本発明は、ヒドロラーゼ、それをコードするポリヌクレオチド、並びにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを製造および使用する方法を提供する。ある特徴では、本発明は、ポリペプチド（例えばヒドロラーゼ活性（例えばエステラーゼ、アシラーゼ、リパーゼ、ホスホリパーゼ（例えばホスホリパーゼA、B、CおよびD活性、パタチン活性、脂質アシルヒドロラーゼ(LAH)活性）、またはプロテアーゼ活性であり、熱安定性および耐熱性のヒドロラーゼ活性を含む）を有する酵素）、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、並びに、これらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドの製造および使用を対象とする。本発明のポリペプチドおよびペプチドのヒドロラーゼ活性は、エステラーゼ活性、リパーゼ活性（脂質の加水分解）、酸分解反応（エステル化脂肪酸を遊離脂肪酸と交換するための反応）、エステル転移反応（トリグリセリド間の脂肪酸の交換）、エステル合成、エステル交換反応、ホスホリパーゼ活性およびプロテアーゼ活性（ペプチド結合の加水分解）を含む。本発明のポリペプチドは、化粧品および栄養補助食品の製造などを含む広範な薬学、農業、および工業用途に使用し得る。ある特徴では、本発明のポリペプチドはエナンチオマー的に純粋なキラル生成物の合成に使用される。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:29、配列番号:31、配列番号:33、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:39、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:45、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:51、配列番号:53、配列番号:55、配列番号:57、配列番号:59、配列番号:61、配列番号:63、配列番号:65、配列番号:67、配列番号:69、配列番号:71、配列番号:73、配列番号:75、配列番号:77、配列番号:79、配列番号:81、配列番号:83、配列番号:85、配列番号:87、配列番号:89、配列番号:91、配列番号:93、配列番号:95、配列番号:97、配列番号:99、配列番号:101、配列番号:103、配列番号:105、配列番号:107、配列番号:109、配列番号:111、配列番号:113、配列番号:115、配列番号:117、配列番号:119、配列番号:121、配列番号:123、配列番号:125、配列番号:127、配列番号:129、配列番号:131、配列番号:133、配列番号:135、配列番号:137、配列番号:139、配列番号:141、配列番号:143、配列番号:145、配列番号:147、配列番号:149、配列番号:151、配列番号:153、配列番号:155、配列番号:157、配列番号:159、配列番号:161、配列番号:163、配列番号:165、配列番号:167、配列番号:169、配列番号:171、配列番号:173、配列番号:175、配列番号:177、配列番号:179、配列番号:181、配列番号:183、配列番号:185、配列番号:187、配列番号:189、配列番号:191、配列番号:193、配列番号:195、配列番号:197、配列番号:199、配列番号:201、配列番号:203、配列番号:205、配列番号:207、配列番号:209、配列番号:211、配列番号:213、配列番号:215、配列番号:217、配列番号:219、配列番号:221、配列番号:223、配列番号:225、配列番号:227、配列番号:229、配列番号:231、配列番号:233、配列番号:235、配列番号:237、配列番号:239、配列番号:241、配列番号:243、配列番号:245、配列番号:247、配列番号:249、配列番号:251、配列番号:253、配列番号:255、配列番号:257、配列番号:259、配列番号:261、配列番号:263、配列番号:265、配列番号:267、配列番号:269、配列番号:271、配列番号:273、配列番号:275、配列番号:277、配列番号:279、配列番号:281、配列番号:283、配列番号:285、配列番号:287、配列番号:289、配列番号:291、配列番号:293、配列番号:295、配列番号:297、配列番号:299、配列番号:301、配列番号:303、配列番号:305、配列番号:307、配列番号:309、配列番号:311、配列番号:313、配列番号:315、配列番号:317、配列番号:319、配列番号:321、配列番号:323、配列番号:325、配列番号:327、配列番号:329、配列番号:331、配列番号:333、配列番号:335、配列番号:337、配列番号:339、配列番号:341、配列番号:343、配列番号:345、配列番号:347、配列番号:349、配列番号:351、配列番号:353、配列番号:355、配列番号:357、配列番号:359、配列番号:361、配列番号:363、配列番号:365、配列番号:367、配列番号:369、配列番号:371、配列番号:373、配列番号:375、配列番号:377、配列番号:379、配列番号:381、配列番号:383、配列番号:385、配列番号:387、配列番号:389、配列番号:391、配列番号:393、配列番号:395、配列番号:397、配列番号:399、配列番号:401、配列番号:403、配列番号:405、配列番号:407、配列番号:409、配列番号:411、配列番号:413、配列番号:415、配列番号:417、配列番号:419、配列番号:421、配列番号:423、配列番号:425、配列番号:427、配列番号:429、配列番号:431、配列番号:433、配列番号:435、配列番号:437、配列番号:439、配列番号:441、配列番号:443、配列番号:445、配列番号:447、配列番号:449、配列番号:451、配列番号:453、配列番号:455、配列番号:457、配列番号:459、配列番号:461、配列番号:463、配列番号:465、配列番号:467、配列番号:469、配列番号:471、配列番号:473、配列番号:475、配列番号:477、配列番号:479、配列番号:481、配列番号:483、配列番号:485、配列番号:487、配列番号:489、配列番号:491、配列番号:493、配列番号:495、配列番号:497、配列番号:499、配列番号:501、配列番号:503、配列番号:505、配列番号:507、配列番号:509、配列番号:511、配列番号:513、配列番号:515、配列番号:517、配列番号:519、配列番号:521、配列番号:523、配列番号:525、配列番号:527、配列番号:529、配列番号:531、配列番号:533、配列番号:535、配列番号:537、配列番号:539、配列番号:541、配列番号:543、配列番号:545、配列番号:547、配列番号:549、配列番号:551、配列番号:553、配列番号:555、配列番号:557、配列番号:559、配列番号:561、配列番号:563、配列番号:565、配列番号:567、配列番号:569、配列番号:571、配列番号:573、配列番号:575、配列番号:577、配列番号:579、配列番号:581、配列番号:583、配列番号:585、配列番号:587、配列番号:589、配列番号:591、配列番号:593、配列番号:595、配列番号:597、配列番号:599、配列番号:601、配列番号:603、配列番号:605、配列番号:607、配列番号:609、配列番号:611、配列番号:613、配列番号:615、配列番号:617、配列番号:619、配列番号:621、配列番号:623、配列番号:625、配列番号:627、配列番号:629、配列番号:631、配列番号:633、配列番号:635、配列番号:637、配列番号:639、配列番号:641、配列番号:643、配列番号:645、配列番号:647、配列番号:649、配列番号:651、配列番号:653、配列番号:655、配列番号:657、配列番号:659、配列番号:661、配列番号:663、配列番号:665、配列番号:667、配列番号:669、配列番号:671、配列番号:673、配列番号:675、配列番号:677、配列番号:679、配列番号:681、配列番号:683、配列番号:685、配列番号:687、配列番号:689、配列番号:691、配列番号:693、配列番号:695、配列番号:697、配列番号:699、配列番号:701、配列番号:703、配列番号:705、配列番号:707、配列番号:709、配列番号:711、配列番号:713、配列番号:715、配列番号:717、配列番号:719、配列番号:721、配列番号:723、配列番号:725、配列番号:727、配列番号:729、配列番号:731、配列番号:733、配列番号:735、配列番号:737、配列番号:739、配列番号:741、配列番号:743、配列番号:745、配列番号:747、配列番号:749、配列番号:751、配列番号:753、配列番号:755、配列番号:757、配列番号:759、配列番号:761、配列番号:763、配列番号:765、配列番号:767、配列番号:769、配列番号:771、配列番号:773、配列番号:775、配列番号:777、配列番号:779、配列番号:781、配列番号:783、配列番号:785、配列番号:787、配列番号:789、配列番号:791、配列番号:793、配列番号:795、配列番号:797、配列番号:799、配列番号:801、配列番号:803、配列番号:805、配列番号:807、配列番号:809、配列番号:811、配列番号:813、配列番号:815、配列番号:817、配列番号:819、配列番号:821、配列番号:823、配列番号:825、配列番号:827、配列番号:829、配列番号:831、配列番号:833、配列番号:835、配列番号:837、配列番号:839、配列番号:841、配列番号:843、配列番号:845、配列番号:847、配列番号:849、配列番号:851、配列番号:853、配列番号:855、配列番号:857、配列番号:859、配列番号:861、配列番号:863、配列番号:865、配列番号:867、配列番号:869、配列番号:871、配列番号:873、配列番号:875、配列番号:877、配列番号:879、配列番号:881、配列番号:883、配列番号:885、配列番号:887、配列番号:889、配列番号:891、配列番号:893、配列番号:895、配列番号:897、配列番号:899、配列番号:901、配列番号:903、配列番号:905、配列番号:907、配列番号:909、配列番号:911、配列番号:913、配列番号:915、配列番号:917、配列番号:919、配列番号:921、配列番号:923、配列番号:925、配列番号:927、配列番号:929、配列番号:931、配列番号:933、配列番号:935、配列番号:937、配列番号:939、配列番号:941、配列番号:943、配列番号:945、配列番号:947、配列番号:949、配列番号:951または配列番号:953と、少なくとも約100残基の領域にわたって少なくとも50％の配列同一性を有する核酸配列を含む単離または組換え核酸であって、ヒドロラーゼ活性を有する少なくとも1つのポリペプチドをコードし、さらに前記配列同一性が配列比較アルゴリズムを用いる分析によって、または目視精査によって決定される前記核酸。
【請求項２】
配列同一性が少なくとも約51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％の領域にわたる若しくはそれより高い、または100％である、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項３】
配列同一性が、少なくとも約50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050、1100、1150、1200、1250、1300、1350、1400、1450、1500、1550残基若しくはそれより多い残基の領域、または遺伝子若しくは転写物の全長にわたる配列同一性である、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項４】
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:29、配列番号:31、配列番号:33、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:39、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:45、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:51、配列番号:53、配列番号:55、配列番号:57、配列番号:59、配列番号:61、配列番号:63、配列番号:65、配列番号:67、配列番号:69、配列番号:71、配列番号:73、配列番号:75、配列番号:77、配列番号:79、配列番号:81、配列番号:83、配列番号:85、配列番号:87、配列番号:89、配列番号:91、配列番号:93、配列番号:95、配列番号:97、配列番号:99、配列番号:101、配列番号:103、配列番号:105、配列番号:107、配列番号:109、配列番号:111、配列番号:113、配列番号:115、配列番号:117、配列番号:119、配列番号:121、配列番号:123、配列番号:125、配列番号:127、配列番号:129、配列番号:131、配列番号:133、配列番号:135、配列番号:137、配列番号:139、配列番号:141、配列番号:143、配列番号:145、配列番号:147、配列番号:149、配列番号:151、配列番号:153、配列番号:155、配列番号:157、配列番号:159、配列番号:161、配列番号:163、配列番号:165、配列番号:167、配列番号:169、配列番号:171、配列番号:173、配列番号:175、配列番号:177、配列番号:179、配列番号:181、配列番号:183、配列番号:185、配列番号:187、配列番号:189、配列番号:191、配列番号:193、配列番号:195、配列番号:197、配列番号:199、配列番号:201、配列番号:203、配列番号:205、配列番号:207、配列番号:209、配列番号:211、配列番号:213、配列番号:215、配列番号:217、配列番号:219、配列番号:221、配列番号:223、配列番号:225、配列番号:227、配列番号:229、配列番号:231、配列番号:233、配列番号:235、配列番号:237、配列番号:239、配列番号:241、配列番号:243、配列番号:245、配列番号:247、配列番号:249、配列番号:251、配列番号:253、配列番号:255、配列番号:257、配列番号:259、配列番号:261、配列番号:263、配列番号:265、配列番号:267、配列番号:269、配列番号:271、配列番号:273、配列番号:275、配列番号:277、配列番号:279、配列番号:281、配列番号:283、配列番号:285、配列番号:287、配列番号:289、配列番号:291、配列番号:293、配列番号:295、配列番号:297、配列番号:299、配列番号:301、配列番号:303、配列番号:305、配列番号:307、配列番号:309、配列番号:311、配列番号:313、配列番号:315、配列番号:317、配列番号:319、配列番号:321、配列番号:323、配列番号:325、配列番号:327、配列番号:329、配列番号:331、配列番号:333、配列番号:335、配列番号:337、配列番号:339、配列番号:341、配列番号:343、配列番号:345、配列番号:347、配列番号:349、配列番号:351、配列番号:353、配列番号:355、配列番号:357、配列番号:359、配列番号:361、配列番号:363、配列番号:365、配列番号:367、配列番号:369、配列番号:371、配列番号:373、配列番号:375、配列番号:377、配列番号:379、配列番号:381、配列番号:383、配列番号:385、配列番号:387、配列番号:389、配列番号:391、配列番号:393、配列番号:395、配列番号:397、配列番号:399、配列番号:401、配列番号:403、配列番号:405、配列番号:407、配列番号:409、配列番号:411、配列番号:413、配列番号:415、配列番号:417、配列番号:419、配列番号:421、配列番号:423、配列番号:425、配列番号:427、配列番号:429、配列番号:431、配列番号:433、配列番号:435、配列番号:437、配列番号:439、配列番号:441、配列番号:443、配列番号:445、配列番号:447、配列番号:449、配列番号:451、配列番号:453、配列番号:455、配列番号:457、配列番号:459、配列番号:461、配列番号:463、配列番号:465、配列番号:467、配列番号:469、配列番号:471、配列番号:473、配列番号:475、配列番号:477、配列番号:479、配列番号:481、配列番号:483、配列番号:485、配列番号:487、配列番号:489、配列番号:491、配列番号:493、配列番号:495、配列番号:497、配列番号:499、配列番号:501、配列番号:503、配列番号:505、配列番号:507、配列番号:509、配列番号:511、配列番号:513、配列番号:515、配列番号:517、配列番号:519、配列番号:521、配列番号:523、配列番号:525、配列番号:527、配列番号:529、配列番号:531、配列番号:533