に存在する核酸を破壊するための不活性化試薬を、該反応受容器に提供する自動化工程をさらに包含する、請求項１〜１３のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項１５】
前記不活性化試薬が、過マンガン酸カリウムの溶液、ギ酸、次亜塩素酸ナトリウムの溶液、ヒドラジンおよび硫酸ジメチルからなる群より選択される化学薬品を含む、請求項１４に記載のプロセス。
【請求項１６】
請求項１４または請求項１５に記載のプロセスであって、該プロセスは、前記不活性化試薬を前記反応受容器に提供する前に、該反応受容器を、前記検出ステーションから前記処理デッキ上の第五位置に配置された不活性化ステーションに運搬する自動化工程をさらに包含する、プロセス。
【請求項１７】
前記分離する工程の前に、前記標的核酸を固体支持体上に直接的または間接的に固定化させるのに十分な時間および条件下で、前記流体試料に、該固体支持体を提供する自動化工程をさらに包含する、請求項１〜１６のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項１８】
前記固体支持体が、ポリヌクレオチドが結合された磁性応答粒子を含む、請求項１７に記載のプロセス。
【請求項１９】
前記標的核酸が前記固体支持体上に固定化される前に、該標的核酸が、捕捉プローブにハイブリダイズされる、請求項１７または請求項１８に記載のプロセス。
【請求項２０】
前記流体試料が、前記分離する工程の間に磁場に供される、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載のプロセス。
【請求項２１】
前記運搬する工程の各々が、受容器運搬機構を用いて実施される、請求項１〜２０のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項２２】
前記増幅ステーションにおいて前記反応容器の内容物をインキュベートする前に、該反応受容器に、油層が提供される、請求項１〜２１のいずれか一項に記載のプロセス。
【請求項２３】
前記反応受容器は、開放頂部端と閉鎖底部端とを有するように形成されている、請求項１〜２２のいずれか１項に記載のプロセス。
【請求項２４】
請求項１〜２２のいずれか一項に記載のプロセスであって、前記反応受容器が、一体化されたアレイとして形成された複数の受容器容器のうちの１つを含み、各々の受容器は、開放頂部端と閉鎖底部端とを有するように形成されている、プロセス。
【請求項２５】
前記複数の受容器のうちの各受容器容器は、同じかまたは異なる標的核酸を同時に分離し、該受容器容器の流体サンプル中に存在し得る同じかまたは異なる標的配列を増幅するための同じかまたは異なる流体サンプルを含む、請求項２４に記載のプロセス。
【請求項２６】
前記受容器の各々が円筒形管である、請求項２４または２５に記載のプロセス。
【請求項２７】
前記ステーションはハウジング内に含まれる、請求項１〜２６のいずれか１項に記載のプロセス。
【請求項２８】
前記ハウジングが、自給型の、独立分析器ユニットを規定する、請求項２７に記載のプロセス。
【請求項２９】
前記分析器ユニットが可動式である、請求項２８に記載のプロセス。
【請求項３０】
前記他の材料が非ハイブリダイズ核酸を含む、請求項１〜２９のいずれか一項に記載のプロセス。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図６Ａ】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２３Ａ】

【図２３Ｂ】

【図２３Ｃ】

【図２４】

【図２５】

【図２５Ａ】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９Ａ】

【図２９Ｂ】

【図２９Ｃ】

【図２９Ｄ】

【図３０Ａ】

【図３０Ｂ】

【図３０Ｃ】

【図３０Ｄ】

【図３１Ａ】

【図３１Ｂ】

【図３１Ｃ】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【図３９】

【図４０】

【図４１】

【図４２Ａ】

【図４２Ｂ】

【図４２Ｃ】

【図４３】

【図４４】

【図４５】

【図４５Ａ】

【図４６】

【図４７】

【図４８】

【図４９】

【図５０】

【図５１】

【図５２】

【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【図５８】

【図５９】

【図６０】

【公開番号】特開２００７−３００９３０（Ｐ２００７−３００９３０Ａ）
【公開日】平成１９年１１月２２日（２００７．１１．２２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−１５１０４１（Ｐ２００７−１５１０４１）
【出願日】平成１９年６月６日（２００７．６．６）
【分割の表示】特願２０００−５４７４７６（Ｐ２０００−５４７４７６）の分割
【原出願日】平成１１年４月３０日（１９９９．４．３０）
【出願人】（５００５０６５３０）ジェン−プロウブ　インコーポレイテッド (58)
【Ｆターム（参考）】