自動化診断用分析器および方法
【課題】複数の診断アッセイを同時に実行するための自動化分析器およびプロセスを提供すること。
【解決手段】核酸に基づく増幅反応を実施するためのプロセスであって、該プロセスは、a)処理デッキ上の第一位置に配置された分離ステーションにおいて、標的核酸を、流体試料中に存在する他の材料から分離する工程;b)該処理デッキ上の第二位置に配置された増幅ステーションにおいて、前記分離された標的核酸を、反応受容器中で1つ以上の増幅試薬とともに、該標的核酸中に含まれる標的配列を増幅させるのに十分な時間および条件下でインキュベートする工程;c)該分離された標的核酸を含む反応受容器を、工程b)の前に該増幅ステーションへと運搬する工程、を包含する、プロセス。
【解決手段】核酸に基づく増幅反応を実施するためのプロセスであって、該プロセスは、a)処理デッキ上の第一位置に配置された分離ステーションにおいて、標的核酸を、流体試料中に存在する他の材料から分離する工程;b)該処理デッキ上の第二位置に配置された増幅ステーションにおいて、前記分離された標的核酸を、反応受容器中で1つ以上の増幅試薬とともに、該標的核酸中に含まれる標的配列を増幅させるのに十分な時間および条件下でインキュベートする工程;c)該分離された標的核酸を含む反応受容器を、工程b)の前に該増幅ステーションへと運搬する工程、を包含する、プロセス。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
コンテナの流体媒体中で固体支持材料を懸濁液に維持するための方法であって、該方法は、
第一の回転軸の周りに円形の経路にて該容器を移動させる工程;および
該コンテナを、該第一の回転軸と平行な第二の回転軸の周りで同時に回転させ、該第一の回転軸および該第二の回転軸の周りでの該コンテナの移動および回転の組み合わせによって、該コンテナの該流体媒体中で該固体支持材料を懸濁液に維持する工程、
を包含する、方法。
【請求項2】
前記コンテナは、ターンテーブル上で前記第一の回転軸の周りに移動され、該ターンテーブルは、1個以上のコンテナホルダーが該ターンテーブル上に取り付けられており、該コンテナホルダーは各々、コンテナを保持するように適合されており、それによって、該コンテナホルダーのそれぞれの前記第二の回転軸の周りでの回転運動と組み合わされた該ターンテーブルの該第一の回転軸の周りでの回転運動は、前記流体媒体中に存在する固体支持材料が懸濁液に維持されるように、該コンテナホルダーによって保持された少なくとも1個のコンテナの流体保持部分によって含まれる流体媒体を攪拌するに十分であり、ここで該少なくとも1個のコンテナの流体保持部分は、ほぼ円筒形である、請求項1に記載の方法。
【請求項3】
前記固体支持材料は、試料中に存在し得る標的分析物に結合しかつ該標的分析物を固定するように適合されている、請求項1または2に記載の方法。
【請求項4】
前記固体支持材料は、磁気応答性粒子を含む、請求項3に記載の方法。
【請求項5】
前記標的分析物は、標的核酸である、請求項4に記載の方法。
【請求項6】
前記コンテナの前記流体媒体は、前記標的核酸に存在する標的ヌクレオチド塩基配列領域に、第一組の所定ハイブリダイゼーション条件下にてハイブリダイズするポリヌクレオチド捕捉プローブをさらに含む、請求項5に記載の方法。
【請求項7】
前記磁気応答性粒子は、前記ポリヌクレオチド捕捉プローブに第二組の所定ハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする固定化ポリヌクレオチドを含む、請求項6に記載の方法。
【請求項8】
請求項7に記載の方法であって、
前記コンテナの前記流体媒体のアリコートを引き出す工程;
該アリコートを前記試料に提供する工程であって、該試料は、反応受容器に存在する、工程;および
該試料を前記第一組および前記第二組の所定ハイブリダイゼーション条件に曝露する工程、
をさらに包含する、方法。
【請求項9】
前記試料を磁場に供し、それによって、前記反応受容器中の前記磁気応答性粒子を単離する工程をさらに包含する、請求項8に記載の方法。
【請求項10】
前記試料の少なくとも一部を、前記反応受容器内で単離された前記磁気応答性粒子から分離し、それによって、非標的核酸を該試料中に存在し得る標的核酸から分離する工程をさらに包含する、請求項9に記載の方法。
【請求項11】
前記試料中の前記標的核酸の存在または非存在を、該試料中の生物もしくはウイルス、または生物もしくはウイルスの群の1以上のメンバーの存在もしくは非存在の指標として決定する工程をさらに包含する、請求項10に記載の方法。
【請求項12】
前記決定する工程の前に、前記標的ヌクレオチド塩基配列領域を増幅する工程をさらに包含する、請求項11に記載の方法。
【請求項13】
前記コンテナの前記流体媒体は、標的−捕捉手段を含む、請求項1または2に記載の方法。
【請求項14】
前記第一の回転軸の周りで前記コンテナの回転位置をモニターする工程をさらに包含する、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
【請求項15】
前記コンテナを流体移動プローブについての作動位置に位置させるように、前記第一の回転軸および前記第二の回転軸の周りで前記コンテナの移動および回転を選択的に停止させる工程をさらに包含する、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
【請求項16】
前記コンテナの移動および回転を停止させる工程の後に、前記流体移動プローブで前記コンテナの一定量の前記流体媒体を引き出す工程をさらに包含する、請求項15に記載の方法。
【請求項1】
コンテナの流体媒体中で固体支持材料を懸濁液に維持するための方法であって、該方法は、
第一の回転軸の周りに円形の経路にて該容器を移動させる工程;および
該コンテナを、該第一の回転軸と平行な第二の回転軸の周りで同時に回転させ、該第一の回転軸および該第二の回転軸の周りでの該コンテナの移動および回転の組み合わせによって、該コンテナの該流体媒体中で該固体支持材料を懸濁液に維持する工程、
を包含する、方法。
【請求項2】