、配列番号:535、配列番号:537、配列番号:539、配列番号:541、配列番号:543、配列番号:545、配列番号:547、配列番号:549、配列番号:551、配列番号:553、配列番号:555、配列番号:557、配列番号:559、配列番号:561、配列番号:563、配列番号:565、配列番号:567、配列番号:569、配列番号:571、配列番号:573、配列番号:575、配列番号:577、配列番号:579、配列番号:581、配列番号:583、配列番号:585、配列番号:587、配列番号:589、配列番号:591、配列番号:593、配列番号:595、配列番号:597、配列番号:599、配列番号:601、配列番号:603、配列番号:605、配列番号:607、配列番号:609、配列番号:611、配列番号:613、配列番号:615、配列番号:617、配列番号:619、配列番号:621、配列番号:623、配列番号:625、配列番号:627、配列番号:629、配列番号:631、配列番号:633、配列番号:635、配列番号:637、配列番号:639、配列番号:641、配列番号:643、配列番号:645、配列番号:647、配列番号:649、配列番号:651、配列番号:653、配列番号:655、配列番号:657、配列番号:659、配列番号:661、配列番号:663、配列番号:665、配列番号:667、配列番号:669、配列番号:671、配列番号:673、配列番号:675、配列番号:677、配列番号:679、配列番号:681、配列番号:683、配列番号:685、配列番号:687、配列番号:689、配列番号:691、配列番号:693、配列番号:695、配列番号:697、配列番号:699、配列番号:701、配列番号:703、配列番号:705、配列番号:707、配列番号:709、配列番号:711、配列番号:713、配列番号:715、配列番号:717、配列番号:719、配列番号:721、配列番号:723、配列番号:725、配列番号:727、配列番号:729、配列番号:731、配列番号:733、配列番号:735、配列番号:737、配列番号:739、配列番号:741、配列番号:743、配列番号:745、配列番号:747、配列番号:749、配列番号:751、配列番号:753、配列番号:755、配列番号:757、配列番号:759、配列番号:761、配列番号:763、配列番号:765、配列番号:767、配列番号:769、配列番号:771、配列番号:773、配列番号:775、配列番号:777、配列番号:779、配列番号:781、配列番号:783、配列番号:785、配列番号:787、配列番号:789、配列番号:791、配列番号:793、配列番号:795、配列番号:797、配列番号:799、配列番号:801、配列番号:803、配列番号:805、配列番号:807、配列番号:809、配列番号:811、配列番号:813、配列番号:815、配列番号:817、配列番号:819、配列番号:821、配列番号:823、配列番号:825、配列番号:827、配列番号:829、配列番号:831、配列番号:833、配列番号:835、配列番号:837、配列番号:839、配列番号:841、配列番号:843、配列番号:845、配列番号:847、配列番号:849、配列番号:851、配列番号:853、配列番号:855、配列番号:857、配列番号:859、配列番号:861、配列番号:863、配列番号:865、配列番号:867、配列番号:869、配列番号:871、配列番号:873、配列番号:875、配列番号:877、配列番号:879、配列番号:881、配列番号:883、配列番号:885、配列番号:887、配列番号:889、配列番号:891、配列番号:893、配列番号:895、配列番号:897、配列番号:899、配列番号:901、配列番号:903、配列番号:905、配列番号:907、配列番号:909、配列番号:911、配列番号:913、配列番号:915、配列番号:917、配列番号:919、配列番号:921、配列番号:923、配列番号:925、配列番号:927、配列番号:929、配列番号:931、配列番号:933、配列番号:935、配列番号:937、配列番号:939、配列番号:941、配列番号:943、配列番号:945、配列番号:947、配列番号:949、配列番号:951または配列番号:953記載の配列を含む、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項５】
配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26、配列番号:28、配列番号:30、配列番号:32、配列番号:34、配列番号:36、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:42、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:48、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:54、配列番号:56、配列番号:58、配列番号:60、配列番号:62、配列番号:64、配列番号:66、配列番号:68、配列番号:70、配列番号:72、配列番号:74、配列番号:76、配列番号:78、配列番号:80、配列番号:82、配列番号:84、配列番号:86、配列番号:88、配列番号:90、配列番号:92、配列番号:94、配列番号:96、配列番号:98、配列番号:100、配列番号:102、配列番号:104、配列番号:106、配列番号:108、配列番号:110、配列番号:112、配列番号:114、配列番号:116、配列番号:118、配列番号:120、配列番号:122、配列番号:124、配列番号:126、配列番号:128、配列番号:130、配列番号:132、配列番号:134、配列番号:136、配列番号:138、配列番号:140、配列番号:142、配列番号:143、配列番号:146、配列番号:148、配列番号:150、配列番号:152、配列番号:154、配列番号:156、配列番号:158、配列番号:160、配列番号:162、配列番号:164、配列番号:166、配列番号:168、配列番号:170、配列番号:172、配列番号:174、配列番号:176、配列番号:178、配列番号:180、配列番号:182、配列番号:184、配列番号:186、配列番号:188、配列番号:190、配列番号:192、配列番号:194、配列番号:196、配列番号:198、配列番号:200、配列番号:202、配列番号:204、配列番号:206、配列番号:208、配列番号:210、配列番号:212、配列番号:214、配列番号:216、配列番号:218、配列番号:220、配列番号:222、配列番号:224、配列番号:226、配列番号:228、配列番号:230、配列番号:232、配列番号:234、配列番号:236、配列番号:238、配列番号:240、配列番号:242、配列番号:244、配列番号:246、配列番号:248、配列番号:250、配列番号:252、配列番号:254、配列番号:256、配列番号:258、配列番号:260、配列番号:262、配列番号:264、配列番号:266、配列番号:268、配列番号:270、配列番号:272、配列番号:274、配列番号:276、配列番号:278、配列番号:280、配列番号:282、配列番号:284、配列番号:286、配列番号:288、配列番号:290、配列番号:292、配列番号:294、配列番号:296、配列番号:298、配列番号:300、配列番号:302、配列番号:304、配列番号:306、配列番号:308、配列番号:310、配列番号:312、配列番号:314、配列番号:316、配列番号:318、配列番号:320、配列番号:322、配列番号:324、配列番号:326、配列番号:328、配列番号:330、配列番号:332、配列番号:334、配列番号:336、配列番号:338、配列番号:340、配列番号:342、配列番号:344、配列番号:346、配列番号:348、配列番号:350、配列番号:352、配列番号:354、配列番号:356、配列番号:358、配列番号:360、配列番号:362、配列番号:364、配列番号:366、配列番号:368、配列番号:370、配列番号:372、配列番号:374、配列番号:376、配列番号:378、配列番号:380、配列番号:382、配列番号:384、配列番号:386、配列番号:388、配列番号:390、配列番号:392、配列番号:394、配列番号:396、配列番号:398、配列番号:400、配列番号:402、配列番号:404、配列番号:406、配列番号:408、配列番号:410、配列番号:412、配列番号:414、配列番号:416、配列番号:418、配列番号:420、配列番号:422、配列番号:424、配列番号:426、配列番号:428、配列番号:430、配列番号:432、配列番号:434、配列番号:436、配列番号:438、配列番号:440、配列番号:442、配列番号:444、配列番号:446、配列番号:448、配列番号:450、配列番号:452、配列番号:454、配列番号:456、配列番号:458、配列番号:460、配列番号:462、配列番号:464、配列番号:466、配列番号:468、配列番号:470、配列番号:472、配列番号:474、配列番号:476、配列番号:478、配列番号:480、配列番号:482、配列番号:484、配列番号:486、配列番号:488、配列番号:490、配列番号:492、配列番号:494、配列番号:496、配列番号:498、配列番号:500、配列番号:502、配列番号:504、配列番号:506、配列番号:508、配列番号:510、配列番号:512、配列番号:514、配列番号:516、配列番号:518、配列番号:520、配列番号:522、配列番号:524、配列番号:526、配列番号:528、配列番号:530、配列番号:532、配列番号:534、配列番号:536、配列番号:538、配列番号:540、配列番号:542、配列番号:544、配列番号:546、配列番号:548、配列番号:550、配列番号:552、配列番号:554、配列番号:556、配列番号:558、配列番号:560、配列番号:562、配列番号:564、配列番号:566、配列番号:568、配列番号:570、配列番号:572、配列番号:574、配列番号:576、配列番号:578、配列番号:580、配列番号:582、配列番号:584、配列番号:586、配列番号:588、配列番号:590、配列番号:592、配列番号:594、配列番号:596、配列番号:598、配列番号:600、配列番号:602、配列番号:604、配列番号:606、配列番号:608、配列番号:610、配列番号:612、配列番号:614、配列番号:616、配列番号:618、配列番号:620、配列番号:622、配列番号:624、配列番号:626、配列番号:628、配列番号:630、配列番号:632、配列番号:634、配列番号:636、配列番号:638、配列番号:640、配列番号:642、配列番号:644、配列番号:646、配列番号:648、配列番号:650、配列番号:652、配列番号:654、配列番号:656、配列番号:658、配列番号:660、配列番号:662、配列番号:664、配列番号:666、配列番号:668、配列番号:670、配列番号:672、配列番号:674、配列番号:676、配列番号:678、配列番号:680、配列番号:682、配列番号:684、配列番号:686、配列番号:688、配列番号:690、配列番号:692、配列番号:694、配列番号:696、配列番号:698、配列番号:700、配列番号:702、配列番号:704、配列番号:706、配列番号:708、配列番号:710、配列番号:712、配列番号:714、配列番号:716、配列番号:718、配列番号:720、配列番号:722、配列番号:724、配列番号:726、配列番号:728、配列番号:730、配列番号:732、配列番号:734、配列番号:736、配列番号:738、配列番号:740、配列番号:742、配列番号:744、配列番号:746、配列番号:748、配列番号:750、配列番号:752、配列番号:754、配列番号:756、配列番号:758、配列番号:760、配列番号:762、配列番号:764、配列番号:766、配列番号:768、配列番号:770、配列番号:772、配列番号:774、配列番号:776、配列番号:778、配列番号:780、配列番号:782、配列番号:784、配列番号:786、配列番号:788、配列番号:790、配列番号:792、配列番号:794、配列番号:796、配列番号:798、配列番号:800、配列番号:802、配列番号:804、配列番号:808、配列番号:808、配列番号:810、配列番号:812、配列番号:814、配列番号:816、配列番号:818、配列番号:820、配列番号:822、配列番号:824、配列番号:826、配列番号:828、配列番号:830、配列番号:832、配列番号:834、配列番号:836、配列番号:838、配列番号:840、配列番号:842、配列番号:844、配列番号:846、配列番号:848、配列番号:850、配列番号:852、配列番号:854、配列番号:856、配列番号:858、配列番号:860、配列番号:862、配列番号:864、配列番号:866、配列番号:868、配列番号:870、配列番号:872、配列番号:874、配列番号:876、配列番号:878、配列番号:880、配列番号:882、配列番号:884、配列番号:886、配列番号:888、配列番号:890、配列番号:892、配列番号:894、配列番号:896、配列番号:898、配列番号:900、配列番号:902、配列番号:904、配列番号:906、配列番号:908、配列番号:910、配列番号:912、配列番号:914、配列番号:916、配列番号:918、配列番号:920、配列番号:922、配列番号:924、配列番号:926、配列番号:928、配列番号:930、配列番号:932、配列番号:934、配列番号:936、配列番号:938、配列番号:940、配列番号:942、配列番号:944、配列番号:946、配列番号:948、配列番号:950、配列番号:952または配列番号:954記載の配列を有するポリペプチドをコードする、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項６】
配列比較アルゴリズムがBLAST Ver.2.2.2アルゴリズムであって、フィルタリング設定がblastall -p blastp -d “nr pataa” -F Fに設定され、他のオプションが規定値に設定されている、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項７】
ヒドロラーゼ活性がリパーゼ活性、プロテアーゼ活性、エステラーゼ活性またはホスホリパーゼ活性を含む、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項８】
リパーゼ活性が、トリアシルグリセロールをジアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、トリアシルグリセロールをモノアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、ジアシルグリセロールをモノアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、モノアシルグリセロールを遊離脂肪酸とグリセロールに加水分解することを含む、あるいは、トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を加水分解することを含む、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項９】
リパーゼ活性が、ジアシルグリセロールまたはモノアシルグリセロール、および遊離脂肪酸とからトリアシルグリセロールを合成することを含む、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１０】
リパーゼ活性が、1,3-ジパルミトイル-2-オレオイルグリセロール(POP)、1,3-ジステアロイル-2-オレオイルグリセロール(SOS)、1-ジパルミトイル-2-オレオイル-3-ステアロイルグリセロール(POS)もしくは1-オレオイル-2,3-ジミリストイルグリセロール(OMM)、長鎖ポリ不飽和脂肪酸、アラキドン酸、ドコサヘキサエン酸(DHA)またはエイコサペンタエン酸(EPA)を合成することを含む、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１１】
リパーゼ活性がトリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)位置特異的である、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１２】
リパーゼ活性がSn2-特異的、Sn1-またはSn3-特異的である、請求項１１記載の単離または組換え核酸。
【請求項１３】
リパーゼ活性が脂肪酸特異的である、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１４】
リパーゼ活性が、加水分解、アルコール分解、エステル化、エステル転移またはエステル交換によって油を改変することを含む、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１５】
リパーゼ活性が位置特異的または化学選択的である、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１６】
