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【課題】本発明は、例えば、ポリフェノール類等のPCR阻害物質を含有する被検試料をPCRにより分析する方法において、植物DNAを含むポリビニルポリピロリドン(PVPP)をPCR阻害物質を除去する目的で使用できるようにすることを課題とする。
【解決手段】本発明は、植物DNAを含有するPVPPから植物DNAを除去して得られたPVPPに関する。本発明はまた、被検試料からDNAを抽出する時に、植物DNAが除去されたPVPPを用いて被検試料中のPCR阻害物質を除去し、得られた被検試料DNA抽出物をPCRを用いて分析する方法に関する。 (もっと読む)


【課題】RNA研究に有用なRNA分解酵素活性を有するタンパク質の提供。
【解決手段】特定のアミノ酸配列又はこれらのアミノ酸配列において1若しくは複数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を含み、RNAを切断する活性を有する、タンパク質、該タンパク質の検索方法、該タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドを含む形質転換体、該RNA分解酵素を用いてRNAを切断する工程を備える、核酸の処理方法。 (もっと読む)


腫瘍に関連するヌクレオチド及びアミノ酸変異が提供される。変異を検出するための方法及び腫瘍を診断及び治療するための方法が提供される。 (もっと読む)


【課題】本発明は、所定の特定の制限エンドヌクレアーゼに対する制限部位を複数含むと共に、その核酸の少なくとも一部分は未知である出発DNAの少なくとも一部分を制御増幅する方法に係わる。本発明方法は、ヒト、動物または植物のDNAフィンガープリント形成、制限断片長さ多形性の同定に適用される。本発明を適用するためのキットも提供される。
【解決手段】本発明は、生物のDNAを少なくとも1種の制限酵素で切断した後に得られる制限断片をPCR法により増幅させる新規な方法を提供する。この新規なPCR法の使用において、使用するオリゴヌクレオチドは公知のDNA配列には指向せずに制限断片の末端を識別するように設計される。 (もっと読む)


【課題】Gカルテット構造に代表される核酸の高次構造を予測し得る方法、並びにこの方法を実行する装置及びプログラムを提供する。
【解決手段】核酸配列の高次構造を予測する核酸高次構造予測方法であって、前記核酸配列において、高次構造を形成し得る塩基を高次構造候補として抽出する工程と、前記核酸配列において、ステム構造を形成し得る塩基をステム構造候補として抽出する工程と、前記高次構造候補と前記ステム構造候補とに基づいて、最適な組合せ構造を探索する工程と、を有することを特徴とする。 (もっと読む)


【課題】ハイブリダイゼーション反応において、効率的に特異的ハイブリッドを形成させるオリゴヌクレオチドの融解温度の制御方法の提供。
【解決手段】下記式(式中、R〜Rは水素原子であってよいが、R〜Rの全てが水素原子であるものは除く)で示されるアンモニウムカチオンを用いる。
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【課題】 タイムラプス観察による細胞等の変化の観察を円滑化することができ、また、遺伝子導入や染色を施さない生きたままの心筋細胞についてその面積を容易に算出し数値化することも可能な、細胞のモニター方法およびモニター装置を提供する。
【解決手段】 培養容器31中の細胞をモニターするために、以下のような装置とする。すなわち、細胞を含む培養容器31中の細胞または細胞集団を撮像手段10が一定時間ごとに撮像し、コンピュータが、特定箇所(細胞中の同一の箇所)につき相前後して撮像された画像を比較したうえ、それら画像間の揺れ(ズレ)を検出し、検出した揺れを補正したうえで各画像を表示する。培養容器31は動かさないこととし、上記の撮像手段10を移動手段20によって3次元に移動させる。 (もっと読む)


本発明は、供試巨大分子上の少なくとも1つの対象ドメインの存在を検出する方法に関し、該方法は、
a)対象ドメイン上の少なくとも2つの標的領域を予め決定し、各標的領域の対応する標識プローブ(対象ドメインのプローブのセットと呼ぶ)を設計および取得し、これらのプローブのいずれかの、他のものに対する位置が選択され、供試巨大分子上の対象ドメインの特異的サインを形成する工程;
b)工程a)で得られたプローブが結合されている供試巨大分子を展開した後、線状化巨大分子に結合されているプローブのいずれかの、他のものに対する位置を検出し、対象ドメインのサインが検出されれば、供試巨大分子上に対象ドメインが存在することを示し、逆に、対象ドメインのサインまたはサインの一部が検出されなければ、供試巨大分子上に対象ドメインまたはドメインの一部が存在しないことを示す工程
を含む。 (もっと読む)