前記コンテナは、ターンテーブル上で前記第一の回転軸の周りに移動され、該ターンテーブルは、1個以上のコンテナホルダーが該ターンテーブル上に取り付けられており、該コンテナホルダーは各々、コンテナを保持するように適合されており、それによって、該コンテナホルダーのそれぞれの前記第二の回転軸の周りでの回転運動と組み合わされた該ターンテーブルの該第一の回転軸の周りでの回転運動は、前記流体媒体中に存在する固体支持材料が懸濁液に維持されるように、該コンテナホルダーによって保持された少なくとも1個のコンテナの流体保持部分によって含まれる流体媒体を攪拌するに十分であり、ここで該少なくとも1個のコンテナの流体保持部分は、ほぼ円筒形である、請求項1に記載の方法。
【請求項3】
前記固体支持材料は、試料中に存在し得る標的分析物に結合しかつ該標的分析物を固定するように適合されている、請求項1または2に記載の方法。
【請求項4】
前記固体支持材料は、磁気応答性粒子を含む、請求項3に記載の方法。
【請求項5】
前記標的分析物は、標的核酸である、請求項4に記載の方法。
【請求項6】
前記コンテナの前記流体媒体は、前記標的核酸に存在する標的ヌクレオチド塩基配列領域に、第一組の所定ハイブリダイゼーション条件下にてハイブリダイズするポリヌクレオチド捕捉プローブをさらに含む、請求項5に記載の方法。
【請求項7】
前記磁気応答性粒子は、前記ポリヌクレオチド捕捉プローブに第二組の所定ハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする固定化ポリヌクレオチドを含む、請求項6に記載の方法。
【請求項8】
請求項7に記載の方法であって、
前記コンテナの前記流体媒体のアリコートを引き出す工程;
該アリコートを前記試料に提供する工程であって、該試料は、反応受容器に存在する、工程;および
該試料を前記第一組および前記第二組の所定ハイブリダイゼーション条件に曝露する工程、
をさらに包含する、方法。
【請求項9】
前記試料を磁場に供し、それによって、前記反応受容器中の前記磁気応答性粒子を単離する工程をさらに包含する、請求項8に記載の方法。
【請求項10】
前記試料の少なくとも一部を、前記反応受容器内で単離された前記磁気応答性粒子から分離し、それによって、非標的核酸を該試料中に存在し得る標的核酸から分離する工程をさらに包含する、請求項9に記載の方法。
【請求項11】
前記試料中の前記標的核酸の存在または非存在を、該試料中の生物もしくはウイルス、または生物もしくはウイルスの群の1以上のメンバーの存在もしくは非存在の指標として決定する工程をさらに包含する、請求項10に記載の方法。
【請求項12】
前記決定する工程の前に、前記標的ヌクレオチド塩基配列領域を増幅する工程をさらに包含する、請求項11に記載の方法。
【請求項13】
前記コンテナの前記流体媒体は、標的−捕捉手段を含む、請求項1または2に記載の方法。
【請求項14】
前記第一の回転軸の周りで前記コンテナの回転位置をモニターする工程をさらに包含する、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
【請求項15】
前記コンテナを流体移動プローブについての作動位置に位置させるように、前記第一の回転軸および前記第二の回転軸の周りで前記コンテナの移動および回転を選択的に停止させる工程をさらに包含する、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
【請求項16】
前記コンテナの移動および回転を停止させる工程の後に、前記流体移動プローブで前記コンテナの一定量の前記流体媒体を引き出す工程をさらに包含する、請求項15に記載の方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図6A】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図23A】
【図23B】
【図23C】
【図24】
【図25】
【図25A】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29A】
【図29B】
【図29C】
【図29D】
【図30A】
【図30B】
【図30C】
【図30D】
【図31A】
【図31B】
【図31C】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42A】
【図42B】
【図42C】
【図43】
【図44】
【図45】
【図45A】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図6A】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図23A】
【図23B】
【図23C】
【図24】
【図25】
【図25A】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29A】
【図29B】
【図29C】
【図29D】
【図30A】
【図30B】
【図30C】
【図30D】
【図31A】
【図31B】
【図31C】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42A】
【図42B】
【図42C】
【図43】
【図44】
【図45】
【図45A】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【公開番号】特開2008−286804(P2008−286804A)
【公開日】平成20年11月27日(2008.11.27)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2008−169680(P2008−169680)
【出願日】平成20年6月27日(2008.6.27)
【分割の表示】特願2000−547476(P2000−547476)の分割
【原出願日】平成11年4月30日(1999.4.30)
【出願人】(500506530)ジェン−プロウブ インコーポレイテッド (58)
【Fターム(参考)】
【公開日】平成20年11月27日(2008.11.27)
【国際特許分類】
【出願日】平成20年6月27日(2008.6.27)
【分割の表示】特願2000−547476(P2000−547476)の分割
【原出願日】平成11年4月30日(1999.4.30)
【出願人】(500506530)ジェン−プロウブ インコーポレイテッド (58)
【Fターム(参考)】
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