リパーゼ活性が、エナンチオマー的に純粋なキラル生成物を合成することを含む、請求項１５記載の単離または組換え核酸。
【請求項１７】
リパーゼ活性がウンベリフェリル脂肪酸(FA)エステルを合成することを含む、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１８】
ヒドロラーゼ活性が熱安定性である、請求項７記載の単離または組換え核酸。
【請求項１９】
ポリペプチドが約37℃〜約95℃、約55℃〜約85℃、約70℃〜約95℃または約90℃〜約95℃の温度範囲を含む条件下でリパーゼ活性を維持する、請求項１８記載の単離または組換え核酸。
【請求項２０】
ヒドロラーゼ活性が耐熱性である、請求項１記載の単離または組換え核酸。
【請求項２１】
ポリペプチドが、37℃より高い温度から約95℃、55℃より高い温度から約85℃、または90℃よりも高い温度から約95℃の範囲の温度に曝露した後にヒドロラーゼ活性を維持する、請求項２０記載の単離または組換え核酸。
【請求項２２】
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【請求項２３】
核酸が少なくとも長さ約50、75、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000若しくはそれより多い残基、または遺伝子若しくは転写物の完全長である、請求項２３記載の単離または組換え核酸。
【請求項２４】
ストリンジェントな条件が、0.2 x SSC中で約65℃にて約15分間の洗浄を含む洗浄工程を含む、請求項２２記載の単離または組換え核酸。
【請求項２５】
請求項１記載の配列の少なくとも10の連続する塩基を含み、結合またはハイブリダイゼーションによってヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を同定するための核酸プローブ。
【請求項２６】
少なくとも約10〜50、約20〜60、約30〜70、約40〜80、約60〜100または約50〜150の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、請求項２５記載の核酸プローブ。
【請求項２７】
ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を同定するための核酸プローブであって、前記プローブが、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:29、配列番号:31、配列番号:33、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:39、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:45、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:51、配列番号:53、配列番号:55、配列番号:57、配列番号:59、配列番号:61、配列番号:63、配列番号:65、配列番号:67、配列番号:69、配列番号:71、配列番号:73、配列番号:75、配列番号:77、配列番号:79、配列番号:81、配列番号:83、配列番号:85、配列番号:87、配列番号:89、配列番号:91、配列番号:93、配列番号:95、配列番号:97、配列番号:99、配列番号:101、配列番号:103、配列番号:105、配列番号:107、配列番号:109、配列番号:111、配列番号:113、配列番号:115、配列番号:117、配列番号:119、配列番号:121、配列番号:123、配列番号:125、配列番号:127、配列番号:129、配列番号:131、配列番号:133、配列番号:135、配列番号:137、配列番号:139、配列番号:141、配列番号:143、配列番号:145、配列番号:147、配列番号:149、配列番号:151、配列番号:153、配列番号:155、配列番号:157、配列番号:159、配列番号:161、配列番号:163、配列番号:165、配列番号:167、配列番号:169、配列番号:171、配列番号:173、配列番号:175、配列番号:177、配列番号:179、配列番号:181、配列番号:183、配列番号:185、配列番号:187、配列番号:189、配列番号:191、配列番号:193、配列番号:195、配列番号:197、配列番号:199、配列番号:201、配列番号:203、配列番号:205、配列番号:207、配列番号:209、配列番号:211、配列番号:213、配列番号:215、配列番号:217、配列番号:219、配列番号:221、配列番号:223、配列番号:225、配列番号:227、配列番号:229、配列番号:231、配列番号:233、配列番号:235、配列番号:237、配列番号:239、配列番号:241、配列番号:243、配列番号:245、配列番号:247、配列番号:249、配列番号:251、配列番号:253、配列番号:255、配列番号:257、配列番号:259、配列番号:261、配列番号:263、配列番号:265、配列番号:267、配列番号:269、配列番号:271、配列番号:273、配列番号:275、配列番号:277、配列番号:279、配列番号:281、配列番号:283、配列番号:285、配列番号:287、配列番号:289、配列番号:291、配列番号:293、配列番号:295、配列番号:297、配列番号:299、配列番号:301、配列番号:303、配列番号:305、配列番号:307、配列番号:309、配列番号:311、配列番号:313、配列番号:315、配列番号:317、配列番号:319、配列番号:321、配列番号:323、配列番号:325、配列番号:327、配列番号:329、配列番号:331、配列番号:333、配列番号:335、配列番号:337、配列番号:339、配列番号:341、配列番号:343、配列番号:345、配列番号:347、配列番号:349、配列番号:351、配列番号:353、配列番号:355、配列番号:357、配列番号:359、配列番号:361、配列番号:363、配列番号:365、配列番号:367、配列番号:369、配列番号:371、配列番号:373、配列番号:375、配列番号:377、配列番号:379、配列番号:381、配列番号:383、配列番号:385、配列番号:387、配列番号:389、配列番号:391、配列番号:393、配列番号:395、配列番号:397、配列番号:399、配列番号:401、配列番号:403、配列番号:405、配列番号:407、配列番号:409、配列番号:411、配列番号:413、配列番号:415、配列番号:417、配列番号:419、配列番号:421、配列番号:423、配列番号:425、配列番号:427、配列番号:429、配列番号:431、配列番号:433、配列番号:435、配列番号:437、配列番号:439、配列番号:441、配列番号:443、配列番号:445、配列番号:447、配列番号:449、配列番号:451、配列番号:453、配列番号:455、配列番号:457、配列番号:459、配列番号:461、配列番号:463、配列番号:465、配列番号:467、配列番号:469、配列番号:471、配列番号:473、配列番号:475、配列番号:477、配列番号:479、配列番号:481、配列番号:483、配列番号:485、配列番号:487、配列番号:489、配列番号:491、配列番号:493、配列番号:495、配列番号:497、配列番号:499、配列番号:501、配列番号:503、配列番号:505、配列番号:507、配列番号:509、配列番号:511、配列番号:513、配列番号:515、配列番号:517、配列番号:519、配列番号:521、配列番号:523、配列番号:525、配列番号:527、配列番号:529、配列番号:531、配列番号:533、配列番号:535、配列番号:537、配列番号:539、配列番号:541、配列番号:543、配列番号:545、配列番号:547、配列番号:549、配列番号:551、配列番号:553、配列番号:555、配列番号:557、配列番号:559、配列番号:561、配列番号:563、配列番号:565、配列番号:567、配列番号:569、配列番号:571、配列番号:573、配列番号:575、配列番号:577、配列番号:579、配列番号:581、配列番号:583、配列番号:585、配列番号:587、配列番号:589、配列番号:591、配列番号:593、配列番号:595、配列番号:597、配列番号:599、配列番号:601、配列番号:603、配列番号:605、配列番号:607、配列番号:609、配列番号:611、配列番号:613、配列番号:615、配列番号:617、配列番号:619、配列番号:621、配列番号:623、配列番号:625、配列番号:627、配列番号:629、配列番号:631、配列番号:633、配列番号:635、配列番号:637、配列番号:639、配列番号:641、配列番号:643、配列番号:645、配列番号:647、配列番号:649、配列番号:651、配列番号:653、配列番号:655、配列番号:657、配列番号:659、配列番号:661、配列番号:663、配列番号:665、配列番号:667、配列番号:669、配列番号:671、配列番号:673、配列番号:675、配列番号:677、配列番号:679、配列番号:681、配列番号:683、配列番号:685、配列番号:687、配列番号:689、配列番号:691、配列番号:693、配列番号:695、配列番号:697、配列番号:699、配列番号:701、配列番号:703、配列番号:705、配列番号:707、配列番号:709、配列番号:711、配列番号:713、配列番号:715、配列番号:717、配列番号:719、配列番号:721、配列番号:723、配列番号:725、配列番号:727、配列番号:729、配列番号:731、配列番号:733、配列番号:735、配列番号:737、配列番号:739、配列番号:741、配列番号:743、配列番号:745、配列番号:747、配列番号:749、配列番号:751、配列番号:753、配列番号:755、配列番号:757、配列番号:759、配列番号:761、配列番号:763、配列番号:765、配列番号:767、配列番号:769、配列番号:771、配列番号:773、配列番号:775、配列番号:777、配列番号:779、配列番号:781、配列番号:783、配列番号:785、配列番号:787、配列番号:789、配列番号:791、配列番号:793、配列番号:795、配列番号:797、配列番号:799、配列番号:801、配列番号:803、配列番号:805、配列番号:807、配列番号:809、配列番号:811、配列番号:813、配列番号:815、配列番号:817、配列番号:819、配列番号:821、配列番号:823、配列番号:825、配列番号:827、配列番号:829、配列番号:831、配列番号:833、配列番号:835、配列番号:837、配列番号:839、配列番号:841、配列番号:843、配列番号:845、配列番号:847、配列番号:849、配列番号:851、配列番号:853、配列番号:855、配列番号:857、配列番号:859、配列番号:861、配列番号:863、配列番号:865、配列番号:867、配列番号:869、配列番号:871、配列番号:873、配列番号:875、配列番号:877、配列番号:879、配列番号:881、配列番号:883、配列番号:885、配列番号:887、配列番号:889、配列番号:891、配列番号:893、配列番号:895、配列番号:897、配列番号:899、配列番号:901、配列番号:903、配列番号:905、配列番号:907、配列番号:909、配列番号:911、配列番号:913、配列番号:915、配列番号:917、配列番号:919、配列番号:921、配列番号:923、配列番号:925、配列番号:927、配列番号:929、配列番号:931、配列番号:933、配列番号:935、配列番号:937、配列番号:939、配列番号:941、配列番号:943、配列番号:945、配列番号:947、配列番号:949、配列番号:951または配列番号:953の少なくとも約10の連続する塩基を含む核酸を含み、前記配列同一性が配列比較アルゴリズムによる分析または目視精査によって決定される前記核酸プローブ。
【請求項２８】
少なくとも約10〜50、約20〜60、約30〜70、約40〜80、約60〜100または約50〜150の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、請求項２７記載の核酸プローブ。
【請求項２９】
請求項１または２２記載の配列を含む核酸またはその部分配列を増幅することのできる、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を増幅するための増幅プライマー配列対。
【請求項３０】
増幅プライマー配列対の各構成プライマーが、前記配列の約10〜50の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、請求項２９記載の増幅プライマー対。
【請求項３１】
請求項１若しくは請求項２２記載の核酸配列またはその部分配列を増幅することのできる増幅プライマー配列対で鋳型核酸を増幅することを含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を増幅する方法。
【請求項３２】
請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸を含む発現カセット。
【請求項３３】
請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸を含むベクター。
【請求項３４】
ウイルスベクター、プラスミド、ファージ、ファージミド、コスミド、フォスミド、バクテリオファージまたは人工染色体を含む、請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸を含むクローニングビヒクル。
【請求項３５】
ウイルスベクターがアデノウイルスベクター、レトロウイルスベクターまたはアデノ随伴ウイルスベクターを含む、請求項３４記載のクローニングビヒクル。
【請求項３６】
細菌人工染色体（BAC）、プラスミド、バクテリオファージP1-誘導体ベクター(PAC)、酵母人工染色体(YAC)、哺乳動物人工染色体(MAC)を含む、請求項３４記載のクローニングビヒクル。
【請求項３７】
請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸を含む形質転換細胞。
【請求項３８】
請求項３２記載の発現カセットを含む形質転換細胞。
【請求項３９】
バクテリア細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または植物細胞である、請求項３７または請求項３８記載の形質転換細胞。
【請求項４０】
請求項１または請求項２２記載の配列を含む非ヒトトランスジェニック哺乳動物。
【請求項４１】
マウスである、請求項４０記載の非ヒトトランスジェニック哺乳動物。
【請求項４２】
請求項１または請求項２２記載の配列を含むトランスジェニック植物。
【請求項４３】
トウモロコシ、モロコシ、ジャガイモ、トマト、コムギ、油糧種子植物、ナタネ、ダイズ、イネ、オオムギ、草本、またはタバコである、請求項４２記載のトランスジェニック植物。
【請求項４４】
請求項１または請求項２２記載の配列を含むトランスジェニック種子。
【請求項４５】
種子が、イネ、トウモロコシ種子、コムギ核、油糧種子、ナタネ種子、ヤシ核、ヒマワリ種子、ゴマ種子、コメ、オオムギ、ラッカセイ、タバコ種子である、請求項４４記載のトランスジェニック種子。
【請求項４６】
請求項１若しくは請求項２２記載の配列またはその部分配列に相補的またはストリンジェントな条件下でハイブリダイズすることのできる核酸配列を含む、アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項４７】
約10〜50、約20〜60、約30〜70、約40〜80または約60〜100塩基長である、請求項４６記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項４８】
請求項１若しくは請求項２２記載の配列に相補的またはストリンジェントな条件下でハイブリダイズすることのできる核酸配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを細胞に導入するまたは細胞中で発現させることを含む、細胞中のヒドロラーゼメッセージの翻訳を阻害する方法。
【請求項４９】
請求項１または請求項２２記載の配列の部分配列を含む二本鎖阻害性RNA(RNAi)分子。
【請求項５０】
約15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25またはそれより長い二重鎖ヌクレオチド長である、請求項４９記載の二本鎖阻害性RNA(RNAi)分子。
【請求項５１】
請求項１または請求項２２記載の配列の部分配列を含む二本鎖阻害性RNA(RNAi)分子を細胞に投与するまたは細胞内で発現させることを含む、細胞におけるヒドロラーゼの発現を阻害する方法。
【請求項５２】