ヒトおよび非ヒト動物由来の単離、精製されたMAR配列が、それらに対応するかまたは基づくヌクレオチド配列として開示される。特に、高い転写および/またはタンパク質生成促進活性を有するMARおよびMARコンストラクトが開示され、かつ例えばタンパク質の高収率の生成を目的とする、かかるMARを同定し、かかるMARコンストラクトを設計し、かつそれらを用いるための方法が開示される。 (もっと読む)


【課題】複雑な染色方法を用いることなく、細径突起部の鮮明な画像を取得して、解析精度を向上する。
【解決手段】細胞Sから発せられる蛍光を撮像して細胞画像を取得する撮像装置4と、該撮像装置4による細胞画像の取得時における露光条件を切り替える露光切替手段5と、切り替えられた露光条件においてそれぞれ取得された複数の細胞画像に基づいて細胞Sの解析処理を行う処理手段5とを備える細胞自動解析装置1を提供する。 (もっと読む)


本発明は融解曲線分析が電気センサ及びプログラマブル加熱素子を用いて実行される生物学的検出装置に関する。本装置は、オプションとして、装置内の核酸を光学的に検出するための手段を更に含む。例えば本発明は、融解曲線分析を実行するための方法であって、マイクロチャンバ中の電気センサの表面に単鎖核酸プローブを供給するステップ、前記単鎖核酸プローブと単鎖核酸ターゲットとの間の二重鎖核酸へのハイブリッド形成を可能にするために、前記マイクロチャンバ中の前記電気センサに前記単鎖核酸ターゲットを含むサンプルを接触させるステップ、前記マイクロチャンバを徐々に加熱するステップ、前記電気センサの電気信号の変化に基づいて前記二重鎖核酸の融解温度を検出するステップを有する方法である。
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【課題】ポリヌクレオチド配列決定およびフラグメント分析、ならびに光学蛍光検出技術を用いる、ポリヌクレオチドシーケンサーおよびポリヌクレオチド分析器における従来の技術における問題の解決であって、以下の1つ以上を提供すること:改善された長さまたは読み取り、わずかなベースコーリング誤差、データおよび実験品質の良好な評価、および/または広範な種々の実験条件下においてデータを呼び出す性能。
【解決手段】新規の電気泳動分析のための内部較正標準。 (もっと読む)


【課題】本発明の目的は、明確にかつ再現性よく核酸配列中の多型を検出することができる方法及びそのための試薬を提供することである。
【解決手段】第一のリガンドが結合しておりかつ判定したい塩基部位(X)を含む少なくとも1種類の塩基判定用オリゴヌクレオチドプライマー(A)とセンスプライマー(B)とアンチセンスプライマー(C)の存在下増幅反応を行い、プライマー(A)の伸長産物と第二のリガンドが結合した相補的な少なくとも1種類の検出用オリゴヌクレオチドプローブ(D)をハイブリダイズさせた後、該プライマー(A)の伸長産物を鋳型として伸長反応を行い、該プローブ(D)の伸長産物と該一本鎖核酸の複合体(P)を形成せしめ、該複合体(P)中に、第一のリガンドと第二のリガンドが共存しているかどうかを検出する方法を提供する。 (もっと読む)


【課題】 細胞を高感度でセンシングする新しいバイオプローブ素子を開発する。
【解決手段】 蛍光を発する特性を示し、シグナル増幅作用をもつ発蛍光性高分子を、生体にやさしい多糖と複合体化することによって生体細胞内へスムーズに導入し、発蛍光させることでバイオセンサープローブとして応用する。多糖としてはβ−1,3−グルカン(例えばシゾフィラン)が好適に使用される。 (もっと読む)


【課題】本発明の分子及び方法は、選択された細胞のサブセット中で、トランス−スプライスされた分子のインビボでの製造のための手段を提供する。
【解決手段】本発明の前−トランス−スプライシング分子は、前−トランス−スプライシング分子と特定の標的細胞において唯一発現される、前−mRNAとの間のトランス−スプライシング反応のための基質である。インビボでのトランス−スプライシング反応は、mRNAとして機能的な又は、ターゲット細胞において発現されるべきタンパクをコードする。mRNAの発現生成物は、細胞又は宿主生物に対して治療上の価値を持つタンパクであるか、特定の細胞の死を誘発する毒素か、またはそのような細胞に通常存在しないタンパクである。本発明はさらに、エキソンタグ方法を用いて前−mRNAのエキソン/イントロンの境界を同定するための、遺伝子操作されたPTMsを提供する。本発明のPTMsは、特定の細胞タイプにおいて発現されるタンパクの精製及び同定に用いることができる、ペプチドアフィニティ精製タグをコードするキメラRNAの製造を生じる。 (もっと読む)