（i）配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26、配列番号:28、配列番号:30、配列番号:32、配列番号:34、配列番号:36、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:42、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:48、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:54、配列番号:56、配列番号:58、配列番号:60、配列番号:62、配列番号:64、配列番号:66、配列番号:68、配列番号:70、配列番号:72、配列番号:74、配列番号:76、配列番号:78、配列番号:80、配列番号:82、配列番号:84、配列番号:86、配列番号:88、配列番号:90、配列番号:92、配列番号:94、配列番号:96、配列番号:98、配列番号:100、配列番号:102、配列番号:104、配列番号:106、配列番号:108、配列番号:110、配列番号:112、配列番号:114、配列番号:116、配列番号:118、配列番号:120、配列番号:122、配列番号:124、配列番号:126、配列番号:128、配列番号:130、配列番号:132、配列番号:134、配列番号:136、配列番号:138、配列番号:140、配列番号:142、配列番号:143、配列番号:146、配列番号:148、配列番号:150、配列番号:152、配列番号:154、配列番号:156、配列番号:158、配列番号:160、配列番号:162、配列番号:164、配列番号:166、配列番号:168、配列番号:170、配列番号:172、配列番号:174、配列番号:176、配列番号:178、配列番号:180、配列番号:182、配列番号:184、配列番号:186、配列番号:188、配列番号:190、配列番号:192、配列番号:194、配列番号:196、配列番号:198、配列番号:200、配列番号:202、配列番号:204、配列番号:206、配列番号:208、配列番号:210、配列番号:212、配列番号:214、配列番号:216、配列番号:218、配列番号:220、配列番号:222、配列番号:224、配列番号:226、配列番号:228、配列番号:230、配列番号:232、配列番号:234、配列番号:236、配列番号:238、配列番号:240、配列番号:242、配列番号:244、配列番号:246、配列番号:248、配列番号:250、配列番号:252、配列番号:254、配列番号:256、配列番号:258、配列番号:260、配列番号:262、配列番号:264、配列番号:266、配列番号:268、配列番号:270、配列番号:272、配列番号:274、配列番号:276、配列番号:278、配列番号:280、配列番号:282、配列番号:284、配列番号:286、配列番号:288、配列番号:290、配列番号:292、配列番号:294、配列番号:296、配列番号:298、配列番号:300、配列番号:302、配列番号:304、配列番号:306、配列番号:308、配列番号:310、配列番号:312、配列番号:314、配列番号:316、配列番号:318、配列番号:320、配列番号:322、配列番号:324、配列番号:326、配列番号:328、配列番号:330、配列番号:332、配列番号:334、配列番号:336、配列番号:338、配列番号:340、配列番号:342、配列番号:344、配列番号:346、配列番号:348、配列番号:350、配列番号:352、配列番号:354、配列番号:356、配列番号:358、配列番号:360、配列番号:362、配列番号:364、配列番号:366、配列番号:368、配列番号:370、配列番号:372、配列番号:374、配列番号:376、配列番号:378、配列番号:380、配列番号:382、配列番号:384、配列番号:386、配列番号:388、配列番号:390、配列番号:392、配列番号:394、配列番号:396、配列番号:398、配列番号:400、配列番号:402、配列番号:404、配列番号:406、配列番号:408、配列番号:410、配列番号:412、配列番号:414、配列番号:416、配列番号:418、配列番号:420、配列番号:422、配列番号:424、配列番号:426、配列番号:428、配列番号:430、配列番号:432、配列番号:434、配列番号:436、配列番号:438、配列番号:440、配列番号:442、配列番号:444、配列番号:446、配列番号:448、配列番号:450、配列番号:452、配列番号:454、配列番号:456、配列番号:458、配列番号:460、配列番号:462、配列番号:464、配列番号:466、配列番号:468、配列番号:470、配列番号:472、配列番号:474、配列番号:476、配列番号:478、配列番号:480、配列番号:482、配列番号:484、配列番号:486、配列番号:488、配列番号:490、配列番号:492、配列番号:494、配列番号:496、配列番号:498、配列番号:500、配列番号:502、配列番号:504、配列番号:506、配列番号:508、配列番号:510、配列番号:512、配列番号:514、配列番号:516、配列番号:518、配列番号:520、配列番号:522、配列番号:524、配列番号:526、配列番号:528、配列番号:530、配列番号:532、配列番号:534、配列番号:536、配列番号:538、配列番号:540、配列番号:542、配列番号:544、配列番号:546、配列番号:548、配列番号:550、配列番号:552、配列番号:554、配列番号:556、配列番号:558、配列番号:560、配列番号:562、配列番号:564、配列番号:566、配列番号:568、配列番号:570、配列番号:572、配列番号:574、配列番号:576、配列番号:578、配列番号:580、配列番号:582、配列番号:584、配列番号:586、配列番号:588、配列番号:590、配列番号:592、配列番号:594、配列番号:596、配列番号:598、配列番号:600、配列番号:602、配列番号:604、配列番号:606、配列番号:608、配列番号:610、配列番号:612、配列番号:614、配列番号:616、配列番号:618、配列番号:620、配列番号:622、配列番号:624、配列番号:626、配列番号:628、配列番号:630、配列番号:632、配列番号:634、配列番号:636、配列番号:638、配列番号:640、配列番号:642、配列番号:644、配列番号:646、配列番号:648、配列番号:650、配列番号:652、配列番号:654、配列番号:656、配列番号:658、配列番号:660、配列番号:662、配列番号:664、配列番号:666、配列番号:668、配列番号:670、配列番号:672、配列番号:674、配列番号:676、配列番号:678、配列番号:680、配列番号:682、配列番号:684、配列番号:686、配列番号:688、配列番号:690、配列番号:692、配列番号:694、配列番号:696、配列番号:698、配列番号:700、配列番号:702、配列番号:704、配列番号:706、配列番号:708、配列番号:710、配列番号:712、配列番号:714、配列番号:716、配列番号:718、配列番号:720、配列番号:722、配列番号:724、配列番号:726、配列番号:728、配列番号:730、配列番号:732、配列番号:734、配列番号:736、配列番号:738、配列番号:740、配列番号:742、配列番号:744、配列番号:746、配列番号:748、配列番号:750、配列番号:752、配列番号:754、配列番号:756、配列番号:758、配列番号:760、配列番号:762、配列番号:764、配列番号:766、配列番号:768、配列番号:770、配列番号:772、配列番号:774、配列番号:776、配列番号:778、配列番号:780、配列番号:782、配列番号:784、配列番号:786、配列番号:788、配列番号:790、配列番号:792、配列番号:794、配列番号:796、配列番号:798、配列番号:800、配列番号:802、配列番号:804、配列番号:808、配列番号:808、配列番号:810、配列番号:812、配列番号:814、配列番号:816、配列番号:818、配列番号:820、配列番号:822、配列番号:824、配列番号:826、配列番号:828、配列番号:830、配列番号:832、配列番号:834、配列番号:836、配列番号:838、配列番号:840、配列番号:842、配列番号:844、配列番号:846、配列番号:848、配列番号:850、配列番号:852、配列番号:854、配列番号:856、配列番号:858、配列番号:860、配列番号:862、配列番号:864、配列番号:866、配列番号:868、配列番号:870、配列番号:872、配列番号:874、配列番号:876、配列番号:878、配列番号:880、配列番号:882、配列番号:884、配列番号:886、配列番号:888、配列番号:890、配列番号:892、配列番号:894、配列番号:896、配列番号:898、配列番号:900、配列番号:902、配列番号:904、配列番号:906、配列番号:908、配列番号:910、配列番号:912、配列番号:914、配列番号:916、配列番号:918、配列番号:920、配列番号:922、配列番号:924、配列番号:926、配列番号:928、配列番号:930、配列番号:932、配列番号:934、配列番号:936、配列番号:938、配列番号:940、配列番号:942、配列番号:944、配列番号:946、配列番号:948、配列番号:950、配列番号:952または配列番号:954と少なくとも約100残基の領域にわたって少なくとも50％の配列同一性を有する（前記配列同一性は配列比較アルゴリズムを用いる分析によって、または目視精査によって決定される）；または、
（ii）請求項１または請求項２２記載の核酸によってコードされる、
単離または組換えポリペプチド。
【請求項５３】
配列同一性が、少なくとも約51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い領域にわたる、または100％の配列同一性である請求項５２に記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５４】
配列同一性が、少なくとも酵素の約10、15、20、25、30、35、40、45、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050残基またはそれより多い残基領域、または酵素の全長にわたる、請求項５２記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５５】
配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26、配列番号:28、配列番号:30、配列番号:32、配列番号:34、配列番号:36、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:42、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:48、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:54、配列番号:56、配列番号:58、配列番号:60、配列番号:62、配列番号:64、配列番号:66、配列番号:68、配列番号:70、配列番号:72、配列番号:74、配列番号:76、配列番号:78、配列番号:80、配列番号:82、配列番号:84、配列番号:86、配列番号:88、配列番号:90、配列番号:92、配列番号:94、配列番号:96、配列番号:98、配列番号:100、配列番号:102、配列番号:104、配列番号:106、配列番号:108、配列番号:110、配列番号:112、配列番号:114、配列番号:116、配列番号:118、配列番号:120、配列番号:122、配列番号:124、配列番号:126、配列番号:128、配列番号:130、配列番号:132、配列番号:134、配列番号:136、配列番号:138、配列番号:140、配列番号:142、配列番号:143、配列番号:146、配列番号:148、配列番号:150、配列番号:152、配列番号:154、配列番号:156、配列番号:158、配列番号:160、配列番号:162、配列番号:164、配列番号:166、配列番号:168、配列番号:170、配列番号:172、配列番号:174、配列番号:176、配列番号:178、配列番号:180、配列番号:182、配列番号:184、配列番号:186、配列番号:188、配列番号:190、配列番号:192、配列番号:194、配列番号:196、配列番号:198、配列番号:200、配列番号:202、配列番号:204、配列番号:206、配列番号:208、配列番号:210、配列番号:212、配列番号:214、配列番号:216、配列番号:218、配列番号:220、配列番号:222、配列番号:224、配列番号:226、配列番号:228、配列番号:230、配列番号:232、配列番号:234、配列番号:236、配列番号:238、配列番号:240、配列番号:242、配列番号:244、配列番号:246、配列番号:248、配列番号:250、配列番号:252、配列番号:254、配列番号:256、配列番号:258、配列番号:260、配列番号:262、配列番号:264、配列番号:266、配列番号:268、配列番号:270、配列番号:272、配列番号:274、配列番号:276、配列番号:278、配列番号:280、配列番号:282、配列番号:284、配列番号:286、配列番号:288、配列番号:290、配列番号:292、配列番号:294、配列番号:296、配列番号:298、配列番号:300、配列番号:302、配列番号:304、配列番号:306、配列番号:308、配列番号:310、配列番号:312、配列番号:314、配列番号:316、配列番号:318、配列番号:320、配列番号:322、配列番号:324、配列番号:326、配列番号:328、配列番号:330、配列番号:332、配列番号:334、配列番号:336、配列番号:338、配列番号:340、配列番号:342、配列番号:344、配列番号:346、配列番号:348、配列番号:350、配列番号:352、配列番号:354、配列番号:356、配列番号:358、配列番号:360、配列番号:362、配列番号:364、配列番号:366、配列番号:368、配列番号:370、配列番号:372、配列番号:374、配列番号:376、配列番号:378、配列番号:380、配列番号:382、配列番号:384、配列番号:386、配列番号:388、配列番号:390、配列番号:392、配列番号:394、配列番号:396、配列番号:398、配列番号:400、配列番号:402、配列番号:404、配列番号:406、配列番号:408、配列番号:410、配列番号:412、配列番号:414、配列番号:416、配列番号:418、配列番号:420、配列番号:422、配列番号:424、配列番号:426、配列番号:428、配列番号:430、配列番号:432、配列番号:434、配列番号:436、配列番号:438、配列番号:440、配列番号:442、配列番号:444、配列番号:446、配列番号:448、配列番号:450、配列番号:452、配列番号:454、配列番号:456、配列番号:458、配列番号:460、配列番号:462、配列番号:464、配列番号:466、配列番号:468、配列番号:470、配列番号:472、配列番号:474、配列番号:476、配列番号:478、配列番号:480、配列番号:482、配列番号:484、配列番号:486、配列番号:488、配列番号:490、配列番号:492、配列番号:494、配列番号:496、配列番号:498、配列番号:500、配列番号:502、配列番号:504、配列番号:506、配列番号:508、配列番号:510、配列番号:512、配列番号:514、配列番号:516、配列番号:518、配列番号:520、配列番号:522、配列番号:524、配列番号:526、配列番号:528、配列番号:530、配列番号:532、配列番号:534、配列番号:536、配列番号:538、配列番号:540、配列番号:542、配列番号:544、配列番号:546、配列番号:548、配列番号:550、配列番号:552、配列番号:554、配列番号:556、配列番号:558、配列番号:560、配列番号:562、配列番号:564、配列番号:566、配列番号:568、配列番号:570、配列番号:572、配列番号:574、配列番号:576、配列番号:578、配列番号:580、配列番号:582、配列番号:584、配列番号:586、配列番号:588、配列番号:590、配列番号:592、配列番号:594、配列番号:596、配列番号:598、配列番号:600、配列番号:602、配列番号:604、配列番号:606、配列番号:608、配列番号:610、配列番号:612、配列番号:614、配列番号:616、配列番号:618、配列番号:620、配列番号:622、配列番号:624、配列番号:626、配列番号:628、配列番号:630、配列番号:632、配列番号:634、配列番号:636、配列番号:638、配列番号:640、配列番号:642、配列番号:644、配列番号:646、配列番号:648、配列番号:650、配列番号:652、配列番号:654、配列番号:656、配列番号:658、配列番号:660、配列番号:662、配列番号:664、配列番号:666、配列番号:668、配列番号:670、配列番号:672、配列番号:674、配列番号:676、配列番号:678、配列番号:680、配列番号:682、配列番号:684、配列番号:686、配列番号:688、配列番号:690、配列番号:692、配列番号:694、配列番号:696、配列番号:698、配列番号:700、配列番号:702、配列番号:704、配列番号:706、配列番号:708、配列番号:710、配列番号:712、配列番号:714、配列番号:716、配列番号:718、配列番号:720、配列番号:722、配列番号:724、配列番号:726、配列番号:728、配列番号:730、配列番号:732、配列番号:734、配列番号:736、配列番号:738、配列番号:740、配列番号:742、配列番号:744、配列番号:746、配列番号:748、配列番号:750、配列番号:752、配列番号:754、配列番号:756、配列番号:758、配列番号:760、配列番号:762、配列番号:764、配列番号:766、配列番号:768、配列番号:770、配列番号:772、配列番号:774、配列番号:776、配列番号:778、配列番号:780、配列番号:782、配列番号:784、配列番号:786、配列番号:788、配列番号:790、配列番号:792、配列番号:794、配列番号:796、配列番号:798、配列番号:800、配列番号:802、配列番号:804、配列番号:808、配列番号:808、配列番号:810、配列番号:812、配列番号:814、配列番号:816、配列番号:818、配列番号:820、配列番号:822、配列番号:824、配列番号:826、配列番号:828、配列番号:830、配列番号:832、配列番号:834、配列番号:836、配列番号:838、配列番号:840、配列番号:842、配列番号:844、配列番号:846、配列番号:848、配列番号:850、配列番号:852、配列番号:854、配列番号:856、配列番号:858、配列番号:860、配列番号:862、配列番号:864、配列番号:866、配列番号:868、配列番号:870、配列番号:872、配列番号:874、配列番号:876、配列番号:878、配列番号:880、配列番号:882、配列番号:884、配列番号:886、配列番号:888、配列番号:890、配列番号:892、配列番号:894、配列番号:896、配列番号:898、配列番号:900、配列番号:902、配列番号:904、配列番号:906、配列番号:908、配列番号:910、配列番号:912、配列番号:914、配列番号:916、配列番号:918、配列番号:920、配列番号:922、配列番号:924、配列番号:926、配列番号:928、配列番号:930、配列番号:932、配列番号:934、配列番号:936、配列番号:938、配列番号:940、配列番号:942、配列番号:944、配列番号:946、配列番号:948、配列番号:950、配列番号:952または配列番号:954記載の配列を有する、請求項５２記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５６】
ヒドロラーゼ活性を有する、請求項６０記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５７】
ヒドロラーゼ活性がエステラーゼ活性、リパーゼ活性、ホスホリパーゼ活性またはプロテアーゼ活性を含む、請求項５２記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５８】
リパーゼ活性が、トリアシルグリセロールをジアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、トリアシルグリセロールをモノアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、ジアシルグリセロールをモノアシルグリセロールと遊離脂肪酸に加水分解すること、または、モノアシルグリセロールを遊離脂肪酸とグリセロールに加水分解することを含む、あるいは、トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を加水分解することを含む、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項５９】
リパーゼ活性が、ジアシルグリセロールまたはモノアシルグリセロール、および遊離脂肪酸とからトリアシルグリセロールを合成することを含む、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６０】
リパーゼ活性が、1,3-ジパルミトイル-2-オレオイルグリセロール(POP)、1,3-ジステアロイル-2-オレオイルグリセロール(SOS)、1-ジパルミトイル-2-オレオイル-3-ステアロイルグリセロール(POS)もしくは1-オレオイル-2,3-ジミリストイルグリセロール(OMM)、長鎖ポリ不飽和脂肪酸、アラキドン酸、ドコサヘキサエン酸(DHA)またはエイコサペンタエン酸(EPA)を合成することを含む、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６１】
リパーゼ活性がトリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)位置特異的である、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６２】
リパーゼ活性がSn2-特異的、Sn1-またはSn3-特異的である、請求項６１記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６３】
リパーゼ活性が脂肪酸特異的である、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６４】
リパーゼ活性が、加水分解、アルコール分解、エステル化、エステル転移またはエステル交換によって油を改変することを含む、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６５】
リパーゼ活性が位置特異的または化学選択的である、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６６】
リパーゼ活性が、エナンチオマー的に純粋なキラル生成物を合成することを含む、請求項６５記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６７】
リパーゼ活性がウンベリフェリル脂肪酸(FA)エステルを合成することを含む、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６８】
ヒドロラーゼ活性が熱安定性である、請求項５７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項６９】
ポリペプチドが約37℃〜約95℃、約55℃〜約85℃、約70℃〜約95℃または約90℃〜約95℃の温度範囲を含む条件下でヒドロラーゼ活性を維持する、請求項６８記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７０】
ヒドロラーゼ活性が耐熱性である、請求項５６記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７１】
ポリペプチドが、37℃より高い温度から約95℃、55℃より高い温度から約85℃、または90℃よりも高い温度から約95℃の範囲の温度に曝露した後にヒドロラーゼ活性を維持する、請求項７０記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７２】
請求項５２記載のポリペプチドを含み、シグナル配列を欠く単離または組換えポリペプチド。
【請求項７３】
請求項５２記載のポリペプチドを含み、異種シグナル配列を含む単離または組換えポリペプチド。
【請求項７４】
ヒドロラーゼ活性が約37℃にて、タンパク質１mgあたり約100〜約1000ユニット、タンパク質１mgあたり約500〜約750ユニット、タンパク質１mgあたり約500〜1200ユニット、またはタンパク質１mgあたり約750〜1000ユニットの比活性を含む請求項５６記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７５】
耐熱性が、上昇した温度まで加熱後に37℃におけるヒドロラーゼの比活性の少なくとも半分の活性を維持することを含む、請求項７０記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７６】
耐熱性が、上昇した温度まで加熱後に37℃においてタンパク質１mgあたり約500〜1200ユニットの比活性を維持することを含む、請求項７０記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７７】
少なくとも一つのグリコシル化部位を含む、請求項５２記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７８】
グリコシル化がN-結合グリコシル化である、請求項７７記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項７９】
P.パストリスまたはS.ポンベで発現させるとグリコシル化される、請求項７８記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項８０】
約pH6.5、pH6.0、pH5.5、pH5.0、pH4.5またはpH4.0を含む条件下でヒドロラーゼ活性を維持する、請求項５６記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項８１】
約pH8.0、pH8.5、pH9、pH9.5、pH10またはpH10.5を含む条件下でヒドロラーゼ活性を維持する、請求項５６記載の単離または組換えポリペプチド。
【請求項８２】
液体、固体、またはゲルを含む、請求項５２記載のポリペプチドを含むタンパク質調製物。
【請求項８３】
請求項５２記載のポリペプチドおよび第二のドメインを含むヘテロ二量体。
【請求項８４】
第二のドメインがポリペプチドであり、ヘテロ二量体が融合タンパク質である、請求項８３記載のヘテロ二量体。
【請求項８５】
第２のドメインがエピトープまたはタグである、請求項８４記載のヘテロ二量体。
【請求項８６】
請求項５２記載のポリペプチドを含むホモ二量体。
【請求項８７】
前記ポリペプチドペプチドが請求項５２記載の配列またはその部分配列を含む固定化ポリペプチド。
【請求項８８】
ポリペプチドが細胞上、金属上、樹脂上、ポリマー上、セラミック上、ガラス上、微小電極上、グラファイト粒子上、ビーズ上、ゲル上、プレート上、アレイ上、またはキャピラリー管上に固定化されている、請求項８７記載の固定化ポリペプチド。
【請求項８９】
固定化された請求項５２記載のポリペプチドを含むアレイ。
【請求項９０】
固定化された請求項１または請求項２２記載の核酸を含むアレイ。
【請求項９１】
請求項５２記載のポリペプチドに特異的に結合する単離または組換え抗体。
【請求項９２】
モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体である、請求項９１記載の単離または組換え抗体。
【請求項９３】
請求項５２記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体を含むハイブリドーマ。
【請求項９４】
請求項５２記載のポリペプチドまたはその部分配列を含む動物用食品補助物。
【請求項９５】
ポリペプチドがグリコシル化されている、請求項９４記載の動物用食品補助物。
【請求項９６】
請求項５２記載のポリペプチドを含む食用酵素デリバリーマトリックス。
【請求項９７】
ペレットを含む、請求項９６記載の食用酵素デリバリーマトリックス。
【請求項９８】
ポリペプチドがグリコシル化されている、請求項９７記載の食用酵素デリバリーマトリックス。
【請求項９９】
ポリペプチドが耐熱性または熱安定性のヒドロラーゼ活性を有する、請求項９６記載の食用酵素デリバリーマトリックス。
【請求項１００】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを単離または同定する方法：
（ａ）請求項９１記載の抗体を提供する工程；
（ｂ）ポリペプチドを含むサンプルを提供する工程；
（ｃ）工程（ｂ）のサンプルを工程（ａ）の抗体と、前記抗体が前記ポリペプチドへ特異的に結合することのできる条件下で接触させ、それによりヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを単離または同定する工程。
【請求項１０１】
請求項１または請求項２２記載の核酸またはその部分配列を液性免疫応答を生じさせるに充分な量で非ヒト動物に投与し、それによって抗ヒドロラーゼ抗体を生じさせることを含む、抗ヒドロラーゼ抗体の作製方法。
【請求項１０２】
請求項５２記載のポリペプチドまたはその部分配列を液性免疫応答を生じさせるに充分な量で非ヒト動物に投与し、それによって抗ヒドロラーゼ抗体を生じさせることを含む、抗ヒドロラーゼ抗体の作製方法。
【請求項１０３】
以下の工程を含む、組換えポリペプチドを製造する方法：
（ａ）プロモーターに機能可能に連結した核酸を提供する工程であって、前記核酸が請求項１または２２記載の配列を含む核酸である、前記工程；および、
（ｂ）工程（ａ）の核酸を、ポリペプチドの発現が可能な条件下で発現させ、それによって組換えポリペプチドを生成させる工程。
【請求項１０４】
更に、工程（ａ）の核酸で宿主細胞を形質転換し、続いて工程（ａ）の核酸を発現させ、それにより形質転換細胞において組換えポリペプチドを生成させることを含む、請求項１０３記載の方法。
【請求項１０５】
（ａ）請求項５６記載のポリペプチドを提供する工程；
（ｂ）ヒドロラーゼ基質を提供する工程；および
（ｃ）前記ポリペプチドを工程（ｂ）の基質と接触させ、前記基質の量の減少または反応生成物の量の増加を検出する工程、
を含み、基質の量の減少または反応生成物の量の増加によりヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを検出することを含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを同定する方法。
【請求項１０６】
基質が脂肪酸、トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)である、請求項１０５記載の方法。
【請求項１０７】
（ａ）請求項５６記載のポリペプチドを提供する工程；
（ｂ）試験基質を提供する工程；および
（ｃ）工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の試験基質と接触させ、前記基質の量の減少または反応生成物の量の増加を検出する工程、
を含み、前記基質の量が減少または前記反応生成物が増加すれば前記試験基質をヒドロラーゼ基質として同定することを含む、ヒドロラーゼ基質を同定する方法。
【請求項１０８】
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を有する核酸または前記核酸を含むベクターを、前記核酸がポリペプチドに翻訳され得る条件下で発現させる工程；
（ｂ）試験化合物を提供する工程；
（ｃ）前記ポリペプチドを前記試験化合物と接触させる工程；および、
（ｄ）工程（ｂ）の試験化合物が前記ポリペプチドに特異的に結合するかどうかを測定する工程、
を含む、試験化合物がポリペプチドに特異的に結合するかどうかを決定する方法。
【請求項１０９】
（ａ）請求項５２記載の配列を有するポリペプチドを提供する工程；
（ｂ）試験化合物を提供する工程；
（ｃ）前記ポリペプチドを前記試験化合物と接触させる工程；および、
（ｄ）工程（ｂ）の試験化合物が前記ポリペプチドに特異的に結合するかどうかを測定する工程、
を含む、試験化合物がポリペプチドに特異的に結合するかどうかを決定する方法。
【請求項１１０】
（ａ）請求項５６記載のポリペプチドを提供する工程；
（ｂ）試験化合物を提供する工程；
（ｃ）工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の試験化合物に接触させ、ヒドロラーゼ活性を測定する工程、
を含み、前記試験化合物の非存在下で測定されるヒドロラーゼ活性に比較して前記試験化合物の存在下で測定されるヒドロラーゼ活性が変化すれば、前記試験化合物がヒドロラーゼ活性を調節すると決定する、ヒドロラーゼ活性の調節因子を同定する方法。
【請求項１１１】
ヒドロラーゼ活性が、ヒドロラーゼ基質を提供すること、および基質の量の減少若しくは反応生成物の量の増加を検出する、または、基質の量の増加若しくは反応生成物の量の減少を検出すること、によって測定される、請求項１１０記載の方法。
【請求項１１２】
試験化合物非存在下における基質の量若しくは反応生成物の量に比較して、前記試験化合物存在下における基質の量が減少若しくは反応生成物の量が増加すれば、前記試験化合物をヒドロラーゼ活性の活性化因子であると同定する、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１３】
試験化合物非存在下における基質の量若しくは反応生成物の量に比較して、前記試験化合物存在下における基質の量が増加若しくは反応生成物の量が減少すれば、前記試験化合物をヒドロラーゼ活性の阻害因子であると同定する、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１４】
プロセッサおよびデータ保存装置を含むコンピュータシステムであって、前記データ保存装置にはポリペプチド配列または核酸配列が保存され、前記ポリペプチド配列は請求項５２記載の配列または請求項１若しくは請求項２２記載の核酸配列によってコードされるポリペプチドを含む、前記コンピュータシステム。
【請求項１１５】
更に、配列比較アルゴリズムおよび少なくとも一つの参照配列が保存されたデータ保存装置を含む、請求項１１４記載のコンピュータシステム。
【請求項１１６】
配列比較アルゴリズムが多型性を表示するコンピュータプログラムを含む、請求項１１５記載のコンピュータシステム。
【請求項１１７】