【課題】真核生物DNAミスマッチ修復経路、関連遺伝子および、例えば、薬物のスクリーニング、ガンの予後および診断におけるその使用における新規の方法の提供。
【解決手段】真核細胞のDNAミスマッチ修復経路において変化があるかどうかを調べる方法であって、以下の工程: a)予め選択された真核生物から生物学的標本を単離する工程;b)DNAミスマッチ修復経路のヌクレオチド配列またはその発現産物における変化について該標本を試験する工程;およびc)工程b)で得られる結果と野生型コントロールとを比較する工程を包含する、方法。 (もっと読む)


【解決手段】 本明細書では、生体試料調製および分析システムを提供しており、この生体試料調製および分析システムは、生物脅威に対する多重検出のための高速で携帯型の頑健な検出システムであり、劣悪な環境での操作用に耐久性を高めることが可能である。組み合わせプローブ分析(Combinatorial Probe Analysis:CPA)と呼ばれる新しい検出方法が当該システムに組み込まれており、この検出方法により検出信頼度は指数関数的に向上する。このタイプの分析は、偽陽性率および偽陰性率を大幅に低減し、また再使用が可能で、特殊な保管要件がない。核酸検出用のハイブリダイゼーションアッセイ最適化において特異度を高める技術的進歩として、多孔質高分子モノリス(porous polymer monolith:PPM)上で行うものも開示している。超高温可溶化プロトコルによる、ウイルス、植物、細菌、および細菌胞子の高速および完全な可溶化の実施についても説明する。本明細書で提供するシステムでは、細菌、ウイルス、およびタンパク質毒素を含む種々の生物剤に対し、高速で高度に多重化された分析を行う能力をもたらす。本明細書で説明するシステムおよびアッセイでは、5分間以下の時間枠で完全に自動化された試料の調製および分析を行える。当該アッセイの単純な設計により、個人用保護具を着用した利用者でも、当該システムを容易に操作することができる。本明細書で開示するシステムは、頑健で、使い方も単純であり、第一対応者コミュニティの目標に対応したものである。 (もっと読む)


【課題】抗原抗体反応のようなタンパク質間相互作用においてその結合部位を効率的に同定する手法を提供すること。
【解決手段】相互作用する第1のタンパク質と第2のタンパク質について、前記第1のタンパク質を支持体上に固定化し、前記第2のタンパク質を断片化して、前記第1のタンパク質に添加し、前記第1のタンパク質に捕捉された前記第2のタンパク質断片を分離し、分離された前記第2のタンパク質断片のアミノ酸配列を質量分析により解析して、前記第1のタンパク質に対する前記第2のタンパク質の結合部位を同定する。 (もっと読む)


【課題】高感度であるとともに安価に製造できるマイクロアレイを提供する。
【解決手段】シリコン基板の表面をHF溶液中で陽極酸化処理する工程、及び得られたポーラスシリコン基板にポリヌクレオチドを固定化する工程を含む、マイクロアレイの製造方法。 (もっと読む)


本発明は、標的ポリヌクレオチド中に散在したアダプターを用いる、標的配列のヌクレオチド配列情報を獲得するための方法および組成物に関する。配列情報は新規なもの、例えば未知核酸の配列決定でもよいし、再配列決定、または遺伝子型同定でもよい。本発明は、好ましくは、標的ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの断片中の分散した位置に複数のアダプターを挿入する方法を含む。かかるアダプターは、様々な配列決定化学、例えば、プライマー伸長、プローブライゲーション等によりヌクレオチドを同定する化学を用いて隣接配列を調べるためのプラットフォームとして役立ちうる。本発明には、アダプターにより近接する標的配列の途切れが生じるように既知のアダプター配列を標的配列に挿入するための方法および組成物も含まれる。アダプターの「上流」と「下流」の両方を配列決定することにより、完全な標的配列の同定が達成されうる。 (もっと読む)


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