配列の１以上の特徴を同定するアイデンティファイアーを更に含む請求項１１４記載のコンピュータシステム。
【請求項１１８】
ポリペプチド配列または核酸配列が保存されたコンピュータ読取り可能媒体であって、前記ポリペプチド配列が請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記コンピュータ読取り可能媒体。
【請求項１１９】
以下の工程を含む、配列中の特徴を同定する方法：
（ａ）配列中の１以上の特徴を同定するコンピュータプログラムを用いて配列を読む工程であって、前記配列はポリペプチド配列または核酸配列を含み、前記ポリペプチド配列は請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；および、
（ｂ）前記コンピュータプログラムにより前記配列中の１以上の特徴を同定する工程。
【請求項１２０】
以下の工程を含む、第１の配列と第２の配列とを比較する方法；
（ａ）配列を比較するコンピュータプログラムを用いて第１の配列及び第２の配列を読む工程であって、前記第１の配列はポリペプチド配列または核酸配列を含み、前記ポリペプチド配列は請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；および、
（ｂ）前記第１の配列と前記第２の配列間の相違を前記コンピュータプログラムにより決定する工程。
【請求項１２１】
第１の配列と第２の配列間の相違を決定する工程が、更に多型性を同定する工程を含む、請求項１２０記載の方法。
【請求項１２２】
配列中の１以上の特徴を同定するアイデンティファイアーを更に含む、請求項１２０記載の方法。
【請求項１２３】
コンピュータプログラムを用いて第１の配列を読み、前記配列中の１以上の特徴を同定することを含む、請求項１２２記載の方法。
【請求項１２４】
以下の工程を含む、環境サンプルからヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法：
（ａ）請求項２９記載の増幅プライマー配列対を提供する工程；
（ｂ）環境サンプルから核酸を単離する、または環境サンプルを前記サンプル中の核酸が前記増幅プライマー対へハイブリダーゼションのために接近可能となるように処理する工程；および、
（ｃ）工程（ｂ）の核酸を工程（ａ）の増幅プライマー対と合わせ、前記環境サンプルからの核酸を増幅し、それによって前記環境サンプルからヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する工程。
【請求項１２５】
増幅プライマー配列対の各構成プライマーが、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:29、配列番号:31、配列番号:33、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:39、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:45、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:51、配列番号:53、配列番号:55、配列番号:57、配列番号:59、配列番号:61、配列番号:63、配列番号:65、配列番号:67、配列番号:69、配列番号:71、配列番号:73、配列番号:75、配列番号:77、配列番号:79、配列番号:81、配列番号:83、配列番号:85、配列番号:87、配列番号:89、配列番号:91、配列番号:93、配列番号:95、配列番号:97、配列番号:99、配列番号:101、配列番号:103、配列番号:105、配列番号:107、配列番号:109、配列番号:111、配列番号:113、配列番号:115、配列番号:117、配列番号:119、配列番号:121、配列番号:123、配列番号:125、配列番号:127、配列番号:129、配列番号:131、配列番号:133、配列番号:135、配列番号:137、配列番号:139、配列番号:141、配列番号:143、配列番号:145、配列番号:147、配列番号:149、配列番号:151、配列番号:153、配列番号:155、配列番号:157、配列番号:159、配列番号:161、配列番号:163、配列番号:165、配列番号:167、配列番号:169、配列番号:171、配列番号:173、配列番号:175、配列番号:177、配列番号:179、配列番号:181、配列番号:183、配列番号:185、配列番号:187、配列番号:189、配列番号:191、配列番号:193、配列番号:195、配列番号:197、配列番号:199、配列番号:201、配列番号:203、配列番号:205、配列番号:207、配列番号:209、配列番号:211、配列番号:213、配列番号:215、配列番号:217、配列番号:219、配列番号:221、配列番号:223、配列番号:225、配列番号:227、配列番号:229、配列番号:231、配列番号:233、配列番号:235、配列番号:237、配列番号:239、配列番号:241、配列番号:243、配列番号:245、配列番号:247、配列番号:249、配列番号:251、配列番号:253、配列番号:255、配列番号:257、配列番号:259、配列番号:261、配列番号:263、配列番号:265、配列番号:267、配列番号:269、配列番号:271、配列番号:273、配列番号:275、配列番号:277、配列番号:279、配列番号:281、配列番号:283、配列番号:285、配列番号:287、配列番号:289、配列番号:291、配列番号:293、配列番号:295、配列番号:297、配列番号:299、配列番号:301、配列番号:303、配列番号:305、配列番号:307、配列番号:309、配列番号:311、配列番号:313、配列番号:315、配列番号:317、配列番号:319、配列番号:321、配列番号:323、配列番号:325、配列番号:327、配列番号:329、配列番号:331、配列番号:333、配列番号:335、配列番号:337、配列番号:339、配列番号:341、配列番号:343、配列番号:345、配列番号:347、配列番号:349、配列番号:351、配列番号:353、配列番号:355、配列番号:357、配列番号:359、配列番号:361、配列番号:363、配列番号:365、配列番号:367、配列番号:369、配列番号:371、配列番号:373、配列番号:375、配列番号:377、配列番号:379、配列番号:381、配列番号:383、配列番号:385、配列番号:387、配列番号:389、配列番号:391、配列番号:393、配列番号:395、配列番号:397、配列番号:399、配列番号:401、配列番号:403、配列番号:405、配列番号:407、配列番号:409、配列番号:411、配列番号:413、配列番号:415、配列番号:417、配列番号:419、配列番号:421、配列番号:423、配列番号:425、配列番号:427、配列番号:429、配列番号:431、配列番号:433、配列番号:435、配列番号:437、配列番号:439、配列番号:441、配列番号:443、配列番号:445、配列番号:447、配列番号:449、配列番号:451、配列番号:453、配列番号:455、配列番号:457、配列番号:459、配列番号:461、配列番号:463、配列番号:465、配列番号:467、配列番号:469、配列番号:471、配列番号:473、配列番号:475、配列番号:477、配列番号:479、配列番号:481、配列番号:483、配列番号:485、配列番号:487、配列番号:489、配列番号:491、配列番号:493、配列番号:495、配列番号:497、配列番号:499、配列番号:501、配列番号:503、配列番号:505、配列番号:507、配列番号:509、配列番号:511、配列番号:513、配列番号:515、配列番号:517、配列番号:519、配列番号:521、配列番号:523、配列番号:525、配列番号:527、配列番号:529、配列番号:531、配列番号:533、配列番号:535、配列番号:537、配列番号:539、配列番号:541、配列番号:543、配列番号:545、配列番号:547、配列番号:549、配列番号:551、配列番号:553、配列番号:555、配列番号:557、配列番号:559、配列番号:561、配列番号:563、配列番号:565、配列番号:567、配列番号:569、配列番号:571、配列番号:573、配列番号:575、配列番号:577、配列番号:579、配列番号:581、配列番号:583、配列番号:585、配列番号:587、配列番号:589、配列番号:591、配列番号:593、配列番号:595、配列番号:597、配列番号:599、配列番号:601、配列番号:603、配列番号:605、配列番号:607、配列番号:609、配列番号:611、配列番号:613、配列番号:615、配列番号:617、配列番号:619、配列番号:621、配列番号:623、配列番号:625、配列番号:627、配列番号:629、配列番号:631、配列番号:633、配列番号:635、配列番号:637、配列番号:639、配列番号:641、配列番号:643、配列番号:645、配列番号:647、配列番号:649、配列番号:651、配列番号:653、配列番号:655、配列番号:657、配列番号:659、配列番号:661、配列番号:663、配列番号:665、配列番号:667、配列番号:669、配列番号:671、配列番号:673、配列番号:675、配列番号:677、配列番号:679、配列番号:681、配列番号:683、配列番号:685、配列番号:687、配列番号:689、配列番号:691、配列番号:693、配列番号:695、配列番号:697、配列番号:699、配列番号:701、配列番号:703、配列番号:705、配列番号:707、配列番号:709、配列番号:711、配列番号:713、配列番号:715、配列番号:717、配列番号:719、配列番号:721、配列番号:723、配列番号:725、配列番号:727、配列番号:729、配列番号:731、配列番号:733、配列番号:735、配列番号:737、配列番号:739、配列番号:741、配列番号:743、配列番号:745、配列番号:747、配列番号:749、配列番号:751、配列番号:753、配列番号:755、配列番号:757、配列番号:759、配列番号:761、配列番号:763、配列番号:765、配列番号:767、配列番号:769、配列番号:771、配列番号:773、配列番号:775、配列番号:777、配列番号:779、配列番号:781、配列番号:783、配列番号:785、配列番号:787、配列番号:789、配列番号:791、配列番号:793、配列番号:795、配列番号:797、配列番号:799、配列番号:801、配列番号:803、配列番号:805、配列番号:807、配列番号:809、配列番号:811、配列番号:813、配列番号:815、配列番号:817、配列番号:819、配列番号:821、配列番号:823、配列番号:825、配列番号:827、配列番号:829、配列番号:831、配列番号:833、配列番号:835、配列番号:837、配列番号:839、配列番号:841、配列番号:843、配列番号:845、配列番号:847、配列番号:849、配列番号:851、配列番号:853、配列番号:855、配列番号:857、配列番号:859、配列番号:861、配列番号:863、配列番号:865、配列番号:867、配列番号:869、配列番号:871、配列番号:873、配列番号:875、配列番号:877、配列番号:879、配列番号:881、配列番号:883、配列番号:885、配列番号:887、配列番号:889、配列番号:891、配列番号:893、配列番号:895、配列番号:897、配列番号:899、配列番号:901、配列番号:903、配列番号:905、配列番号:907、配列番号:909、配列番号:911、配列番号:913、配列番号:915、配列番号:917、配列番号:919、配列番号:921、配列番号:923、配列番号:925、配列番号:927、配列番号:929、配列番号:931、配列番号:933、配列番号:935、配列番号:937、配列番号:939、配列番号:941、配列番号:943、配列番号:945、配列番号:947、配列番号:949、配列番号:951または配列番号:953記載の配列またはその部分配列の少なくとも約10〜50の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、請求項１２４記載の方法。
【請求項１２６】
以下の工程を含む、環境サンプルからヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法：
（ａ）請求項１または請求項２２、またはその部分配列を含むポリヌクレオチドプローブを提供する工程；
（ｂ）環境サンプルから核酸を単離する、または、環境サンプルを前記サンプル中の核酸が工程（ａ）のポリヌクレオチドプローブにハイブリダイゼーションのために接近可能であるように処理する工程；および、
（ｃ）工程（ｂ）の単離された核酸または処理された環境サンプルを工程（ａ）のポリヌクレオチドプローブと一緒にする工程；
（ｄ）工程（ａ）のポリヌクレオチドプローブと特異的にハイブリダイズする核酸を単離し、それによって、環境サンプルからヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する工程。
【請求項１２７】
環境サンプルが水サンプル、液体サンプル、土壌サンプル、大気サンプルまたは生物学的サンプルを含む、請求項１２４または請求項１２６記載の方法。
【請求項１２８】
生物学的サンプルが細菌細胞、原生動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物細胞、真菌細胞、または哺乳動物細胞に由来する請求項１２７記載の方法。
【請求項１２９】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸の変種を作製する方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む鋳型核酸を提供する工程；および、
（ｂ）前記鋳型配列における１以上のヌクレオチドを改変、欠失または付加、またはそれらの組合せにより、前記鋳型核酸の変種を作製する工程。
【請求項１３０】
変種核酸を発現させて変種ヒドロラーゼポリペプチドを生成させることを更に含む、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３１】
改変、付加または欠失が、変異性PCR、シャッフリング、オリゴヌクレオチド特異的変異導入、アッセンブリPCR、セクシュアルPCR変異導入、in vivo変異導入、カセット変異導入、再帰的アンサンブル変異導入、エクスポネンシャル変異導入、部位特異的変異導入、遺伝子再アッセンブリ、遺伝子部位飽和変異導入（GSSM）、合成連結アッセンブリ(SLR)およびそれらの組合せを含む方法により導入される、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３２】
改変、付加、欠失が、組換え、再帰的配列組換え、ホスホチオエート-修飾DNA変異導入、ウラシル含有鋳型変異導入、ギャップ付加二重鎖変異導入、点ミスマッチ修復変異導入、修復欠損宿主株変異導入、化学変異導入、放射性変異導入、欠失変異導入、制限-選択変異導入、制限-精製変異導入、人工遺伝子合成、アンサンブル変異導入、キメラ核酸マルチマー生成、およびそれらの組合せによって導入される、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３３】
鋳型核酸によってコードされるポリペプチドの活性または安定性に対して変異した若しくは異なる活性を有する、または、変異した若しくは異なる安定性を有するヒドロラーゼが生成されるまで反復される、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３４】
変種ヒドロラーゼポリペプチドが耐熱性であって、上昇した温度に曝露した後にある程度の活性を維持する、請求項１３３記載の方法。
【請求項１３５】
変種ヒドロラーゼポリペプチドが鋳型核酸によってコードされるポリペプチドに比較してグリコシル化が増加する、請求項１３３記載の方法。
【請求項１３６】
変種ヒドロラーゼポリペプチドが高温下でヒドロラーゼ活性を有し、鋳型核酸によってコードされるヒドロラーゼが高温下で活性を有しない、請求項１３３記載の方法。
【請求項１３７】
鋳型核酸のコドン使用とは異なるコドン使用を有するヒドロラーゼコード配列が生成されるまで反復される、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３８】
鋳型核酸のものよりも高いもしくは低い、メッセージ発現レベルもしくは安定性を有するヒドロラーゼ遺伝子が生成されるまで反復される、請求項１２９記載の方法。
【請求項１３９】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸のコドンを改変して宿主細胞における前記核酸の発現を増加させる方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を提供する工程；および、
（ｂ）工程（ａ）の核酸中の非優先コドンまたは低優先コドンを同定し、前記コドンを置換されるコドンと同じアミノ酸をコードする優先コドンまたは中性的に使用されるコドンに置換し、それによって核酸を改変して発現を増加させる工程であって、前記優先コドンとは宿主中の遺伝子内のコード配列において高頻度に提示されるコドンであり、非優先コドンまたは低優先コドンとは前記宿主中の遺伝子内のコード配列において低頻度に提示されるコドンである、前記工程。
【請求項１４０】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼポリペプチドをコードする核酸のコドンを改変する方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を提供する工程；および、
（ｂ）工程（ａ）の核酸中のコドンを同定し、前記コドンを置換されるコドンと同一のアミノ酸をコードする異なるコドンに置換し、それによってヒドロラーゼをコードする核酸中のコドンを改変する工程。
【請求項１４１】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼポリペプチドをコードする核酸のコドンを改変して宿主における前記核酸の発現を増加させる方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む、ヒドロラーゼポリペプチドをコードする核酸を提供する工程；および、
（ｂ）工程（ａ）の核酸中の非優先コドンまたは低優先コドンを同定し、前記コドンを置換されるコドンと同じアミノ酸をコードする優先コドンまたは中性的に使用されるコドンに置換し、それによって核酸を改変して発現を増加させる工程であって、前記優先コドンとは宿主細胞中の遺伝子内のコード配列において高頻度に提示されるコドンであり、非優先コドンまたは低優先コドンとは前記宿主細胞中の遺伝子内のコード配列において低頻度に提示されるコドンである、前記工程。
【請求項１４２】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸のコドンを改変して宿主細胞における前記核酸の発現を減少させる方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む、ヒドロラーゼポリペプチドをコードする核酸を提供する工程；および、
（ｂ）工程（ａ）の核酸中の少なくとも一つの優先コドンを同定し、前記コドンを置換されるコドンと同じアミノ酸をコードする非優先コドンまたは低優先コドンに置換し、それによって核酸を改変して宿主細胞でのその発現を減少させる工程であって、前記優先コドンとは宿主細胞中の遺伝子内のコード配列において高頻度に提示されるコドンであり、非優先コドンまたは低優先コドンとは前記宿主細胞中の遺伝子内のコード配列において低頻度に提示されるコドンである、前記工程。
【請求項１４３】
宿主細胞が細菌細胞、真菌細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物細胞または哺乳動物細胞である、請求項１４１または請求項１４２記載の方法。
【請求項１４４】
以下の工程を含む、複数の改変ヒドロラーゼ活性部位または基質結合部位をコードする核酸のライブラリーを作製する方法であって、前記改変ヒドロラーゼ活性部位または基質結合部位が第１の活性部位または第１の基質結合部位をコードする配列を含む第１の核酸に由来する前記方法：
（ａ）第１の活性部位または第１の基質結合部位をコードする第１の核酸を提供する工程であって、前記第１の核酸の配列が、請求項１または請求項２２記載の配列またはその部分配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列を含み、前記核酸がヒドロラーゼ活性部位またはヒドロラーゼ基質結合部位をコードする、前記工程；
（ｂ）前記第１の核酸中の複数の標的コドンにおいて天然のアミノ酸変種をコードする、変異性オリゴヌクレオチドの組を提供する工程；および、
（ｃ）前記変異性オリゴヌクレオチドの組を用いて、変異させた各アミノ酸コドンにおいて一群のアミノ酸変種をコードする、一組の活性部位コード変種核酸または結合部位コード変種核酸を生成し、それによって複数の改変ヒドロラーゼ活性部位または基質結合部位をコードする核酸のライブラリーを作製する工程。
【請求項１４５】
工程（ａ）の第１の核酸を、最適化定方向進化システム、遺伝子部位飽和変異導入（GSSM）、または合成連結再アッセンブリ(SLR)を含む方法によって変異させることを含む、請求項１４４記載の方法。
【請求項１４６】
変異性PCR、シャッフリング、オリゴヌクレオチド指向変異導入、アッセンブリPCR、セクシュアルPCR変異導入、in vivo変異導入、カセット変異導入、再帰的アンサンブル変異導入、エクスポネンシャルアンサンブル変異導入、部位特異的変異導入、遺伝子再アッセンブリ、遺伝子部位飽和変異導入(GSSM)、合成連結再アッセンブリ(SLR)またはそれらの組合せを含む方法によって、工程（ａ）の第１の核酸または変種に変異導入することを含む請求項１４４記載の方法。
【請求項１４７】
組換え、再帰的配列組換え、ホスホチオエート-修飾DNA変異導入、ウラシル含有鋳型変異導入、ギャップ付加二重鎖変異導入、点ミスマッチ修復変異導入、修復欠損宿主株変異導入、化学変異導入、放射性変異導入、欠失変異導入、制限-選択変異導入、制限-精製変異導入、人工遺伝子合成、アンサンブル変異導入、キメラ核酸マルチマー生成、またはそれらの組合せを含む方法によって工程（ａ）の第１の核酸または変種に変異導入することを含む請求項１４４記載の方法。
【請求項１４８】
以下の工程を含む、小分子を作製する方法：
（ａ）小分子を合成または改変できる複数の生合成酵素を提供する工程であって、前記酵素の一つが請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸によってコードされるヒドロラーゼ酵素を含む、前記工程；
（ｂ）工程（ａ）の酵素の少なくとも一つに対する基質を提供する工程；および
（ｃ）複数の生体触媒反応を容易にする条件下で工程（ｂ）の基質を前記酵素と反応させ、一連の生体触媒反応によって小分子を生成させる工程。
【請求項１４９】
以下の工程を含む小分子を改変する方法：
（ａ）ヒドロラーゼ酵素を提供する工程であって、前記酵素は請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸配列を含む核酸によってコードされるポリペプチドを含む酵素である、前記工程；
（ｂ）小分子を提供する工程；
（ｃ）工程（ａ）の酵素を、前記ヒドロラーゼ酵素によって触媒される酵素反応を容易にする条件下で、工程（ｂ）の小分子と反応させる工程。
【請求項１５０】
工程（ａ）の酵素に対する複数の小分子基質を含み、それによって前記ヒドロラーゼ酵素によって触媒される少なくとも一つの酵素反応によって生成される改変小分子のライブラリーを作製することを含む、請求項１４９記載の方法。
【請求項１５１】
酵素による複数の生体触媒反応を容易にして前記複数の酵素反応によって生成される改変小分子のライブラリーを生成させる条件下で複数の追加の酵素を含む、請求項１４９記載の方法。
【請求項１５２】
ライブラリーを試験して、前記ライブラリー中に所望の活性を示す特定の改変小分子が存在するかどうかを決定する工程をさらに含む、請求項１５１記載の方法。
【請求項１５３】
ライブラリーを試験する工程が、更に、改変小分子の一部を所望の活性を有する特定の改変小分子の存在または非存在について試験し、前記所望の活性を有する特定の改変小分子を生成する少なくとも一つの特異的な生体触媒反応を同定することによって、ライブラリー中の複数の改変小分子の一部を生成するために使用された生体触媒反応の一つを除く全てを系統的に除去する工程を含む、請求項１５２記載の方法。
【請求項１５４】
以下の工程を含む、ヒドロラーゼ酵素の機能的断片を決定する方法：
（ａ）ヒドロラーゼ酵素を提供する工程であって、前記酵素は請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む酵素である、前記工程；
（ｂ）工程（ａ）の配列から複数のアミノ酸残基を欠失させ、残存する部分配列についてヒドロラーゼ活性を試験し、それによってヒドロラーゼ酵素の機能的断片を決定する工程。
【請求項１５５】
ヒドロラーゼ活性が、ヒドロラーゼ基質を提供すること、および、基質の量の減少または反応生成物の量の増加を検出すること、によって測定される、請求項１５４記載の方法。
【請求項１５６】
以下の工程を含む、リアルタイム代謝フラックス分析を用いた、新規な、または、改変された表現型について全細胞を操作する方法：
（ａ）細胞の遺伝的構成を改変することによって改変細胞を作製する工程であって、前記遺伝的構成が細胞に請求項１または請求項２２記載の配列を含む核酸を導入することによって改変される、前記工程；
（ｂ）前記改変細胞を培養して複数の改変細胞を生成させる工程；
（ｃ）リアルタイムで工程（ｂ）の細胞培養物を監視することにより、前記細胞の少なくとも一つの代謝パラメーターを測定する工程；および、
（ｄ）工程（ｃ）のデータを解析して、測定されたパラメーターが同様な条件下における未改変細胞の対応する測定値と異なるかどうかを決定し、それによってリアルタイム代謝フラックスを用いて細胞の操作された表現型を同定する工程。
【請求項１５７】
細胞の遺伝的構成が細胞中の配列の欠失または配列の改変、もしくは遺伝子の発現をノックアウトすることによって改変される、請求項１５６記載の方法。
【請求項１５８】
新規に操作された表現型を含む細胞を選抜することを更に含む、請求項１５７記載の方法。
【請求項１５９】
さらに、選抜した細胞を培養し、新規に操作された表現型を含む新規な細胞株を生成させることを含む、請求項１５８記載の方法。
【請求項１６０】
以下の工程を含む、トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を加水分解する方法：
（ａ）ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドは請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；
（ｂ）トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）前記ポリペプチドがトリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を加水分解する条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させる工程。
【請求項１６１】
以下の工程を含む、組成物からトリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を除去またはその量を低減する方法：
（ａ）ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドは請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；
（ｂ）トリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）前記ポリペプチドがトリアシルグリセロール(TAG)、ジアシルグリセロール(DAG)またはモノアシルグリセロール(MAG)を除去またはその量を低減する条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させる工程。
【請求項１６２】
ヒドロラーゼポリペプチドのグリコシル化を含む、ヒドロラーゼポリペプチドの耐熱性または熱安定性を増大させる方法であって、前記ポリペプチドが請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１若しくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドの少なくとも30個の連続するアミノ酸を含む、前記方法。
【請求項１６３】
ヒドロラーゼ比活性が、約37℃より高い温度から約95℃の範囲の温度において熱安定性または耐熱性である、請求項１６３記載の方法。
【請求項１６４】
請求項１または請求項２４記載の核酸を含むベクターを発現させることを含む、細胞で組換えヒドロラーゼポリペプチドを過剰発現させる方法であって、過剰発現が高活性プロモーター、二シストロン性ベクター、またはベクターの遺伝子増幅によって行われる、前記方法。
【請求項１６５】
請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む洗剤組成物であって、前記ポリペプチドがヒドロラーゼ活性を有する、前記洗剤組成物。
【請求項１６６】
ヒドロラーゼが、非界面活性ヒドロラーゼまたは界面活性ヒドロラーゼである、請求項１６６記載の洗剤組成物。
【請求項１６７】
ヒドロラーゼが、非水性液状組成物、鋳造固形物、顆粒形態、粒状形態、打錠剤、ゲル状形態、ペーストまたはスラリー状形態として製剤化される請求項１６５の洗剤組成物。
【請求項１６８】
以下の工程を含む物体の洗浄方法：
（a）ヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドを含む組成物を提供する工程であって、前記ポリペプチドは請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；
（b）物体を提供する工程；および
（c）前記組成物が前記物体を洗浄することができる条件下で工程（a）のポリペプチドを工程（b）の物体と接触させる工程。
【請求項１６９】
以下の工程を含む、動物によって消費されるに先立って、飼料または食物中の油を加水分解する方法：
（a）油を含む飼料材料を入手する工程であって、前記油はヒドロラーゼ活性を有するポリペプチドで加水分解されていてもよく、ここで前記ポリペプチドは請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、前記工程；および、
（b）前記油が加水分解され処理済食物または飼料が生成されるために十分な量で十分な時間、工程（a）のポリペプチドを前記飼料または食物材料に加え、それによって動物が消費する前に前記食物または飼料中の油を加水分解する工程。
【請求項１７０】
食物または飼料がコメ、トウモロコシ、オオムギ、コムギ、豆類、またはジャガイモである請求項１６９記載の方法。
【請求項１７１】
請求項５２記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む飼料または食物。
【請求項１７２】
油、および請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む組成物。
【請求項１７３】
請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む医薬組成物。
【請求項１７４】
核酸が植物プロモーターに機能可能に連結されている、請求項３２記載の発現カセット。
【請求項１７５】
植物発現ベクターをさらに含む、請求項１７４記載の発現カセット。
【請求項１７６】
植物発現ベクターが植物ウィルスを含む、請求項１７５記載の発現カセット。
【請求項１７７】
植物プロモーターが、ジャガイモのプロモーター、イネのプロモーター、トウモロコシのプロモーター、コムギまたはオオムギのプロモーターを含む、請求項１７４記載の発現カセット。
【請求項１７８】
プロモーターが、アグロバクテリウム・ツメファシエンスのT-DNA由来のプロモーターを含む、請求項１７４記載の発現カセット。
【請求項１７９】
プロモーターが構成的プロモーターである、請求項１７４記載の発現カセット。
【請求項１８０】
構成的プロモーターがCaMV35Sである、請求項１７９記載の発現カセット。
【請求項１８１】
プロモーターが誘導性プロモーターまたは組織特異的プロモーターである、請求項１７４記載の発現カセット。
【請求項１８２】
組織特異的プロモーターが、種子特異的、葉特異的、根特異的、茎特異的または離脱-誘導プロモーターである、請求項１８１記載の発現カセット。
【請求項１８３】
植物細胞が、ジャガイモ、イネ、トウモロコシ、コムギ、タバコまたはオオムギの細胞である、請求項３９記載の形質転換細胞。
【請求項１８４】
以下の工程を含むトランスジェニック植物の作製方法：
（ａ）請求項１または請求項２２記載の配列を含む異種核酸配列を細胞に導入し、それにより形質転換植物細胞を生成する工程；
（ｂ）前記形質転換細胞からトランスジェニック植物を生成する工程。
【請求項１８５】
工程（ａ）が更に、植物細胞プロトプラストのエレクトロポレーションまたはマイクロインジェクションによって異種核酸を導入することを含む、請求項１８４記載の方法。
【請求項１８６】
工程（ａ）が更に、DNA粒子ボンバードメントによって異種核酸を植物組織に直接導入することを含む、請求項１８４記載の方法。
【請求項１８７】
工程（ａ）が更に、アグロバクテリウム・ツメファシエンス宿主を使用して異種核酸を植物細胞DNAに導入することを含む、請求項１８４記載の方法。
【請求項１８８】
以下の工程を含む、植物細胞中で異種核酸配列を発現させる方法：
（ａ）プロモーターに機能可能に結合した異種核酸配列で植物細胞を形質転換する工程であって、前記異種核酸配列が請求項１または請求項２２記載の配列を含む、前記工程；
（ｂ）前記植物細胞中で前記異種核酸配列が発現する条件下で植物を生育させる工程。
【請求項１８９】
請求項５２記載のポリペプチドの部分配列を有するペプチドを含む、シグナル配列。
【請求項１９０】
請求項５２記載のポリペプチドの部分配列を有するペプチドからなる、シグナル配列。
【請求項１９１】
請求項１８９または請求項１９０記載のシグナル配列を含む第一のドメインおよび少なくとも第二のドメインを含む、キメラタンパク質。
【請求項１９２】
タンパク質が融合タンパク質である、請求項１９１記載のキメラタンパク質。
【請求項１９３】
第二のドメインが酵素を含む、請求項１９１記載のキメラタンパク質。
【請求項１９４】
酵素がヒドロラーゼである、請求項１９３記載のキメラタンパク質。
【請求項１９５】
以下の工程を含む、構造脂質を生体触媒合成する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程；
（ｂ）トリアシルグリセリド(TAG)を含む組成物を提供する工程；
（ｃ）トリアシルグリセリド(TAG)のSn2位にあるアシル残基をポリペプチドが加水分解する条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させ、それによって1,3-ジアシルグリセリド(DAG)を生成する工程；
（ｄ）R1エステルを提供する工程；
（ｅ）R1-特異的ヒドロラーゼを提供する工程；および、
（ｆ）R1-特異的ヒドロラーゼがSn2位のエステル化を触媒する条件下で工程（ｃ）の1,3-DAGを工程（ｄ）のR1エステルおよび工程（ｅ）のR1-特異的ヒドロラーゼと接触させ、それによって構造脂質を生成する工程。
【請求項１９６】
ヒドロラーゼがSn2-特異的リパーゼである、請求項１９５記載の方法。
【請求項１９７】
構造脂質がココアバター代替物(CBA)、合成ココアバター、天然ココアバター、1,3-ジパルミトイル-2-オレオイルグリセロール(POP)、1,3-ジステアロイル-2-オレオイルグリセロール(SOS)、1-パルミトイル-2-オレオイル-3-ステアロイルグリセロール(POS)または1-オレオイル-2,3-ジミリストイルグリセロール(OMM)を含む、請求項１９５記載の方法。
【請求項１９８】
以下の工程を含む、構造脂質を生体触媒合成する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程；
（ｂ）トリアシルグリセリド(TAG)を含む組成物を提供する工程；
（ｃ）ポリペプチドがトリアシルグリセリド(TAG)のSn1位またはSn3位にあるアシル残基を加水分解する条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させ、それによって1,2-DAGまたは2,3-DAGを生成する工程；および、
（ｄ）動力学的に制御された条件下で工程（ｃ）の1,2-DAGまたは2,3-DAGにおけるアシル移動を促進し、それによって1,3-DAGを生成する工程。
【請求項１９９】
R1エステルおよびR1-特異的リパーゼを提供する工程、および、前記R1-特異的リパーゼがSn2位のエステル化を触媒する条件下で工程（ｄ）の1,3-DAGをR1エステルおよびR1-特異的リパーゼと接触させ、それによって構造脂質を生成する工程をさらに含む、請求項１９８記載の方法。
【請求項２００】
リパーゼがSn1またはSn3-特異的リパーゼである、請求項１９８記載の方法。
【請求項２０１】
構造脂質がココアバター代替物(CBA)、合成ココアバター、天然ココアバター、1,3-ジパルミトイル-2-オレオイルグリセロール(POP)、1,3-ジステアロイル-2-オレオイルグリセロール(SOS)、1-パルミトイル-2-オレオイル-3-ステアロイルグリセロール(POS)または1-オレオイル-2,3-ジミリストイルグリセロール(OMM)を含む、請求項１９８記載の方法。
【請求項２０２】
工程（ｄ）がさらに、イオン交換樹脂を使用することを含む、請求項１９８記載の方法。
【請求項２０３】
動力学的に制御された条件が、1,3-DAG対2,3-DAGの比が2:1よりも大きい最終生成物を生成する結果となる非平衡条件を含む、請求項１９８記載の方法。
【請求項２０４】
工程（ｂ）の組成物が蛍光脂肪酸(FA)を含む、請求項１９５または請求項１９８記載の方法。
【請求項２０５】
工程（ｂ）の組成物がウンベリフェリルFAエステルを含む、請求項１９５または請求項１９８記載の方法。
【請求項２０６】
最終生成物がエナンチオマー的に純粋である、請求項１９５または請求項１９８記載の方法。
【請求項２０７】
以下の工程を含む、プロピオン酸のラセミエステルからプロピオン酸の1つの光学異性体を調製する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、前記ヒドロラーゼはプロピオン酸の1つの光学異性体に対する立体選択性を有する、前記工程；
（ｂ）ラセミエステルを提供する工程；
（ｃ）エステルの加水分解を選択的に触媒することができる工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）のラセミエステルと接触させ、それによってプロピオン酸の前記光学異性体を生成する工程。
【請求項２０８】
プロピオン酸の光学異性体が2-(6-メトキシ-2-ナフチル)プロピオン酸のS(+)体を含み、そしてラセミエステルが2-(6-メトキシ-2-ナフチル)プロピオン酸のラセミ(R,S)エステルを含む、請求項２０７記載の方法。
【請求項２０９】
以下の工程を含む、2-置換酸のエステルのラセミ混合物を立体選択的に加水分解する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、前記ヒドロラーゼは立体選択的である、前記工程；
（ｂ）2-置換酸のエステルのラセミ混合物を含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）工程（b）のポリペプチドが前記エステルを選択的に加水分解し得る条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させる工程。
【請求項２１０】
ヒドロラーゼが固定化されている、請求項１９５、請求項１９８または請求項２０９記載の方法。
【請求項２１１】
2-置換酸が、2-アリールオキシ置換酸、R-2-(4-ヒドロキシフェノキシ)プロピオン酸または2-アリールプロピオン酸を含む、請求項２０９記載の方法。
【請求項２１２】
2-置換酸がケトプロフェンを含む、請求項２０９記載の方法。
【請求項２１３】
以下の工程を含む、油または脂肪を改変する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程；
（ｂ）油または脂肪を提供する工程；および、
（ｃ）前記ヒドロラーゼが前記油または脂肪を改変し得る条件下で工程（ａ）のヒドロラーゼを工程（ｂ）の油または脂肪と接触させる工程。
【請求項２１４】
改変が油または脂肪のヒドロラーゼ触媒加水分解を含む、請求項２１３記載の方法。
【請求項２１５】
加水分解が、油または脂肪の完全または部分的加水分解である、請求項２１４記載の方法。
【請求項２１６】
油が、ポリ不飽和脂肪酸のグリセロールエステル、または、魚油、動物油もしくは植物油を含む、請求項２１４記載の方法。
【請求項２１７】
植物油が、オリーブ、キャノーラ、ヒマワリ、ヤシ、ダイズもしくはラウリン系の油または米糠油を含む、請求項２１６記載の方法。
【請求項２１８】
以下の工程を含む、ポリ不飽和脂肪酸(PUFA)エステルを加水分解する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程；
（ｂ）ポリ不飽和脂肪酸エステルを含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）前記ヒドロラーゼが前記ポリ不飽和脂肪酸(PUFA)を加水分解し得る条件下でヒドロラーゼを工程（ｂ）の組成物と接触させる工程。
【請求項２１９】
以下の工程を含む、飽和脂肪酸エステルに優先してポリ不飽和脂肪酸エステルを選択的に加水分解する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、前記ヒドロラーゼはリパーゼ活性を有し、かつポリ不飽和脂肪酸(PUFA)エステルを選択的に加水分解する、前記工程；
（ｂ）ポリ不飽和エステルおよび飽和エステルの混合物を含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）前記ポリペプチドが前記ポリ不飽和脂肪酸エステルを選択的に加水分解し得る条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させる工程。
【請求項２２０】
以下の工程を含む、ポリ不飽和脂肪酸(PUFA)を含む食物または飼料添加物を調製する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、前記ヒドロラーゼはポリ不飽和脂肪酸(PUFA)エステルを選択的に加水分解する、前記工程；
（ｂ）PUFAエステルを含む組成物を提供する工程；および、
（ｃ）前記ポリペプチドが前記ポリ不飽和脂肪酸エステルの加水分解を選択的に触媒し得る条件下で工程（ａ）のポリペプチドを工程（ｂ）の組成物と接触させ、それによってPUFA-含有食物または飼料添加物を製造する工程。
【請求項２２１】
以下の工程を含む、ラテックスを処理する方法：
（ａ）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、このポリペプチドは不飽和エステルに優先して飽和エステルに対して選択性を有し、それによって前記飽和エステルをその対応する酸およびアルコールに変換する、前記工程；
（ｂ）飽和および不飽和エステルを含むラテックス組成物を提供する工程；
（ｃ）前記ポリペプチドが前記飽和エステルを選択的に加水分解し得る条件下で工程（ａ）のヒドロラーゼを工程（ｂ）の組成物と接触させ、それによってラテックスを処理する工程。
【請求項２２２】
アクリル酸エチルに優先してプロピオン酸エチルが選択的に加水分解される、請求項２２１記載の方法。
【請求項２２３】
工程（ｂ）のラテックス組成物が、アクリル、ビニルおよび不飽和酸モノマー、アクリル酸アルキルモノマー、アクリル酸メチル、アクリル酸エチル、アクリル酸プロピルおよびアクリル酸ブチル、アクリレート酸、アクリル酸、メタクリル酸、クロトン酸、イタコン酸およびそれらの混合物を含むポリマーを含む、請求項２２１記載の方法。
【請求項２２４】
ラテックス組成物が毛定着性である、請求項２２１記載の方法。
【請求項２２５】
工程（ｃ）の条件が、約pH4からpH8の範囲内のpHおよび約20℃から約50℃の範囲内の温度を含む、請求項２２１記載の方法。
【請求項２２６】
以下の工程を含む、潤滑油を精製する方法：（a）請求項５６記載のヒドロラーゼを含む組成物を提供する工程；（b）潤滑油を提供する工程；および、（c）前記ヒドロラーゼが前記潤滑油の中の油を選択的に加水分解し得る条件下で潤滑油をヒドロラーゼで処理し、それによって潤滑油を精製する工程。
【請求項２２７】
潤滑油が油圧油である、請求項２２６記載の方法。
【請求項２２８】
以下の工程を含む、繊維製品を処理する方法：（a）請求項５６記載のヒドロラーゼを含む組成物を提供する工程であって、前記ヒドロラーゼはカルボキシルエステルを選択的に加水分解し得る、前記工程；（b）繊維製品を提供する工程；および、（c）前記ヒドロラーゼがカルボキシルエステルを選択的に加水分解し得る条件下で前記繊維製品をヒドロラーゼで処理し、それによって繊維製品を処理する工程。
【請求項２２９】
繊維製品の処理が、最終繊維製品の手ざわりおよび垂れ具合の向上、染色、難燃性の獲得、撥水性の獲得、光学的な明るさの獲得、または樹脂加工の獲得を含む、請求項２２８記載の方法。
【請求項２３０】
繊維製品が、綿、ビスコース、レーヨン、リオセル、亜麻、リネン、カラムシ、すべてのそれらの混紡、または、それらとポリエステル、ウール、ポリアミド繊維、アクリル繊維もしくはポリアクリル繊維との混紡を含む、請求項２２８記載の方法。
【請求項２３１】
請求項５６記載のヒドロラーゼを含む、繊維製品、織物糸または繊維。
【請求項２３２】
ヒドロラーゼが繊維製品、織物糸、または繊維の表面に吸着または固定されている、請求項２３１記載の繊維製品、織物糸、または繊維。
【請求項２３３】
食物または油の汚れを除去またはその量を低減する方法であって、請求項５６記載のヒドロラーゼを、前記ヒドロラーゼが汚れの中の油または脂肪を加水分解し得る条件下で、食物または油の汚れと接触させる工程を含む、前記方法。
【請求項２３４】
ヒドロラーゼの、界面活性剤による変性および熱による非活性化に対する安定性が向上されている、請求項２３３記載の方法。
【請求項２３５】
ヒドロラーゼが洗剤または洗濯水である、請求項２３３記載の方法。
【請求項２３６】
請求項５６記載のヒドロラーゼを含む食品組成物。
【請求項２３７】
脂肪を含む栄養素をさらに含む、請求項２３６記載の食品組成物。
【請求項２３８】
ヒドロラーゼが胆汁酸塩によって活性化される、請求項２３６記載の食品組成物。
【請求項２３９】
牛乳ベースの乳幼児用調製乳をさらに含む、請求項２３６記載の食品組成物。
【請求項２４０】
ヒドロラーゼが長鎖脂肪酸を加水分解し得る、請求項２３９記載の食品組成物。
【請求項２４１】
以下の工程を含む、ミルクまたは植物ベースの食品組成物の脂肪含有量を低減する方法：（a）請求項５６記載のヒドロラーゼを含む組成物を提供する工程；（b）ミルクまたは植物油を含む組成物を提供する工程；および、（c）前記ヒドロラーゼが前記組成物中の油または脂肪を加水分解し得る条件下で工程（b）の組成物をヒドロラーゼで処理し、それによってその脂肪含有量を低減する工程。
【請求項２４２】
栄養素を含むヒトまたは非反芻動物用の食品組成物であって、前記栄養素は脂肪を含み、ヒドロラーゼを全くまたはほとんど含まず、そして効果的な量の請求項５６記載のヒドロラーゼを含み、それによってヒトまたは非反芻動物の脂肪吸収および成長を増進させる、前記組成物。
【請求項２４３】
以下の工程を含む、エステル交換反応を触媒して新たなトリグリセリドを生成する方法：（a）請求項５６記載のヒドロラーゼを含む組成物を提供する工程であって、前記ヒドロラーゼはエステル交換反応を触媒し得る、前記工程；（b）トリグリセリドと遊離脂肪酸の混合物を提供する工程；（c）前記ヒドロラーゼが遊離脂肪酸とトリグリセリドのアシル基との交換を触媒し得る条件下で工程（b）の組成物をヒドロラーゼで処理し、それによって付加脂肪酸のエンリッチされた新たなトリグリセリドを生成する工程。
【請求項２４４】
ヒドロラーゼがSn1、Sn3-特異的リパーゼである、請求項２４３記載の方法。
【請求項２４５】
以下の工程を含む、トランス酸および中間鎖脂肪酸の含有量の少ないマーガリン油を調製するためのエステル転移方法：（a）ステアリン酸、低分子量一価アルコールのステアリン酸モノエステルおよびそれらの混合物からなる群より選択されるステアリン酸原料物質を含むエステル転移反応混合物を提供する工程；（b）液体の植物油を提供する工程；（c）請求項５６記載のヒドロラーゼを提供する工程であって、このポリペプチドは1,3-特異的リパーゼ活性を含む、前記工程；（d）ステアリン酸原料物質および植物油トリグリセリドをエステル転移して、反応混合物のグリセリド成分の1-、3-位にあるエステル基を非グリセリド脂肪酸成分と実質的に平衡化する工程：（e）エステル転移混合物のグリセリド成分からエステル転移化遊離脂肪酸成分を分離して、エステル転移化マーガリン油生成物と、植物油から遊離された脂肪酸、脂肪酸モノエステルまたはそれらの混合物を含む脂肪酸混合物とを提供する工程；および、（f）前記脂肪酸混合物を水素添加する工程。
【請求項２４６】
1-パルミトイル-3-ステアロイル-2-モノレイン(POSt)および1,3-ジステアロイル-2-モノレイン(StOSt)を含む組成物を製造する方法であって、請求項５６記載のリパーゼを提供する工程を含み、ここで前記リパーゼは、1,3-ジパルミトイル-2-モノレイン(POP)とステアリン酸またはトリステアリンとの1,3-特異的リパーゼ-触媒エステル交換によって1-パルミトイル-3-ステアロイル-2-モノレイン(POSt)または1,3-ジステアロイル-2-モノレイン(StOSt)のエンリッチされた生成物を製造することが可能である、前記方法。
【請求項２４７】
リポポリサッカライド(LPS)-媒介毒性を軽減または予防する方法であって、請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む医薬組成物を患者に投与する工程を含む、前記方法。
【請求項２４８】
エンドトキシンを解毒する方法であって、前記エンドトキシンを請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドと接触させる工程を含む、前記方法。
【請求項２４９】
リピドAから2'または3'脂肪酸鎖を脱アシル化する方法であって、前記リピドAを請求項５６記載のポリペプチドまたは請求項１もしくは請求項２２記載の核酸によってコードされるポリペプチドと接触させる工程を含む、前記方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】













































































































【図３１】

【公表番号】特表２００７−５２４３７５（Ｐ２００７−５２４３７５Ａ）
【公表日】平成１９年８月３０日（２００７．８．３０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５０９２４１（Ｐ２００６−５０９２４１）
【出願日】平成１６年３月８日（２００４．３．８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／００７０９５
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０３２４９６
【国際公開日】平成１７年４月１４日（２００５．４．１４）
【出願人】（５０３０８９４８９）ダイヴァーサ　コーポレイション (31)
【Ｆターム（参考）】